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Ranking of RP:PFM:REP : from 1001 to 1100

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[1001] PF02994           1342                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  9                                                
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 zf-C2HC:Zinc finger, C2HC typ                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         13334241111222461215122326211121221 1111211312212 1         1                            
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 hionine synthetase, N-termina                                                                    ** ******************* ****************************************************************************   **********              ****************************************************************  **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************** *****************************************************************   *    *     **************************************************************************************************************************************************************************** ******  ******************** ******************************************************************************************************************************************************************************************   ** ********************************* ******* *************************************** ****** *************************************************** ************************* ************************** ******************************** ******
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 ATP-synt:ATP synthase          --------------------------------------------------11---------------- 1111121111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121211222211--1111112211111--------------12111111211211111111112211111111111111121111111111111111111-----111111111111111111111111111111111111122222211111111113111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111-1--122111111111111--11211112111111111211121111111111111111111-1111111111111111111111111112121111111111111111111122121112111111111111111111111111111111111111112212112122112222221222321111111111111121211112111111111111112211111211121112111111111113311111121112111111111111111111111111111111112121111112111111112111111111111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112122121211111111111111111111111112111111111111111111111111111111121111121211111111111111111111111111----------1----1-121111111111111111111111111112111 11--112-31111121111111111111111112111111111111111111111111111121111111111111211311111111211212211111111222-15-4231112111111142-32723-436212132221111122111322113321313331122421222253222373751422232122
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 sphate synthase small chain,      * *********** ************************************* *     ***  ** ******************* *********************************************************** **************** ************               ******************************************************************************************************************************************************************************************************** **   *** * ********** *  ******************* ************************************** *****************************************************************               **************************************************************************************************************************************************************************** *************************** ***********************************************************************************   * **    *  ******************************************************************************                                      *  ********* **  *** *** ********************************************************************************************** ************************* *********** **************** *************************************
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 TRAM_LAG1_CLN8:TLC domain      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3111335-41311232345344443443333334443333333323465546532334433322322433233332312323333332323334443332223543121939510220908728591004441530979727349678182689051309757775463416983378535647589434176645452
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 olases family 2, sugar bindin          *******  *      *  * *                                       *** *  *                             *     **** *** ***  *    ***************** **      **** ***   ** *** * *                        * *****   * *  *              *    *             ** **** *                 **       * *          **               *  ******* ** *************** *********  ************************ **********   *          *    **** **  **  **    *   ** *     ****                                       *   ************  *          *                                                *** *                         *   **       *       * *   * *           *            *      **   *      **                             * ** *  * ** * *  *    * ** *              ***************** ************************    *   *          ********  ************   *             *******      **            *                            *** **** * ************      ********        *                             ** ***** ***       *        **************************** ****************** ** *     * *                 * *      *      ********** ************* *** ************ ** **************** ***** * ****************  ***
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 TIL:Trypsin Inhibitor like cy                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         33421311   11 22 21322 223    2111  1   2  512346122      11                             
 steine rich domain             -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-19178996657496757221551458386793599248682541080937134843724654752------------------------
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 AIRC:AIR carboxylase           --21--1111111111-111111221122211333222122232222222223211111-11111-12 2221211222211111111-1111121111111111111111111121111111111111112111111111111111112121111111111111---1111111111---------------1111111111111122111112222332222223222222222222222122232122111113211111111111111111111111111111221112111111121111111111111111221211111112-1-1111112121111111111111111111111111111111111111111111111111122122222222212122221111112211112122222112323322111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------1111111111111111111111111122111111111211211111111111111111111111111111111111111111222223122222211212232222222122212211111111-1-------12111112221111111211112111111121111111-12111------11111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--121111111111111111111111111111122212211111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111121111111--------1---------------------------1-111212221121 ----111-----111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111211111111111111121111111111--13-211111-111-11-4211-273-2221--11-171-11-11112-1112111121-1111-1111111151112211121221121221
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 OMPdecase:Orotidine 5'-phosph  11122111111111112211111111111111112111222221112122122222222221111-11 1111111111111111111-1111111111111111212111111111112121111-11112111111112222222111111111111111111---1111112111---------------11111111111111111111112212221111111211211222221111111111111111111111211111111111111121111111111212111111111122222222222222232214212123111111111221111221112222222122222222222222222222222222222111222211121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111---------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111114321111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111121111121111211-1111111-11111121111111111111-11111111111111111111111212111111111111111112111111111111111111111--11111111111211111111-1111111--11111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------1------------1--111--1-1----1-1-1-1---1111 11--111-311-111211122222222112222211211111121222221111-1222222-11111-1111111111111111111112111111111111-11-121112212-111111111121441-11211111111111111111111131133121111111-11111117111113232112--12111
 ate decarboxylase / HUMPS fam  ***************************************************************** ** ******************* ************************************* **************************************   **********               ******************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** *****************************************************************               ********************************************************************************************************** **************************************************************** ******* ******************** *****************************************************************  ******************** *******  *****************************************************************************         *            *  ***  * *    * * * *   **** **  *** *** ****************************************** ******* ***** ********************************** ** ********* *************** ************************************** ********************  *****
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 biosynthesis protein             *   * *******        ******************** ** *****************     *** **    *     *    *   *      *     ** ***  * **  *** *       *      ****    ****    **********  ******** *               ****************   *** **  * *        ** ****                    ***************************************************************************************************************************************************************  *******************  * ****         * **  *** *            ****** **** ************  * * *****  *            *   *                              **** *    ******************* ********    ***    * *  *** *   ************  * *** *  * *** * ***** *********   **                 *  **  ***** * *    **       *        *         **  ************* *******************     ** * *********************** ************   *         ***  **** *******  *     *  ** *   ***** *******           ** *     *****              *     ****                                    * *** **** * *                                                            *                                                                                                              ****        *  *  *      *   
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 hATC:hAT family dimerisation                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1                                               8   3                                     5     7         21  2           1  2                            33193 3      1    2        62511   3614 
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