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Ranking of RP:PFM:REP : from 1401 to 1500

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[1401] PF06472            988                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                   2    1                                           4           1       
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[1407] PF03710            984                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GlnE:Glutamate-ammonia ligase  -------------------------------------------------------------------- --2-232222222322222-22222222222222222222232222223222222222--222222232222222222-----22332-----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22222-2222222222222222222222222222-22222222223-22222222223322222332322333322222222222-2232------------------------------2222-22222222222222222222222222222222222222222222222322222222222222222222222222------------3232322322222-2-2-------------------------22222222232222222222233322322222---2222------22222222222223222-2222222222222222222222222222222222222222222222222222-222222222222---2-----222222323222222222-2222222222222222222223222222222222---------2222222222222222222222222------2-11--------------------------------------------------3--- --------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---21121122131-11111-121-11-111-21--11------1----------------------------3-------
  adenylyltransferase                                                                                  * *************** **************************************  ******************     *****                                                           *                                                                                                                                                                                                                                  ***** **************************** *********** ************************************** ****                              **** **************************************************************************            ************* * *                         ********************************   ****      ***************** **************************************************** ************   *     ****************** **********************************         *************************      * **                                                  *            *                                                                                                            *   *********** ***** *** ** *** **  **      *                            *       
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[1408] PF02302            984                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11111                                      1                                                          1           1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
 PTS_IIB:PTS system, Lactose/C  -------------------------------------------------------------------- -------1222-1--------1-----------111-11-------2--2211111-1-----41--1-1--------2--1-------------------------------------------------------------1----------------------------------------1--1--1-455554455464453686332156512314140002091-1333332333333333111162-1471-3-233--09212313-112223655133444455544453333333333332355---655412-332222222423-4---223----12-1------------44311-2------------------------------------------------------------------------------------1---1--1------------------------------------22--------------------------------111--1--1-----------------------------1--------------------------------------------------------446-------4---------------------1----------6423-414333432344-2443311434343334333399341114243434433434334333133231-322222222212--1-------------2-1111-1---1---1211111-1-------1--112-----2-1-----------255533333433241111111111-------4------22223222-------1-1-2211-222-33211--------1-------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
 ellobiose specific IIB subuni                                                                              **** *        *           *** **       *  ******* *     **  * *        *  *                                                             *                                        *  *  * *************************************** ********************** **** * ***  ******** ***************************************   ****** ************ *   ***    ** *            ***** *                                                                                    *   *  *                                    **                                ***  *  *                             *                                                        ***       *                     *          **** ************ **************************************************** ************  *             * **** *   *   ******* *       *  ***     * *           ************************       *      ********       * * **** *** *****        *                                                                                                                                                                            *                                   
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[1409] PF08323            983                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
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 c core, N-terminal domain                                                                 **        ******************* *****************************************************************************  ****************************************************************************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************************************** ****************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************ ******************************** *********************** ********************************************************************************************************************************************* ************************************************* *********************************        *                                            *                                     *                 *                                                                  *                **     
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[1413] PF00887            983                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                   1  11  1        11 1 341 111       1         1           1 1           1                   
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 PI3Ka:Phosphoinositide 3-kina  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2211004-512222212222222222222222222222122122212222222212222424222222-232232222222222222222222222323332243516-22323615998991931896191-00396899500970890486582006637365746446686311118111-32346254-135451
 se family, accessory domain (                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                         ******* ************************************************************ *************************************** *********************** ************************************************** ******** ******
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 -P) KOW-like domain            **                    *                                              ******************* *************************************************** *************************  *********************************************************************************************************************************************************************************************************************** ******************************************************** ************************************ ************************************************************************************************************************** ***** *****    ** **************  ***************************************************************************    ***    * *  *** **************************** ****************************************************************************************************************************************************************************** ***** * ******** *****  *****  **** ************ *     **      ***                                                                                        *    *                                                      *           ** ** ******** *********
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  (SPase) II                                                                                         ******************* ****************************************************************************** ***************************************************************************** ********  *************************************************************************************   *************************************************** ********* *****   ********************************************** **************** ** ********************************************************************************************************************************************************************************************************* *       ** * ********************************* ******* ******************** ******************************************************************************************** *************************************************************************************** *****    * * *   *    ****     *************                           *                                                      *                               *                                                           *              *          
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 Nup88:Nuclear pore component   --1--1--------1-2---1--------1-1----------------------------1------- ------1----------------------------------1---------------------------1--------------1---111--1----------------------11111111---------1-----------1-2--11-1----------11---1--------------------11-2222214212222121----122211------11-1----11111-11111111-------------111-------------------1-1-11--------------------------------------------11-1-1-----------1---1-11--11----111-------1------------------------------------------1---11----11------1---1----------------------1-------------------------------1---------1111-1---------------11------------1-----1------------------1----1---------1-------1--12-----1-11------------1112111--2-12--1--1--1--1-------------------1-------------------1---------------------------------1----1-111111111-1-11-----------------------------------------------------1--------11---111112--11112--11--------------11111---------------------21------------------2-----1--12------------1-1----------1- 11--253-8374643-55-11--111-112111-21112121122231111342352322124-231--22-12-21-32323111-31-21523-4112--2248-2225681378623446382296657-150463483865058459444468774784563892542555241132-42242563841-52942
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