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Ranking of RP:PFM:REP : from 1701 to 1800

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[1701] PF03308            808                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                111 
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 HDA2-3:Class II histone deace  ---------------------------------------------------1---------------- -------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1----------------1--------------------------------------------1--------------------------------1----------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-14225-41-2--43132211222233223331122111122333431-1333111-----523445245335442132434554322-2-1211213211124313447373175422337342322788221362267461852213025045554499456426336423421121113-312342494124137
 tylase complex subunits 2 and                                                     *                                                                                                      *                    *                *                                            *                                *                                                                      *                                                   *                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                             * ***** ** *  *********************************** *******     *************************** * ******************************************************************************************* ***************
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 PNPase:Polyribonucleotide nuc  -------------------------------------------------------------------- ---11111--111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-11-11111111111---1111---1--111111111111111--------1111111111111111111111111111-11111111111111111111-----11--1111111111111111111111111111111---11---1-111111111111111111111----------------------111-------1--1111111111--------------111111111-1--111111111111111111111-1-1-1111111111111-11111-111-111111111111111111111111111111111-111111111111-11--1111-111-1-11111111111111111111--11-1-1111111111--1111111111111111-11--11-111-111111-----11--11111111-11-1111111-1111-1-1-111111111111111111111--111111-111--111111111111111--1------11111-----------1-11111111111111111111111111111111111--111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111--1---111111111111111-111111111111111111111111111-11111111111111111------111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----11111111111111--------------------------1111-111-1--1- -----------------1-------------------------------------------------1------------------------------------------11111--1-1-11111-21441-131111-1-11-1111-2111-1111----1---3-1---1-1---921---1112-21-------
 leotidyltransferase, RNA bind                                                                          *****  ********* ************************************************************ * ** ***********   ****   *  ***************        **************************** ********************     **  *******************************   **   * *********************                      ***       *  **********              ********* *  ********************* * * ************* ***** *** ********************************* ************ **  **** *** * ********************  ** * **********  **************** **  ** *** ******     **  ******** ** ******* **** * * *********************  ****** ***  ***************  *      *****           * ***********************************  *************************** *******************************  *   *************** *************************** *****************      ***************************************************************    **************                          **** *** *  *                   *                                                 *                                          *****  * * ***** ***** ****** * ** **** **** ****    *   * *   * *   ***   **** **       
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 DUF45:Protein of unknown func  ----1------------------1-11--1---11---1211-1211111212-21111111-----1 ----1112111211-----------------1--------111111111---111-11--111111111111111111-111---2-11211-1------------------------------111114112121--12311------22---11-------2-11---------------121-----1--11111211-121121--11--111------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------13111-1-11111111111122-211-11211-11211111111--1-11---111111111212111111111122222222221-11111111112-1111121111111111111111111223233333311121-11------------1-11-11-1-11------11111111111111111111111211121111122232--1112222222222211112222111222221111221-2211111121211112--1212------21211211111112122222223111122122112211211121111121121211211--131-1------11--2121111111-11-111112111111111111112112---1211111111111111111111111-111121111121---1-----1111221-1---1-------1---11111112331111111111211111211111112111121111111131211222323322222221-111111----------2-1----1-111111-111111-111112-2-1------1-- -1--------1-----1---------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1-----------------------1-----------------------------1---------1-1-----1----
 tion DUF45                         *                  * **  *   **   **** ********** ********     *     **********                 *        *********   *** **  ****************** ***   * ***** *                              ************  *****      **   **       * **               ***     *  ******** ******  **  ***      *       *                                                                                          ***** * ************** *** ***** ***********  * **   ********************************* *********** **************************************** **            * ** ** * **      **************************************  ************************************* ****************  ****      ***********************************************************  *** *      **  ********** ** ************************   ************************* ************   *     ******* *   *       *   ******************************************************************** ******          * *    * ****** ****** ****** * *      *    *        *     *                                                                           *                             *                       *                             *         * *     *    
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 TBPIP:Tat binding protein 1(T  --------------1-------------------------------1----1------------1--- --1------------1---------------11111----------------------------------------------------1-----------------11-----------------------------------1--1-3--1-------------2-1---------------1------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----11-1--------------1--------------------------------------11------------------1--------------1----1-1-----1------2--------1------1-------------2----------------------------------1----------5---111----21111-1--211-1-----------1-1-----1---------------2-1---------21----1----11------1------------------------1-------3--21-1--------------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1--------------------1--1-------1--2-------------1--------111----1-1--111------------------------------------------1--1------------------ 1111216-6-2411122312111-713121232111122221133311-1---1--21-13--112-1--11---31---12231111234124411111-2121312-25964499637636699315661388865562571786545023339965112433228-22-114113183111141461211313231
 BP-1)-interacting protein (TB                *                               *    *            *      *            *               *****                                                    *                 **                                   *  * *  *             * *               *      *                                                                                                                          **    ** *              *                                      **                  *              *    * *     *      *        *      *             *                                  *          *   ***    ***** *  *** *           * *     *               * *         **    *    **      *                        *       *  ** *              *     *                                                                                                             *         *                    *  *       *  *             *        ***    * *  ***                                          *  *                   ******* * ************* ************************ *   *  ** **  *** *  **   **   ******************** ******* *********************************************************** ** ***************************
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[1738] PF01386            788                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ribosomal_L25p:Ribosomal L25p  -------------------------------------------------------------------- 1111111111111111111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111----1-1--11111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111-111111----------11111111------------1--11111-11---------------111111---111111111111111111111111111111111111--------------1------------------------------------------------------122-12222222222----211-111112--11111111111111111--11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111-111111-11111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--------------------------11111111111111 ----11--1-------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111211-1-1-1111-
  family                                                                                             ******************* ******************** *************************************    * *  *********** ********************************************** ******          ********            *  ***** **               ******   ************************************              *                                                      *** ***********    *** ******  *****************  ***************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ****** *********************************************** ************************* ** **************************************************** ************************************************************************************************************************************                          **************     **  *             *                                                                                                                                                           *********** * * **** 
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[1739] PF02901            787                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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