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Ranking of RP:PFM:REP : from 1801 to 1900

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[1801] PF01843            757                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1111        11 1 26  111              1  1                         1          1        
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[1802] PF01088            756                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             23                                                3                   
 Peptidase_C12:Ubiquitin carbo  -------------------------------------1------------------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2222222-522-2224455544344444443334444444434433444445455544433321222212112121111112222222236244352222221774-34274545754454455674941341967454473564344444447454442233433352734433222242222225735322323322
 xyl-terminal hydrolase, famil                                       *                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ******* *** ********************************************************************************************** ********************************************************************************************
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[1803] PF05343            755                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Peptidase_M42:M42 glutamyl am  111-21----------222222211111112111111111111111111111114343343---3--- --1------------22----1---1------------------1---------------11-------1--------11112--------1----211-111113111---------------1--------1123311---14------1--11------11--111-------------522--4414333333333333333334233333333222543333333413333333333333333223331-1-21-111----11---11-11122221112112222222222211111111111112221112222-34421111111111323341111-3114-1--33-1---1--3631-1-2-2--------------------------------1-1-21-1----1----1------22------11---------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------112111111----1--1-1-11----1-------------------------1-------------------1---1121-------2--1---3221311122-2232221222222333332---1----111111111111111112-12222--111111111111---------1111--1-1-------------------------1-22221211112111111----------------------------------------12--------------2-31-1---2--12--111----1211144344343332131 -------------111-------------------------------------------------------------------------1---------------1---1---------1---------------------------------1-1-----------------------------1-------------
 inopeptidase                   *** **          *********************************************   *      *            **    *   *                  *               **       *        *****        *    *** *********               *        *******   **      *  **      **  ***             ***  ******************************************************************* * ** ***    **   ** *********************************************** *********************** **** *  ** *   *  **** * * *                                * * ** *    *    *      **      **                     **                                                                                                       *   *             *********    *  * * **    *                         *                   *   ****       *  *   ********** *******************   *    ****************** *****  ************         ****  * *                         * *****************                                        **              * ** *   *  **  ***    *******************              ***                                                                         *               *   *         *                                 * *                             *             
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[1804] PF02733            755                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Dak1:Dak1 domain               ----------------------------1-1------------------------------------- ---1211-----1-1---------13-----1-222-211----213-1221323--2----122341221-------1-1-1----------1----------1------------------------------11122-------1--------------------1------------------------22222222122222222----2231---111222223-1-111111111111112111211--12-----22--11-21---2112222--2--------2------2--3---2--2-122---2222-1--111111112211---111-11-1----1-------1---211--1--------------131---------12331333135-11111-1114--411-2335523311---1------2----------1111---2-----------------------------------------11111121111121222211121---------2----1-3--1----211----------11-------1--1-11111--------------11-----------------------------11-----------------------------------------23--21-1111121211--111211111-111111113221---2----------------111-111---111111111111-------------1--2-1112-1--------1----------1----------------11-------------1------1--------------------1--------------1----------1--------11-------------------- ----111-21--12123221111111211111112112111111111136223433222222314112-21111322122111111212112312132221-2111-1214213112111111111111371-113111-1-1111111111-1111111--11212--25311--11152111121182211111111
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 nzoate carboxy-lyase           *************************    * ********************************** ** *** *         * *                       ****                **    ****           * *****                *   ***************                    * * **********************  ***   * ** *****     *               **** *    *           **                      *        **  *** *  *                                                **                         *  **  ***** **       *******       *    ******  ** ******   *  * ** * ****  *** **    ** *****                ******       *******************  **  *********************************  ***** **   *  ** *   ***************  ** ********* *************** ************************************ *********************   ****      ***************** *********************************************************************     ******** *** * *    ****          *******************          **************                * ******                                              *            *         ** * ****   *               *  *****          *          *********     **  ******                                                        *       **   *               * *   *     ** 
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 ACCA:Acetyl co-enzyme A carbo  -------------------------------------------------------------------- 113-1---------1----------1-----------1----1-----------1-----1----111-1-----------1111111--------1--11111111111111111111111112222221221211122---1111211111111111111111111111111111111111111111-111111111211111111111121112111211111111122111111111111111111111-111111-1-22111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--1111111111111111111111-----3-111111111-1------11111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111-----------------------------11111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111121111111111---111111121111111111111111111--1111111111111111111111111111111111111-1------------------1-11111------11111111111111111-111111111111111111111111112111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------1-1-----------------------------------14-1 ------------------------------------------------1---------------------------------------------1--------1----------1-------------------------------------------1----------------111-----113--4121-------
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  of resolvase                                         *                    ***   *       *               *  ****  *      *  **      **** ***  **        *** **   *   *  *  *   *                            *                  *   ** *            *                  *     *               *      * ********  *****      *** * *   *       * ****        * ***   * *       *      **   **                                     **                 *   *** ******       *                                            *  ** ** * * *** *            *** *             ********** * * *            *     **            *       ******     ****    *********  *  *    *  * ** *             ***          * *        *    **  * *                         **   *  *          * ***   **                   * *   *********  * ** *  *** *  *     *          *     *   **** *  *  ********* *   *          *                   ******    * ****   *      **           *        *              * *                                                                             *                                                                                         *         *                                                      *                            
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 SATase_N:Serine acetyltransfe  ------------------------1---1--111---------11-11-111---------------- 1111--1-----1----11-1-----11111------1----1--1----1----1-----------------------111------111--1--------1-112-----------------11111111111111111111-1122222111211111111113232111111111111-----11--111111111111111111111111111112111------111111111111111111111-1----------------------------------------------------------------------11-1----------1---------1--1-1111111111111111-------1111-----222341112121211111111111-22122322111-3111221232112211111112112111111111112211222-----------------------------------11111223332211112212111211122-111--11212111231131-211222111111111211132-11--11-121111-11111111111111211-------------------------22111211112111111111-1111-1--1211--111111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111211111111-1111111111111111---------2111111111111111111122222131113312112222112223232---------111111111111111---------------111-------------------------------------------1--------1111 --------------------------------------------------1-------------------------------------1-------------------4-------------------------------------------------------------3-1--22337333224325-5313----3
 rase, N-terminal                                       *   *  ***         ** ** ***                 ****  *     *    ** *     *****      *    *  *    *    *                       ***      ***  *        * ***                 ******************** *************************************     **  *********************************      ********************* *                                                                      ** *          *         *  * ****************       ****     ************************ *********** *******************************************                                   ***************************** ***  ************** ********************* **  ** ****** *****************                         ******************** **** *  ****  ****** ******************** **************************************************** ****************         *************************************************         ***************               ***                                           *        ****                                                   *                                     *                   *                                                             * *  ************** ****    *
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 SAM_PNT:Sterile alpha motif (  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11---------------------------1-1-----------------------------------------------------1---1-----1----------1237449898600759768042-448779680930517542742160385244546486611331-------------1----------
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 Macoilin:Transmembrane protei  ---------------------------1----------------1----------------------- --1-1---------------------------------1-----------1---------1---------1-------1-11---------------------------1-----------------------1-------------1-221---------------------------------------1-11111--1-111--1------11------1-------1--111111-1111121--1---------------------------------------------------------------------------1-----------1----1112------------------1---1----------------------------------------1--11----1---112----1----1----------------------------------------------------------------------------------1---------1--------1--------11--------1-------------11---------1--2-1----1-----1--1---1---111-1---------------11----1-1-1----------------21--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-112-2---------------------------------1-1-----1--1-----------------------------------------------1-------------------------------1----------1-1-1---- -321-43-432112-132-22-14132--21-1112-111---2---3311-112-251312---2---2--11222--1---211-21-1-3223121--212-2-413606557854741449522487025582345744134145362402768635327583713545752-111-4-1233343436-2113-
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 OG2135                                                 ********            *  *    *                ** ********* ****** ******************************* ******  *** ******* ****    ***       *         *  ****                *   **   ******     * *  *   **  ******   **** ************     **                   * ** *   *** *        **                     *      ***           *                                               * *            *       *   *  *  **   ****    *   * **  *     ******************** *** *********** *************************************** ***                              ****  * *** *****    **** * *  ******* ***  *   ******  *   **         *** ***       *       ** * **    ***                          *     ***    *    * *    * **  *   ***        *   * ********** ********* *** **   ***     *   ****  * *  * ***   **                      ***   **                *******   * *****************                        **              * **              *                                   *  * *     * *   ***************** * ****************** ** *** **** ***** ******** ********   *******   *****   **************** * ****** **** * ************************** ****  ****** ************** *** 
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[1829] PF02719            743                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Polysacc_synt_2:Polysaccharid  ---------------------------1----1---11-1--1----1-1---------1-------2 -21-1--111-----------------------------1-111---2---1---1-2----1--1-------------12-1---1-6435-8-----21221211-2--------------1----11-121-11132-----1-----1----11-1-1------3--111111-11--1----11---3-----21--12-12--12231-13---1122------111222222221222212--21------------------1--------------1--21111121111-------------1--------1-11222221221222-122211-22311-131211321311----1--2---12222-------11132-1131111111111111-2112121211--1---11221111--2121-21111---1111111111111212------------1111111111111-----1-11-111131111111111111121111111111111--2-111-1--21111222111111111111111141222221111-12----3221212211-21--222222222221211111111112111--22-11-2221222--32-11-111221213---13----------11--------------------------------------21--1---------------------1-----------------------1111111-2---1-1-----1--2111-1111111211212223212121111211111111-33221111112122111111111111111-11222233--------213-------------------------1121111111-1-1 -----2--1----2-1-----1----------------------11---1----------1-1--------------111-------------1----------------------------------1141-1-2---111---------1----1-1----1---------4-----------1--2-----2----
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[1830] PF04857            743                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                     1                  14                                                        12 1        
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[1831] PF02207            743                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1                                                                                                          11 1         1  1 24  1 1                   1                             1             
 zf-UBR:Putative zinc finger i  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1082-312122122222222222222122222212231121222122222222222222233333-3313332212233333333312221222222131333-34-814808555444743951320620734465647826654475584166735566552555869331--211111-31131443245551
 n N-recognin (UBR box)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ** **** ************************************************************ ************************************* ** ******************************************************************  ****** **************
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[1832] PF06508            742                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[1833] PF07722            742                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Peptidase_C26:Peptidase C26    -------------------------------1-------------------------1112------1 11111----------1111-1111141111114222--113---1-1--11-4-11-1---11-1-11111-11111111132--------2-211-----------11--------------1-----------22233---11---1----1--1-------------------------2-------1-1---------------2-----------11--1111111----------------1----111111112-2112222-1-1111-11111111111222222222221111111111111222221222212-11-------1--12------1-1122--111111-11111--11-221111112-------2111--1-11-11-11111111--------1121-211111122211-21--21-1112111111111113111212111112-------1133112112111---1----1------344444322223324333323342---1-----2211112211111-----11--------11-112-1----1-----1----1----1111111-----1-1--111----------1-1-1121--1111--12111111111112121111--1-111-------2-----111-1---11-11111--1111-111111-111--1------------------1---1111-----------------1-----1-11--11--------------------------1-1112221-143321121--------------------1---1111111-21-------1--------------1-1------------------------------1-1111--- ----22-------1----------1-----------1-----------1---1----1-----------------------------11------------------1145433231--1111122111151-11--111112111111111-111112----111121----62122-4--1243359-921--121-
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 PLA2_B:Lysophospholipase cata  --------------------------------------------1-----1----------------- --------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11--------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-11-----------------------------1---1---------1------------------1----------------------------------1-1--------------------------------1------------------------------------------------------1--------------------11---------------------------------------------------1---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1------------------------------- --11----------24522354347434222222323222322333433374603322222264422223452264424426660934737151--1111192212-1111123281556667690685046-87745543566535643552940005349-11--------2--23---------1-2---1----3
 lytic domain                                                               *     *                                                              *                                                                                                      * **              *                                                                                                                                                                                                                             *     * **                             *   *         *                  *                                  * *                                *                                                      *                    **                                                   *   *                                                                                                                                                                              *                                             *                                  **          ********************************************************************************  ********** ************************* ***************************** **        *  **         * *   *    *
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 BCDHK_Adom3:Mitochondrial bra  ---------------------------------1-------------------------1--11---- ---------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11---- ------3-322-3354434244434344444444344634344445323432322443433344434123215642222232224511135344444331334655-3424576675535445555575945-748455454575355446438534651115222221421123133161112223313124263441
 nched-chain alpha-ketoacid de                                   *                         *  **                                                                                                  *                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                *                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *  **           * *** ********************************************************************************************** ************************* ******************************************************************
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