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Ranking of RP:PFM:REP : from 2101 to 2200

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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 MAP1_LC3:Microtubule associat  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111232-773-32111121111111111-111212111111111111111111112111111-11111111111111111111--111121111111111-1221-1426827785667675771525271-879545674577465658558656664214452321122244-1110111116451-231111111
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 DAGK_prokar:Prokaryotic diacy  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------11111-----11-1-1-----12111111-1--------------------------11111---1-11111111111111111111111111111111111111-11-11-1111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111-1-11-1---111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111-1-11--11-11-1-11-1111111-1--1------------1----1--1111111111111--------1-1--111111111111--------------------------------------------------------1-11------111111111111111111121111111111111-211111111311-111111111111111111---312--1-11--1--1111111111111----1-1-111-111111111111111111111111122-112-221111-22111111111211------1------11111111231111111-211111111121111111111111111111111111111111111111111--111111111111--11---------1-113111111111111111111111111111111111111211121111--------111111111122122221111111111111-1------------------------------------1------1111111111---1 ---------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1--------------------------------------------------1------------------------1-----1----
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 peptidase family, N-terminal       *                                                             ** ***   **         ** * ** ******  **********   * *        ***    *** * *           ** ***                *    *************** **    **** ********  ******      *   ** *****  *****  **           ***************************** **      *                 * *                                                                        ** *               *** *   *                        *  ***** * *******  ************* ** *************** **** *** * *        ******** *******    ***** *************** *      * *******************************    ***           *********       *** ***** *  *  *    * * ****     **** **                  ** *  ***** *************************  ****** ******************** **************************************************** ************ ***      ***********************       ********************** *************************************  *               *   *                                 *     *  **                         **                      *                                               * *     ******* ** ********** ******** **  * * ** * ** *        **     *  *   **  *  * **  ***  
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 CstA:Carbon starvation protei  11-111------------111-1-1---1-11------------1-----1---1--1111------- -11--11-111---11111-11--1111111-11111211--1-1--1----111111-----1-11--11-111-11---111----1111-1--------------1---------------------11----11-----------------------------------------------------112222211112221122111112211121211------1----------------1---1-----------------------121111-------11111111111------------------------21112222222-2--2--1111-1-111111----1--1411112-111131----------1-------21----1---1-11--11111111-----------2---------------------------------12--------------------------------2-------1111111----11-21111-111-1111--111-11-----11---1-1112111111111-1--1-11-1-11112333112-1211-1--2--1-11--1-111111111111111-1-----2111---111-1122212122221-11211--1-11-------22223212222222222-222222122222211211222222221222222222222222222212222--222222222222-------------11-1111111111111111111111111111-11111111-11111111-----------11111111111111111111111-------1--2222--------1----------------------------1-11-1----11- ----------1--------------------------------1-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----1------------------1-------1--
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 n amino acid transport protei                         *                                          *       ******* *                      *          *        *      *        ******  *                  *   *     ***************  *                                                                ****************** ******** *****     ** ************************************* * *** **********  ******************** ************* ************** *  **** * **     **     *       *                        *                                                                            **                                           *                        *                *****          *   *                       *  **                      *** *      *******************  *          ***************** *****************************************************************  **              *** ******************  *  *****************          **************                      *         **                                     *    *        *    * *    *                                                                                            *      *                                                     **            *   *  * 
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[2137] PF04006            605                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          2              1    2                                    1                               
 Mpp10:Mpp10 protein            --------------------------------------------------1-1-------------1- ---------------------1--------------------------------------------------111-----------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------11------------1-------------------------12111----1---------------------------------------------------------------------------1-1-1---------1--------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- 7412223-7233222-31341121111112222122111111113262214342-2121231253121212262135-534113621412-133213342134111-3241743334125132370441705-63721224-16223122621365435639236222378235212114111112425294532532-
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[2138] PF00605            605                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1121111       11 2 441 112    1  11        1 1  1                                        
 IRF:Interferon regulatory fac  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------1----------------------1----------------------------------------------------------------------1----8312491766698884707097-40257852882049664963484792769532--------52------------------------
 tor transcription factor                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                      *                                                                      *    ********************** ********************************        **                        
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[2139] PF07338            604                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1    1           1   1   1       1      1 1  11  1 1 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
 DUF1471:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------86323059990999898-9889099909992897996709341120809900980909099966678884-954455545555---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1471)                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ***************** **************************************************** ************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
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[2140] PF08704            603                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 GCD14:tRNA methyltransferase   111111112222222111111111111111111111111111111-12-1---211111111111111 -1-1111111111111122-2111222222221222112211121111111111211111111111111111111111-----11111-------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--1------------------111----212-1---11-11-1-------1----------------------------------------------------------------------------------11-1-11111-1----111------1-----11--1---112-1111----1----1-------2--------------------------------1-----------------1-----------------------------------------------------------1--------------------1---------------------------------------1111----------2--1111211111-11--1--------1-2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------111--1----1---1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------------------------11-1111111---- 1111111-211111122332222353233222223224342442312323212-11121111112211-1111211111121111111114121-21221111222-1214122222212-22121262522-324-22121231111112-1122422--11311111141122131171111122-12131112111
 complex GCD14 subunit          ********************************************* ** *   ***************  * **************** **********************************************************     *****                                                                                                 ** *  *                  ***    *** *   ** ** *       *                                                                                  ** * ***** *    ***      *     **  *   *** ****    *    *       *                                *                 *                                                           *                    *                                       ****          *  ********** **  *        * *                                                                                                           ***  *    *   *  *                                                                                                                    ****                                                      ** *******     ******* ********************************************* ************** ************************* *********** ************* *********** *** ************** *******  ************************** ***********
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Peptidase_S66:LD-carboxypepti  -----------------1------11--1-1------------------------------111---- 11--2--------1-------------------------------1-1-11---------11--311312------------------111-----1---221-21112---------------11111111111----------1222222--11222222111-22221211111311111-2-------24444444534443443111324331--4232222222211--------------1---1--11111----22--111-111111-111111111111111111111-1---1--1--1112222----1-12222222222223-12212223---1211-2--1------1-----121-----2-------------1-----------------------1----2--------------1------------------------1------------1121221222212211-11-11-1-122211112111111111121111112112211111111111111111111---1-2-1111111------11111----------1-1------11111111---------------------------11------11---------------------------------11-11111111111111-1111111111111111111211-----1211111111111112-11111111---------------1-------1-----------------------------111--1111111111111-111-11111111-----221221--11-----------------1---------------1---------------------1-----1----------11 ------------------11--1-1-------------------------1121----1---------------------------------------------------1-------------------------1----------1--11-2111--------------2------1------2-11-----1-11-
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 Alg14:Oligosaccharide biosynt  ---111-----1----------------------1-1-------------1--1-----1-------- ----------------1-----------------1----1----1---------------11----------111--------------------------------------------------------------------1---12--1-------------1-1---------------------------------------------------------------1-----------------------1--1-1-----------------111----------1-----1------------------11--------1------------------1-1----1------------------------------------------------------------------------11-111-------1------------------11------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1------------------------------------------------2------1--------------------------1------------------------1-29-1-------1--12-----------1----------------------1122--2---76554267-6----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1111111-311-11-111-1111-1--22222211111111111111111111111-1-1111112111111-1111111111111111121112-111111-111-11242-1121111111111111121-111111111121111111111111111121112-1112-111111172111112-321111-1111
 hesis protein Alg14 like          ***     *                      * *             *  *     *                         *                 *    *    *               **          ***                                                                    *   **  *             * *                                                               *                       *  * *                 ***          *     *                  **        *                  * *    *                                                                        ** ***       *                  **                                                                        *                                          *                                                *      *                          *                        * ** *       *  **           *                      ****  *   ******** *                *                                                                                                                                                 ******* *** ** *** **** *  ***************************** * ************* ********************** ****** *** ***** ******************* ********************************* **** *************** ****** ****
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[2146] PF00864            602                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11  11     1 11 1 391 1 2    1         1  1                                             
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 DUSP:DUSP domain               -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--451-------1--11111111111111111111111111111--11111111--1---------------------------222-21-111---1-111-3-3--88169706645675403859113200557482787565658544686765743633222202242--------1--23516-1270832
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 drolase/transferase N-termina        *                *      *                **                     *** *********          **     **    *** ***            *     **  *     ***             ********   * ** * *                 ***********   **   *                   *                     **      ******** ******      ** * ***        *                                                                                             * *       * * ***     * *   ** *********   * **    ***      *****  ***************** *           ****   *    ** *   *****   ***********  ***                               **  **** ******************* ********  *** ****** *    *     *           *******          *****************                              ** **** ***** ******** ***                  * **** *    * ** **  **** ******         *** ***** * *  * *    **  ****** *****                                 ********* * ******** ********                        ** * **         ****  **          *           *         *   * *   *    ***     ***   *   *******************   ************  ***************************************  *****    *  *** * *                                                *   ************         *     *         
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 Rad60-SLD:Ubiquitin-2 like Ra  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-22282-3111111332-211221-1222233111111211121122111111222111212121111-22121122222222122222323243322212222211717476675239414107402090-59924366225413312613723243221242222234-322262191--4345552833844336
 d60 SUMO-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           * ***** ********** ****** ******************************************* ************************************************************** ************************************** *********  ****************
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Transferrin:Transferrin        ---------------------------------------------1--------------------11 -------------------------1------1-1-----------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------1----------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------1----111-----------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1--------------------------------------------------------- ----------1--------------1--1--------------------------------------1------------------------------------------9767608785476504967469-78646480760486758783062636472224496826--22------1-3----1--1-------
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 FliD_C:Flagellar hook-associa  -------------------------------------------------------------------- 1111------------------------------------1---1---1----1--------1----1---------------11111-------------------1------------------------------------2--1------------------------------------1-----111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------111-1111111111111111---121--13321211111121111121--111-----------111---11-11-------------------------------1------------1111----------------1-1--------------------------------111111111222311333311213334132111213--442111111--111121221231-------112-11133-12111-32231----1111-11-1--2-1111-1111111111111111111---12-122111111211121211121122231---2111------21111111111111111-1211211111112-11--1---1111111111111111111111111111111121222121221---------2322--221-------------------------1211111111211112111---------2111211111221111111111112------111111111111111111--------------------------1-11111111-1-- --------------------1----------------111111----21--1-----1-------------1--11--------1--------1-1---1----1---1--211-12---1-1141-21271-21321-21111-1--111112-1111---------------------------11--1----1---
 ted protein 2 C-terminus                                                                            ****                                    *   *   *    *        *    *               *****                   *                                    *  *                                    *     ******************************************                                                                                          *** ****************   ***  ********************  ***           ***   ** **                               *            ****                * *                                ************************************  *********  ************       *** ***** ***** *****    **** ** *  * **** *******************   ** ***************************   ****      ***************** ************* **  *   *******************************************         ****  ***                         *******************         *************************      ******************                          * ******** *                       *                ******    **  *     *             *  **        *        * *   *    *   *  *** **   * **** ***** ***** ***** *  ****** ****                           **  *    *   
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[2153] PF02453            597                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1 12        11 1 251 1 1       1         1                                122 2        
 Reticulon:Reticulon            ---------------------------1---------------------------------------- -1--------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-1-211---11-11---------------------------11-11111--111111-111111111111222221111111----------------123-1-1182631643424444448249517664432624043444462303824413611111811317211111-111118633164-------
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