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Ranking of RP:PFM:REP : from 2501 to 2600

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 IP_trans:Phosphatidylinositol  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1----1----11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--44--1--1-------------1----------------------------------------------------------------------------121213--635299755545451168566619664654855743554352435876726233344634033531---------511---1--1212-
  transfer protein                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                              *    *    **                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                         **  **  *  *             *                                                                            ******  ******************************************************************         ***   *  **** 
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[2509] PF02592            488                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF165:Uncharacterized ACR, Y  11---1-----------1111--1111--11121----1--1------2-1-2--------------- 1----1-1111---1------1---1------11111111------1-----11111111---1---------------1-1------1111-1--2---1-1111111111111122222222----------------111-1---1---11--111111----------------------111----11---------------1-1111-------111------1111111111111111111111-------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1----1---------11-------111-1-------------11111111111------1--11--11111111111111--11111111111--------------11--------1111-1111-1----------12222-11111--1---------------------111--111----111-------1-1-12-1111111----1---1-1111--2--11-------------11--------------1--------1-----111-1-----11111111111111111111--1----------11221111111111111-1111111111111111111111111211111111111111111211111112-111111111111--1-111-12313---11111111111111111------------1111121-11111-111111111111-111111111111112222222221-------1111111111211211---------------------------21-2321222-1-- ---------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1-------1----
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[2510] PF07470            488                                                                                                                                                                  11                2                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                                                                       
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 TctA:Tripartite tricarboxylat  -------------------------------1111---11---111--1-111-1---1--------- ----1---111---1------1---2------1111--12----1-------132-1-------212-111-----------2----------------------------------------------------122----------1---------------------------------31---11-------------------6211-------114--------3--------------------------------------------------------------------------------------------4---------------------1----1----55-----1-------1---------------733--822232----------4-21111---3---133222932254221--8653-46425--------------1-----------11-----------------1-----24425-----------------------54455111112242243428336------------------1----12-1-1----2----------1111-1-11--------1-----------------21--1-----1-1111----11---------------------1111-----11-111-------111-1--1-11-113-----112111111111111111111-----------------------------------189---1-2--------1--------1-2-222212112111111-1----------1-132222212122-----------------1----11------------------------------------------3------- -------------1----1------------------------------------------------------------------------1------------------1-------------------1---------------------------------------------------------3----------
 e transporter TctA family                                     ****   **   ***  * *** *   *              *   ***   *      *   *      ****  **    *       *** *       *** ***           *                                                    ***          *                                 **   **                   ****       ***        *                                                                                            *                     *    *    **     *       *               ***  ******          * *****   *   ***************  **** *****              *           **                 *     *****                       ***********************                  *    ** * *    *          **** * **        *                 **  *     * ****    **                     ****     ** ***       *** *  * ** ***     *********************                                   ***   * *        *        * * *************** *          * ************                 *    **                                          *                     *    *                                                                        *                  *                   *                                                         *          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF1234:Alpha/Beta hydrolase   -------------------------------------------------------------------- -1--1--------------------1------1---1111--1---------1----1---1--1-1-11------------------------------2---422----------------------------------------1---1------------------------------111----------------------------1-------------------1111111111111111111-------2-----11-----------------------------------------------------------2------------11-------------------------------1---11-11111123----2----111233121223-11111123141-933254286532-11-1--22121------------111-1----------------11---------------12--111115244541-11122672221117252354--2231221122233112--2--21-----------11----------------------------11--1-------------------1--11--221--11---------------1-1--1-----------------22-1----------------------------------12111----------------1---------1----------------------11--1--111111-----1---2222221---1122222213212211111----------------------1-121-2-----1--------------------------------------11--1-------------------- ----11--1------111-----1-1-----1--------------11------111------1----------------------------1--------1-----11-3--1-1----111-11121121-1--11112-111-11-111-11---111---1--1--3-11--111-1---111-1132-13--1-
 family of unknown function (D                                                                        *  *                    *      *   ****  *         *    *   *  * * **                              *   ***                                        *   *                              ***                            *                   *******************       *     **                                                           *            **                               *   ** ********    *    ************ *********** ************ ** *  *****            *** *                **               **  ************ ********************  ****************  *  **           **                            **  *                   *  **  ***  **               * *  *                 ** *                                  *****                *         *                      **  *  ******     *   *******   *******************                      * *** *     *                                      **  *                         **  *      ***     * *     *              **      ***      *                            *        *     ** *  * *    *** ******** *  ***** *** ** *** **   ***   *  *  * **  *** *   *** **** **  * 
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[2526] PF02154            485                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 FliM:Flagellar motor switch p  ------1------------------------------------------------------------- 1111------------------------------------1---1---1----1--------1-1-------------------1111------------1----1-1------------------------------------1---------------------------------------------122--1-11111111111112212111222111211111121------------------------------------------------------------------------------------------22-11111111111111111---111--11111221112212111111--1111-111----1121111112112------------22222122--1-------------1-1-1---1111-----------1111-121--------------------------------111111111111111111111111111111111111--111111111--111111111111-------111-11111-1111111111111111111111-1--1-1111-1111111111111111111---11-1111111-1111121111111111111---1111---11111111111111111111-1111111111111-11--1---11111111111111111111111--1111211111111-1111---------1111--111-------------------------1111111111111111111---------1111211111111111111111112------111111111111111111--------------------------1-11111111-1-- -----------------------1-1--------------------------------1---------------------------1---------------------------------------1-------------------------------1-----2---------------------11-----1-----
 rotein FliM                          *                                                              ****                                    *   *   *    *        * *                   ****            *    * *                                    *                                             ***  * ***********************************                                                                                          ** *****************   ***  ********************  **** ***    *************            ********  *             * * *   ****           **** ***                                ************************************  *********  ************       *** ***** ********************** *  * **** *******************   ** ******* *******************   ****   ******************** ************* **  *   ***********************  ************* ****         ****  ***                         *******************         *************************      ******************                          * ******** *                          * *                                *                           *                                       *                               *     *                     **     *     
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[2527] PF02494            485                                                                                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                       7                  13    1                                  1  1                         
 HYR:HYR domain                 ------------------------------------------------------------------21 --1-----------------------------------------1----1-------------------------------------------------26-32-3------------------------------33--------------------------------------------------------------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------11-14------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------8---------------------------------------------------------------------------------------1---------------3474445433444196392644-64134445451535454641444644749376529672230-------------------------
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 lutaryl-coenzyme A synthase C                          ********       ****                       **     *       *           *           *                             *                               * *   *                              ***          *                   *                       *                    *       *  ******   *****************************************************************************************                                    *         *  *                                          *     *                                                                                          *       **** *                                                                         **                                             *               *            *                                                                     ***********     *                                            *                    *                                      ********  *                                           **** *********************** ******** *************************** *************************************************************** ******************************************* *     ****************
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 PEX11:Peroxisomal biogenesis   --------------------------------------------------------1----------- -------------1-------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-644-3335223332253443323234332222123232211132331121-321222112111211221-1131111111214323232232222446-3223435434213334163243413-33423224234323243353442223213123123215-12211221211126597263212212-
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[2539] PF05401            481                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 NodS:Nodulation protein S (No  -----------------------------------------------1--121--------------- 1-1-1---------111----1--62-----11----211-321--12-11-22211---51--4-2-142-----------1-----------------11122---2---------------31---21-11----11---1-1-1---2--11---------22-1---------------1------1----------------------------1-1-------2--------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1--1---12---------------2--1--------11212411-1341-11---11112-1221122214--2113552543122-----1-1111---11111111-11--121-----------------------------------1----------1------12--------2312------21-111-1-1-2-21---1----------1-1-----1-1-12-11----1-1-1--11-141-----1--------2-----------111111-------1-----------------1---1------------3-1--1111111-11-111111-111111111111111---2-111-1-111121-1-1--11111---111111111111---------1-----------------------2222212-2-1-23-22112111121111--------------------1-111-21111-----------11---------------------------------------------------3-- ---1----212-11--11-2-112112111111-----------1--2111133--11----1--------------------------1-111-----1-1------2-1-1211---------1-------1-----------------------------1-111----1---11-1--------2-12-21---2
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[2540] PF04442            481                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 CtaG_Cox11:Cytochrome c oxida  ------------------------------------------------1------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----1111132111111--11-111111111111111111-111111111111111111111111111------------111-111111111111111111111111-111111111------111111111111111111111111111111111111111111111111-1111-------111111--------------------------------------------------------------111111111111111111111111111---11-1--------------------------------------------------------------------------------------------1-----111111----------------------------1111111111111111111-------------1-----111111111111111----11---------------------------------------------------------- 11--111-311-1121111-111121111111111111111-1111111121111111111111111111111111111111111111211111111111111111-11-1111221111111121-52603134111-12-112-1111111111211---1211111121111111101111111-21111111221
 se assembly protein CtaG/Cox1                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ****     *************  ** ****************** ***************************            *** ************************ *********      ************************************************ ****       ******                                                              ***************************   ** *                                                                                            *     ******                            *******************             *     ***************    **                                                           **  *** *** ******* ********************* **************************************************************** ** **************** *********** ** *** *************   ************************* ***********
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Leu_Phe_trans:Leucyl/phenylal  -------------------------------------------------------------------- ---1-------------------------------------1111--1--------------11------------------1--1-----1-------111111-111---------------11-1111111111111---1-11111111111-----111111111------------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---------1---------------1-1111-----11111111121211111111-1-1-11111111111111111111111111-1111111111111111111111111111------------------------------11111111-1111111111111111111111111111111221121111111111111211111111111111111111111111111111-------1-111111111--1-111111---------11112111111-1111111111111111111111111--11111------11111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111--11-----111111111---------------11111111111111111111111112111---------11111111111111-11111111121111--1-111111--------1-------------------------------------1-11 11----1-1---1---1----------------------------------------1----------------------------------1---------------1-----------------------------------------1-------1---1-----------------1----------1131111-
 anyl-tRNA protein transferase                                                                          *                                     ****  *              **                  *  *     *       ****** ***               ** *************   * ***********     *********            ***                                                                                                                                             *                    *         *               * ****     ******************** * * ************************** ****************************                              ******** **********************************************************************************       * *********  * ******         *********** *************************  *****      ***************** ***************************************************  ************  **     *********               *****************************         ************** **************  * ******        *                                     * ** **    * *   *   *                                        *                                  *               *                                         *       *   *                 *          ******* 
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[2544] PF03198            481                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1111 
 Glyco_hydro_72:Glycolipid anc  -------------------------------------------------------------------- ----1-------------------------------------1-----------------1--------------------------------1------------------------------------------------------1----------------------------1----------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- ---------------6776577688764444444444544444444675633424455555546466552654455658655555644414172181111111122--1------------------------------------------------------------------------1-----2-6--112215-
 hored surface protein (GAS1)                                                                            *                                     *                 *                                *                                                      *                            *                                                    *                                                                                            *                           **                                                                                                                                              *                                                                                                         *                                                                                                                                                                  ****                                                                                                                                               *                   *******************************************************************************************  *                                                                        *     * *  ****** 
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[2545] PF03650            481                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                       1        1                   
 UPF0041:Uncharacterised prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------- 22--22--621-221222222322222222222222222222222222222222223223332222211232222332332222212222322222222222-344-2333322132214113235131733-435322241232222223242242223221233252222222222232222235542442222632
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 DUF1981:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----321-21--3322111111111111111111111111111111-111212111212222111111-11111111-1111111123223211112211211111-222243406724344335534281425534243524634333461313534344-333225335233312217211127215168221111-
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 ed in the vesicle membrane C-                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ***** *   ******* ******************************************************************************** ***** ************************* *************** ************************** ********************** 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[2551] PF03200            479                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Glyco_hydro_63:Mannosyl oligo  -----------------1-----------1-------------------------------------- 114-2-------------------------------1---111-1--1----2-----------31--1----------------2111--2-1------1-2-121-11-------------1------------------------2111--11---111-1-21-11-----------------1-----------------------------------1------14--------------------------------------------------------------------------------------------------1-11---------------------------------1------11-------------1---------------------1----2-----------1-------------------------------11-------------------------------------------------------22--------1------11--------------1-------------111----------------1-------1-1-----1-1--------------------------------1--1------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------1-----1------------11--------------11111111----------------------------------1-----11 ----232-21--2113244333322222222222112131211222222222323343222233232212432232212223232211125422321111252323-524411111-111111111111491-112112131112-111-1-111--11468123232-143442112-----111113423--1231-
 saccharide glucosidase                          *           *                                       *** *                               *   *** *  *    *           **  *                ****  * *      * * *** **             *                        ****  **   *** * ** **                 *                                   *      **                                                                                                  * **                                 *      **             *                     *    *           *                               **                                                       **        *      **              *             ***                *       * *     * *                                *  *                        *                                                                                                                                              * *                      *     *            **              ********                                  *     **     *** **  ********************************************************************************************** ********* *************** ************ *** * ***  *********** *********     *********  **** 
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[2552] PF03323            479                                                                                                                                                                                                                                                                                   11  1            1         13                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GerA:Bacillus/Clostridium Ger  --------------------1--------1--------------1-1--------------------- ----------------------------------------------1----1------------1---1------1-----------------------------------------------------------------------1---------------------------------------11-66578788698560289198555687735636--------32------------------------------------------------------------------------------------------2744144454452524-662222242--3114167552324142222-----------------11-111-1-11-------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------13-1----------------------1---1----1--1--1---------------1-1----1-----------------------------------------------1-------------------1------------12----1--1-------2------1-----5----1-----11-
 A spore germination protein                        *        *              * *                                                                    *    *            *   *      *                                                                       *                                       ** ********************************        **                                                                                          **************** *********  *******************                 ** *** * **                         **                                                                                                     *                                                                                                  *                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                         ** *                      *   *    *  *  *               * *    *                                               *                   *            **    *  *       *      *     *    *     ** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2553] PF10527            479                                                                          2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
 PQQ_N:Pyrrolo-quinoline quino  -------------------------------------------------------------------- --4----------------------1----------------------------------------1------------------------------------11-5----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----2-----27577---11123----------1-55455446313-222221223232-2-1-3-223331-15555555534464-1-------------------------------1261-----11111121----1113-------14232------401--211-54----536-------------41-----------------------------------------------------------------112-1------------------1----1--------12---221111111111-1111111111111111111232-1--111-111111111111131--1111---------------------------2--21---------------22322221-11-22322322333344222------------------------1134344-11------------------------------------------------------------12-- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
 ne coenzyme N-terminus                                                                                *                      *                                        *                                    ** *                                                                            *                                                                                                                                                                                            *     *     *****   *****          * *********** ************ * * * ****** ************** *                               ****     ********    ****       *****      ***  *** **    ***             **                                                                 *** *                  *    *        **   ************ ********************** *  *** ***************  ****                           *  **               ******** ** *****************                        ******* **                                                            **                                                                                                                                                                                                     *    
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Nexin_C:Sorting nexin C termi  -------------------------------------------------------------------- ---------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------1-----22321222222222222222222222122222221222122221211222111111--1111111--1111111---11111111-11111331-5--56066553444344541025052941242461464334435327264444322342212251122-1-11111114122211-1-----
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 Atx10homo_assoc:Spinocerebell  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-311-1111111111111111111111111111111111-11111111111111111111--11111111111111111111-11111111111---11-12128758743243342884319061378342241434343314319365654212112131111341-1123112112112122211121-
 ar ataxia type 10 protein dom                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      * * *     *                                                                                                                                                                                              *** *** ********************************** ********************  ******************** ***********   ** ******************************************************************** ********************** 
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 Peptidase_M32:Carboxypeptidas  111-121122222221-111111-12211111--------1-1-----------2111111--111-2 ---1-1------11-------1--1------1-1-1----------1-----------------11---1--2221111---1-------------1-------1--2---------------1-------1---22212---31-----------111111-------111111-11111131111---1112222221221112211111111221111-2112121211--------------------1---11-1---11--111--12-111-----------------------------------------------1-------------------1----------1----1-------11---2-11---1--1--------1---------------11111111-111-----------111---121111111111111111111-11-11121111111111111112-1-1111111--------------------------------------------1----1--1---------1----------1-1----------1----------------1-2--1---------------------------112-------1111112-1111-1111-11-----1-------11-1112------------------------------111--1------------------1---------111111211111---------1111----1-------------------------1----1-------------111-11111-11111111111111------------------111111----------11-22---------------------11211------1-- --------642----11-------1--11-211--11---------1---1----1-----------------1--------1-------2-1------------1-211213----1------------3----11----------------1-11----1-2--1---------2116121-12-----512--121
 e Taq (M32) metallopeptidase   *** ************ ****** ********        * *           *******  *** *    * *      **       *  *      * * *          *                 **   *  *******   *             *       *  *               *       *   *****   **           ******       ****** ***********   ******************************* **********                    *   ** *   **  ***  ** ***                                               *                   *          *    *       **   * **   *  *        *               ******** ***           ***   ********************* ** ******************** * *******                                            *    *  *         *          * *          *                * *  *                           ***       ******* **** **** **     *       ** ****                              ***  *                  *         ************         ****    *                         *    *             *** ***** **************                  ******          ** **                     *****      *           ***    **       *  ** ***  **         *   *    *                 *        *       * *            * ******    *            *    **                * **    * *  *         ******* **     ***  ***
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