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Ranking of RP:PFM:REP : from 2801 to 2900

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF1393:Protein of unknown fu  ----1-----------2----------------1----14-1------------11--111--12--- -------------------------------------1--------11-----11------1-----11--1------1111--------------------------------------------------------------21-1--------------------------------------------1222222322221222--1121222111222222222221-22222222222222111112323-13223322221121-12-222444312133322222222222333333333333332232222241442422222224143122333343123-331-21211131-222211-1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----11111----------------------------------11-1---1---11-------11------21---------- ---------------------1--------------1------------------------------------------------------------------1------1----------------------------------------------1---------------------------1-------------
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[2802] PF06011            422                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TRP:Transient receptor potent  ------1-------1----------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1----------------------------------------1-----------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------1-1--------------------------------------------11---------------------------------------------------- -1--11-----11115544555564644553334444333333444454466766657556694332313334354424427743433312352322222-22323-342---11-------------------------------------------------------------62------1---141---37552
 ial (TRP) ion channel                *       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                  *      *                                        *                       *                                                                                                                                                  * *      * *                                            **                                                      *  **     ***************************************************************************************** ***** ***   **                                                             **      *   ***   *****
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2803] PF07223            422                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        2                                 1             1     3                      1                                             
 DUF1421:Protein of unknown fu  ------------------------------------------------------------------1- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1--------------------------1------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1-1------------------------------21-1-1----------------------------------------------------1-------1-------1-------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------11-------------------------------------------------------------1-------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1--------------------- -1---2--1-1---13-2132-132-32222232122----1-312-221121211-32-11-111-----2111-2---211-1-1--21--3111-13-31113-1--52-12432113211161828341535121-61331124-1411035424167131--1-2-272-----2----14665981121-11-
 nction (DUF1421)                                                                                 *                                                                                                            *         *                          *                                                      *                                                             * *                              ** * *                                                    *       *       *                                                 *                                                                                                                                                         *                 **                                                             *                   *                                                                                                          *                            *                                                                                    *                       *   *  * *   ** **** *** ***********    * *** ********* ** ** ***     **** *   *** * *  **  **** ** ***** *  ** ************************** ******** ****************  * * ***     *    *********** ** 
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[2804] PF05965            422                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1  1 14  1 1                                                               
 FYRC:F/Y rich C-terminus       -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------111--------------------------------------------------------------------------11--111----1--566-3124787856632445506202385117245246455334434533453345112433128234215222426121313456-74-------
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 Rad21_Rec8_N:N terminus of Ra  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111-311-1221132222221122222222221121211112222222332221122222222212211122212222212222211213122222122121113133332522133331333328031345133231236122233116243322323221111-5221223315222-124452741111111
 d21 / Rec8 like protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ***** *** ************************************************************************************************************************************************************* ************* ***************
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[2808] PF01899            420                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 bunit                            * *                   ************* *****  * * **   *******             **********      *   *      **** ***   ******** ******  **   ** ***           *                   *    *                *  * **   ******    *                                      **      **               ******   * ***********  ********************                                                                       *                      *   *   ***    **      *    *   ****** **  ******************* ** ** * * * **** *******  *************             ********************************      *****                        ***        *****  *******           ****  ***  **             * **    **                                 * ** **      **      ** **   ****                                                                                            ******     ****               *******   *******************         *    *****     **********      *                                           ****** **                                                                                                            *                                                             *                                  
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[2809] PF10257            420                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1    12    1                                                               
 RAI16-like:Retinoic acid indu  ----------------------1--------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----112-22--221-1111111111111111121111111122112121111111111111---------------------------1211111121112133512--7556848434454405453385275634445445434353632844434562123123238-231--------------2----2112-
 ced 16-like protein                                  *                                                                                                                                                                                    *             *                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                          *                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *** **  *** **********************************************                           *******************  ************************************************************* ***              *    **** 
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[2810] PF06719            420                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AraC_N:AraC-type transcriptio  -------------------------------------------------------------------- --2-1--------------------1------------1-----1---------------1------1--------------------------------1---1-1-----------------------------111----2-11---------------1---1-2--------------2-----1-----------------------------------------5----------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------3--2-----2----------------------1-11-11-1--21-533121246123---3---31-11-1----------21---------------------------------1-------1113466463122213321222212732--------32--------3--1--1----------------1----2--1-22--2-2112-11211-1--3----11-----------------------111-----32-1----11-1---3-------------------22141211111111111-111111111111111111133231---21111-1---111111211111-11-1111111-1111---------------2341111-2---------1122113-1-1-33223344323351314----------111------12111-2111111----------11---------------------------------------------1-111---- -------------1-------------------------------------2-------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1---------1-----1----1--------1--1-
 nal regulator N-terminus                                                                              * *                    *            *     *               *      *                                *   * *                             ***    * **               *   * *              *     *                                         *                                                                                              *                                                *  *     *                      * ** ** *  ** ************   *   ** ** *          **                                 *       ****************************        **        *  *  *                *    *  * **  * **** ***** *  *    **                       ***     ** *    ** *   *                   ***************** ************************   ***** *   ************ ** ******* ****               ******* *         ******* * * *****************          ***      ***** *******          **                                             * ***                  *                                     *                                                 *                                                              *         *     *    *        *  * 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Peptidase_C13:Peptidase C13 f  ---1---------------------------------------1---1-------------------- --1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1---1---1--------1-------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-----------111-11-11---11111111-1111-111--------------------------1-1--112---------------------------------------------------------------- 1111111-311111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111211111-1111112125322285312323246233054-549222241212221222232223222432224112112222-22171112155671731112322
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 Ceramidase_alk:Neutral/alkali  -----------------11------12------------------------------1---------- --1-1------1-----11-1---2-1-111-----2111-----1------1---------1---1--2--------------------1--------------15-2-----------------------------31---1-2-1-----------------1---------------------------11111111--11111------1-1----------------------------------------------11---------2--------------------------------1------------------------------------------1------------------1----21---------1------------------------------1--1----21--1---------------------------------1--------------------------------1---------------------------------------------------------------------------1-1-1---1-----1--------11222----------------------------------------------------------------------------1---1--11111-1--11--11----11--1--1-------------------------1-1------------------------------------------------------------1--1211-------------------------------------------------------2211---------------------------------------------------- ----211-1-1---11211231131212211111111111211111233311-211322222---------------------1-----1212222------1111-21131-221311-111122131003-412121121121111222121-1212496121235332-2-1-21-1--11221391421-44491
 ne non-lysosomal ceramidase                     **      **                              *             * *      *     ** *   * * ***     ****     *      *         *   *  *                    *              ** *                             **   * * *                 *                           ********  *****      * *                                              **         *                                *                                          *                  *    **         *                              *  *    **  *                                 *                                *                                                                           * * *   *     *        *****                                                                            *   *  ***** *  **  **    **  *  *                         * *                                                            *  ****                                                       ****                                                         *** * *   ************************************** *********                     *     *******      **** ***** ****** ************ ********************* **************** * * ** *  *********** *****
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[2819] PF02364            418                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1     1111 11       
 Glucan_synthase:1,3-beta-gluc  -----------------1--1----------------------------1------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1-----11----1---------------------1-----------------------------------1---------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------11111111-1---1-1---------11------------------------11111111------------------1-----------------1------1---------------------------------------------1---1-------------------1-------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1--------------1----------------------------------2222-1--1---------------111111---------------------------------------------------------------1-11--11-------------------------------------------------- -2-------------11211112211111111111213333332222111222322112111262332-33133353-4324333444422212242122111333--31--------------2----31----3-1---------------------21----3-1----11--75-42211-21231202288782
 an synthase component                           *  *                            *                                                                                                                            *                                *     **    *                     *                                   *                                                   **                                                                                              *                                        ******** *   * *         **                        ********                  *                 *      *                                             *   *                   *                                                             *                                                                                  *              *                                  **** *  *               ******                                                               * **  **                                                    *             ***************************************************** ******** ****************************  **              *    **    * *                     **    * *    **  ** ***** **************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2820] PF11339            418                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3141:Protein of unknown fu  -----------------------1112111-----------------1------------------11 --1---1-------11111-11111111111111113222----------------------11------1----1----1-1------------------------------------------1----1----1111--------11111-----------1------------------1----------1111111111111111-----111--------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------3-------------14123-----6562621-221-3------------144124121-1--1112131-111161111-2-1-1---111111113111-2-1--------------11--------------121---1111233231-2223332332331126314421122121133222211113----2---------1-33---21-------------------------1-1----------------------------11-1-----------------------------211-------------------------------------------------1-----------------1------------------------------2343-1-2--------------------------4-----------1--2---------------------------2122122111------1-1------------------------------------------------------- ---------1----2--1-2121-1-2-1---------------------11-----------------1--1-1--------1--1-------12------------1-1--------------1-------------11---------1----2--1-1-----1--------------1---1--1--4--1-111
 nction (DUF3141)                                      *******                 *                  **   *   *       ***** ********************                      **      *    *    * *                                          *    *    ****        *****           *                  *          ****************     ***              *                                                                                                                    *           *             *****     ******* *** *            ********* *  ******* ********* * * *   ************ * *              **              ***   ********** ****************************************    *         * **   **                         * *                            ** *                             ***                                                 *                 *                              **** * *                          *           *  *                           **********      * *                                                                 *    *  * **** * * *                     **                 *  * *        *  *       **            * *              *             **         *    *  * *     *              *   *  *  *  * ***
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 PTPA:Phosphotyrosyl phosphate  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1-------------------1----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------- 1111231-3111222222322222222222222222222222222242232222222223222222222122222222222222222222222328222234222212212231152111111133151794-722-11121111111--11141212111-11112311112312111211-1121232111121111
  activator (PTPA) protein                                                                                                                                                                                                                  *           *                   *                                                    *                                                                                                                            *                             *                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                           *                                                                        ******* **************************************************************************************************************************** *** ***********  *********** ******************** ****************
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 DUF1394:Protein of unknown fu  --------------------------------------------1----------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------1--------1-------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------11---------------1------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----222-----222----------------------111111-11-----1---1-----1--1-------1----------------------1-------212-21361166203245354774944162670343354443344434539566662743322432332253----------1--1111--34222
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 I_LWEQ:I/LWEQ domain           ----------------------------------------------------1--------------- --------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----363-----22211111111111111111111111111111111111111-11111111111---111111111-11-11111111111111111112-1111-6--37769764422445883546043547243544355-43239237455342683232234332422----------2-111---------
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 IspA:Intracellular septation   -------------------------------------------------------------------- --------11-1--2-----------------------11-----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111211111122211111111111-111111111131111111111111111112111111111-------------111----------111111111111111----111121111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111--------------------------------------------------------1111111-11--11111111111111111111--11--111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--111111111111111211111111111111111221111111111111122-1111-121111111111111122222222222--------------111--------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------21-------------------------------------------------------------1-------1------1-------1--------------1--------------------------1--1-----1----
 protein A                                                                                                   ** *  *                       **                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ********************************* ***************************************             ***          ***************    ******************************************************************************                                                        ******* **  ********************  **  *** ******************** **************************************************** ************  *************************************************** **** ***************************              ***                                                                                                                   **                                                             *       *      *       *              *                          *  *     *    
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF1041:Domain of Unknown Fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------3819435445345486464958316544445456545444244150545246523226-183722-------------------1--1-
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 ATP-gua_PtransN:ATP:guanido p  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------------------1---------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------6---3-------------------------------------------------------------------------------------------------3-0787408324334353344387-44614340335234233422655544884-27119733377------------------1133331
 hosphotransferase, N-terminal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   * *                       *                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *   *                                                                                                 * ********************** ***************************** ***********                  *******
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[2843] PF10106            413                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1     1              1          1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       111                                                                                                                                                                                                                                                                        
 DUF2345:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------11----------2----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1----------------------------------------------2---1----------1---------------------1---------------------11-11----------------------------------------1------------------4576871111164565556370826252--410--5------4-------26------------34----------------------------------1----------------------------------------------------------4---------5-1-1----2-1211-----------1-11------333-284--7--------------1----------55435534552---------------133---------------3343254-----4323611-31--2-122-------------------------------745---------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                                               **          *                                                                *                                                                                                                                                                *       *                                              *   *          *                     *                     ** **                                        *                  ****************************  ***  *      *       **            **                                  *                                                          *         * * *    * ****           * **      *** ***  *              *          ***********               ***               *******     ******* **  * ***                               ***                                                                                                                                                               *                                                                                                        
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 DUF86:Protein of unknown func  ----3------1---11-65-1-3-----2----3-51-----21184--716-2--22-2------- -1-2--------------------------------------3----1-11-------------1---------------3--12222--21-3--------1----1------------------1126-12--11101------3754551-22------2311----------------1-32241-1111111111211111121111111121111111------11111111111111111111111---------------------------------------------------------------------6-------1--1--2--22-11--------1-3221216-4233324---17-111------11------12122-------------1--1-21-----11-11-111------------------------------212--------------------------------1-----------------------------1----------3-----11--1--1-1-----------3--21---1---1--------1-214-4-1--1----------------------------31------1-----2--------1-1--4--------1-13-------1--------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------1--------------1-------------1------------------------1-1--1-11------------1---------------------------111-1-1------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
 tion DUF86                         *      *   ** ** * *     *    * **     *****  *** *  ** *         * *                                      *    * **             *               *  *****  ** *        *    *                  **** **  *****      ******* **      ****                * ***** **********************************      ***********************                                                                     *       *  *  *  ** **        * ******* *******   ** ***      **      *****             *  * **     ** ** ***                              ***                                *                             *          *     **  *  * *           *  **   *   *        * *** * *  *                            **      *     *        * *  *        * **       *                                                                                                  *                         *              *             *                        * *  * **            *                           *** * *                                                                                                                                                                      *                                        
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 Hydrolase_2:Cell Wall Hydrola  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1----------2--------------------------------------------23344444345344444433333344544433--------65------------------------------------------------------------------------------------------22231444444413121444111324--4224322555-51233332------322311111111111111111122222221222-22223222221-211-22122211111111124222111-------------221------------------------------22131----------------------------------------------------------------------11-----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--2221----------------------------1111111111---------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--------------------12-1---------
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 ATP-synt_D:ATP synthase subun  11111111111111111111111111111111111111111111212411111111111111111111 -------------------------------------------------------------------------------------1--1111-------------------------------1--------------------1-------------------------------------1111111---------------------------------------------------------------1--------------------------------1--1--111-1-1-11111111111111--------------1111111111-1--111122122-----------1---11--111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1--1111-1--------------1---------1-------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------11111111112------------------------------1--1----- 1111111-3111111121111111111112111111111111122222111-111111-1121111111112111111111111111111112111111111111212232111112111112111111191-111111111121111111123111121111213431111111112171111131211111111111
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 CTF_NFI:CTF/NF-I family trans  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1----------21-3-1-----1---1----------11----1--------2-1---------1-----------------------1--------4--------2784665444234460362925195434434456345423533349354--1-1----1-----1---11-------1-----------
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 Ribosomal_L28e:Ribosomal L28e  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --12222-31312211212222222222222222222212-222122222222212212222211111-12111111-112111112222222222222212233512214232431-1-122247252672-229-2--322241211121131113221224221523512221121722-2274662322222222
  protein family                                                                                                                                                                                           *                                 **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ***** ******************************** *************************** ******** *************************************** * ************ *** *  ****************************************** ****************
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 PITH:C-terminal proteasome-in  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1133222-311-11222222222222222221222222222222221222222222222222222112-21-212-----12221222215322432232123222-2513242123212222233222492-22222223-221221222213222222223222233312231122252222233432222123223
 teracting domain of thioredox                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ** *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ******* *** ******************************************************** ** ***     ************************** ************************* ******** *********************************************************
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 Strumpellin:Hereditary spasti  --2---------------------------------1---------------1--------------1 --------------1------------------------------------------------------------------------1---1--------11-------1------------------1-----------------1-----1----------1--1-------1-1----------------111111---1-1-1--------11-----1-------2---------------------1----------------------1--111---1---------------------------------------------11---------1----1--------1-------------1----------------1-----------------------------1----------------------------------------------------11--------------1-----------------------------------------------------------1--------------1-1------21-1-------1-------1-----------1---11--------1-------1--1------1-1--11-1-----11-------1---------------------1---------------1------------------1-2--2-11221222-111121----------------------------------------1--1----------------1-1-------------1--1----------------------1----------------------11------------------------1------------11--------------- -1--222-212111---11--11----------2---1111111--32---1112-321----2--22---11--12112-1-112-1--2----3-----3---2-2-46731231222313266121693222522124112213222112713313--23332593223763-----222-14222--32113121
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 ein S24e                       ******************************** *   *     ************* *********                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *************************************************************** **** **  ** * * * **  ******************************** ** ********** ****** ****** *  *************************************************
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 Ski_Sno:SKI/SNO/DAC family     -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------1----------------0801153354236664404219-510322463666363-26511794662214443333341223---------------1--------
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