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Ranking of RP:PFM:REP : from 3201 to 3300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[3201] PF01447            351                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Peptidase_M4:Thermolysin meta  -------------------------------------------------12----------------- ----2---------2------1----------1--------111--1--11-111--1--1-2---1853------------------------------1----1-----------------2------------11-----2--1-------------------111-----------------------1446456484555655-----2554-1--111-1111-1-111111111111111-11-11------------------------------------------------------------------------2-6566555-5--------------------------------------------------1-------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------11-1111111-111-----1111-11--------------------1--------1----------------------------------------1-42-----------------------------1-----1----211111-2111---11--2--------------111------------------------------------1111--1--------------1------------------------1-----3333--31----------------------------1111---1-----1111--------------1111121122--21211-22------------34-------------------------------------------------- ------1-----1--------1--1-1--------------------1212111-----211------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1------------1---------
 llopeptidase, catalytic domai                                                   **                      *         *      *          *        ***  *  ** ***  *  * *   ****                              *    *                 *            **     *  *                   ***                       ****************     **** *  *** **** * *************** ** **                                                                        * ******* *                                                  *                                     *                                                                           ** ******* ***     **** **                    *        *                                        * **                             *     *    ****** ****   **  *              ***                                    ****  *              *                        *     ****  **                            ****   *     ****              **********  ***** **            **                                                         *     *        *  * *                    *******     ***                                                                                                      *           *            *         
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 DUF721:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -11-111111111111112-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------1111-1-1----11111-111-111111-------111111111111----------11111111111111111-11111111111---1111-111--11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------11-11111111111-111111111111111111111-1111111111-111-111111111111--111111111111111111-11-1-1111--------111-111111111111111-11111--------------------------1-------------------------1---1----------1---111111111111111111-11111----1----------------------------------1--1-1-111111-11-111-1111----1------------11-1---------------------------------11111----------------1-------1-111111111111---1---------1----------------------------------------1111-111----------1111--------------------------1-111111---------1--------------------------11--111111---- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 CUE:CUE domain                 -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-----112221-2433334433322333223133232332222112122221222122-4-12---231--1111112211-13322121212112333-1-2723226122-122223-61662-325-1--41433231-1411512122321-22-121121224-12-4111--1-122----3221-
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[3208] PF05605            350                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                        11 1        
 Di19:Drought induced 19 prote  ------------------1------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1--1-1--1-2-------------1---------1------------------------11-1--1--------------------------------------------44243365323453562511851659335372575355336439264551113331481541122----------4714-14-----1-
 in (Di19)                                        *                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *  * *  * *             *         *                        ** *  *                                            *****************************************************************          **** **     * 
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[3209] PF03813            350                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Nrap:Nrap protein              -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-----11111-------------------------------1-------------------1---------------------------------------------------------------------1-------------1-------------------------------------------------1-------------1----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------11---------------1-----------------------------------------------------------1----------------------------------11---------------------------------------------------------1-------------------------------------------1--1-----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111211-311322113212222123232222223224333331112312122111211112111111112112111-1211111111132132231111111212-1-15111312111-11113131632-324121111111-111121-214141131113321111112112216111112341121-22111-
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 TF_AP-2:Transcription factor   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1----------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------1-----1----------------------------------------------------------------------------------2576592435355508365748-963353355553358536459565653512312121111411-------------1--------7-
 AP-2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                          *                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                   *     *                                                                                  ********************** ******************************************             *        * 
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 DDT:DDT domain                 -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----2-------111111-122111111111-1-11111111111111111111-1111111111-1--11211-22122111111---121111111111-1222--5-3233323221232145272925174632233233423232431423211112311715214141111------126421175121212-
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 HIG_1_N:Hypoxia induced prote  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111--------121212211212111222111121212212222223333112112222122-2112112122222-1111112224121112121-11213-21-4111112222-32187233918-435233131371133123113122541--2212-423-11211--17---11324221-1-3423-
 in conserved region                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ***        *************************************************** ************* ******************* ***** ** ********** *********** ***************************  **** *** *****  **   ******** * **** 
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[3214] PF11902            349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1         1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 DUF3422:Protein of unknown fu  ----------------------1--------------1------------------------------ --2--1--------1-1--------------------------------------------------1-1-------1-------------1---------------1------------------1------111--1----1----1----------2---1----1------------------------------------------------1-----1-------1----------------------1------------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------1-------1-11111--1--212121112111111111-11111---1--1--11--411-2113322112---111111111111111111-----111--------------------------------11---1--111111-----2232------12122213---111---1121-11-1-----1-------11-111-----------111-------------------------------------------------2-5-1--------------------1---111-----------1---891---1---0---------0-1----------1----------------------1-------------------------------1---1--------------------------1----2--1---1-1111----------------------------1-----------1-11-----------------------------------1------------------ -----11---2----1------1-------1---222---------1---------------------------------1---1--1-----3-3---1--------3-3-21113-1-1-2112-2-371151--2------1--13---1-21-----------1121------124212-1--13-122-1143-
 nction (DUF3422)                                     *              *                                 *  *        * *                                                  * *       *             *               *                  *      ***  *    *    *          *   *    *                                                *     *       *                      *                  *                                                 *                                        *       * *****  *  ****************** *****   *  *  **  *** **********   ******************     ***                                **   *  ******     ****      ********   ***   **** ** *     *       ** ***           ***                                                 * * *                    *   ***           *   ***   *   *         * *          *                      *                               *   *                          *    *  *   * ****                            *           * **                                   *                        **   *    *      *       *   ***         *                                 *   *  *     * *   *        * * ***** * * **** * ******  *      *  **   * **           ****      ****** *  ** *** **** 
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[3215] PF10437            349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Lip_prot_lig_C:Bacterial lipo  --------------------------------------------------------------11---- ----------------------------------------------1-------------------------------------------------1----------1------------------------------------------------------------------------------------11111111111111111111111111--111122222211122222222222221111212-3-11-3---221111111112111222211111111111-1111122222222222221111111111-12--2222212121-111----11--11----11---111--111---1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------------------------------------1---211-11-------------------------------------------------11-----------------------------------------111-11-1111111111-1111111111111111111111-1--111111111111111111111---1--11111111111111---------------1---1-1-----------------11--------------------------------211111-------------------------------------2-111111-2-22111111121121----------------1 11--11--1-----1------------------------------------------------------------------------------1---------112--11-------------------------------------1---------------------------------------------------
 ate protein ligase C-terminus                                                                **                                                   *                                                 *          *                                                                                    **************************  ********************************* * ** *   ****************************** **************************** **  ********** ***    **  **    **   ***  ***   *                                                                                                                                ****                                                                  *   *** **                                                 **                                         *** ** ********** ********************** *  *********************   *  **************               *   * *                 **                                ******                                     * ****** * **************                * **  **  *     *                                                                              *         ***  **                                     *                                                   
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  syndrome (SBDS) protein       ********************************************************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ******* ************************************************************ ************************************************ ********  **** *** ******** ******** *  ******* *********************************
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  C-terminal                                                                                         * * ******** *                           * ** *     *****   ** *******                      *            * *                                                ******         *     *    ***                                             **                                                                                                                         *                  * *****     * ***********   *  ** ** **********  **************** **************************                              *****                                                                  *    * * * ***  *** ***************                          *  ******************************      *      ***************** ********************************************** ****  ************              ** *                         *******************         ******* *********************  * **                                                   **                  *                                                                          **         *     *                                            *                *     ******* *        *     
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 FAST_2:FAST kinase-like prote  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------6695831646533338476259405334539547536533725834553---11-1-224----4----------------------1-
 in, subdomain 2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *************************************************   ** * ***    *                      * 
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[3226] PF12440            348                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1      1 21552 111 1     11 1                                                    
 MAGE_N:Melanoma associated an  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------30-3-6150201807-8144473723302341-96-----------------------------------------------
 tigen family N terminal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *      ** * ********** **************** **                                               
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 MetW:Methionine biosynthesis   ---1----1----1----2-1-111--1-1--------------21--1-11--------------11 --31----111-----------114------2----1--1-211----------------1--1-----1-------------11-------------------1-1-------------------1111---1-----------211-111-----1-----------21-11----11------------------------------------------------------------------------1---1----------------------------------------------------------------------------------------------1----1--1---1----------11111-----1212221112211------------11211111-22--1111----1--11-------------1111111112211221-----------------------------11-11111111211112111111111111111121111111111112113111121111111211111111111211-1121-1--2211--111--11--1-----11--1---------------------132-1--11-----------1----1----1-1---2111---------------------------------------------------------------------------------------------------1---1111---------------11111111111111111111121231112---------1------------------------------1-111111-----------------------------------------------1-1 -------------------111111-2-11-11---1-----1---1--1---111----------------------------------1------------1-1--2----1--1------------------1------1------1---1----1---------1----1----1------1--1------1---
 protein MetW                      *    *    *    * * ***  * *              **  * **              **   **    ***           ***      *    *  * ***                *  *     *             **                   * *                   ****   *           *** ***     *           ** **    **                                                                        *   *                                                                                              *    *  *   *          *****     *************            ******** **  ****    *  **             ****************                             ** ************************************************************************** **** *  ****  ***  **  *     **  *                     *** *  **           *    *    * *   ****                                                                                                   *   ****               *****************************         *                              * ******                                               * *                    ****** * ** **   *     *   *  *   ***                                  *            * *  *    *  *                  *      *      *   *    *         *    *    *      *  *      *   
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 Sec15:Exocyst complex subunit  ---------------1-----------------------------------1---------------- -------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------1----------------------------1----------1-----------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------1-------1-----------------------------1-------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1122------------------1------------------------------- ----111----1111211121111111111111111111111111-1111111111111111121121111111111-1111-12121111111111111111111-2-1433233222222423424180315352222322322222221362234213711221122211211-1-8----12454121111111-
  Sec15-like                                   *                                   *                                                                                                *                        *             *                            *          *                                                                                         **                                                                         *                                                      *       *                             *                                                       **                                                                                           *                             *                                                                                                                                                                                                                  *                                                      ****                  *                                    ***    ********************************** ******************************* **** *********************** * ******************************************************************* * *    ************** 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF552:Protein of unknown fun  -------------------------111-----------111--------------------11-1-- ---1111111111-11111-111111111111111111111112111111111111111111111123331111111111111------------------------------------------------------------1-9231121111121122211211111121111121111---------11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111121---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1----1---1--------1--------------------- ---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction (DUF552)                                          ***           ***                    ** *      ********** ***** ***************************************************************                                                            * *************************************         ******************************************************************************** ****************************************************************************************************                                                                                                                                                   ******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                 *    *   *        *                                                       *                                                                                                                                                                     
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[3232] PF08357            346                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1             1    25                                                                    
 SEFIR:SEFIR domain             ----------------------------------------------------1--------------- -11-1-----------------------------------------------------------1---------------1------------------1----------------------------1---3---------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1------------------------------------------------------------------------------------1------1-----1--------------------------1----------------------------------1-----------------1---11-----------------------------------------------------------------------------1----------------------------1-------1-----------------------------------------1-1----------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- -----1--------------------------------------------1-----------------------------------------------------------7445533444455517361028-64924435336414332432865453432124------3332------------------------
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 FlaE:Flagellar basal body pro  -------------------------------------------------------------------- -11--------------------------------------------------------------------------------1-111--------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------1---------1-----1-------------11----1----------1131----11--1------------1--------1--111-2-1112-1----------------------------1----------------------------------1--1111112223111111111111111221-1111--2111111-1--111111111121-------111-11111-1121-241132----11---11-1-----111-11111----------1-11---12-111111111211121211121122221---1111------21111111111111111-1211211-11112111111---1111111111111111111111111111111122222222221---------1111--112-------------------------1111-1111-211111222----------111211111221111111111112------1111-------------1-----------------------------111--11---- -------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1----
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 nction (DUF1456)                                                                                                                                                                                        ***  *  *                                                                                    ******** ******      ***                                                       **                                                 *                                              *                                                                                                                                                                                                         * * *        * *   * *                                *  ****  * **********************             *    ************ ************************  ********************** **  ************              *  *                          ******************          ****       *************                                                                              *                                                                                                                                                     *                                   
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 Tho2:Transcription factor/nuc  ----1-------------------------------------1-------113--------------- ----------------------------------------------------------------------------------------1-2-----------------------------------1--------------------------------------------------1------------------------------------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-1--------------------------------1--------------1-------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------- 11-1141-3---1111-221111111122111111121111111111111311112112223111111-11111111111222111122111-1111121-1-114-1243224451221131424132772-242432221453343111314211111422314111233131--1191-1-122231111122132
 lear export subunit protein 2      *                                     *       ***                                                                                                        * *                                   *                                                  *                                          *                                                 *                                                    * *                                *              *                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *        ** **** *   **** *************************************************** *********************** ******* * *** ************************* ******************************************  **** * ***************
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 EST1:Telomerase activating pr  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1--------------------------- -----1-----12221-111111111111111111111111111111111111111111111-11111--1111122-121111-1222111-11-111--11-------4342482333323356272535364422233327332131433723343321233322--21132--1------13123132-1-111-
 otein Est1                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                       *                                              *                                 *     ***** ********************************************* *****  ******* ****** ******* ** ***  **       **********************************************************  *****  *      ******** * *** 
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 RRN3:RNA polymerase I specifi  -----------------1-------------------------------------------------- ---------------------------------------1------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1-1---------------------------------1-------------------------------------------1-----------1-----------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1------------------------------------------- 111212--1--111411231211212211121211111111111111111225111111111122111-12-21112-131211131111211311111111121311128-42121211211161122943-43311222111-111123111-11311121122-11122231111112221121232423122111
 c transcription initiation fa                   *                                                                                          *                                                                  *                                        *                                                             *                                                                                                                 *          * *                                 *                                           *           *                             *                                                                                           *                                                  *      *                                                                                                                                                                                                                                                                     *  *                                            ******  *  ********************************************************* ** ***** ********************************* ******************** *********** ********* *********** ********************************
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 DUF908:Domain of Unknown Func  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------1-1---------------------------------------------1---1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1------------------------------------1----------------------------------------- 11-11-1-2---1-111122121112544232212131111222223212212111341212121111-11121111-1311111121212-11333211-32-11-1-111313142-1121132132014143612225224211111311521111222121212--11121-13-3---22111223211132--
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 -myristoyltransferase, C-term                                                                                                                                            *                                                                                                                *        *                  **                                                                                                              *  *                     *                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ******* ****** ********************************** ********************************************************************************** ********************************* *** *** ************************
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 DUF178:Putative periplasminc   11-3--2111111112-2222222-------------------------------------1121-12 222-2-----------------------------------2322----------------22-----222--------1----22222-----1----------2--1222222222222222--------------------11--------1-----1--1-----1-------------2222211-------------------22--------------------22-------------------------------------------------------------------------------------------11-11111111111-111-111-----21-12112421--11-------222---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1-------111111---------------1-1--------1----1----------------------1--1----22-222222222-2222223233222---23232222222212111111132222--------------------1--------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------1----------------222222--------1------------------------------11111112--- ------------12------------1-------------------------1-----------------1-------1-----1-----21--1-----------------------------21-----------1----------1-1-----2--------------------1----------1----------
 binding protein (DUF178)       ** *  ********** *******                                     **** ** *** *                                   ****                **     ***        *    *****     *          *  ****************                    **        *     *  *     *             *******                   **                    **                                                                                           ** *********** *** ***     ** ********  **       ***                                                   *                                                                     *       ******               * *        *    *                      *  *    ** ********* *************   **************************                    *              *                                                                                                                                                   **                              *                ******        *                              ********                **            *                         *                 *       *     *     **  *                             **           *          * *     *                    *          *          
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 Arabinose_trans:Mycobacterial  -----------------1------2--------------------------------1---------- -12--11111111232333-33333333333333333334-------------1--1--------18-----------------------1--1---------------------------------1--------11---------------------------1-1------------------------------------------11-----1------------2--------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------1-----------1----------------1------211-----------1-------------------------------------------------1-----------11--1-1----1----1------1---111-------1---------------------------------------1----2--------1------------------------------------------11-1---1---------------1-------------------11------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------- -----11-2-2---111----1-12121121-2111111--111111-333-21323132321--------1----13----------1---11312-1--2--3---1-1-1223-2-1--3---131523132531222-141-2--111-1-31-21--1-1--1---11-1-3-1-----221-12------1--
  cell wall arabinan synthesis                   *      *                                *            **  ************** ********************             *  *        **                       *  *                                 *        **                           * *                                          **     *            *                                **                                                                                          **                                      *           *                *      ***           *                                                 *           **  * *    *    *      *   ***       *                                       *    *        *                                          ** *   *               *                   **            *                                                                                                  * *               * *                                                                                                       ** * *   ***    * ******** *******  ****** *** ***********        *    **          *   ***** *  *  *   * * **** * *  *   *************** *** *  *** * ** **  * *  *   ** * * *     *** **      *  
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 Hairy_orange:Hairy Orange      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------8809828223446356446257-559-4334257425231441047455231256460464--32------------------------
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 -lactamase                     **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        **  *** *** ********************************** ********************* ******** ********************** ***** ********** ********************* ************** *************** * ********************* *** 
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 ation - propanediol utilisati                    **                                                             *    ** *   * *****        *           *****    **   *  *                               *                         *   *       *             *                                       *                 ** *      *   *******                     *      ***   **  *        ****                              *          ** *********** *** ** **       *** **   * *    **                   ******      *              *  *************    *                 *               *                                       ***   ******   *                    *   * *             *  *  *  ** *              * **      *                         ***   *   ****   **** *  *               *      ********** **********************     **************** ** ****  *                            *                        *                                                                                                              * *         **  *  *       ********************    ****** ******* * * ****   *  ***      ****** **                   *  *                **     *   *                * **   * *       *                   **** 
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 DUF1908:Domain of unknown fun  ----------------------------------------------------1--------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1--- ----------------------1----------------1--------------11---------1--------------------2----1---------------11149749564333544184948043942434354564244248217453541233212111231131----------1--1--11---1--
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 SapB_2:Saposin-like type B, r  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----441----------------1-----------------------------------------------------------------------------------3--428375622-336374-33355-77512-372372-34-232-4-8421457344345451--44--------2-3547-34-------
 egion 2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ***                *                                                                                   *  ********* ****** ***** ***** ****** ** *** * ****************  **        * **** **       
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[3271] PF05602            339                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 CLPTM1:Cleft lip and palate t  -------------------------------------------------------------------- -------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1---------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------11----1---------1---------------------------------------------------------------------------11-----------1----------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- 1112112-311-111-1121111111111111111112111111111-111111112111111----2-1-------------------11111111112111211-2926333323222222224252442-435322-22241122113212211224212222122234332-11271111111322211212322
 ransmembrane protein 1 (CLPTM                                                                                                *                                                                                                                                                                                *             *                                 *                                                                               **    *         *                                                                           **           *          **                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                          ******* *** *** ******************************* ***************    * *                   ***************** ************************* ****** *********************************** ***********************
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[3272] PF03452            339                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Anp1:Anp1                      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------1-------------------------------------------------------------1----------------------1---1---------------------------------------1-----------------------1--------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----11--11------------------------------------------------11-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--------23433333343333333333333333333333333333333343333344333143443533234334444222---3----------623-1--123331------1-1-11-2721211--------1-2------1---11--3232--1111--1-----------1---31---32362
                                                                                                                                           *                                                             *                      *   *                                       *                       *                                      *                                                                                                                       *    **  **                                                ** **                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                    *                                                                                                                                                           *        **************************************************************************   *          *** *  ******      * * ** *******        * *      *   **  ****  ****  *           *   **   *****
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[3273] PF04124            338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 Dor1:Dor1-like family          ---------------1----------------------1--1-------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1---------------------------------------------------------------1----1------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1------------------------------- ----121-211-2121211-222122211111111112221111111111111-11121111111111111211121111111111313111211111111-1232-1135142141353222135121402-222211223231111111112153233-1116327123224312110112-22231121111213-
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 PRP38:PRP38 family             -------------------1------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2311212-3121222111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111122212624242224112113122132502-425212221211222122134222222442222222122222122232222132241341212223
                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ******* **************************************************************************************************************************** ******************************************************************
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[3277] PF04348            338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 LppC:LppC putative lipoprotei  -------------------------------------------------------------------- -------2111-1--------------------1-1--1------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------2------------11-11-------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1---11112111112------------11-1--11111-----------1-1-111--2-1---1-111111111--112--------------1-1111111111------1111-11111-------------------------1----------------1111--1211111-11-1--------1--13--1----11-1----------11---------------------------11111111211111111111111111111111---1111------111111111111-1111-1111111111111111111111121111112111111121221111111111-111111111111---111111111111111111111111111111------1---1211111211111111111---------21111111111111111111111111111--1--------------------------------------------------------- ----------1----1---------------------111111-1------12--1------1----------------------------1-1-1-----1-1-------------------2---------------------------------------------------1------------------11---
 n                                                                                                          **** *                    * *  *                              *                                                                                                   *            ** **                                                                                     *                                                                                                      *      *   ***********            ** *  *****           * * ***  * *   * *********  ***              * **********      **** *****                         *                ****  ******* ** *        *  **  *    *