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Ranking of RP:PFM:REP : from 3501 to 3600

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[3502] PF01775            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 Ribosomal_L18ae:Ribosomal L18  -------------------------------------1----1------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 111111115221111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111-11--11221221111112221211111111112134511212111111-1---2123152214-423-1-111121-11--2--1311112441211112911111111161111163381311111211
 ae/LX protein domain                                                *    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ************************************************************ ******* **  ******************************************** *   ********** *** * ****** **  *  **********************************************
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[3503] PF11261            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 IRF-2BP1_2:Interferon regulat  --------------------------------------------------2----------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1---4-1-11----112111212--2122-1-11-1-11111--221-1-11--1------1-----1-1------1------11--2--1-----12--1----187869812-12131512518362439212-41364-54--61-833433---237213323343---1-5--1------1----21112
 ory factor 2-binding protein                                                     *                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                          *                                                                                **                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *   * * **    *********  **** * ** * *****  *** * **  *      *     * *      *      **  *  *     **  *    ********* ******************** ***** **  ** ******   ************   * *  *      *    *****
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[3504] PF04065            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Not3:Not1 N-terminal domain,   -----------------------------------------------------------1-------- -----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111------------1--------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------ ----111-21111111121111111111111111111211111111111121111111121112222223222222232222222211112111111111121314-1129422252211212211-21822152211121111111--13--11-111131321111225111-11212--132211211---11212
 CCR4-Not complex component                                                                *              *                                                                                                       *******            *                                            *     *                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   * *           *** ************************************************************************************************** ******************* ********************  **  ** ****************** *****  *********   *****
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 Metal_hydrol:Predicted metal-  -------------------------------------------------------------------- 1---1---------12211-14--3211111134543342-2------------------------1211-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----------------------------------------2-------------1--11--------------------------------------------------------1121------33334323342331-6666-74111-11--221--1------1---------------------------------------------------1----------------------------------4-----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111-----02-----------------7992986-----3333-1-13-----12--------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------------1-1111----1--1-1-1141-11--1--11111-1---1---------2----------------1---1---1------------1
 dependent hydrolase                                                                                 *   *         ***** **  **************** *                        ****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ***                                         *             *  **                                                        ****      ************** **** ***** **  ***  *      *                                                   *                                  *     *                                                                                                                       *****     **                 *******     **** * **     **                                                                                                                                                                                              *    *               * ****    *  * * **** **  *  ***** *   *         *                *   *   *            *
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[3506] PF04338            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF481:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- 1-2----------------------------------------------------------------------------------3--------1----1------1-----------------1-----11--------------2----------1-11-----1----11----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-2---1----------1---------------------------------------------211--11111-------------------------------------------------11211-----------1-------1------------------1-----1-----1--1-1---------1---1-1--1----------------1---11111---1-------------------1--121111-2134122-4344433443434434354-----11------11111121111111111-111111111111111111111111---1111111111111111111-11111-111111111111--11----------1-11--------------------------222221111211111121---------12222111112111111111111111111---------------------------------------------------------3-- ----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------2----------------------------------1----------------------1-------1--------
 ction, DUF481                                                                                       * *                                                                                  *        *    *      *                 *     **              *          * **     *    **    *                                                                                                                                                                                                  * *   *          *                                             ***  *****                                                 *****           *       *                  *     *     *  * *         *   * *  *                *   *****   *                   *  ****** ******* *******************     **      ***************** ************************   ******************* ***** ************  **          * **                          ******************         *****************************                                                         *                                                 *                                                                             *                                  *                      *       *        
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[3507] PF03157            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1             1     2                                                                    
 Glutenin_hmw:High molecular w  -------------------------------------------------------------------- --------------1---------------------1----2---------------------11-3------------1---------------------------------------------------------------1-1-----------------------------------------------------1---2---2-------1--------------------------------11--------------------------------1-1----11----------------------------------------------1-----1-----------11-1--------------------------------------1111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1-11---------------------------------------------------------------11--------------- 1----11-3-2-4---1--11-2322---1122--1-1-1--11--1-111----1-11121-11-1--2-212111------211--1-1-1---1111-1--21--21714331212-224302-22877-44621-211261-2311---2121-5121112211--1-24--11--1---11-1-112--11--1
 eight glutenin subunit                                                                                            *                     *    *                     ** *            *                                                               * *                                                     *   *   *       *                                **                                * *    **                                              *     *           ** *                                      **********                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                       *                                                                 * **                                                               **                *    ** * * *   *  ** ****   ****  * * *  **  * ***    * ***** ** *  * ******      ***  * * *   **** *  **  *********** ****** ***** ***** ****** ****   **** **********  * **  **  *   ** * ***  **  *
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[3508] PF02487            306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                          2                         
 CLN3:CLN3 protein              -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1 ----111-321----1112212121211111112212111-111111112222111111211111111111111111-2211111111112111131111121----1-1512211321-121-52171952-928111111-1-1121111131--11---1111-1125336-1-1------1----22-2111111
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 Peptidase_C78:Peptidase famil  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1---------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------- --111121211---11111-111-1-111111111111111111111111112-11111111-------------------------111-11111111111-121-1515443432422233342232242-34422232-23223322322322232112233332342123312217---2352141331-1111-
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 MCD:Malonyl-CoA decarboxylase  -------------------------------------------------------------------- ------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1--------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-111--21-11-------------11111111----11111111111111---1-1-1-11-1--------1----1-111111122-----------------1111-------1111---1--------------------111111-----111211111--1----------------111-----1----------------------------------------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----21--221-441------1-----11----2-1--------------1-1------111-----------------------1---------1-------11--2126533562222223233-21443-544-212212311211-22-332434--21133---141231-1--3---1-1212-211142231
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 RusA:Endodeoxyribonuclease Ru  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------1--111-----1---------------------------------------------------1----1-------------1------1--------------------1-----------------1-11-1----------2-------1111-1---1221411-11-1----1--2---1--1---2---2211--1-----------1-1-1-1111-111-1-1-----------11111-1-----1111311-121-1-1---1-----1-------------------1----------1---1--1----------------1--1-------------1---1--1-----1----22222222-----1---------------------------------1-------1---1--1----11-1-------1--1--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------13-----177315163119-12145114964111113-11--------1121---1---12--3133443---------------1-----------------111--------------1---------1-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------11-121-1-23----1-1--1-1-1-11----------------------------------1---------11-----
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 Glyco_transf_43:Glycosyltrans  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------11-----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------3------------------------------------1---------------------------------------------------------4-----32-15434543223333532324041434133362242143313123364453831322263463741---1------5187153-------
 ferase family 43                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                      **                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                    *                                                         *     ** *****************************************************************   *      *******       
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 AMPKBI:5'-AMP-activated prote  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111----1-11111-111111111111-1111-1111111111111111111111111223212-2332223313322222211111-112-111111111--1--1343343212222132221332-233222122222212122224332221113-11-112-2211-11131111124671311111-11
 in kinase beta subunit, inter                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ***    * ***** ************ **** ******************************* ********************** *** *********  *  ********************** ****************************** ** *** **** ******************** **
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 methionine hydroxide adenosyl  ********************************   **         * * ***********   *     **                      *      *       ****  *             **        *           ******           ******* **               ****** ****   *** ****** *******      * ******               **                       ***        * *******   **************        * ** * *    **    *           **************             **********                                                  **                                                                                       ***                                                                                      **                   *   *** *****       *  ****  **           * *******       **                *              ****              *** ***   *   *** * ** ** ***                         ***   *                 *         *               *                                                                        **                                          ***********  *                     **      *    *   *   *          *              *                       *   *        *            *****     * *** ** *   *    *    *                         *        **   * *   *  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 tylase                                                                                                                                                                                                                                              *           *                                     * ** *  ***                                                               *                                                                                                                           *                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                             *                                               * ***               *                    *                ********************** ******************************************    *                   
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 Noc2:Noc2p family              ----------------------------------------1--------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1111111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------ 1121121-31111111121111111111111111-211111111111111211111111111111212-11111211111111111222221111111111412221111211121-1-1122123242383-225-2--22231-11212--7114112211232121151111111171111124241411-1111-
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Bile_Hydr_Trans:Acyl-CoA thio  ------------------------------------------------1------------------- --1-----------------------------------1------1------------------1-1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------1-------------------------------------------------------11---------------------------11------1-11-----------1--------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--------------------------------111----------1------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------ ---------------------------------1----------------------------------------------------------------------------9294554332413452243574-32422136235412111522534431572121------752-------------------------
 ester hydrolase/BAAT N-termin                                                  *                      *                                   *      *                  * *                                                                                                                                               **                  *                                                       **                           **      * **           *                    *                                                                                                                                           ***                                ***          *                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                          *                                                                            ********************** ********************************      ***                         
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[3532] PF11127            303                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2892:Protein of unknown fu  ---------------------------------------------------21--------------- 1-11---1------------------------2-----11--------------------------2--------------------1----------------1---1---------------2211121121211123---1--11----11-1------1-1--------------------1111--1-111111111111111--11-111111-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--1--1------1132--123222-------------2------1--------------1121131-121211-2--------1-----1--------------------------------12--1------------------------1----1-21211111---1212----141-1-2----------2321121----1------1111111--1111-------------------------1---22111--111-12111111111111111111----1212------1---11-1111111111-1111111111111111111--------1111111111111111-1111111-----------------1-----------1-11111-1--------------------1--------------------------2----11111-1-11---------------12-----------------------------------------------------13-- -----------------------1-1-----11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[3533] PF05206            303                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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 Foie-gras_1:Foie gras liver h  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------11---------1---------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------ ----321-2--1211212111111111111111-21121223312221111-1111211111213-1-12--111------2211-----2111111111-11121-2-26222222222212222142423-42722-3222211121222221232211-2222232231111-11-11111-1243122-112211
 ealth family 1                                                                                                                                                                             *                                                                              *                                           **         *         *                                                                                                                                              *                                                                                        *                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                 *** *  ********************** ***************** ************* * **  ***      ****     ********** ***** * *********************** ***** ********************** ************* ** ***** ******* ******
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[3537] PF02099            303                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12    1                                                               
 Josephin:Josephin              -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2111112-2---221---------------------------------------------------------------------------21-1111111-1111--25233335233221343831835941640212252335232212322432331132223-11111232227171-1212213-22222211-
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 7TM_GPCR_Srx:Serpentine type                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1       30                          
 7TM GPCR chemoreceptor Srx     -------------------------------------------------1------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------11111--1----11--------1----------------------------------------------------------442142---------1--------1----------------------131---01------3752---1---1------1---------
                                                                                 *                                                                                                            *                                                                                                                                     *                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                        *                     *                                                                                                                             *                                                                                                       *                                                                                                                                *****  *    **        *                                                          ******         *        *                      ***   **      ****   *   *      *         
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[3543] PF07022            302                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phage_CI_repr:Bacteriophage C  -------------------------------------------------------------1------ ------1------------------------------------------------------------------------------1---121-1-----1---1-----------------------------------------2------11------------------------------------1-211111111-111111--1111111-111---------111------------------------------------------------------------------1111----1---------------3--------------1-------------1----1-1-------1-------------1-1--1--2--111----------------1-------1-2111--1---11-----11-1221111-------------212-----------------------------------22111-----------11-1---1---1--------1---2-------------------11111-------21--2343423651---5-1--3--------2-----1-1-1---------2-1121--11---21----111---1--12-2----------12--------22-21---2-----1--111-31----1111-11-1---2221---2-------2122121-111--2-----1-----11----11111-1----------1--3-1--1-2--------1--1----------2111--11----------11-1-3--211-1112211111213112--1--------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
 I repressor helix-turn-helix                                                                *             *                                                                              *   *** *     *   *                                         *      **                                    * ********* ******  ******* ***         ***                                                                  ****    *               *              *             *    * *       *             * *  *  *  ***                *       * ****  *   **     ** *******             ***                                   *****           ** *   *   *        *   *                   *****       **  **********   * *  *        *     * * *         * ****  **   **    ***   *  ** *          **        ** **   *     *  *** **    **** ** *   ****   *       ******* ***  *     *     **    ***** *          *  * *  * *        *  *          ****  **          ** * *  *** ****************  *                                                                                                                                                                                                                             *                                   
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[3544] PF11306            302                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3108:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- 111---------------------1-------1---1-------1-------------------------------------------1111-1111--11111111-1--------1---------------1--------------------------------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------31----------111111111111111111111111-11211111111-111111221111111141--1111---------------111-----------------------------------------1111111111111111111112131111-111122121111111221213211-------11111112--------1----323-121-122322---------------------------------111111111111111111111121111----111--------------------------------------------------------------------------------------------1----------31-1---------------11111111111111111111111112111-------------2----------222222222212221-11-----------------------------------------------------1-1 ---------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1-------------------------------1------------------------------------2----------
 nction (DUF3108)                                                                                    ***                     *       *   *       *                                           **** ****  ******** *        *               *                                                  *    *                                                                                                                                                                                      **          ************************ *********** ******************  ****               ***                                         **************************** ************************       ********        *    *** *** ******                                 ***************************    ***                                                                                            *          ** *               *****************************             *          *************** **                                                     * *                                                          *                                                             *                               *                                    *          
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 pb4                              * ***         *******                           * *         *                                                                                                   *                                                                                                          *  *   *                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ** ***  *** ** *********** ************* *********************************************************** ******************************* *********** ********* **************** ******* ****************** 
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[3549] PF06165            301                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Glyco_transf_36:Glycosyltrans  -----------------------------2--------------2----------------------- --2----------------------------------------1---------------------------1---------------------------------------------------------------11122-----------------------------------------------22-2----------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------------22-2222222222226-222---323---12----2---3---2222---2-----222222-----2------222222222222----------2--222222442242-------222-2---222222222-----------------------------------------------222-2------------------4---------------22-2-22-2--2----------22--2------2----------2---2--2222-1------------------------------2---21-1-----------------1---------------------2--------------------------------2----------------------2---------2-------------------------------------------------------1-----2------2--------------11111111111211--13131111------------------------2---------------------------1--1-111-4-- -----------------11-------------------------------------111111-----------------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------1---------
 ferase family 36                                            *              *                          *                                        *                           *                                                               *****                                               ** *                                        *                                                                                          ** ************* ***   ***   **    *   *   ****   *     ******     *      ************          *  ************       *** *   *********                                               *** *                  *               ** * ** *  *          **  *      *          *   *  **** *                              *   ** *                 *                     *                                *                      *         *                                                       *     *      *              **************  ********                        *                           *  * *** *                    **                                     ******                                               *                                                                               *         
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3550] PF06941            301                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 NT5C:5' nucleotidase, deoxy (  -------------------------------1--------1----1----211------11------1 ----------------1---------------1---11---1--1--------1---1-------1---------1------------------------2--11-2-1---------------11-11121--1---------1-1-------------------111-----1----------------11-----1-1----1--211112---1112111------1-21111111111111121111---------------11---1-1------------------------------------------------11211111111-1--111---------1-1--1112112-13--1----------1------1---------------------2-11-11-1-----------------------------1-----------111---------------------------------------11111---------------------------------1----1-21-------------------------1--1--------------------------1-------------------------------------1--------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------1-----------1---11----1-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1 ------1----1--------------1-------------------------------------------------------------11-1-2112223---112--212131111111-22232222412-222-122222221212-22-2-1214----11-------211221-----111111-1---1111-
 Pyrimidine), cytosolic type C                                 *        *    *    ***      **      *                 *               *   **   *  *        *   *       *         *                        *  ** * *               ** *****  *         * *                   ***     *                **     * *    *  ******   *******      * ********************               **   * *                                                *********** *  ***         * *  ******* **  *          *      *                     * ** ** *                             *           ***                                       *****                                 *    * **                         *  *                          *                                     *                                      *                                                                               *           *   **    * **                                                                                                                           *      *       *    *              *                                                             ** * *******   ***  ************ *********** *** ************ ** * ****    **       ******     ****** *   **** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 LtrA:Bacterial low temperatur  -------------------------------------------------------------------- ----3-------1-1----------1------1---1333---121------211-----31----1112---------------------------------------------------------------------------1----------------------1-------------1-1-------------1-1----------------------211111111-111111111111112-----1--11--1-2----11--2--------------11------------------------211---111---------------------------------------------------------------1-1111---1111----------1--------1----111-11-111-1-2----------------------11-------------------------------------1--------------------------------1-----11------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------111111---1-------1-----1-----------------------------11------------------------------------------------------------------------ ------2-------15-321-11212322222222211-11112222243324311-2-----21----1--111------22111---1------1-1---3223-----------22--11245-3-451131121-1--22-221--22-------------------11---------------13--211--12
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 DUF484:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------1----------1-----------------------------------------------------------------------11----------1-------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1--1111----------------------------------------1-----------------11111111111-------------111-------------------------------1---2121111111121111112211111111211111111111111121111221111112-------111111--11------1----------------------------------------------111111111111-1111111111111111111---1111------11111111111111111-11-111111111111-111111111111111111111111111111111111-111111111111---1---------11111---111--------1----------1111111111111111111---------11111111111111111112111111111--1--------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------11--------------------------------2--------------1--11-1----11--------------1---2----1----1--1----1--1-------------1------------1--------1-
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 Pectate_lyase:Pectate lyase    -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------1----121-------------3-111-----------------------------------1--------------1111---------------------------------------------------------------------------------------11-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------2----------------------------------4----------------------------------------2--1---------------------------------22--------------------------------------------------------1----------------------------3--------------111--------------------------11-11-----------------------------------------------------------------1- --11-----------112153313-33-------------------2---771721141111-----2------------------------124----------------------------------------------------------------------------------------------3----6497-
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 ORMDL:ORMDL family             -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----211-----11111111111111111111111111-11-111111111111111111111111111121111221221111111111211111111111121111-12233231332333344343913-335233343334234313322242321111111-113---21111-----1113341211111111
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 Ribosomal_L35Ae:Ribosomal pro  ---111----------1------------------------------------11111111----1-- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111---1111-1--1--------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111111-152111111111111111-1111111111111111111111111111111111112-1111--1-11112-111111--22213111111111111334112121111-11--111112171511-11212-121141111--2111111111-1112121121-111111171-111624424211111-2
 tein L35Ae                        ***          *                                    ********    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *****   **** *  *                                                        *                                                                                                                                                                                                          ****** ****************** ************************************* ****  * ***** ******  ***************************** **  ************ ***** *********  ********** ********** ********* *************** *
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 CbiG_C:Cobalamin synthesis G   ------11---------------111111-1111111111111111111---1--------111--11 ---11-------------------------------1--1-111----------------11-11-1111-----------11-----11-1-111--------1-------------------11-1-----1111111-----11111112111111111-111-11111111111111111-11----1-------------------------1111---1111111----------------------------------11---------------------------------------------1----------111111111111111111111111----111111112--1111----11------------11-11--------11111111111--1-1--------1--111111111-----1----------------------1-1----------------------------------------11111111111--1111111111---------1-21---11-1---1----1------------11-11-1-11111111-111111111-----1-------------------------------1-------------------------1------1-------1---1--------------------------------111--11-1111111111111111----------1--------------------------1-1---------------------------11111-1111111--11---------------------1------------------1---1111--------1------------------------------11--------- ---------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------
 C-terminus                           **               ****** *******************   *        ***  **    **                               *  * ***                ** ** ****           **     ** * ***        *                   ** *     *******     ***************** *** ***************** **    *                         ****   *******                                  **                                             *          ************************    *********  ****    **            ** **        ***********  * *        *  *********     *                      * *                                        ***********  **********         * **   ** *   *    *            ** ** * ******** *********     *                               *                         *      *       *   *                                ***  ** ****************          *                          * *                           ***** *******  **                     *                  *   ****        *                              **                                                 **                                                                                                                         *                                    
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 PTE:Phosphotriesterase family  -------11111111--1---------1-------------------1-------------------- ----11---------1111-1---11111111-111-2112---2----1---2----11---1---111------------1--------------------1--1---------------------------1-----------------------------------------------1-1--11-----------1-11-1111211--111111----111211------------------------1-1----------1--------------------------------------------------------1-------------------------1--------------1---11-----------------1--1--------------------------1--1111---22-----------1-11---------------------------------------------------1--------------------1---------1-------------------1-----------------------2------------1--------1-------1----------------------------------------------------------------------1------1--2122212--111212112-21111111111--1121--111111111111-11111111--1----------------------------------------------------------------------1-1-------------2------1-------------------1------------------------1--11--111--1111----------------- ----11---11------1-----1-1---1-------111111---1-1--------1-----------------------11--1----------------------116121121111111121-11432-1221111111111111111-111111----21111112111----1-1--------------1-1-
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[3560] PF03398            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                        11 1        
 Ist1:Regulator of Vps4 activi  ----------------------1--------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--221-411-11111111111111122111111111111112221111111111111111111111-11111111111111112111132122211111-2111-121212111211111311113166112121111211111111121121111211-32111111-12-11-1151111139161531121111
 ty in the MVB pathway                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *  *** *** ******************************************************** ******************************** **** ****************************************************** ******** ** ** **********************
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[3561] PF03414            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1        11    2  1 1    1  1      1       1                                        
 Glyco_transf_6:Glycosyltransf  ---------------------------1---------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------1-1----------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------- ----------------1---11-----11--------1111-1-------------------------------------------------1--------------1--4693337343444561274684-030156455212-32520425-1222---2-----------------------------1------
 erase family 6                                            *                                                                                                                                              *                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *      *                                                                                                                                                                                                                                        **        * *                                                                            *                                                         *   **     **        **** *                                                 *              *  ********************** ************ ******** ****   *                             *      
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[3562] PF04958            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AstA:Arginine N-succinyltrans  --------------------------------------------1--------1-------------- -----------1--------------------------------1-------1-------------------------------------11---------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------122-----------------------------------------1-1---1--11--1--211--------------------------------------------------------11211-----244342222223322222222342---------------------------22-------------1------------------1----111111-----------------------------11-13-1122-2111121111111111111-------------111--111111111111-1111111111111111111222--11-11-1111111-11-1111111111--111111-11111---1-----1111--222---------------2222111---2-2222354222222-222----------11111111111211-------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------1-1-------------------------------------------1-1---------------1---------1------------------1-------1------------------------1--------1---1----------1-
 ferase beta subunit                                                        *        *                          *                                *       *                                     **                                       *                                                                      *            *                                                                                                                                      *                        ***                                         * *   *  **  *  ***                                                        *****     ************************                           **             *                  *    ******                             ** ** **** *******************             ***  ************ **********************  ** ** ******* ** **********  ****** *****   *     ****  ***               *******   * ************* ***          **************                                                                                                                          * *                                           * *               *         *                  *       *                        *        *   *          * 
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[3563] PF05572            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         2                                                                                   1                     
 Peptidase_M43:Pregnancy-assoc  --------------------------------------------------1----------------- --------------------------------------11-------1------------1---------------------------111---------132-223----------------------------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1----------------------------------------1-----------2--1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------562-2111111-------4223121111-----11235266211222-----------------------------16826------3----1--1223444222223233122393-22312122123322211312213222----21--------21-501----2--13-1--41-----
 iated plasma protein-A                                                           *                                                        **       *            *                           ***         *** ***                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            **** *                                        *           *  * *                                                                                                                                                                                                                                                                                 *** *******       **********     **************                             *****      *    *  ********************** **************************    **        ** ***    *  ** *  **     
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[3564] PF07007            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1311:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -11--------------11-1-----11111--------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1----------1---211---------------1------------------------------------1--------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-----------------------------4--1-22------12---1-----------------1-21-11-1213112111111112111---1-12--1----11111111---1---1------------1111--1-----------1---------2334421----111211111-73111----21------111-1--11----2--------1---------1-----------------1--------1-2----------1-----------4--1-------1--1------2----1-211-----1---------15---11111-1---11-1111---1-11--11111-11132--1212233222232322211--1-1---1------------------------1-1-----------------2321211-111-1111144121112-211-------------1-----31----112-23---------1--------------------------------------------------------- -------------1-------111-11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1311)                                                                                     **              ** *     *****                                                                                                  *                     *          *   ***               *                                    *        *                                                                                                         *    *                             *  * **      **   *                 * ** ** *******************   * **  *    ********   *   *            ****  *           *         *******    ********* *****    **      *** *  **    *        *         *                 *        * *          *           *  *       *  *      *    * ***     *         **   ***** *   ** ****   * **  ***** *****  *******************  * *   *                        * *                 ******* *** ************* ***             *     **    *** **         *                                                                       *       *** **                                                                                                                                                                            
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[3565] PF11905            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1 1                    1  11131 1                                                                                                                                               
 DUF3425:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------317356852925332333333132324433327413444903-21--------------1--------------1-1111-1111--3438-----------------------------------------------------------------------------------6---------
 ction (DUF3425)                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ****************************************** **              *              * **** ****  ****                                                                                   *         
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[3566] PF01158            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1    1                                                1                   
 Ribosomal_L36e:Ribosomal prot  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111111115221111111111111111111111111-11112211111111111121121111-1111--12-11222221111--2221211111111111-244112121211111-11-1-64-43576-333----11121-1--1-2-2321-11112112-41451121111131111122141421111111
 ein L36e                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ************************************ ************************** ****  ** ***********  **************** *************** ** * ** ***** ***    ***** *  * * **** ******** ********************************
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[3567] PF08356            300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 EF_assoc_2:EF hand associated  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111121111112----2573363212122276262554-527112121223222222117231221111111-21141111111------14223131111111-
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[3568] PF03571            299                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Peptidase_M49:Peptidase famil  -------1---------------------------------------------------1-------- -13-----------------------------------1-------------------------------------------------11111111------1-----1---------------------1---------------1--------------------------------------------4-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------111112-1---------1----------1---------1--1111------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1111------------------------------------------------------------------------3------------------------------------1-------1--------------------------2-- ----321-32-211111114222-21511111111121111122221312211111211111121111211211111-11111211---1121111----11-311-1-25222112111111112131382-224111121121-11-111111--11----32312135-221--1-------2112111-------
 y M49                                 *                                                   *          **                                   *                                                 ********      *     *                     *               *                                            *                                                                                                                                                                               *                                                 *                                                                                                                                                             *                  ****** *         *          *         *  ****                  *                                                                                                    *     ****                                                                        *                                    *       *                          *       *** ** ************ ***************************************************** ********   *******    ** *** * *********************** ************ ** ******  **    ******** ***  *       *******       
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[3569] PF12137            299                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RapA_C:RNA polymerase recycli  ------------------1------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------1-------------------1-------------------------------------------------------------------1-----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1---2---------------------------------------------------------1---11-1-----------------------1-------------------1-------1--------------12----------------------1-------111-----------11111--1---------------------------211112111113111111111112111112----1--------11111111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--1------1111121211111111111-111111111111111111111121111211111----------11111111121111--1------1--------11--11----------1------------------------------------1-- ---1----------1-------1-1----1111--1-------1----------------1----1--------1--------------1---1-----------------11-1-------1111-12463-21311--1-112---11------------2-2------11----1-111-1-2-----1---2111
 ng family C-terminal                             *                                                                                                              *                   *                                                                   *                 *                                                                                             *                                                                                                                                *                      *   *                                                         *   ** *                       *                   *       *              **                      *       ***           *****  *                           ******************************    *        ***************** ** ************************************************* ************  *      ******************* *********************************          **************  *      *        **  **          *                                    *      *          *       * *    ****  *       *                *    *        *              *   *                 ** *       **** ***** *****  * ***   **            * *      **    * *** * *     *   ****
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[3570] PF10510            299                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 PIG-S:Phosphatidylinositol-gl  ---------------------------------------------1---------------------- ----------------------------------------------------1----------------1--------------------------------------------------------------------1-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------11-------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------3-----------1------------------------------1------------------------------------------------------------1------1---------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1----------------------1--------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------- ----11--1---11111111221222-11344311112222222221111112111111211111121-211111111111--1--21212211121111121112-1-13321232211211112121381-364121121341-111111-1111111-22231311231121-11-4211--1122122121111-
 ycan biosynthesis class S pro                                               *                                                                           *                *                                                                    *     *                                                                                                               *          **                                                                               *                                                                                     *           *                              *                                                            *      *                                             *                                                                     *                                        *                      *                                            *                                                                     *                                                                               **  *   ************** ***************************************** ************  *  ******************** * *********************** ************ ****** ******* ************** ** ****  ************* 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 HA:Helicase associated domain                                                                                                              1                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                2                                                                                   40     
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 EpoR_lig-bind:Erythropoietin   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------5886796524254341424676196233425556325343532433434--3-21----1-----------------------------
 receptor, ligand binding                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                             *************************************************  * **    *                             
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[3578] PF07884            298                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 VKOR:Vitamin K epoxide reduct  11----11------1--11111---------1------------------------------------ 11-1---21121-121111-111111111111111111111---2112111131211111111-1-1111-1111111------------------------21--2----------------------------111-1---1111111111-111--11111111111111-11111-11----------1--------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------2----------------------------------------------------1---11----------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1---------------2--1--1-------------2-------1------------------------------------1-1------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1---------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ----111-21---------1--------------------------------------1--------------------------------------------1----2-322221-212-22232211592-3321--1222231222121111122124-1321-111---2111128121111111-1111----1
 ase family                     **    **      *  *****         *                                     ** *   ***** ****** *********************   ******************* * **** *******                        **  *                            *** *   ********** ***  ************** ***** **          *                    *                                                                                                                                        *                       *                                                    *   **                                                                *                                                     *               *  *  *             *       *                                    * *                              *                                                                                              *         *                                                                                                                                             *       *** **         *                                      *                                            *    * ****** *** *********** ****  ********************** **** ***   **************** ****    *
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[3579] PF11760            298                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CbiG_N:Cobalamin synthesis G   ------1122222211--1-1-1111112-1111111111111111111---1--------111--11 ----1--------------------------------------1----------------11-1--111------------11-----11-1-111--------1-------------------11-1-----1111111-----11111112111111111-111111111111111111111-11----1-------------------------1111---1111111----------------------------------11---------------------------------------------1----------111111111111111111111111----111111111--1111----11-------------------------11111111111----------------1-------------1----------------------1------------------------------------------111111111111111111111111--------1-21---11-1---1----1------------11-11-1-11111111-111111111-----1-------------------------------1-------------------------1------1-------1---1--------------------------------111--11-1111111111111111----------1--------------------------1-1---------------------------1111111111111-111---------------------1------------------1---1111--------1------------------------------11--------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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