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Ranking of RP:PFM:REP : from 3601 to 3700

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 Stap_Strp_tox_C:Staphylococca  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------018862824551342---------------------------------1-4---------------6654656444632--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 l/Streptococcal toxin, beta-g                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***************                                 * *               *************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 of unknown function (DUF830)     *             *      *                                 ***             *          *                           *                       * *           *            **    *   **                  *    *  * *           *                  *                          *      * *   **         * *           *  ************** ***                     **          **  ***********             *        *   **            **           *       *         **              ***********                   * *                 *                   *                                        *       *** **              *     *    *      *  *   *                 * * *          *  * **  **    *        ****   *                *                                               ********** **********************    ** ******** ****  *******   ***********         **** **                        *       *             * *  * *     *        * *******         *   ***           *                                        *    **                                    ** *                                                                                                                           ***                     **** 
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 NDT80_PhoG:NDT80 / PhoG like   -------1------------------------------------------------------------ -----------------11-1-----11111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---- ----232-----22322212322233222222222212121122222333333433323333233111-31131211122123333-----12---------1837-1--21123131--1-212415-4821425-1--2-122-1---2--114221111-11111---33-1--------------2-----1---
 DNA-binding  family                   *                                                                              ** *     *****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *         ***     ******************************************************** *****************     **         **** *  ********  * ****** ******* *  * *** *   *  ********* *****   ** *              *     *   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Paf67:RNA polymerase I-associ  -------------------------------------------1--------1--------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1---1--------------1-------------------------------------------1------1--------1----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------11-------1----------------------------------1--------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------1----------------------------------1-----------------------1------------------------------------------------------------------------------------- 1111211-411-1111111111111112211111111111-1111112112112111111111--------------------------12211121111111122-121312211211111113112-722-312111111131-1-1-1112-32221121111131222326111271112132621312111211
 ated factor PAF67                                                         *        *                                                                                                                        *                        *   *              *                                           *      *        *    *                                                                                                       *                     **       *                                  *                                                  *                                                                                                                 *                                                      *                               * *                                                                                                **                                  *                                  *                       *                                                                                      ******* *** **************************** **********************                          ***************** ********************* *** ************ * * **** ********************************************
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[3612] PF03840            295                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SecG:Preprotein translocase S  -------------------------------------------------------------------- 111-------------------------------------------------------11---------------------1--1---111--------------------------------1--------1----------------------------------------------------------1-------------------------111-----------1---------------11111----11---------11--111-111------------------------------------------------------------111--------------------1---11---1--1------11-1-------1-1--1-----------------------------------------------------------------------------11-----------------------1------------------1--------------------111----1-11111-------------11-1-111-----1-11111-11-11-------1111-1-11111-1111111111-----111111111111111111111111111111111---111------11111-11111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--11-----11111111-111-11-----1---1111111111111111--11-----1111111111111111111111111111--1111111111111-1-------------------------------------------1--1111-11---- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[3613] PF03666            295                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 NPR3:Nitrogen Permease regula  -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-----11111-----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------2-1---------1--1---------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1----------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--21----1-2211-111111211111111111111111112111221111111121111131111111111111-12111112122121-1211111-22121-1133133221121222185151343-6141121312222111121-3132121---11112-1-2122-----1--------1---11221-
 tor of amino acid transport a                                                                                        ** *     *****                                                           *                                                            * *         *  *                                                               *                                                                                                                                                                     *                                        *                            *                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                          *  **    * **** ************************************************************ ************** ******* ***** ************************* ******************* *******   ***** * ****     *        *   ***** 
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 egion in TFIID subunit                                                                                                                                                                                      *                       *                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                  *                                                                                                                                                                    *                                                                                                                   *****     ************************** ************************************************************* *************************** *** *******************************************  **************  *****
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 PKK:Polo kinase kinase         -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------11------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1------32-----------1------1--------------1-----------------------------11-----1--1-1-------------------496626-4242463682626642646134343442232-243173444426022121222-312--------------1----------
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 DIM1:Mitosis protein DIM1      -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-111--31111111122111112111111111111111111111111111111-1111111121311111111111111111111111211112111113111111214212232232222225232583-323221222222222222222-213211213211111-1-222111711111233312311212--
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 LEM:LEM domain                 -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------5966103324434400362246-778354232572353423341262332752211131222314------------------------
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 Peptidase_C65:Peptidase C65 O  -----------------------------1-------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1-------------------------------------1-------------1111111-------------------------------11-------------------------------1------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1------------------------------- ------1-211-111111-111111111111111111111111111-2-1211-11111111----------1-------------2--111111111112-121-11--2542133123334353232614-4362223533341331132133-2231111111121111131-32------124421111111111
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 Chal_sti_synt_C:Chalcone and   -------------------------------------------------------------------- 11--1----------3333-32--4133333212221----1111-11-11-1111----1----11122------------1-----------------1-1111111----------------------------------1---1--------11-11----------1-----1----212------11---------------111111----1111--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---------31-111---------------------1----1----1---22-111----------1-11-----------------1---------------------------------1----------------------------------------------1--------------------------1-----1--------1--------111112---------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1--2----1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------11-- ----33-----1----121----112-------1111111111---11--1121-121-111---------------------------3--1---------------21-----------------------------------------------------------------122-----159987155------3
 stilbene synthases, C-termina                                                                       **  *          **** **  *************    **** ** ** ****    *    *****            *                 * *******                                  *   *        ** **          *     *    ***      **               ******    ****        *                                                                                                                          *                    *         ** ***                     *    *    *   ** ***          * **                 *                                 *                                              *                          *     *        *        ******                                       *                                                                                                     *                                                     *  *    * *                                                                                                         **       **     *    ***    ***       **********   **  **** *** ***                           *  *               **                                                                 ***     *********      *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Phycobilisome:Phycobilisome p  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2820289219022222278929005122211121221-----11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------7---------------------1-
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 sphate carboxylase large chai    * **          *      *   *   *   **      ********** *******           *                 *          *                   **                               *                    * *               ***********         **************************************        ******************* **********  **      **                                                                                                                                                         ****** *****          *   *  *   *  *   **********    ******           *    ***                                    *   *            **        ** **     **   *****   **            ***  *                                                         **                                 ****                                                                                                      *  **                                      *              *                            **                                                  *   *                                                      **                                           *              *   **              *         *               *        *         *  *****   ***  *       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF1744:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-21111-311-11112111211211111111121211111111121121111111112111112111-11112111-111111111111112111111211111111113112112211112224122412-22411211111-112212111111112462113211122121111191111112132211112221
 ction (DUF1744)                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                              *      *                                *                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                   **                                                                                                                                                  * ***** *** ******************************************************** ******** ****************************************************** *********** ******************************************************
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[3645] PF09789            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13                                                                    
 DUF2353:Uncharacterized coile  ---1---------------------------------------------------------------- --------------1---------1-----------1-------------------------------------------------------------------------------1-1-----1------------------------------------------1---------------------------------------------1------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------1--------------------1---------------------------------------------------------------1---------------------1---------------------------------------------------------------------1---1----1----------------------1------1-----------------------------1--------------------------------------1----------1-----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1----------------------------------1-11--------------------------------------1---------------------------1----------------------------------------- -----1--1-1111-223--11--1-----------11--1----1----1-1111----1----1----1---------2---------112-11------1-1---2163453371314311731436331626123231234221115213242211-2231--113-2122--2-41---1---1--2--1-221
 d-coil protein (DUF2353)          *                                                                               *         *           *                                                                               * *     *                                          *                                             *      **                                                                                                              *     *              *                    *                                                               *                     *                                                                     *   *    *                      *      *                             *                                      *          *                                               *                                                                      *                                  * **                                      *                           *                                               *  * **** ***  **  *           **  *    *    * ****    *    *    *         *         *** **      * *   **************************************************** ****  *** ****  * **   *   *  *  * ***
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3646] PF05694            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 SBP56:56kDa selenium binding   ------1111111111--11----1---------------1-------------------------1- --1----1-----------------1-------111-------1----------------------2---------------1-----11---------------------------------------------111------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1------------------------1--1--1----11---1----------1------1-3--------------------------------------------------------111111-----1111------112111-----1------------1-------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------111-1111----------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- --11----11-----12111-1-1-1--------1----------1--1--111-1121------------------------------1--2---111------2--1-4122121222123245-115321221-232231211221242-1122612541121214122311-31-----213116-42-------
 protein (SBP56)                      **********  **    *               *                         *    *    *                 *       ***       *                      *               *     **                                             ***      *                                                                                                                                                                                                          *                                      *                        *  *  *    **   *          *      * *                                                        ******     ****      ******     *            *                                                 *                                                              *                                                                                 *** ****                *                                                                                                                                              *      **    **     ***** * * *        *          *  *  *** ****                              *  *   ***      *  * **************** ********* *************** ********************** **     ****** **       
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[3647] PF00838            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                   2                                                                    
 TCTP:Translationally controll  ---------------------------1---------------------------------------- -1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111121--422111-1111111121111111111111111111111-11121111111111111113111111112111111111111111111111111211112-1120111111112115133181784-123111331-32211-121-512121221121-1111211131--------132231211-2111-
 ed tumour protein                                         *                                          *                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                ******  ****** ******************************* *********************************************************** ************************* ********* ***** *** ************ **********        ********* **** 
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 DUF1722:Protein of unknown fu  ----------------------------------1---11111---11-1111--------------1 --------------------------------------------------------------------------------1---1-12-------------------------------------------------------------------------------------------------1111-11-11111111-111111------111---------------11111111111111111111--1-1------11-------------1111---1-------------11111111111111----------11-2--------1-------------------------11--------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1112111111111-1-1111-111111--111-------------------11-----111-1111-111111111-111111--111---111--------1121111111111112-111111111111211121211111--21111121111111112111111111-111111111111---1---------112-1-------------------------11111111111111111111--------1111-1111111111----------------1---------------1---------------------------1------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------1---------1---21----------------------------------------------------12------------1------------1--------
 nction (DUF1722)                                                 *   *****   ** ****              *                                                                                 *   * **                                                                                                 **** ** ******** ******      ***               ********************  * *      **             ****   *             **************          ** *        *                         **        * *                                                                                                                                                         *                                           ************* * **** ******  ***                   **     *** **** ********* ******  ***   ***        **************** ************************  ************************** ************   *         *** *                         ********************        **** **********                *               *                           *                                                                                                             *         *   **                                                    **            *            *        
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 Pacs-1:PACS-1 cytosolic sorti  ---------------------------------------------1---------------------- -------------------------------------------------1-------1------1---1-----------------------1---------------1-------------------------------------------1-----------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-22-1--111-1112----1--------1-2111-2----11-1-11-----------11--------------------1-2211--1--12-31----1212354852213-222632325232229-32133521130323213242413332111131361222---1---1-22--1---1----1-
 ng protein                                                                  *                                                                        *       *      *   *                       *               *                                           *                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *               **                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                  *** ** *  *** ****    *        * **** *    ** * **           **                    * ****  *  ** **    ************* *************** **************************************   *   * **  *   *    * 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3651] PF03568            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Peptidase_C50:Peptidase famil  -------------------------------------------------------------1------ --1----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-------------1------1-------------------1-23-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111-11111-----------------1----------------------------------------1----1--11-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------1-------------------------------------------1---------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1-------2---------- 1122111-211111111111221111111111111111112111111111122311111111111121-11211131131112211111131121911211211121112311111-2-112111111-191111111211121111111111211-2111111112111-421-2111221-11111212121111-1
 y C50                                                                                       *         *                                        *                                                                                 *             *      *                   * **     *                                                                                                                ***** *****                 *                                        *    *  **     *                                                                                                                                                             *                       *                                           *                                       *                                                                        *                                                    ****                                                                                          *                                     *       *           ******* ************************************************************ *********************************************** * ********* *************************** ************* *** ******* ************** *
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[3652] PF00101            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4     2             
 RuBisCO_small:Ribulose bispho  -------------------------------------------------------------------- ---1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------7555555554411111125555564111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------112332-11211----------------------------------11-1-----11211-----------1-----2-------------------------------------------------------1--------11-21------2-------1----1--1---------111------------------------------------------------------------22---------------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------1--- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12533323218688-52---1---
 sphate carboxylase, small cha                                                                          *                                                                                                                                             *************************************                                                                                                                                              *                                                            ****** *****                                  ** *     *****           *     *                                                       *        ** **      *       *    *  *         ***                                                            **                                 ****                                                                                                      *                                                         *                                                                                    *                                                                                                                                                                                   ************** **   *   
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[3653] PF08372            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                       112 1        
 PRT_C:Plant phosphoribosyltra  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-------1--------------------------------------------------------------------------------------1-1---2--1673572211222161152124153613313122122132321524223139221112115-411-1113211116332-74------2
 nsferase C-terminal                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *       *                                                                                      * *   *  ************************************************************* *** ************* **      *
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 EBP:Emopamil binding protein   -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11--11--11132332333343222222222222222222224434344333322333---------------------------151221111----111--2-16311-33122222322222752-2332222522212212221141--21----12--------2211------1111223121-----1
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 CKS:Cyclin-dependent kinase r  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 11-1111-3111-121111-111111-111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222121111--1223-22-31212222346232674-4381222222222222212231112233113111222-223111-18111212112122-1111-1
 egulatory subunit                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ** **** **** ****** ****** ********* ********************************************************************  **** ** ***************** ************************************* ****** ************** **** *
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[3657] PF06220            291                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 zf-U1:U1 zinc finger           -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1111-1---22-1221111212--2212221-11111-1111211111222--1-2212-1-1211111-1111111111111221--222221112132-21-121432221-114312222231383-315142251222-231121231222222-2223-3254-133-111-11112123221-112212-
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 DUF607:Protein of unknown fun  ------------------------------1------------------------------------- ----1----------------------------------------------------------------1-----------------------------------1----------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------1-------------1-------------------1---------1-1---------------1111------------------------------11----------------------------------------------- ----211-844--12--1111111112-------------------1111111111211111---------1-----------------121-11-111---1----1-14342313223223231232642-32421234123222122222312222131212416111112--21-3111213537271--2334-
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 Vault:Major Vault Protein rep  ------------------------------------------------------------------1- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----094-368------------------------------------------------------------------------------------------------8-18-83484232144444483078-28812132444--42244--424-4444-466--------64-------------------1333-
 eat                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *** ***                                                                                                * ** ******************** ***********  *****  *** **** ***        **                   **** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF2781:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------1-------11111121111-1111211111-111111-111----1-111111111111111111111111111111-111-1-11111111111-1212-1312574433332233354243603-5452222423313322232263231311-111---------11-1111111113311331-----1
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[3663] PF05184            290                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13    1                        1                          1           
 SapB_1:Saposin-like type B, r  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----47-----------------------------------------------------------------------------------------------------1-2154253421-224333192566-762221262154-22-232141633122523812-11-1134---1-----23547-32-------
 egion 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     **                                                                                                     * ********** ************ ************ ** ****************** ** ****   *     ***** **       
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[3664] PF08515            290                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1    12                                                                    
 TGF_beta_GS:Transforming grow  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2667777434245268472248-569353374355434435324353544511-2215226--2-------------------------
 th factor beta type I GS-moti                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ********************** ****************************** *******  *                         
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[3665] PF01166            290                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11   13    1                                           1                   
 TSC22:TSC-22/dip/bun family    -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------197588431132824118271729532142534491332143163222411121111811133------1-------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ***************************************************************      *                   
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[3666] PF01328            289                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           211                                                                          1                                                                                                1      11 
 Peroxidase_2:Peroxidase, fami  ---------------------------------------------1---------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1 -----1--------4083553426553221222----------1228444483811442111---------------------------3868835-----531-3-----------1--------------------1----------------------------------------------1-1-0----7802-
 ly 2                                                                        *                                                                                                                                                              ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *      *        *******************          *******************                           *******     *** *           *                    *                                              * * *    **** 
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[3667] PF02158            289                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1 1 14  1 1                                                               
 Neuregulin:Neuregulin family   ---------------------------------------------------1---------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1------------------1-----------------1---------------------------------------------------------------------------11111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------111-1--------------------------1----------------------------1-----------1--1----11--11--1--------11263454132223293231669-45021225222322212232657333221----111----1--------------1-2----1---
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3671] PF04695            289                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Pex14_N:Peroxisomal membrane   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11--211-113112222322222223222222322222222222122222212321121111111111111111111-111111112212121111112323-11-51514-41-1111-1213-353-124111-21132-211-1-11111--121-111-113211-111-11--111234231--12133-
 anchor protein (Pex14p) conse                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               **  *** ********************************************************************* ************************ ** ***** ** **** **** *** ****** ***** *** * *****  *** *** ****** *** **  *********  ***** 
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[3672] PF01549            289                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        5 2                                                            121     2                   
 ShK:ShK domain-like            -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------0-912222-1------12-31371-1-1-1-111-11---1----2--221166-822-----653--572944532-443-3-35----2
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                     * ****** *      ** ***** * * * *** **   *    *  ****** ***     ***  ********* *** * **    *
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[3673] PF04500            289                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             14                               1    216                             
 FLYWCH:FLYWCH zinc finger dom  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------23--23186463476385822--3244--41--2-----------01327196-12---------------------1--1-
 ain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *      **  *****************  ****  **  *           ******** **                     *  * 
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 MAF_flag10:Protein of unknown  --1-111111111111--11--11-----1--111111111111111121111111111111111-11 ---------------------1------------------------1------------------1-------------------1-------1-----------------------------3----------------1---------1------------2-1-----1-----3-------------------------------1--------1-2---------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-1421111111313--332----23----321---1-22--1---1----------------------------------------------------1----1---1------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------11--1-1-12--1-----1-12---------1111-764455222222222122----22-1----1--122221112--22221211-----------------1--------1---------1--------------11---1--1--------------2------------------------------------1-1--------------------------------11--1112-111---------1-----------1------------------13333333--------44-------------------------------------1-- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------
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 DUF2428:Putative death-recept  ----------------1--------------------------------------------------- ----------------1--------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111----1-----1--------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------1--------------------------------------- ----112-221-112-13112132131111111111322223211112111111111111211111111-111111111111-1-1111--11---3221121111-1-132113-112221112224107215111111221112222-21111111122122231522-1122111111111112111111-1111-
 or fusion protein (DUF2428)                    *                                                                    *        *                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                             *  *                                                                                                                                                                                ***    *     *                                            *                                                                               *                                                                                                                               *     *                                                              *                                            *** *** *** ***************************************************** ************ * ****  **   ********** * ****** ********************************* ******************** ********************** **** 
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[3676] PF03594            288                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BenE:Benzoate membrane transp  -----------------------------------1-------------------------------- ----1--1111--------------------------122--1-1----11-11---2----1---1--------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------212---------------------------------------------11------------------------11---------------------------1----------------------------------------------------1----------------11--1---11-------1-----1--------11---1-1---111-111112----------1--111111111111-1------1111-11---------------1-----------------------------------222122223222111122111111112221211---1--111121--12-11----11------------111------1----1--------------1---1--------------------------1-11--1111--1111---1111----1---------------11---111111111111--1112111-1-1111111-11111-1-111-1111-11111-12---------1---------------------------11---------------2222212-2-1-11113331133322111--------------11111-----1111111-22---------------------------------------------------------------- --------------------1-------------------------------1-----------------------------------------------------------1-----------------------1------------------------------------1--------------------1----
 ort protein                                                       *                                     *  ****                          ***  * *    ** **   *    *   *                                                                    *                          *                   ***                                             **                        **                           *                                                    *                **  *   **       *     *        **   * *   *** ******          *  ************ *      **** **               *                                   *********************************   *  ******  ** **    **            ***      *    *              *   *                          * **  ****  ****   ****    *               **   ************  ******* * ******* ***** * *** **** ***** **         *                           **               ******* * * *****************              *****     ******* **                                                                                     *                               *                                                           *                       *                                    *                    *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3677] PF04305            288                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1         
 DUF455:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------11-------------1---------1--1-------------1-1----------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111-111-11--------1-111111111112----111-----111-------------21--------------------------------111-111111111111111111111111111111111111111211111111-1111211111111111----111----------------------------2--11111111111-2---------11111---------------------------------1--1------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------11--111--------------------------------------1--------------1111111111------1-111111-------------------------------------------------- ------1-------11---111211112211111---------111-------------------------------------------131-1211111111------2-31--11--1-----11---------1----1-1-11--------11-1----------12--1--22292222221-3533--3232-
 ction (DUF455)                                                                                                                                                                        *                                        **             *         *  *             * *                                        *                                                            *                                                                                                                               ******* *** **        * ************    ***     ***             **                                *** ************************************************ ****************    ***                            *  *********** *         *****                                 *  *                                                                                                      *            **  ***                                      *              **********      * ******                                                         *       **   ***************         ***                                           *** **********      * **  **  *     **         *    * * **        ** *          **  *  *********** ****  **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3678] PF03531            288                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 SSrecog:Structure-specific re  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1211111-311-22122112222221211112122222222221111111222222111111111222-11111122132211111121132211111111112131151213113-112112122121131-111-111-211-11121111212111131111111111521212220222-112322112211111
 cognition protein (SSRP1)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ******* *** ******************************************************** *********************************************** *************** *** *** *** ************************************** ***************
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[3679] PF04824            288                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Rad21_Rec8:Conserved region o  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --12--1-----12211111111111111111111121-11111111111223311122222111111111---1111111--11-1221-111--1111-11-2--1111333132212222233131523122512123-225-2112321721112-2-1121111-4241111-11122-2-4541611-1111-
 f Rad21 / Rec8 like protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               **  *     ************************** ********************************   *******  ** **** ***  **** ** *  ********************************** *** ************* * ******* ******* ***** * ******* **** 
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[3680] PF07541            287                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 EIF_2_alpha:Eukaryotic transl  111111-1111111111111-112111111-11111111111111-111-11111111111-1--111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-311111111111111111111111111111111111111111111111121111111111-11211-11111111111111121111111111111121121211112211111111111-121-11111112-111111111-31111121--11111111-1121111101111122331311111112
 ation initiation factor 2 alp  ****** ************* ********* ************** *** *********** *  ***                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ******* ************************************************************ ***** ***************************************************** *** ******** ********* ********  ******** ****************************
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 X interacting family                         *                                         **   *                                                                                                                    *             *           *   *                                                                                 *        *                                        *                                                          *              *                  *                                                    *           *           * **                                                                                                                                                                                            *             *                         *                                                           *                                                                      **** ****                                                                                                          **** *   ***  *        *                   ***   *          *   *        *                  *      *    ********************************************************************      *   **** **   ****
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