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Ranking of RP:PFM:REP : from 3701 to 3800

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3701] PF02309            286                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1466 61       
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 CaKB:Calcium-activated potass  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------1-------------------------1----------------------------------0433336343334366264578-7503343434543433244443432446447--11---1-2-----------1--------1----
 ium channel, beta subunit                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                         *                                  ********************** *******************************  **   * *           *        *    
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[3707] PF11705            285                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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 RNA polymerase III subunit Rp                                                                           *                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                    *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                           *  *** *** ****                                                                                                                                  *   *                                                 *****        ** ************************ *************************** ******************** ******     * ***    **********  *************** ******************* **** *** *** ****          * ****  *  ** 
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[3708] PF09794            285                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                           
 Avl9:Transport protein Avl9    -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------- 1---111-1---111112-22222222222222312222222222222222323222222221111111111211211-113311211212211111111121122-2--3211241111121113121571132611-12111-11111121311222---111112329-1211-------------2---------
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[3709] PF03895            285                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
 YadA:YadA-like C-terminal reg  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------33321--1----------111-1-1-11-----------------------------------1-------------------------------------------------------------345676433322163666623533-2------1---------1------------21211------------------------------------------2--------------------------------------------------1--------------1---12--221-21211-3--131511122111-111-------3111-1111111111-1-1111-11--223134323343------------------1-125111-13-112--------1------------------------------1-------------11--------2222------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Methyltransf_15:RNA cap guani  --------------------------------1---------------11111-11111-1------- -----------------11-11--121111111111-----------------------------111-1-----------------------------------------------------------------111-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-1--22121111-11111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111112111121111111111-11121212111211-1111121111-113111111111111111111151112421-12211172211112-211-1111111312322321
 ne-N2 methyltransferase                                        *               ***** ***** *                         ** **  ************                             *** *                                                                 ***     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ** *                                                                                                                                                    ******* *  ******** ************************************************************************************** ************** ********** ****************************** ************** *** ****************
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[3714] PF08512            284                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Rtt106:Histone chaperone Rttp  --------------------------------------------------------1----------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------------------------------1--1---------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2111211-4111222111-1121111222111111311111112211111111111111111111112-11-11111-111111111111311221112111211111-15111211211112312-11171-1242211211121122111222--121331221221232211111131111112242211211112
 106-like                                                                               *                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                   *      *                                     *  *         *                                                                                                                                                                                        ******* ********** ************************************************* ** ***** ****************************** ***************** ***** **********************  ******************************************
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[3715] PF12417            284                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             23    1                                                               
 DUF3669:Zinc finger protein    -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1-221----1121------1--1-----------24--2--1---223------------------------------2--2-----1--------------44432335984870971765452396666166--62284111---------------------------------5-------
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 Phage_Mu_F:Phage Mu protein F  -----------------------------------11-------------1----------------- 1--------------------------------111-1----------------1------------------------------1---------------------------------------------------------1------------------------1---------------1----------------1-----1-111-1-1---1---12-----1-11-----22122141-112-2---11--2-1----1--------31---1-2-------------1-1122221111212-----------4--1-1-1112-1--2--1---1111--11------------------------------5------------------------------3--1------2-----11-13-------2---11-------------11------------------------------------12-12---3--1----11---------2--1----1--1----1-1-------1-11---12-1--------1-----3----22----------------121---1-1----------------------1------1---11---------2-------1---2-------2---1--1-----1------2-2-11----------11-1-2211----1-1--13-2-1----11--4----------1-1--1----------1---------1222-21-1-42333311-------1-1-1--11----1---------------2--2---------------2111--------------------------------------------------1--------- ------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------
  like protein                                                     **             *                  *                                *** *                *                              *                                                         *                        *               *                *     * *** * *   *   **     * **     ******** *** *   **  * *    *        **   * *             * *************           *  * * **** *  *  *   ****  **                              *                              *  *      *     ** **       *   **             **                                    ** **   *  *    **         *  *    *  *    * *       * **   ** *        *     *    **                ***   * *                      *      *   **         *       *   *       *   *  *     *      * * **          ** * ****    * *  ** * *    **  *          * *  *          *         **** ** * ********       * * *  **    *               *  *               ****                                                  *                                                                *                                                                                                                                     *          
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 UDP-g_GGTase:UDP-glucose:Glyc  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------1-----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-211-11111-2111111111111111111111-221111111111111111111111---111-1211111111111111122111211111111111-1312443414222211242242443-433233212222222223223252221-311112111422211-11111111---2111-2-11--
 oprotein Glucosyltransferase                                                                                                       *           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                   *** *** ***** ********************** ************************   *** ********************************** ************************* *************************** *************** ********   **** * **  
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 Otopetrin:Protein of unknown   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------- ------5--------------------------------------------------------------------1-----------1-----1-----------1----32843243-1132365133403-33612--444541222331-432348231676376567585-----------1-------------
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[3727] PF12157            283                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3591:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------------------------------------------------------------------11-----------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1- 1122131----111111111111111232111212122121121222211111111111111111121111111111-11121111111131111111111111121112211121311111-132211593-33111211113-1121131-3221112231112141131121111121111122341212--1311
 nction (DUF3591)                                                                                                                                                                                                                                                                            *                           *                                                                                                                 *                        *                                                                         **                 *                                                                                                          *               *                                                                                              *            *                                                                                                                                                                                                                                             *  *******    ****************************************************************** ******************************************** ********* *********** ******* ****************************************  ****
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[3728] PF04358            282                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DsrC:DsrC like protein         -----------------1131221-11----------------------------------------- -1-------------------------------------------1--------------111-------------------------------------------------------------12111111121---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------122111---12--------2---------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------9-------------------11121111121111--------1-------1---------------------------11111-1111111111111111111111111---21511-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111---------1-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111--------------331--------------------------------------------------------- ------------------------------------1--------------------------1-------------------------------------------------1--------1----------------------------------------------------------------------------
                                                 ******* **                                           *                                           *              ***                                                             ***********                                                                                                                                                                                                                           ******   **        *                                                                                       *                                                                                         *                   **************        *       *                           ***** *************************   ***** ******************** **************************************************** ****************         * ******************************************************** **************              ***                                                                                              *                          *                                                 *        *                                                                            
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[3729] PF05015            282                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Plasmid_killer:Plasmid mainte  -----------------------------------------------------------1-------- 112--2---1--------------1--------------1-1------11---1-1------------------------1-------1----1--------2--141------------------3-11--3------------21----6-----------1--11--------------------------------------------------------------------------------------1------1-11--------------------1-1---------------------------------------------------------------------1--11-------------1----34-4-11-23-227-1-----------1-111---31-12-1-------1-1222-1-------------------122--126--------------------------------21-------11----------1-------1----11---1------1-11-1--11--1-1-1-----43-1--1132-----1-111-12-11-2-1-------1------------------------111----1--21------------1--1-------35--1------23----2---1-223---------2-1--21-----2----123------------1----1---------1-------------11111111---1--1----1-1-11113---------1---31----11-2-111--2--------------1-11211---------1--1112222--1-2111------------1--------------------------1------------ -----1-----------------------------------------------1---------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1-----
 nance system killer protein                                                               *         ***  *   *              *              * *      **   * *                        *       *    *        *  ***                  * **  *            **    *           *  **                                                                                      *      * **                    * *                                                                     *  **             *    ** * ** ** *** *           * ***   ** ** *       * **** *                   ***  ***                                **       **          *       *    **   *      * ** *  **  * * *     ** *  ****     * *** ** ** * *       *                        ***    *  **            *  *       **  *      **    *   * ***         * *  **     *    ***            *    *         *             ********   *  *    * * *****         *   **    ** * ***  *              * *****         *  *******  * ****            *                          *                  *                                               *                                             *                                                                                             *     
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 PMEI:Plant invertase/pectin m                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1320 8        
 ethylesterase inhibitor        -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1----------------1-------------------2298-94-------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                               *                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  * *                                                                                                                                  *        *                *                   **** **       
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[3734] PF01159            282                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 Ribosomal_L6e:Ribosomal prote  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-521-111112211111111111111111121111111111111111111111111-1111-111-21-2-1-1111--1111111111111111122411-12211-12111116129-61284-12811111111-111112111-111111-1311122111111111151111142222311132221
 in L6e                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ******* *** *************************************************** **** *** ** * * ****  ********************** ***** *********** ***** *********** ********* ****** *************************************
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[3735] PF03164            282                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Mon1:Trafficking protein Mon1  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-311-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111-1111111111112111111111121111-131152224421212223314286213241222422511222-22-212132121111-211111121-1111111113114111--21111
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 Porin_O_P:Phosphate-selective  -------------------------------------------------------------------- --1--------------------------------------------------------------------------------1321-3334-311---2311--1-21-----------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-32112-------111-1------------------22122-21--2---------------1-1----------33333333-1111-2-------------------------------12111-----------------------------------111------1-------1213--1------113---12-------------3322214--221324-------------------------1111---1-21-3--21221-2--11-2-22-23---21-1--------------------------------------------------------------------------------------------1---------3-------------------------------2232-1--211111---------------------------42464664442222----111111-----------------------------------------------2-- ------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------3---1
  porin O and P                                                                                        *                                                                                **** **** ***   ****  * **                 *      *                                                                                                                                                                                                                                              * *****       *** *                  ***** **  *               * *          ******** **** *                               *****                                   ***      *       ****  *      ***   **             *******  ******                         ****   * ** *  ***** *  ** * ** **   ** *                                                                                            *         *                               **** *  ******                           **************    ******                                               *                                                                                             *                                                                                                       *   *
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 Methyltransf_8:Hypothetical m  -------------------------------------------------------------------- ------------1----11-1-11--11111-1------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1--------------------------------------------------------------11-----1--------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1---------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1-1------------1-------1--------------------------------------------------------------------------------------1------------ 1111111-2111111111111111111221212111111111111212111212121221111111111111111111111111111211421121112221113111313112221111-111211111211111111221111121-111-12-2-1121113-111131211121181111112311122111121
 ethyltransferase                                                                                                *    ** * **  ***** *                                                      *                                                                             * *                                        *                                                                                                       *                                 *                                                              **     *              *                                                                                                                                        *                                   *                           *                                                                                                                                                           **  * *            *       *                                                                                      *             ******* **************************************************************************************************************** *************************** *** ** * ******* *********************************
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 Cys_knot:Cystine-knot domain   -------------------------------------------------------------------- ------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2365533314145545381830-90434244246624343533445344111-1-1-211-----------------------------
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 Rad9:Rad9                      -----1-------------------------------------------------------------- ---------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --11111-21--1111111-11111-111111111111111221-1-111111112111111111111112111111-11111111211-2211111111111112-1112142222222122232232182-224111132242122122112121223211111121121121-11131111121121111221121
                                     *                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ***** **  ******* ***** ****************** * ****************************** *********** **************** ************************* ****************************************** ***********************
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[3748] PF04245            280                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NA37:37-kD nucleoid-associate  ---------------1-----------------------------------------1-1--1----- ---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1------------------------1--------------------------------------------1-----------------1--------------------------------------------------1-----1-1--111111-------------111---111--111-1--11-1121-211------1-------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1-------1---11-------------111-------------------111211111112222231222221211211-------------11111111111111111-1111111111112111111111211121111111111121211111111111-111111111111---------------112121111-111121111---1-----1112212322111111122----------11111111111113------1------------------------------------------------------------------- --------------1-----------------------------------------------1-1--------1-------------1-----------1---------11-------------2--1-1211212---11-------1-11------------1--3-----1-------------------1-----
 d bacterial protein                           *                                         * *  *                                                                                       *                                                             *                        *                                            *                 *                                                  *     * *  ******             ***   ***  *** *  ** **** ***      *                                                                                                 **                                                                                                                         *           *       *   **             ***                   ******************************             ***************** **************************************************** ************               ********* *********   *     *******************          **************      *                                                                                  *                                               * *        *             *           *         **             *  * *******   **       * **            *  *     *                   *     
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3749] PF06133            280                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF964:Protein of unknown fun  -------------------------11-1-1------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3333333333333333332233333333223333333332223333333333333232333331-1--111111111---11111-1111112221221111111111111111111111111112221112---------------1------------1---1332---1---11-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1-1---------------------------1----------------------------------------1-1---13-----------
 ction (DUF964)                                          ** * *                                                                                                                                                                                                                                    **************************************************************** *  *********   ***** **********************************************               *            *   ****   *   **     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                       * *                           *                                        * *   **           
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 DUF619:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---1-111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-2-------------------------------------------------------1--------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------11111111111111----111111--------------------------------1----------------- 1---22--------23222222224122222222222222222222222322222231222222222222322222212222222222223222233222232232----111111-111111111111161-111-1-11--11-111-1--11---1----12--------1---------------2---------
 ction (DUF619)                                                                                        *                                                                                                                                                                                                   **   * ***                                                                                                                              * *                                                       *                                            *                                                                                         *                                                                       *                                                                                                                                                              *                                                                                  **************    ******                                *                  *   **        ********************************************************************************************    ****** *************** *** * **  ** *** *  **   *    **        *               *         
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[3754] PF08083            280                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 PROCN:PROCN (NUC071) domain    -------------------------------------------------------------------- ----------------1------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------- 11111111311121111112221111111111111111111111112111111131111111111111-11-21111-111111111112111211111111112112118131121211112132211261-113222121111211211112112-1--9112221112112111116111112-121211711111
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 BHD_3:Rad4 beta-hairpin domai  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111-211-11122222222322222222222222221222222222222222222222112111-22121212-222222222221212-11111111-111-121211111--11-11111111221-1211--111111-111-2111122111112111135411111111121112111112121-1121-
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 tion DUF82                     *************************  *****   *       ** ***    ************      *            **** *   * *****     * **                          *****           **                      *                     *         ****  * ** ***  **      ** ****                                                *                                                                                                                                        *     *            *    *                                   *                                                                                         **** *     *********** *****  ***       *     **              **   *   *                  *  *** *                       *                                                                                                                                                                            *                                                                                                      **   ******          * ***                                           ** *                                                 ****  *****  *   ** ***** *****  ****  ****** **** ***** *    *  *  *   *   * ** * ****  ** 
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 DUF3384:Domain of unknown fun  ------1------------1------------------------------------------------ ----1---------------------------------------------------------------------------------------1------------1---------------------------------------1----------------1---11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------- ----212-1---1-1--112211212111111123211111111112211221211111111111-11----111--2--1-1211222--1--1---1--21--1-1--21225-121-11218418-015-5371111412111112-3-1113211111-31121112-312----------111-11-122111-
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 MRJP:Major royal jelly protei  -------------------------------------------------------------------- -12------------------------------111---------1---------------------1--------------1-----------------1---3----------------------1-----------------1---22---------------1-----------------1-------1---------------1---------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------------------------32-14-44------------1------------------22222222-442----------------------------------------111----1-1-------1---------1------------------------------------------1--------------1-1-1---------1---------------------------11--------1---11-1-1------1--------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1---1---11------1-2------------------------1-----------------11---------------------------------------------------3-- --------------22332-----1--11-111-1-----------32-----------2121---------1-----------------423-4----------1--1163112--------1-------------------------------2----------65374---------1--------3-1-------
 n                                                                                                    **                              ***         *                     *              *                 *   *                      *                 *   **               *                 *       *               *         *                                                                                                                                                                     *                        ** ** **            *                  ******** ***                                        ***    * *       *         *                                          *              * * *         *                           **        *   ** * *      *                                                        *                                                                                       *   *   **      * *                        *                 **                                                   *                 *****     *  ** *** *           **           ****         *                 *** *          *  *******        *                               *          *****         *        * *       
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[3763] PF06130            279                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PduL:Propanediol utilisation   -------------------------------------------------------------------- --2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22----------------------------2214---44444422--------------------2-2----------22---------------------------------------------2----------66-22222222424-422222-64---2--6-66-6-----42-----2--2---------------2--2---------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------2-----------------------2-2-------22-2------------------------------------------------2-2-------------------2----2---------------2---------2-2222-------22-2--22-----4242----22222222222222222-------2--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22222---------------------2222222222-2-- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 protein PduL                                                                                          *                                                                                                                                                                                        **                            ****   ********                    * *          **                                             *          ** *********** ****** **   *  * ** *     **     *  *               *  *                                                                     *                                                                               *                       * *       ** *                                                * *                   *    *               *         * ****       ** *  **     ****    *****************       *  *                                                                                                                                   *****                     ********** *                                                                                                                                                                                                          
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 aG DnaB-binding                                                                                          ****** ******* ************************                    *******                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                ****** ***                                                                                                                         ** *  **              **  ** *************                                                           ***  **************************  *** *********************** *******************************************************************************    ***************          *******************          **** ***********************                                                                                                                            *                      **                *      *                                                                 *                     
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 Channel_Tsx:Nucleoside-specif  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------1-----------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------11------------------------------1-----------1-----1------------1-2--------------1-1------1111----1--------------------------11-1--2--1-2222222422222222232-------------11111212114234411-112244414214111211211111221323233333333332311111111--11111111111----------------21----------------11111-2-1---23222233233232212-----------1121111112111-------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1--------
 ic channel-forming protein, T                                                                                                                           *                                   **                                                                                                                                                                                                                                                                                                *             *                                            *                                                                   **                              *           *     *            * *              * *      ****    *                          ** *  *  * *******************             ***************** ***************************************************  ***********                **                ***** * *   *****************           *************                                                                                                                                                                                                                     *                                                   *        
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 DWNN:DWNN domain               -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111-----11111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111-1111111111111111121111111112111111111211326211111--43121473-316111111111111--11151111-2211311111-21311111141111-323211311-1111
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[3767] PF08623            278                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 TIP120:TATA-binding protein i  ------------------1------------------------------------------------- --1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-------------------------------------------------------1---------1---------------------------------1-------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-311-11111111111111111111111111111111111111111211211111111----1--111-------111111112111111111111111111121231252222332241224022223111121213112112215232221341224-11115121-1111111-12113111111111-
 nteracting (TIP20)                               *                                                    *                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                  *              *                                                       *         *                                 *                   *                                                                                                                                                                                                                                                                          *** *** *****************************************************    *  ***       ************************************************************************************ ******** ******* ************** 
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[3768] PF06964            278                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Alpha-L-AF_C:Alpha-L-arabinof  -----------------------------1-------------------------------------- 225-2---------------------------------------333-222-211---------4--23--2111155----------1143-3------2-114---1------------------------1----11-----------------------------------------------22-112---------------221112-----1-----------8----------------------2------------------1------------------------------------------------1--11----------3-------1-1----1---------------1------311--------------------------------1-------1--111111-11211--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1--1------------1------1------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------------------------------11111111-------------------------------------------------------22112-6-- ------2--1-----221211123333---------1------11132--324311322111--1------------------------221212-1-1---2-1---2-------------------------------------------------1-------------1----------222583222-------
 uranosidase C-terminus                                      *                                       *** *                                       *** *** ***         *  **  *******          **** *      * ***   *                        *    **                                               ** ***               ******     *           *                      *                  *                                                *  **          *       * *    *               *      ***                                *       *  ****** *****  *                                                                                                               *                                                                                   *  *            *      *                  *                                                                                                  *                          *                                           ********                                                       ***** *         *  *     ************         *      *****  ************  *                        ****** * *   * *   *                                                 *             *          *********       
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[3769] PF02614            278                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 UxaC:Glucuronate isomerase     -----------------------------2-1------------------------------------ 111----1111--------------------------------1111-11-1111--2----11-11---1----1------------111111------11-12-111-----------------------------------------------------------1-----------------------1---------------111111-----1-1---------1------------------1---2------------221-----1111111111---------1-----------1------21---111111-13----------2----1--1--1--1---------------11------1111-------------------212--1-11----------11-----111-111111-1-1---111111------------------------------------------------211------111111----------1----11--------------------------------------------------------------1-----------1-----------------------------21-2----1--------------------------------211111-1111111111-11111111111111111111111111-1111111111111111111-1111--111111211111---------------1-11111-1-1--1-11------------1------1-----------------------1------1-11--11111111-------1--------------------------------------------1--11111-1-1 ----------------------1--------------1-1-11---1----------------------------------111-----1-----1---------1--------1-------------------------------------------1-----------------1--------2-------1-----
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Chromo_shadow:Chromo shadow d  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-------45---111---1-1-111111-1111111221-111----------1---------------------------111---------------1------555653334434338353924-348434252253333333233143331-1-11526233122-------------1-1---------
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 SK_channel:Calcium-activated   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2968645443345270244785-6681443534772442232253133212222521711383--------------------------
 SK potassium channel                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ********************** ****************************************                          
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[3777] PF10515            278                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1 15  1 1                 1                                             
 APP_amyloid:beta-amyloid prec  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1354963322234386213576-143233263342133316-2038123--1211111114121-------------------------
 ursor protein C-terminus                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ********************** ****************** *******  *************                         
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[3778] PF01922            277                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SRP19:SRP19 protein            1111-1--1111111-11111111111111111111111111111111111111111111----1-11 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-6111111-111222111-1111111111111111-111111111111-11122211111111111111111111111111121111111-111111111121211111211111-22112-231-122-21-2-111111211111111121--11111121121111111311111111211111112-2
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 associated factor (TAF)                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ****      ****** *********************************************************************** ***************************************** *** *******  *********  ************** *********** ********  **** 
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 GPP34:Golgi phosphoprotein 3   -------------------------------------------------------------------- --1-2------------------------------------1--1--------1----------212231--------------------------------------------------------------------------------------111---------------------1---------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----2-1-----11111111111111111111111111111111111111111121111121111111-112111111112111111111211121111112112321--4321142212223131231412-325222222223222222222233221211111132111111--------------1---------
 (GPP34)                                                                                               * *                                    *  *        *          ******                                                                                      ***                     *                           **                                                                                                                               *                 **                                                                                                          *                                                             *                                                                  *                                           *                                                                                                          *                                                                                                                                                                                * *     ******************************************************** ***************************************  ********************** ******************************************              *         
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 Elongin_A:RNA polymerase II t  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------------------------------------------------------------------- ----111-------211111111-1--111111111112111111112121111111211-111112111-111111111111111111-1211111111-1111--1-12222222112721-12426755-3243342122--11121211413211211141214-151111-11-------21-1112-----1-
 ranscription factor SIII (Elo                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ** *                                                                                ***       ********* *  ********************************* ********* ****************** ********** ****  * ************** ******** **********  *********************** ****