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Ranking of RP:PFM:REP : from 4201 to 4300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[4201] PF04384            241                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF528:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- 11----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111111---------------1111------111111111-11111111111111111111111--111-----------1111111111121111---111------------------------1111-----------------------------11------1---1-11111-111111111111------1------111111-1111111-11-111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111---1---------1----111111111111---11111111111-11111111111111111----------11111111111111--------------111--------------------------------------------------------- 11------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 ApoO:Apolipoprotein O          -------------------------------------------------------------------- -1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------1111111-11111111111111111111111111111111111111111111211112112221111112222211-11111111111-12111-1--165414211-231284241502-32522224-24223111211312323---111--11-111-1------------1-1---------
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 HSCB_C:HSCB C-terminal oligom  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1----------------------------1111-1------1---11--121-11111111-----1---------------------------------------------------------11--1--------1------1111111111-1-------------1-1-11-1111111111-111111111111111111111111--1111111111111111111111111--111111111111-------------1-------111-11------111111111--------111----------------------11111111111--------------1----------------------------------------------------------- ----11-------------11111-11----1-----111111-1----------1---111----1----------1-----1--111-11---1-----1-----1-112-111----111121-3-141-111-1-11111-111-11111-11-1-1---11-112---1-111-1--11--111-1----111-
 erisation domain                                                                                                                                                                                                                                                          **                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                   *                            **** *      *   **  *** ********     *                                                         **  *        *      ********** *             * * ** ********** ************************  *************************  ************             *       *** **      *********        ***                      ***********              *                                                                **             ***** **    *     ****** *          *   ***    *          *     *  *** **   *     *     * *** ***    ****** * *** *** * ***** *** ***** ** * *   ** ***   * *** *  **  *** *    *** 
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 EcsB:Bacterial ABC transporte  ----------------------------1--------------------------------------- ----1-------1------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------12323233333333333111112333111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111211111111111111111111111111111111111111-11--------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1---------------------------------- ----11--2--------11------11------112-111111----1--------1-----------------------1------------1------1-----1--11--1-------11-----1454-1-2-1-----11-----2------------1----1---1--------------11-----1-1--
 r protein EcsB                                             *                                            *       *                                                      *                                                                                                    *                      *********************************************************************************************************************************** **                                                              **                                                                                                                                                           *                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                             *      *                                       **  *        **      **      *** ******    *        *                       *            *      *     *  **  *       **     **** * * *     **     *            *    *   *              **     * *  
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Arylesterase:Arylesterase      -------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------113--1111111-11111111----------111--112121---11111-----------------------------1-111----211112----422126-323331233232834-54423333333233233332332111---261------242-------------------------
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 Dynactin_p62:Dynactin p62 fam  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1---------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------ 1111112-1---11-111211112121111111111111111111111111111111111111111------1-1---1--111-1----111112-1111111-1-1--3211312123223253231733-3152221432312222222221111122111111112-1111--------------1---22111-
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 DUF940:Bacterial putative lip  --------------------------------------------------------1-1--------- --------------------------------------1--------------------------------------------1----6627-2------------1----------------1---------2--------------------------------------------------1----------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-------------------1-1-11111-----------------1--------------------------------------------------------1111-1--4---------1--------2--------1----------------1------------1-1---1----1---1----------------------------1-11--11121-1111---1111-1121---------------11-1-112221211121-222212121221122222111111---1111111111111111-2212222-------------------------------1---------------------------------11-------------------1111-----11111-------------------------------------------------------------------------- ------------------------1--------1---------1-----------1---1-1------------------------------------------1-----------1--12-1-3211-151-12111-11-1221-1-12-1-2--11--------------------1--1------1--1--121-
 oprotein (DUF940)                                                                      * *                                                *                                            *    **** *            *                *         *                                                  *                            *                                                                                                                                                                 *                                        *                   * * *****                 *                                                        **** *  *         *        *        *                *            * *   *    *   *                            * **  ***** ****   **** ****               ** * ************ ************************   **************** *******                               *                                 **                   ****     *****                                                                                                   *        *         *           *   * *                                          *           *  ** * **** *** ***** ** **** * ** * *  **                    *  *      *  *  *** 
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 PROCT:PROCT (NUC072) domain    -------------------------------------------------------------------- --1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-311-111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111--1-11111-1111111111121111211111111121111121311211-1111121111101-11211-111111111111--2211-1--01111111111111-11171111122321211211111
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 DUF1342:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1------11-------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-------111111---------------------------------------------------------1111-1--111-11111111111111111111--1-211------11111111111111112-1111111121111111112111111111111111111111111111122111-111111111111--111111111111-------------------------------11-1-----------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ---------------1---------1---------1-1----------------------------------1--------------------------------1-1-1-1--1-3------------------------1---1------------------------------------1--3-----------1-
 nction (DUF1342)                                                                                                                                                 *                                                                                     *      **             *                                                                                                                                                                                                          *       *                                                                                                                      **********************************************************       ******                                                         **** *  *** ********************  * ***      ***************** **************************************************** ************  ************                               ** *                       **************                                                                                          *         *         * *                                  *                                * * * *  * *                        *   *                                    *  *           * 
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 PEMT:Phospholipid methyltrans  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------11-------------------------------------1--1111111111-----------2-----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----222-21--223111211111111111111111111111111-1211111111111111111212111112111111211111112121111-1111121111-3114-11121111-11161121823-212-1--11131-1-111--112111---111---------13--141111111-212-11----1
 ferase                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                              *                       **                                     *  **********           *                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *** **  ********************************* ************************************************* ********** **** ******** *********** *** *  ***** * ***  ******   ***         **  ********* *** **    *
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 PAD_M:Protein-arginine deimin  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------111-------------------------------------------------------------11--------11-11------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-111--------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------111-------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------5221314554354465445805155135547536335642553443111---------11-----------------------------
 ase (PAD) middle domain                                                                                                                                                     ***                                                             **        ** **                  *                                                                                                                                                                                                                                               ** ***                                            *                                                                                ***                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                             *************************************************         **                             
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 Tmemb_14:Transmembrane protei  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----221-------1--11211121-1111---111-111-11111-1--1112-1-------11111-11-111-1-11111111----1----------1-111-1--322233311-122134142634-33612113112312-21211223332-----111-22---11211--1-12-64571641-221--
 ns 14C                                                                                                                                                                                                                                               ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ***       *  ******** ****   *** *** ***** *  **** *       ***** ** *** * ********    *          * *** *  ********* ************ ************** ***********     *** **   *****  * ** ******** ***  
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 Mt_ATP-synt_D:ATP synthase D   -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1-1--1-----1121111111111111112221121111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111112112----2121213111111163131242-219-1120-1321-1-111111111122112212312111111----11111312211-11131--
 chain, mitochondrial (ATP5H)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          * *  *     **********************************************************************************************    ********************** *** **** **** * ***************************    *********** *****  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 ATG13:Autophagy-related prote  -----------------1-----1----------------------------------------1--- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------11111111111111111111111112122121111111111111111121111111-11111111111111111111-3-12-21111-11212-12-223111-111111-22141581162411113112111111211311111111-11111212--11-2-1111-122234132-11111-
 in 13                                           *     *                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                           **      ******************************************************** ******************** * ** ***** ***** ** ****** ****** ************************************** ********  ** * **** ********* ***** 
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 TRAP_alpha:Translocon-associa  ------------------------1------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-211-111111-11111111222221111111111111111111111111111111---1----------------------1211-1111111-1112-11124721122-1211124-21741-2221121211111111111231111111-1111211-11111-111211111313313--------
 ted protein (TRAP), alpha sub                          *                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *** *** ****** ********************************************   *                      **** ******* **** *********** ******* ***** **************************** ******* ***** ***************        
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 DUF3779:Phosphate metabolism   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------244343333233233333333333233333234433234333233333223322132222322122233333-11411432222221111-2---------------------------------------------------------------------------------1-4---------
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[4239] PF08920            237                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SF3b1:Splicing factor 3B subu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1111111-311-111111111111111111111111111111111112112111111111111---------1-1-----------11111111111121111111-1112-11-12211122122222292-212111121222121122112122221341211121162121-11181111112121131111111
 nit 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ******* *** ***************************************************         * *           ******************** **** ** ***************** ****************************************** ***********************
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 PP2C_C:Protein serine/threoni  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1--------------------------------------------------------2884572232223378253789-65721226136223222321312232-2121111611---11------------------------
 ne phosphatase 2C, C-terminal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                        ********************** ************************** **********   **                        
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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  binding protein BART                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ***  **                                                                                             ************************ **************************** ************* ****     *    * * *****
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 RPH3A_effect_N:Rabphilin-3A e  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------334315534133440715306316263352822451522153334454324-2111-1--21421------------------------
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 Spt4:Spt4/RpoE2 zinc finger    1-1--1----------11111111--------111--11111111-111--1-111-1-1111-1-1- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1111-31111111111-1111--1111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111121211111-11--11131-11161-111----1111111---1113111-12111111-11111111111101--1111-21211111111
                                * *  *          ********        ***  ******** ***  * *** * **** * *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ** **** *********** ****  ********** ***************************************************************** ************* **  ***** ***** ***    *******   ******* ******** **************  **** ***********
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[4245] PF09665            236                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 RE_Alw26IDE:Type II restricti  ------1---------------------------1-------------------------------1- -1----2-------1----------3------1-------------------1-1---------------------------11--1---------------2--------1111-1------1---------1--------------1--------1-----1-1--------------------------1--1111-1-11111---11-111---111-------1--1--------------------------------1112------1-1---------------------1--------1--------------1----------1----221--1---------------1---------1-----------------------------------------------------1---------------1-----1-----------------------------------------------------------------11-----------------------1---------1---------------------------------------1-1---------11--1-1--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------11111--1-------------------1--1---------------------------------------------------------------------------------1---------11----------1 1--1----1--2------1--------1111-----1------111---1--1------1-1-1-1---1--1--1----22--121------11--------1--1--3-12-124-11----11--12752515-------1---1-11-14-11----11-1---1----21-----------11112---1112-
 on endonuclease (RE_Alw26IDE)        *                           *                               *   *    *       *          *      *                   * *                           **  *               *        **** *      *         *              *        *     * *                          *  **** * *****   ** ***   ***       *  *                                ****      * *                     *        *              *          *    ***  *               *         *                                                     *               *     *                                                                 **                       *         *                                       * *         **  * *                          *                                                                                *                                                                  *****  *                   *  *                                                                                 *         **          * *  *    *  *      *        ****     *      ***   *  *      * * * *   *  *  *    **  ***      **        *  *  * ** *** **    **  ********       *   * ** ** **    ** *   *    **           *****   **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4246] PF07792            236                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 DUF1630:Protein of unknown fu  -------------------1------------------------------------------------ ----------------------------------------------1-----------------------1-----------------------------------------------------------------11---------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1----------1-------------------1-1--------------------------------------------------------1----1--------------1-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------- ----111-2121212--121-2-21--11--------------1-----1------------2--------------------------121-1121212111121-1-22422333212121324341012-333211222232122212123222321131111111--1312-11-----1-22121131-1131-
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 DUF3496:Domain of unknown fun  ---------------------------------------11--------------------------- ---------------------------------111----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------1---------------------------1-----------------------------------11-2-2111-13167-432443780111111133322112-141--11--------------1-----------------1-------
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[4250] PF07907            236                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 YibE_F:YibE/F-like protein     -------------------------------------------------------------------- ----1111111-11111----1---1------11111111---111--1---111--1--111-111111-----------1-----------------------------------------------1---1-1--------1----------------------------------------11-----2------1--------------------2----------12222222222222222222222212222223222233222223222---------------------------------------------424311111111111-33111-1---2-1-1133-1---1------11--------------------------11111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--1-1-12----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------------1-------------------------------1--------------------1---------------2----------------------------------------- --11--------------1---11-1-------1------1------------1---------------------------------1----------------------------1----------------------------------------------1-----------------------------1-----
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4256] PF00427            236                                                                                                                                                                                                                                    111111   11111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
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 MAS20:MAS20 protein import re  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- ------1-----11121121111111111111111121--111111111211111111-11111111112121111111111111111211211313111112323-1--324222--11221222-3-272123212-121234-222221231322111-1131121121131---------11--111------2-
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 DUF775:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11--12121111111111211-1111121111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111121111---111-121111111211111113413-693-31211122-121111111111-21111111211111111111-111-111114121112113121-
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 BHD_1:Rad4 beta-hairpin domai  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-1111--311-1112222111121111111111111111-111111212212111112222112111-211211-1-1122221122212121111111-1-111112-2111112111111-11111201-1211--111111-111-21111221-111-111-3541111111112111211111212111121-
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4264] PF10236            235                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DAP3:Mitochondrial ribosomal   ----------------------------------1------------1---1---------------- ----------------------------------------------------------------1--------------------1----1---------------------------------------------11---------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 21--1-2-311-1111111111111111111111111121111111111111111112111111111111111111111111111111112112111111-11----1113121121121111222141382-1121-11211211-111112111111111111211112141111--11111111111111111-11
 death-associated protein 3                                       *            *   *                                                                                 *                    *    *                                             **         *                                                                                                                                                                                                                            *                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       **  *                                                                                                                           **  * * *** **************************************************************************************** **    ************************* **** ******** ******************************  ***************** **
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[4265] PF11277            235                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              3                                                                    
 Med24_N:Mediator complex subu  ---------------------------------------------------1----------1----- -----------------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------1--------1------------------1------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------11-----------------------------1---------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1-------------------------------------1----------------1---------------------------1--------1---------------------------------------------------------------------------1----1-------------------------------------------------------1----------------1--------------------11111---------------1-----------------------------1-------------------------------------------------------- ----111-2-2--111-1----1------2-1-1------------------12---------1---1-1------2----111--1----1----1111-1-2-1-2--42111411111121562319132523121211112211--4213132241112121222331-11--2-------1--2-111--1-11
 nit 24 N-terminal                                                                 *          *                                               *                      *                                                                              *        *                  *                                                *                                                                                                                                                       *              **                             *                                                               *                                                          *                                     *                *                           *        *                                                                           *    *                                                       *                *                    *****               *                             *                                                             *** * *  *** *    *      * * *                  **         *   * *      *    ***  *    *    **** * * * *  **************************************  ********************** **  *       *  * ***  * **
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[4266] PF03374            235                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 ANT:Phage antirepressor prote  -------------------------------------------------------------------- ------2---1-1--1--------------------1--1--------2--2--------21-1-----------1--1--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1----1-11-1-----4--11---32111-1221332411------------2-3--22-1-11-1-1111--------------1-----1211-1111-122----------11--2----1--1211-211----1211-------1-------1-------------176-5-----2--------------------1--1-1-----------------1------1-------11111111---1-----------------------------------------------1------------------1------------1--------------------------------------------------------------------1--2---------------------------------------1---------------------3------12--1-1--12----13--121--------------1-------------------1--1-1------------1--1------------1----1-1--1-11------1---1--------1----11-11-1---------------------1--------------------------------------1-------------------------------------1- ----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 in KilAC domain                                                                                           *   * *  *                    *  *        *  *        ** *           *  *                    *                                                                                                   *        *    * ** *     *  **   ***** **********            * *  ** * ** * ****              *     **** **** ***          **  *    *  **** ***    ****       *       *             *** *     *                    *  * *                 *      *       ********   *                                               *                  *            *                                                                    *  *                                       *                     *      **  * *  **    **  ***              *                   *  * *            *  *            *    * *  * **      *   *        *    ** ** *                     *                                      *                                     *            *                                                                                                                                                                                            
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4267] PF12053            235                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1 12  1 1                                                               
 DUF3534:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----------2-----------------------------------1---------------------------------------------------------------3239748332223265113656-06022332233223232133426114---2-14-111113-1----3------------1------
 ction (DUF3534)                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                   *                                                               ********************** **************************   * ** ****** *    *            *      
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[4268] PF04990            235                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                 1                   
 RNA_pol_Rpb1_7:RNA polymerase  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11111111312-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-2-1-11111-111121111111111111--11222-111--1-1-22124---191-112-1-1111--1111111-11--2-1303115111-3111111117111-121-11111111111
  Rpb1, domain 7                                                                                                                                                     *                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *********** *************************************************************** * * ***** ******************  ***** ***  * * *****   *** *** * ****  ******* **  * ********** ************* *** ***********
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 RRM_4:RNA recognition motif o  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------- 11111111311-11111111111111111111111111-111111111111111-1111111111111-11-11111-111-1111111311111111111111211111213112-111111132111151-11211-12-11-111111112112-1--9111111111111111116111112--112117-1111
 f the spliceosomal PrP8                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     **                                                                                      *********** ************************** *************** ************* ** ***** *** ********************************** *************** ***** ** ** ************ *  *************************  ****** ****
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 DMPK_coil:DMPK coiled coil do  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------121122524311410844402821432332244322433-31-31-131--3-1-----------------------------------
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 hSac2:Inositol phosphatase     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----21----------111111111111111-1111111111111111111111111111111---------------------------1111111111111-11---22343432223123242333653133333133233323332332322324---2231231121121--------------1---------
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 HpaB:4-hydroxyphenylacetate 3  ---1--4333333333--1-1113------------------------------------------11 -------1------------------------11113276--1--1------112-----11--------------------1-----------11---------------------------------------11111----4-------------------------------------11112---2-1------2-11--1--11---1-1--2211--------1--------------------------------11-------------------------------------------------------------1-----------111--------------1---1---2---------------------------1-------------------------1-1-------1--1--12------------------------------------------------------------1---------1111--1111----1111-11---21--1---11---1-------1--------------------5-1---------------1----1--1--12---------------------------------1----------------------1----------------1------------1--1-1---1----111-1111-1--34-1111111111111111111-1--1---11111111111--------------------------------1------------2222-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------1----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------2----------------2---------1------------1
 -hydroxylase C terminal           *  **********  * ****                                          **        *                        ********  *  *      ***     **                    *           **                                       *****    *                                     *****   * *      * **  *  **   * *  ****        *                                **                                                             *           ***              *   *   *                           *                         * *       *  *  **                                                            *         ****  ****    **** **   **  *   **   *       *                    * *               *    *  *  **                                 *                      *                *            *  * *   *    *** **** *  ** ******************* *  *   ***********                                *            **** *                                                                                                                                                           *    *                                                                                                           *                *         *            *
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[4276] PF02112            234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PDEase_II:cAMP phosphodiester  ---1---------------1-------------------------------------1---------- ------------------------------------1------------------------------------------------1--------------1--12-------------------------------11-------1-1-111----------111---11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------111---------12-1-----21---------------1--1-----------------1-1-1---------------------------11-----------------------------------------1-----------1-1-1----1--------11-----111---1-111---------11-111-1-------1-----1111--1------21211-------------------11--1---------11--------------------------11----------1-1--------------------------------------11111111111111111---11----111111111111-----1-111111---1------------------------------------------------------1111----------------------------------------1----------------------------------------1--- ----23--21-----11111111111111111111111111111121111111111112111111111111111111111111111111121111112121--------1---------------------------1--------------------1---1--------1-----------1-----1-1--1----
 ases class-II                     *               *                                     *                                               *                                                *              *  **                               **       * * ***          ***   **                                                                                                                                                                                               *           ***         ** *     **               *  *                 * * *                           **                                         *           * * *    *        **     ***   * ***         ** *** *       *     ****  *      *****                   **  *         **                          **          * *                                      *****************   **    ************     * ******   *                                                      ****                                        *                                        *        **  **     **************************************************************************************        *                           *                    *   *        *           *     * *  *    
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[4277] PF04432            234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 FrhB_FdhB_C:Coenzyme F420 hyd  -----------------------1-----2-14354545545535377334644---1-1-------- ---------------------------------------1-------------1----------------------------1-----1243-----------------------------------22---111111---11--12111111111----1111121111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------2------1----2-1--11--------------1-------------11111----------------------------11----11-----21-----1----------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11241122-------------1------------------------------------------1-------------1----------------1--------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------1----------------------------1-------1---------------------------------------------------1-----------------------------------------------1--1---------------11113111111111-1-11-----
 rogenase/dehydrogenase, beta                          *     * ***********************   * *                                                *             *                            *     ****                                   **   ******   **  ***********    **********                                                                                                                                                         *                     *      *    * *  **              *             *****                            **    **     **     *                **                                                                                                       * ********             *                                          *             *                *                                *                                                                                                           *       *                                                                                                                         *                            *       *                                                   *                                               *  *               ************** * **     
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[4278] PF03660            234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 PHF5:PHF5-like protein         -----------------------1-------------------------------------------- ----1-------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1111-3112221-1111--1111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111121-12132211111-1111112211121-11111112111-111111-12111111221112111112211111161111112-7121211111-
                                                       *                                                 *                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ** **** ******* ****  ******************************* **************************************************** *********** ************* *********** ****** *********************************** ********** 
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 COX2_TM:Cytochrome C oxidase   ---------------------------1---------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111-----11111221-11-11111111-111---------111-11111111111111111---1111-11--------1---------1--11111--111111111111-11111---1------111111111111111111111111111111111-111111111111-1----1---------21----------------------------------------------------------------1-11-1---1111--1---1-1111-1---1-----------------------------------------------------------------------------------------------1---------111---------------------------1-1111-111111111----------------------1------------------------------------------------------------------------------ -1------1------------------111-11111-----------1------131-----1-111---1-----1----------------1---11-1--111-----111111-----1-11-2-17--11-----1--11--------1-1------12--12--1----111----1-----1-1--------
 subunit II, transmembrane dom                             *                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                          *  ****     ******** ** ******** ***         *** *****************   **** **        *         *  *****  ************ *****   *      ********************************* ************ *    *         **                                                                * ** *   ****  *   * **** *   *                                                                                               *         ***                           * **** *********                      *                                                                                *      *                  *** *****           *      ***     * ***   *     *                *   ** *  ***     ******     * ** * **  **     *  **        * *      **  **  *    ***    *     * *        
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[4280] PF06007            234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhnJ:Phosphonate metabolism p  ----------------------------1--------------------------------------- -----------1--------------------1----------------1------------------------------11-----------------------------------------------------111-1---------11--1-------------1-1---------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1----1------------------------------------------111--111111----------1---1--1-1-3--11111111111111-----11-11111--------1----1-------------------------------------------------111111111-111--111111------2--1---111---1---11-------------------11-------------------------------------------------11----4-----1--------------------------------1111-1-2222222122-222222222222212222122212---121111111111111113121112--111111111111---------------------------------------------1111---11-----111---------1---------------------------------------------------------------------------------------- --11-----------------1--1---------------------------1------------------------------------1-----------1------1-1---2------------1-11--1-----1------1----1-----------------------------1----------1------
 rotein PhnJ                                                *                                                   *                    *                *                              **                                                     *** *         **  *             * *                                                   *                                                                                                     *              *    *                                          ***  ******          *   *  * * *  **************     ** *****        *    *                                                 ********* ***  ******      *  *   ***   *   **                   **                                                 **    *     *                                **** * ********** ************************   ************************  ************                                             ****   **     ***         *                                                                                           **                 *  *                           *                                    *           *      * *   *            * **  *     *      *    *                             *          *      
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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  protein family                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ***** *** ******* ***** ***********   ************** ************* ******** ****************** ********* ********* *** ***** ***** ***************  ** *** **  **** *********************************
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 DUF1771:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----33--1-1-111122221222212221111332333333322223222221222222222111-1-1211111111111111--111--2111-11-211323-1-221-111-111----21-1-2711111-1-11-11111---111-1111---------2-1---1-1-----11115274321--1111-
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 NUC153:NUC153 domain           -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-1-----11211222222222222121211122221222222222222222222222222121-222222-1-111222221112421222---12-221-12---111-11111111-11121251-21211-111121-1121111111111-21--1---11---2-112-1---2111112-2-------
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 PDEase_I_N:3'5'-cyclic nucleo  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------3314335212313303383534-0413333633651332131162224312231111611-121-------------------------
 tide phosphodiesterase N-term                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ********************** ************************************* ***                         
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 PyrI:Aspartate carbamoyltrans  11-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11 -----------------------------------------------------------------------1111111----------11111111--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-111111111111--11----11-11-11------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111-----------------------------------------------------------------111-------1-------3-----------1------1--11111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------11111111111211--------------------------------1---------------------------1-11111111---- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
 ferase regulatory chain, allo  ** ************************************************************** **                                                                        *******          ********        *                                                                                                                                                                                                                          * ************  **    ** ** **                  *                                                                                                                                                                                       *********                                                                 ***       *       *           *      *  ******************** *****************************************************************                                                                        **************                                *                           * ********