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Ranking of RP:PFM:REP : from 4801 to 4900

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4801] PF05861            199                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhnI:Bacterial phosphonate me  ----------------------------1--------------------------------------- --------------------------------1----------------11-----------------------------1------------------------------------------------------111-1-----1---11--1-------------1-1--------------1------------------------------------1---------1-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------------------------------------112---11111----------1---1--1-1-3--11111111111111-----1----111--------1--1---------------------------------------------------1111--1111111---11111------2--1---111---1---11-------------------11-------------------------------------------------11----4----11----1------1---11---------------1-11-1-1111111111-111111111111111111-11112----1--------------11-1---1--111111111111---------------------------------------------1111---11-----121---------1--1------------------------------------------------------------------------------------- ---------1----------1------111----------------1---1---1-----1------------------------1-----1--1-1-11--------1------1------1--4-1--1--------1----------21-2----1----1----1--1-----------------111-------
 tabolism protein (PhnI)                                    *                                                                        *                **                             *                                                      *** *     *   **  *             * *              *                                    *         *                                                                                           *              *                                               ***   *****          *   *  * * *  **************     *    ***        *  *                                                   ****  *******   *****      *  *   ***   *   **                   **                                                 **    *    **    *      *   **               * ** * ********** ****************** *****    *              ** *   *  ************                                             ****   **     ***         *  *                                                                                               *          *      ***                *   *   *     *                        *     *  * * **        *      *      *  * *  *        *          ** *    *    *    *  *                 ***       
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 FTCD_N:Formiminotransferase d  ----------------------------------------------------1--------111---- 1111-1----------------------------------------------------------------------------------1121-111-----------------------------------------------1---------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------11111111111111----------22---------------------1---1-----------11-111-12-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------2-1-------------------------1-------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1111-------------------------------1111-------------------------1---------------------------1121111111---- ----111---------------------------------------------11--------------------------------1---------------------1-32322231----1111-21713-2121-1111121--1-12--2111121221111-------2--1117111111123-2411----2
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 BPL_N:Biotin-protein ligase,   -------------------------------------------------------------------- --2----------------------------------------1----------------------1-1------------------------1---------------11111111111111----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1-1-----------------------------------------------11---------------------------------------1------------111111211-11-----------------1111----------------1--111--------------------------------------------11-1-1---------------1----------------------------------------------1---------1-------1------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11--------1-12221111111111111111211111111-111111222211211111111112111111111-1-11112111121-21112111111212---211----1-----11-1--------------11------1-1----11-1--1-12--1-1-13-2-11-----12----1---1-----
 N terminal                                                                                            *                                        *                      * *                        *               **************                                                                *                                                                                                                                                      *                                 * *                                               **                                       *            ********* **                 ****                *  ***                                            ** * *               *                                              *         *       *                                                *                                                                         *                      *                                                                                                              **        * ***************************** ********************************* * *********** **************   ***    *     ** *              **      * *    ** *  * **  * * ** * **     **    *   *     
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 Lambda_tail_I:Bacteriophage l  -------------------------------------------------------------------- --1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------11-117----------------------------------------------------------------------------------------------------11-1-1---1-----------1------------------------1-1----------------1--------------------1------------------------------------------2------2-1-------------------1---11-993-315---11-4145244044111-11-----1-1--1-11-21-113--2-23-21222-1221-2222---------------------1-111------1-----1-1--1----112-11-1----1--11------------------------------1------------------------------------------------------------------- -------------------------1----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------------------1----------
 ambda tail assembly protein I                                                                         *                                                                                                                                                                                      **                                                                                              *                                                                                             *                                 ** ***                                                                                                    ** * *   *           *                        * *                *                    *                                          *      * *                   *   ** *** ***   ** ************* **     * *  * ** ** ***  * ** ***** **** ****                     * ***      *     * *  *    *** ** *    *  **                              *                                                                                             *                            *                                                                                      *                    *                         *          
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 DUF952:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----1---------11-11-11--1111111111111222-111-11-1--------1------1111111-------------------------------------------------------------------11---1-111-111----111111---1111--1-----1------1--------11111-111111-11------111------1------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111-----111111111111111111111111-11111111111-111111111111111111111111111------------1-11-----------------------------1-111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------ ------1-----1111111-11111-1-------------------1111----111-----1--------------------------111111----1--1-----21------------------------------------------------------------------111------11-1111------1
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 DGOK:2-keto-3-deoxy-galactono  -------------------------------------------------------------------- -------------------------1-------------1--------1-----------------1---------------------------------------1------------------------------------1-11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----1-121--------11111111111---1--1-111--1221111111221--1-1121221121--------111--------------------------------------1------111211111111111111111211------111--1----1321-----------------------------------------------------------------------------------------2--------------------1-------------11---1-1--2122211--111312121-212212222121----1-1-1-111-1-1--11---1111------------------------------11-------------------------1-------11------111------------11---------1--11111111---------------------------------------------------------------- ----------1----1--------------1---------------------1---------------------------1--------------------------------------1-----------------------------------------------------------1----11-------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[4813] PF12589            199                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 WBS_methylT:Methyltransferase  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-11111-211-11111111111111111111111111111111112111---111111--1-111111111111111111111111-111111111111-21111-1212111121-----1141111261-111-1-111111-1--11--211111111-11-1111-1111-11151111111211111-1-111
  involved in Williams-Beuren                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            * ***** *** **************************************   ******  * ************************ ************ ***** **********     ********** *** * ****** *  **  ********* ** **** **** ***************** * ***
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[4814] PF05669            199                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Med31:SOH1                     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11111-1-1--1111-11111111111111111-11111111111111111111111-11-112111111111-1-1111111111111-211111111111111-12--21111111-111111111-141-1-211111111-11111111-111-12211111-2141111111117111111222111111111-
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ***** * *  **** ***************** *********************** ** ************ * ************* *************** **  ******** ********* *** * ********* ******** *** ******** ******************************* 
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[4815] PF08526            199                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12    1                                                               
 PAD_N:Protein-arginine deimin  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------1----------------------------------------1---------2112135442543552550251652344474463353214334431-1------1---------------------------------
 ase (PAD) N-terminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                        *         ********************************************** *      *                                 
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 HHV6-IE:Human herpesvirus 6 i  ---------------------------------1----------------1----------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------1--------------------------11-------------1---------1---------------------------1-1-------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------11111-1------------------------1-------------------------------------------------------------1----1------------------------1-- --------1-1-3311-11-3-11112222211--1111----211121211-12111--1-1-2--1--21-1----1-----1-121--2---1--11-1-11--1-216-223--1--1-1-114-263-2-2--212-112-11-31-21----221-3-24-4121-32------------11-12-12--1--
 mmediate early protein                                          *                *                                                                                                                                                      *      *                          **             *         *                           * *                                                 *                                                                                   *                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                        *                                                                    *                                                             ***** *                        *                                                             *    *                        *           * * **** ** * ***********  ****    ********* *****  * * *  *  ** *    *     * ***  *   *  ** * **  * *** ***  *  * * *** *** * *  *** *** ** ** **    *** * ** **** **            ** ** **  *  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4819] PF05709            198                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Sipho_tail:Phage tail protein  ------------------------------------------------------1------------- ----------------------11-------------1---------------1--------------------------11-----------------1--1------------------------------------------------------1---------------------------------1-224242-1213214-1322---16-11-1----------111111--1111111-----3---33-----2-1122--11--22122-2-3---------1-1---2444312321221-------------2-2--1-1-2-11----111--2-----2----11-----1---------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1--------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------1----------1111---------------1----------1-1-------------------------------1-----------1-------------------------------------------------------------------------------1-------1-----
                                                                                      *                                    **             *               *                          **                 *  *                                                      *                                 * ****** ******* ****   ** ** *          ******  *******     *   **     * ****  **  ***** * *         * *   *************             * *  * * * **    ***  *     *    **     *                                                   *                                                                                                                                                       *                                          *                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *          ****               *          * *                               *           *                                                                               *       *     
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[4820] PF03405            198                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1           1       
 FA_desaturase_2:Fatty acid de  -------------------------------------------------------------------- ----1---------63422-22223222222333332132-332----------------11-----111------------------------------121---1-1----------------------------------1----1---------------------------------11----------------1-----1---------1-----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1--1----1---------------------------1-------------------------------------------11-----------------------------1---------------------------1---------------------------11--------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1 ---------------------------------1----------------1------------------------------------------------------------1311----------------------------------------------3---1-------1--2217111217796-931------
 saturase                                                                                                *         ***** ******************** ***                **     ***                              ***   * *                                  *    *                                 **                *     *         *     *                                                                                                                                                     *                                                                                       *  *    *                           *                                           **                             *                           *                           **                                            *                                                                                                                                                                   *                                                                            *                                  *                *                                                            ****                                              *   *       *  ************* ***      
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 DUF1683:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-211--11111111111111112111111111111111111111-1111111111111-----11111-----111111---12111-11------111-1412111122111111111-21282-21411-1-2-31111--11111211112-12111211111-1-1-1-11--1--2211---1111-
 nction (DUF1683)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *** **                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                  *** ***  ************************************** *************     *****     ******   ***** **      *** ******************* ***** ***** * * *****  *********** *********** * * * **  *  ****   **** 
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[4825] PF04667            198                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Endosulfine:cAMP-regulated ph  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------111111111221111211-11111111111111111111211113111211111-1111111-1221221111111111211131211-111112-----32213--1-1--------636-213-1--2-1111--131-141---211--1----11-11--1----------45215---1----
 osphoprotein/endosulfine cons                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ****************** *********************************** ******* ************************* ******     *****  * *        *** *** *  * ****  *** ***   ***  *    ** **  *          *****   *    
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[4826] PF04148            198                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Erv26:Transmembrane adaptor E  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1---211-11111111-1111111111111111111111111211111111-1-1111111111121111111111111111111-111111111111-111112-311131111-111111121451-111111111112-11-111-41--11211121--112---11-1-171-11-2-----1------1
 rv26                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *   *** ******** ********************************** * ******************************* ************ ****** ********* ************ ************ ** *** **  ********  ***   ** * *** ** *     *      *
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 DUF3377:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-887866331334454141454-44632245245313531431733223----------------------------------------
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[4829] PF04244            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DPRP:Deoxyribodipyrimidine ph  ------------------------111111-1--1--------------------------------- 1--1-----------------1----------1111-----1--1----11--1-1------------11-------------------------------11111-1---------------------------11111-----1111--11111111111111---111--1111-11-1--------1--------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-11---------11----------------------1----1-----11---------1--1111-111111---------1-----1------------------------------111---1----------1----11---------1--11--1---1112---------1---11-------------------1----------------------------------------------------121-11--111111111-111111-2111-1------1-----------1-------------------------------1111------------------------------1--------------------1-11--111-------------------------------1-1-11-111111111-11-11-11--1111111111--12121111--------11------------------------------------------------------ -------------------------------1---1-------------1-1-------------------------------------1-----1------------------1----------------------------------------------1-------------------------------------
 oto-lyase-related protein                              ****** *  *                                  *  *                 *          ****     *  *    **  * *            **                               ***** *                           *****     ****  **************   ***  **** ** *        *                                *                                                                                                                                                      * **         **                      *    *     **         *  **** ******         *     *                              ***   *          *    **         *  **  *   ****         *   **                   *                                                    *** **  ********* ****** **** *      *           *                               ****                              *                    * **  ***                               * * ** ********* ** ** **  **********  ********        **                                                                                      *   *             * *                                     *     *                  *                                              *                                     
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[4830] PF07000            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1308:Protein of unknown fu  -------------------------------1--------------------1--------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1--1----------------------1-----------------------------------------------------------------1-----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------2-412111111111122212111112121111111111111121211111311111---------------------------11111212221---213----1111121----11-21121782-1-1-2-111111-11-121111112212111132111221-11-1-------3111121-------
 nction (DUF1308)                                              *                    *                                                                                                                                                                                        *                                                                                   *                                                                       *                                                                                             *                 *  *                      *                                                                 *                 *                                                                                                   *           *                                                                                  *                                                                                                                                                                                    * ******************************************************                           ***********   ***    *******    ** ******** * * * ****** ** ************************ ** *       *******       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 nction (DUF1513)                                                                                 *    *                                      *                                                              *   *                     *  *         * **                  *** *              *     *                                                                                                                                                                                       *               *                        * **  **************   **********                                                    ****                                 ***  **                         * *                             *                               *   *                    *              *                                           *   * ***  ***                                     *** *                      **** *****************          *** **********           * *                                                                  *  *  *   * ** **   *     * *** * **        *             *    *    *       *** *   * *    **   *  *   * * *  *   **   ***  *** ***  * * **  ***   *           *   ***  *  *  **       ****    *  
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[4833] PF10223            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DUF2181:Uncharacterized conse  -------------------------------------------------------------------- ----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------3-5132141343333333153663-439433352341133313312111232-1-31323112221----15------12----1-1111-
 rved protein (DUF2181)                                                                                  *                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                    * ********************** *************************** * ***********    **      **    * **** 
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[4834] PF04622            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 ERG2_Sigma1R:ERG2 and Sigma1   -------------------------------------------------------------------- ---------------------1----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ ----111-211----1--211112121111111111-------1111111111112111112211111121111111111111122111111-1111111111111-2-2412121-111111124131522-314-1112-112-111-11111-112-11121------1111-------------2-11--1----
 receptor like protein                                                                                                    *          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                           *                                                                                         *** ***    *  ******************       ************************************************* ************* * ******* *************** *** **** *** *** ***** *** *****      ****             * **  *    
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[4835] PF02030            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Lipoprotein_8:Hypothetical li  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------1------------1------------------1-----------111-----1---------1---------------1-----------------------------1-------------1------1----------1---------------------111111-1-111--111--11-------1111--121111122-22111111111111-21-1121111-111-----------1-----------11-1--22-------------1---------------1---1----------------1---------12--------------------------2-----------------1---------------------------------1---------------------------------1------1-----1----1-------11-----1-----------1----11-1--------------------------------------------1---1-1----1-------------------------------11--11-------------------------------111-----------------------1--------------------------------1-1-1-----------------------1---2222133--1111-211---------------------1-------------------1------11111-11-11---11--11-111111212111111----1---1----- -----1---------1--1-----------------------------2----------1-1---11-1-------11-----------1-------------------11--------1------------------2-----------------------------------------------1-1----------
 poprotein (MG045 family)                                                                                                                                                                       *            *                  *           ***     *         *               *                             *             *      *          *                     ****** * ***  ***  **       ****  ********* ************** ** ******* ***           *           ** *  **             *               *   *                *         **                          *                 *                                 *                                 *      *     *    *       **     *           *    ** *                                            *   * *    *                               **  **                               ***                       *                                * * *                       *   *******  **** ***                     *                   *      ***** ** **   **  ** ***************    *   *           *         *  *                             *          * *   ** *       **           *                   **        *                  *                                               * *          
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[4836] PF03411            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Peptidase_M74:Penicillin-inse  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------111111111111111111111111-1111121111--11111111121111---1111111111------------11------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1---1---------------------------14-1---------------------------111---------------1------11--1-------------11111111111111111-111111111111111111111111---111111111111111111111111--111111111111---1---------1----111111111111111------------------------------------------1-----11111-------------------------------------------------------------------------- -------------------1-----------------------------1--------1----------------------------------------------1---11----------------------------1---1---------1-----------------1----------------2--11------
 nsitive murein endopeptidase                                                                                                                                                                                                                       * *     *                                                                                                                                                                                                                               *        ************************ **********  **************   **********            **                                                                        *                               *   *                           ** *                           ***               *      **  *             ***************** ************************   ************************  ************   *         *    ***************                                          *     *****                                                                                              *                             *        *                                              *   **                            *   *         *                 *                *  **      
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[4837] PF11911            197                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3429:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------11-11-11--------------------111-1111111111111111--1--1----------------------------------------------------11---------------1111-11-----------2---------------------------------------------------------------------------------11--1--1------1-----------1----111-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1--11---111111-111----1-----111---------------------------------------------------------------------------- ------------11--111111111-111111111111111111111111111111111111---------------------------13111111111121-----2112-2211111111-211--151-111--11-11--11111121111211----112-------1--1111111111---1---------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4841] PF09481            196                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CRISPR_Cse1:CRISPR-associated  -------------------1-----------1------------1--1-1-----1------------ ---111-----1-1----------------------1----11-----------------2----3-1-12------------------------------------------------------1---1----1----11--1---21---1------------------------------1--1-----------------1-------1-----------------1------------------------11-11-------------------------1-1------------------------1------------------------------------111-1--------------------1---------------1-----------------------1-1-------------------------------11111111211-1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------2-1---11---------1-1111----1--1------------------------------1------1---11----------------------------112---111-1---11-11111--1-11-1--1--1--1--11---1-1111111111---1-----2------------------------------11---------------------1---1-11-1----1----1------------------1--1-------------------------11---------------------------------------------------- -----------------1-1---------------1------------------------111------------------------1----------------------1--11---1---1----2-693-211-11-2--23121--21-2---1---------2-------1------------1---1-1----
  protein Cse1 (CRISPR_cse1)                       *           *            *  * *     *                ***     * *                      *    **                 *    * * **                                                      *   *    *    **  *   **   *                              *  *                 *       *                 *                        ** **                         * *                        *                                    *** *                    *               *                       * *                               *********** *  *                                                                                                           * *   **         * ****    *  *                              *      *   **                            ***   *** *   ** *****  * ** *  *  *  *  **   * **********   *     *                              **                     *   * ** *    *    *                  *  *                         **                                                                      * *               *                        ***                        *                      *  **   *   *    * *** *** ** *  *****  ** *   *         *       *            *   * *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4842] PF02662            196                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                            2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
 FlpD:Methyl-viologen-reducing  -----------------------3-------13321122211211112112222----------2--- --------------------------------------------------------2----------------------125----------1-------------------------------122111112----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------16--4432-123--------3-------------------------------------------1-------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------11-------------------9032533222222-2321212--1111--51-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-1-----------------------------------------------------------------1-- --------1----------------------------------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  hydrogenase, delta subunit                           *       ***********************          *                                                            *                      ***          *                               *********                                                                                                                                                                                                                            **  **** ***        *                                           *                                           *                                                                                        **                   ************* *******  ****  **                                                                                                                                                                                                                                               *  * *                                                                 *           *                                  ***                                                                                                                                                         
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[4843] PF03234            196                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CDC37_N:Cdc37 N terminal kina  ---------------------------------------------------------------1---- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1---11111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111-1111111111111213131111141111-11-13222121-1-11222-11362-321-1111-1-1-11--1--21--111331111211211211---1--11---11-1--11---11
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 DUF574:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----7-------------------------------4----644----------------65--4500204-----------------------------------------------------------------1111---1--------------1---1----1--------------1--------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1--11--------11---------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------11-1--------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ -------------11-------1-------------------------11--1------------------------------------------------------------------1------------------------------------1-1----1------------------------1----------
 ction (DUF574)                                                                                          *                               *    ***                **  *******                                                                 ****   *              *   *    *              *                                                                                      *                                                                                                                                                       *                 *                                                                                            *                                                    *  **        **                                                                           *                                                                                              *                             ** *                          *                                                                                                  **       *                         **  *                                                                  *                                    * *    *                        *          
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4847] PF07548            196                                                                                                                                                                                            1121111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
 ChlamPMP_M:Chlamydia polymorp  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------99999993605488--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------1-----------1-----------------------1-----------1----------------1---1----------3-----314---------------------------------------------------------------
 hic membrane protein middle d                                                                                                                                                                                    **************                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *           *                       *           *                *   *          *     ***                                                               
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[4848] PF12400            196                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3661:Vaculolar membrane pr  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1----1-1---111111-111111-1111111111111111111111111111-1111111111111111111121111111111----1111111111111444--3-232213311--11111-21341-111----1111111---1-12124221111111--12---2--11-----------1--114452-
 otein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *    * *   ****** ****** **************************** *******************************    ****************  * *********  ***** ***** ***    *******   * **************  **   *  **           *  ****** 
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 RNA_pol_Rpc4:RNA polymerase I  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-3111-1111111121111111----1111111111111-111211211211-1-111111111111111-111111111112-11--111111-1111---11232121111111111111281-111-11-1112211-1221111--111111113111111-21-11--11111121212--11111-
 II RPC4                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                           *** **** ****************    ************* ************ * *************** ************ **  ****** ****   *********************** *** ** ******* *******  *************** ** **  ***********  ***** 
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 DUF3546:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --1111------1111111111111-111111111112222111111111111111111111------------------------11111111112111-21111-1--113321-11111111-131622-221-1--2111--111-111-1--111341111131241111-1111-1--123321111-11111
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 DUF899:Bacterial protein of u  ----------------------------------------------1--------------------- -22-1---------1-1----2--12------3333--25--11-12-------------11--2-3-13----------------------------------1-1-----------------1------------------2-----------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------2211----11-----------2---------142-211-44344434-------1-------------------------------------------------------2---21-1111111-22211134222212113-121--221-------3-2-----------------------1----------------------------2-------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111-112111--------------------------------------------------------------------------------------------------1-- -----------------------2-11-----------------1---11--2----1------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------
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 DUF1025:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --1-211111111212222-211122222222-1112311211211212111212-12--222122221221122222--1-1----------------------------------------------------11111111-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----1111111-1111111111111111-1111111-111-11111111111111-1111-1111--1------------1111------------------------------1-11------------------------------------------------------------------------------------------------11112-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 SUN:Beta-glucosidase (SUN fam  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------11-------------1----------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ---------------11112222222211111122122222221112122322222212322233333144633365255333333333---1----------------1-----1------1-----------------11----1--1-------11----1-----5-------------------1---1-1---
 ily)                                                                                                                                      **             *                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                  **************************************************************************   *                *     *      *                 **    *  *       **    *     *                   *   * *   
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[4862] PF01122            195                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Cobalamin_bind:Eukaryotic cob  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------11------1------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4--------1---1-------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------111-2-1------------------------------1------------1-----------------1-------------------1-1211125323325382362633-33432333335233223323331131-1--1-211112--12--------1------------1--
 alamin-binding protein                                                                                                                                                   *                                                                  **      *                                                            *                                                                                                                                            *        *   *                                                             *                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *** * *                              *            *                 *                   * ********************** ************************** *  * ******  **        *            *  
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[4863] PF06832            195                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BiPBP_C:Penicillin-Binding Pr  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------111--1---------------------------------------------1----------------------1---111--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------111------1-11111-11111----------1-1111111111--111111111111-1-11-11-1---11------------1--1---------------------------------1--111-11111111---11-11111-111-1111-------11111--1--------1--------------11-----111-------------------1---------------------------11-----1----------------------1--------------11---1-1111111111-11111111111111111111-1--111111111111111111-111-1-11--1------------------------1-1-1----1---------1----------------1--1-1111-111------------------------11----------------111111-------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------242-11--------1-1---1-------------------------------------------------
 otein C-terminus Family                                                                                                                                                                     ***  *                                             *                      *   ***                    *                                                                                                                                                                           *             ***      * ***** *****          * **********  ************ * ** ** *   **            *  *                                 *  *** ********   ** ***** *** ****       *****  *        *              **     ***                   *                           **     *                      *              **   * ********** ******************** *  ****************** *** * **  *                        * * *    *         *                *  * **** ***                        **                ******                                                                                                                                                                                    *** **        * *   *                                                 
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 GpcrRhopsn4:Rhodopsin-like GP  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------11----1---------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 21--561-3-----1----1-1----------------------------------1---1----------------------------------------------111732421222121224222-322-3232221212231212-21122111212234322122-2242---11111--1------111111-
 CR transmembrane domain                                                                                                                                                                            *                                                                                                             *                                                         **    *                     *     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                  **  *** *     *    * *                                  *   *                                              ********************* *** **************** ******************** ****   *****  *      ****** 
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 DUF3315:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2124------------------11111111111----------1--1----1111111---1-----------11111111-11-------------------------------------111-----1111111111111-11-11111111111----1--1---1-21-11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--121111111111-1111111111111--1--1122-----1111111111111111--111-11-----------------------------------------------3333336----------121-2122-111------------------------2212222222---------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------12---------------------------------------------------------------------------------1----
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 DUF1208:Protein of unknown fu  -----------------------------1-------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1----------1--11-----------1-------------------------------------------------------------111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1--------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-------231111-----1---1---------------11------1-1-------------------------------11-----1---1111-------1--4131123324122152143883-32512222-25212221231921112--1212121222-121--------1---1-----------
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[4875] PF03843            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Slp:Outer membrane lipoprotei  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------------------2--12111------2--------------------------111111---11------------------------2222------11112112222222222-222222222222222222211111111111111111111111112222222--11111111-111---1---------1-------111-1111---1---------------------------------------11111111111111111111111111-1--------------------------------------------------------6--- -------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
 n Slp family                                                                                                                            *                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                           *                          *                                                                                                                                                                   ***                   *  *****      *                          ******   **                        ****      ***************** ***************************************************  ******** ***   *         *       *** ****   *                                       ************************** *                                                        *                                                           *                                                                                                                                          *    
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[4876] PF07147            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 PDCD9:Mitochondrial 28S ribos  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ----------11------------------111-----------------11--11-------------------------------1-------1----1211------4233232422222234142562-4232222212311213122142532223222351222-1232------2------11------2--
 omal protein S30 (PDCD9)                                                                                                                       *                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                  *                                                       *                                                                                  *                                                            *                            *                                                                                                                                                                                          *                                                                     *                                                                    **                  ***                 **  **                               *       *    ****      ********************** ************************************* ****      *      **      *  
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[4877] PF12024            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 DUF3512:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------1---1-------1-1-------1----1-1----------1---------------1---------1----------------1--3-------1--1--3222243222222223-52173-34622222222-123122223232221121211111151421-------------------1---1
 ction (DUF3512)                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                          **                                                                                                                                                    *                                                                                                                       *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                *   *       * *       *    * *          *               *         *                *  *       *  *  **************** ***** *********** ******************************                   *   *
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 DUF2348:Uncharacterized conse  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------- ----11------111----111111111111111111111111-1111-11-1111111111111112111111111-111111--111-11-113---1-11111-1-11111222111111121111281-212-11111111112111111112221111112-11111111-11-11--1-11-1-11--1121-
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[4881] PF12205            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12    1                                                               
 GIT1_C:G protein-coupled rece  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1---------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1----------1---------------------------------------------------------------1--------------------2733342212222276292055192212214224212221321322212-112111-1112--1-------------------------
 ptor kinase-interacting prote                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                  *                     *                                                                                                                                        *                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *          *                                                               *                    ************************************************* ****** ****  *                         
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[4882] PF03195            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     2215 41       
 DUF260:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ---------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------9958-55-------
 ction DUF260                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                           *                                                                                                                                                       **** **       
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[4883] PF06003            194                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 SMN:Survival motor neuron pro  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1----3-1-------------------------------------------------------------------------------------------1---11-3--3534423211223233142078-4441-123-24322321211432223123221113421-111-11-5---1-21-1-2--------
 tein (SMN)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *    * *                                                                                           *   ** *  ********************** **** *** ***************************** *** ** *   * ** * *        
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 WAP:WAP-type (Whey Acidic Pro  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------52343221411-4343254883-3344213214621411-314411122--1135215238118-------------------------
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 FrhB_FdhB_N:Coenzyme F420 hyd  -----------------------1-----1-14354545545535377134644---1-1-------- ---------------------------------------1-------------1----------------------------1--------------------------------------------22---111111---11--12111111111----1111121111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1--------------1-------------11111----------------------------11-----------21-----1----------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------221------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------11113112111111-1-11-----
 rogenase/dehydrogenase, beta                          *     * ***********************   * *                                                *             *                            *                                            **   ******   **  ***********    **********                                                                                                                                                                                             *   *              *             *****                            **           **     *                **                                                                                                           ***                                                                                          *                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                               *                                                     ************** * **     
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 Transposase_Tn5:Transposase T  ----------------------------1--------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------6-2---811--------4--2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------1-----------------2----------------------------------------1------------------------------------1---------1------------8---6--6---------------------------------------------2--9-----------------------------------------1---------5----1-----------------------111-11---------9----1--------------1-------------------111---1----------------------6-5-------------------------------6-------------------------------8-----9---1--------------------33---------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------
 n5 dimerisation domain                                     *                                                                                                                                                                                         * *   ***        *  *                                                                                                                                                                                               *                                                                  *                 *                                        *                                    *         *            *   *  *                                             *  *                                         *         *    *                       *** **         *    *              *                   ***   *                      * *                               *                               *     *   *                    **                                                                                                                                                                                                *                                                           
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Hist_Kin_Sens:Predicted histi  --------------------------------------------3--2--656--------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----11---1-------------------------------------------------------------------------111----111111-1--------------------1---------------------------------------------------------------------121111-11111515-1654111-1----1--211-1-112-31--2------------------------1---------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------63--21--51----313-12166112-1-11-----------------------------2-------------------1----1---------------1---------1---11-------11----11-----1111-----11-1111111111111-1-----1--1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3-- --------------------11------------------------------1---------------------------------------------------------3-----------------------------------1-------------------------------------1--1------1----
 dine kinase sensor domain                                                  *  *  ***                                                                                                                                                     *    **   *                                                                         ***    ****** *                    *                                                                     ****** ******** ******* *    *  *** * *** **  *                        *                                                                     *                                                                                                           **  **  **    *** ******** * **                             *                   *    *               *         *   **       **    **     ****     ** ************* *     *  *                                                                                                                                                                        *                       **                              *                                                         *                                   *                                     *  *      *    
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 DUF2076:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- 1-------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------1111-11111111------------11111111----111111-111--11------1111---------------1111-----------------------------------------------------------------1-1--111-------------------1------------1--------------------1--------------------------------------------------------1------1---1-------11-111-1111-1------------------------------111---------------------1-------1------------------1111----1---1-------------------------1-11111111-1111-111-------------1--------------------1111--1-------------------------------------------------------1- --------1----1---------211-11-1-1--------11------11--21---2-1----1----------1----------1--------1-------1--2-252---44-11--111--11-4---11-3-112121131--11---4-12------1---12-11---2--------1-------112--
 in conserved in bacteria (DUF                                                                       *                                                                   *                                                                                                                                                                                                                         **                                                                                                **** ********            ********    ****** ***  **      ****               ****                                                                 * *  ***                   *            *                    *                                                        *      *   *       ** *** **** *                              ***                     *       *                  ****    *   *                         * ******** **** ***             *                    ****  *                                                       *          *    *         *** ** * *        **      **  **   * *    *          *          *        *       *  * ***   ** **  ***  ** *   ** * *********  **   * **      *   ** **   *        *       ***  
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[4895] PF11719            193                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Drc1-Sld2:DNA replication and  -------------------------------------------------------------------- -1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------2-12--111211111122121331211221111111112111121211112112221111-1-11111112111111111111---1111221--111-1----3-1-21---1-11133-11261-11311---11311112----2----1211-1-213--12-------21--------2-1--21-11
  checkpoint protein                                                                                  *                                                                                                                                      **                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                     *                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                               * **  ***************