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Ranking of RP:PFM:REP : from 4901 to 5000

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4901] PF02762            193                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Cbl_N3:CBL proto-oncogene N-t  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1--124-542232223256241733-437223343332233234325324311113-1-1221-23-1------------------------
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[4902] PF08170            193                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 POPLD:POPLD (NUC188) domain    -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1111-----1111111111111111111111111111-11-111111-111-1112111111111-111111121111111111111-11111111111112111--21222-111111112211125111111111111111111121121111-112-1111111-11111-111111111--111--1-111-
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 NOC3p:Nucleolar complex-assoc  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111-----111-1111111-11111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111211111111111111111111211111111111-11-1-261-2231--12111111---11-111111111-1111111611111-1-1111-1114-1111-1111-
 iated protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *****     *** ******* ******************************************** ****************************************************** ** * *** ****  ********   ** ********* ************* * **** **** **** **** 
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 DUF972:Protein of unknown fun  11----------------------1------------------------------------------- ------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1112222211212121111111112211111112111111111111111111111111111121111111111111111121---11111111111111111111111111111111111111111111111-------------------------------1-1111111-21--------------------------------------------------------------1----1-----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1---------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1------------------------------2--------------------------------------------------------- ----------------1---------------11-----------1----------11----------------------------------1--1---1-------------1--------1------131---------------------------11-------1--------2----------1-21-------
 ction (DUF972)                 **                      *                                                                                            *                                                                                                                  *                          **********************************************************************************   ***********************************************                               * ******* **                                                              *    *                                                                                         *                   *                           *                                                                                                                                                                                                                                                     *         *                              *                                                                          *               **           *          **                                  *  *   *             *        *      ***                           **       *        *          * **       
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 Peptidase_M11:Gametolysin pep  ------------------1------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------1---1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1-----------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------1--------1------1111-1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1-1--------------------2----------------------------------------------------------------------------- ------1-------------------1------------------------1----111-------------------------------------------------3-------------------------------------------------------------------84-----1--------52----1
 tidase M11                                       *                                                                                                                     *   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *          *                                                           *                                                               *                                                                                        **                               *        *      **** * *                                                                                                       *                                                       * *                    *                                                                                    *                   *                        *    ***                                                 *                                                                   **     *        **    *
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[4907] PF09811            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Yae1_N:Essential protein Yae1  --------------------------------1----------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1111------1----1-1-------------1---------1----1----------------------------1-----------------------11--11111111111---------------1--------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------- ----1-1-1---1111111111111-1--11-111-1111111---11111111-11-11-12-1111111-111111111111111111111111-----11-12-1--211--111--111122-1-371-11111111111-11111111111111-1----2-2--1--12-----111--1212122---111-
 , N terminal                                                   *                                                                                                                        *                                                                                    *                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *    ****      *    * *             *         *    *                            *                       **  ***********               *                                                                    **                                                                               * * *   ************* *  ** *** *******   ******** ** ** ** ******* ************************     ** ** *  ***  ***  ****** * *** *********** ************** *    * *  *  **     ***  *******   *** 
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[4908] PF04940            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BLUF:Sensors of blue-light us  -------------------------------------------------------------------- --1----1-----------------------------------------221--------------------------------------------------1------------------------------1--------------1-------------111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---2-------------34-14------------52532124--1----------------1213-322212---------------1---------------------------------11-1----------------------------111111---122111221221--1-1-1--------------11-1----------------------------------------------------------11---2-1-------------1----1------1-------2---211--1111111--111111111-1111111-232----------------------------------------------1-------------2---------------11111-4132---------------1------------------------1--622-------------3--------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1------5------------------------------------------------------------------------------------2----
 ing FAD                                                                                               *    *                                         ***                                                  *                              *              *             ***                                                                                                                                                                                                                 *   *             ** **            ********  *                **** ******               *                                 ** *                            ******   ************  * * *              ** *                                                          **   * *             *    *      *       *   ***  *******  ********* ******* ***                                              *             *               ***** ****               *                        *  ***             *                                                                                                                                                    *           *      *                                                                                    *    
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[4909] PF04938            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SIP1:Survival motor neuron (S  -------------------------------------------------------------------- ------1-----------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------- ----22--211-111----1---111---1-1---1-111111111---1------------111-1-11--1-1--111-111111----1-21211-1-1111--1112121112111111122151393-314111111111111121111111311111211-1233-311--11-11-1-2112-341-21111
 MN) interacting protein 1 (SI                                                                             *                                                           *                                                                    *                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                        *                                                              *                                                                                            **  *** ***    *   ***   * *   * *********   *            *** * **  * *  *** ******    * ***** * ****  ************************* ********************************* **** ***  ** ** * **** *** *****
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 7TM_GPCR_Srbc:Serpentine type  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1------------------1----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------ --11-----------1---------------------------111-------------------1----------------------------------1---------1-----2--------1---------1----1--1----1--1-----------1-------32----1-----2---------------
  7TM GPCR chemoreceptor Srbc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                    *                                            *                  *                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                 **           *                           ***                   *                                  *         *     *        *         *    *  *    *  *           *       **    *     *               
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4914] PF04351            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PilP:Pilus assembly protein,   -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1111--1111111111111111111111-111111111-1111111111--------1111111111111111--------------------------111111111-1111111111111411111111--111-1---------------------------------------------------1----------------------------------------1-----11111111-1111--11111---1111111111111111111111111-1111111111111-1111111111111111111111111111------------------1----------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------21-----------------------1----------
 PilP                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                              *                                                                                           ****  ********************** ********* **********        ****************                          ********* **********************  *** *                                                   *                                        *     ******** ****  *****   ************************* ************* ****************************                  *                                                                                                                                                          *                                                  **                       *          
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[4915] PF11176            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2962:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1----1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------1 ----111-21111111111-111111111111111111111111211111111111112111111111111111111111111111----2211112111111112-1--3211121-1111111113-161-1111111211111121121111111111-211111112--21-----------11-1-----1---
 nction (DUF2962)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ** *                                                                                                                                                                                                                                          *                                                            *    * *                                                                                                      *     *** *********** ******************************************************************    **************** *  ******* ********** *** **************************** *********  **           ** *     *   
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 DUF1154:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------324-1363311233662622551635233252332233-241-512232---1-1114137-21-------------------------
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[4918] PF08815            192                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 Nuc_rec_co-act:Nuclear recept  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------443525213233289262346-52733324133512333332824233----------------------------------------
 or coactivator                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ********************* **************************                                        
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[4919] PF02830            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 V4R:V4R domain                 ---1------------2---------------1-1352-----31112-12224----1-----31-- ---------------------------------------1-------------------------------------------11--1-----------------------------------------------1---------422322-23--------113--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1----1--1-----1-------1--------------------2---11111--------------1----------------------1---1-111111----------1-----11-------------------------------31-------111111-111111111111-1221-412--22214-1---1--1-------------------321-211----21------4154-1-11-1111-------------------------------------1--------1----------2------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------2--------11-1---111-------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                   *            *               * ****     ***** *****    *     **                                          *                                           **  *                                               *         ****** **        ***                                                                                                                                                              *                     *    *  *     *       *                    *   *****              *                      *   * ******          *     **                               **       ****** ************ **** ***  ***** *   *  *                   *** ***    **      **** * ** ****                                     *        *          *      *                                                                                                           *                         *        ** *   ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
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[4920] PF08223            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PaaX_C:PaaX-like protein C-te  -------12112222----------------------------------------------------- ----3---------21111-11--2111111211111211-1-1--------2-------111-111111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------1--------22--1-------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1-----------1-111----11-2-----------------2--1---------1---11-1---1-1-----11--------1----11------------------------------------11111111111-1112---1211211-312322--111--------2--111----------------111-1------------------------------------------------------------11---1-1--------1---------1-----------------1--1---1---11--111---1-1-----1--1221---------------------1----------------------------------1---1---------------222321----------11---1212------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----11---------------------------------1----------
 rminal domain                         ********                                                          *         ***** **  **************** * *        *       *** ******                                                                                                                   **                      *        **  *       **                                                                                                                      *                     *           * ***    ** *                 *  *         *   ** *   * *     **        *    **                                    *********** ****   ******* ******  ***        *  ***                *** *                                                            **   * *        *         *                 *  *   *   **  ***   * *     *  ****                     *                                  *   *               ******          **   ****                                                                                                                          *                                                                                                                               *     **                                 *          
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[4922] PF06210            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1003:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- 122-2-1111111111111-11--1111111-111111111333111111112211111111111--111------------------------------11--11------------------11-11-11---1--1----1----1-------------------2---------------------1-------------------------------------------------------------1-1-11-----11--11---11-1111111----11---------------------------111---------1111111-1-----------------------------------11--1111--------1-1-------------------1213212-121-211121-12121--------1-11---------------------------------------------------1-------1--------------------------------------1--1-1--1---------------------------------111-11-----1---1--------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111-----------111---1------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1-----------1-------
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[4923] PF05283            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11    1                                                               
 MGC-24:Multi-glycosylated cor  -------------------------------------------------------------------- ----1--------------------------------1-----------------------1----------111---------------------1---------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------11--1-3-11--------------1---1-----1111---112-1---------1-----1---------------1-11--1-1----1------23121221211322253281022-720223-521431312122-515111----12--6----------------1-----------21-
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[4924] PF11991            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1 1  1                                                                                                                                                                            
 Trp_DMAT:Tryptophan dimethyla  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------1-----------------------------11--1-------------------------------------1--------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------11--1------------------------------------------------------------------------------------1-----------1----------------------------1---1-------1-----------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1----------------------------------11111111------1------------------------------------------------1-111---- ------1-211------22670303903312236743111111---21-2-112--41-111-11-----------1------------121-214----112-------------1--1---------11--1-------------1-----1-1-----------2------------1--1-1--1---1------
 llyltransferase                                                                                                                       *                             **  *                                     *                                            *                                                                               *                        **                                                                                                                                         *             **  *                                                                                    *           *                            *   *       *                                                                             *                                                                                                                                         *                                        *                                  ********      *                                                * ***           * ***      **************************   ** * ***  ** *** **           *            *** ***    ***             *  *         **  *             *     * *           *            *  * *  *   *      
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4925] PF12031            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              3                                                                    
 DUF3518:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1------------------111---------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ---1--------------------------------------------------------------------------------------2-----1111-1-111-1-134334322121212622319061432112223232212213224132121112111-31-112111---------2-------------
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 DUF2012:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------1--------------------1-----------------------------------------1--222--------------------------1---------------------------------1---1---1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------- 1---111-211-11111111111111-111111111111111111111111111-1111111111-1------11------1111-1111111111111--11111-111211112-111111111-1-131-1-11--11-11-111-11-111111--111211112211122-111-111111112132-111211
 nction (DUF2012)                                                                                                                                                          *                    *                                         *  ***                          *                                 *   *   *                                                                                                                                                                    *                                                               *                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                        *   *** *** ************** *************************** ********** *      **      **** *************  ***** ********* ********* * *** * **  ** ** *** ** ******  *************** *** ************ ******
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 Zn_peptidase_2:Putative neutr  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------11112-----111111--1---1111111-1---------------111111111--1111111111----11-1-------1---------------------1111111--11111111111111111121111111211111111111111111111111111111111111-------1-111---------------------------------------------------------11112111111111111111111111111111------111--1111-----2----------------------------------11-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1---------------------------------------------------------1----------------------------111--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------------------------------------------------1-------------------------------1--------------1-------------------1-------1111111111-111 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------
 al zinc metallopeptidase                                                                                                                                                          *****     ******  *   ******* *               *********  **********    ** *       *                     *******  **************************************************************       * ***                                                         ********************************      ***  ****     *                                  ** **                                                                                                                   *                                              *                                                         *                            ***                                                                                                        * *                                                     *                               *              *                   *       ********** ***                                                                                                                                                                                        *               
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[4928] PF12114            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                      1                                             
 Period_C:Period protein 2/3C-  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------2---------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------2-------------------------------------------1---1--------------------------------------1-------------14435864331-233463324533345331333422-2211412035222-1----1----------1-----------2----------
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[4929] PF06859            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bin3:Bicoid-interacting prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ 11--1-1-1---111--11-----------------------------1--1-1--------------------------------1111-1-111------1212-121313323--22222132232492-2341111222231221221-3-11211213212143441222-111-11111111111211-222-
 in 3 (Bin3)                                                                                                                                                                                              *                                                            *                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                     **  * * *   ***  **                             *  * *                                **** * ***      **** *********  ************** ******************* * ******************** *** ************** *** 
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[4930] PF05764            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 YL1:YL1 nuclear protein        -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------ 11--1-3-2-----1211-111111122211-1-1111-11111--2211111-121--11121--21-1-----111111------211-11-1-1-1---2----1-1221111-211-13211121271-122111211121-121121122111-1112213-1212361----------12--211-12111--
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                         *  **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                   **  * * *     **** ************ * **** *****  ******* ***  *****  ** *     ******      *** ** * * *   *    * ******* *** *********** ************ ************ ******* *******          **  *** *****  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Mlf1IP:Myelodysplasia-myeloid  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------1------------1----------------------------------------------1-----------1------------------------11----14222223224223233241792-657124241121122-12213232233211111241411111111-------1122----------
  leukemia factor 1-interactin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *            *                                              *           *                        **    *********************** *************** *****************************       ****          
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 Med25:Mediator complex subuni  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------14121-11332-31334102033-7442311433433333231121--11---111213--1--11---------------------1--
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[4935] PF02251            191                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1    2                                                                    
 PA28_alpha:Proteasome activat  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------136333-212333360253825-43623223334313312322732133323111111111111-------------------------
 or pa28 alpha subunit                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ****** *************** *****************************************                         
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[4936] PF05116            190                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1        
 S6PP:Sucrose-6F-phosphate pho  ---1---------------------------------------------------------------- --------------1--------------------------------------1-------------1-----------------1--------------1--------------------------------------------1211-----111111112211112--1-1---1-1-------------11111----1-1-----1111-1-------1---------11-1-1-1111111-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1--------------2----------------------------------11-11-1------11--------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-11--------1111----21--2------------------------------------------------1-11---------------------------------2-11--------------------1------------------------------------------------------------------------------------1-------------111----------1---1-----1-----------------21----------1-----1-11---------3------------------------------------------------------1-- --11--------1------------------------------------------1--------------------------------------1---------------------1--------------------11-----2-------------1-----------------5513111237799-05--11---
 sphohydrolase                     *                                                                               *                                      *             *                 *              *                                            ****     ***************  * *   * *             *****    * *     **** *       *         ** * * *******                                                                                           *                    *              *                                  ** ** *      **              *                                                                                                                ** **        ****    **  *                                                * **                                 * **                    *                                                                                    *             ***          *   *     *                 **          *     * **         *                                                      *     **        *                                          *                                      *                     *                    **     *             *                 ************* **  **   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4937] PF03604            190                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA_RNApol_7kD:DNA directed R  ---------------------1---------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1--11111----11-1121-11111--111111111-1111111111111111-1111-111111111111111111111111111111--11-11--1-11-2-2-1-1-1-1-1-11-241-13221222-1131212-1121112111141122112111111-1-11111--111-11-1113-1121--1-1-1
 NA polymerase, 7 kDa subunit                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *  *****    ** **** *****  ********* **************** **** ******************************  ** **  * ** * * * * * * * ** *** ******** ******* ************************* * *****  *** ** **** ****  * * *
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 Bac_rhodopsin:Bacteriorhodops  ------------------------64433222------------------------------------ --------------------------------------------1----------------------1--------------1------------------------4-------------------------------1-------12----------------1-1------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------ ---------------422311112222111111222111111111122--333311112111--1---1114--1222221322121115712---11122-3-------------------------------------------------------------------------56---1111--1-2---------
 in-like protein                                        ********                                                                                 *                      *              *                        *                               *       **                * *                                                      **                                                                                                                                                                                           *                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                              *********************************  ************  *   ****  *******************   ***** *                                                                         **   ****  * *         
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 Cytochrom_CIII:Class III cyto  -------------------------------------------------------------------- -23------------------------------------------------------------------------------------------------11111-11--------------------1-------44422---------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------31-------------11-------------------11-11-11------------1---------------------------11----------------------------------------------------------------------1-------1-------1------------------------1460-765556878-2422333--321311-2-1-------------------1-----------------1211-11212-213--21---2------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------11---------------------------------------------------1-1 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 PPC:Bacterial pre-peptidase C  -------------------------------------------------------------------- --3-1---------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------2--------------------3-5------------1-1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1--------------------1---------------------53-----------------------------1--1--51-2-3767551111112118110---------------------------------------------------------------------------------------------------7-----------6-------------------------------------1----------------------44444311212243433233---------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------11------------------
 -terminal domain                                                                                      * *                                                               **                                                                            *                    * *            * * *                                                                                                                                                                                                                                      *                   * *                                                                                                          *        *                    *                     **                             *  *  ** * *******************                                                                                                   *           *                                     *                      ********************                                                                                                                                                                                            *                                                       **                  
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[4942] PF00862            190                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       11 1        
 Sucrose_synth:Sucrose synthas  -------------------------------------------------------------------- ----1---------------------------------11-2-1----1-----------111--2--11----------------11------------1---1-1---------------------------------1----2-15-----111111111122345-111111111111----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1-----------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------1111-11-111111--1111---1-1----------------------11-1---------22311---11--1----------------------1---------------------------22---------------------------------2--2---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1------------------------------1-------------------------------------------11111------1-- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----227966-04-------
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 DUF3029:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------1------------------------------1-----------------------11---1----------1----------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1111111--111111--11--111---1-11---------------------------------------------------------------------------------------------------1111222222212111--1111-11-----1-11111---2------------11--------------------------------------------------1----------------1--11111111---------1-----------------------------------------------------1---------------------------------------------1----------------------------------------------1----------------11--1-------1111-11-----111111-------------1---21-1211111111--1111111-1111111111-------11111111111111111-1-11111--------------------------1------------1111---1-----1---111--------------1-------------121-----11111--1---------------------------------------1------------------------------- ---------1-------------1-----------1----1-----11--1----------------------------------1-------------1-------------------------1---------1---------------------------------1----1----------11------1-----
 nction (DUF3029)                                                                                           *                              *                       **   *          *                            *                                                                                     *******  ******  **  ***   * **                                                                                                   ****************  **** **     * *****   *            **                                                  *                *  ********         *                                                     *                                             *                                              *                **  *       **** **     ******             *   ** **********  ******* **********       ***************** * *****                          *            ****   *     *   ***              *             ***     *****  *                                       *                                         *             *           *    *     **  *                                  *             *                         *         *                                 *    *          **      *     
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 SirB:Invasion gene expression  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------1----------------------------------------------------------------11-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------11--1-111--1-11---111111111111111-----------------------------------------------------------12-211111111111111111111111111---111-------11---111111111111-111111111111111111-11111---111111111111111111111111--111111111111---1-----------1--1111-1111111--11111111----1---------------------------11111111111122-------------------------------------------------------------------------- ------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  up-regulator, SirB                                                                                                                      *                                                                ** *                                                                                                                               **************                                                                                                                                                                            *                                                                                                  *                  **  * ***  * **   ***************                                                           ** ***************************   ***       **   ************ ****************** *****   ************************  ************   *           *  **** *******  ********    *                           **************                                                                                             *                                                                                                                                                                                    
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[4945] PF07967            190                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 zf-C3HC:C3HC zinc finger-like  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 11--111-1---1111111112111-111-1--11111111111-111112-111111111111--1----111111-1-1111-1111121111-111111-111-111-11121212--11141131581-32311-11111111111111111-11-11--11------111-111111111-12312211-111-
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 DUF464:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111111111111122111111111111111111111-1-11-1--1111111111---1221111111111111111111111111111111111---------111111111111111111111111111111111--1---1-1-11111-11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111--------111111-1---1--11----111--1111-111-1------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 DUF1971:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111----11111111111111-------------111111111------------------------------------------------------1-------------1-1------------------1-----------------------1-----1-------11111111---------------------------------------13------------------------------------------------------------1111-----1--------------------------------1---------------------------1111-------1-11111-12----1-11-11-------------2--2-2-1111111--1-111111111111111111-22222112222222222222222211-1---1--111111-11111---------1111-----111111-111-1--1---------1-----------------------------1111-------111-------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3---------------------------------------------------1-----------------------1------
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 AMOP:AMOP domain               -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------6643343332222344242884-435131223342-233143-334523---42321212333------------------1-------
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 sphosphate 2-kinase                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                  **   *                                                                                                                                                                                              *** ***   *  ****************** **********  ***  *     * **    *        ** **    *  **** ********** *  ************************* *** * ****** *************** *** **** **** ********************** 
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  RNA-associated protein 6                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ******* ************ *********************** ************************************************************************ *   ***  ***** *** **********  ** ** ****  ******** *  **  ** *  ****************
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 DUF2264:Uncharacterized prote  ---------------------------1----1----------------------------------- --1-5-----------------------------------------1-----111--2-----21--111------------------1132----------1-1---3----------------1-------------------------------------1-------------------------1-----------------------------------------2--------------------2----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------111142122211---------------------------------------------------------------1------1--------------------1-----------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1--1----------------------------------2---11--------------------------------------1-1-------------------------11111111111-------------1-----------------------------------------------------------111--------12-------------------------------------------------------------------111-1-- ---------------113242213-21---------111--11---1112244343311211--4-------1-1--------------1221111111-----------1--------------------------------------------------9---------------1-3---------1------1-1
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4962] PF12097            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3573:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------1-------------------1--11----------------------1--------------------------1------------------------------1-----------------------------1-1-11----1-1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------11-------2------1-------1--11---------1-------1----------1---------------------------------------------------------1---------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------22121111--------------------1-1--1------------------------5543445551--------------11------------------------------------------------------------------------ ---111--1----------1-11---1----1------------------1-1---------1------1-----1----2--1--1------------------4---1-22-11---21--11--4-371-11-45221--1-11121-134----11111--11-1--121------------24111---1----
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 NPH3:NPH3 family               -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------- -----------------------------------1--------------1--1------------------------1--11-------2-----------------1------1------1----1-----------------------------------1-------------1-------0629-66-------
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[4964] PF02501            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GSPII_IJ:Bacterial type II se  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------111------1111114111111111111112211111--11111111111111-------1----------11-------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111----111------1-12--11111122212-111111211112121122111111-------------------1111------21-111111111--11-----1111-11-----------------------1-1--11121----11---1------------111111111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1----------
 cretion system protein I/J                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  **                                                         *                                                           ***      ****************************  **************       *          **                                                             ******************************    ***      * **  *********** ************************                   ****      ** *********  **     **** **                       * *  *****    **   *            ***************                                                                                                                                                                                                                                              *                        *          
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[4965] PF08952            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1    12                                                                    
 DUF1866:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2111232222222239262283285422224223212121422322221---111112112221-------------------------
 ction (DUF1866)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                             *                                                                                    *                                                                                                           *                                                                                                                *                                                                                                                      *************************************************   ************                         
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[4966] PF02184            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 HAT:HAT (Half-A-TPR) repeat    -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111------1111111112232211-111111211111111111111111111111111---1--------1----------12112112111111111111-1-1-11-11-111111211-21221-11111-111111-1-1111122111111-11111111-1211-1116111112322131--11-1-
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[4967] PF11618            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 DUF3250:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------211---1------------------1--------------------------------------------------------1------------1-1---13224273222232221152833152932113223122222313823133-46--3------121--1112-------------1-1---
 nction (DUF3250)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***   *                  *                                                        *            * *   ************************************************** **  *      ***  ****             * *   
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[4968] PF11413            189                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 HIF-1:Hypoxia-inducible facto  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------43256632-23336617-256-66721333334413221522634332----------------------------------------
 r-1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ******** ******** *** **************************                                        
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 DUF134:Protein of unknown fun  --1-11----------1----211------1-1-111-11111-121112333-1111111---1--- --1----------------------1------1----1-1-----1-------------------1-1-----------------------1-1------------------------------22122122211---1-111-----------------------------------------------------------------11--1-------1---11111---1-----------------------------------------------------------------------------------------11-111111111-1-1-331---11-----1-111121111111111----------------1---------------------1-------------------1---11------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1--212-2-21--------1-1----------1---------------------11-----13---------122--21---1111111----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--1--------------------122311111-1111-------------------------------------------------------------1------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction  DUF134                    * **          *    ***      * * *** ***** ********* *******   *      *                      *      *    * *     *                   * *                       * *                              ***********   * ***                                                                 **  *       *   *****   *                                                                                         ** ********* * * ***   **     * ***************                *                     *                   *   **                              *                                                                                                         *  *** * **        * *          *                     **     **         ***  **   *******                *                                                                                                                              * *  *                    ********* ****                                                             *                                                                                                                                                                                                                    
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 Sec61_beta:Sec61beta family    --1--1------------------------------------------1----1---11-------1- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1--111--1------11111111111111111111-121111111111111111111111111-11-11-21-112222211111-11111-11111111-----2-11-211111--11--112112-131-111-11111-11111-11-11111111-11212-11111111-11-1111--34-3141--11111
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 ApoLp-III:Apolipophorin-III p  ------1---------------------1----------------------1-----11--------- --1--1-------1-----------------------------------------------------------------------1-------1------1------------------------------------------1---1-----1--------------1----------------------1------------------------------1----------------1--11----1-------------------1----------------1-----------------------------------------111111--1-1-----------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1--1-----------------------------------------111---------------1----------------------------------------------------1---------------------1---------------------------------------1-1-----------------------------------------1----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-111---- -----1--------1-1--1112-----------1-----------111-------2-11---------1-----1--1--1-1-----1--1---1-1----1-1---1411--4--1--13-14241613-541-----2---11-1----5---31-3-3--314-3--151--1-3-1---3--1--1---212-
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 XLF:XLF (XRCC4-like factor)    ----------------------1--------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------98999999----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------11-------------------------------------------------- -----------1---111111111-111111111111111-1111111112-1112111111--1--1--1-----1---1-----------1-----------------2112-2-1----11-1-11681-1111---1-11111----1-1111111---211-2-----21--------------1---------
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[4976] PF12082            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3559:Domain of unknown fun  ---------------------------------------1---1--11-1313---1-1--------- -----2-------1-------2-----------2-22-------------------------1---------------1-----------21----------------------------------1-2---1------------1-----1----------------11-----------------------------1----1-------------11-----------1----------------------------11---22---------------------11111111111------------------------1---111-1---1----------------1----1--1-1------1---13-------------1---11------------------------------1--11-----1-11--------1-----------------------------------------------------------------------------------------1--------1----11------------1-------22-------1----1-1--1----------------------1----------------11-----------2---2----1--------1------------3-1-1--11212---------------1-11111---121--1--1----2--1111--11---------------------------------1111-------------1-11-11--------------1-----1-1----------------------1---1-----111----------------------1---------------------1----------------1-- ---1-1--------1---------1-----1--1---------------1--1--1-----------11-----------1-------1------2---------1----1-111-------------------------2-1-------1---1-------2---------------------------11-------
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===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4977] PF06840            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2                                                                     
 DUF1241:Protein of unknown fu  ------------------------------------------------------1------------- --------11----------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111------------11--1-1---1111---------------------------------------------------------------1-1--------2--2-22125221222122-61396-1-8112121241222122124233321-41112123342152-----1------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4982] PF08609            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Fes1:Nucleotide exchange fact  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111----11111111111111111111111111211--1111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111--1111--2-13221-1-11-11121112-232-1-2-1-11-1111--1111111-121--1-2111212---21-1-14-1--23233142-------
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[4983] PF05979            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF896:Bacterial protein of u  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------112222222212222221111112221111111222222-2122222222222221211222-111111111111111111--1-1-11111111111111111111111111111111111111111111-111-111-1-1---11------1-----111-1111-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------------------------------- ---------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 SPC12:Microsomal signal pepti  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1111-1--1-11111--111-1-1111111-1-111111111111211-11111111-11-1--11-11-1-111111-----11---111-1--1-11-1---12-211111111122111111-381-11111111-1111111-21111121142-11-1111112111-11132111161-412311-1--1
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 YcgL:YcgL domain               -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------111111111111111111111111111111---1--1------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---1----------111111111111111111111111111111111111111111111111---------1111111111111111111111111---------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[4987] PF08551            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 DUF1751:Eukaryotic integral m  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11----1-11111111111111-11111111111-----11112121111111111221221-1111121211-11111-111-122111111111111111-1--2--112-11111-1-1111131-11111--1-111-11-1-1-1-1-11111211111111--11-11121111123421111-1----
 embrane protein (DUF1751)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **    * ************** ***********     *********************** ********** ***** *** ****************** *  *  *** ***** * ******* *****  * *** ** * * * * **************  ** ***************** *    
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[4988] PF12550            188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 2   1                                              13                                                                                             
 GCR1_C:Transcriptional activa  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------1-----1----1-------------1-11111210-----12758434512234234633333---------14112---507-----------------------------------------------------------------------------------------2-1-
 tor of glycolytic enzymes                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                  *     *    *             * ********     ***********************         *****   ***                                                                                         * * 
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 MBF1:Multiprotein bridging fa  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------- --11--1-111-111-1111111111111111111111111111111111111--1111111111111-21-11111-111111111111111111----11-111-1--2-111121----1111-41342-216-12111122-11121--12111111-1211121211111----1---112123131--1-1--
 ctor 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                     **  * *** *** *************************************  ************* ** ***** ******************    ** *** *  * ******    **** ***** *** ******** *****  ******** *************    *   *********  * *  
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