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Ranking of RP:PFM:REP : from 5101 to 5200

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Trs120:Transport protein Trs1  -----------------------------------------------1------111----------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111---------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----11----1--11-1111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111-1111111111112-1---1----11211-11-2-11--21112-1123---4211212111-1--11-111-1---121112211----1-1-------1-----1-211-122--1112-
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[5102] PF05280            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 FlhC:Flagellar transcriptiona  -------------------------------------------------------------------- ---------------1111-1-----1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111112111111111122231111112222232--3212112111-11211-1111---------111-12------------------------------------------------------------1--------------------2--------------------11111121111111111-11-11111-1111111111---11112111111112111111111-11111211111-1111111----------------1--------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------11-----------------------1-----1-1-----------------------------------1------------------------------------------------------------1-----------------------------------111----------
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[5103] PF10221            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DUF2151:Cell cycle and develo  -------------------------------------------------------------------- -------------------------1-----------------1----------------------1---------------------------------------------------------11----1--------------------------------------------------1-------------------------------------------11--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------11---1-----------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1111--1--------------------------------------------------------- ----11------1--1----------21---111-------------2-2-111----------1--1------1--------------------------1-111---22242312111211135131341-3-61-211133121211122621212--31132221111221----1-----1-------1---1-
 pment regulator                                                                                                              *                 *                      *                                                         **    *                                                  *                                           **  *                                                                                                                          *           **   *                                         *                                                                                                                                                                               *             *                                                                                                                *                          *                                                                   *                                         ****  *                                                              **      *  *          **   ***             * * ***          *  *      *                          * ***   *********************** * ** *********************  **************    *     *       *   * 
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[5104] PF04320            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF469:Protein with unknown f  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------------------------1----111111-----11--------11----1--------11-------------1---11-11---1-------------------------------------------------------------11----1-1-11111111112211111111-------------11111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111----------------1-111111111111111----------1-22221111111111111---------1111------11111-------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------
 unction (DUF469)                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                  *                                                                                                         *                                                                                                                     ****                                                      *    ******     **        **    *        **             *   ** **   *                                                             **    * * ********************             ***************** ***************************************************  ************                * ***************          * *****************         ****      *****                                                                                                                                                                               *                                                                                                  
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 Amidoligase_2:Putative amidol  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------1111--------------------------------------------------------------------1-----------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-22------3--1--5-3-2-1-----1--1----------------------1----------------------------------------------1-----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------------------1-1-11-----------------------1-------11-1--1---------------------1-1-1--------------------------------------------------------------------------------------------1-----------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1111-----1111--112254323322221118722464423455222---1-------------------------11-12----------------1--1-------------------------------------1-----------------------------------1---3----1
 igase enzyme                                                                                                                                                                                ****                                                                    *                             *                                                                                                                                                  * **      *  *  * * * *     *  *                      *                                              *                       *                                                                                                                  *                  * * **                       *       ** *  *                     * * *                                                                                            *           **                                                                                                                                                              ****     ****  *********************************   *                         ** **                *  *                                     *                                   *   *    *
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 Ada3:Histone acetyltransferas  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------42--11111111113111111111111112222222111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111112211--131112-2111--1131111371-112-1--11111112111--11111-----1--1-1----1----------11-111-1-------
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[5107] PF03168            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     2253 2        
 LEA_2:Late embryogenesis abun  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------1---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------11---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1-----------1-----------------0751-97-------
 dant protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                 **                  *   *                                                                                                                                                                                                                                                *                            **   *                                                                                                                                                                                                                      *                                                 *           *                 **** **       
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[5108] PF11710            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Git3:G protein-coupled glucos  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------- ------------1--44313221232223222222211111112222211244333522111214111111122211-111111111111564345312-14--------------------------------------------------------1----1-------------------------4---------
 e receptor regulating Gpa2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                                               *  ************************************************************** ********************* **                                                        *    *                         *         
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[5109] PF07869            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1656:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111---11----11111111111--11--11-----1-----------1-------------------------------------------------------------1--1-11--222322211112222111111222-122--------------2---------------------------------------------1---------------------------------------------1---------------------------------11-1-111111111111-11111111111111111111111----1111111111111111-111-1111-111111111111--------------1-1--------------------------1---2-2212-11121222--------------------1---1111111------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------
 nction (DUF1656)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ****   **    ***********  **  **     *           *                                                             *  * **  ************************ ***              *                                             *                                             *                                 ** * ************ ***********************    **************** *** **** ************              * *                          *   * **** ********                    *   *******                                                                                                                                                                                                                                                                *          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 SRP1_TIP1:Seripauperin and TI  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------1111-2193212124341---11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 P1 family                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **** *************   **                                                                                                                 
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[5113] PF11540            181                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1    22                                                                    
 Dynein_IC2:Cytoplasmic dynein  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1233533211222245271222-64622223124122221321313222133-11---11-----------------------------
  1 intermediate chain 2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ********************** ***************************** **   **                             
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[5114] PF08438            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MMR_HSR1_C:GTPase of unknown   1111111111111111111111112222122211111111111111111111111111111---1122 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111-211-1111111111111-1111111111-11111111111111111-1111111111111111-11111111111111111---1----------------12----------------------------------------------------1-1-------1---1-----------1----1111-
 function C-terminal            *************************************************************   ****                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                           *****                                                                                                                                                          ***** *** ************* ********** ***************** **************** *****************   *                **                                                    * *       *   *           *    **** 
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[5115] PF11769            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3313:Protein of unknown fu  ----1------------------------------------------------1-------------- --------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1112----1--1------------22-22111----4112---221-------------------------------1-------------------------------------111---------------1------1-------1--1-------------2----11-------------------1-1--223-------2-1------1----------------------------1-1---3-----------1-----121-11-------------21-1-111111111111-11111111-111111111111111---111111111111111121-1111---1------------------------1-----------------------------1--12-212121211--11-------------1-------1----1111-------------------------------------------------------------------- --------1--------1--------------------------------------11-------------------------------------------1-----------1-----------1--------------1------1-------11-1----------12--------------1-------------
 nction (DUF3313)                   *                                                *                                                     *                                                                                                                                    *     *                                                                                                                                                                                                        *      ****    *  *            ** *****    ****   ***                               *                                     ***               *      *       *  *             *    **                   * *  ***       * *      *                            * *   *           *     *** **             ** * ************ ******** ***************   ****************** ****   *                        *                             *  ** *********  **             *       *    ****                                                                             *        *                                      **                                           *           *           *              *      *       ** *          **              *             
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 Prim-Pol:Bifunctional DNA pri  --------111---12-------------1-----------------1-------------1------ ----2--1-------2-----1--1--------112-1----1--1-1-------11---21--2-34451----2------1--------------------------------------------------1-------------2--------1---------111--------------1-1---1-------------------------------------------------------------------2-1---22--1212-1--113-1---1----------------122--122-1------------2-------------1----1-----9-----------2----------------------------121----1---------------1--4-1-1----------------------------1111111111----1----------------------------------1--------11------------------------1-----------------1-----------------------1-----4-----------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1-----------------------------------11-----------------------------------------------1----------------1----1--------------------------------------------------1----1--28----11--1--------
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 GPDPase_memb:Membrane domain   -------------------------------1------------------------------------ ---------------1111-11--1-1111111111------11-11-11111111------1----1121-------------------------------------------------------------------1----1-1-----111-------1---111----------------------1--111111111111111------111---1---11111111-11111111111111-----211-11-11-11111112212--111-111---1--111111111111111111111111111---1111-1---1111111-11-1--1---21-----------------------------11---------1-----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1----1----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------1----------1------------------------------------------------------------------------1---------1----1--------------------------------2----------
 of glycerophosphoryl diester                                  *                                                    **** **  * **********      ** ** ********      *    ****                                                                   *    * *     ***       *   ***                      *  ***************      ***   *   ******** **************     *** ** ** ***********  *** ***   *  ***************************   **** *   ******* ** *  *   **                             **         *                                               *                                                           *                                                                                                       *                                              *    *    *                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                   *          *                                                                        *         *    *                                *          
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[5119] PF11989            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Dsl1_C:Retrograde transport p  -----------------------------------1---------------------------1---- -----------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1-----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------11--1--------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- -----11-----1-11111-11111111111111111111111111111111111-222111111111-1111-111-11122111---1211111-1-111111--1-111211111-1--2111-11161-1121-121--11111-111111211111-11221111-12---------111-11-111-------
 rotein Dsl1 C terminal                                            *                           *                                                                                        *                   *                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                   *    *                                                                                                                                      *            *                 *                                                                                                           *               **  *                                                                                *                                               **     * ***** *********************************** ************ **** *** ********   ******* * ******  * ********* *  **** ***** **** ***  ***** ************ ******** **         *** ** ***       
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[5120] PF09154            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1939:Domain of unknown fun  ---------------------------------------------------------1---------- ----------------------------------------------------------------------------------------111--1------1-1-11--1------------------------------------1-----------------------------------------------111111---1-111---11--111-1---22--------1------------------------------------------1--111111111111111111111-------------1--111---1------------1-1-----------11-----------1---------1--------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1----111111111111-1111111111111-11--1111-----1-11111111-1111111111111--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------11 --------------111111111222211-111-1111111111--11--------311122------------------------------111111111-1------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction (DUF1939)                                                                         *                                                                                                   ***  *      * * **  *                                    *                                               ******   * ***   **  *** *   **        *                                          *  *********************             *  ***   *            * *           **           *         *                                                  **                                                                                                                                                                                                                             *                          *    ************ ************* **  ****     * ******** *************  *                                                                                                                                                               *         **               *************** *** **********  **        ******                              ********* *                                                                                                
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF3712:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------1----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------21212533472873411111112212122222-112223222233222-----------------------------32-35----3-7259----------------------------1-----------------1------------------------------------2----2346-
 nction (DUF3712)                                                                                                                           *                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ******************************** ***************                             ** **    * ****                            *                 *                                    *    **** 
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[5123] PF09750            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 DRY_EERY:Alternative splicing  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --1---1-----112----------------------------------------------------------------------------------------121----32312412-1122121232402-326211222221122-13112211212323222252162621--2-----212-32-11--211--
  regulator                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *   *     ***                                                                                        ***    ******** ************* *************** **************************  *     *** ** **  ***  
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[5124] PF05615            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 THOC7:Tho complex subunit 7    -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1------11-1111111111-111111111111111112221211111111111111--------------1-----------12-11111------1-1---1-421111121111111211-251-2141--22-221111121111111111121112131111111-11161111-1221121--21112
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 HH_signal:Hedgehog amino-term  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------1------6454474333123233142643-234-33231353-3321322334233223111122111--2-------------------1-----
 inal signalling domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                          *                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                              *   *                                                                                                                                                                                                                            *      ********************** *** ******** *************************  *                   *     
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[5128] PF08272            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Topo_Zn_Ribbon:Topoisomerase   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111------1--11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--11----------111111111111111111111111111111111111111111111111----------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 I zinc-ribbon-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *******************************      *  ******************** **************************************************** ************  **          ************************************************          **************                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[5129] PF01848            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 HOK_GEF:Hok/gef family         -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------1---2-510-562223-4466382412033555542232---12------1-1--3----4363-6-3--------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[5133] PF12253            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CAF1A:Chromatin assembly fact  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --111-1-21--111-11-1111111111-1111111111111111-111-11111111111111111-1111-111111111111-1112111111111111212----211113-111-1111--2-261-3121-1-11-11-111-11-213121-1111-4-11111111111--1--1-111-11111---1-
 or 1 subunit A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *** * **  *** ** ********** **************** *** ***************** **** ************ *******************    ****** *** ****  * *** **** * ** ** *** ** ****** **** * ***********  *  * *** *****   * 
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[5134] PF09799            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Transmemb_17:Predicted membra  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-1-1-111-------------------------------1----1--------------------------------------------------------21334223-223133244232784-42312324334213221312313222212121--511--12--1235------------------1
 ne protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    * * * ***                               *    *                                                        ******** *************** ********************************  ***  **  ****                  *
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[5135] PF11648            180                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                   2                                                                    
 RIG-I_C-RD:C-terminal domain   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------11222214212433245341513-42523223332233333433232333111233------123-------------------1-----
 of RIG-I                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *********************** ********************************      ***                   *     
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[5138] PF07908            179                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 D-aminoacyl_C:D-aminoacylase,  ------------------------1-----------------------------1------------- -35-2----------11-------12------1111--11----111-----1----1----1---111----------------------------------1----------------------------------------1--------------------1----------------1------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1------1---------21-1---2-1-------511-113-------132------------------------------4-----------------1-1------------------------------------------------------1141-122142222221111122211111112122143--111-------2232-------------------------1---1--------1------------1-------------------------------------------------------1--1-----------------------------------1-------------11-1---------------------1-----------------------------------------------------------------1-----111------111-------------1-----1-132-------------------------------------------------------------------------- ---------------1--------1-----------------------11----------------------------------------------1111---------------------------------------------------------------------------------------------------
  C-terminal region                                     *                             *               ** *          **       **      ****  **    ***     *    *    *   ***                                  *                                        *                    *                *                                                *                                                                                           *              *      *         ** *   * *       *** ***       ***                              *                 * *                                                      **** *********************************  ***       ****                         *   *        *            *                                                       *  *                                   *             ** *                     *                                                                 *     ***      ***             *     * ***                                                                                          *        *                       **                                              ****                                                                                                   
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[5139] PF07879            179                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PHB_acc_N:PHB/PHA accumulatio  ---------------------------------1---------------------------------- -11--------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------11111---1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----1111111111111------------11111222111-111111111111111111111111111--------111-1111------------------------------1111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111----11----------111111---------------------111111----------------------------------11-------------------------1-111--------------------------------------------------------------------------------------------------1111---1--------------------------1--------------1---------------------------1111111111------1-111111------------------------------------1--11--------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
 n regulator DNA-binding domai                                   *                                    **                                                                                                        *                           *****   *                                                                                                                                                                                                                                       ****     *************            *********** ***************************        *** ****                              **** ****************************************************    **          ******                     ******                                  **                         * ***                                                                                                  ****   *                          *              *                           **********      * ******                                    *  **                                                                                                                                                                        *                                        
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5140] PF07749            179                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ERp29:Endoplasmic reticulum p  ---------------------------------------1---------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----122-311-11111111111111111111111111111111111111111111111111-11--------11------1-1--11111111111111-1111---112-----11-1111112-21141-111-11-1111111-1111-313121----12111132--2--21-----111252113-121112
 rotein ERp29, C-terminal doma                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *** *** ************************************************** **        **      * *  ************** ****   ***     ** ******* ***** *** ** ******* **** ******    ********  *  **     ********* ******
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 ein A                                                                                                   **                           ***      *                        **                        *      * *                                    *     *  *  *                                                                                                                            **                                                       *                                                                                                                 *                       *                                                          *        *          *    *          *   *       *                                             *                     *                                                 *              *  ** ****************  ***  *                       *                             *     **                                                                                                                  ** * ** * * * * *     * * **         ****** **  **       *  *  **     * ****  *    *    *   *   **** ***   ** ** **  *   * *** * *** *** *  *     ***   **    *   *** *  ** **           *** **  *  *  
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 DUF968:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----112-1113-1--1---1--------1-11----1-1-------------------------------------------------1---------------11-----1-----1------------------------------------------------------1-----------------------1--------------------------------------------------------------------1---------------------------------1----2-----------------------------------1--------------------------1---------------------11---1-------------------------------------------1---2-166213-43--81-1124113743-11112-11----11---111-1---1--1-1412121----------------------------------1------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------- --------------11-------------2-----1-111-11--------------------------------------------------------------1----1---1--------1---2-541-11---1-----1----------1--1------------------------1---------------
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[5149] PF04664            179                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 OGFr_N:Opioid growth factor r  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------111-------------------------------------------------------------------------- ----111-311-----112---------------------------11-----------1-------1----------------------2-1111111112-------22232363222222243142832-53312111-22122121311323323---211------------------------11---1----
 eceptor (OGFr) conserved regi                                                                                                                                                                           *                                                                   *                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                  *                                                       ***                                                                               *** ***     ***                           **           *       *                      * **********       *********************** ******** *****************   ***                        **   *    
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[5150] PF03089            179                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 RAG2:Recombination activating  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- -1---11-311----2-11-1111111---111-----------21-----1-1-------------1-------------------11-2--1---------122---1-24263123-112163131513-443-3223122213-1-312423221----131-1--1--1-----1--------1---112113-
  protein 2                                                                                                                                                                                                                                     *                                          *                                                                     *                                                                                                                                                                               *     *                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                           *   ** ***    * ** *******   ***           **     * *             *                   ** *  *         ***   * ******** ************ *** ********** * *********    *** *  *  *     *        *   ****** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 HHA:Haemolysin expression mod  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------32221212235243133-32233242243332222222441211122223222232322222343221331111111111311--1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ulating protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ***************** *****************************************************************  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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 zf-primase:Primase zinc finge  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-31---1111111111111111111111-11111111111111111111111111-111---111-111111111111111112111111111----1--1--1211112111111121121592-111-2211111-11-1-1-12111111111111-1111111--11111111--1-111------1-
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 in conserved in bacteria (DUF                                              *   *                        *          **** *   ************  ** **  *   **      *        ****                                **   *                ******  ******     * *******  ********** *****************                                                                                                                                                 ******* *             *     **  *              *             *                      *  * *  *              *** *      * *        *     *                               *               *                                  *    *                *   *** *** ***** ********       *                      *         **                      *    ** *                                                                                                       ***                       *  * ****                       *                             * **                                                   *                                        *** **                                                                 * *                                    *                           *****  **        *      
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 tRNA_synt_1c_R1:Glutaminyl-tR  ------------------------------------------------1------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----22--2111111-----------------------------------------------111111111111111111111111111111-1111111111111-1-2212113111111111-111921-122111132122111111112111111-01111111111111-11-----111222-13----1--
 NA synthetase, non-specific R                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     **  *******                                               ****************************** ************* * **************** ****** *************************** ************** **     ****** **    *  
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[5160] PF10099            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[5162] PF09832            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2059:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -21-------------------------------------------------------------------------------------111-----------1-----1-------------------1----------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---111111112111111111111111111111-2212212211--11--1111111111-------------------------------------------------------------1-------1111111111111111111111111111--111------11-------1-11-1111111------------1---------1----1--1221-1-----------------------------1-------1---------1------12-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------111-11--121-11111111111111111---------1--------------11111111111111---------------------------------------------------------1-1 ---------------------------------------------------------1-----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[5163] PF11221            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Med21:Subunit 21 of Mediator   -------------------------------------------------------------------- -1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--------------------------------------------1-----------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------111-2211111111-21222211112111111221112111123111211111111111111111111111111111--12114--11-1-111-1-12231-22--1--1-1111-121-1-11--21-111121--1--1-1-11--111-212-12--21--112-----1--211--1--1--
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 Lact-deh-memb:D-lactate dehyd  -------------------------------------------------------------------- --------11----------------------------1-------1----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1-------1-----------------------------11---------------------------------------------1-1------------1---1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1-1111--1-------1---------------------1-1-1----1--11111111---1--------------------------------------1-1-1----1---------1--------11--------------1--------------1111111-----1----------------------------------------11--------------------2---------------------------------------11--1111111111111-11111111111111111111111-111111111111111111111111111--211111111111-----------------11111---1111111-1111111--1----------1---------------------1-----11---11------------------------------------------------------------------------ -----------------------111------------------------------------------------1------------------------------1---11---------3----------------------1-1-------------11--------------------1----------1111---
 rogenase, membrane binding                                                                                  **                            *       *                                                    *                                                                        *       *                             **                                             * *            *   *                                                                                                           *             * ****  *       *                     * * *    *  ********   *                                      * * *    *         *        **              *              *******     *                                        **                    *                                       **  ************* *********************** ***************************  ************                 *****   ******* *******  *          *                     *     **   **                                                                                                ***                                                *                              *   **         *                      * *             **                    *          ****   
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[5167] PF10269            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Tmemb_185A:Transmembrane Frag  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1 ----23--72----3-------------------------------------1-----------1--------------------------------------211-212635322211221213312-212-123112-41121-121111-21111111112311232-1221----------1113-41122555-
 ile-X-F protein                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                              *                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *     **  **    *                                     *           *                                      *** ********************* *** ****** ***** ****** ***************** ****          **** ******** 
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[5168] PF09148            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1934:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---111-1111--1-111111--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------ -----------------1-----------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------
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  motif, C2HC5-type                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               **  *** *********************** *** ********** ****************************** *********** * **  ****  **** ************* ** **** *** ****  ****** **  **** *********** *** ****             *** **     
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Tape_meas_lam_C:Lambda phage   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1--1-1-------------------1-------------------------------------3-1------------11---3-111-1---------1-----1---------1---1----1-1------------------21-----------------1------------------------------------------1------1-1-------------------1------073-315---21-4123244144111-11-----1-2--1-11-21-113--2-22-21-1---111-1111------------------------------------------------223111-1-11-1-1-1-------------1------------------------------------------------------------------------------------ -----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 Ninjurin:Ninjurin              -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------73523422-1-22142-21492-324-1122222--12-2221222221-31111430033--2-------------------------
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 ATP_synt_H:ATP synthase subun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-------2111--1111--------111--------111111--11111-11111111-----1--------11-1------1--1-1-211111--11-1-111-12-1112132111112-22121853-11311112-1211111-211112212---2111-6121111111-121111-1112132-------
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 VASP_tetra:VASP tetramerisati  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111--------------------------------------------------------------------------------------------------------552862211134398-3-643-43721123133-22111921527212---2----6--3----------------------------
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[5175] PF05181            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 XPA_C:XPA protein C-terminus   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-----1111-111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111121-1111111111111111-211-2111-1-11-33131141-2111111111111112111-11111-1111211-111311-1-1--1---1-----1---12111-
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *     **** ************************************ ************************************** **************** *** **** * ** ******** ******************* ***** ******* ****** * *  *   *     *   ***** 
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[5176] PF12203            178                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 HDAC4_Gln:Glutamine rich N te  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------243454121223383142186245623214133113211521435234--------2-----------------1-----1-------
 rminal domain of histone deac                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                   ************************************************        *                 *     *       
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[5177] PF10143            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhosphMutase:2,3-bisphosphogl  111111111111111121111112--------222122333331222111111111111111111-11 ----------------------------------------------------------------------------------11----111111------------------------------1----1----------222---------------------------------------1111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-----1-1----1--1-11------------21-----------------1----------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111-111-1-111111121------31-------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1111111111---- ----11--211---------------------------------------1----------------------------------------------------111---1------------------------------------------------------------------11------21-13-21--1111-
 ycerate-independent phosphogl  ************************        ********************************* **                                                                                   **    ******                              *    *          ***                                       *******                                                                                                                                                    *   *     * *    *  * **            **                 *                            *                                                                                                                                                     *  **** *** * *********      **                                                                         *                                                                                                                                                                                     *                                           **********         **  ***                                       *                                                    ***   *                                                                  **      ** ** **  **** 
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 SLA_LP_auto_ag:Soluble liver   -----------------------2----------12222222221211121112-------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1----------------------------------------11-------------1--------------------------------------1--------------1--------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----- 11--11--311----------------------22-1------111--1----------------------------------------------------------131311121111111113-13-302-21211111111-111111111111221131-11-121112111111812111-------1111111
 antigen/liver pancreas antige                         *          ********************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                            *                                        **             *                                      *              *                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *      **  **  ***                      ** *      ***  *                                                          ****************** ** *** *********** ****************** ** ******************       *******
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[5180] PF06450            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NhaB:Bacterial Na+/H+ antipor  -----------------------------1-------------------------------------- --1-----------------------------------1----1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------11----------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------13------------------------------------------------111111--1--1111111111111111111-------------112-11-1111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111--11-111111111--------------11-1111111111-----1------------1111111--111---------------11111111111111---------------------------------------------------------------------1---- ----1-----1--1---------1-11-----------------------1------1---------------------------------------------------------2------------------------1-------------------1-----12--------------------1--------1-
 ter B (NhaB)                                                *                                         *                                   *    *                                                                                                   *                         *               **                                                                                                                                          *                                                                                 *                                   **                                                                **                                                                    **                                                ******  *  *******************             *** ** ********** ***************************************************  ** *********              ** **********     *            *******  ***               **************                                                                     *         *     *  *         * **                       *      *                                                         *                        *                   *     **                    *        * 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF1007:Protein of unknown fu  --------------------------------------11-1-------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------1-------------11111-111111111111111111-11211311111-21121211111111---311-----11-------------1-1-----------------------------------11111------1------1---------------------------1-------------------------1-----1--1------------1--------11211----------------------------------------------------------1------1111-11------------------------------11111--111111111111111111-------1-111111111111----------------11111-1-1111-1111----------------------1----------------1--1------------------------------------------11---------------------------------------- ----------1---------------1--------------------------------------1---------1----------------------------------2------------11---------------21------------------------------------------------1----31-1
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[5182] PF11897            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3417:Protein of unknown fu  ------------------------------------------11--211-----2111111------- --1----1111---11111-11--11111111111111111111111--11-1111------1-1111111-----------11----11221111---1-------1----------------111-111111111111---1----2---22--------1-11221-------------11111--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1---------22-----1----1--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------------------221--1--21-11111111111111111-1------4------------------------1111----2-----------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------------1-------------------------------------------11--1--111--- -----------------------------------------------1----------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1---1--------1-------------------
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[5183] PF10179            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DUF2369:Uncharacterised conse  ---------------------------------------------------------1---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-----------------------------------------------------1--------------------------------1-------1-1------2552642322412255142564-53523433332223312422224444----211-1-11-1--------------------------
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 0kDa (Rpp40) subunit                                                                                                                       *     *                                                                                                                        *                                                                  *** ** *******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *  **                                                                                                                                                                                                                                                                                                     **      *********************************** **** **********          *            ***** ****     ***** *  *********** ********** **************** * *******   ****  ***  **  ***    *    *  * **** 
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[5187] PF06699            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PIG-F:GPI biosynthesis protei  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----11---------11111111111111-111111-111-111111122122111111111111111111111111-11111111111--111111111-1-11--1-1221121111-11111112-332-21211111111111-1-12111111111-1111-122---11---11-11--1211111---1-1-
 n family Pig-F                                                                                                                                                         *                                                                   *                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **         ************** ****** *** ************************************ ***********  ********* * **  * ********** ******** *** ************** * *********** **** ***   **   ** **  *******   * * 
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[5188] PF11739            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DctA-YdbH:Dicarboxylate trans  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------33342323-3------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----1----------------------------------1---------------11-------------------------11-------------------------------1111-----------------------------------------------1------------------------1111-1--------------------------------------------------------1-111111111111111111111111-------------11-11111111111111-1111111111111111111111111111111111111111-1111111111--111111111111---1----------11--11111-1----1-------------1-1111----1----1----------------2----------1---------------1------------------------------------------------------1-- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1----11-----2-------------
 port                                                                                                                                                                                                                             ******** *                                                                                                                                                                                                                                                ****     *                                  *               **                         **                               ****                                               *                        **** *                                                        * ************************             ** ************** **************************************** **********  ************   *          **  ***** *    *             * ****    *    *                *          *               *                                                      *                                                                                                                                                         *                      *    **     *             
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 XendoU:Endoribonuclease Xendo  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1----1--------------1-------------------------------------------------------------------------419554472111111121121261-11311112111-111111-13123232313456221123331-11------12111--12121111
 U                                                                                                                                                                                                                                    *                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         * *                                                                                                                              *                                                                                                                                                 *    *              *                                                                         ************************ *********** ****** *********************** **      *****  ********
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[5190] PF06530            177                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Phage_antitermQ:Phage antiter  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------11--------------------1----------------------------------11111111-----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------2------------------------------------------------1-------------------------------------1--------------112133113121114-12-232-2333221222-2---3231-----------1--1--1-11-21-322221222222--2---------------1-111--21-1-------2-1---------2-----1--2--------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-3-402-3-1---------1-----------------------------------------------------
 mination protein Q                                                                                                                                                                                                                                **                                                                                                                                                                                                                                       *               **                    *                                  ********                                                                                   *                                  *                                                *                                     *              *************** ** *** ********** *   ****           *  *  * ** ** ************  *               * ***  ** *       * *         *     *  *                                            *                                                                                                                                                                                  *    * * *** * *         *                                                     
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 PPI_Ypi1:Protein phosphatase   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-------1-1-11111111--1-11-111111111-1111111111111-111-1111111111111111111211111122212111--111211111-1-111-1--2111-111-1111112111811-111-11-11123-1--11-131--11--1111--2-1-22-1111-----1-122211-11--11-
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[5196] PF11658            176                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3260:Protein of unknown fu  -------------------------11--1-------------------------------------- ---------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1-----------------------------------------------11--------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------122222-111-33-11111-1231-1-1-1---1-----------1-----1-------------------------------------1--------------------------------------------1----------1----------------------11--11-1111111111-11111111-111111111111111--11111212111111111112-1111--1------------------------1----------------------------------------111-1-------------1111--------11-------1------------------------------------------------------------------ --------------------11--------1---------------111----1-----------1----------------------------1---------------1--------2-11121---2611215-------11-1-1-2---------------1----------2----------------1-1--
 nction (DUF3260)                                        **  *                                                                  *                                                                                                                                                                                                           *                                          *                                               **                                            *                                                                                                                        *    *         ****** *** ** ***** **** * * *   *           *     *                                     *                                            *          *                      **  ** ********** ******** ***************  ******************** ****  *                        *                                        *** *             ****        **       *                                                                                       **        *               ***    *           *                            *               *        * *****   *******       ** * * *               *          *                * *  
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[5197] PF06933            176                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 SSP160:Special lobe-specific   -------------------------------------------------------------------1 ---------------------1----------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1--1---------11-1-1--111111-----------------------------------------------------------------1------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------1-----------------1-----------1------------------------------------------------------------------------ 1---111-9--111--13-21---11----1--11--1111-------11-------2-11----2-1----1-111---------1--1-11--1-----121-1---26-2211221-----11121301-62-----1-11--1--11----41-3--222-1-1-2-1-3----11--1-111221---222-2-
 silk protein SSP160                                                                               *                      *          *  *                                                                                                                                   *                                                    *  *         ** * *  ******                                                                 *                                          *                                                            *           *