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Ranking of RP:PFM:REP : from 5301 to 5400

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[5301] PF10098            170                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2336:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1----------2-----------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4342-------89844444436----------1-111111321141222221122222--324-----------------------242--------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------- ----------------1-12----------------1------------1---1111-------1-------------------1-----2-1---1----1--------------4-------------1--------1-------11--------------------1---1-12----------1---1-------
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                                                                                         *                                         *          *                                   *                                                                                                                                                           ****       ***********          * ************************  ***                       ***                                * *                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                      * **                *            *   ****       *                   *     * *   *    *              *             *        *       **                    *   * **          *   *       
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[5302] PF10382            170                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2439:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --111-1-1--1211-111111211121-1111112122222211111-11-11111-1111111212--22111221222-11-1121--111111111-2--1--1-1-------11-1-11-112-351-2-41-111-12-111111-121111-----1---111--1----------1---1311-1-1111-
 nction (DUF2439)                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *** * *  **** ************ ******************* ** ***** **********  *********** ** ****  ********* *  *  * *       ** * ** *** *** * ** *** ** ****** ******     *   ***  *          *   **** * **** 
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[5303] PF05848            170                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CtsR:Firmicute transcriptiona  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-11-1---111111111--1111111111111111111111111111111111111111111111111--11111111111111111111-11111--1111111111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 l repressor of class III stre                                                                                                                                                                                                                                 **                                  *************************************************************** * ** *   *********  *************************************************  ******************** *****  ****************                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                     
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[5304] PF07344            170                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    95                                                                                                                                                                                             
 Amastin:Amastin surface glyco  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------13---------------------1----------------------------------------------------------------------------- --------982-------------------------1--------------------------------------------------------------1----------1-------------------------------------------------------------------------1--------------
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 CRC_subunit:Chromatin remodel  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11122222222222122222222122222222222222222222222222211222112211122122211111222112211111111-1123----------------------------------------1-----------1-14------------1------------1-2----11---
 ling complex subunit                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***************************************************************************************** ****                                        *           * **            *            * *    **   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5308] PF09971            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2206:Predicted membrane pr  ------1--------------------------21--1-111--1-111-313-1-------111--- -11-2---------1-----------------------------1------------------------------------------------8--------------------------------------------1-------2-1------------------------------------------------------1---1-------1------------------------------------1---11---1----------------111--------------------------------------------1------------------1------1---------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1--1-1-1-----11111-----------------------1----------1-------1-----------------------------------------------------------1--------------------------------------------------11-----------1-----------------------------------------------------------1--------------------11-------------------------------------------1--1------- 11--3---5------1121-----------11-1111111-111---12111-21--1-111-1-2---111--1--1------1-------1---1--1112---2--24--11----1--11-2----1----1---1------1---------1---21-------12-1--1------1--121---1-1---1-
 otein (DUF2206)                      *                          **  * ***  * *** *** *       ***     ** *         *                             *                                                *                                            *       * *                                                      *   *       *                                    *   **   *                ***                                            *                  *      *                                                                           *                                                                                                                                               *                      *  * * *     *****                       *          *       *                                                           *                                                  **           *                                                           *                    **                                           *  *        **  *   *      ****           ** ******* ***   ***** **  * *** * *   ***  *  *      *       *   *  ****   *  **  **    *  ** *    *    *   *      *         *   **       ** *  *      *  ***   * *   * 
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[5309] PF03694            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Erg28:Erg28 like protein       -------------------------------------------------------------------- ----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----43------111111-1111111-1111-11111111111111111111111111-111111111111-1111111111111111112111111111111111-111211111111-111111111131-11111111111-1111111-111-11---1111-112----1111-----111111111-------
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 Cenp-F_leu_zip:Leucine-rich r  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1----------1---------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1----------------------------- ------1-1------------1---------------------1-------1----1-----------------1---------11------------------------4331--2223-23336162885-531332362243323-14133341-1-----3--1-1---1-----------------------2-
 epeats of kinetochore protein                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                         *                                                                                                           *                  *          *                                                   *                                                                                                                                                                                                              *                                             *                                    * *            *                     *       *    *                 *         **                        ****  **** *********** *************** ******** *     *  * *   *                       * 
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[5312] PF06487            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SAP18:Sin3 associated polypep  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------1--------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11--111-1---11111111111121-211111111111111111111111-21111-1111-------------------------111-111-11111--1111-11-21111111-1211-52111361-11111112111--112111-11111121122111111-1111-11-----111113111---11-1
 tide p18 (SAP18)                                                                                                                                                     *                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        **  *** *   ************** ************************ ***** ****                         *** *** *****  **** ** ******** **** ******** ***********  ****** ***************** **** **     *********   ** *
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[5313] PF10455            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BAR_2:Bin/amphiphysin/Rvs dom  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----131----111111111221211122111111111111111111111111112111111122222132221222332233222--1121111211111212411---1--12-----1---12-2--1------1-----------------1-1-----1------1-11----1------3---2--1------
 ain for vesicular trafficking                                                                                                                                         *   *                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *             *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ***    ***************************************************************************  *******************   *  **     *   ** *  *      *                 * *     *      * **    *      *   *  *      
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[5314] PF05672            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 MAP7:MAP7 (E-MAP-115) family   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------11------------------------------------------11111-1--111---------11--------------------1--1-----------1------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------1---------1----------------------------------------------------1---------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111----------------------- -----1--2-1-22-----1---1-1--------11-----11---1-1-2212---------1------2----------2211---11---2---------------3-112214--1-11133121441-244---11121212-212--2323-----1-1---1---23-111----1---1-----1-12111
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[5315] PF08881            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1 1                                                                                                                                                                     2       
 CVNH:CVNH domain               -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1-2223643333------2111221131---2224637333562536----------------------------43---1-----------1--------------1--------------------------------------------------------------1---2-1-------
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 Talin_middle:Talin, middle do  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------1-----111--------------------------------------------------------------------------------------------1--34535452222222552322922333232221232122126222262211442111111123211------------------------
 main                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *     ***                                                                                            *  *****************************************************************                        
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[5319] PF05486            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SRP9-21:Signal recognition pa  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1---11--1-----111111-11111-111111111111111111111--1111111111111111--11211111111111-111111111111--1---1111--121211111111111-111-21662-313-1-1111-11111-1131-111----1111-112111-1-11-----112--211--------
 rticle 9 kDa protein (SRP9)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *   **  *     ****** ***** *********************  ****************  ************** ************  *   ****  *************** *** ***** *** * **** ***** **** ***    **** ****** * **     ***  ***        
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[5320] PF07713            169                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1604:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----111111-11111111111111111111111111111111111-11111111-----------------------11112111111111-11111-1-111111121111-1123111161-1111111-11111111111111311111-1111111121111-1111-111111111111-1131-
 nction (DUF1604)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ***     ****** *********************************** ********                       ************** ***** * ************ ********** ******* ******************** ************* **** ************ **** 
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[5324] PF11885            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3405:Protein of unknown fu  -------1------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-2------25442422211221222211221121112233344335454265444---2------------------------1-52--------2-1----11--2---1----1----------1--------1---1---1---------------1-1-----3--1---------1-3----1----
 nction (DUF3405)                      *                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                    *                               *                                                                                                                                                                                         *                                                                                                               * *      ***********************************************   *                        * **        * *    **  *   *    *          *        *   *   *               * *     *  *         * *    *    
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[5325] PF02295            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             14                                                                    
 z-alpha:Adenosine deaminase z  ---------------------1---------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1--------------1----------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--121234-222-22283353518-736-1222-15312-2-32-2--113--------------------1-------------------
 -alpha domain                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                           *              *                **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *  ****** *** *********** *** **** ***** * ** *  ***                    *                   
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[5326] PF08244            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1            
 Glyco_hydro_32C:Glycosyl hydr  ------------------------1--1---------------------------------------- -1--------------------------------------------------224-----------1-----------1-----------1--------1---1--1-----------------------------11-----------------------------------------------------11---------------1-22-1--------1--------1---------------------1-----11----------------------------------------------------------------21-----------1---------------------------1----2------------2--------------------------1---------------------------------------------22---------------------------------------------111112-1111---11111-1-1----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--------111--------------11111------------------------------------------------------------------------------- ----------------211123-1313-------------------1---2247-1-1-1-1-----------------------------12-------12-----1-----------------------------------------------------------------------------8098-84-------
 olases family 32 C terminal                            *  *                                          *                                                  ***           *           *           *        *   *  *                             **                                                     **               * ** *        *        *                     *     **                                                                **           *                           *    *            *                          *                                             **                                             ****** ****   ***** * *          *                                                                                                                                            *                                                                                                                       *      *        ***              *****                                                                                                ****** ****                   *   **** * * * *                             **       **     *                                                                             **** **       
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 Nucleo_P87:Nucleopolyhedrovir  --------------------------------------------------------1----------- ------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1---1-1111111111-1111111111111111111111-----1111111111111111-1111111----------------1-------------------------------------------------------2---------------------------------------------------------------------------------------------------1- ----------2----1111-231113----------2---1--------1--2-11--13-2---1--------------------1-11--11-----1----------6111-------1-111----1----1----1131--1-21-----1-22-2-2-2--21---31-1------2--234221-21--1--
 us capsid protein P87                                                                  *                  *                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                               *                                                                          *   * ********** **********************     **************** *******                *                                                       *                                                                                                   *            *    **** ******          *   *        *  * **  ** *   *                    * **  **     *          ****       * ***    *    *    ****  * **     * ** * * *  **   ** *      *  ****** **  *  
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[5328] PF09106            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SelB-wing_2:Elongation factor  -------------------------------------------------------------------- -1------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------11-----11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1111111-1--1---111--------11111111-111--1-1---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111-1-11--------------1----------------------------1111111-11111-111-1111-11111-11------------------------------------------1----1---1------------------1---11-1111111111-1111111111111111111111--1111111111111111111-1111111--1--------------------------------111-1-111--1-------------11-1----11111---------------------------11------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
  SelB, winged helix                                                                                  *                                                                              **                                                      **     **                                                                                                                                                                                  **  ******* *  *   ***        ******** ***  * *   *                                                                                                                                  ******************* * **              *                            ******* ***** *** **** ***** **                                          *    *   *                  *   ** ********** **********************  ******************* *******  *                                *** * ***  *             ** *    *****                           **                                                                                                                                                                                                                                                                           *    
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[5329] PF04606            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ogr_Delta:Ogr/Delta-like zinc  -------------------------------------------------------------------- ----1----------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----1---11---------------------11111---1111-1-2112-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-3----11--2----1---11----1-2--1---------------13---------------------1--1-----------------------------------------------12------1---1-1---1--11---------------------211232111111-111-1311132---211111212---3411211-3---2-114143-111-----1-11-13--1-123---------------2------------1--1-----1---------1------------------------2-------11----1--------------------------------------------------------------------1---- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
  finger                                                                                                 *                                                                                        *                                                                                                         * *    *   **                     *****   **** * ****                                                                                                             *                                                                                                                                                 ** *    **  *    *   **    * *  *               **                     *  *                                               **      *   * *   *  **                     ************ *** *******   *********   ******* *   * ****** ***     * ** **  * ***               *            *  *     *         *                        *       **    *                                                                    *                                                                                                                                                                                                       *    
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[5330] PF12519            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3722:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------11------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-1--1111111--111111111-11111111-11--1-------------------1111111---------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------1112121111111211111111122111111111212112111111211111111111111121111111111112111111111111-11111-----1--1-----1----------------------------1------111-------------1---3-1----------1-7-------
 nction (DUF3722)                                                                                                                                              **                        *                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                                                        *                                                                                       * *  *******  ********* ******** **  *                   *******                                                                     *                                                                                                                     **************************************************************************************** *****     *  *     *                            *      ***             *   * *          * *       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 rminal domain                                                                                                                                                                                                             *                         *  *                              *                                  * *                                                                                                                                        *                   *                                                                                                                       *                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                      *             * *  *** *********** *********************    *    *   *     *                *   *    
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 GN3L_Grn1:GNL3L/Grn1 putative  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---1111-----1111-111-111111111111111-111111111111111-1111111111111111-11111-1-111111112111-1-111111-1-1----11--11-1121-11-111--21463-114211-11-----1--11-1-11----1-2-1----11111-11-2---111---11-1111-1-
  GTPase                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ****     **** *** *************** *************** **************** ***** * ************ * ****** * *    **  ** **** ** ***  ***** ****** **     *  ** * **    * * *    ***** ** *   ***   ** **** * 
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 Img2:Mitochondrial large subu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 2---11--2----11-11-1111111111-1-111111-1111111--111111111-11111111111-1111111111111111-111-11111111---1111--41212111-11111112112-241-121-111111111111111111--11-111111-111111111--------1----1--1112-11
 nit ribosomal protein (Img2)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *   **  *    ** ** ********** * ****** *******  ********* *********** **************** *** ********   ****  ******** *********** *** *** ******************  ** ****** *********        *    *  **** **
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 PurA:PurA ssDNA and RNA-bindi  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1- --------------------------1-------------------------------------1--------------1------------------------------52454611-1113243123424-2342-213232122-111113242131124211241221212111------321-3-21-------
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[5340] PF10495            168                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF3776:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------212122214537-768-6691-312223132222231422211----------------------------------------
 nction (DUF3776)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ************ *** **** *********************                                        
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[5342] PF09821            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ABC_transp:ABC nitrate/sulfon  --1---1111111111111111---------------------------------------1111--- 1--------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------11122----1---1---1111----1---1---1------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---1----------11-12----1-----------------1--------11--1--------11-------------11111111111111----------------------------------1-1-----3221221111133112222222211111--221--1--------11-----11-------11-----------------1-2---11----1--------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------111111111----------------------1-----------------------111111111111-------------------------1111------------------------------------------------------------ ----1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------------------
 ate/bicarbonate family transp    *   ****************                                       ****    *                                                                          *                                                           *****    *   *   ****    *   *   *                  **                                                                                                                                                                               *    *   *          ** **    *                 *        **  *        **             **************                                  * *     ****************************  ***  *        **     **       **                 * *   **    *                                                                                *                                                                                  *********                      *                       ************                         ****                                                                 *       *                                                                                                                                                                * *                       
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[5343] PF07514            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TraI_2:Putative helicase       -----1--------------------------------1--------------1-----1-------- 1--------------------------------1-1-1-----------------------------11--------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------1--------------11111---1-------------------1-1-111----11--111-1-11------------------------------------------------------------------------------------1---------------1-------------------------------------------1--------------------1--------------------------------------------------------------41--1-------11---------11--12--31--124-1121-21---------1------1-3-2----------1-------1-----------------------------------------1211-------1------1--1-------------1------1-111---------11--------1--1---------1-11--2211--------12-1--3---------2--------1------111111111--1------1-31----1------------1--121-111---111112-----------------1--------11221---1---------------------------------------------------1----------- ---------------------------1--------------------1--1--------------------------------------------------------1--------------1---------------------------1---13-------1------------------------------1--1
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 DUF2352:Uncharacterized conse  --------111111------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1--1--------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1----------------------------------------------111111------------------------------------------------------------------------------------------ 1-----1-----11--1------------1----------------2-1----------1-1--------1--------1------------1--1------1----1-14211212111111221141815-5221111122111111141122111112-1113-113-111------1-1---11--1----1---
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[5346] PF10249            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NDUFB10:NADH-ubiquinone oxido  -------------------------------------1------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------11111111111111111111111211111111111111111111111111--1-------1-------111-1----1111111112111-22-11-31111211111-1112111151-11-11111111-111--11-111111---1211121211121---12--11111-212111-1---
 reductase subunit 10                                                *                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *** *                                                                                                                                        **************************************************  *       *       *** *    ************* ** ** *********** ********** ** ******** ***  ** ******   *************   **  ***** ****** *   
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[5347] PF05859            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Mis12:Mis12 protein            --------------------------------------------------1----------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---111111-11-------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------111111111111111111111111111111111111111111--11-11111111111111111111111111111112-1111-111121111-121-3--111----11-111-1121-111--113111-1111-1-11-1111---1111-------1-1---11-1--1121111--111--
                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *       *                                                                                                                                                             *   ****** **                                                                                                       **      ******************************************  ** ******************************** **** ********* *** *  ***    ** *** **** ***  ****** **** * ** ****   ****       * *   ** *  *******  ***  
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[5348] PF10108            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Exon_PolB:Predicted 3'-5' exo  ---------------------------------------------------1-----------1---- -1-----------------------------------------------------------------------------------1----------1--111111-1-----------------11-1-----1------11----------------------------------------1-------1----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1----------------------------------1----11------------------------------1-----------------1111111111---------------1111------111111111111111111111111111111111-1----------------12111-11111111--1111-1----------------------1111-----1111111111112112211-1-1111------------------1------1-------1121------------------------------------------------3-------------------------------------------1-----1111-1------1---------2-1111111111----------------------------1------------------------------2-----11---------------------1---------------------------1 --------1--------1------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1---------------------1-1------------------------
 nuclease related to the exonu                                                     *           *      *                                                                                   *          *  ****** *                 ** *     *      **                                        *       *                                        *                                                                                                                                 *            *                                  *    **                              *                 **********               ****      ********************************* *                ***** ********  **** *                      ****     ******************* * ****                  *      *       ****                                                *                                           *     **** *      *         * **********                            *                              *     **                     *                           *         *        *                                                                        *                                                           *                     * *                        
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 DUF1783:Fungal protein of unk  -------------------------------------------------------------------- -1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------11--------1---11----1------------1-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1---------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------11-1-11------------------------------------------------------------------- ----1-----------1111111111-111111111-111-11111-11111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111-----11--11----1----14-941-11111111-1111111111-----11-------1111-------------1112-1112---1-1-
 nown function (DUF1783)                                                                              *                                                                                                  *                                     **        *   **    *            *     *                                                                                                                                                                                                    *                                           *               *                                                                                                                *                                                                                       *                                                                                                                                                                                    *                        ** * **                                                                        *           ********** ********* *** ***** *********** ***********************************************     **  **    *    ** *** ******** **********     **       ****             **** ****   * * 
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[5350] PF11605            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Vps36_ESCRT-II:Vacuolar prote  -------------------------------------------------------------------- -1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-21---1111111111111111111111111111-11-111111-1111111111121111-211111111-1111111111-1-1111--1---111--1-111111111--111111-11141-1-11-111-21111-1-1111-1111131211-111211211-1111-----1---111--1111-
 in sorting protein 36 Vps36                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *** **   **************************** ** ****** **************** ********* ********** * ****  *   ***  * *********  ****** ***** * ** *** ***** * **** ********** ********* ****     *   ***  **** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF600:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------11--1-1----------------------------------------------------------------------------3-----3-12--2-3-112-2151-----------------66929146066628-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1---1-11-1-261-121-1--11-111-1-1111----------------------------------------------
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 TMP_2:Prophage tail length ta  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------1--------------------------------------1-------------------------11---------------1-2----91---------------1--1-------2-------------------1---------------------------------1--13-1--------------11-2-11------------11-2--1-------------1----1-1-1------------------------------------------------------------------------------1------1-1-----------1------1-------6531314---8114-12234744111-111------1--1-11-21-1-3--2-12-21-1--111--1111----------------1---------------------------------11-1-1--11----1-------------1--------11-------------------------------------------------------------------------- --------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-------
 pe measure protein                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                   *                                                            *                                      *                         **               * *    **               *  *       *                   *                                 *  ** *              ** * **            ** *  *             *    * * *                                                                              *      * *           *      *       *******   **** *********** ***      *  * ** ** * *  * ** ** *  ***  ****                *                                 ** * *  **    *             *        **                                                                                               *                                                                                                                                                                       *  *       
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 BLVR:Bovine leukaemia virus r  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--11---3------1--1--------2----------------------1--------------------1-1-------1---1----11---11--1-1-131226311-1-22131161893-536-11-32121-12-12--7121211321112-21131321--------------1--1-21---
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 UPF0172:Uncharacterised prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1-------------------- 1-11111-311-2211-1-----------11------------------------------------------------------------1-111-11-111----1111222221212222222122602-32312212222112221211321112---1211111111111-111--111111221111-21-1-
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 DUF3317:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------11-1212222122222221112212122111-1-11111111-1111------------------------11--111-11-111-----1----3--212-211-12222-21352-222111111231122211112222521-1--1--112---------------231111-----11-
 nction (DUF3317)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ** **************************** * ******** ****                        **  *** ** ***     *    *  *** *** ***** ***** *************************** *  *  ***               ******     ** 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[5361] PF11601            167                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Shal-type:Shal-type voltage-g  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------27454322323-335524255413442221433121332232133322311131111211-111-------------------------
 ated potassium channels                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *********** ************************************************ ***                         
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[5362] PF03437            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BtpA:BtpA family               1111111--------1--111111-1111-1----11----------------11111111------- ---------------------1---1------1111-1------------------------2-----------------------------------------------------------------------111-11----111111111111-----111111111----------------------------------------------1-------111111----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------111-----------1-------------------------------------------------------------------1--2111---11---------1-1-111-----------------1------------------------------------------------------------------------1----------1-------------------------------1-----1----------1--1-------------------------------------------------------------------------------1---1--------1--------1111111-111-----1-11111111111111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------- ------------------1-----------------------------------------------------------------------1----------------1-12111111-------1---------1--------1--11---1---11111-2-111-12311111-------1----------------
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[5363] PF04919            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF655:Protein of unknown fun  221111111111111111111111111111111-1111111111111111111111112111112111 ----1--------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------11-111-----------11-1-11------------------------------------------------------111111-------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------11-----1--------------------------1----1----11-111111---------1-------1--111----1-----------------------------------------------------------11------1111-111-111---1111112-111-----11-11---11-1-111-----1------------------------------------------1------------------------1--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------1------1-----1--11-1---1-1- ------------------------------------------------1----1----------------------1----------------------------------1---------------1-----------------------------------1--1----------------------1-----1---
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[5366] PF05275            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CopB:Copper resistance protei  -------------------------------------------------------------------- 2------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------------------1------------------1-11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2114---------1---------------------1--3-----1---------------221---------111111111-1111---------------------------------2314--1111-----------11-----------1112--341---1-1-----22-1------------11---------------121----1-------1----------------------------11-----111-1-1------11-1---1---1----------------1------------1----1-------1---------1-1----------------------------------------------1-1----111-2------------------21122-111111111-111-122232112---------2---1----------21111111111111---------------------------------------------------------1-- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1-------
 n B precursor (CopB)                                                                                *                                                                                    * *                                        *                  * **                                                                                                                                                                                                                                ****         *                     *  *     *               ***         ********* ****                                 ****  ****           **           ****  ***   * *     ** *            **               ***    *       *                            **     *** * *      ** *   *   *                *            *    *       *         * *                                              * *    *** *                  ***** ********* *** *********         *   *          **************                                                         *                                                                                                                                                                 *                                *       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5367] PF10021            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2263:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- ----1-----------------------------------------------------------1--111-----------1------------------1---1-------------------------1------------1----------------------11----------------1---------------------------------------------11------------------------11---11----11-1------------------------------------------------------1------------------------------------1-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--------2142-222212122222212222222221121123344433122111-----------1---------------2531416------------37-------------1-------------------------------1-----------------2------1--------3---1----1
 in conserved in bacteria (DUF                                                                           *                                                           *  ***           *                  *   *                         *            *                      **                *                                             **                        **   **    ** *                                                      *                                    *           *                                                                                                                                                                                                                               ** *                                                                                                              **                                                                                                                                                                                                                *        **** ******************************************           *               *******            **             *                               *                 *      *        *   *    *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5368] PF07063            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1338:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------1--1---11112-11--1-1111111----113-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------11-11-11111------1--1---1---11111111--1---------------------------------------------------------------1------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---111111111111-11111111-1111111111111-----111-1111111-1--111111111--111111111111----------------11-----------------------1-------1111-1111-111------------------------1111111111---------------------------------------------------------------- ---------------1----1-12121------111--------------1231--1-1-------------------------------------111---1-------------------------------------------------------------------------------------1-----1----
 nction (DUF1338)                                                                                           *  *   ***** **  * *******    ***       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *        ** ** *****      *  *   *   ********  *                                                               *                                          *                                                                                                                                 **   ************ ******** *************     *** ******* *  *********  ************                **                       *       **** **** ***                        **********                                                                                *    * *****      ***              ****  * *                                     ***   *                                                                                     *     *    
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 DUF1395:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------11------------11----------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1 ------1-1---111--1------1--------------------1-----1--------------------------1----1-1-11-----12-----------2-12243112111122122211403-34623512-1131212131121-312--11211-111--111111----1112213-52-----1-
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  factor                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *   *  *** *   *** ******* **************************************  *                     ********** ***** *** ** ********************** *** ** ***** ** **  * * **** ************* ****** ******** *** ** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Brr6_like_C_C:Di-sulfide brid  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--1----------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- 111115--2-1-111221111111111111111111111111111111111111111111112222221222222221223222221111312212112--1123-11--1-2---------------------1--------------------------------1-----1-1---41-----11-1---------
 ge nucleocytoplasmic transpor                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***                                                                *                                                                                                                                                                                ***  *                                  *                                                                                                      ******  * * ***************************************************************************************  **** **  * *                     *                                *     * *   **     ** *         
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 DUF1249:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111-1111111111111111111-----11------11111111111111111-111111111111111111111111---1111111111111111111111111-111111111111---1---------11111-------------------------1111111111111112111----------1111111111111111111111111111------------------------------------------------------------ --------------------------------------------1----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1249)                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ********** *******************     **      ***************** ************************   ************************* ************   *         *****                         *******************          ****************************                                                                                                         *                                        *                                                                                                                 
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 Agenet:Agenet domain           -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3----------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------0-1512342--2--1244---503-31311--2124211-111-14-2-------------------1--1-----25172-341----1-
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[5375] PF02827            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 PKI:cAMP-dependent protein ki  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111---------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-14-12413132372371838-33542214234223132331221333-----111-21-----------------------------
 nase inhibitor                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ********                                                                                                                                                                               * ** ***************** **************************     *** **                             
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[5376] PF10180            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2373:Uncharacterised conse  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111----11111111122111-21111111111111-111111111111111111111111-11111111111111111111---11111111111--1111-1212111-21-1--11113-11741-112111111111-11--1---1211-1---11-1111---11---11---------1---12111-
 rved protein (DUF2373)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ***    ************** ************** ************************ ********************   ***********  **** ******* ** *  ***** ***** ************ **  *   **** *   ** ****   **   **         *   ***** 
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[5377] PF05676            166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NDUF_B7:NADH-ubiquinone oxido  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-211-1111111-11111-111-11111111-11111111211111-111111111-1--------11-------11------1111111-111-1112-11-211111-1-1-1121111-121-1131-1-11-11111-11--11--11121121111111112111116111112112111-111111
 reductase B18 subunit (NDUFB7                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *** *** ******* ***** *** ******** ************** ********* *        **       **      ******* *** **** ** ****** * * ******* *** **** * ** ***** **  **  *********************************** ******
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 RPM2:Mitochondrial ribonuclea  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------3-1-11-111-11111111111111--11111-11111--2112121111-111-11111111211111-11111122--1---1-2-1------522---2---1-----------------------------------------------------------------------11461811-1--1-
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 PFO_beta_C:Pyruvate ferredoxi  22--1112111111122232211-1--11112--1---11111------1111--1--111222--11 11----------------------------------------------------------------------------------21-1---------------------------------------1-1-1--1122-----------------------------------------------1111--1-111111111111111-1----1111111-1-------1111111111111111111111-----------------------------------------------------------------------2112------------------1----1----------11----1-1---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111---111---------11111--1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1111-11111-1-- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 n oxidoreductase beta subunit  **  ******************* *  *****  *   *****      ****  *  ******  ** **                                                                                  ** *                                       * * *  ****                                               ****  * *************** *    ******* *       **********************                                                                       ****                  *    *          **    * *   *                                                                                                                                                                                                      ******   ***         *****  *                                                                                                                                                                                                                                                                *                                           **** ***** *                                                                                                                                                                                                          
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 Alpha-amylase_N:Alpha amylase  ----------------1--1-------1---------------------------1-111-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------121-----3----------------------------------------------12-1111111111111111111-1111111-12111111112--------------------11---1--111111111-2----111---11111---1111211-1-1----1111----1---------------------1---1---1111-1---12--------1---221---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111111-1111111211111111111------------------------1---1111--111111111111----------------------1--------------------------------------------------11--------111----------------------------------1--------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
 , N-terminal ig-like domain                    *  *       *                           * ***                                                                                                                                                ***     *                                              ** ******************* ******* ***********                    **   *  ********* *    ***   *****   ******* * *    ****    *                     *   *   **** *   **        *   ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     * ********** *******************                        *   ****  ************                      *                                                  **        ***                                  *                                                                                                                                                                                                      *                                        
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[5381] PF12047            165                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DNMT1-RFD:Cytosine specific D  ------------------1------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1----1---------1-1-111-1---11-1112222111111-1---121-21--111-------------------------------11-2-1--------1---1111112221-1111115111201-2121111111121112111-31-11121211111---2--1-22311111112125-92-------
 NA methyltransferase replicat                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *    *         * * *** *   ** ************* *   *** **  ***                               ** * *        *   ********** ************* ******************* ** ***********   *  * ************** **       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5382] PF05048            165                                               1     221                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 NosD:Periplasmic copper-bindi  -----------------------3--------------------7--6-1347-----------1--- -------------------------------------------------------------------------------------1----------------11--1-------------------------------------1----------------------------------------------1----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------1-1--1-1-1111111111111---1--------------------1-----------11-1-------------1-----------------------------------------1--------------------------11--111--------1----1-------1111-1---1---2------------------------1-------11----------------2---2------1-1---1---1-1-1111111--11-----1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ng protein (NosD)                                     *                    *  * ****           *                                                                                         *                **  *                                     *                                              *                            *                                                                                                                                      **                             * *  * * *************   *                    *           ** *             *                                         *                          **  ***        *    *       **** *   *   *                        *       **                *   *      * *   *   * * *******  **     * *                                                                                                        *                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                            
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[5383] PF11964            165                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3478:Protein of unknown fu  ------------------------1--1------------------2--1111--------------- --------------111----1--2------21121------------------------------2---------------------------------2-6--1-11------------------------------------21----2--------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1----------------------11111111111-11-11-111--------------------31-1111-------------------------------------------------------------------------1----------1-1------------------11---11-------1111111-1-2-----2----------1---------1------------------------3----------1113333314333333332342---2-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------1--1-----------------------------------1----1------------1---2-------111-------------------------------------------------------------------------1 --------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3478)                                       *  *                  *  ****                              ***    *  *      *****                              *                                 * *  * **                                    **    *        *                                                                                                                                                                                                   *                 *                      *********** ** ** ***                    ** ****                                                                         *          * *                  **   **       ******* * *     *          *         *                        *          **********************   *                                                                                               *          *  *                                   *    *            *   *       ***                                                                         *                                             *                                                                                                                                                          
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 Cid2:Caffeine-induced death p  ------------------------------1------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-----1111111-11211--11111-112111111111111111111111-11111111112-11211111111111-111111112121111-1111-----212211--1111111111-431-11311111111-111-11111111111211111-2112--11--------------1-1-------
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 DUF1836:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1222222221222222--1111222-1--122-------1--------------------1-111112-1-221111223--1---1111111111111111111111111111111111111---1111---222222222222112222222-----11--111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------- ---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------1----1-----------------------------
 ction (DUF1836)                                                                                                                                                                     **                                                                                                              ****************  ******* *  ***       *                    * ****** * *********  *   *************************************   ****   *********************     **  ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                           *                                                                                                                                        *                       *    *                             
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[5387] PF05838            165                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 DUF847:Predicted lysozyme (DU  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------11--1--1-----22222221221------0---3-------------1-11--1121111141------------1-11-------------------------------2-11-----------3------12-------21-------1-1----3-------1-----1--1111---------1-----1---21-----------------1-----------------------------1--1------------1---1-1-------1-----------1--31---------------1-1----------------1----1212122111121221----------1----------------------------------1-----1---333243--------------------------------1-----2--2---11--1-1--------------------------------------------------------------------- ----------------1---------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------
 F847)                                                                                                                                                                                             **                                                                         *                                                                                                                                                                                                         *            **  *  *     ***********      *   *             * **  **********            * **                               * **           *      **       **       * *    *       *     *  ****         *     *   **                 *                             *  *            *   * *       *           *  **               * *                *    ****************          *                                  *     *   ******                                *     *  *   **  * *                                                                                      *                                                                           *                                                                                               *          
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[5388] PF07603            165                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                   11                                                                                                                                                                                                                                                          
 DUF1566:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------173--12--1111--1-5--2-1-----3-5-----------------------16--2222-21-22---22-------3----323------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------2----------------------------3---------------------------12222222222-33--------------11--331441-------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------9----------------------------------------
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 FOP_dimer:FOP N terminal dime  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------3222223---------------------------------------------------------------------------------------------31422222322122224422-513-2-5212132221121112225222211--22211---2--32-1-33------222-1--1--12-
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 AXH:Ataxin-1 and HBP1 module   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1-----------------------------1--------------------------------------------------------------------------2757434222222245242133-32422213223312211212222223211311-1111--122------------------------
 (AXH)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                             *                                                                          ********************** ******************************** ****  ***                        
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 hemP:Hemin uptake protein hem  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----111111----------1--------1111-----11-1111111---2-11111111--------------1-----------------------------------------1111111111-11111111-11111111--1111-111111-111--1-2111-------11-111-------------------------1--------------------------------------------------------------------11------2---11-1111111-11-1111111111111111111111---1111111111111111111111-111--1--111111111--------------------------------------------------------------------------------------1111111111---------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 P                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *     ******          *        ****     ** *******   * ********              *                                         ********** ******** ********  **** ****** ***  * ****       ** ***                         *                                                                    **      *   ** ******* ** **********************   ********************** ***  *  *********                                                                                      **********                                                                                                                                                                                                                                                                        
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 MRP-L28:Mitochondrial ribosom  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------ -------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111-1111112111111111-1111211-111----2111-1-11111112-141241-11111--11112--111111111111-1211111111111-1------------1-21--------
 al protein L28                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                                                    **************************************************************** **************** ******* ***    **** * ******** ****** *****  *****  ************ ************* *            * **        
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[5395] PF12423            165                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 KIF1B:Kinesin protein 1B       -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2434723-121222342519651736122231221222213-241521213311111211-33-1------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ******* ********************************* ****************** ** *                        
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[5396] PF09538            164                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 FYDLN_acid:Protein of unknown  ----------------------1----------------------------2-1-------------- ---------------------------------1-1-------1--------------------------------------------11---------------------------------------------1---1-------11-----11------1-1-1111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111111-11111112111111-1111111111111111111111111111111111111111------------------------------11111--------------------------------------------------------------------------------1--------------11111----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111-------------------------------------------------- -----------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------2--1---1-1--2-11212-22---1---1-1--1---1-3-2111-------------------------------1--1---1-
  function (FYDLN_acid)                               *                            * *                                                * *       *                                            **                                             *   *       **     **      * * ****                                                                                                                                                                                                            ********************************** ************** ****************************************                              *****                                                                                *              *****                                        *                                                                                                                                                                                                                           ******                                                                          *                                                                       *                 *  *   * *  * ***** **   *   * *  *   * * ****                               *  *   * 
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[5397] PF05845            164                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhnH:Bacterial phosphonate me  ----------------------------1--------------------------------------- -------------------------------------------------1------------------------------1------------------------------------------------------111-1---------11--1-------------1-1---------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------------------------------------111---11111----------1---1--1-1-3--11111111111111-----1----111--------1------------------------------------------------------1111--1111111---11111------2--1---111---1---11-------------------11-------------------------------------------------11----4-----1----------------------1---------1111-1-1111111111-111111111111111111-11112----2--------------1111---1--111111211111---------------------------------------------1111---11-----111---------1---------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------11-41-----1-1-------------------------------1----
 tabolism protein (PhnH)                                    *                                                                                         *                              *                                                      *** *         **  *             * *                                                   *                                                                                                     *              *                                               ***   *****          *   *  * * *  **************     *    ***        *                                                      ****  *******   *****      *  *   ***   *   **                   **                                                 **    *     *                      *         **** * ********** ****************** *****    *              ****   *  ************                                             ****   **     ***         *                                                                                                                                                                                          *                                                    ** **     * *                               *    
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 DUF1749:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1----------1------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------11-----------------------------------------1-1-----------------------------------------1------11---------------1---------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- --------211---112313332322211111111111111111112223112-22132111111-12-1--1211----111111-11---2-111111-221111-2-------------------------------11--------3-----------1-------------11111112-222221111----1
 nction (DUF1749)                                                                                                                                                    *                                                                              *                                                      *          *                                                      *                                                                                                                                                          *                                     **                                         * *                                         *      **               *                                                                     *                                                                                                                                         * *                                                                                                                                     *           ***   *************************************** *********** ** *  ****    ****** **   * ****** ****** *                               **        *           *             ******** *********    *
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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