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Ranking of RP:PFM:REP : from 5701 to 5800

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[5701] PF02952            148                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[5702] PF07451            148                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SpoVAD:Stage V sporulation pr  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1----------1---------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------22122222222223322322111122222211--------22-----------------------------------1------------------------------------------------------12111111121112111111111111--1112111121111111111------------------11-------------------------------------------1-1------1-11---11111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------2-- -----------------1----------------------------------3------------------------------------------1--------------1--------------------------------------------------1-1---------1-------------------------
 otein AD (SpoVAD)                                                                                                                                            *          *                                                                     *                                                   ********************************        **                                   *                                                      **************************  *******************                  **                                           * *      * **   ********                                                                                                                           *                    *                              *                                                                                                                                                                                                                          *                                                             *                    *                                  *                                          *              *                                                  * *         *                         
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[5703] PF10204            148                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DuoxA:Dual oxidase maturation  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------11---------------------------------------------1-------------1----3111112222221164242592-4242222422221222222-322211342-2221521311----1---------------------
  factor                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                           **                                             *             *    ********************** ******************* ********* **********    *                     
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[5704] PF10206            148                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                      2                             
 WRW:Mitochondrial F1F0-ATP sy  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1------------------------------1--1--------------------------------------------1---------------21123111-111-122-91995-324-1-221122-1---11121222222-11111226111--------------------------
 nthase, subunit f                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                              *  *                                            *               ******** *** *** ***** *** * ****** *   *********** ***********                          
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 DUF406:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------11112112222222222-2222222222222222222222111-11111-11111111111122212221-111111111111------------------222111122222221---------------------------------------1---1--1--1----------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction (DUF406)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *          ***************** ************************* ***** ******************** ************                  ***************                                       *   *  *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF3723:Protein of unknown fu  -----------------1--------------------------------1-------------1--- -------------------------------1-------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1-----1--------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1---1-11-11--16522251641331--125433442---1221112251-1------1-----------------------1--1--2---1-1---1---2------------1-11----------------1----1-----------------1--2-1--1---1------1----4-1-----1-
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 DUF2383:Domain of unknown fun  ------------------1-1----------------------------------------------- -111------------------------------------------------------------------------------------------------1-112-4-3-------------------------------------111-----------------111---------------------------------------1-11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------3--111-111-1------111--2----1------11--1---1------11-----------1----11112--------------------------------------1---1-22221----------------1---------------11--------------1-1------1------1------11--------1212-----1-111111--1-11----1-----------1-----2----------1-1-2------11-1-1----------------------------------1--11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1-11111111311111111------------------------1111111111-------------------------------------------------------------1-- ----11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------4---------------1------------------------1----
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[5719] PF06552            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TOM20_plant:Plant specific mi  ------------------------------------------1----1--11---------------- --2---------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1-----11----1--------1121--1--------------37---1---1--1-------------------------------------------111111--------------------11-------------------------------------------------------------------------21----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1----------------------------------1--------------4--1--------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1------------------------------------------1------- ----22--------1----1------------------------------11-1---------------------11-11-----------------------122---1--21-21-2-1---------1--------1------1------212112-----1--11-------1128212135554-63-------
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[5720] PF10998            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2838:Protein of unknown fu  --------------------------------------------1----------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------- ----221-21----111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111121111111111-1212-1421-------1--------------------------------------------12----------1112411122211211212-1--1
 nction (DUF2838)                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      **                                                                                                        *** **    *************************************************************** *********************** **** ****       *                                            **          ******************* *  *
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[5722] PF07095            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 IgaA:Intracellular growth att  -------------------------------------------------------1------------ -------------1-----------------------1---1-------------------11--------------------------------------------------------------------------------2-1-1-1----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------1--------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------11111111111111211-1111111111121-11111111112111111111111111111111111111-111111111111-------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------11--21-1------11-21----11---11211-----------1-----------1--2----1--------------------1-11-1-------------------------------------------1---1-1-1----2-22-----------------1--------1--1-------12-
 enuator protein IgaA                                                                  *                          *                       *   *                   **                                                                                * * * *                *                                                                                                                                                                                                **                             *                                                                    *                                                                                           *                                                                                   *                                    ***************** ************* ************************************** ************                                                       * *                                                                                                               **  ** *      ** **    **   *****           *           *  *    *                    * ** *                                           *   * * *    * **                 *        *  *       ** 
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[5723] PF07079            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1347:Protein of unknown fu  --------------------------------------------------------------1----- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111---1------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1-----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -2---1---------1----------1-1-111111-1-1-11-------1-11--------1---1---1----11--------11----------------------1-111-12111212221-213921325121221112211-1411213221---11-----1---1------1----311--2-1------
 nction (DUF1347)                                                                             *                                                                                                                   **************   *                                          *                                                                                                 *                                                                                          *              *                 *                                                                                                                                                                   *                 *                                                                                   *                                                                                                                *                                                                                                                                                  *   *         *          * * ****** * * **       * **        *   *   *    **        **                      * *** *********** ********************* **********   **     *   *      *    ***  * *      
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 DUF1793:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- 1-1-1-----------------------------------------------------------------------------------227--1----------2-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1111--------11---1--1------------------------------------------- ------1--------64323333343311-11111111111111114211------222222---------------------------163426-----331----4--1-------------------------------------------------------------2----------------2---------
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 DUF3308:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------1112---51768783-0------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---111----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------2--1-1--1------11--1--------------1---11-----------------1---------------1-----1--------111111-21-11-1------------------------------------------------------------------------------------------2222211122-------------------------------------------------------------------------1 ---1------------------------------------------------1----------2-----------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-------------------------------
 nction (DUF3308)                                                                                                                                                                                ****   ******** *                                                                                                                                                                                                            **   ***                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                *                        *  * *  *      **  *              *   **                 *               *     *        ****** ** ** *                                                                                          **********                                                                         *    *                                                *          *                                                           *                                           *                               
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 DUF3353:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1111112111111111111111111111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------1--1-------------------------------------1------------2------------------126321-1-1---11---------------------------------13229333317697-45------2
 nction (DUF3353)                                                                                                                                                                                 *                                                   *************************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                         *                                                                                                                                                        *  *                                                                                                                                                                       *  *                                     *            *                  ****** * *   **                                 ************** **      *
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 T4SS:Type IV secretion system  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------2-------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-4226--1-1--------11111111111--------12---2111121----1-1---2---1--11---------1---------------------------------------1---1--2--1211-------311------13-1-------1--2-----11-----------------3-1--------------------------1-----------2--2--1-----------------------------------------------------------11-1--1-----------------1-----1-------111---1-----1---1--------1--1----1--1-----11---2------111--1---------------------1---------1------------1-------------1--111111-1111-1111-1--1--1---------------------------------------------------------1-- --------11-------------1-1--------------------------------------------------------------1---------------------1----2-------------------------------------------------2---1--------1------1-------------
  proteins                                                                                                                                                                                          *                                      *                                                                   *                                                 *                                                                                                                          *  * ****  * *        ***********        **   *******    * *   *   *  **         *                                       *   *  *  ****       ***      ** *       *  *     **                 * *                          *           *  *  *                                                           ** *  *                 *     *       ***   *     *   *        *  *    *  *     **   *      ***  *                     *         *            *             *  ****** **** **** *  *  *                                                         *           **             * *                                                              *                     *    *                                                 *   *        *      *             
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[5729] PF04353            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Rsd_AlgQ:Regulator of RNA pol  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111-1-111111111111111111111-------------11-1-111111111111-111111111111111111111111---1111111111111111111111111-111111111111--------------1111-------------------------1111111111111111111----------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ----------------------1-------------------------------11-----------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-------------
 ymerase sigma(70) subunit, Rs                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ****** * *********************             ** * ************ ************************   ************************* ************              ****                         *******************          **************                                                                                                 *                               **                                               *                                                                                 *             
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[5730] PF05545            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 FixQ:Cbb3-type cytochrome oxi  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111------------11-111111-111111----1--2---21--11121-211221-111-1-1111112-------------1---------------------------------1------------------------------------11---111---11111--3--2-11----------111--------------------------------------------------------1--11-111-----1211111111111111111----1-1--------------------------------------------------------------------------------------------1----------11------------------------11111-12-1222122221111----------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 dase component FixQ                                                                                                                                                                                                             *       *                                                                                                                                                                                                                                                   ***            ** ****** ******    *  *   **  ***** ****** *** * *******             *                                 *                                    **   ***   *****  *  * **          ***                                                        *  ** ***     *******************    * *                                                                                            *          **                        ***** ** *************          **************                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 DPM2:Dolichol phosphate-manno  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----21--211--1-1111-1111--11111111-1-1--111111111111-1111111-1111-1--1--11------111111111-111-1111111--11--1--2121-11----1111-121381-212--1-2-111--11-211111111----1---111---11------121-11-111----111-
 se biosynthesis regulatory pr                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **  ***  * **** ****  ******** * *  ************ ******* **** *  *  **      ********* *** *******  **  *  **** **    **** ****** ***  * * ***  ** *********    *   ***   **      *** ** ***    *** 
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 Auxin_resp:Auxin response fac  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----2-------------2------------1-----------111------------1--1----------13147-78-------
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[5735] PF12254            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA_pol_alpha_N:DNA polymeras  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1--1--------111111111-111111111111111111-111111111111111111111111-11-1111111----111111111111111----11-1--1-1--211111-111--1-11---251-11111--1111-11-1--1---111-24311111-1111-1--11-1---111---1-1--1----
 e alpha subunit p180 N termin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *  *        ********* ****************** ************************ ** *******    ***************    ** *  * *  ****** ***  * **   *** *****  **** ** *  *   *** ******** **** *  ** *   ***   * *  *    
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[5736] PF12009            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Telomerase_RBD:Telomerase rib  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 21111---311-1-1--1111111-11---1--11-1--1------11--11-11-11111-111111-11111-11-11111111-111------1-----1--111---11-225111111-12-31472-324-11-11131-11--51-41311--2-------------------1-1---1-1-1--------
 onucleoprotein complex - RNA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *****   *** * *  ******* **   *  ** *  *      **  ** ** ***** ****** ***** ** ******** ***      *     *  ***   ** ********* ** ***** *** ** ***** **  ** *****  *                   * *   * * *        
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[5737] PF06001            147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DUF902:Domain of Unknown Func  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1--1344415222222233242303-3352222222222222232242322111-4111111-11311------------------------
 tion (DUF902)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                    *  ********************** **************************** ******* *****                        
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[5741] PF12044            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Metallopep:Putative peptidase  ------------------------------1------------------------------------- --------11--------------1------1-----------------------------------11----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------1--1--1------------------------1--------------------------------------------------------------------------1---------1-------------------------------------------------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1- --------------122113111212122222211111112113331111111111122111211111111111111-111111111111-12--------2-1-1---2---1-----------------------1---------------1---------11111211--1-1-1-----------2--1-1111-
  family                                                      *                                              **              *      *                                   **          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                    *  *  *                        *                                                                          *         *                                                       *      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                *************************************************************** ************ **        * * *   *   *                       *               *         ********  * * *           *  * **** 
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[5742] PF11146            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2905:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- 111-------------------------------------------1-----------------------------------1-1111--------------------------------------1----111-11111----1--------------------1------1-------1---1--11--1-1111111111111111111111-1111-1--------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1--111-1111111-----1------------1------------------------------1---------1-----------------------------11---------------------------------------------1111111111111111111111112222-----111--111-1--1-1------------1-1--1-------1-------111-111-1--1----------------------------11-----------------------------------1111---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------1--------------------------------------------1--1111--------------------------------------1--111111--- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF2905)                                                                                    ***                                           *                                   * ****                                      *    *** *****    *                    *      *       *   *  **  * ********************** **** *        *                                                                                                                       *   *  *** *******     *            *                              *         *                             **                                             ****************************     ***  *** *  * *            * *  *       *       *** *** *  *                            **                                   ****                                                                                                         *                         *               *                                            *  ****                                      *  ******                                                                                                                                                                                                           
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[5743] PF05472            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ter:DNA replication terminus   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1--------1------------------------------------------1-----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1--2222----2222---------------------1----------------------------------------------1---------1---------------------------1---3----1---------31-1----1-----1-1-------11111111111111211-1111111111111111111122111111111111111121111111111111-111111111111----------------------------------------------------1---------------------1--------------1-11------------------------------------------------------------------- --------11------------------------------------1---1------------------------------------------1---------1-1--------------------------------------------------1------1-------1-----1--1-----11-----------
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[5746] PF10321            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       46                          
 7TM_GPCR_Srt:Serpentine type   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------11111-------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1-111111-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------11-------------------------1-------------1--------------------------------------------11-------------------1------1--------------------------------112--1---1------451-1----------------1------
 7TM GPCR chemoreceptor Srt                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                      *****                                                                                                 *****                                          *                                                                         * ******       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            **                         *             *                                            **                   *      *                                ***  *   *      *** *                *      
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5747] PF04220            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF414:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1---11111111111111111111111-------------11111111111111111-11111111111111111111111111111-1111111111111111111111-111111111111------------------111111111111111---------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------1-----------------------------1-------------------------2------------------1-1-------------------------------------------2-----------------------------------1----1--
 ction, DUF414                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                        ** *   ***********************             ***************** ***************************** ********************** ************                  ***************                                       **************                                                                                                             *                             *                         *                  * *                                           *                                   *    *  
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[5748] PF04222            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF416:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------11111-111111111111111111111111-------------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---------------11-111112111111111---------------------------------------11111111111111------1--------------------------1---------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction, DUF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                ***** ************************             ***************** **************************************************** ************               ** ***************                                       **************      *                          *                                                                                                                   *                                                                                                                            
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 g) domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *        *****************************************************  ******** *********  *  *   **    *    ** * **** *** ** **** ****** ********* *****  * ****************  **          *     *       
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[5753] PF04904            146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 NCD1:NAB conserved region 1 (  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------113--2-212223-2-2112264172232-745-2123222212211212221122121111-11112111-------------------------
 NCD1)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ***  * ****** * ************* *** **************************** ********                         
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[5754] PF05380            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            2                                               4     4                                
 Peptidase_A17:Pao retrotransp  ---1---------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------14--------------------------------------------4-42-1115---87-5-------------------------
 oson peptidase                    *                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **                                            * ** ****   ** *                         
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[5755] PF03008            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF234:Archaea bacterial prot  ------121111111---22-11----1-311--1-2---------14--2-1-8889613---1--- ----1-------------------------------1-----1--------------------------------222--11----1-321--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1---------------------------------------------------------------3--------------------------1--3--11------1----2-1---------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------1----------1-111211111-1---------1--11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------41321---1---1 -------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
 eins of unknown function             *********   ** **    * ***  * *         **  * * *******   *        *                               *     *                                ***  **    * ***                                                                                                                                                                    *  *                                                               *                          *  *  **      *    * *                                                         *                                                                                                                         *                        *             *          * ********* *         *  **                                                                                                                                                                                                                                                                           *       *****   *   *                                                                                *                                                                                                         *             
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 DUF3670:SNF2 Helicase protein  --------------1--------------------------------2--1-1--------------- -----111111111---11-1----111111-----1112----1-1-------------111-1-2312----------------------------------------------------------1--11------------2111112--11111111111212-1-11----1--1---------1111111111111111111111111112111---------12-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--1---1-1-----------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-21-------------------------1-----------1------------1---1-----------------1-----11--------------1---1----1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1---------2- ----------------------------------11------------------------------------------------------------------------1-2---------------------------------------1-----------------------1----------------------1-
                                              *                                *  * *                     *********   ** *    ******     ****    * *             *** * ****                                                          *  **            *******  ************** * **    *  *         *******************************         **                                                                                           *                          *  *   * *                             *                                                                                                   * **                         *           *            *   *                 *     **              *   *    * **                                                                                               *                                                                                                                                                                                 *                             *         *                                    **                                                                        * *                                       *                       *                      * 
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 APH_6_hur:Aminoglycoside/hydr  --------------------1----------------------------------------------- -------------1-------1---1-------11-1-2----2-32--11-111--1----1-1-22231-------------------------------------------------------------------11-----------------------------1------------1-1-------111111111-111111-1----1111------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1--111111-11111------------------------------------------1--11--1---------------1-----111111-----111-------111--------------1------1--------------------1-1------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------1------11-------------1------------1--1--1----1------1-------------------11-1--1-------------------------1-------1131-11---1-----1-----------------1------11--1-------------------------------------------------------------1------- ------------1----1-------------------------------------1-1---------------------------------------1------------1-----------------1251--1------------------------------1----------------------1--1-------
 oxyurea antibiotic resistance                      *                                                             *       *   *       ** * *    * **  ** ***  *    * * *****                                                                   **                             *            * *       ********* ****** *    ****            **                                                                                                                                                                               *          *  ****** *****                                          *  **  *               *     ******     ***       ***              *      *                    * *                                                      **                                                          *      **             *            *  *  *    *      *                   ** *  *                         *       **** **   *     *                 *      **  *                                                             *                    *    *                                     * *                                       *            *                 ****  *                              *                      *  *       
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[5758] PF06514            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PsbU:Photosystem II 12 kDa ex  ------------------------1--111-------------------------------------- -----------11------------------1---------1--1--1--1------------1--1---1-------1-11------------------1------------------------1--------1222-1----15122111221111111111111111-1-----1----1-111-1--1-----------------1-------11--1--222212--------------------1-1--------1------------------------------------------------------------------------------------11--1--1111-11-1-1-111-1----1------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1----1-1-1-1-111-111-2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12--1--------- ------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------32----1-------------------------------------------1----1-----------1---1------------13-2-23
 trinsic protein (PsbU)                                 *  ***                                                  **                  *         *  *  *  *            *  *   *       * **                  *                        *        **** *    ************************** *     *    * *** *  *                 *       **  *  ******                    * *        *                                                                                    **  *  **** ** * * *** *    *                                          *                                                                                                                                                            *     *    * * * * *** *** *                                                                                                                                                                               *                                                                                                                           **  *                                                                            *                                         **    *                                           *    *           *   *            ** * **
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[5759] PF02278            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Lyase_8:Polysaccharide lyase   ---------------------------1---------------------------------------- ----2----------------------------------------2------1-1--------11--111---------------1--113-----------1-----7-------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1-11121121111111-----2---11----------1---------11111-1---1111111111111111111111-1-22----------------------1-----111--------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2---------------------------------------2-1-------------------------11111111111------------------------------------------------------------1------------111--------24---------------------------------------------1-------------------------1-- ------4----2------1-----------------------------21---------------------------------------111-111-------211-----------------------------------------------------11------------5-----1----------1---1----
 family 8, super-sandwich doma                             *                                             *                                        *      * *        **  ***               *  ***           *     *                                                                                           *                              * **************     *   **          *         ***** *   ********************** * **                      *     ***                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                       * *                         ***********                                                            *            ***        **                                             *                         *         *    *      *                             **                                       *** ***       ***                                                     **            *     *          *   *    
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[5760] PF12126            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13    1                                                               
 DUF3583:Protein of unknown fu  ------------------------------------------1-1----------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1-1--------------------------1---1--------2--1-----1------------111----------1-1------1--1-1----------4----11112121141141019-620-13121112-11--112312-1-----1------2--1------------1------------
 nction (DUF3583)                                                         * *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *    *                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                  * *                          *   *        *  *     *            ***          * *      *  * *          *    ***************** *** ******** **  ****** *     *      *  *            *            
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF2349:Uncharacterized conse  --------------------------------------------------1----------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------112-11111111111112111111111111111111111111111--111--1---------------------11112-1111111---1-21-1---111142111-11142-21431-223-11121111-111-2--21111-1---2--111111111----1---------1---------
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 Casc1:Cancer susceptibility c  -------------------------------------------------------------------- --1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------1----1-------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------11----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1----------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1-------------------------------------------1----------1-----2-------1------------------------1---311221221-1-42-61533-3312--21116-1211131-1-111-34-----12221--22------------------1-----
 andidate 1                                                                                            *                                                                                                                               *                                   **                                                                                      *    *       *                                                                                                                                *                     **                                              *                                                                *                                  *                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                           *          *     *       *                        *   ********* * ** ***** ****  ***** ******* * *** **     *****  **                  *     
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 DUF2136:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- --1-------------------------------------------------------------------------------------1----1-----1-11--16---------------------1---1------1-----1-2-334----------11--111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1---1----------1-12---------------1-2-111--1-------1---1-1-------1-----1-----------1---11------------------------------------11---------------1---------1--1------1----112-1-----------------1--1---11------1------1---------------------------------------------2-1---------2--------1--------1--1------1----1-11111----1-111---1---1-111111----1-1-11-11111112-1111-11--1112----------------1--------------------------11------------21----11-2---1---------------1--1----------------------------32------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------
 in conserved in bacteria (DUF                                                                         *                                                                                     *    *     * **  **                     *   *      *     * * ***          **  ***                                                                                                                                                                            *                                 *   *          * **               * * ***  *       *   * *       *     *           *   **                                    **               *         *  *      *    *** *                 *  *   **      *      *                                             * *         *        *        *  *      *    * *****    * ***   *   * ******    * * ** ******** **** **  ****                *                          **            **    ** *   *               *  *                            **                                                                                                                                  *                                                                                                  *                        
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 Fe_bilin_red:Ferredoxin-depen  -------------------------------------------------------------------- --1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2131311111133333311131133333333333333-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--------------1-----------------------------11--------------------------------------------1----1----------3--------------------------------------------2---------------------21129212113122-3233---1-
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 Med20:TATA-binding related fa  -------------------------------------------------------------------- ----1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------- ----11--------2--111111111122111111111-1111111-1-----1-----------111-1--111-----1111-1111--1-1---------111-1---1-251-111121-11-1-561-212-1111-11-11---111111-2--2-1211-111---1----111--1-11121311------
 ctor (TRF) of subunit 20 of M                                                                           *       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                               **                                                          *                                                                            *                                                                                                             *                              *                                                                                                                                                                                                                                             *                **        *  ********************* ******* *     *           *** *  ***     **** ****  * *         *** *   * *** ****** ** * *** *** **** ** **   ****** *  * **** ***   *    ***  * ********      
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[5769] PF09984            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2222:Uncharacterized signa  -------------------------------------------------------------------- ----------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------12------------------------------------------------------------111-1-1--111111111111111111111------1------11111111111111111-11111111--1111111111111111-1111111111111111111111111-111111111111--11----------11-1---------------------------1111111--1111--------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-----------------
 l transduction histidine kina                                                                                             **                                                                                                        *                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *               **                                                            *** * *  *********************      *      ***************** ********  **************** ************************* ************  **          ** *                           *******  ****              **************                                                                                                                                                                                 *                                                                              *                 
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[5770] PF02267            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Rib_hydrolayse:ADP-ribosyl cy  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------- --------------------------------------------------1-1------------1-----------------------------------------1---1273-3223223242122332-32422225223322221222322312---322--------23----------1-------------
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[5773] PF06958            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Pyocin_S:S-type Pyocin         -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1-----1-----111-------1-1----1-------5--1-731-1--------------1----------22122221222----------1----------------------------------2211--61-12---213-------------------111---------------------------------------------------------------------------1 --1-----1-----1---------11---------------------1--1-2---1------------------1---1--------------1-1-1----------------3---1-2----141961-233--3-11--------2------------------1--------1--------------------
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[5774] PF10120            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MethylPyrKinase:Archaeal phos  11212233333333334123222-32231322--111111111121111112112222212---1-11 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1---------1----------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111---- -----------------------------1111---------------1-------1-------------------------1---------------------------------------1-11---1------------------1-1----21-------1-------------1--------------------
 phomethylpyrimidine kinase     *********************** ********  ***************************   * **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                   *                                                                                    *         *                                                    *                                                                                                 *                                                                                                                               *                                                                                              *  *******                                  ****               *       *                         *                                       * **   *                  * *    **       *             *                    
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[5775] PF05384            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DegS:Sensor protein DegS       ----1--------------------------------------------------------------- ----------1------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-----------11111---11---------------------------------------1------11-------------1-111112---1111111------11-------------------------------------------------------------------------------------------11------------1---------1-----2-11-11111-21-1------1-------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1----1--1-11--11--1--11-------------------11------2-11---------------------------1--1-1------1----1---1--2--123-----1111-2-823-11-21---1----2111--1-----2--------3-1-------1-------1-1211-1--2-1-
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[5776] PF05219            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DREV:DREV methyltransferase    -----------------------1-----------------------1--1----------------- ------------------------1--------111-----11-----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1---------1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-11------------------------------------------------------------------11----------------------------------1-----------1-1------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1---11------------------------------------------------------------------------ ----111-421-----------------------111---------1---------------------------1--------------------------------16-2111111111111112121212-11211112111-11111111111111---121-211121111--114111------1----1111-
                                                       *                       *  *                                          *        ***     **                                                           *                                                            *       *                                                                                                                                                                                    *                                 *         *                                  *                                                                                       * **                                                                  **                                  *           * *                                                                        *                                                                                                     *                      *   **                                                                             *** ***                       ***         *                           *                                ** ********************** *********** **************   *** *********  ******      *    **** 
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[5777] PF06754            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhnG:Phosphonate metabolism p  ----------------------------1--------------------------------------- -------------------------------------------------1-------1-----------------------------------------------------------------------------111-1---------11----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------------------------------------111---11111----------1---1--1-1-3--11111111111111-----1----111--------1------------------------------------------------------1111--1111111---11111---------1---111-------11-------------------11-------------------------------------------------11----------1--------------------------------1-11-1-1111111111-111111111111111111-11112----1--------------111----1--1111111-1111---------------------------------------------1111---11-----111---------1---------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-----------------------2------------1----------1---------------------------------1---------------
 rotein PhnG                                                *                                                                                         *       *                                                                             *** *         **                *                                                                                                                                                           *              *                                               ***   *****          *   *  * * *  **************     *    ***        *                                                      ****  *******   *****         *   ***       **                   **                                                 **          *                                * ** * ********** ****************** *****    *              ***    *  ******* ****                                             ****   **     ***         *                                                                                                                                                                                      *       *                       *            *          *                                 *               
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 TRAP_beta:Translocon-associat  ------------------------------1-1-----1---------212-2-1111111---1--- ----------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-212-----------------------------------------------------1------------------------------------1-----121211221-221111111-1-381-112--12122311111-1111113-12--2111212112211-111311111-252-11-------
 ed protein beta (TRAPB)                                      * *     *         *** * *******   *                                                                                                  **                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                              * **                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *** ***                                                     *                                    *     ********* ********* * *** ***  *********** ******* **  ************* ********* *** **       
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 Lact_bio_phlase:Lacto-N-biose  ------------------------------1-----------------1------------------- -1-------------------------------------------------------------1-----------111---1---------2-----------1--------------------------11-1-------------------------------11------------------------------------1---1----------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1113-16---1----------1------1-------1--------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-1121----------------1------------------------------------------1--------------------2--1--------------------------------------------1-----------------2----------------1------1--1111111--111-11----1-11111--------------------------11-------------------------------------111--1-11111111----------------1----111------------------------1-111--11111112------------------------------------------------------1---11-1-- --------1------2--11---1-1----------1111111--------------1-----------------1------------------11------------1-------2--------------------------1-------------1----1------1---1----111--------11---12111
  phosphorylase                                               *                 *                     *                                                             *           ***   *         *           *                          ** *                               **                                    *   *                      *                                                                                            *                  **** **   *          *      *       *                                                                                *                                           * ****                *                                          *                    *  *                                            *                 *                *      *  *******  *** **    * *****                          **                                     ***  * ********                *    ***                        * ***  ********                                                      *   ** *           *      *  **   * *          *******              *                 *                  **            *       *                          *             *    *      *   *    ***        **   *****
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 FPL:Uncharacterised conserved  ---------------------------------------------1---------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------- 1121111-211-21---1-----------------------------------------------------------------------------------------1212121112112111153111271111211111112-111--2112122111441111-21211121111-4---1111-4-114211111
  protein                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                      ******* *** **   *                                                                                         ************************************* ***  **************** *********** *   **** * *********
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[5782] PF06258            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1022:Protein of unknown fu  ---------------------------------------------------------------1---- ------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------11111111--1-----------11--111----------2222222211111111------------1111111111111----1---1-1----------------------------------------1----------1--1--------------111111------------------2------1-----1------------------1---1---1-----------11---------------1--2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111---1------------------------------------------11111121111111----------------------------------------------------------1- ------------1-1--1-----------------1--------------1-1---------------------1-------------------11---1---111--2------------1--11---------1-----11---1--1----------------1-----------11-----1213-21--111--
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===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5783] PF06452            144                                                                                                                                                                                 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
 DUF1083:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- 123-1----------------------------------------2--1-------------------1-------------------11-1-2------3-253031------------------------------11-----------------------------------------------13------------------------------------------7---------------------------------------------------------------------------------------------------------5-------1--------------------------7-2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111113--------------------------------1--2-11-1-----2-111--112-1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1---------1-------------------------------------------------------------21--41242-3-1 ------1-------2------------1-----1--------------------------------------------------------------------------3-1-----------------------------------------------1-----3--------2-----------------11-2232-
 ction (DUF1083)                                                                                     *** *                                        *  *                   *                   ** * *      * ******                              **                                               **                                          *                                                                                                         *       *                          * *                                                                                                                                                                                                                           ******                                *  * ** *     * ***  *** *                                                                                                    *                                                                       *         *                                                             **  ***** * *       *       *            *     *                                                                          * *                                               *     *        *                 ** **** 
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 Caleosin:Caleosin related pro  -------------------------------------------------------------------- ----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1-133111-1111--------11---------1111-2-2-1211111---------------------------11-1331----2-2111-1--2-------11-1111111-131-111211121-121111-1111-12-1-----------------33--1--123904293-------
 tein                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             * ****** ****        **         **** * * *******                           ** ****    * **** *  *       ** ******* *** ********* ****** **** ** *                 **  *  *********       
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[5787] PF03125            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       46                          
 Sre:C. elegans Sre G protein-  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----1----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------1------------------1111----------------------------1----------------------------------------1----------1-1-----------5---------------------------1---2--152---11-------1----1----1---
 coupled chemoreceptor                                                                                                                                                       ***                                                                                                                                      *    *                                                                                                                                            **    *                            *                                                                                                                                            *                                                                                     * *                                                                                                                                                                        * *                                                                                                                                               *                  ****                            *                                        *          * *           *                           *   *  ***   **       *    *    *   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF2081:Uncharacterized conse  -------------------------31---1-----11---------1-------------------- -----211111----------------------1-1--1--1------------------2---111-1-1----------1-------11--1-------1------------------------------211--1-----1-11--------------------1---------------1--------------1------------------11-----1----1---------------------------1---------1--1-------1111----11-----------1122112121211-----1----111-------------------1-1------11--------------1-----------------2----1-----------------1---------1---1--------11-----1--1------------111------------------------------1-11------------------------------1----------------1----1-1-11------------------1---2-1-----------------------1-------1--------111--1-------1--1-------1---------1------1----1-------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1--1---------------1-1-----1----1----------------------------------------------------------11--1--11-11----- -----1--------------------------------------------------1--------------------------------------------------------11--------1-----------------1-11----------------1-------------------------------------
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 DUF1073:Protein of unknown fu  -----------------------------1------1--11---1--1-------------------- --------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1--------------------------11----------------------------------------------------------------------3---------------------------------------------------------------------------------------1--4--11-----------11--1-------------11111111----1---------------------------------12---1---1---1--2----11---------1--1----1-------1-----------------------------------------------------------1--------------------------------------1111--------------------------------1-----------------1-1--------1---1---22-2---1--1--12-1-1---111111----------1-1-------------------------21-1----11-1111----------1---------------------------------------------21-1----------20351---------------1----------------------------- -----1-----1----------------------------------------1-----------------1-----1----------1--------1111-----2-----------------------------1------1-------------1--1---1-----3---------------------1-------
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[5794] PF07689            143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[5795] PF04070            143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF378:Domain of unknown func  --------------------------------------11111-------221--------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1111---------------------------------------------------------------------------1112222222222222211111112-211111--------1---------------------1-1--------------1-1---------------------------------------------------21122222222121111111111-1--11-----11---1---------------1-----1--11---111----------------------1-------1---1-11---------1-1-------------------------------1-111-1111111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------11111111---------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 tion (DUF378)                                                        *****       ***                                                                                                                *              ****                                                                           ************************* ******        *                     * *              * *                                                   *********************** *  **     **   *               *     *  **   ***                      *       *   * **         * *                               * *** *******                                                                                                           * **                                                                                                                                                             *                                                                                     ********                                                                                                                                                                                                                                                                        
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 NUP:Purine nucleoside permeas  -------------------------------------------1------------------------ --1--------------------------------------1-----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------111-------------------11111111--2----------------1-----------------------11111111-111--------------------------------------2-----1111111111-11111111-1121------222---------1-------------------1---------------------------11-1-----------------------------11---1----2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----111------111-------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------111-11111111--1-----1----------32112222--1--111-1---2-1--2-2-----122212-111-11------12----------------------------------------------------------------1--------------------11---1---1---
 e (NUP)                                                                   *                           *                                      *           *                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                   *                           ***                   ********  *                *                       ******** ***                                      *     ********** ******** ****      ***         *                   *                           ** *                             **   *    *                                                                                                                                                                 *     ***      ***                                                                                                                  *** ********  *     *          ********  *  *** *   * *  * *     ****** *** **      **                                                                *                    **   *   *   
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 DapD_N:Tetrahydrodipicolinate  -----------------------------------------------------1-------------- ------------------------------------------------------------------------------1--1------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111--11-1-1-111111-11111111-------11111111111111-------------1111111111-1-111111111111-1111111--------------------111---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1111111111---- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  succinyltransferase N-termin                                                       *                                                                                             *  *                                                                                                            ****************************** *********************************  ** * * ****** ********       **************             ********** * ************ *******                    ***   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                          **********                                                                                                                                                                                                            
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[5798] PF05934            143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 MCLC:Mid-1-related chloride c  ---------------------------------------------------------1---------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------1-1--------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------1------------------------------------------------------1------------------------------------------1-52211-21111111541414131527122131111111121115132111--162-------121-----------11-----1-1---
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[5799] PF11800            143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RP-C_C:Replication protein C   ----------------------------------------------------------------1--- ------------------------1------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1--------------------1----1--11---14-2-----11111111116-13---1-152--433884285532-1---3--41-11--1111111141-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------11-----------------------------1------------------------------1--1-----2-----------------1--1--------1----------1-----2-----------------------------1----1-------------------1-------------
 C-terminal region                                                                              *                            *      *                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                             *            *                    *    *  **   ** *     *********** **   * ***  ************ *   *  ** **  ********** *                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   **                             *                              *  *     *                 *  *        *          *     *                             *    *                   *             
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[5800] PF09511            143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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