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Ranking of RP:PFM:REP : from 6101 to 6200

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[6102] PF09819            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ABC_cobalt:ABC-type cobalt tr  --1-1-----------1--------------------------------------------------- -----211111-11-------1---1-------111--------1-2-1111111--11111-1------12333122---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------111---------------1-1111---111-111---------1111111111111111111111111111-1111111---123---111-------11111111111----------------------------1111111-1----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ansport system, permease comp    * *           *                                                         ****** **       *   *       ***        * * *******  ***** *      ********   *                                                                                                            ***               * ****   *** ***         **************************** *******   ***   ***       ***********                            ******* *                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
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[6103] PF11996            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3491:Protein of unknown fu  ---------------1---------------------------1------------------------ -1----------------------------------------------------------------------------------------1---------1----1--13-4413--11-------------------11-------1------------------------1----------------1------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1----1----------------------2-3-------1------1---1--------1-----11--------111-1--------------------1------------1---------------------------------1--1----1---------------1-1---------------1------------------1--------------------------------1-----------------1---------------------------------------11--------1----2----1------------------------------------------1-------------1------------------2-------1--------------------1-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11-------1111-------------------1-------------121-12--------------2-111----------1----1---------1-----21---1-1--------1-----1-------2------------------2----1--11-----111--2------1----6111-1---111-1
 nction (DUF3491)                              *                           *                          *                                                                                        *         *    *  ** ****  **                   **       *                        *                *                              *                                                                                                                                               *                 *    *                      * *       *      *   *        *     **        *** *                    *            *                                 *  *    *               * *               *                  *                                *                 *                                       **        *    *    *                                          *             *                  *       *                    * **                                                                                                             **       ****                   *             *** **              * ***          *    *         *     **   * *        *     *       *                  *    *  **     ***  *      *    **** *   *** *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6104] PF04782            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1 2 1        
 DUF632:Protein of unknown fun  ------------------------1---------1--------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------- ----1-------1------1-------------------------------------1-------------------------------------3---------------------1-1--2-111--141-1111-1-1111--1---11-2-1---------------------1-------8878-86-1-----
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 DUF1113:Protein of unknown fu  ---------------------------------------------1---------------------- -----------------------------------------------------------------------21111212152---------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------111111----------------------11------111--11--------111--------11-------------------------------------23-------2-22355-1225-311-31--11---21-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1---------1-------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- --------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1--3----11-1-11-121----------------1-1-1---1--111123---1-2--4-----3-------------------------
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 HTH_Mga:M protein trans-actin  -------------------------------------------------------------1------ -------------------------------------111----------------------1----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------3-34---21-----1-----------1---111111---11111111111111211-12---22-----11--22--1----11--112112--12211122221221122222221-1-----------------------1-1------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------1-------111--1------------------------------111--------1-------1-11--------------------------------------------1--------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
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[6107] PF10688            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Imp-YgjV:Bacterial inner memb  -------------------------------------------------------------------- --1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22-22122--------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1----------------------1--------------1--1-------------------------------1-1121---12-11----1211-1211-12--------------1111--1111111111-111111111111111111111111--------------------11111111-111111111111----------------1---------------------------1---------------------------1-1411111-2123-------------------------------------------------------------------------- -----------------------------1111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----
 rane protein                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                           **                                                                                                                         ** *****                                                                                      *                                                    *                      *              *  *                               * ****   ** **    **** **** **              ****  ********** ************************                    ******** ************                *                           *                           * ******* ****                                                                                                        ****                                                                                                                                                                *     
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[6108] PF11806            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3327:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --1----1111--------------------------111-----1---------------1------12------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------111-1--1-1111-1------111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------1------------1--------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------2111-2-1112122211-1121111111121111111113--111221222222222222211121111--1--------------------------1---------------------------------1---1---------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
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 CM_1:Chorismate mutase type I  -------------------------------------------------------------------- ---11-------------------------------------1-1-----------------1----1111---------------1------------------------------------------------11111---112111111111111111111111111111111111111---11---111---------------111111---11111--11111121------------------------------------------------------------------------------------------1-1--1111111-1-1--------11-----1111-1111121-111-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111-----------------------------------------------1-----------------------------1----------- --------------------------1--------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1---1---------------1----------------
                                                                                                        **                                     * *                 *    ****               *                                                *****   ***************************************   **   ***               ******   *****  ********                                                                                          * *  ******* * *        **     **** ******* ***     *                                                                                                                                                                                                                           ****                                                                                                                                                                                                                           *********                                               *                             *                                      *                                                  *                                                                                    *   *               *                
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 DUF1092:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------2221222111111111122212222111111111111--1---------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------- -------1641-----1-1-------1--------------------------1----1---------------------------------12---1----------3-11-------1-1--32----1-------1-1-11-------------------------------11119111112212-1111----2
 nction (DUF1092)                                                                                                  *                                                                                                                *                 *************************************  *                                             *                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                              *                                                    * *                                                                                                                                                                                                                         **                                                                                                          ****     * *       *                          *    *                                 **   *          * **       * *  **    *       * * **                               ************** ****    *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 DUF2315:Uncharacterised conse  -------------------------------------------------------------------- -------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11---------------------------------------------------------------------------111-111-111--11-1-1--31111132212-2133-32012-22111112-22122121221512221---121111---2111---------1--------------
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[6113] PF10325            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       17                          
 7TM_GPCR_Srz:Serpentine type   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------11---------------------------1------------------------1-------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 11------31-------------------------------------------------------------1-----------------------11-11-1--1----21--------1------1---------------1---------------1-211-------1381----------------1---112--
 7TM GPCR chemoreceptor Srz                                                                                                                                                                                *                                              **                           *                        *             *                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             **      **                                                             *                       ** ** *  *    **        *      *               *               * ***       ****                *   ***  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6114] PF04260            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF436:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---1111111111111111111111111111121111------11111111111111111111111-11--11-----11--11----11111111111111111111111111111111111111111111111-----------------------1----1--1-11-----1-1111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------
 ction (DUF436)                                                                                                                                                                                                                                                                               **   **********************************      *********************** **  **     **  **    ***********************************************                       *    *  * **     * ****                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                        *                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                 *                                                                               
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[6115] PF06196            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF997:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111------111--111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--111-1--------------------------------------------11-----------------------------------------11111111111111111-1111111111111111111111-1111111111111111111111111111--111111111111--1---------------1111111111111-1------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ --------1---------------------------------------------------------------------------1-------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------
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 DUF1242:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---111-------1-111111---1--111111111-------1--1---1-11111-11111-1111-1----1-1--11111-----1311--1---11--11-----11-11111--111122-1-112-1221111-11-1--1111112112111-111-1-111---2-11--11--1-122211----21--
 nction (DUF1242)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ***       * ******   *  *********       *  *   * ***** ***** **** *    * *  *****     ****  *   **  **     ** *****  ****** * *** ******* ** *  ************* *** * ***   * **  **  * ******    **  
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 TFIIIC_subunit:TFIIIC subunit  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11-------11-111111111-1111111111111-1-1111-1111111111111111--1111-11-1-111111-----111---1-1--111-1-1-1----211111211--11-21111121-1-2--111-1111-11-1111-1111----111-1-11-21----------1----1-----211-
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[6119] PF00159            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Hormone_3:Pancreatic hormone   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------344453--1224233252504-44313325123412431221311122----------------------------------------
 peptide                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ******  ************* **************************                                        
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[6120] PF04943            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Pox_F11:Poxvirus F11 protein   ----1--1--------------------------1--1-------------1---------------- -----------------------------------------------------------------------------------1--------1-------------1------------1111--------------------------11------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-----------1--------1-1----------------1-----------------------------------------11----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------1---------------------------- -1--1--------------1---------------------------1----------------------1------------1-----------1--------1----22------112---134131541-22311-12-1121-111121---122---3112------------17-----1-----1-------
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                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[6124] PF10188            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Oscp1:Organic solute transpor  -------------------------------------------------------1------------ ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-211-------------------------------------------------------------1----------------------1------------112223272111111122131622-31211112111-1111111-2111111211111-111-1111-1317--------------11111
 t protein 1                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   * ***                                                             *                      *            ************************ *********** ******* ************* *** **** ****              *****
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[6125] PF10363            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2435:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- 1------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1-------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1--------------------------------------------------------- ----11------111-------------------1--------1----1------1--------1-11----1-1--------------221-1-11------11----122111122112221231111511125111-2133-112-13114222111-2-111-2-----21---------------1-21---1-
 nction (DUF2435)                                                                                    *                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                             *                                         *             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *         *                                                              **      ***                   *        *    *      *        * **    * *              *** * **      **    ****************************** **** *** *********** * *** *     **               * **   * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6126] PF02161            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1    1                                                               
 Prog_receptor:Progesterone re  -------------------------------------------------------------------- -1----------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------11----------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1-------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-1-----1-----------1--11-----------------11-----1-----1----11-------------------------1-------1--------1---113221122266262201-440-1112125112-1-1-11111-1----11-1--------------------------------
 ceptor                                                                                               *                                                          **                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                *                                                                                       **                **                                                                                                                                                                     *                            *                                     *                                                                                                                                              * *     *           *  **                 **     *     *    **                         *       *        *   ****************** *** ********** * * ***** *    ** *                                
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[6129] PF07997            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1694:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111-111111111----1--111111----------------------1111221111155112211-11----11111111111111111111111111111111111-11111111-11--1111111-1-------------------1111--11--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
 nction (DUF1694)                                                                                                                                                   *                                                                                                                                *************** *********    *  ******                      ******************* **    *********************************** ******** **  ******* *                   ****  **        *                                                                                                                                                                                *                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *    
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[6130] PF03612            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 EIIBC-GUT_N:Sorbitol phosphot  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------22------1---------------------------------------------------------------21111-----------111111-----------------1----1---11-----12--11-1-----------111-11---------------------------------1----11111111-12-3---------------------------------------------1----------------------1----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1--------------------------------------13----------------------------------------1-1----1-21111111--1111-1111-1211111-323-1---1111111121112111111-11-1--1--------------------------------1--------111------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ ---------------------1------------------------1---------------------------------------------------------------2----------------------------------------------------------------------------------------
 ransferase enzyme II N-termin                                                                                                                                      *                                                                        **      *                                                               *****           ******                 *    *   **     **  ** *           *** **                                 *    ******** ** *                                             *                      *          *                                                                                                                                *                                           *                                      **                                        * *    * ********  **** **** ******* *** *   ******************* ** *  *                                *        ***                                          *                                                                                                          *                        *                                                               *                                                                                        
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 nction (DUF1090)                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                            *** *    *                                       **                            *                            ****                  **       *  ****  ***** *  *               **   ************ ************************  *********************  **  ************                                             ************* ***          *         *                                                                                                       *                              *                                                                                      *           *           *                           * * 
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 DNA_pol_B_2:DNA polymerase ty  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1--------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------- --------11-21-1--------------------------------1-------------------111-----------11-------1--1-----------1-------5-1-------1--------------------------1-------33---564-----423---------------------1---
 pe B, organellar and viral                                                                                                                                                                                  *                  *                                                                          *                                                                       *                                                                                                                                                   *                                                                                                                      *                                                *                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                  *                             ** ** *                                *                   ***           **       *  *           *       * *       *                          *       **   ***     ***                     *   
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[6134] PF09478            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                54                                                                                                                                                                                                 
 CBM49:Carbohydrate binding do  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----76-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4453-33-------
 main CBM49                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                       **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   **                                                                                                                                                                                   **** **       
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[6135] PF10482            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 CtIP_N:Tumour-suppressor prot  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1-----------111111----------1-------------------------------------11----------------------------332211212112232-11754-32312232123222121211422322-----------2-------1-------22-----------
 ein CtIP N-terminal domain                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                       *           ******          *                                     **                            *************** ***** **************************           *       *       **           
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6136] PF01468            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   11 1 1111 11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 GA:GA module                   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3344-320355303-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **** *********                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
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[6137] PF09747            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2052:Coiled-coil domain co  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------- ------1-----11-1-11212111-1111111111-11111111121111-111-11-111--------------1-------------1----1----1-1-1-----2111-1-1--121-11-1-141-123---11--21-1-211--31--11---11111111---11-11-1111--1141111-12111-
 ntaining protein (DUF2052)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                   *     ** * ******** ********** ************** *** ** ***              *             *    *    * * *     **** * *  *** ** * *** ***   **  ** * ***  **  **   ********   ** ** ****  ******* ***** 
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 DUF126:Protein of unknown fun  111111----------11111111-----1--11111111111111121111111111111-----11 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1----------1---11---111-11-------1----1-1----------------------------------------------------213-122121-----11--------1-1------------------12-1---------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111---------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- -------------------111-2121---------------------111121------------------------------------------------------2------------------11451-111----------------------2---------------------------------11----1
 ction DUF126                   ******          ********     *  *****************************     **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *               *          *   **   *** **       *    * *                                                    *** ******     **        * *                  ** *                     *                                                                                                                                                                                                                                    ****                                                                     *                                                             *** ****                     ******                                                      *                  ***** ***                      *                                 **    *
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 Thiol_cytolysin:Thiol-activat  -------------11----------------------------------------------------- --1-------------------------------------------------------------------------------------2--3-3-----2-1--------------------------------------------------------------------------------1----------11111111-111111------111---2----1111-1--------------------------------------------------1------222222212221111111111111-11---111-1-----------1-1----211--1----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1------1----------1---------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-11111-11111111----111-------------------------------------------------------------------------------1-11-1------------------------------------------------------------------------------------------ ----------1--------1--------1-----------------1-------------1------------------------------------------------2----2------------------------------------------------11-1------1-------------------------
 ed cytolysin                                **                                                        *                                                                                     *  * *     * *                                                                                *          ******** ******      ***   *    **** *                                                  *      ************************ **   *** *           * *    ***  *                *                                                                                                                                                                                                                             *     *      *          *                                                               *                                           * ***** ********    ***                                                                               * ** *                                                                                                     *        *        *                 *             *                                                *    *                                                ** *      *                         
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 DUF98:Protein of unknown func  -----------------------1--------1-111111111-1-1111111--------------- -----------------11-1-112-111111--------------------------------1---------------------------------------1--------------------------------------1-1111111111111111111111111111111111111-----------11111-11-111-11------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------1-----------112222214---1------111-
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Spore_YtfJ:Sporulation protei  ---------------------------------1-------------1-1------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------111333333333333333111111333111-1--------11------------------------------------------------------------------------------------------12121111121112121221111111--1111111111211111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------
 n YtfJ (Spore_YtfJ)                                             *             * *                                                                                                                                                                            *                                    ****************************** *        **                                                                                          **************************  *******************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                               
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 Phytochelatin:Phytochelatin s  ---------------------------------------------1--------------1------- ------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------------2111-1-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1------------1---1-------------------------------------------------------------------------------1111--1-111111--1-----1-----------------------------------1--1---------------1----------1----------------------------------1----------------------1----------------------------------------------------1-------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111---2-112------1----------------------------------------------------------------111-----------12-223-282----------------------------------------1--------211323------124-12211---11-213-213322113
 ynthase                                                                     *              *                                                                    **                                                                                    * *                 **** *     *                                                                                                                                                                                                                *                           *            *   *                                                                               ****  * ******  *     *                                   *  *               *          *                                  *                      *                                                    *                                                 * *                                                                                                                                                             ***   * ***      *                                                                ***           ** *** ***                                        *        ******      *** *****   ** *** *********
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 Pox_E2:Poxvirus E2 protein     ---------------------------------------------------------------1---- -------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------22-1706--------1-----211-1222122122-----------1-------------------------------------------1-----------------111---------------------------------------------1-------------------------------------------22-----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------11-1-------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1-----1----------------------------- --2----------------1-1-----------------------------------------1-----1---11-----2-----------------------1-1-3------------------1----------1-------------------------1---------------------11-----------
                                                                                               *                              *                                                                                                 *                                         *                                                                 *                          *                   ** ****        *     *** **********           *                                           *                 ***                                             *                                           **                       *                                                                                          ** *                               *                                                                                *                                                     *                                                              *                                                   *     *                                *                * *                                         *     *   **     *                       * * *                  *          *                         *                     **           
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 Pet127:Mitochondrial protein   -------------------------------------------------------------------- -1-----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----11------11111121111111122111111211211111111111111111121111111121-12111111-111111111111411111211111111----12---------------1-----------------1-----1----1--------1--------1-1------------21--3------
 Pet127                                                                                               *                                                                 *                                                                                                                                                                                        *          **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                     **      ******************************************************** ******** ***************************    **               *                 *     *    *        *        * *            **  *      
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[6146] PF11843            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3363:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --1------------------------------1-1-------------------------------------------------------1-------------------------------------1----2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------3--1-------1-4-3312--1----------1-------1-323-------------1711--14----------------76----1-------------------------------1311----31----3-----11------1-------3---11--11321--1----------------------------------------------1---------------------------------121------------------211--------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--12---------1---------------------1------1------------------------------------------------------------------------- ------------------------1------------111111-------11--------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------11------------------------1------1---
 nction (DUF3363)                                                                                      *                              * *                                                       *                                     *    *                                                                                                                                                                                             *                                                  *  *       * * ****  *          *       * ***             ****  **                **    *                               ****    **    *     **      *       *   **  *****  *                                              *                                 ***                  ***              *                                                                                                                                    *  **         *                     *      *                                                                                                  *            ******       **                                                  *                                                           **                        *      *   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6147] PF09529            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Intg_mem_TP0381:Integral memb  -------------------------------------------------------------------- ---1-1--111--11----------2------1222-11-------1------------------11--------------------------1-----------------------------------------111------------------------------------------------------111111111-111111--11-1111----1--------11----------------------------------------------11111112111111111111111111111111112111111111---------------11--1212---11--------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-11-----1---11---------------2- -----1---------------------------------------------------------------------------------------------1-----1------------------------------------------------------------------------1---------------1-1--
 rane protein (intg_mem_TP0381                                                                          * *  ***  **          *      **** **       *                  **                          *                                         ***                                                      ********* ******  ** ****    *        **                                              ********************************************               **  ****   **                    **                                                                                                                                                                                                                                *                          *  *                                                                                                                                               *                                                                                                               ** **     *   **               *       *                                                                                             *     *                                                                        *               * *  
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[6148] PF07406            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 NICE-3:NICE-3 protein          -------------------------------------------------------------------- ----1--------1-----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------11-----1---------------------------1---1-------------1------1----------------------------1-----1--4223221-1211112313-613-3351-1131121111-1111212111-1111121212---12--1-------------2-------
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 DUF3672:Fibronectin type III   -------------------------------------------------------------------- ---------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1--1---083-315-1-11-4134244044111211-------------1-21--12--1-22-2122---111-1111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1----------------------------------1-----
 protein                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       **                                                                         *                                        *  *   *** *** * ** ****************             * **  **  * ** ****   *** ****                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                            *                                  *     
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[6155] PF10697            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2502:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------21-1-1-222222221--22221222222222222221-111---111111111111111112112222--222222222222-----------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------1----------------2--------------------------------------------------11-----------
 nction (DUF2502)                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                  *                                                                                                      ** * * *********  ******************** ***   ************************  ************                                               *                                                                                                                                                                          *                                                            *                *                                                  **           
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[6156] PF09902            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2129:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111-1111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111-1111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                                                                                                                                                      ************************ **************** ***************************************** ********************************* *************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
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[6157] PF03873            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RseA_C:Anti sigma-E protein R  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1111111111111111111-------------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---------------------111111111111---------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 seA, C-terminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *        *******************             ***************** **************************************************** ************                     ************                                       **************                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[6158] PF10187            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Nefa_Nip30_N:N-terminal domai  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11-11-1111111-111111111111-11-111111-11-1---1--11-----1----------------------1111111-----11-1-----22111--1--112-11131151-11112-13112-11-212113-111133-11-111121111------------11-1------11-
 n of NEFA-interacting nuclear                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ** ** ******* ************ ** ****** ** *   *  **     *                      *******     ** *     *****  *  *** ******** ***** ***** ** ****** ****** ** *********            ** *      ** 
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[6159] PF08914            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Myb_DNA-bind_2:Rap1 Myb domai  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------1111111111111-1111111111111111111111-1--1--11-1222------------------------1111611223-----1--------3-111221-1111122-11171-1-21-111-111111-11111111-1---1111-------11--------------1-----1---
 n                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ************* ********************** *  *  ** ****                        **********     *        * ****** ******* ***** * ** *** ****** ******** *   ****       **              *     *   
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 Beta-APP:Beta-amyloid peptide  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------22265-111113134161133-624111141122111112-1516111----------------------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 HrpB1_HrpK:Bacterial type III  --------111111------------------------------1----------------------- --1------------------------------------------------------------------1---------------------1-----------------1111111---1111----------------1-------3---1----------------1--------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1-----11--------1--------------------------------------------------------------------3---131222-----3333-2-----1-----1--3-------------------------------1-11-----1-----1----------------------------------------11------1-------------------------------------------111-1-1-1--1111----111--11111-------------------------------------------------1------1111--1---------------------------------1--------------------------------------11111111---------------------------------------------------------------- --------------1---------------------------------------------------------------------------21----------------1-------------1-------1------------------------------------5------------------1-2--3-------
  secretion protein (HrpB1_Hrp          ******                              *                          *                                                                  *                     *                 *******   ****                *       *   *                *                                                  **                                                                                                                                                                         *                            *     **        *                                                                    *   ******     **** *     *     *  *                               * **     *     *                                        **      *                                           *** * * *  ****    ***  *****                                                 *      ****  *                                 *                                      ********                                                                               *                                                                           **                *             *       *                                    *                  * *  *       
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[6165] PF04276            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1 11 1    11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 DUF443:Protein of unknown fun  ------------------------1------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------8-------2---33120152933320-11-------------------------1---------1-------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------1---------------------------1----1-------11-------11--------1----------------------1-------------------------1----------------------
 ction (DUF443)                                         *                                                                                                                  *                                                                                                                                          *           *       *   ************** **                         *         *                                                 *                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                           *    *       **       **        *                      *                         *                      
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[6166] PF00741            126                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 Gas_vesicle:Gas vesicle prote  -------------------------64-1-------------------6--5---------------- -2-------------------------------222--05-111----------------------363--------------------------------------------------------------46------------------533------------4426----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4--2-2---------------------------3-----------------------------------------------------2-22--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------3----------------------------------------4----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 in                                                      ** *                   *  *                  *                               ***  ** ***                      ***                                                              **                  ***            ****                                                                                                                                                                                        *  * *                           *                                                     * **                                                                                                                                                  *      *                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                         
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[6167] PF08961            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 DUF1875:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------1---------1-------- ---------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1-11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------------------------------8------------------------------------------------------------------------------ ----11--------1---1--------------------11---------------1--1-1-----------------------1----1----1--------1---1-1121-22111112122621421-22611112113111111111211212--1--------------1--1----------3----1--1
 ction (DUF1875)                                                                 *         *                              *                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                               * **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *   *                                    *                                                                                   **        *   *                    **               *  * *                       *    *    *        *   * **** ***************** **************************  *              *  *          *    *  *
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[6168] PF12580            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TPPII:Tripeptidyl peptidase I  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ------1-----111--1----------------------------------------------1---------------------111-------------1112-11121111-2111111122121261-22211111-11-11111211111111-331111121321111-21-----112122-211-11111
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 SdiA-regulated:SdiA-regulated  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------121---------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----------------1-------------------------------1---------------------------------------------------------------------1------1221111111-21-112-11121111111---------1122332311122221-11----------------------------------2---------------------------3-33333222222224414-------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------12---------------------
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 DUF1236:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------275461323214----------2-3435342325--111-453475571-------1111---------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1236)                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                         ************          * **********  *** *********       ****                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF3638:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------1--------------------------- 1111--31311----23342112-1--1--1112114111111---22224-33--332111-1---------------------------23-21------------53-----------------------------------------------------1------------32111111-----4---1-31-3
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 Phe_ZIP:Phenylalanine zipper   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------222512131--2-72-427831326-1-242233-12--222532221-------13112----------------------------
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[6175] PF03700            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Sorting_nexin:Sorting nexin,   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------1------------------1---------------1-------------------------------------------1----------------132232121112113281424-434-2223124122112122422122----------------------------------------
 N-terminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                  *               *                                           *                ********************* *** **********************                                        
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[6176] PF06526            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1107:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------222-------11111111111111111111-------------11111111111111-11-11111111111111111111111111111111111111111111111-1-11-111111111111------------------------------------------------------------------------22221111122122-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1107)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ***       ********************             ************** ** *********************************************** * ** ************                                                                        **************                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[6177] PF10253            126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PRCC_Cterm:Mitotic checkpoint  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------111--111111111111111-111-1-11111111--111-1---1111---------------------------211-11111-----------111111-1-1-11-11-31472-31111-11-111-11-111-2111111--1111-113-1111--------111121111----1-1
  protein PRCC_Cterm                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ***  *************** *** * ********  *** *   ****                           *** *****           ****** * * ** ** ***** ***** ** *** ** *** *******  **** *** ****        *********    * *
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[6187] PF04883            125                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF646:Bacteriophage protein   ------------------------------------1------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1---1-1----------1-------------21-----11-2213----1-1---------------1-21----2------1-----------------1111---1111-----------1---2--1--1---1-111--1--1-----2-----------1---------1-------------12--------------------------1-----------------------21-1--------------------------------------------------1-------------------11-2-2---1-----------2---------1--1--1-------------------------------------------------------------------------------------------1------1-1-------------------1---1--45----1---4---113---4---------------1------------------1-----1----------------------------1-----11-------------1-1-1-------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 of unknown function (DUF646)                                       *                                                                                                                     *                                                                                                  *                *   * *          *             **     ** ****    * *               * **    *      *                 ****   ****           *   *  *  *   * ***  *  *     *           *         *             **                          *                       ** *                                                  *                   ** * *   *           *         *  *  *                                                                                           *      * *                   *   *  **    *   *   ***   *               *                  *     *                            *     **             * * *             * *                                                                                                                                                                *                                                                                                                                              
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 YfbU:YfbU domain               ------------------------------------11------------------------------ --------------------------------1-----------------------------1--------------1-----1----------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3-1--------------------1-------------------------111----------------------------------------111111-111111111--111111111111111111121211--1211111111111111111111111--111111111111---------------------111------111---1------1----------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------1---------------------1--------1---------------1---------1----------1--------------------------------------2-----------------------------
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 Methyltransf_13:Hypothetical   -------------------------------------------1---1-------------------- -------------------------2------------22-112----------------1----11-11--------------------------------------------------------------------12------1-222--111-------2----111----1--1--1----------------1111-1-1-1-----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------111-------------------------------------------1----1-------3331---1--1--11-111111-11111-11--1--111--2112-22-1--------------------1----23-----------------------------------------1----1------------------1---------------1--1--------1----------------1--1-----------------------1----------------------------1-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111----------------------------------1-------1-----1--------------------------------------------------21-----------------------------------------------1-- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------------------------------------------------------------------------------------------
 methyltransferase                                                         *   *                                              *            ** ***                *    ** **                                                                    **      * ***  ***       *    ***    *  *  *                **** * * *                       *                                                                                               ***                                           *    *       ****   *  *  ** ****** ***** **  *  ***  **** ** *                    *    **                                         *    *                  *               *  *        *                *  *                       *                            *       *                                                                                                                         *****                                  *       *     *                                                  **                                               *                                                                                                               *                                                                                          
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 PAS_5:PAS domain               -------------------------------------------------------------------- 1---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------2121-----112111131111111111111111-1111111-110-111-11111111--1111111211111-----------1--611111111111---------------1-1---1-11--------------------------------------------1---------------------------------------------1--------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------1-------------------------------1------------------1------------------------------------11--------------------------1------------------1-
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Mu-like_gpT:Mu-like prophage   -------------------------------------------------------------------- --1----------------------------------1--------1--------------------1--------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1-------------------------------------------1---------------11-1---------------2----------------11-------11---1-1-4--1---------------22---------------------------------1--------------------1--------1----------2----21----------------1-------1-----------1-111----------1---111-----------------------------1---------122111----1-2-----------1--------------32--1-1---4--1-3--12311-----2----------1-11-11-1-2----------1--------------------------------1-1---2-1--1-1----------------3--------1-------------------2--2--1---------------------------------------------------------------------------- ----------------------1---------------------------------1-1--------------------------------------1-----1-----------------------------------------------------------1-1-------------2---------------1---
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 SdrG_C_C:C-terminus of bacter  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------777577467777771112--------------11-----------11111-1--------------------11111-1------------------------------------21------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11---------------11--------------------------------------------------------------1----------1-----------------------------------2-------------------------1-----------------------2--------
 ial fibrinogen-binding adhesi                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ******************              **           ***** *                    ***** *                                    **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  **               **                                                              *          *                                   *                         *                       *        
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