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Ranking of RP:PFM:REP : from 6201 to 6300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[6201] PF06411            125                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HdeA:hns-dependent expression  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111--11-1--1-----------------------------------------------------------------------------------2----------1---------------------------------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--2222222222-2222222222222222222111-----1111111111111111-2222222--211111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
  protein A (HdeA)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                **********  ** *  *                                                                                   *          *                                             *                                                                                                                       *  ********** **********************     **************** *******  ************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                   
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[6202] PF07052            125                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Hep_59:Hepatocellular carcino  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1------1---111------1-----1-111-1-1-1-11--------------------1---------------------------111-11111111-1111-1--21111111-1-11111111301-233-1-111123111--1111211-111111111111-1111-1111111--2131-11-------
 ma-associated antigen 59                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *      *   ***      *     * *** * * * **                    *                           *** ******** **** *  ******** * *********** *** * *********  ******* ************ **** *******  **** **       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6203] PF09496            125                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cenp-O:Cenp-O kinetochore cen  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1---1----11111111-1111111111111111111111111111111111111111-11-1-111111111111-11-1-------------111--1-----1---1--111-3-12-341-214111-111111111-11-212-11--------3-----1-----------1---1---------
 tromere component                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *   *    ******** **************************************** ** * ************ ** *             ***  *     *   *  *** * ** *** ****** ********* ** *** **        *     *           *   *         
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[6204] PF08081            125                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13  1                                                                 
 RBM1CTR:RBM1CTR (NUC064) fami  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1-212111331-2968-053211111111211-112121111-----------------------------------------
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 Phenol_Hydrox:Methane/Phenol/  --------2--2-22----2---------1---------------------------1---------- ------------------------22------------2---4-------------------2-1-------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------25224------------------------------1--------------2------2-22--1--------2--------------------------------------------------------------------23--626--44-29-2------4--------------------64------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------4-----------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------- -2----------------------1-------------------------1---------------------------------------------------------2------------------------------------------------------1-----------------------1-----------
 Toluene Hydroxylase                    *  * **    *         *                           *                                   **            *   *                   * *                                                                               *                                                                                                                                                                                                                                               *****                              *              *      * **  *        *                                                                    **  ***  ** ** *      *                    **                                                                                                                                                                                                      *                             *           *                                                                                                          *                      *                         *                                                         *                                                      *                       *           
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[6207] PF05597            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phasin:Poly(hydroxyalcanoate)  -------------------------------------------------1------------------ ------------------------------------------------------------------------222-1------------------------------3---------------------------11111---2-111-111--11------11-1-----------------1----------------1-------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-21-11211112---------------------------------------------1-1------------------------------11-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------1111111-----2222222222222-221-------------5----------11111111111111------------------------------------------------------------ -----1-----------------------------------------------------1------1------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1------------11--1---11-1-
  granule associated protein (                                                   *                                                                                           *** *                              *                           *****   * *** ***  **      ** *                 *                *       *                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                  * * ** ********                                             * *                              ** **                                                                                                                                       **                 *******     ************* ***             *          **************                                                                  *                                                     *      *                                                                                                *         *            **  *   ** * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6208] PF06491            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1094:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- 111---------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111121---------------------------------------------------------------------------------1122222222222222222222222222222111------1122222222222222222222--------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1 -----------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1094)                                                                                    ***                                                                                             *  **********                                                                                 **********************************      **********************                                                                                                  *                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                            *                                                                                                                                           
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[6209] PF01203            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GSPII_N:Bacterial type II sec  -------------------------------------------------------------------- ---------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------11--1----1111111111111111111111111111--1-1-1111-1---1-------1-------------------------------------------1-----------------------------1111-1111111111111111111111111----121-------------------------------------------11111--------------------------------------------1-----------1-----------------1-11111-1--1---------1--1-------------111111111111111--11111------------------------------------------------------------------- --------1------------------------------------------------1-------------------------------------------1--------1--1----------------------------1-------------1--------1------------------------1--------
 retion system protein N                                                                                                  *                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     * *                                                         **  *    ****************************  * * **** *   *       *                                           *                             **** *************************    ***                                           *****                                            *           *                 * ***** *  *         *  *             ***************  *****                                                                            *                                                *                                           *        *  *                            *             *        *                        *        
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[6210] PF02117            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       14                          
 7TM_GPCR_Sra:Serpentine type   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1-------1----------112--1---------------------11---------------------------------1--1-1--1-----1---1------------111-21-1249312332-1--1--1-----2------------1-------931------------1-2----------
 7TM GPCR chemoreceptor Sra                                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *       *          ***  *                     **                                 *  * *  *     *   *            *** ** ********** *  *  *     *            *       ***            * *          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 of unknown function (DUF1400)                                                                                                                                                                                                                        *******  ****************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                                            **                                           *              *                                                    *                  **         * 
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 DUF910:Bacterial protein of u  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111-1111111111-1111111111--111111111111-11111-1111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nknown function (DUF910)                                                                                                                                                                                                                                                                           ****************** ********** **********  ************ ***** ********************** ***********************************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
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[6214] PF04721            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        4                          
 DUF750:Domain of unknown func  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2121113-1111-121121581-312-1112-111111111-17-1111--111111211-1011------------------------
 tion (DUF750)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ******* **** ********* *** **** ********* ** ****  ********* ****                        
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[6215] PF10177            124                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2371:Uncharacterised conse  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------17334111311-22323-314941336211-211-2131212123133321-2211-1111-11--------------------------
 rved protein (DUF2371)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *********** ***** ************ *** **************** **** **** **                          
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 DUF354:Protein of unknown fun  11--------------1111111----1-2--12211121112-1-1--2232-2111112---4-11 -1----------------------------------------------------------------------------------1------1-1---------------------------------------1------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1---------------111-----------------1-------------1-----------------------------1111-------------1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-----------1------------------------------------------1----------1-----------------1-----1------------1-1-----2--1--------1--------1-------31---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1----------------------------11------------------------------------------------------ -----1--1--------------1-1-----------111111-------11-1--1-----1----------------------1----1---------------------------------1-----------------------------------------------2-------------12--1----1211
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 Paramyx_RNA_pol:Paramyxovirus  ------1----------1-----------------1------2------------------------- ------1-111---1--------------------------1----------------------------------------------1------1--------------------1--------------------------1----1-----22--------11---------------------------------1----------------2--2---------------------------------------------------------------------------------1----------------------------111---------------------1-------1--------------------------------------------------------------21-111------------------------------------------1----------------1------------2----------------------1------------------1---------------------------------1----1-----------1---1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1------------------------------------------------1----------------------------11------------1---------------------------1-------1--1-- ----1------1---1--1------11-----------------11------1--1---------------11---1---1----11--------------2-----1-12---2---111------2--------1------1-------------2-1---11-6-11-1-1------------433-44---1---
  RNA dependent RNA polymerase        *          *                 *      *                                * ***   *                          *                                              *      *                    *                          *    *     **        **                                 *                *  *                                                                                 *                            ***                     *       *                                                              ** ***                                          *                *            *                      *                  *                                 *    *           *   *                                                                                                                                                              *                     *                                                *                            **            *                           *       *  *       *      *   *  *      **                 **      *  *               **   *   *    **              *     * **   *   ***      *        *      *             * *   ** * ** * *            *** **   *   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 nction (DUF3311)                       ****** * *                                           ***         *                                  *  *                 * * * ***               *                                                                                                         * ****************  ***** ****                                                                                                                                                                    * *                            **    *  ** ****  *              *********** *                                      *    ************************ ***  **      *    *                                                                                                                                                                                                    * **     **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
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 Alpha_TIF:Alpha trans-inducin  ----------------------------1--------------------------------------- ---------------------------------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-111---1---------11------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------1------------------------------------1-----2--1--111---------------------------------------------2--1----11132212221352412243311112-112124--1-1213212---1----2---1---------------------------
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[6223] PF10149            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 NAcGluc_Transf:Carbohydrate (  ----------------------------------1--------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------1----1--------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------- --------111-111----------------1-------------------------------------------1--1-------1--1------------------1-3111221--1111121111253-211111-11111111211-11-111111-3311-112-1111-1115--11----1------1--1
 N-acetylglucosamine 6-O) sulf                                    *                                                                                                                                       * *                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                         **                                                                       *    *                                            **                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                * *                                                                      *** ***                *                                           *  *       *  *                  * *******  ************* ****** *********** ** ****** **** *** **** ****  **    *      *  *
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[6224] PF06150            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Vert_HS_TF:Vertebrate heat sh  -------------------------------------------------------------------- -11--------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------1-----------------------------------------1-1---1-----------------------------------------------------161123122112233211433-2232211312241231-4--516222--------4--1--------------1-------------
 ock transcription factor                                                                             **                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                              *                                         * *   *                                                     ********************* **************** *  ******        *  *              *             
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[6229] PF10278            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Med19:Mediator of RNA pol II   -------------------------------------------------------------------- -------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------- ----1--------------1---1-1----------------------------------------------------1------------3------------1--1--4211152212112133111593-224-11211111-11-14-131111122-1121111111111----------3--------1----
 transcription subunit 19                                                                                         *                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                        *                                     *                                                                                                                                                                                                                                                               *                                *              *   * *                                                    *            *            *  *  ********************** *** ******** ** ** ********* *************          *        *    
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[6230] PF09955            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2189:Predicted integral me  -------------------------------------------------------------------- ---------------1111-11--111111111111-----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----1231111222222----------1---2--2--221-211-11221122-11-12121111111--------1----211--------------------------------1----------------------------------------21-1122-1-2--1---11-----------321--------------------------------------------------------------1----1-1-----------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------11111----------------1--------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 mbrane protein (DUF2189)                                                                                           **** **  ************                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *     *************          *   *  *  *** *** ******** ** ***********        *    ***                                *                                        ** **** * *  *   **           ***                                                              *    * *                       * *                                                                                                       *                                                                  *****                *                                                                                                                                                                                                                                                                 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF2721:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------1111-1---------1-1------------------11-11111111--------1---------------112--------------------111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------1---11-------------1----1------------------------1----------1--1-----1--------------------1111--------------------------------11-11----------------------------------11--------1111-1221-1--11----------------1-1---------1111121111121--1-1-----------------------------2-1--22--1111-1111111111111----1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1--------------------------2--------------------------1--------------------------------22--11-----------------------------------------------1-- ----------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1-----------------------------11----------1--------------------------------1-------------
 nction (DUF2721)                                                                                                                                                                            **** *         * *                  ** ********        *               ***                    ***                                                                                                                                                                  *                   *   **             *    *                        *          *  *     *                    ****                                ** **                                  **        **** **** *  **                * *         *************  * *                             * *  **  **** *************    * *                                                                                                      * * *                          *                          *                                **  **                                               *                                                 *                                                               *                             **          *                                *             
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6236] PF10153            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2361:Uncharacterised conse  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------- ------1-----1111-11111111111111-111111111111111112111111111111111111111211111-22111111111111-111111-11111--11--------------1-------------------------------------------------1111-11111-1-12-113----21-
 rved protein (DUF2361)                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                             **                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                *                                         *     **** ************** ********************************************* ************** ****** *****  **              *                                                 **** ***** * ** ***    ** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6237] PF09458            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                                                                                                        3                                                                                        
 H_lectin:H-type lectin domain  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----11---------------------------------------------------------------111-----1111-1--------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ----22-----------------323---------------1----2-3-653-51----------------------------------6--4----------------6-----------------------------------------------------1-----------2----------------------
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[6238] PF05835            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Synaphin:Synaphin protein      -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--1----------1--------------111---------------------------------------------------------1--1----------------12334511--114145-31514-215----41223-2---31-31221511222-1-----1111----------------1-------
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[6239] PF03603            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA_III_psi:DNA polymerase II  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-1111-1111--1------------11111111111111-11-1111111111111-11111111111111-1111111111111-111111111-11111111-111111---------------111111111111111---------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------1-------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 I psi subunit                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *      * **** ****  *            ************** ** ************* ************** ************* ********* ******** ******               ***************                                       **************                                                                                                                             *                         *  *                                                                                                                       
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[6240] PF06486            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1093:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------14544445434345631-44-1345--11--21222221-------------------111-1-22-----11--111-----322---------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[6242] PF05233            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[6243] PF08558            123                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 DUF1985:Domain of unknown fun                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1        
 ction (DUF1985)                -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1--12--7--------
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 erminase subunit                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           * *    **  *    *   *       *      *            *                     *  *                                                *      *   * *   *  **  *                   * ***   * * * * ** **** *****      *  *** *   **  ********  *      * *   *     **               ***       *   * *     **    *   *                        **   * ***    * **   ***                                                                                                                                                                                                                                    *                                   
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 DUF1517:Protein of unknown fu  -------------------------------1------------------------------------ ----------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------1322112111111111112122221-1-1---1-11-11111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --1---------------1-----1---------1-1--------------------1-----------------1-------------------------1--1---2------------------------------------1---------------------61------34214111112314-11221----
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 DUF3343:Protein of unknown fu  -----------------------------------11111111----------1-------------- -------------------------------------------------------------------------------323-11111------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------1----------------------------------------------------------------------43112222222121-1---1111--111-11--21--1-112112-1---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----1-------1-111131------31----------------------1-----------------------------------------------1-------1-1-1--1--11--11-111-11-1---1-11----------------------111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------4-----------------------------1----------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3343)                                                  ********          *                                                                                              *** *****      **                                                                                                                                      **                    *                                                                      ************** *   ****  *** **  **  * ****** *   *                                                                                                                                                                                                      **    *       * ******      **                      *                                               *       * * *  *  **  ** *** ** *   * **                      ***                                                                                                                         *              *                             *                                                                                                                                                                                                                   
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[6252] PF04674            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1112 1        
 Phi_1:Phosphate-induced prote  -------------------------------------------------------------------- --1----------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1-11------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ---------1--99---1-------------------------------------------------------------------------------------131--1-1-----1----------1-----------1-------------1-------1-----------1--1---11--26021-07-------
 in 1 conserved region                                                                                 *                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                * **                                                      *                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                      *  **   *                                                                                     ***  * *     *          *           *             *       *           *  *   **  ***** **       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6253] PF10100            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2338:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------1------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------1-----------------------------------------------------------------1----------1---------1-111111111111111-11-------------11-----1-1---------------------------------------------------------------------1111-------1------------------------------------------------------------------------1--1------------------11111111-----1--------------------------------------------------------------1----------------------------11--------------1----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111---------------------------------------------1111---1-----------------------------1-------------------1--------------------------------------------------------- --------1--------1---------1----1------------------2-1--1----------1------1---------1-1--------11-11---1-1-----------11-1---11-11151-122----1-112111-11--21----------11-----------------------2-----1--
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                              *                        *                                                                      *       *                                                                 *          *         * *************** **             **     * *                                                                     ****       *                                                                        *  *                  ********     *                                                              *                            **              *                                                                      *                                                                                                       ***********                                             ****   *                             *                   *                                                                  *        *         *    *                  * *  *          *      *         * *        ** **   * *           ** *   ** ***** ***    * ****** **  **          **                       *     *  
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[6254] PF05061            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Pox_A11:Poxvirus A11 Protein   -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11--------------11----------1------------------------1------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ ------1-----------1-------1---1--11---------11--11--------1-1--------1-----------111--1---2----------------1-1-1----21----313312-473-52411-21-24--212-4212-11--11------------------------2---11-1------
                                                                                                                                                                                                *                                                                              *                                     *                                                                                                                                * **              **          *                        *                                          *       *                                                                                                                                                                                                *                                                                       *                                                                                                                         *                                                                                           *           *       *   *  **         **  **        * *        *           ***  *   *                * * *    **    ****** *** ***** ** **  *** **** **  **                        *   ** *      
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6255] PF10148            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
 SCHIP-1:Schwannomin-interacti  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-1-1----------------11--------------------------------------------------------------1------------------1474241111111125111031-21511114-11111-1-21-2-2111--1211112121111-------------------1-----
 ng protein 1                                                                                                                                                                                      **                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               * * *                **                                                              *                  ********************** ******** ***** * ** * ****  *************                   *     
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[6256] PF10676            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 gerPA:Spore germination prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------32555554665565555--3343556334----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 in gerPA/gerPF                                                                                                                                                                                                                                                                                     *****************  **********          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
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 DUF3506:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1111111111111111111---11111111111111111211111111---------------------------13-1--------1------3-2211-1--1-------111261-211-1------1-1------1-1-----------------12-221211111412323222-----
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[6259] PF07073            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ROF:Modulator of Rho-dependen  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------11-1----1-1--11111111111111111-1-------------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--------------------------------------------111-1--1-1----------------------1111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 t transcription termination (                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           **                                                             ** *    * *  ***************** *             ***************** **************************************************** ************                                            *** *  * *                      **********                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[6260] PF10155            122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2363:Uncharacterized conse  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-----111----------------------------------------------------1---------------------12--1----------12-1212111112111121111111251-111121111111111111-11112111131111121111211--113----13213-211112112
 rved protein (DUF2363)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ***     ***                                                    *                     **  *          ** ************************* ****************** ***********************  ***    ***** *********
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 -less-like N terminal                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ********************* *** ******** *** *********                                        
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[6263] PF09852            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2079:Predicted membrane pr  ---1---3----------------------------------------------11211--121---- ---13---------------------------------------211--11-1--11-----1----1-1--------------------------------------------------------------------42---1--22122111--32211211----13-21----2-------------1----------1-1------------11-------------------------------1-----11-----------------------------------------1111111111111------------------------------11------------------1-------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------------11------------------------------------------------111----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------11--11-------------------------------------------------- --------------1------------------------------------2------------------1------------------1------------------2----------------------------------------1------------------------------------1---11-------
 otein (DUF2079)                   *   *                                              *****  ***        **                                       ***  ** *  **     *    * *                                                                    **   *  ********  ********    ** **    *             *          * *            **                               *     **                                         *************                              **                  *                                                       *                                                                                                                                                            *   *                  **                                                ***                                                          *                                                                                                                **                                   **  **                                                                 *                                    *                  *                  *                  *                                        *                                    *   **       
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[6264] PF12535            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Nudix_N:Hydrolase of X-linked  --------1111111----------------------------------------------------- ---1---------------------1---------------1---------------------------------111---------------1----------1-1-----------------------------------------------------------1-1-----------------------11111111111111111111-1111------1-------1--------------------11-1111-1121---11-1----1----------1111111111111-------------111---111-----------------1---111-----1--------------------1--------------------1-------------------------------------------------------11111111-11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------1------------------------------11-----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1-------------------------------1111-1------------1--------11-1-1-----------111111111----------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  nucleoside diphosphate N ter          *******                                                         *                     *               *                                 ***               *          * *                                                           * *                       ******************** ****      *       *                    ** **** ****   ** *    *          *************             ***   ***                 *   ***     *                    *                    *                                                       ******** **                                                                                                                    **                     *                              **                                                                 *                                            *                               **** *            *        ** * *           *********                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
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[6265] PF04238            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF420:Protein of unknown fun  ------------------------22222222------------------------------------ 111--------------------------------------------------------------------------------1----------------1111211-1-----------------------------------1-------------------------------------11111---11111111111111111111111111111111211111112211111111111111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------1------------------------------------------------------------------1111----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-- -----------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------
 ction (DUF420)                                         ********                                     ***                                                                                *                ******* *                                   *                                     *****   **************************************************************                                                                                                  *                       *                                                                  ****                *                                                                                                                                   *******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       **                                ****                                                                                                                                          *                           
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[6266] PF11553            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3231:Protein of unknown fu  ------------------------1-----1------------------------------------- ------1----------------------------------------------1------------------------1--------------------------------------------------------------------1---------------------1-----------------------11111111-11112111---111---131--------3-------------------------------------------------------------------------------------------14---------------66-------------4119----2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------- --------1-1--1--2------2-2-------------------------111--------1----------1---------------1--2----------1----1---1---31-1--11-3------------1-1--11---11111411111------1-----------1------------1--------
 nction (DUF3231)                                       *     *                                            *                                              *                        *                                                                    *                     *                       ******** ********   ***   ***        *                                                                                           **               **             ****    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                             * *  *  *      * *                         ***        *          *               *  *          *    *   *   ** *  ** *            * *  **   ***********      *           *            *        
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[6267] PF11850            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3370:Protein of unknown fu  -------------------------------1------------------------------------ ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------4213222--33222222222-223--3-----2-------------1---------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------1--------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-111111----------1----------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1 --------111-------------------------------------1----1----1-1-------------------1--------------1-1------------1------1-------1-5-971-1-3--------------1----1---------------------1---1------1----1--11-
 nction (DUF3370)                                              *                                                                                                                                                                       *              *******  *********** ***  *     *             *                                       *                                                                                                                         *    *        *        **                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                              *** ******          *                                                                            *                                                                       *         ***                                     *    *    * *                   *              * *            *      *       * * *** * *              *    *                     *   *      *    *  ** 
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[6268] PF08011            121                                                  1                                                                                                               1                                   1                                                                                                                                                                                                                                 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
 DUF1703:Protein of unknown fu  -----------------------------------------------6-------------------- ------------------------------------------------------------------------------------3-213218-6----------1---------------------0-----2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-1111121--------1----14------------11---25---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5--------------------------1----------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------2------------------------------44--------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
 nction (DUF1703)                                                              *                                                                                                         * ****** *          *                     *     *                                                                                                                                                                                                  *** *******        *    **            **   **                                                                                                                                                                     *                          *                                  *                                                                                                                                                                                                      *                                                                          *                              **                                                                                                                                                                        *                                        
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[6269] PF09546            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Spore_III_AE:Stage III sporul  ---------------------------------------------------1---------------- ---------------------1-----------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------11111111111111111111111111111111--------11------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111111111111111--1111111111111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1--------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------- 1---1------------11----------------11111-11----------1---------------------------11-------------------1-------2---1---------11--------------------1-----1--------1----------1-----1-----1-------1------
 ation protein AE (spore_III_A                                                     *                                      *                                   *                                                                                                             *                      ********************************        **                                                                                          **************************  *******************                                                                                                   *                           *                                                                    *                                                     **                                                                                                                                          *****                                                                                                                      *                                 *   *            **                ***** **          *                           **                   *       *   *         **                    *     *        *          *     *     *       *      
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[6270] PF04514            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[6271] PF09859            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2086:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -11-1----------1111-1---11111-1------111-1-----1------------------11--------------------------------1---1-1-2------------------------------------1-------------------1------------------------------------------------------1---------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-------211------------------1---1------1-----------------------------------------------------------------------------11-222111111111111-11111111-14111212--111-1---2-1-1------------------1------------------------------1-11---------------------------------------1------------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------------1------11-------------------------------------1-11------------------------------------------------------------------- -------------------1----------------------------------------------------------------------1-----------------8-2--------------------------------------------------1--------2----------------------1-----
 in conserved in bacteria (DUF                                                                        ** *          **** *   ***** *      *** *     *                  **                                *   * * *                                    *                   *                                                      *         *                                                                                                                                                ****       ***                  *   *      *                                                                             ** *************** ******** ********  *** *   * * *                  *                              * **                                       *            *     *                                                                                                             * *                           *      **                                     * **                                                                                       *                                                                      *                 * *                                                  *        *                      *     
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[6272] PF06833            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MdcE:Malonate decarboxylase g  -------------------------------------------------------------------- -1--------1--------------1----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------11--111--12----1-2-1-------------11111111------------------------1111------------------1--------------------------------1-------111111111111111111111111-1----11-12---11-11112-------------------1-1-------------------------------------------------------------------1-----------------------1--------1-11-1------------------------------1111------1----------------------------------------------111--------------------11111-11--1-1111-111--1111111------------------------1111111------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1--------------------------2-----------1----------
 amma subunit (MdcE)                                                                                  *        *              *                                                                      *                                                              *                              *                                                                                                                                                                         *               **  ***  **    * * *             ********                        ****                  *                                *       ************************ *    ** **   ** *****                   * *                                                                   *                       *        * ** *                              ****      *                                              ***                    ***** **  * **** ***  *******                        *******                                                                                                                                                                  *                                                      *                          *           *          
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[6273] PF04842            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1           
 DUF639:Plant protein of unkno  -------------------------------------------------------------------- --1----------------------------------------1------------1----------1-------------------1------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1------------11----11-----------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1---------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1------------1------------1---------------------------------------------------1------------------------------------------ ----------------1---------------------------11--------1---1------1-------1------------1-----1--1--1--2-------112--22111-1-1112-21231-111------1---1---1--211-1------1--2-----1-1------1-17617152-1-----
 wn function (DUF639)                                                                                  *                                        *            *          *                   *                                    *                                                                                                                                                                                                                              *                          *            **    **                                                                                   **                                                                        *                                               *                                       *    *                                                                                                                                                **  *            *            *                                                   *                                                           *                           **        *   *      *       *            *     *  *  *  *       ***  ***** * **** ***** ***      *   *   *  *** *      *  *     * *      * ******** *     
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 Peptidase_M9_N:Peptidase fami  -------------------------------------------------------------------- ----2-------------------------------------------------------------1-11-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-------------------333334231222322------224---1---------2------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111----1111-1----------------1---------------------------------------------11-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1------------------------------------------1111--1----1113--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1111-13-22--------------------1111--------1----------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11131-111-11-----------------------------------------------1----1-------
 ly M9 N-terminal                                                                                        *                                                             * **                               *                                                                       *                   ***************      ***   *         *                                                                                                **********    **** *                *                                             ** *                                                                                                                                              *                                          *                                          ****  *    ****  *                                                                                                               *                                                            **** ** **                    ****        *                                                                                                                                                                         ***** *** **                                               *    *       
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[6275] PF06122            121                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
 TraH:Conjugative relaxosome a  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1---------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------1----------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------9--11---1----------321---------11--2----11---------1-----------1-2-----------------1--------2-2------------------1-1--2----1-11---------1---------------1--2--1--------123---1--2-------------------------11-----1-21-----111-----1-------2------1-----------11---------------------1------------111-----------------------2------------------------------------1------1----11-------------------------------------------------------------------------- ------------11----1-----------1----------------1---------1----------------------------------------------------1------------1--------------------------------------1-1-------1--------------------2---1-
 ccessory transposon protein                                                                                                                                                              *                                     *                                       *                                                                                                                                                                                  ***       *                                                                                        *                                 *  **   *          ***         **  *    **         *           * *                 *        * *                  * *  *    * **         *               *  *  *        ***   *  *                         **     * **     ***     *       *      *           **                     *            ***                       *                                    *      *    **                                                                                       **    *           *                *         *                                                    *            *                                      * *       *                    *   * 
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 Latexin:Latexin                -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------1------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------11-----------------------------11------------------------------------------------------ --------1--------------------------------------------------1---------------------------------------------------12-113222121132222934-34372221112-22221321123311------1---------------------------------
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 clusion domain                                                                                                                                                                                                                                                        *                                               **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ****    *  *                                                                                               * *********************** *************** *****************        *            *           
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 AgrB:Accessory gene regulator  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1---11111111-11111111111111111111----------11----1-----------------------------------------------------4214222223212241331221--2---24-132511111-311--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1------1------1--------------111-----------------------------1---------------1-------------------------1-----------------------------------1----------------------------------------------------------
  B                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *          *   ******** ********************          **    *                                                     **********************  *   ** ********* ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                   *      *      *              ***                             *               *                         *                                   *                                                          
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 DUF842:Eukaryotic protein of   -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------- 11----1-1------------------------------------------1-------------------------------------1--------------------2211-121112-211113-442-113---211141-1121111211--11-111111312-1111-11--111111111-431-11111
 unknown function (DUF842)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                **                                                                           **    * *                                          *                                     *                    **** ****** ****** *** ***   ****** **********  ** ********* **** **  ********* *** *****
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF496:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------1--------------------------1--11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111-11-11111111111111----------------111111111111111---------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------
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 ER:Enhancer of rudimentary     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-111--2---111-----------------------------------------------------------------------11---------------11---314232111111111124-11121-11411-121121111112111111111-11211-22-112211---6---1122-2-12--111--
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 Nebulin:Nebulin repeat         -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------3-21---1-23113115-124-425-11111124111111116-4--3-11---1--1--1---------------------------
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 DUF897:Domain of unknown func  --1----------------------------------------------------------------1 ---------------1111-1---1-111111-----------1------------------------------------------1---------1--------1-----------------------------11121-----3111112--11---1-111--321-1111111111111--11----11----------------1-------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------11-----------------1-------------------------------------1--1-11--1--1-1--------------1-------------------------------1--------------------------------------1----1-11--------------------------1------------------------------------------------------------111------1-1111112-111111--1--------------------------------------------------------1--------------------------------------------1----------------------------------------1--------1----1---------------------------------------------221111-------------------------------------------------- -----------1------------------------------------1---------------------1---------------------------------------------------------------------1------------------------------1---------------------------
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 t of unknown function              *                                      **                           *                                  ***           ***            **                                   * *                    **  *                                 *                                                                **                                                                                                                                                        *****  *   *           *     *  **    ** ********              *             *                                     *********** ************ ********  **** *     ** ****   *            **                  *           *                                                                                                                                                                         *                        ***      * ** **** * *                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                      
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 HXXSHH:Protein of unknown fun  --------111111------------------------------------------------------ --7------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1----------------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-7-----------------11------------------------1--1----------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1------------------1--------50----------------------------------3-----------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1---------1-1----------------------------4------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1-------------1--------------------11---1--1-11----1-------------------------------1---------11------------1--11-------1-----------------------1--------1-2-----1--------1-11------1--1----2--2--
 ction (DUF1552)                        ******                                                         *                                                                                                                                                                  *                                                      *                                  *  *                                                                                                                 * *                 **                        *  *                *                                                                                                        *                          *                  *        **                                  *                             *                                                                                             *         * *                            *                                                                                                                          *             *                    **   *  * **    *                               *         **            *  **       *                       *        * *     *        * **      *  *    *  *  
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[6289] PF02553            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CbiN:Cobalt transport protein  -----------------------1-11-1---1111111--1-1211111121--------------- ------------------------------------------------------------11--1---1-------------------------------------------------------11-1-----1-111-1-------1----------------1-11-----------------------1-------------------------1111---1111111----------------------------------11--------------1------------------------------1-----------1-11111111111111111111-------111111----1111----1-----------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------2------------------1------------------1----2-------------------------------------1----------------------------------------1------------------------------------111-----1111111111111111-------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----
  component CbiN                                       * ** *   *******  * **********                                                                            **  *   *                                                       ** *     * *** *       *                * **                       *                         ****   *******                                  **              *                              *           * ********************       ******    ****    *                                                                                         *                                                                                        *                  *                  *    *                                     *                                        *                                    ***     ****************                         *                                                                                                                                                 **                                                                                                                                                                                                            *    
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 in conserved in bacteria C-te                                                                         *  * ****  *           *      *     *                 *     *  *     **** **  *          *           *                      **** **          *                                                             * *    *                                                                                                              *  *                 *       ** ** *   ***                     *        *                                                                  *                                         * ****       *      ****         *        *   *              * *    * **           * *  *       *                             *          ****   * ** *  *     ***                                                  *                            *** ****                     ***                       * *       *   *                                  *******                                               *                   *          *                                 * *   *                                         *                                                                                   *            *  
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[6292] PF08803            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ydhR:Putative mono-oxygenase   -------------------------------------------------------------------- --1----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--2------------------------11111111-1111-1----1-111----------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------11------11------11111---------------------------------1----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---------------------------------1--------------------------11-------1------------------1---------------------1111111-11-1111111111111111111--------1111-11111111111-11-1111---11111111111-----------------1------------------------1-------------------------------11------11---------------------------------------------------------------------------- -------------1-----------------------------111------------------1--------------------------------------------1------1------------------------------1----------------------1----1-------1---------------
 ydhR                                                                                                  *    *                                                                                                                                                           * *  *                        ******** **** *    * ***                                  *                                                                                                       *                    **      **      *****                                 *                *                                                                                                            *           *                                 *                          **       *                  *                     ******* ** *******************        **** *********** ** ****   ***********                 *                        *                               **      **                                                                                          *                             ***                  *                                            *      *                              *                      *    *       *               
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[6293] PF06866            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1256:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111222-111------12-------------------------------------------------------------------------------------------2142222223223211222222122--2--111121221111222--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1-----1-----------------------------------
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 DUF3411:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--------------1-------------------------------------44430333552831-06-------
 ction (DUF3411)                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *      *              *                                     ************** **       
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[6297] PF06892            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phage_CP76:Phage regulatory p  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1----------1---------1----1------------------------------------------------------------------1--------------11---1---1-----------1-----1-------------1-----------------------233------------------------------------------1----2------1---1--1--1--12-1-----------------------211--212-2-1--1---12----4211-1121---1------2-11111121221-11-----------1-----11-------------------------1----1--------1----------1-------11-1---------111---1-111--2--1------------------------------------------------------------------------ -----------------1--------------------------------1---------------------------1--------------------------------------------------8----------------------------------------------1------------1---------
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[6298] PF12304            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BCLP:Beta-casein like protein  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------273323322232262242692-32312212222-22222211621112--------------------------------1-------
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 Fumarate_red_D:Fumarate reduc  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-------------------------------------------------------------------------111-------1-----------1----1----1----------111111-1111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111------------------111111111111111---------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
 tase subunit D                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                    *    *                                                                         ***       *           *    *    *          ****** ********** **************************************************** ************                  ***************                                       **************                                                                                                                                                                                                                                              *                                   
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[6300] PF09867            120                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2094:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21---------------------------1---1---111-1-1----------111-11-----------1-------------------------------------------11-131111111222111-22221221-2-1-----11-1--1---2---------------------11-------------------1--1-----------------------------------------1-----------1--------------------------1----2-----------------------------------------111-11-1111111------------------------1-----------11----------------1111111---1-1111-1-11-111--11-------------1------1-11--1-2--222---------------------------------------------------------------- ---------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        **                           *   *   *** * *          *** **           *                                           ** *************** ******** * *     ** *  *   *                     **                   *  *                                         *           *                          *    *                                         *** ** *******                        *           **                *******   * **** * ** ***  **             *      * **  * *  ***                                                                                      *                                                                                                                                                                              *  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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