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Ranking of RP:PFM:REP : from 9201 to 9300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[9202] PF01114             38                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Colipase:Colipase, N-terminal  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------111-11-11-11121-111-11-12111-11111--1111-111--------------------------------------
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 EABR:TSG101 and ALIX binding   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------121---11--1-112-13-151--11-111111211111-1------------------------------------------------
 domain of CEP55                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ***   **  * *** ** ***  ** ************ *                                                
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[9207] PF03511             38                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Fanconi_A:Fanconi anaemia gro  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------211--111111--151-111-11-1111--111121-1-2-11----------------------------------------
 up A protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***  ******  *** *** ** ****  ****** * * **                                        
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[9208] PF01684             38                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        3                          
 ET:ET module                   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------8--------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                          
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[9209] PF12552             38                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1           
 DUF3741:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3808-72-------
 nction (DUF3741)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **** **       
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[9210] PF09518             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RE_HindIII:HindIII restrictio  --1----------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------121-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1------------------------------------------------------------111----------------------- -11---1--------------11------1--------------------1------1--------------------------1------------------------2-------------------------------------------1--1-1-----1--1-----1-----------2---1-----1---
 n endonuclease                   *                                                                                                                                                            *                                                                             *                                                                                   *                             ***                                                                                                                                                                                                                       ***                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                              *                                                            ***                         **   *              **      *                    *      *                          *                        *                                           *  * *     *  *     *           *   *     *   
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 II (PA-IIL)                          *                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                            ******               *          *                  *                                                                                                 *                                                            **                                                                                    ****                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                    
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[9213] PF08394             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Arc_trans_TRASH:Archaeal TRAS  ------112221111--211111111111111------------------1----1--111111---1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 H domain                             *********  ***************                  *    *  ******   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
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[9214] PF12139             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 APS-reductase_C:Adenosine-5'-  -----------------1111--1-------------------------------------------- --------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------11--1--1-----------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11--------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------2-------------------1111111111111-----------------1---------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 phosphosulfate reductase beta                   ****  *                                                                             *                                                                                            **  *  *                                                                             **                                                                                                                                              *  **              *                                                                                                                       *                                                         *                   *************                 *                                                               *                                                                                                          *                                                                                  **                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[9215] PF09711             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cas_Csn2:CRISPR-associated pr  --------------------11---------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1--1-------11111---11-----------1-11-111111-1-----1-------1--1--------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1----------------------------------------- --------------------------------------------------------2------------------------------------------------------1--------------------------------------1--------1--1------------------------------------
 otein (Cas_Csn2)                                   **                                                                                                                                       **                                                                                                                                      *                                          *  *       *****   **           * ** ****** *     *       *  *                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                        *                                                         *                                                                                                  *                                                      *                                      *        *  *                                    
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[9216] PF11994             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3489:Protein of unknown fu  ------------------------1------1------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---323--------------------------------------------1-------11---------------21--------------------------------11-----------------------------1--------13----1-------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------------------------------------------------1---------------7--------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3489)                                       *      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *   ***                                            *       **               **                                **                             *        **    *       *                                                                                                                                                                                                                          * *                                                                      *               *                                                                                                                                                                                                                                                                 
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[9217] PF09888             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2115:Uncharacterized prote  --------------------------------2121111212124232-1---1-------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1-----------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------21-----------------------------------
 in conserved in archaea (DUF2                                  **************** *   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                             *                               *                                              **                                   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9218] PF08870             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1832:Domain of unknown fun  -------------------------------------------11----------------------- 1-------------1----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------11-111--------------1111------------------------------1----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1-------------------1---------------------------------------1------1---------------1-----------------1----1---------------1-----1----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------11----- -----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------
 ction (DUF1832)                                                           **                        *             *                                                    *                                                                              ** ***              ****                              *                      *                                                                                                                *                                                                                *                           *                                                          *                                                                  *                   *                                       *      *               *                 *    *               *     *                                                                      *                                   *                      *                                                                              **                                         *                                                                                             **                                                                    
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[9219] PF01358             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PARP_regulatory:Poly A polyme  -------------------------------------------1------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1------------------1111----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1-----1-432-------------1---------------------11------11-----------------------------------1-1-----1-------3-3-------------------------------------------1------------------------------------1--------
 rase regulatory subunit                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                 *                                                                                  *                  ****    *                                                                                                                                                                                                                                                                   *     * ***             *                     **      **                                   * *     *       * *                                           *                                    *        
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[9220] PF11449             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2899:Protein of unknown fu  ---------------------------------------------------1---------------- --------------------------------------1-----------------------------------------1--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------1-------------------1------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------11111111111111--------------------------------1----------------------------------------- --------------------------------------1--------------------------------------------------------1------------2-11----------------------------------------------------------------------------------11-1-
 nction (DUF2899)                                                                  *                                                       *                                         *                          *                                                                                                                                                                                                                                      *            *                                                                                                               *                                                                                    *                       *                   *                                          *  *                                                                                                                                   *                                                        **************                                *                                                                                *                                                        *            * **                                                                                  ** * 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Adeno_E1B_55K:Adenovirus EB1   ----------------------------------------------------------------1--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1-------------------------------------------211-----------------------------------------1-------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1-----------------------11------------1--------------1-------------------------1---1-------------------------12-----3-----------221----1-1111-
 55K protein / large t-antigen                                                                  *                                                                                                             *                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                       **                                                                                           *                                                                                                                 *                                                         *                                           ***                                         *                                                                                                                  *                       **            *              *                         *   *                         **     *           ***    * **** 
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[9222] PF03718             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Glyco_hydro_49:Glycosyl hydro  -------------------------------------------------------------------- --1-------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1----1-------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------1--1----1----1--------------------------1-12211-----------------------------------------1---2------2--1-1---------------------------------------1--------1-4-------------------------1--1-----
 lase family 49                                                                                        *             *                                                                                                                                                                                                               *      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                    *    *                               **                                                                                                                                             *                                                                                                                                                 *  *    *    *                          * *****                                         *   *      *  * *                                       *        * *                         *  *     
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[9223] PF08990             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Docking:Erythronolide synthas  -------------------------------------------------------------------- ----1---------------------------------11-2-3----------------24--6-3617----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 e docking                                                                                               *                                 ** * *                **  * ****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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[9224] PF12120             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RNApol_Rpb2_rif:DNA/RNA tunne  -------------------------------------------------------------------- --------221---1------1--11-----11111---1------------1-1-------------1------------------------------------1--1--------------------------------------------------------1----------------------------------------------1---------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1---------------------1-------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------1 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 l of bacterial DNA dependent                                                                                ***   *      *  **     *****   *            * *             *                                    *  *                                                        *                                              *         *                                                                                                     *                               *                     *             *                                                                                                                ****                                                                                      *                                                                                                                                                                                                    *                                                **                                                                       *                                                                                                                                                                                                        
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[9225] PF03497             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Anthrax_toxA:Anthrax toxin LF  -------------------------------------------------------------------- --------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11----1--------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1----11--------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------111----------------------------1-------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------111111-111---2------------------------------------------11-1---1------------------------------1---------------------------------------------------------------------------- -------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------1------------------1
  subunit                                                                                                          *                                                                                                                                                                                   * **    *                                                  *                                                                                                *    **                                                                          *                                                                    ***                            *                                           *                                                                                                    *                                                                   ****** ***   *                                          ** *   *                              *                                                                                          *                                                                                                                                                 **                  *                  *
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[9226] PF11487             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RestrictionSfiI:Type II restr  -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-----11111--------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1-----------------------1------------------------------------------------------------1-11---1-----------------------------11111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- ----------------------------------------------1----1---1-1---------------1-----------------1-------1-----1------------------------------------------------------------1-------------------------------1
 iction enzyme SfiI                                                                                                   ** *     *****                                                                                                        *   *                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                *      *                                                 *                                                                        *                                                                   *                       *                                                            * **   *                             *****                                                                                                                                                   *                                                  *    *   * *               *                 *       *     *                                                            *                               *
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 Herpes_U5:Herpesvirus U5-like  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------------------11-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ----------1------1---1---------------1111--------111-1-----111--------------------------------1-------------1------1-----1-----1---------1-----------------------------------------1-------------------
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 DUF3541:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2----211111-1-11-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111211-11111-------------------------------------------------------------------------- --------11----1----------------------------------1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1------------------------1--------
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[9229] PF11877             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3397:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1----1-1-1111-1--------------------1--------1111-----1--------------1--11111111111------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------1-------------------1------------------------1--------------------------------------------1-1-------1---1-----------------------
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[9230] PF05098             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 LEF-4:Late expression factor   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1--------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------ --1---1----------------------------------------------------------------1---------------------------------1----1-------------1---1452-212---1-------------2------------1--------------------------------
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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 VRP3:Salmonella virulence-ass  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1--1-----1-1--1-1111--1-------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------1---------------------1-------------------------------------1--------1----------341-11---1-2----1-1---111---------------------------------------------
 ociated 28kDa protein                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                *                                                                                                       *                                         *  *     * *  * ****  *                                                                         *                                                                                                                                                      *                     *                                     *        *          *** **   * *    * *   ***                                             
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 DUF2584:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1-11---------------------------------------11111111111111111--1111111111----111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF2584)                                                                                                                                                                                                                               *        * **                                       *****************  **********    ******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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 Tir_receptor_C:Translocated i  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1--11--------1----1----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------2-----1----------------------------------1----------------------1----------------------1-----------1-2------1---1--------1-------------------11--1--1--1-1--1---1-----------11-1------1--
 ntimin receptor (Tir) C-termi                                                                                                                                                                                                                   ***                       **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                             *  **        *    *    *                                                                                                          *                                                                                                                          *     *                                  *                      *                      *           * *      *   *        *                   **  *  *  * *  *   *           ** *      *  
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[9234] PF11691             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3288:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3288)                                                                                                                                                                                                                                     *************************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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[9235] PF11352             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3155:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111-111111111--121111111111111111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3155)                                                                                                                                                                                                                                     ******* *********  ******************                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                      
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[9236] PF10843             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2578:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------1-----------11111112211122122111111------------------------------2----------------------------------------------------1-1-------------------11------
 nction (DUF2578)                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *           ***********************                              *                                                    * *                   **      
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[9237] PF05480             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Staph_haemo:Staphylococcus ha  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2122-2222-2224453--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 emolytic protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               **** **** *******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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[9238] PF08306             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Glyco_hydro_98M:Glycosyl hydr  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11112111111-------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-1--111------------------------------------------1--------------------- -----------------1-------------------------111--------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------12---------3------------1----------1-1--
 olase family 98                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ***********                                           *                                                                                                                                                                                                    *                                                                                             *                                                                                                                                                                     *                                           * *  ***                                          *                                       *                         ***                                                                                                  *     *        **         *            *          * *  
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[9239] PF00845             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 Gemini_BL1:Geminivirus BL1 mo  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------1---------------------------1---------1-1-1-------------------------------12--1-------1---------------1------------1071---------------------1-----------------------11-------11-1---------
 vement protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                           *         * * *                               **  *       *               *            ****                     *                       **       ** *         
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[9240] PF08493             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AflR:Aflatoxin regulatory pro  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1------1-3-413-312-------111----1-------11-1-11-1---------------------------------------1-----1-----------------------1-------------------------------------1------------------------1---------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[9241] PF08898             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1843:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------3333----3233-2-----------3----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------33------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ction (DUF1843)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *      ****    **** *           *                                                                                                                                                                                                                                                                            **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
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[9242] PF12201             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 bcl-2I13:Theoretical model of  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1----1111121161-111-111121---111-11---1-----------------------------------1-------
  a pro-apoptotic protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                     *                                                                                  *    ********** *** ******   *** **   *                                   *       
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[9243] PF08692             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Pet20:Mitochondrial protein P  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------1------------------------1---------1332-32-1-332333------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 et20                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                        *         **** ** * ******      **                                                                                                              
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 PyrBI_leader:PyrBI operon lea  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------111111---1--111-111111111-111-----------11--1---11111--11111-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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[9246] PF07671             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
 DUF1601:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------55854------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1601)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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[9247] PF09236             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AHSP:Alpha-haemoglobin stabil  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------111--111-1-11121-111111111-1-1111111111-------------1------------------------------
 ising protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           **      *                                                                                                           ***  *** * ***** ********* * **********             *                              
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[9248] PF05497             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Destabilase:Destabilase        -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------8--------------------1-------------------------------2-22522126------------2-----2-------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                    *                               * ********            *     *       
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 Tcell_CD4_Cterm:T cell CD4 re  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-11-11-1-221--12--1-2-112-1---1--3---------------------------------------------
 ceptor C terminal region                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     * * ** ** * ***  **  * * *** *   *  *                                             
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[9250] PF12023             37                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 DUF3511:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4743-81-------
 ction (DUF3511)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  **** **       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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 DUF3049:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------755-73-------
 nction (DUF3049)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *** **       
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 PIN_2:Predicted nucleotide-bi  22--------------------------1-2-----------------------1--1311------- 1-------------------------------------------------1-------------------------------------------------------2---------------------------------------21---1-------------3-----------------------------------------------------------------------------------------------------11--------1----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------2-------------------------------------------------1---1------------------------------------
 nding protein, containing PIN  **                          * *                       *  ****        *                                                 *                                                       *                                       **   *             *                                                                                                     **        *                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                       *                                                 *   *                                    
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[9253] PF09970             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2204:Conserved Archaeal pr  1111111111111111-211111--------------------------------1------------ ----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---1--------------------1------------------1------1-1---------1-------------------------------1-----------------------------------1--------------------------------------------------------------------
 otein (DUF2204)                **************** ******                                *                                                                                                                       *                                                              *                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                    *                  *      * *         *                               *                                   *                                                                    
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[9254] PF06405             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RCC_reductase:Red chlorophyll  ----1-------------------------------------------------------1------- -----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------112-------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------1-----------------------111------------------11--------------------------1---21------------2-------------------------------------------------------------------1-------212-4-11---11--
  catabolite reductase (RCC re      *                                                       *                                                             *                                                                                                                ***                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                       ***                  **                          *   **            *                                                                   *       *** * **   **  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9255] PF11778             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SID:Septation initiation       ---------------------11--------------------------------------------- -------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---1-----------------------------1-----------------------------111211-2-11122122111111111------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
                                                     **                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                             *                             ****** * *****************                                                                                                *             
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[9256] PF09403             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 FadA:Adhesion protein FadA     -------------------------------1-------------------1---------------- -------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1111---------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------53----------------------------------------------------------------------------11111111-----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----1--------------1-------------------------------1-----1------1---------------2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                               *                   *                                                                                    *                                           ****                                 *                                                                                                       *                                                                                                                     **                                                                            ********                                               *                                                                                                                                                    *                                                                                                                      *                                        *                                                                                                           *              *                               *     *      *               *                                                                                                                      
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[9257] PF04206             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MtrE:Tetrahydromethanopterin   --------------------------------1111111111111111111111-------------- ------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1----------------1------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--1----------------------------
 S-methyltransferase, subunit                                   **********************                                                                                 *                                                                                                *                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                      *          *                *            *                                                                                                                                                                                                                                                ****                                                                                                                                                                                                                                                                                     * *  *                            
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 Hanta_G1:Hantavirus glycoprot  -----------------------------------1-------------1------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------11-111-1111------------------111--------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------1------------------------------------1-------------1----------------1----------1--------------1-1----1-------------------------1--11-----------------1--1----------2----------
 ein G1                                                            *             *                                                                                                                      *                                                                                                                 *                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                *                                                    *                                                *                                                                                        ** *** ****                  ***        *                                                                                                                                                            *                                    *             *                *          *              * *    *                         *  **                 *  *          *          
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 AnfO_nitrog:Iron only nitroge  -------------------------------------------21-----22---------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------------------1--------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------11----------------11---------------------------------11--1------------------------------1----------------1------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------11---------1----------------------------------------------------------------------------1111-----------1------------------------------------------------1----------------------------1---------
 nase protein AnfO (AnfO_nitro                                             **     **                                                                                                                         *   *                        *        *                                                                                                                                                                                       *            **                **                                 **  *                              *                *                  *                                                                                                                                       *                                                                          *                                                                                                                           *                                                                                                                             **         *                                                                            ****           *                                                *                            *         
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[9260] PF08759             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1792:Domain of unknown fun  ---------------------------------------------1---------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------1-2--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------3----------1--11111----1--1--1-111-1--------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------11-------------------------------1------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1----------- ----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[9261] PF01673             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Herpes_env:Herpesvirus putati  ----------------------------------------------1--------------------- -----------------------------------------1-------21--1--------1--1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-2------------1----------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------- -----------------11-------------------------------------1------------------------------------1-----------------------1----1-1-----1-1----------------------------------------1-------1----12-1---1-----
 ve major envelope glycoprotei                                                *                                                               *       **  *        *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                    * *            *                                                                            *                                        *                                                                                                                                                                                                                             ****                                    *                                                                                            **                                     *                                    *                       *    * *     * *                                        *       *    ** *   *     
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9262] PF07011             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1313:Protein of unknown fu  ------------------------------------------------------------1------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1--6---111357-52-------
 nction (DUF1313)                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                       *                                                                      *  *   ****** **       
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[9263] PF04896             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AmoC:Ammonia monooxygenase/me  ------------------------------------------------------------------21 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1--------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------335-----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---------------------------------------------------------------------------------------------3----------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------4--- ----------------------------------------------------1-------------------------------------1----------------------11-----------1--------------------1-----------------------------------------1-1-------
 thane monooxygenase, subunit                                                                     **                                                                                                                                                                          *                    *                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ***                                                                                               *           *                                                                                             *                                                                      **                                                                      *                                                        *                                     *                      **           *                    *                                         * *       
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 Cyc-maltodext_N:Cyclomaltodex  -------------------------------------------------------------------- 11--------------------------------------------------------------------------------------1111-3-----111111--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-1111111-111-11-1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 trinase, N-terminal                                                                                 **                                                                                      **** *     ******  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                      *     * ******* *** ** *  *                                                                                                                                            *                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                        
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 YqhR:Conserved membrane prote  -------------------------------------------------------------------- --1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111111111111111111-1---------1---------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1--------------------------------------
 in YqhR                                                                                               *                                                                                                                                                                                            ***************************** *         *                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                    *                                                  *                                      
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[9266] PF06284             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cytomega_UL84:Cytomegalovirus  -------------------------------------------------------------------- ----------------1----------------------------------------------------1--------------------1--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------1-------------11--2----------------------------------1------2-----1----1-----1---21---2---1----------------------2----------1---1----3-------------------11--1--------
  UL84 protein                                                                                                       *                                                    *                    *                                                              *                                                                                                                                                                                                         **                                                                                                   *                                               *                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                               *             **  *                                  *      *     *    *     *   **   *   *                      *          *   *    *                   **  *        
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9267] PF06438             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HasA:Heme-binding protein A (  -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-----11111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1---------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------411111111111---------------------------------------------111111-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------
 HasA)                                                                                                                ** *     *****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                        *                           *                                                                                                                **                             ************                                             ****** *                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *          
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[9268] PF03035             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RNA_capsid:Calicivirus putati  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------21------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------1------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1----1--1---------1---------------1-----------1----------------1------------1-------1----1------------------------11--------------------1-111-----1-------1---11--------111--------2-----1-----------1-
 ve RNA polymerase/capsid prot                                                                                                             **                                                **                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **      *                                                                                                       *    *  *         *               *           *                *            *       *    *                        **                    * ***     *       *   **        ***        *     *           * 
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[9269] PF05785             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CNF1:Rho-activating domain of  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------1-----1-----------------------------------------------------------------------------------------------1--------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1---------------------1----------1-----1--------------------------------------------------------------------------11111----------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1-----------------------------1----------------------------1----------1----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------- --------1---------------1-----------------------------11------------------------------------------------1----1--------------------2-------1-------------------3---------------1-----------------1------
  cytotoxic necrotizing factor                                                                                                                  *     *                                                                                               *        **                                                                                                                                                                                                                           *         *                     *          *     *                                                                          *****                                        *                                                                                                *                                          *                             *                            *          *                                                                                  *                                                                                      *               *                             **                                                *    *                    *       *                   *               *                 *      
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[9270] PF08405             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Calici_PP_N:Viral polyprotein  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------1-----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----2-------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------1----1---------------------------------------1------------------------------2-----------------2--21321--------------1------------------1-----1-11----------------------------------------
  N-terminal                                                                                                                                          *                 *                                                                                               *    *                               *                                                                                 *                                                        **                                                                                     *                                                                                                      **                                                                 *                                                                                                                 *                                                                                             *                                                                                                                             *    *                                       *                              *                 *  *****              *                  *     * **                                        
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 CgtA:Beta-1,4-N-acetylgalacto  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------1-------------------2-----11---1-----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------111---1------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------2-211-1-11-11-1-------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1------------------------------3-------------------------------------------------------- --------------------------1--------1-------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------
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 Phage_Gp15:Bacteriophage Gp15  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11------------------------------------------------------1---------1-1---11111-11-1-1---------------------11---2-----1--------1-----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------1-------------111-------------------------------------1----------------1---1--------------------------------------------------------------------------------------1-----------------
  protein                                                                                                                                                                           **                                                                                                                                               *  **                                                      *         * *   ***** ** * *                     **   *     *        *                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *             ***                                     *                *   *                                                                                      *                 
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 GRDA:Glycine reductase comple  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1111222----1----------41-----------11-----2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1---------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------1----------------------------------------- -------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------1-----------1-----------------------------------------------------------
 x selenoprotein A                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                 **  *******    *          **           **     *                                                                                                                                                                                                       *        *                     *                                                                                                           *                                                                                                                         *                                          *                                                                         *                      *                                                                        *           *                                                           
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[9274] PF04162             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Gyro_capsid:Gyrovirus capsid   -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1- --------------1-------11-1-11----------------------------21-11-1------------------------------1----------------12-1--------1--------------------11--------------1------32----------------1---1-1-------
 protein (VP1)                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                     *                     *                                                                        *                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                       *                *       ** * **                            ** ** *                              *                ** *        *                    **              *      **                *   * *       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9275] PF09517             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RE_Eco29kI:Eco29kI restrictio  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----11-----1--------------------------------------1-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1--11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------1-------------------------------1-------------------------------------1----1----3------22--1-1-11-11---1-1--------------------------1------------------1
 n endonuclease                                                                                                                                                                                                                          *     **     *                                      *     *                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                        *                    *                         **                                                                                                  *                                                                                       *  **                                                                                                                                                                                                                     *                               *                                     *    *    *      **  * * ** **   * *                          *                  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9276] PF12291             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3623:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11122-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1-11---11111------------11111-11---------------------11-11111----------------11--------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3623)                                                                                                                                                                                                                         * *****                                                                                                                                                                                                                         *                           * **   *****            ***** **                     ** *****                **                                                                                      *                                             *                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[9277] PF11109             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RFamide_26RFa:Orexigenic neur  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----1----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1----111---1-22-11131-111----21113--1--1111----1----------------------------------------
 opeptide Qrfp/P518                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                      *                                                                                   *    ***   * ** ***** ***    *****  *  ****    *                                        
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 DUF3285:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111-111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF3285)                                                                                                                                                                                                                                     ********* ***************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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 DUF2011:Fungal protein of unk  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------1-----------------------------12--1------11111111111111-1111111221111----------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------
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[9280] PF11552             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF1533:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------1222212222222------------------------------22-------------1--4-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nction (DUF1533)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ** *              *************                              **             *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[9282] PF12614             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RRF_GI:Ribosome recycling fac  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-----111111111111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111-------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------1--------------------1--------------1------------------------------1----------------------------------------------------------
 tor                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                          *    *     ******************                                                                                                                                                                           ***********                                                                                                                                                    *                    *              *                              *                                                          
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[9283] PF03967             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PRCH:Photosynthetic reaction   -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11---11111------------11111-11---------------------11-11111----------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1----------------------------------------1------------------------------------------1-------------------------------1---1--12------------1-----------------------1-------------------------1-----
 centre, H-chain N-terminal re                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        * **   *****            ***** **                     ** *****                **                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                        *                                          *                               *   *  **            *                       *                         *     
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[9284] PF11666             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2933:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1----------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------1---1---22--1-2113-1----1----------------1-1----------------------------------------------------------------1----1--------1-------1----------------1-----------------1-----------------1-1----------------------------------------------1--------------------------------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------
 nction (DUF2933)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                              *          *     *                                                                                           *   *   **  * **** *    *                * *                                                                *    *        *       *                *                 *                 * *                                              *                                                  ****                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                        
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[9285] PF09961             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2195:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111----------------------------1--------------------------1------------------------------------11-1-------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111-1-------------------------------------1-----------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------11-------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------------
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ***********                            *                          *                                    ** *                                     **                                                                                                                                                                                  *  ******* *                                     *                             ****                                                                                                                                                 **                                                                         *                                                                                          
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[9286] PF03519             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Invas_SpaK:Invasion protein B  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----1111-1------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-------------------------------------11111111111111111--111--12-1-------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  family                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ***     **** *                              *                                                                                                                        * *                                     *****************  ***  ** *             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
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[9287] PF05155             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phage_X:Phage X family         -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1----------1-----------------------------------------------------------------2-4----------------------------------------1-----------------------------------------------------------1----------------------------------2---1----4--14----------------------1---------------232-3--1------1--------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 CRT-like:CRT-like              -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -11131--1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-2-----------------------------------------------------------------21-------1-241-211-3223-
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *****  *                                                                                                  * *                                                                 **       * *** *** **** 
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[9289] PF05253             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 zf-U11-48K:U11-48K-like CHHC   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-----1---2--------------------------------------------------------1--------1------------------------------12---2-----1211------------------1------112111-------1-1-21----1-1-------1-11---1-1-----
 zinc finger                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *     *   *                                                        *        *                              **   *     ****                  *      ******       * * **    * *       * **   * *     
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9290] PF08574             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1762:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------1--1---1111111111111---1111111111-----------------------1-11-1-1--------1------1----------11----1-----------------------------------------------------------1-----------------------------
 nction (DUF1762)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *  *   *************   **********                       * ** * *        *      *          **    *                                                           *                             
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 tage-gated channel                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ***** *      *  ***** *** *  * *   **  *  **  *                                         
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 STAT2_C:Signal transducer and  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111---21111151-112111111112-11-11-1----------------------------------------------
  activator of transcription 2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ****   ******** ************ ** ** *                                              
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[9295] PF08999             36                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 SP_C-Propep:Surfactant protei  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1-1111-11301-11111--11-1--11--1-11---------------------------------------------
 n C, N terminal propeptide                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ** * **** ***** *****  ** *  **  * **                                             
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[9296] PF09891             35                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2118:Uncharacterized prote  111111-----------------------------11-11111----1-----11111111------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1---------------------1---1-------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1----------------------
 in conserved in archaea (DUF2  ******                             ** *****    *     ********                                                                                                                 *                                                                                                                                                                      *                                                                 *                                                                                *                                                                                                                                                      *                                         *                     *   *                   *                                                                                                                                           *         *                                                                                                                                                                                                    *                                                                                      *                      
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[9297] PF11520             35                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cren7:Chromatin protein Cren7  1112132222222221-111111--------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 Vmethyltransf_C:Viral methylt  -----------------------1-------------------------------------------- --------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1---1---11---1---1---------------------1------1---1---1-------------1--------1111---------1---1-------------1---------------1------------------1--------------------------------112-------------1--
 ransferase C-terminal                                 *                                                                             *                                                                                               *                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ******                                                                                                                              *   *   **   *   *                     *      *   *   *             *        ****         *   *             *               *                  *                                ***             *  
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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