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Ranking of HM:PFM:REP : from 1201 to 1300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[1202] PF00616           1579                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                121                                                                                                111 2 111112211111111331216 2 213 11111111 1111111211111 11     2  1 111                        
 RasGAP:GTPase-activator prote  --------111111------------------------11111------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------1----11---1-----------11----------------1---------------------1----------------1-------2----1-----1-------1-----------------1-----1---------------------1-1--1-----------------------------------1----------------------1111111111111-------------1-1-1-1-1----------------------------1-------------------------------1-------------------1----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1-------1--------------1------------------------------------1--------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------22--11--------------------1------------------------------------------1---------------------------------------------------1----- --11601-1--174833422343434433443333444444333337554544743454554442433234142345-453333442423543544354436413820-156853096637544312536-05661932195575867207446634148439867827967700-1--------1-1331-1-6544-
 in for Ras-like GTPase                 ******                        *****                                                                                                             *    **   *           **                *                     *                *       *    *     *       *                 *     *                     * *  *                                   *                      *************             * * * * *                            *                               *                   *                                                                            *                                                              *       *              *                                    *              **                                                                                                                                     * *                     **  **                    *                                          *                                                   *        ***** *  ****************************************************************** ****************************** ********************* ******************************************** *        * **** * **** 
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 DeoC:DeoC/LacD family aldolas  2221211-11111111311111123334223321222222222233334244311112222-111-22 2251222111111112211-1311131111112222111221321211111-113112--1132211113--------1111122222335313111--111212-13-11111111111111111112111221222331112-12211111111111122211222211111111111111111111221122222222134222311221122211122112222231113333333333333322221311-46111-2-111341-1--1121223432333322222222222333333333333333421-4334122141211111111211111111123111121112121111111211-22-3-----------1-11---1-------------2-11-11-13131-5332222563331----2123223131111111111---1-231111111111---------------1111--11-1-2211-1122--1-11--221112-13-2233------1-1--1-1-25------11--------------33-32233143111--21----2-222222-2--------------------1--1111211---11-111111111111111111111--1-1--------33111314443433344-4445433454444344553445433334334334334444444433344431-344444434444----111112222--13-1111211112-2332--------1-------11-111111-112111111111-11111111111112----------------31111111--------211----2-1121121111121111111131111512122-1 1211--2-4111---112-12222232121111111122231111111-2-11---1--111------------------------1----11111-1---12111-1-1213311-112211-111115-2-3231211112111112211121211211212211111-1112----------2---2-111141-2
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 eins L2, C-terminal domain     ******************************************************************** ******************* *************************************************************************************************************** ****************************************************************************************************************** *************************************** ****************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************* ********************************************************************************************************************************** * ******************************************************************
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 RimK:RimK-like ATP-grasp doma  1113114345444444-454454141132243---223444441112222212-121-1--2--1-22 --222--1-------22----2--12------2222------122--2-11-----1---31--1-2--21----1------------111--2------14411-31--------1-------2-2--1---1222232---83-264545-3--1---1-42228873------------51111---2--------2--111-1118111--11----724111111----------------------------------1----1--------111----211------------------------111---11111121322222224244-22-333232--1----111--2-3--2221--11-2------1--11121-2-23-11----------2-11211211311-1-------2-11-11241------21-------------1112-----------3---------1--------1-1--23232--------------2--------12222-311-432223213232121111-2-----1-453213-532411--23----2------1-445424-31--------1--1----1--1--2222431345343145544545254533422322---3224------2111-1-1111111111-111112311111111111211111---1111221112211112111111111----------------211111464423454222122111111221------1---42666655545645445562222122123222533333223551121111111-111--1-442211-----------------------2------2----------------1-5 --111-1-5--111111111211211111122221211111112111111111111111111111111-11111-11-112111111111-112111111121213125535234464544445383922-5387053556255454242756164335133211-151133412224181111122141212122114
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[1214] PF08501           1574                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Shikimate_dh_N:Shikimate dehy  11-1--1111111112-111111111111111111111111111111111111111-111-1111-11 1131112333311111111-1211131111112222144512242111111233411211211111221111111111111111111212111111-11111112111111111111111111111111111111111111111122211111111111111111111111111111111112221111-113111111111111111111121111111111133333311111111111111111111111--1221--1-44--2-11-11-1211111111111111111111112222222222222111111111111111111222122312331111111-11121111111111111111-11112211111111318431111111133333333332-11211612311-3332314424222311111211111121111111112221111--1--------------------------1121111111153333432222335422221223312111122251111264141111111111111111111111112211111111111-111111121111113111111111111111111111121112111221111111211111111111111111111-1111111111121212122222222222-2222322232222222223554111113131333333323213112222221-22222221222211111111111111112311112212222211221111111115122223333154541333222222222111111111111111111111111121111111111111--------1-1---------------------------1--1-1111211 -----11-----11133543774778711211111122222221112333766733434444112111-21111211-111-2111111-2231111112333122-11-----1----1-------------------------------1------1131------1---1--11113111221237413-111111
 drogenase substrate binding d  ** *  ********** *************************************** *** **** ** ******************* **************************************************************************** ******************************************************************************************** ***************************************************************  ****  * **  * ** ** ************************************************************************* ******************** ************************************** *********** *******************************************  *                          ******************************************************************************************* *************************************************************************** **************************** **************************************************** **************************************************************************************************************************        * *                           *  * *******      **     ******************************************************** ******** *** ******* **************** **     *    *                               *      ****      *   *  ***************** ******
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 Secretin:Bacterial type II an  ------------1-----------1------------------------------------------- 646--------------------------------------------------------------------------------2331111----------11---1-2122222222222222211----131------------111111211111--11111141121-1--1-11--1-11111112------------------------1-1-------111111--------------------------11---------11---------1111----------1-------------------1------------1--1-----------------1----1---------3--------112282225-----2255521112112----------2-123253113521211121512222-124311-1111111--------222111-1-------------------------1-1111342-4544495557956774557509914957554672287864523436745324586641111111132353544332321-3333315345333633333324316111111121-11-----11142222472364344324435333433334344355--13333------21252152442243333-4223244222433322332222554424333223343333333212221123-756456536754--721-1-13333236222221223111211122222212142338887655854446357611111111133767344447766644446444332222-13-111111--------1----1------1---------------1123232343-32- ----------------1-----1------2111-----------1--2--------------1------------1------11--------1----------------1--1--------------213-1-221---1--11-11----------12----363------11---1--1-1--1-1311---2--11
 d III secretion system protei              *           *                                            ***                                                                                *******          **   * *******************    ***            ************  *********** *  * **  * ********                        * *       ******                          **         **         ****          *                   *            *  *                 *    *         *        *********     *************          * ************************ ****** *******        ****** *                         * ******* ******************************************************************************* ********************************** **     **************************************  *****      ***************** **************************************************** ************  *** * ******************************************************************************************** ** ******        *    *      *               ********** **                  *     *      ****           *  *              *            *      **        *                *  *              *** * ***   *  ** **          **    ***      **   *  * *  * ****   *  **
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 PAT1:Topoisomerase II-associa  ------1-------------------------------------1--1-1------------------ -1----1-----------------------------------1-----------------1------12-1----------1-----------1-----11------------------1111----------1-----------1-1-------------1---111------------------------1----------1---1---------------------1--1-----------------------11----1----111------------------------------------------1---------------------------------------------1---1--------1---------------1-11-1-1---------------------11----------111--2----------------------1-----------------11--------------1--------------------1-----12-----------1---2-1---1------1-------2----------------2--11---1-----------------1-----1-----------------1--1---------112---------11---1-1-----------------1----1--------------------------------31----11----1-------------1---------------------------------2-----------------11-11-----11------1-1---2-121---------1----1--1-------------------------------------------------------------1------------------ -113034-92-13632450367636445636058586334406476756357429879250433645444333657356559024451178242444254119837-51136356034457262304539-3-461346275588156567325378654598990746874554-90681229673560715865672
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 Cofilin_ADF:Cofilin/tropomyos  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------1---------------------1---------------------------------------------------------------1----------------------------1---------------------1---------------------------1----------------------------1---------111-1332122------------------11------------1-11--1--2---------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------6------------------------------------------------------------------------------------1-------1-1---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---------------------------- 2311157-033-7783374455586445545555555755655555866668983666466553555533544553545455555355567635667666345689159129064051016022499012-7-767709750162738084042149115743399699027875121113231110276422145544
 in-type actin-binding protein                                                                                                                                                          *                     *                                                               *                            *                     *                           *                            *         *** *******                  **            * **  *  *                                       *                                                                                                                *                                                                                    *       * *   *                                                                                                                                                                                                                                                                                          *           *                             ******* *** ********************************************************************************************************************** * ******************************************************************
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 Sod_Fe_N:Iron/manganese super  11----1111111111-111111-22222221--1--------2--111-111--------111--12 111--11111111121111-1-1112111111-1111211-111112-111111111111---11121211-----------111-111111-2111--222123121211111111111111111111111121111111112121222221111----11112223311-----1----111111---122333333333333333322222333222111111111141122222222222222111111---11-----------1-----11111111111111111111111111111112111111111111111-1-12222222222211222111111--2--11221111-1-1--1---1211122111111212112121212211111111112-111112111111133111111111211211121111111111111111111112111111111111111111111111111111-11221122221111111111111111111111511112-111111211212131111211121-1111111111112---1-31-1-111-121-111--111112121111112111121211121112---112211112211111111111211111111111-1111111-11121111212222222222-222222223222222222222211212222222222222222222222222112222222222221111111111111211211111112111211111111113111122222222212222122211111111111112222222222233232333332222--1111----11111111--11112-------------1---------1-------1211 2211121-255-342233223333213222222111123332222221333333442323332121131311212111112222112233533234111111221311152141112211-131212126-4-514111111211211--2121111121112311121331343367171115643763932442212
 oxide dismutases, alpha-hairp  **    ********** ****** ********  *        *  *** ***        ***  ** ***  ************** * ********** ******* ****** ************   ********           *** ****** ****  *********************************************************    ***********     *    ******   ***************************************************************   **           *     *********************************************** * ***********************  *  ******** * *  *   ************************************* ************************************************************************************ ************************************** ************************ *************   * ** * *** *** ***  ******************************   ********************************* ******* ******************** *********************************************************************************************************************************************************************  ****    ********  *****             *         *       **** ******* *** ************************************************************************************************************ ********* * ***************  *************************************************
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF972:Protein of unknown fun  ------1-----------------1------11--------1------11----32-2231------- ---------------------1---1-----------1-2-1--------------------1--------------------1----1--1-------2----1---1----------2111----------------1---2---1----------------1-1------------1-----111--1311111111111211121111111110413111111111111111111111111112111111111111111111111212---11111111111111112121211111112111111124223132221111132222222-3---11-221-1--1---1-1112121-12-------11-1-----------11---11-------------4-----1-------------14----------------------------------1-------------------------1-22----------1----------------------------------11----------1--11-1-------1----1-21---1311---------11--1----1---1111--1--31--1--1----11---------1---1-1----------1----1-----1------------------------------------------------------------------------------------1--------------------11-------1-----1--1----------41--11--1------1-2-1-----1----1--------11112--1-------------------111-1--------2-3------------------1---1--1-1-------1 -231423-94512342373431-43335553141-2212111-2343821465313-222312-1-12-2111123112131-1-1--22223239-113333394-18992123566585077015732-07477779744445385678680983436789246721675923-67511223389134652367122
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 phospholipid synthase             *             ******    * ***           ** *** ***     *          * * *************** ******************** ****        **  *  ***  ****** ******     **                *   *                  ** ************    * ** *   **     **  * **** *    ***   ****        ************ ***   * ** ****         *                     *********************** *****    *                           ********    *********** ******** *                           *****    **************** ********   *  *  *** **************************************** **                             ********* ***************************** ******************** ***      *   *** ****** * ** * *** **************    ***** * ******** ** **** *************** ******  ***    ***      ***************** ***************************************************  ************   *     *********               ****************************** * ** *   ***********************      * **   *                                                   *   *** * * **********************************************************  ***  *   *****   ***************** **** *** *    ** *          *       ** * *    *   * **  ***  * *****************************
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[1231] PF03098           1555                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1                                                        61111121111111111213 1 212111111111 1121111311   245 1274122411                          
 An_peroxidase:Animal haem per  ----------------------------1-------------1--------11--------------- --1-----------1----------1------1----------1--------122-----1-----11-----------------------------1-1---1-----------------------------------------32----3-------------1--1----------------------1------------------11--------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------3-----------1------13-4------------7313-1-122---------2---1-1------1-221-2------------------------------------------------------------------------------1----------22-----1-------------------3-3-------------------------------1----------------1-----------------------------------------1----------------------------------------------------1---------------------------------------1----------------------------------------------------------444------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--121-1-----455436363435745667623264344545553211654122253333---------------------1-----2435222---1211113--6336713195154353352238-91302149225115762001320528891642163163458872--332111--1113431-1----1
 oxidase                                                    *             *        **                  *           *          *      *          *        ***     *     **                             * *   *                                         **    *             *  *                      *                  **                                                  *                                                                                                               *           *      ** *            **** * ***         *   * *      * *** *                                                                              *          **     *                   * *                               *                *                                         *                                                    *                                       *                                                          ***                                                                                                         *  *** *     ************************************************                     *     *******   *******  ********************** ********************************************  ******  ******* *    *
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[1232] PF01326           1554                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 PPDK_N:Pyruvate phosphate dik                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1                                                                                                                            1611      1  1       
 inase, PEP/pyruvate binding d  42111-21222222221123211114311-22211111111112211212542111112121112212 -2111--1111----3111-1311211111113121-3151-3122-3----246-----3221--52321-------111121111122221211----1--12-111---------------111111-1111111111112354534441111------21136543-------1----122331111-411111111-111111--3322111-------222221111--------------111111---11-----11--111-1------1111---3--------------------------3--------11313622222221211266111111211111126672211311222111--32111411111233341111111111111111111-11111112111-11122212221122111111111112111111111111-12211111111111111111111111111111121221-122111111121111122131111112122411-133113131222222111211111111111121232123163492456669112123223522323937---2-1-1111121111111-211222212121113111111111111-11121111--11231------11111111111111111-1111111111111111111111112311111111111111111111111111-111111111111---1-----111112411-------------1-11111111112-111112331211112431111111111---2222221111111111111111111--21--------------41--------------------------1111111111221- --21--1-3111--21---21-1-2-1---------1----------1-211-3---211-1----1---11-------------------1---------------1732-11--1----------3-2------1------11-----------1-1---33-22-1--21-1286403197895811712233322
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