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Ranking of HM:PFM:REP : from 1401 to 1500

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[1401] PF05701           1389                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                   21    1     1 11 2 3 1 111              1  1    1      1   1               2223 51       
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 tein) 'four-disulfide core'                                                                                     *    ** *     *****     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                 *                                                                                                                                                       * **                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                          **  ** ***  ** ******* **  *         *    *   *  *   * ***    *        *    * *         * **            ********************** * ******************************************           *  *  **     
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[1408] PF01597           1381                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                   2                   
 GCV_H:Glycine cleavage H-prot  111-113333333333--1-----1111--11------111-------------21111111111-11 135411-----11111111-1111211111121111213311111111-11-32211311111221311111111111----1532112211-111---13111311111111111111111121111221113111111---1411121111111111111111111121112111111111111111111111111111111111111113111111111111111111-122222222222222111211-3-11-1---2211111--------1111------111111111111111111111111----------122--1112111-1--155----1---21----31-4-1111332211--112122211111112112111111111111111111-2112111-211-1111111-1111111111111111112111111111111-111-----------------------------11111-1111111111111111111111111111111111122111111111111--211111111111111111122-2-1111413111-22222221266451111-------------------------4421-111221111111112111111112111--12114------11111111111111111-1111111111111111111111121111111111111111111111111111-111111111111---111111111112211---------------1112111111213433222222322222222222222211112111111111111111111111111111-111111--------1-1------2-11---111-1--1----11111111111111 22--873-621-1111111111121111111111111111111111111122222-13-1-1111111111111111121111111111-1111111111112223-24153343322256222233834-3-3232113334031213221252532221424222226-332211241311113587142413242-
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[1409] PF08702           1381                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                              1                                                       111111     1 31 1 3 1 112    1 111 1  11  2 1 11  111         1                         
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 sphate synthase small chain,      * *********** ************************************* *     ***  ** ******************* *********************************************************** **************** ************               ******************************************************************************************************************************************************************************************************** **   *** * ********** *  ******************* ************************************** *****************************************************************               **************************************************************************************************************************************************************************** *************************** ***********************************************************************************   * **    *  ******************************************************************************                                      *  ********* **  *** *** ********************************************************************************************** *********************** * *********** **************** *************************************
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 Ribosomal_L5:Ribosomal protei  11111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111115111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111121111211111111112111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111212111111111111111111111111111111111121111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111112111111111111111111111112111111211111121111-111111111111111111111111111111111 12111111512111122222211121111111121122222221122222222231322222211222-12212133323211111333-2123122222122457112121411111----1-5612-4-1-12311115-11--11111111121122321211211212311211141111196162831111112
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 DnaB:DnaB-like helicase N ter  -------------------------------------------------------------------- 1111411111111112111-12111111111112133232111111123111121111111112111151111111111111111111112122111-1111211121121221111221111211111111111211111111112111111111111111211132311112111112111111111112233333233134535222223333432322212222224222222222222222222322111111111111111111122111112111222111111111111111222111111111111111111132232222223333212642121213111231111322112112223111221111115112111111121111111111111112-112214322112111111111111211112111211111111111111112112111111111111111221111111111111111121111111112112111111121111111511111112211212131111111123111232211111112111321111112111122111111121111111111-1121221121111111131212111111111121111111111111111111111-1111111111113113311321121232121131211122211111121112113324122112212212213111223211211111111311111111111111111111111121221--1321422332211111122212111211311121111111111112411111111111111211111111111111111116112222221112321-21121-122211111111111121111111121 -2-12--------2-1--1----------------------------------------------------------------------------1---------1---1---4-1-12--1-------------2----------11---41-------1--412------1-11------------2-12-11----
 minal domain                                                                                        ******************* ***************************************************************************** ********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** *************************************************************************************************************************************************************************************************** ******************************************************* *************************************************************************************************************************  ************************************************************************************************* ***** ***************************  * **        * *  *                                                                            *         *   *   * * **  *             *          **   **       *  ***      * **            * ** **    
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[1420] PF07727           1372                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                24 
 RVT_2:Reverse transcriptase (                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11                               1         2                 14 11   1     4            3                                                               1                  651 4    1454 
 RNA-dependent DNA polymerase)  --------11--11----------1------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1--------1-------1----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1------------------------------1------------ --1--1--1---8-14-2-3------2-1---1-1---1---16--26-1---5--245--1-76----9-1---62146--10-----514--13---7-7211---8-4--2---1---------1--------------------1------1--2-1-41-93--17-----14--2-7-11244055-369042
                                        **  **          *                                                                                                                                   *                    *                                                                                   *        *       *                                                                *                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                            *  *             * *                                                                                     *                                                                                                                            *  *                              *               *  *  *   * ** * *      * *   * *   *   **  ** *   *  ***  * **    * *   *****  **     ***  **   * ****   * *  *   *         *                    *      *  * * ** **  **     **  * * ******** ******
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 hionine synthetase, central d                                                                    ** ******************* ****************************************************************************   **********               ***************************************************************  **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************** *****************************************************************   *    *   ****************************************************************************************************************************************************************************** ******  ******************** ******************************************************************************************************************************************************************************************   ** ********************************* ******* ********************************* ***** ********************************************************** * ********************* * *********************************************************** ******
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