[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]

Ranking of HM:PFM:REP : from 1901 to 2000

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1901] PF01619           1050                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                 1                   
 Pro_dh:Proline dehydrogenase   ------------------------1111--2------------------------------------- 111131-211111111111-11--111111111111122211231111-111111112--11223211111-----------1-----1-11-1-----1111111111--------------1---------1----------11111111-1--------11111111--1---------11111---2221111111121211222211121211213121------2211111111111111111111----11------------------------------1-----------------------------------1------------1---1--------11------1---1---------1-11111-----11111111121121111111-111-1111211111--111111311111111111111111111222222221111211111111111-----------------1111-1111-111111111111111111111111122111111--111111111211122111---11-111111-1111-111-1111-11111-111-111------1--2---1-1121111111111111------11-11-211121111111111111111111-1-111-------11121111111111111-1111111111111111111111111211111111111111111111----111111111111111--11111111111--111111--------1--111111111111-11111111111111111111112111-1111-1111111111111111111------------------------------------------------------------1111 ----111-311-11221223222432344222233322223222114312358543111111111111--111111111111222121122212212322222242-27282252232212132251232-214151111524212321122-131123--53222392522221144-731113321424121311-2
                                                        ****  *                                      ****** ************ **  ************************ *********  ***********           *     * ** *     **********              *         *          ******** *        ********  *         *****   **********************************      **********************    **                              *                                   *            *   *        **      *   *         * *****     ******************** *** **********  ***************************************************                 **** **** *********************************  ******************   ** ****** **** *** **** ***** *** ***      *  *   * ****************      ** ** ************************ * ***       ***************** **********************************************    ***************  ***********  ******        *  ************ ************************** **** *******************                                                            ****     *** *** ********************************************************  ************************************ *********************** ********************* ******  ***************** ****************** *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1902] PF07888           1048                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                     1221221     1 1111 5 1 112    1  11     1  1  1 1                  1 1        1          
 CALCOCO1:Calcium binding and   ----------------1----1-------------------------1---------1---------- -1-1-----------1-----1---------------1----1-------1-------11----112---------------------------------1--1--------------------1--1-----------------2-2---1---1------------2------1---------------1------------1-----21---------------1-----------------------1----------------------------------1------1-----------111----------------1---1------1-1-11-----1-----1---1-----1---------1-1---------1----1-------1111111-111-11-111-111-----1--1---11--1-------------------------1-1------------1--1-1--1------1------1--------21-----------------------------------1-----1---------------3-----1-1--------1----1------11---------------------1-------1--12----1---------------11---1-------1----------1-2----1-1-1-------11---1-1-----------1---1---------1-1--1-------------------11----------111---------------------1-------------21-111--1--1----------------------1-------11----1------------11-------------------------------------------------1 -121222-07326622-312--2-3--11-1-11---212222111311-2111123-21111212111---2-----11-11-1-1-1481-333-2-2-2-321242336332059768708420969-31856697638901798994663950713443986712233355-15182112-73211-2116536-
 coiled-coil domain (CALCOCO1)                  *    *                         *         *            * *           *     *               *    *       *       **    ***                                 *  *                    *  *                 * *   *   *            *      *               *            *     **               *                       *                                  *      *           ***                *   *      * * **     *     *   *     *         * *         *    *       ******* *** ** *** ***     *  *   **  *                         * *            *  * *  *      *      *        **                                   *     *               *     * *        *    *      **                     *       *  **    *               **   *       *          * *    * * *       **   * *           *   *         * *  *                   **          ***                     *             ** ***  *  *                      *       **    *            **                                                 *  ****** ******** ***  * *  ** * **   ************ ******* ***********   *     ** ** * * **** *** * * * *************************** ******************************************** ******** ***** ******* 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1903] PF03982           1047                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        3        111211    1 1   111111111 1 1 11  1 11   1                  1 4        1     11 11
 DAGAT:Diacylglycerol acyltran  ---------------------------1---------------------------------------- ---------------22----2--4------41222-----1----1----------------------------------------1----------------1--------------1111--------------------1-3321122----------11--3221-----------------11-------------------------1--------------11-----------------11---11-----1--11------1----------------------------------------------------------------1-------------------1-----------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------1---------1--------------------------1------1---------------21---------------------111111---1----11-------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1--------------------------1-------------------------1----1-------------11111-------------1-----------------------1-----1---1----------1--------------------------------1------------------------------ ---1313-752-11511112221132111111111112122111111113111111111111234222242-3222223325544521111211143112111232133-24554491110909989292-9-113032411806190087453086701114422532456781282815658985441744514930
 sferase                                                   *                                                        **    *  *      *****     *    *                                        *                *              ****                    * *******          **  ****                 **                         *              **                 **   **     *  **      *                                                                *                   *                                   *                                                                                     **                               *         *                          *      *               **                     ******   *    **                                     *                                                                    *                          *                         *    *             *****             *                       *     *   *          *                                *                                  **** *** *********************************************************** ************************************* ******************** * ******************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1904] PF01726           1045                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 LexA_DNA_bind:LexA DNA bindin  11--1---1--111---1--1-3-2223-111---------------11-112----22--------- 1112122211121221111-11111211111122222222121312122111111121--33113121121111112111111--1-111----1-1---1------2---------------1-----------12221111111412221--1132222211--115-221134322112---1111111211111211112311111221111122122211111111221111111111111-1-11121-11111111111111111111-----------------------------------------------23112211211131111111112112-1111312131211113---33--1131121-1111123234111112111111111112-22122421121-2331123212211211121111111311111111111111331----------------------------1111211111111111121111143211121111111112122211131122111211211-1------------32121-1-112-2-----212212114111211-2-------------------------11221111111112111111111111111211----111------22211121112131311-1111112121142111113122121212111121111121111111111111-132312232111----11--1----11111212111111111121----------1121122223122221222----------1221122121221121222222221111--21111112----------------------------1-------1111111111-2-- 11-------------11-1112----2--11112--1-----------1------11---1----1---------1--1----------1--11-2-----3-2-8-16-1---1--------132-115-1-213------------1---1---1------5-4--111-1--11-13-2---1222--1---4111
 g domain                       **  *   *  ***   *  * * **** ***               ** ***    **          ******************* **************************************  ***********************  * ***    * *   *      *               *           *****************  **********  *** ************   ************************************************************* * ***** ********************                                               ************************** ****************   **  ******* **************************** *********** *******************************************                            ************************************************************* *            ***** * *** *     *************** *                         ********************************    ***      ***************** **************************************************** ************    **  *    ********************          *******************          ****************************  ********                            *       ********** *   **             ** ****    *  *****  *           *      **   *    *         *  *          *  ** *     * * * ** *   *        *** *** * ***            *   *   *      * *  *** *  ** ** *   ****  *   ****
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1905] PF05762           1045                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 VWA_CoxE:VWA domain containin  332-221---1-11---14212111---1---1311--------12--12342--------11-21-1 -1225---------12122-21--2322222244354556-4151-1-----111-----243-3143442-211------23-----1121-------111-23-----------1-----------11--11-53346---315-24---1----------1--1275------------41-111111---1-1------------------------1--------21----------------------------------------------------------------1-----------------------------11111111-1--1--2----1---3----333-22--22------12-41222------358621132443------------65454353243-31-2-23---13322324323244224--------2112-121--------------11--1-----------2221-211122111123121122321121112162322-1232331323221432111-1111---------1211-222---2---11--112-1-12123218921----------1-------------12242111-11211-----11-11-1----11----1312------12111112222222222-212232222123222222211111123112121212221211212132211--111111111111-------------125-----------------1111-111121-22221232212111212---------112111112111211--2-2-----------13221133--------2--------------------1-------1---------12- -----3-----11----1--21--1-2-2----1-1------1----1--1-3----1--1--1-1----------2-1------1---32---1--------------36-11--2--1-32-1--218-11213-11141-11-----2--1----3311-81114--11332-312311124212--12---3-13
 g CoxE-like protein            *** ***   * **   ********   *   ****        **  *****        ** ** *  ****         ***** **  **************** **** *     ***     *** ******* ***      **     ****       *** **           *           **  ** *****   *** **   *          *  ****            ** ******   * *                        *        **                                                                *                             ******** *  *  *    *   *    *** **  **      ** *****      ************            *********** ** * **   *****************        **** ***              **  *           **** ********************************* ******************* ****         **** ***   *   **  *** * ***********          *             ******** *****     ** ** *    **    ****      ***************** ***************************************************  ************             ***                 **** ****** *****************         ***************  * *           ********        *                    *       *         **       *     **    *  **  * * *    * *      *    *  * *    *  *  * *          * *      *   **   *              ** **  *  * ** *  *** ***** ***** **     *  *    **** *****  ***** ************  **   * **
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1906] PF01784           1045                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 NIF3:NIF3 (NGG1p interacting   --------------------1--1111112112121111111111213-111122111111------- -12-111111111111111-1111111-11111111121111111111111111111111111111111111111111-11111---1111111111--1111121111111111111111111----------1--------221--1-----------1-----221---------1---11211111211222223221211331121111212112111111111123211111111111111111111111111111111111111111-1111142111111111111111111111111113111111111111112111111111111113111111-11111-13222222111212111111111---------1-------11111--------------------1-----------1----------1----------------------------------------------------------111111111111111111111111111111111--11111111111111111-111111111111111111-11111112111111111111111-----1211111121111111111111111111--11111-1121111111111111111111121-1-11111111111212111111111111-11111112111111111111111112211111111111111112522334211111111111111--1-1111111111111111111112121122111111111111-111111111111111111----1-1-111111111121111--------------1111------1111111111-----1-1-1111-111111-11221-1---------111 ----211-31112211122111111-11111111111211211-1211121111211-111121111121113122111111111111112111-11111111111123-41321111112111322413-1-41221-221212222121-141321111-111211129--21---------1--1-1-1-1-1---
 factor 3)                                          *  ************************* ************         ** *************** ******* ************************************************** *****   **********  *************************          *        ***  *           *     ***         *   ******************************************************************************************** ********************************************************************** ***** ***********************         *       *****                    *           *          *                                                          *********************************  ***************** ****************** ***********************     ****************************  ***** ************************* * ************************** *****************************************************************  * **************************************** ******************    * * ***************              ****      **********     * * **** ****** ***** *         ***     *** ***************** ***************** ************* ************************************ ************** ******************** * ***** ************ ********* *********  **         *  * * * * *   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1907] PF02895           1045                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 H-kinase_dim:Signal transduci  ---------------------1-11111-111---1--1111112-12-1212-1-1121-------- 1212------------------------------------1---2---1-------------1-1-1-----------------1111-------1-----------1-------------------------1-12222---2154446612233------333-3353--------------------111--1-11111111111111111111111121111111111------------------------------------------------------------------------------------------41134111111111121221---214--11131112213312111231--31-3222-----1144611134115------------1121121311--1222333323221-2-1-11333311---------1111-223--1---------------------------1-2111111111111131111112211121211133331-22252222211322343322343-------32-144232211321543341778654744663654211111-1111111111111112111---32-3231111-2122221162312411122--11222------22111112222222222-22-2212222222222221---11111111111111111111121212222--111111111111---1----------1512---------------11111-11111344434224333332345---------21112333331112233454553441111--523311212222222211---------------1----------1-11111111-2-- ----------1------------------1111-1--------------11---------1----------------1-----1-----------------2--------1---1-----1--11--1-5---2-1----1---1-1--1--------2---1--1---1--3----------1---1-1----1-1--
 ng histidine kinase, homodime                       * ***** ***   *  ******* ** **** * ****         ****                                    *   *   *             * * *                 ****       *           *                         * *****   *************      *** ****                    ***  * ***********************************                                                                                          ********************   ***  ********************  ** ****     *************            **********  ************* * * ********         **** ***  *                           * ************************************* ***********************       ** *************************************** *******************   ** ******* *******************  *****      ***************** ** ****************   *****************************  ************   *          ****               ***** ***********************         *****************************  ******************               *          * ******** *             *                  **** *              **         *                *     *                 *        *   *     *  **  * *   * *    *   * *  *        *   *  *   *  *          *   * *    * *  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1908] PF02447           1043                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GntP_permease:GntP family per  --------1--------------1----------------------23-12-1---1----------- 1-311131111-111------111-6------1111-144----2-2-111-5521-5--1--1134222-1---------------------1-----11--2113-1-----------------------1-----11-------1-----------1-------11--1-------------------114454544425454343122325532112312------22111111111111111111151-3-11-2---1132112-1222--1111-----------------------------------------1222111-111111--2--511123--232-1----------21---24-1-41--------11--------1-1----------1----------1------------1--11-1--11-11-1----------111--11-------------------------1-1------1-----1111112111111311111111121122--112-----1---1---------111111111-----------------------111------------111---------2-1--21-1-----442-111-11113333-2322213232222-------------33213227346767556-4465534465365667663454323326566666656655566533343351-233333322333---------------121222527-231124441111112-11113333164622341-555----------42133333333133---------1-------1--------------3---------------------------111---1----1-- ---------1---------1-----------1--------1--------1-1--11--------1----------------------------1-1--1-----------6-----1-1111----1211-1-12111--2-1211-1222-11-111-11--111---1---1--1-------11--2-1-1----1-
 mease                                  *              *                      ** ** *   *            * ********* ***      *** *      **** ***    * * *** **** *  *  ******* *                     *     **  **** *                       *     **       *           *       **  *                   *********************************      *********************** * ** *   ******* ****  ****                                         ******* ******  *  ******  *** *          **   ** * **        **        * *          *          *            *  ** *  ** ** *          ***  **                         * *      *     ****************************  ***     *   *         *********                       ***            ***         * *  ** *     *** *** ******** *************             ***************** **************************************************** ************               ********* *************** ***************** ***          **************         *       *              *                           ***   *    *            *         *           *        *        * *  **        *                            * *  *           *     * ****    **** * *****  * **** **** ** *** **  ***   *   *  *       **  * * *    * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1909] PF02996           1042                                                                                                                                                                                                                                               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1                                                                                                        1             1 1     1    1                      1      1        1        1          
 Prefoldin:Prefoldin subunit    11121211111111111111211111111111111241112111111111112111323211111212 ----1--1-----------------------------1------------------1-----------11-------------31-1---1-----------------1--------------1---1-1---------1---11-11-------------------41---1--------------1-1---11111-2-1-12--1-1--111-----111--------------------------------------1---11------1-11--------------------------------------------------1111-2--1-1------1-------1--11------11---11-1---1--------2--11-----------------------1--------------------1-----1-----11---------------------------------------------------1---7---------------1---------------1---------------1-1-------1-----------1-------------------------1---1-----1-----1----------------------------11------1--------------1------1----------------------------------------1-------------------------------------------------1121-1--------11--------------------21-1----------2-1-----------1111111112-11----------------------------------1------------------1---------1---------- 4653544-54544453333333332424422222243222422222342222233343232433333323324233333333332322245233426673223554146696607644344554554010-8-964443412554454354433332444325194366404565242283453354522533265952
                                ********************************************************************     *  *                             *                  *           **             ** *   *                 *              *   * *         *   ** **                   **   *              * *   ***** * * **  * *  ***     ***                                      *   **      * **                                                  **** *  * *      *       *  **      **   ** *   *        *  **                       *                    *     *     **                                                   *   *               *               *               * *       *           *                         *   *     *     *                            **      *              *      *                                        *                                                 **** *        **                    ** *          * *           ********** **                                  *                  *         *           ******* ************************************************************************************************************************** * ******************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1910] PF02120           1041                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Flg_hook:Flagellar hook-lengt  ------1------------------22----2------------------------------1----- 1131---1----------------------------1---1---121-11---1--21--2-1-3---1---------------211----------------1--11-----------------------1------------111-1----1111---12---1111-------------11-22---121111-1-111111111122211111222112311111122-1111111-1111-1------11--------------------------------------------------------------1----23212111111121221111---312--12322112222221211121---1131211----114242223323311111111111-2332123214111111111231111-2123122222111--------1111-122-------------------------------1211244122222322222133232234332222232--1111441112-221322222252--1----222-22122-221111121222222222222222213-2222-2222221111111112111---14-222123212422232333342332422---222211-11131322212222222222-2322222222223122111---2222113111111111111111111222211232333122231---------2222-132211--1----1-----2222232---2234332334453233543---------21112232332212211111111121-----212211111111111111--------------------------1-11121222-1-- --------333--2----------------------1-----------1-------------1--------------11-1------------2-21----1--21--4-6-21-12---1-1------2------1--1---12--1---1-----11----1411--11111--5115------445---22121--
 h control protein FliK               *                  **    *                              *      ****   *                            *   *   *** **   *  **  * * *   *               ***                *  **                       *            *** *    ****   **   ****             ** **   ****** * ********************************* ******* **** *      **                                                              *    ********************   ***  ********************   *******    ************************ ************************* *************        **** ***                               *************************************  ********** ************  *    *** ***** *************************** **** *******************   ** ***************************   ****** ******************** *******************   *******************************************         **** ******  *    *     *******   *******************         **************************     ******************                          * ******** *           ***  *                      *           *             *              ** *            * **    *  **  * * ** **   * *      *      *  *   **  *   *     **    ****  *****  ****      ***   *****  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1911] PF03950           1040                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                 4        1          
 tRNA-synt_1c_C:tRNA synthetas  11111111111111111111111112211111112111111111111111111111111211111111 --1----------1-------------------------------------------------1------------------------11111111-11121112-111-------------------------------------------------------------------------22211-------------1--1----1---1--------1-----1--13---------------------------------------1-1-----------1------1------1111111111111-----------1111111--------11111111-1---111-111111-----------1-1-----------11111111111------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111122211122211111111111111111211111111121111112111111111111111111111111111111------------------------2--1111121111111111111111111111111-1----11111121111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-----1111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------------------111211-------------------------------111 3322241-72222222221222232433322223332222222232222222222222222232222222232233313222222222222222232222222224224244332132222222232326-2-236221232222223132225223223652224421242232222212222234602543332223
 es class I (E and Q), anti-co  ********************************************************************   *          *                                                 *                        ******** ******** ***                                                                         *****             *  *    *   *        *     *  **                                       * *           *      *      *************           *******        ******** *   *** ******           * *           ***********                                                                                                      *******************************************************************************************************                        *  ******************************* *    *********************** *********************************************************************     **** ****************************************************************************************                  ******                               *** ******* ************************************************************************************************************************** * ******************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1912] PF01936           1040                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11                                                                                          1  1 3        
 DUF88:Protein of unknown func  -----------111------1--122222222--211111111-----1211112322223---1--- --11322422222212222-24--22222223422211121-2122222-111-3-3-----2-1-12221-------111122221---12-11-----2-1-12-1----------------113241112-2422311113133354432322------24324365------------22222---2-----------------1-----------1--------------1-1---------1--------------------1-----1--------1---------------------------------------1-------------1-11---------1121-22-1-1-1------1--1-21111-----11322221211121111111-112-2211323111112111114121221111222123231211111111113111112--1-----------------------1---1112-----11121221----11111111-12112122--1--3123123213411211-121---111-211322-23-1-2111-33111--1-----11112-1---1-11211121-323332211--111-2421-1-1111111112121112112211---1113---------------------1-----2----------------------------------------------------------------1-------1112112-----1-----------11--11---211111121211112212----------221311111121112111212211------21------111-----111----------1----------1---1---1--1---111 1---112-2-1-1111121221122231111111111111111111212212412212----------------1-1-----11-----17-1402----1-1-1--1635-111131111111341213-112131-112111-111111-12113111-21212----21-3--4333232-1176213821-2--2
 tion DUF88                                ***      *  *********  *********     *************   *      ***************** **  ***************** ******* *** * *     * * *****       *********   ** **     * * ** *                ********* **********************      ********            *****   *                 *           *              * *         *                    *     *        *                                       *             * **         **** ** * * *      *  * *****     ******************** *** *******************************************************  *                       *   ****     ********    ******** ********  *  **************** ***   *** ****** ** * **** *****  *     ***** *   * ******** *********  *** **** * **********************   ****                     *     *                                                                *       *******     *           **  **   ******************          ************************      **      ***     ***          *          *   *   *  *   *** *   *** * * **********************************************                * *     **     ** ****    * * *  **** ****************** ****** ****** ****** ******** *****    ** *  ******* ********** *  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1913] PF09382           1040                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1                                 
 RQC:RQC domain                 ----------------------------------------1---1112-1331--------1--1--- ----1-------------------------------11---1-1--1--111---1----11--111111-1111111--12------2234-2111--1212111211---------------1-1111112-1--------3-122-111------1---11-11111------------1-11------222222322222223221221222111112--11111122111111111111111211111111111112111111111111-111---------------------------------------------11121111111212-111122211-1------2222--------1--1---21111-----111111--11111------------11112111-11-1111111111111111111111111111111111111111111------------------------------1111-111111122221111111111111112111121-111111111211111111121111111111111-111------11-11----111-11111-----11------1--------------1-1-111111111111111222221122222211211----1-1------11111211111111111-11111111111-1111111111111111111111111111111211111111-111111111111----111112122112-111111111111111131--1-----1111111112112111111---------12221111111111111111111111111--1-111111--------1--------------------------------------111 11--321-1---11121211111111111111112211111111112-111134111111--111111-12211111-2111111111112312122222131222111163432564222332773315-4-446313352333333224237342432234243111272242-1213-1111532413312121-1
                                                                        *   **** ****        *  *        *                               **   * *  *  ***   *    **  ****** *******  **      **** ****  **********               * ******* *        * *** ***      *   ** *****            * **      ******************************  ************************************************** ***                                             ************** ********* *      ****        *  *   *****     ******  *****            ******** ** *******************************************                              **** ********************************* ********************************* ***      ** **    *** *****     **      *              * * *********************************    * *      ***************** *********** **************************************** ************    ************ ******************  *     *******************         *****************************  * ******        *                                      *** **  *** *   *********************************** ************  ****** ******** **************************************************** * ****************************************** **** **************** *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1914] PF00190           1039                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 Cupin_1:Cupin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1111                                   1                                                                                               2851 57       
                                -----1--------------1-------------1---------1--------------1-------- -12--1--------1------2--22-----111-1-112-------11-----------------221----------------------1-------1-----------------------------------------------11-----22---2---2--12----------------------1-511111222-2223324-4254222---31-----11-33------------------------------------------------------2-1--------------------------------------2222222-2--------------1------------------------1--------284111-----21------------2---2-22--1-122---1-----2---1--2------1---------432------------------------------------21------22222222222---12222-222--1-1--11---1----11------------------------------1----------------1--1------------------------------------------------------------1--------------------2121112-211-1112--111-11111111----1-22-----------------211-1111-----------------------------------------------------1-----11---1-1------------------1---1-----1----1---------------------11-------------------------------------1------------ ----1---11--11398969343665311-1--545244434411145770051893562-2---1----1---2---------1----5758242221--2111---31------111-----11---1------------1-----1------11----1-1-1------1-12-1--2-2453929994--1----
                                     *              *             *         *              *          **  *        *      *  **     *** * ***       **                 ***                      *       *                                               **     **   *   *  **                      * ********* ******* *******   **     ** **                                                      * *                                      ******* *              *                        *        ******     **            *   * **  * ***   *     *   *  *      *         ***                                    **      ***********   ***** ***  * *  **   *    **                              *                *  *                                                            *                    ******* *** ****  *** ********    * **                 *** ****                                                     *     **   * *                  *   *     *    *                     **                                     *                 *   **  ***************** *  *************************** *   *    *   *         *    **********  ****   **      ***     **   *            *     *      **    * * *      * ** *  * **********  *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1915] PF02563           1039                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 Poly_export:Polysaccharide bi  ------------------11--2---------------------------------1----------- 472----1------1------1--2-----------------1211------1-1--1----------------------1--1----6585-811---1222144422--------------1--112-1212----12-----3222223----2111-1111645322-1-13--11-1-----22-----------1-1-------11------1-2------------------------------------------------------111----------------------------------------------111-----------1-------11----1--------1----------1-83223-----223433132121422222222222-44755157432-655543665456333112317676211--------2331--33------------------------------44521111135444552222233545555356663223--2213211--2223-113212112--1111-322321-1221-31111322-32324252333233434----1111111-------------221111313514231111112232231223322---2212------12-2-212332222222-33222222223223223311112111-1111111111321212222122221----------------1---------314111111-1-----1--21111111111321-1113421112112222---------33321112144244--111111111111--1-----------------1-------------------------11111111211424 ------1---------------------------------1--------2--1-------1-----------------------21---1-------------------------------------------------------11------2-11------1--1---1-----1-----------1-1--------
 osynthesis/export protein                        **  *                                 *            ***    *      *      *  *                 ****      * *  *                      *  *    **** ***   **********              *  *** ****    **     *******    **** ********** * **  ** *     **           * *       **      * *                                                      ***                                              ***           *       **    *        *          * *****     ************************ *********** ***************************        ****  **                              **************************************  *******  **** *********  **** ****** **** ******** *****************    *******             *********************************   ****      ** * ************ ************************** *************************                *         ********* *     *  ************** ****************         **************  ************  *                 *                         **************       *                                 *        *  *       *                       **   *                                                       **      * **      *  *   *     *           * *        
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1916] PF02020           1038                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11121       1 12 1 4 1 1 1       1      1  111 2  11     2           2                   
 W2:eIF4-gamma/eIF5/eIF2-epsil  ---------111---------------1-----------111--------2----------------- --------------------------------------------------------------1-1--1111------------------1---------------11------------------------------------------------------------1-----1-----1----------1--11111--------------------------------1---------------------------------------------1-----------------------------------------------1---1-----1----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1------------1-----------------------------1------1---------1-------------1----------1-----------------------------1---------------1------------11-----1----------------------------------------------------------------------1---------------------1------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3312525-511255512231222222222222222122222122122222322221212222322222122-22222-2223332222234323333333162757-38270412985668825875141-41389676675703677562674016265577768536983464332423322464973733329332
 on                                      ***               *           ***        *                                                                                * *  ****                  *               **                                                            *     *     *          *  *****                                *                                             *                                               *   *     *                                                                                              *                                                                *            *                             *      *         *             *          *                             *               *            **     *                                                                      *                     *                                          *                                                                                                                                      ******* *************************************************************** ***** **************************** *********************** ********************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1917] PF08535           1037                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 KorB:KorB domain               ---1-1-------1-1--1---1---------------------1-----------1---------1- 32211-11111111-1112-111111111111-213213211-1-------11-1---11---1-11-2--111121111111-------1---1-1---111-1111111111111-11111-111111111112---3---33112---------------1---1-112---1122--11-11111121222222222122222221112222412121221111111312222222222222212212112133121112222222211111111111111111111111111111-1111111-11-11-111111111--1-------1-113---1111121-11111--1112-11121111--221311211111-21121211111111111111111-111111121122111111123111112111124336111222222221111--1111-1111111--11111121111111-11124711211123233236111144111221212641212126322214128424211311111211111111214121-31-112-11-------1---1111111--1----1-----------------1--111211-11111-1111311111111111111---2111--------1--211221121321-21132111112211111111-2---1-1-1-1--12113-1-212222112-----------1-----2222122322-2111-----------1---2233211111113214111311111121111111111112--111111-11--11312111113223--3-111111---1--1121----------------11------------------1-21 -1------321-----1---1----------------2111111-------1111---1-1------1--------11---------11-1-132-------------31------2---1--------1--------2-11---1--1--11--1-11----123-11-11---121----------11-1------1
                                   * *       * *  *   *                     *           *         *  ***** ******** **** ************ ********* *       ** *   **   * ** *  ************       *   * *   *** ************* ***** ************   *   *****               *   * ***   ****  ** ******************************************************************************************************************** ******* ** ** *********  *       * ***   ******* *****  **** ********  ************ *********************** ***************************************************  **** *******  ************** ******************************************************************************** ** *** **       *   *******  *    *                 *  ****** ***** *******************   ****        *  ************ ******************** *   * * * *  ***** * *********           *     ********** ****           *   ****************************************  ****** **  **************  * ******   *  ****                **                  * **  *      ***     *   *                *******       ****   * *      *        **         ** * ***             **      *   *        *        * **   *  *  **  * **    *** ** **   ***          ** *      *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1918] PF03222           1037                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1                                                                                                                                                                                                                                                                                     1                   
 Trp_Tyr_perm:Tryptophan/tyros  --------------1---------------------1--1-----------------1121------- -----21-111----------------------------------------1---1--------1--1----------------------1------------------223222211122116---------------------2------------------1---1------------1-----------22222211-212311------122-----------1--------------------------111-----11----1--------------------------------------------------------------------------------11---11--------11-------1-----1----------------------------------------------1---1----------------11111111--------------------11-1111---11------1---1------------1111-----------------------------------------11111111------1---3--11-222----------------------111111111-1111111-------65-------2-3455425554443453445--2----------84113427887877777-87776777778776777765553344476467666665565664676666611444444444444--2-111112222-----444252554453445------------43231111-11111111178668767-35574444446444-1----------------------------------------------111----------------------- ----111-1---------1---------------1-------------1-------2----------------------1-------11-------1----1---1--7122-1-------1------1------2-----------------1--------241----1---13-1223342214434-2223-1-13
 ine permease family                          *                     *  *                 ****             ** ***                                        *   *        *  *                      *                  ***************                     *                  *   *            *           ******** ******      ***           *                          ***     **    *                                                                                **   **        **       *     *                                              *   *                ********                    ** ****   **      *   *            ****                                         ********      *   *  ** ***                      ********* *******       **       * *******************  *          ***************** *****************************************************************  * *********     ***************            ******** ***************** ************** *                                              ***                            *** *         *               *             *       *                      *       **       *    *   *  **** *       *      *      *                 *        ***    *   ** ************* **** * **
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1919] PF04641           1037                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1 1               1   1        1  1 2   1 1                        1        1         1     1  1          
 Rtf2:Replication termination   ---------------------------------------------1-----------1---------1 ------------------------------------------------------1--1----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1------11-------------------------1------------------------------------------------------1---------------1------1------------------------------------11-----------------------------------------------------------------111---------------------------------------------------1--------------------------------------------------1--1--------------------------11-----1-------------------------------------------------------------------1---------------------------1---------1-----------------11------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11------------------------------------------------1--- 2523767-713134354642454345345455575645445343446443434333545652433-33151122431-2212212244474640573248432743178384865145466597484262-8-161263564669575455226443679067655677185986263554447514514984886474
 factor 2                                                                    *           *         *                                                       *  *          *                                                                                                 *                               *      **                         *                                                      *               *      *                                    **                                                                 ***                                                   *                                                  *  *                          **     *                                                                   *                           *         *                 **                  *                                                                                                                                                             *  **                                                *    ******* ********************************************************* *********** **************************************************** * ******************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1920] PF00301           1036                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Rubredoxin:Rubredoxin          ----------------1------4-----11-626121211116625522131111--111--11--- ----11-----1--12-22-22--4222222421122435-22211-1---------1----211111111-------1-1211-1112121--------1---111-----------------33124311411----------1221221112222221211113332132111141111--1--1111-------1--11--1---------1--------------11----------------1-------------------------------------------------------------------------1213734333335441111156523231-212144511-1213111121--2-3111-----1-121---111-1------------12-11-1-----------------11-1---11111-----------2--1-2-1------------1111-1111-11-----------111112222222221222352122223433234121111411122321121121-1111111111111131-423322222222314241232121-11-143--------------------2---1--111-6----1-----1-11------11-1----2312------1--111-111-111111-111111111111111111111111---2222322222122222111111111-----------1----21111111111321----------------21212111122-3333121152121111111111111111111-------21111111111121111-132--------------21--------------------------1212312111---- 111211-153----1-22------------111121-111111----1-1-1-112-1---------11------12--2------1---212-1-1-1--2------812--11-11------------------111-------1----111----124-131-12136--1-4645634342946815432-11-1
                                                *      *     ** ************************  ***  **        **     *  ** ** **  **************** ***** *         *    *********       * **** *******        *   ***                 ***********          *************************************  *  ****       *  **  *         *              **                *                                                                         **************************** ********* **********  * ****     * ***   *** *            ** ** *                 ** *   *****           *  * * *            **** **** **           ****************************************************** **************** ************************ ** ***                    *   *  *** *    *     * **      ** *    ****      *  *** *** ****** ************************   *************************           *    **************                *********** *******************************       ***************** ***              **                          **********     ****** ***    * **            ****** ******    * * * *** *         **      **  *      *   *** * * *  *      ***  ** **                  ***       *    ***    *** *** *****  * ******************* ** *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1921] PF07678           1036                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1212231  1  1 111112 1 112    1  21 11  1  2 1114   1111 11 2                            
 A2M_comp:A-macroglobulin comp  -----------------1--------------------1---1------12----1-1-1-------- -27----------------------------------------------1-----------1--11---1-----------------------------------1--1-----------------------------11---1---------------------1-11-------------1------1--11111111121-1321--1111113-------------22-------------------------------------------------1----------------------------------------1-1------------1--------2--------------11-----1-----2---------1------------------------11111111111----1--1--1-1-1----1-1111-----------------2------------------------------------11111-11--------------------------1---1-------------------------------1-1----2--------1-1---2-111-123---------------------------11---1-11-------------------1----------------11---1-1111111111-1111111111111111111111--1121111-1111111111-111----1--1--------------1-----------1-----------------3333331----1----111211111-111----------------------11-----------------2-------------------------------------------1-1111112--2- 1----1--------11----1122-21---------------------------------------------------------------11---1-------1---1--33810238819625452246-21533877619803601774872795206763030614812582----3--------1-1------1-
 lement component                                *                    *   *      **    * * *          **                                              *           *  **   *                                   *  *                             **   *                     * **             *      *  *********** ****  *******             **                                                 *                                        * *            *        *              **     *     *         *                        ***********    *  *  * * *    * ****                 *                                    ***** **                          *   *                               * *    *        * *   * *** ***                           **   * **                   *                **   * ********** **********************  ******* ********** ***    *  *              *           *                 *******    *    ********* ***                      **                 *                                           * *******  *  *    *        **    **** **                                                               **   *       *   *  ******************** ********************************************    *        * *      * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1922] PF05764           1036                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1        1                                                                                           1111              1 1   1                            1  1             2      1      111 1 
 YL1:YL1 nuclear protein        ------------------------------1------------------------------------- -1----------1----11-1-----111111------------------------------------------------------------------------1---------------------------1--------------------------------1--1-------------------------------------------------11------------------------------------11-------------------------------------------------------------------1------1--1---11-----1------1---------------------------1---------1-----------------------------------------1-------------------------------------------1-------------------------------------------11-----------------------------------------------11----------------1---------1-------------------------------------1------------------1-----------------------------------------------------------1--1----------------------2-----------------11111-----------------------1------------------------------------------------1-211-----------------------------1-----------------------1-------------------- 2221693-2531--35305645343337721-15754111111212554514654334666542433318315433112324343721287339957654635866-86031474586353465976175-9-065554572595-34424215383464550580552273733277823357280758842169844
                                                              *                                       *          *    ** *     ******                                                                        *                           *                                *  *                                                 **                                    **                                                                   *      *  *   **     *      *                           *         *                                         *                                           *                                           **                                               **                *         *                                     *                  *                                                           *  *                      *                 *****                       *                                                * ***                             *                       *                     ******* ****  ***************** ************************************************************************** *********************** * ************ *****************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1923] PF02839           1035                              2                                                                                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                                                                                                                                                                                      1                                              1          11 1111121 11                                                                                                                                                                                                                                                                            1     
 CBM_5_12:Carbohydrate binding  ---1---------------------331-1-------------1--1--------1-11--------- 3--291----1-----------------------------2----2--2---2-------44--2-1195------------------11-1----------3-611------------------------------------0--11----1------1------13------------------------111111313123223242112-226---11--33333365----------------1--------------------------111----1-----------------------------1------------16555555525-2-------31--------611-----------------1-------------------------------1-1-1126-----1------------11------3-23-2-11111111-----1-1---------------1---------------1---1----222226-2222----222222221--------1--3--1-2----------0---------1----------------------------3--124-11-----1---1-3--------2-----75--26--1-4-55562-32331-423--9-------------3211-2154565766-5-251--38111361445541-----32122112232222321113-------3-311131111533---------------6---------------------1-1----9336211-1---12-11245747844514349020010152212---11---------------------------4--------------------------------------- 12--1-1-3--1112---1----1-1-111111--------111212-----1511---111----------1-----------1----367-543111211-316----2-----2----1--1-------------------------------------121-2------1--1---------------121-2-1
  domain                           *                     *** *             *  *        * **          *  ***    *                             *    *  *   *       **  * ****                  ** *          * ***                                    *  **    *      *      **                        ********************* ***   **  ********                *                          ***    *                             *            *********** *       **        ***                 *                               * * ****     *            **      * ** * ********     * *               *               *   *    ****** ****    *********        *  *  * *          *         *                            *  *** **     *   * *        *     **  **  * * ***** ***** ***  *             **** ********** * ***  **************     ********************       * ************               *                     * *    ******* *   ** *****************************   **                           *                                        **  * * *  ****   *    * * ******        ******     ****   ***          *           *    *** ********* ***    *     *    *  *                                     *** *      *  *               *** * *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1924] PF00229           1035                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          41111231111121321217 2 2121111211211211111 311111    1                                   
 TNF:TNF(Tumour Necrosis Facto  --------------------------------------------1-----1----------------- ----------------------------------------------------------------------------------------111--------1-----1------------------1--------------------------------------------------------------------111111----11-1-------111-1------------1---------------------------------------------------------------------------------11---------------1111-----------------------1-------------1-------------1--------------------------------------1-----------1----1-11-------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1---------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------1----21---11-----1---11------------------1--------------1---------------1-----------1-1---------------2-61412115565413404865-5-76936778384510632918037113465669112211--7-----4------111-----11---
 r) family                                                                  *     *                                                                                                          ***        *     *                  *                                                                    ******    ** *       *** *            *                                                                                 **               ****                       *             *             *                                      *           *    * **                                                                                                 *                                                         *                                                   *                           *                                                                                                                              *    *                                                                                                             *    **   **     *   **                  *              *               *           * *               * ******************** * **************************************  *     *      ***     **   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1925] PF02508           1034                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Rnf-Nqr:Rnf-Nqr subunit, memb  ---------------------1---11--------------------1-22-1-------------11 -1-----------------------------1---------1---1-1--------------1-----------------2-------4444-555---2--22--1--222222222222222---21422-24-----------1----------1--------1--------------------22-1--1-1-1------1--------2----1------------1---1-1--------------1-1---------------------------------1-11-----------1-------------------42-22222222-2--222222-222242321-------251-22--12---2------------1-1----------------------------------11--------1------2232-22-------------2-1------------------------------1---2----1------1--------------112-----------1----------62-2--422222222--445-26742222-622---1-----2-------22---------------------------566544454446866646666666666666--4226222-22232222222222222222-2222222222222222222544225442422222222222222422222222-466666566666---4---------64424444444444444444-------222644444222-422126111---------244444444444454----------1---3222--------------2-4-------------------------4244424222---- -----1-----1---------------------------1------1------2---------------------1--2---------1-------------------11-----1--1--11-1--1-3-3---1--1-111--1---11--1--------11-21--1--1---1-----11-1--2111--2----
 rane protein                                        *   **                    * ** *             **  *                             *         *   * *              *                 *       **** ***   *  **  *  ***************   ***** **           *          *        *                    ** *  * * *      *        *    *            *   * *              * *                                 * **           *                   ** ******** *  ****** *********       *** **  **   *            * *                                  **        *      **** **             * *                              *   *    *      *              ***           *          ** *  *********  *** ******** ***   *     *       **                           ******************************  ******* ******************** **************************************************** ************   *         ********************       ************ *********         ***************          *   ****              * *                         **********          *     *                           *      *      *                     *  *         *                   **     *  *  ** *  * * *   *  * ***  *   **  *        ** **  *  *   *     ** *  ****  *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1926] PF05686           1034                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11   11 1                                1                                   1        1      4                                                                   42     1      1112    1
 DUF821:Arabidopsis thaliana p  ------------------------------------------1------------------------2 -----1-1----------------1------1--------------------------------------------------------1111---------1------------------------------------1------------1---------------------------------------1--------------------------1----------1-----------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------1--------------1------------------------------------------------1----------------------------------1----------------11----------------------------------------------------1----------------1--111-1-1-----------------1--------1111-1-----11---11--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111-----------------------11111111---1------111---------------------------------------------------------------------------- ----1-------33-226841280789984555887676777535587688865791766651---------1---------1-----112128898778756--1--6-56634425454334553459-4-43944438533333442334647533477232242227--22275376952715689022212120
 rotein of unknown function (D                                            *                        *      * *                *      *                                                        ****         *                                    *            *                                       *                          *          *                                               *                                                                         *                                                                  *              *                                                *                                  *                **                                                    *                *  *** * *                 *        **** *     **   **  *                                                                                                                             ********                       ********   *      ***                                                                                 *       ** ************************************************         *         *     ***************  *  * ******************** * **************************************  **************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1927] PF00292           1033                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3                                                                                                                                                                                       1      221221       31 2 5 2 212    1     1      2 1  1  111 1121 3111                         
 PAX:'Paired box' domain        --------1111111---------------------------------1------------------- ------------------------------------1-6---3---------------------------------1-----1---------------------------------------------------------------41---1-----------------1---1----------1-------------------------------1-------------------------------11--------------1------------------------------------------------------------------------------------13----11--1-----------------------------18--1--2------------1--------1------5----------------------------------------------------------------------1------------------33-----1--------------------1--1---------1------------------------------11---------------------------------------------------1----1-------1---------------------1---------------------------------------------------------------------1-----1--------------1---------------------------------------------------------------2-----2------------------------------------------------------------------------------ -----4--11-2--1----------------11---------1---1-----1----1-1---1----------2------------------112-----21139-1--99063449888897095288-5-969699718898408779650876695741088801235102------1--1---111---1-511
                                        *******                                 *                                                        * *   *                                 *     *                                                               **   *                 *   *          *                               *                               **              *                                                                                    **    **  *                             **  *  *            *        *      *                                                                      *                  **     *                    *  *         *                              **                                                   *    *       *                     *                                                                     *     *              *                                                               *     *                                                                                    *  ** *  *                **         *   *     *    * *   *          *                  ***     ***** *  ******************** * ******************************************      *  *   ***   * ***
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1928] PF05485           1033                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                                   
 THAP:THAP domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      111  41       11 2 2 1 111    1 111       1     212 53161315  11                         
                                -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---------------------1-----------------------------------------11---------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-------------------------------------------------------------------1---------------1111-1-11111--------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------11-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1-111---------------1-1----------------------------------------------------------1-- ------1----------1-----1-----------1-1-1111-------1--------1-----------------------1--------------------2---2-84398606877495106062-4-4397957371204958689085448765540788772482911--1----------11------2-
                                                                                                                                                                                               *           *                     *                                         **                                             *                                                                              *                   *                                                                   *               **** * *****        *                                                                                                                                                       *                         ** *                                                                                                                *                                              *                                                                         * ***               * *                                                          *         *          *     *           * * ****       *        *                       *                    *   * ******************** * *******************************************  *          **      * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1929] PF01634           1032                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               3                   
 HisG:ATP phosphoribosyltransf  1--1--111111111111111111222221221121111111121132111111-1-111-1----11 1111211111111111111-11111111111111111111111111111111111111--211111111311111111--11112111221111------111111111---------------111111111111111122211111111111111111111111111111111111112111111111111111111112111121111111111111111112222211-11111111111111111-1----11-1---12--11--1-1-1-1-------111------------------------1----1----11-1111111-1-1111111---1-1--1111111211111111111--11121111-----113111111311211111111111111111111312-1111111111111111111211111111111111111111111-----------------------------1111211111122222211111111111111112111111111-111111111121121111112211111111111-1111111111111-2222222121111111111111111111-1-------11111111111111121111121111111111111211--111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111-1-----111111111111111-1111---1111111111111111112111111111111--------111111111111111111111111111111111111111-------------------1--------1--1------1--1-1111111 --11-11----111211212111121211111111111111111211111111112211222112111-1111111111111111111112111111111111211-12--------------------1-----1---1---------1---1----111111-1----3----121211112121121211113111
 erase                          *  *  ************************************************ * *** *    ** ******************* **************************************  ******************  **************      *********               ************************************************************************************************************ ***************** *    ** *   **  **  * * * *       ***                        *    *    ** ******* * *******   * *  *******************  ********     ************************************ *******************************************                             ******************************************* ********************************* ************* **************************** *       **************************************  *************************** **************************************************** ************** *     *************** ****   *******************************        ***************************************                   *        *  *      *  * *******   ** **    ********************************************************* ************************************* **                    *     *   *         *   *    ****** *    *    ************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1930] PF02237           1031                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BPL_C:Biotin protein ligase C  --1-12----------1------121211-11111111---11112121111111112111-----11 1111111111111111111-11111111111111111112112111111111111-111111111111111-111111--1-111211--1--1--1--1-1111--1---------------111111111111111111121---11--11---------1112---1-1-----1----21111---111111111111111111111121111111111111111111122111111111211121111-111111-1-231111111121212111111111111111111111111111111-1111111111111-211-111111111111111111111-111111112111131-111-2---23111111111211111111212111111111112-11111121111121111111111111121111111112111111111111211121111111111--11111111111111111-111111111111111111111-121111111211111111111111111111-11111111111111111111121-1112-11-11221111111111111111323-------------------------11111111111111111111111111111111--11111------11111111111111111-1111111111111111111112112111111111111111112111111111-1111111111111112111111111111111111111111111111111111---112222-1112---12111111111111-111111111111111111111111111111-1111111--------11------------------------------------131- --1-21------111-1-112111112--1111111-1111--121-------------111111111112111111-21111131111--21-2-----1--212-1-2412-111-111111111112-1-13111111115-2111-111211111--11122111111411---171--1-2--4141--2111-
  terminal domain                 * **          *      ****** ********   ********************     ** ******************* *********************************** *************** ******  * ******  *  *  *  * ****  *               *********************   **  **         ****   * *     *    *****   *************************************************************** ****** * ********************************************* ************* *** ********************* *************** *** *   *********************************** *****************************************************************  ***************** ********************* ****************************** *********************** **** ** ***********************                         ********************************  *****      ***************** **************************************************** ****************************************************   ****** ****   ************** ****************************** *******        **                                    ***    * **      *** * *********  ******* ****  ***             ****************** ***********  ** *     *  *** * **** *** ************ * *********** **** *********  **************   ***  * *  ****  **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1931] PF04246           1031                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RseC_MucC:Positive regulator   ---1-1--1122121---11----1-112-11-----222-11---------1---112--------- 111122-1222------11-1111--11111211112-1--1112-12-12112--13--113-13--2111---11-1-1-1---112113-121---112-111-11--------------21--11111-11----211-1-1-42------------1-1---12----11--111-11--1112---144455335-3223221122-11131-1111232222322-111111111111111211-1-1--2--2-1222221-1--1-----------1--------------1111-1--22-1-11---111122313222122321--43311--2213211---1-1-2-11--23-1-11--12111-1--1-11--1111-1------------1------11--2--1-----1----1--12---111121----------1----2--------------------------------1-1-1121113-21231322222--2322-1-2-1311--12-1--11--3-21--31-1--1---1------2331222-21--1------1-1--11-1--1--22-21-1-1----1-----------11--231121112213122112311212131122--12121------23212113112322222-2222322222222222223112121122111221111111112121222332-111111111111---3---------21112222111113122111212-21----1233331---1-1-12211122222222122212122111111-11-1-1211----112222--22111-----212---------11--------------3121221222-2-1 1---1---1112----11----1-1-----1-1--1-------1--1-1---2--1-------22-------2-21-----112-----13212-1111111------72-2-12411-1122-431211-1-1212--1113212112-12-111-1-111-112-2-1212---211------1563-311--1-11
 of sigma(E), RseC/MucC            * *  *******   **    * *** **     *** **         *   ***          ****** ****      ** ****  *********** *  **** ** *****  **  *** **  ****   ** * * *   ****** ***   *** *** **              **  ***** **    *** * * **            * *   **    **  *** **  ****   ********* ********** ***** ************* ****************** * *  *  * ******* *  *           *              **** *  ** * **   ******************  *****  *******   * * * **  ** * **  ***** *  * **  **** *            *      **  *  *     *    *  **   ******          *    *                                * * ******* ***********  **** * * ****  ** *  **  * **  ** *  *   *      ******* **  *      * *  ** *  *  ** ** * *    *           **  ******************************  *****      ***************** **************************************************** ************   *         *********************** **    *******   * * ***************************** ** * ****    ******  *****     ***         **              ********** * * *   *   ****    **    * *     * *  *       *  * *   *  *       **       * **     ***     ***** *******      ** * ***** **** ****** * ****  ********** ** *** * *** *** * ****   ***      **** ***  * **
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1932] PF02900           1031                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       11        1 
 LigB:Catalytic LigB subunit o  ------1222222231---2-----11----------------11-----11--1111111121---- 1-122---------221----4--22-----22445213612131--1--1---2-----113-4323312----211--12--1---------------1---11--1---------------1-1------1-----1----1-------------1-------------------------------311222222221222222--22-1211-1-----------11---------------1-----1----1---------------------------------------------------------------21-23111--11-1---32----111--1--11111111211111111--1-12112-----211551--5-242----------------------1-2--1111-1-21-131----1-11-11111111111--113-1--1----------------------------43--3321122222213332332433331433524121122132112632442111111111-------2-11442-1---1------1-1------1-121111--1--------------------------221111-11--1111111-111111--1-----1--2------11111112221211123-2323212322213331332444113312122222222222222322-2223--122222222222---111111------125----11--1-1--1111111121214122222212122252112-----------------------11122322322--------111111--------1--------------------------------------1-1 ----121---1-112335132323443222111-1-1112111221212144753322112132111--1--111------111111-121-31121221222112-1133---------11-----1-3-1-111----1----------1------2-11-3-14-1--135--32-61-1111422523218460-
 f aromatic ring-opening dioxy        **********   *     **                **     **  **********     * ***         ***    *  **     **************  *  *   *     *** *******    ***  **  *               *   **  *               * *      *     *    *             *                               ******************  ** **** *           **               *     *    *                                                               ** *****  ** *   **    ***  *  *****************  * *****     ******  * ***                      * *  **** * ** ***    * ** ***********  *** *  *                            **  **********************************************************       * ***** *   *      * *      * ******  *                          ****** **  ******* ******  *     *  *      ***************** ********************************************** ****  ************   ******      ***    **  * *  *******************************                       ***********        ******        *                                      * *     ***   * ********************* * *******************************  *  ***      ****** *** ************** ****         **     * * * ***    *          *      * ** * ** *  ***  ** ** **************** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1933] PF01928           1030                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CYTH:CYTH domain               1112111111111121111111111111211111111111111111111143212223322---11-- 11112111111-1-11111-11--111111111111-132-4131---111-2111-1----1-11-151-----111---11-----11111111---11111-1---------------------------1----11---2-4111111--1111111112121111-1-1---1-11-1------1-112222222212212222111112221111111111111-11111111111111112111111-1111-111----111---1-11111111111111111111111111111111111111211121111-1-1111111111112-11111211111111--11-----1-----------11111-----11-221-1-1---------------24222434221-21111221121112-1---3--------------------121--1-----------------------------1--111-13222232222233222222222332232--2221111111112112311-11111111121-2111-11111112321111-1----1-----------1----------------------111221111111121222214222222224241---1111------11221111111111111-111111111111111111111122112111111111111111111111111--222222222221---1---------11312111111-1111111111111-12111111111211111111111---------12112111112211111111111111111--2-11----11111111--1--------------------------1------------ ----231-42221112-1-1---1------------1---------21121--1------------------------1--1---1--------1----------1--22522221-2111111111112-1-1112111121111211-11112-112111193411112113321229211122337-342211--1
                                *************************************************************   **   *********** * ***** **  ************ *** ****   *** **** *    * ** ***     ***   **     ********   ***** *                           *    **   * *******  **************** * *   * ** *      * *************************************** *********************** **** ***    ***   * *********************************************** * ************* **************  **     *           *****     ** *** * *               *********** ************** *   *                    ***  *                             *  *** *****************************  ******************* *********** **** ************** *    *           *                      *********************************   ****      ***************** ***************************************************  ************   *         *********** ************* ***********************         *****************************  * **    ********  *                          *                 *** ******** * *   *            *         *****  *                        *  *   *        *          *  ******** ************* * **************** ***** ********************************* ******  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1934] PF03070           1030                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TENA_THI-4:TENA/THI-4/PQQC fa  11--1-2344444444-222222-2---1222----1-----------------222---1321--11 21--1--1111--1-------1---3------31112232-2-21-1-111-2111-2----12--4---111111-1----3--1---11--1--1---------11-11111111111111----------1--1111---121-2-1111111----------11241---111-1--1---22---211222223222232235312221222111-2111111111121111112111111-211221-111111----1--111-111-111111-------22222222221---------1-----------------1---2-111-1--11-11------1-----------1------1-1---1--------32311-221111211111111112-22122222----2---2212221212-1-3-321214121111111122211111--------11--------1------4-33-------22111111115111122-21111-1-343221--22-24---11--11231-1221--------111111211-2-----------------------31-------111111--1111111-------1-112-11--2-----1------------2-1-1----------111--1------------------------------333---21----1-----------1-------------------------11111----1--21111----1111---13332323--12-22222334154542223---------11111-----1211111111113332111---1111111------------------1-----1-1-------------------1--- ------1-2-----224342343222211111112121111211111132453542333222223-2223242423434422222443414141214331211331--321----2-------------------4---------1----2-----1----31--1-----11112232-222513347442321-122
 mily                           **  * ********** ****** *   ****    *                 ***   ****  ** **  *  ****  *       *   *      ******** * ** * *** **** *    **  *   ****** *    *  *   **  *  *         ** **************          *  ****   *** * *******          *****   *** *  *   **   ****************************** ************************* ****** ******    *  *** *** ******       ***********         *                 *   * *** *  ** **      *           *      * *   *        ***** ****************** ********    *   ********** * * ************************        **        *      * **       ***************** ***** * ******  ** **   **  ***** ****        ********* *                       **       ******  *******       * *** **  *     *            * * *          ***  *                              ***   **    *           *                         *****    *  *****    ****   ********  ** *****************         *****     *******************   *******                  *     * *                   *          * *     *************************************************** ****************************************  ***    *                   *         *    *     *    **  *     ******** *************** ***
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1935] PF05231           1030                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 MASE1:MASE1                    -1----------------------2112--11-----------33--1----1-11------------ 152-3---111-1-132----2--1-------322223---2144--3-12--2---2--226-2-3-23----------1--1-------1--------1-21-----11----1---11-1-1--11------111-1---21121-2211122111---43-112----1-------2-1----1-----2212221--1111321---1--11----1--------21----------------1--------------1111-11--1----1---------------------------------------------11-1--------------------3--2--------1--1---------1-13221-------1--3-2---2-----------3-1-1-1----2--11--212111-1-2--213-3123------------2211----------------------------------2-1-232211224111222232112342124121423-1422532--22121--21231143----------13321-1---1--1111-3322114-2--1-4--1--------------------1------1111-31113--23331-323321-2-212---1211------53113545765555553-555554665556555555533311221554445555554544543432233--3-1111111111---1-1--1----11411----11-----1--22221211--12212121---11112--1------------11221222-1-124312221--1---1--1-331111-----------------------------------------------11- ---1--3----1--3---1--111------132-2--1111121---1-1--1-11--2------1---------3-1-12----------4-2-1112----111--522--11-2-12--123214-0-4-1-2---111161-21--1---------11-2-213--11-21-1----1-3-568222-1--111-
                                 *                      ****  **           **  *    * **             *** *   *** * ***    *  *       ******   ****  * **  *   *  *** * * **          *  *       *        * **     **    *   ** * *  **      *** *   ***** **********   ** ***    *       * *    *     *******  *******   *  **    *        **                *              **** **  *    *                                             ** *                    *  *        *  *         * *****       *  * *   *           * * * *    *  **  ****** * *  *** ****            ****                                  * * ********************************* *******  *****  ********          ***** *   *  **** ******* *  * *  *                    *      **** *****  ***** ****** * ***   ****      ***************** ***************************************************  * **********   * *  *    *****    **     *  ********  ********   *****  *            ******** * *********  *   *  * ******                                               **     *  *    *  *   *  ***      *** *  *******   * *  * **  *      *         * * **          * * ****    ***  ***  ** * **  ****** * * * *   ****** **  *         ** * ***  ** ** *    * * ****** *  *** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1936] PF01292           1030                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ni_hydr_CYTB:Prokaryotic cyto  ---1-----11---11111-21-1-----------1---1----1--1--13-------1--212--1 111-1--1131-1124411-1---11211212-1111-23-2131321111-1----1--3-2--3-1111-------11321-1------1-111----211232411-111111---------1--5--13-2-11-1--11131-22211112-----11-1-531221-------11-2--12----1-1121232121322-33-22--3-2--2---2------21------1-1-----1----1--11-----------11-------11-------111-----------1----1---111--1----------------------1--1-----1----1-1-111--1-12--111----2231222------32571--2--4211111111112-44254122-2--1---22121213111-2-11123212211111111322-12-3---------1--------------------11211-1-112-----3111122321111-3222215-112321-11111-311-1--2221-11-11-1--2-2223-21---12-21--2122--3-112212-11311211-1-1--11-1----2----221--3-22212132543-2332225421123--1-2-4------2-1-3112222223232-222322233322222222111--1--33232323331323223-2222221---11111111-11---2-1-------2--------11--------1---------11-113-23-11---112222--111---1---2---1--2-11----------2--11-21----22-----------1-1---1111----1---1-1--------1----111-1 ----3---2--2--111---2--13211--------1---11----21125-33121-1-1-21-------11---1---1---1---1--11221----21--12--611142243--111--1-1213-1-31-121-11-22---1--2--21-1411-1213-1113-131121-5-111126432321122431
 chrome b561                       *     **   ***** ** *           *   *    *  *  **       *  ***  * *** *  **** ******* *   ******** **** ** ********** *    *  * *  * ****       ***** *      * ***    ********* ******         *  *  ** * ** *  ***** ********     ** * ******       ** *  **    * ************* ** **  * *  *   *      **      * *     *    *  **           **       **       ***           *    *   ***  *                      *  *     *    * * ***  * **  ***    *******      *****  *  ************* ******** *  *   *********** * ******************** ** *         *                    ***** * ***     ************* ******* ****** ***** *** *  **** ** ** *  * **** **   ** **  ****  * ****** ******** * *  ** *    *    ***  * *********** *************  * * *      * * ************* *********************  *  ***************** *******   ******** **   * *       *        **        *         ** *** ** **   ******  ***   *   *   *  * **          *  ** **    **           * *   ****    *   * *        *    *** *     *   *  *  ***   *  *****        *   **    ***** ***** * * **       **   *   *   *   *  *****    **  **  *********  ***  * **** * ** *** ** **   *  *  ** **** **** **** ****** * ******************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1937] PF02767           1028                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA_pol3_beta_2:DNA polymeras  ----------------------------1------------1-------------------------- 1111111111111111112-1111211111111212322312432111111111111111211122223221111111111111121111111111111111111121111111111111111111111111111111111221112211111111111111111122111111111111111211111141122222232123324311111122211131111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112312111111111111111111111111111111111121112111111111111111111111111111111111-1111122111121112121111111111111311111111111111111111111111121111111111111111111111111121111111111111111111111111112111111111111111111221212111111111121111111111112111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111-2111111111111111111111111111-11111111111111111111111111211111111111111111111221111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111131111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111-11111-111111111111111111111111111111111 ------------1----1------------------------------------------------------------1------------------------3-------11------------2-----------------1-----------3---11----1-1------------1-------------1----
 e III beta subunit, central d                              *            *                           ******************* **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ************************************************************************************************************************************************************************* ********************************************************************************* **************************** ***************************************************************************************************************************************************************************************** ***** *********************************             *    *                                                            *                        *       **            *                 *           *   **    * *            *             *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1938] PF02953           1027                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                               1     1             11   1                                        1        1     1    1        
 zf-Tim10_DDP:Tim10/DDP family  1---------------------------------------------------------------1--- ----------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1--------------------------1--------------------------------1----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------11-------------1----------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1-----------------------1-------------------------1--1------------------------------1-------1---1---------------------------------------------1----------------------------------1------------------------------------1-------------- 5511242-556-2433352334344-34444345431545544344354444454454446454655545555455556555555544454634454344413808-58265898648385777516644-7-777467957886569546328695591-37668396536765452325514509894183615212
  zinc finger                   *                                                               *                                                              *                                                           *                          *                                *                                                          *                                                                                                                                        *                                                                                               **             *                                                                                        *                                                               *                                               *                       *                         *  *                              *       *   *                                             *                                  *                                    *               ******* *** ************* ******************************************************************************** *********************** * *************************** **************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1939] PF07191           1027                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                          
 DUF1407:Protein of unknown fu  ---1----1--111--1-2--11-622711-12--211-11121------131-1212111-----31 -13-4-------------------------------1----12---1---1----------3--1--2---2---11-1111---1-1112--1-------12--1--1---------1-------1-------1---1-231-2221233------1-111-1-31121111-11111-11111111-1122112212211221311-1112322332231131----1111----1-------1------11111121212111111221--1222---12221121111111111111---111111-1111111111112113111112121241--2--121312-3231--232-131222-4121123-----2122112111-----1-11111111111---1--1--111-122111122312-11--1---------111111111111132---------1---------------------111112---2-------1111---12111-112-11111-11--121---------11----11111111-----113--214-1--111-322-1111611-11-1-1111-111111111111111--1---1223-11----2-1132-1----2--11213---2-12---111222122-3323333233-3333323323333333432234-1--2222232222212222213333333--11111-111211---2-----------111------11111-1112222222--11111111---11112-------------1421911111-1212---1-11---1---11112211--11111111----------------------------11-113121112-- 22--122--213-2---1111--1-------1---1-111--1----------2---1--31-11----1--1-1---------11-11----1-------1--12-19-31222-2-1--1---1---2----11------1------131-4-1---2119-3-12-11--42-11---1-1-6148-32114121-
 nction (DUF1407)                  *    *  ***  * *  ** ****** **  *** *****      *** *******     **  ** *                               *    **   *   *          *  *  *   *   ** ****   * ****  *       **  *  *         *       *       *   * *** *******      * *** * ******** ***** ******** ******************* ****************    ****    *       *      ********************  ****   ********************   ****** ****************************  *  ****** ****  *** ****** *******     **********     * ***********   *  *  *** ************ **  *         ***************         *                     ******   *       ****   ***** *** ***** **  ***         **    ********     ***  *** *  *** *** ******* ** * **** ***************  *   **** **    * **** *    *  *****   * **   ********* ********** ********************** *  *************************  ***** ******   *           ***      ***** **********  ********   *****             ********** ****   * **   *   ********  ********                            ** *********   **  ***  *** *   ****  *       *   * ***  *          *   *  ** **    *  * *         ** **    *       *  ** ** ***** * *  *   *   *    **      *      *** * *   **** * ** **  ** **   * * **** ****