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Ranking of HM:PFM:REP : from 2001 to 2100

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 ein A N-terminus (FbpA)        ********************************************************************   *        *  *      *                  *               *    *                          * *         * ** ***               *** *************   ********************************************** **************************************************************************************************************************************************************************************                        *                           *               *                                  *                             ****                 *                     *                     *    *********  *    ** ******  ***************************        *   ****     * *    *                        *                                             *                                            *                        *      *    **  *  *        *                         *        **  ********* *                         **********   * ******* ************************************************************  ** ************ ***   *  ****  * **************  *********** * * *  * ******** ************************* *********************** 
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[2008] PF00417            990                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Glyco_hydro_17:Glycosyl hydro  ---------1----------------------------------1---------------------1- ----------1-1--------------------1-1------------------------------------------------------------------------1--------------1---------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------2---------------------------------------------------------1--------------------------------------1------------------------31122111122--------------------1-2-------------25---------------------2----31--------------------------1-1-------------------------11--------1-------------1----------222------------22---------------------------------2------------1------2------------2---1--1---------------2-------------------------------------------------------------1----------11-------------------------------1---------------------------------2-11112222-2222-2-1----------21-1-------111--------------------11---------------------------------------------------- ----------1-12-8655577636433444443454433334444564455656852455553423323333344323434444411144163241111112532--8-12----3-----22971------1-----1----11-11----51111--1--2--2----1-----1-------8987669--03271
 lases family 17                         *                                  *                     *            * *                    * *                                                                        *              *                                                                           *                                                                *                                                         *                                      *                        ***********                    * *             **                     *    **                          * *                         **        *             *          ***            **                                 *            *      *            *   *  *               *                                                             *          **                               *                                 * ******** **** * *          ** *       ***                    **                                                               * ** *******************************************************************************************  * **    *     *****      *     *    ** **    *****  *  *  *    *     *       *******  *****
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 RPE65:Retinal pigment epithel  ------------------------1---3--------------------------------------- ----3---------13322-23--2322222252221131-212----------------------2-1------------------1-------------------1-------------------------------------8542335111111111122124332111111131111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2221-------111---11112-------------------1--1----1------------1---1--------------------1-------------------------------13-2------111111-1111----11111111----1--211---11-1--1---------1--------------------------------11-------22-----------------------------------------11111----------------------------1-------------------------------------11-1-------------------------------------------11--1------3------------------------------------1-1-------2----------------------11---1---------------------------------------------------------1----------- --------11----1443444217564221111212-22232212223112054853312221------------------------1--3-4------1112455--5199388176835634455781-4-74857455633245643455534535343167321113446-1467166677959349365----5
 ial membrane protein                                   *   *                                            *         ***** **  **************** ***                      * *                  *                   *                                     *************************************                                                                                                                                                                                                 ****       ***   *****                   *  *    *            *   *                    *                               ** *      ****** ****    ********    *  ***   ** *  *         *                                **       **                                         *****                            *                                     ** *                                           **  *      *                                    * *       *                      **   *                                                         *                    **    ********************** **************************                        *  * *      *******  ********************** * ***************************************** *******************    *
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 RuvB_C:Holliday junction DNA   1-11--1--------1---1-------------1---------1-1-1--------1-----1-1--- 1112111111111111111-112212111111111111111111121111111111111121211111111111111111111--111111111111--1111121111111111111111111111111111212221111111211211421121111122111111111111111111111111111111111111111111111111112111111-1112222221111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121211111122211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-113122121111111111111111111121111112111111111112111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111221111111112111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111112111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111-11112------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--11111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111--311-11-111111111111122111111111111111 --------------1----1-----------11--------------1--11-4------1-----------1-------------1----1------1----1-----12------------1--------------------------1-----1-----1--1-------1-----------1-----11-11---
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 RecO_C:Recombination protein   -----------1-----1---------1----------------------1----------------- 111111111111-111111-111111111111111111321111111111111111111111211111111111111111111111-1111111111--1111111111111111111111111111111111111111211131211122111111111121111112111111111111111111-1111211111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-----1-111111111119111111111111111111111-11111111111111111211111111111111111112-33133111111111211111111111111131211111111111111122-11111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111211111113211111111111--11111111-1112-2111111111111111111111-------------------------11111112111121111111112211111112--11121------21111111111111111-1111111111111111112111112112112222222222222111111111-111111111111--11111111111111111111111111121111111111111111111111141111222111111111111111111111111111111122111111--11112222--------111---11--11--------11-1-----------1--1111 -------------111-21--11-1--11--11-----------1----1--12---1--------------2------1---1-2----11------------1---1-41--1------2------------------11----1------2------1--3--11---1----12------22221121-2-1---
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF485:Protein of unknown fun  ---1-1-1-------1--1--1--2-1111--11---------12-1---2-2----1--1-1--2-- 2-111112111--1-1122-22---4221221322243462-1125111331224112--432-4487441----1---12-1--1111----2-----1--2111-------------------1---1---11-11221---2-22---11----------1--1-21-1----123---11111------2221221131213411311111-21223213------3-111121211211112---------2---1-111--22---1-1-------1-----------------1--1--1----1--1-----1-----1---1-111111111-----12---1122--2---1-1---1----1111----1---121-----1--1-------------23322621-1---1111-2---11-2--11-22112-1-111111111111-413---1-----1---------------1------2-------1112113212222322222133111431114313-1--1323-11241---32------1---336------1--2-111-33322331132331-2-2--1-----1--1-------11111--21--22--1--2-----1------1---11--1-1-1------21111111111111111-111111111211111111211122122111-111121-111-1211-111-1-111111111111----222211111--3-1---------------11211111112212222212233243211---------11----------1--1-212113231111--1-111111--------2-1----1--------111----1----11------------ 1-----1-2--1---21111-111-31------1-------21111111-3132---1--212--1--1------21------1----11431-32---1-1-1------3-1112--12211111-214-1-1111--1111111142-111312-11-112413-8213-321----6----131-12212-11---
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