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Ranking of HM:PFM:REP : from 2201 to 2300

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 lastoquinone oxidoreductase,   ** * ***************************                *****        **** ** ***** *       ***** **  ******************** *  *     *     ***********           ***********   *   **  *****              ***************************************************************** * * ***************      * **** *        **                               **  *                   *                                      *       * *             *  * ****    **       ** ********************************* ************************************************** ***************************************************************************************************************   *  ***** * *************** *******************************      *       *  *** *  * **  *************************** **************************************************** **************************  *               ************ ***** ******* *************              ***************** ******          *                                   ****  *  **     *  *            *   ** **        ** *   * ****     ***     *       *  *       *   *    *      *      *******  ** ** *** * ** * **** ** * * **** *  *   ** *** ** ** ***      ***** **  ** * 
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 ACCA:Acetyl co-enzyme A carbo  --------------------------------1---------------1------------------- 122---------------------------------------11----------------11---21222---------111211111--------1--11111111111111111111111112222221221211222---1111211111111111111111111111111112111111111111-111111111212111111111131112111211111111221111111111111111111111-111111-1-22111112111211132221111111111111111111111111111111111111111--11111111111111111111111----2111112211111------11111111111111111112311111111111111111-1111111111111112111221111111111111111111111111111111211----------12-------------1---11111113111111111111112111111113111112111111111111111111111112111121111111211----11111121111111111111111111--1111111111111111211111211111111111211------1-------------1-11111------11111111112111111-111111111111111111111111213111111111111111111113231112111111111111111112111111111111111111111-11311111111111111111111112111111111111111111111111111111111212111111111111---------------1-1-------1----------1------1---------11-1 -1--2-1-6---1-1-2-1--------------11--------1----------------1----11---------1------------1--2-2--12--4---1---21-----1--2-----1---1-1-----------1---------1111111--113111---1-2-112-----124--3-432-1212-
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 nd metal-dependent hydrolase   *************** *     *************************  ************   **   *** *  ****      ** *     *****  ******* **** * *   *****   **  *******    *      *     ***          *** ***           ****        *** ****  * *****  **         *** *                  *  ** ************************************************************** *      ***       *        *        ***  ******                       *************** *********   *   ******  * *  *  * ***                                             *       ** *     * *       *           ***                                *  * *********** ************ **** **   ** ***     *    * * **        ** **  *  *********** **   ***    *                        * *   *** **   **        * ** * *      ****      ** ************** *****************************************************************  *      **** ****     *        *       **** *****   ******             ****     ***  ***********     *   ****                                    * ***      *    *    *    * **   *  * *   **    * *          *    **                    *    *          * *   *     * * * * **    * *    *      * *    ***  * *  * *  *   *     ** *** ** ***  *       ***** * * **** 
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[2223] PF01244            875                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                  1                                        1                            
 Peptidase_M19:Membrane dipept  111---1111111111-21111--1------------------------1----11211111------ 145-1---------1---------11-----1----14-1--1-1--1-11---------2-3-1-1124----------11---------2-311----2-1411321111111111111111-----------21111---131--1-------------1---1--1-1-----1----21111---11-1111111111111111111--11111112--11111142------------------1-----------------------------------------------------------------------13--1111111112113111111-11--1--1-111111111-1111--15--2112----------1-------11111111112---1----1122-2223111111241111112711111351111111121111-1------------------------------12233--221-2221211111111211111-1111-1------1------11--1-------------------1---1--1--------------11--1211126-1--1---------------------------1--212111111111-111111-1112--1-----------111--1------------------------------111----------------------------------------------211-12------111--------------1211-111-11112222242223232-322-1111-111-1--------1-1--1121211111-------1----------------1---------------------------1---1------- -----1--------1111122423132331121323323223234511232445112-1111-11-11----1---1---1-----11212111211113--1121-23232322323322524834552-3-65714253363-3344131-222231132352755562--32--1--------1--2-------11
 idase (Peptidase family M19)   ***   ********** *****  *                        *    ********       *** *         *         **     *    ** *  * *  * **         * * * ****          **         * ***    * **********************           *****   ***  *             *   *  * *     *    *****   ** *******************  ********  ********                  *                                                                       **  ******************* **  *  * ********* ****  **  ****          *       ***********   *    **** **************************************** *                              *****  *** ******************* **** *      *      **  *                   *   *  *              **  ******* *  *                           *  ************ ****** ****  *           ***  *                              ***                                              *** **      ***              **** *** ***************** *** **** *** *        * *  **********       *                *                           *   *             *        ******************************************* **** ** **    *   *   *     **************  **** *********************** * *********** ******* ******************  **  *        *  *       **
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[2224] PF02075            875                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RuvC:Crossover junction endod  -------------------------------------------1---1--1------------1---- 2111111111111112111-111112111111111112111111311111111111111111111111111111111111121--111111111111--12111111111111111111111111111111111211111111111411112111111111111112111111111111111111111111----------------------1--1--1----------11---------------------------1----------------11----111--------------1111111111111---111----111-----------111--1-----1111--1111111111111111211111111114316112111121111111111111111-112113211111111112111211122111111111111111111111111121111211111111122112222222221145-11111231111111112111111111111111211111111121112222111111111111111111111111111211-1111111111211111111111112111111111111111111111111112111111111121211111111111111111111-11111------11111111121111111-11111111112111111111111111211111111111111111111111111122222223222--11111211111112111111111111111111111111112111111111111111111111111111111112111111111111111111111111--81111111-------111--------------------------21111111111111 -----------1-----------------------------------------1-----------------------------------1----------------1----1111---------------------------1--------1----1------1-3------23-11---1--1-1--1-----11---
 eoxyribonuclease RuvC                                                     *   *  *            *     ******************* ***************************************************************  ************  ********************************************************************************************                      *  *  *          **                           *                **    ***              *************   ***    ***           ***  *     ****  ******************************************************* ************************************************************************************ ******************************************************************************** ************************************************************************************* *****      ***************** *****************************************************************  **************************************************************************************************  ********       ***                          **************            *                                         *                                   *                *    ****                           *        *    *      * *      ** **   *  * *  *     **   
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[2225] PF03711            874                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 OKR_DC_1_C:Orn/Lys/Arg decarb  ------------------1111---------------------1-11--------------------- --------111---12211-1-111111111-1111111----11-----------------1-1---12--------------------------------111----1111111-----------------------1----11111111221111111111111122111111111111-------122222222222222222222222222222221221111213221111111111111111111-1-2112-121----11-1-----------------11111111111----------------------1323222222222222222212222221-22211332222-1122223111------------11211---1---1------------11211211-------1-2----2221-------------------------11-------------------------------------2111123333221111221311111142211121111121111111111111121121---------1111-1--------1------------------------------------------------11---1---1-21111---1111-1--1----1----------33115325556556654-554555655556455555433311111554556555643535552323334--422222222222---1----------------------1-1-211------1--111222211111-1111---111-11111-213-2222222-2211----------------111111----------1--------------------------------------- 12------1-----------------------------------------------1--11-11------------3-1------------------1---1-1-11-1--------------------1-----5--1---------1--------1----111--3-------111-----112124-----1--2-
 oxylase, C-terminal domain                       ****                     * **                              ***   ***** * ********* *******    **                 * *   **                                ***    *******                       *    **************************************       *************************************************************** * **** ***    ** *                 ***********                      **************************** *********** **********            *****   *   *            ********       * *    ****                         **                                     **********************************************************         **** *        *                                                **   *   * *****   **** *  *    *          ***************** ***************************************************  ************   *                      * * ***      *  ************ ****   *** ***** *** ******* ****                ******          *                                        **      *                                               *  ** **            * *                  *   * * ** *                    *     *  *         *        *    ***  *       ***     ******     *  * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2226] PF01603            873                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1  1    1   11 1 1 1 1 1    11          111     11   1 1                  111 1        
 B56:Protein phosphatase 2A re  --------1111111---------------------------------1--------------1---1 ------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1-1-------------------1--11-----------------------1--1--------------------------------1-------1---1-1----------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1------------------------1-------------------------1-----------1--1------------1-----------1----------------------11111----------------------1-----------------------------------------------------------------------------11----1---------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1------------------------11-------------1-------------------------1---------- ---1112-31-322121112222322322233212111112212232112112111121211122223-2222233222222223322211112122113141547236-59076288751655318278-01094787951757487966501066545277630465557642711181211183261261176554
 gulatory B subunit (B56 famil          *******                                 *              *   *                                                                   *                                                                                                                                                          *                * *                   *  **                       *  *                                *       *   * *                                  *                                                                                                          *            *                        *                         *           *  *            *           *                      *****                      *                                                                             **    *                                                                                             *                         *                        **             *                         *              **** ** ********************************************************* **************************************** ******************** ********************************************************************
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[2227] PF07012            873                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1 1                                                                                                                                                                                                                                             1   1 1 1111112 1111111 1 1                                                                                                                                                 1     1112                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
 Curlin_rpt:Curlin associated   --------111-1-1------------------1---------------------------------- -------------------------------------1--------------------------------------------------------------4----------------------------------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1--------------61----2-0----------------4---8-5----66-6-1---------3-4--2----------------------------------------------------------------------------------8-1---------------1----------------------------------1---1------1------------------------------------------0---5-0-6866776-6655254-5-5-------------6----7-7776767667-6777677767767777776--------8688888888888888-3--4446---------------------------------------------------------------2-6--33336-------------577---------------------------1--------------------------------------------------------3 -----------111----1-------------------------------1---1---------1-------------1----1-----------------1-------1---------------------------------------------------11-------------1----------------------
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[2230] PF06011            872                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                   1                  1 11
 TRP:Transient receptor potent  -----------------------------1----1----1----11-1--1----------------- --------------1---------1------1-----1---------------11------11-----1---111-1-------------2--1------1----2------------------1----------1-------1----1--1--------------1------1----------------2----------------11-11--1---1--1-1---------22222222222222-111311-1111---1---------1--------11211--211222222222222222222222-111--111------111111111112---11--1------------2-211-----2----21-------------1-1-------------------------1-------1-112--------------------------------------1---------------------------------1-----------------------------------1---11--12----1------------------2--1---------11---------------1-1----------------------11-----1-------21121--11111---121-----1------------1---------------1----------------------1--------1------1------------------------------1-1111----111-----------------------1------------------1112-221---11------1-12----1-1-----------11111-----------1----------1-------------------------1-- 2-11421---12--16554555674754453334655444533477544578987757576673332213334345425424443433325352222322-22343-20632-12111-1--211324-8-5-11711--1-122-11-211-233-13-2-5211-6--11-1--79121-11-44585--1-54525
 ial (TRP) ion channel                                       *    *    *    ** *  *                                *         *      *     *               **      **     *   *** *             *  *      *    *                  *          *       *    *  *              *      *                *                ** **  *   *  * *         ************** ****** ****   *         *        *****  ************************ ***  ***      ************   **  *            * ***     *    **             * *                         *       * ***                                      *                                 *                                   *   **  **    *                  *  *         **               * *                      **     *       *****  *****   ***     *            *               *                      *        *      *                              * ****    ***                       *                  **** ***   **      * **    * *           *****           *          *                         *   * *****   **  ************************************************************************************** ***** ***** ***** *  ****** * * *****  * *** ** *** *** ** * **** *  ** *  ***** ** *****  * *****
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Ribosomal_L25p:Ribosomal L25p  ----1-------------1------------------------------------------------- 1111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111121111111111----111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111-211111---------111111112------------11111111-11---------------111111---111111111111111111111111111111111111--------------96-----------------------------------------------------122-12222222222----2221121112--11111111111111111--11111111111111111111111111111111111111112111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112212111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111121111111111111111111111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--------------------------11111111111111 11--11--2----1--1-1--1-1-1---1-----------------------------1-1-----------------1------------1-1-------------21-1-1---------------1---1-2----------------------1---1241------------11111112213-311-1211-
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[2233] PF02086            870                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
 MethyltransfD12:D12 class N6   ----1--11---2----1-----1---1--5--3--1-1111-11-21--------11---112--51 -2--31---------------2----------------------------4-----------------------------111--111122111-1---1---3--1-----------------1---23---1-366542--1133333361111------23212234----------------1---51---------11-111112------1-223-1-1--2--1-2--------------------11------1--1----1-------------22-11111-1211-11-1-----22-11-1--11-----41-1-1-1-11---12186--11-12--121215341221-1311-4131--1-----5--912------------------------1--232--------1----1--1------125-24-11-------------5------------392-11-111--11------1-3---1------2145---1111--2-122-21-1-1-------31-1-31-3-52-1--131111112---1---1-2---2---1--1-1-12------2-11-11122312111224236431122-1-121111--111111122111111111211111--13---------11323111112111212-1211123111122111211111323232113312222252431121111118-122221222124--11-----23321--2-112112212-121111131111-------2-------1--113-----------111111111121112------11-2-11--23--1122---2-121121317---2-711--112123----------1-1--1--1- 1-1-1----------1---------------------------------------------------1----1-----------21-------1-----------1---1----------1-----------------------------------------12--1---31--2------1---1116-1--------
 adenine-specific DNA methyltr      *  **   *    *     *   *  *  *  * **** ** **        **   ***  **  *  **               *                            *                             ***  ********* *   *   *  *                 *   **   * ******  *************      ********                *   **         ** ******      * *** * *  *  * *                    **      *  *    *             ** ***** **** ** *     ** ** *  **     ** * * * **   *****  ** **  ************ **** ****  *     *  ***                        *  ***        *    *  *      *** ** **             *            *** ** ***  **      * *   *      ****   ****  * *** ** * *       ** * ** * ** *  *********   *   * *   *   *  * * **      * ** *********************** * ******  ************************  **         ***************** **************************************************** ************  **     *****  * ********* ************       *       *  ***           ***************      ** * **  **  ****   * *********   * ***  ******          * *  *  *  * * *          *                                                   *    *           **       *           *   *          *                                         **  *   **  *      *   **** *        
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 Peptidase_S28:Serine carboxyp  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------1----------------------11111------1---------1-----------------------------------------------------1----------------------------1------------------------------1-------------------1---------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------222232-------1-------112---------------1--1-------------------1-----------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------11--------------------------11-------------------------------------------------------------------------1------------------11-------------------1---1--------1--------------------- ----985----2-1-44462445654422222222243233332236542342343854422-----1--1------------------90646933223111321-34716244506234445333855-4-932443444731243664546632546643545660177873-22441115225727074298688
 eptidase S28                                                                                                                                                                              *                                                          *                        *                      *****      *         *                                                     *                            *                              *                   *                                       *                                                                                                                   ******       *       ***               *  *                   *                       *                                                                                                                               *                  **                          **                                                                         *                  **                   *   *        *                          ***    * * ***********************************************     *  *                  ***************** *********************** * ****************************************** ***********************
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 inolamine dehydratase                **********  ***   ********           *  *                   ** *****  ****   ***** * ********************** ***    *** *   *** *******           *** *             * *******               ** * * *********   ***************************************** **   *  *****************    ******  **      *                                    **      *                                               *                 *                             ** ******    ************************ *********** * ********** **************        *** ****             **** *** **     ***** *************************************** ******************       *******                     * ******      *                    **** ***************************   ****                        *         *                *  *       * **           *              *     *********                      **********************         *   *************************  * ******                         *                    **   *   *** *** **************************** ******************** *************** ******** ** ***** **** * *** *********************** * *************************** **************************************
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