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Ranking of HM:PFM:REP : from 2501 to 2600

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF2232:Predicted membrane pr  22-----21-----------11-11----1-11-----11-1----1--------1-1--1-11---- 1---21--------221----2---1------11112111-1-21-2-------------------2-1-1-------11-1-12-1-2242----------1-1-11---1-----------1-1---1---1-----1-----11321111111111112111-1112111122211111---1111--11444432233333353211131333321321211221-42111111211211122122231--3113--------11-1-11-221-------111------------------------1---------222233333343331255521121311121212232111211111121---1----1211112211211112111111111-1111-23322122-1--21131311111112-1------------------------1-1---------1----21----------------1---------------------11-------1-------1-1-------1----11-1---------------122211----22----11212121111111-112--1-1------2-------1-21-21211-2-2-1-1---1--1-1----212------11-2----1-1211-11---------------------------1--1-1--13-1-112111111111122---------1--------------1-----1-1-1--1------11------------1--11-------211-------111---------12211--------1111--------------1-------111-1---1--1---1-----1------------1-1-----1---2--- 121114--2-1------11---1311-----11--------11----1-1--2--12-------------------1--1---1---------1-3----1--122--6-2-21-3---------1-313-3-3--211---113------1-2--112--135-2-71-1-22--122721-11324414112-----
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Lamp:Lysosome-associated memb  -----1----------------------1--------------1--1--------------------- ---11----------------------11-11-----1---1-------11---1-----1-1-1-1-------------1--------------------1---------------------------------211-------1----------------1--------1-----1------2-------1--------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1---------------1----------------------------1-------------2------------------------------1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------11-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1---------1-----------------------------1------------------1-------------------------- ----243--1-2211--1---------12--1--1-1------1--1-112-1-21-2-------------1--------111--------1--1-----11122--73251331719103796699183-1-205807706749870958855089707712379667324623-31-1---1-2332121-12-2--
 rane glycoprotein (Lamp)            *                      *              *  *                         **                      ** **     *   *       **   *     * * * *             *                    *                                 ***       *                *        *     *      *       *                    *                                                                                                                          *                                  *               *                            *             *                              *                                  *                                                                                                                     *            **     *                                                                                                                                       *                                                          *         *                             *                  *                               ***  * ****  *         **  *  * *      *  * *** * ** *             *        ***        *  *     *****  *********************** * ****************************************** ** *   * ******* ** *  
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[2517] PF11026            758                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                        
 DUF2721:Protein of unknown fu  -------1--11-----1--1---233111--------------2-1---1-----1111---2---- -11-11-1111---12211-11---211111-112112--1-1-4121--1--1--11--1---1124111----1111-2-------1113-1------1-2212---1233232-1-11111112111121111332121-2-92--111--11-2-213-11----1-11---12--11211-----1--------2-11-----31--2-11--1---1--1-----1---------------111---21---1--2---------1-2---1---1111-11-----------11111--111111---------111-23---------11---1---1-1---1---231----1-----1--11---11--------1-21----2--111-11111-1-22522322----1----11-11-113-111-2----111--------11112---33--1------------1-------1-1-11121-----11111122-11-11211131--12212211111---1--212112231-4-121---1--1----3--111111--------1111132112242-1--2-----------------------1-----2-2--22-2111211112211112121----212--1------1--------1--1------1--1------------------------------------------------1-----------1--------1112-1------1--------------1----3-1----111-1-1-122---------2----------11--------------1-----22--11-------------------1------------2----1---------2-1 1111-12-42-21-31-22--11311212121131------1--2--1-1112-112-11---3-1----1---13--1----1-1-1-123-314111--2-12122111112421--212---3--1---12-2----2111--1211-----21-2111164111--33533--12-12-212465-232423--1
 nction (DUF2721)                      *  **     *  *   ******              * *   *     ****   *      ** ** ****   ***** **   ****** ******  * * ****  *  *  **  *   *******    **** *       **** *      * ****   ******* * *********************** * **  ***  ** * *** **    * **   **  *****     *        * **     **  * **  *   *  *     *               ***   **   *  *         * *   *   **** **           *****  ******         *** **         **   *   * *   *   ***    *     *  **   **        * **    *  *** ***** * ********    *    ** ** *** *** *    ***        *****   **  *            *       * * *****     ******** ** ********  ***********   *  ********* * ***   *  *    *  ******        ************* *  *                       *     * *  ** *******************    ***  *      *        *  *      *  *                                                *           *        **** *      *              *    * *    *** * * ***         *          **              *     **  **                   *            *    *         * * **** ** ** ** ** **  **************      *  *  * **** *** **   * *    *   **  *    * * * *** ******  * **************  ***   *  *   ** *    ****  ****     ** **********  *****  ** ** ****** ******  *
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[2518] PF02790            758                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      2                            
 COX2_TM:Cytochrome C oxidase   --------------------1---211111-1----1--1-1-------1------------------ 1121--1-111------------------------------1111--1-------1--22--1--------------------1---------------1111111111--------1-----1-----------21111---11132211111112123222212534211111111211211-11---12322223233232322222222423312221111111113211111111111111111121----------1------------------------------------------------------------3---------------1----------1-------------------2-2-11111-----12311221111121111111-111122122222211-11111111111111111111111111111111111111-212-111111111111211111121111-111111111--1111111211211111133111112112121111112111111111111111-1121-------11211111----11---111-1-2-1111111-111--1--1-----1------------------1-212211211122212122221112212---21-1-11111-1---1------------------------------------111-----1--1---------------1--------------1-1222221111111-1---------------111-1-----1111111111111111----2-1212-2---11-----111111122322222----11--111122-----------------------------------------------1-- 33--1-1-2---111--------1-11111-11111-------111-1------131-2---1-111---1---1-1----11---112-2--1---11-11-111---13111131-----2-26-2-2---11-----2--11---1-1--1-1---1-1231-22--0131-111----1--1-11-21--2112-
 subunit II, transmembrane dom                      *   ****** *    *  * *       *                   ****  * ***                              ****  *       *  **  *                    *               **********        *     *           *****   ***************************************** **   **************************************************************          *                                                            *               *          *                   * * *****     ******************** *************** ************************************** *** ************************ *********  **************************************************** ****       ********    **   *** * * ******* ***  *  *     *                  * ***************************   ** * ***** *   *                                    ***     *  *               *              * ************* *               *** *     ****************    * **** *   **     ***************    **  ******                                               *   **  * * *   ***        * ***** *****       *** *      *** *   * ***   *   * *    **   *** *  *   ** ** ***   ********     * ** * *   **     *  **   * *  * *   * **** **  **** ***    *  * ** **  **** 
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 UPF0102:Uncharacterised prote  1--11----------1-------1--------------------2--------1-------------- 111-111111111111111-11111111111111111111111112111111111111111121111111111111112234-112111111-1111--1111111111---------------1111122-11111111111111121112211211111111112221-1--1--1----111111111------------------1--------------------11------------------------------1-------1------1--------------------------------------------1112111111111111111111121111112111111111112111111211111111111111112111111111111111-111-11111111111-11111111111111111111111111111111111111-111111-111111111--------------111-12111111-12222221111121111111113111111--21111121111111211-111121111111211-111121111111111111111111111111111211-111111111111111111111111111111111111111111111111111111--11111------11111111111111211-111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111--1111111-111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111-111111111111111111111111111111--11111111--------11--------------111---------111--111111121 ---------------------------1-1121-----------1------1--------------------------------------------111-----11----1--1-1-------------------1-------------------------11--1---1------1---------------1------
 in family UPF0102              *  **          *       *                    *        *               *** *************** ************************************************************** ********* ****  **********               ******* ************************************** *  *  *    *********                  *                    **                              *       *      *                                            ********************************************************************************** *** *********** ************************************** ****** *********              *** ******** *****************************  ***************** *************** ************************************ ******************************************************  *****      ***************** ***************************************************  ************  ******* ****************************************** **************** ******************************  ********        **              ***         ***  *********                            * ****           *      *                                            ***     **    *  * *                   *                         **  *   *      *               *      
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[2520] PF03235            757                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF262:Protein of unknown fun  -------------1---------1-11-1-1-1---11-1----2--3--1-1--11----3----3- -21-12112222-11---------1--------1-11-21-1211111----1--11---2-2-11-12-12444311-1-3------2424-1------2321-2--------------------3-232--1--1211---5-1532745-----------2-22657-------------1---1---1------1-1------2------1--2211--22--11---1--1-1------------1-1---111-1--1---1-----1--1---------------------------------------------11-11-----15--1-----112-11-221-11-13213-1-----11142--3--1-----1--1----1-112------------12-131--3-1----11--1-1--1221---1--1211-111111111-2----------------1----------------1--1-1------111211-----11-1-1--1-11---1---3--12-31-21112211-11------1-1-1--22---1532--1------1------11----22---1--2211-229397686493--1--23-2121---12-131--11313--1-2111---42--------1----11-332-222----2-2112131-1-------11-1122-----1-11-------1---1-------111-11-1--1---------------1-1---1------13--222112-125-------2-14--21112-1---------1-114343441------1--------1-1----11----------------1--1-1-211-----11--1122--1--21111--1-1 -1---1--1---1132-1------------1---------------21-1-1-1--------------1------11112---------122-364--121111-1--4322111-1---1-1-11-------------------------11--------1311-1--1--21--412412122----11--2---11
 ction DUF262                                *         * ** * * *   ** *    *  *  * *  **    *    *   ** ******** **         *        * ** ** *******    *  **   * * ** ** ******** * *      **** *      **** *                    * ***  *  ****   * *******           * *****             *   *   *      * *      *      *  ****  **  **   *  * *            * *   *** *  *   *     *  *                                             ** **     **  *     *** ** *** ** ***** *     *****  *  *     *  *    * ***            ** ***  * *    **  * *  ****   *  **** ********* *                *                *  * *      ******     ** * *  * **   *   *  ** ** ******** **      * * *  **   ****  *      *      **    **   *  **** ************  *  ** ****   ** ***  *****  * ****   **        *    ** *** ***    * ******* *       ** ****     * **       *   *       *** ** *  *               * *   *      **  ****** ***       * **  ***** *         * *********      *        * *    **                *  * * ***     **  ****  *  *****  * *  *   *  *   **** *            *               ** * * *              *      *****         *** ***  ****** *  ******* *   * * **                         **        **** *  *  **  *********    **  *   **
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 ferase family 25 (LPS biosynt                                     **  *  *                          *             *                           *            *                                ***         * * * *                   *    *                         *  *  *   *                              *  * * * *      * *       ** **                              **              *                                    *                      *   ***         *                    * *                **   ************        *** ******  ***   *    **     **         **  * *            * ****    *                 *  ***       *       * ** *  ***  *  *   *       *   *******                             *****     **   **** *********       **        *     ***      * ***      *  *      ***  ***       *         * *     *   * **                    *    *  ***********             *    *********************** ***    *     *       **** *** * **     ***    ********    ** ******* **                                                     ** ***   *************      *** ****     ***** *   ******  *      *      *     **   ******      *      ********************** *************************************** ****** ********  * **** *  *
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 KAP:Kinesin-associated protei  ---------11---1---------1-----------1------------------------------- ---------------------------------------------1-------------------1--------------1--------1--------------------------------------------------------12---1----------------1--1---11----------------------------1-----------1--------------1----------------------------------------------------------------------1-----------11---------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------11-------------------------------------1--------1--------------------------1----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1---------------------1111---------------------------------------------------- -1--261-1--1234-22-13233233332433233243433232313-2223211121-21121----1--1-1----2-111121121312-111211111451-233965545445666481665-2-5-666425452494453544437355423662643482142254-3239-1-2116621341749263
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 on-system coupling protein DN    ** ** * **** *  **  ***   ***   **        *  *        ****  *** *  *  **   **                      *   ** * ***   * ** **  **    *    *** *        *    *  ****   *     **                    *  *                ******   *          * ****              *      *   * ** ** *** **     *      *          *         *    *   * **  **               *                                      *            *     *                    *  **     * **** *   ****** ***** * * ** *  *   *      *   * *     *  **** *   *      *  *** ****************        ************************ ****     ** **  *    ****       *** **  **  ******** **  *  *   *      *** *   *  *  *   *   ** *   *   * *        * * * ********  * *  ** *        ***   * **  *  *    *  *      ** ****     * **     ****    **** ** * **   ***   *  * **** **  *   * **       **           ****  *         *    **   **         *** ****  ** ****         * **   *    *** * ***                             *    ****   ***   **      *       ** *         *              * *   *                    **      *  *       *   *  *            *     *     *  *    **  *        **  ** *     *                *   * ** *** **   ****   **      *  * *      * 
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