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Ranking of HM:PFM:REP : from 2601 to 2700

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF423:Protein of unknown fun  --1--------------------------1----1---------1----------------------- --31-----1--------------------------1---11111---------1-------1--2---------1------------11-1--------112112122--------------1-1-----1------1----1-3121111-1----1---1--11121------------111-----111222222222232233121111213211212112221113122221222222222111111-------1--11----------------------------------------1---1-------------------------------------------1------------------1-21111-----111121112111111111111111-11111121-11-2111121212111112--1-1--1---11111111-1111121---------1----11---------------121111111-11-1-1------1-------------------------1------------1-------111-----1-------1-------------111111--1------------------------22112311211121121212112211111111---1--1------12111112121111122-1111121111211122111232111114212321233211121111111111-111111111211---111111----11112111-21-11112--121111111111121121111111111121111111111-1221111111111111111111111---111-111111----------------------------------------------11-1 ----21--633-1132212-2----------------------------1-131--1-1-11------1----1-----1------111132211411121-2123111-122111-1-11111131123-2-121-11-2-211-1--122-11---1---12111211121322-1-------8111211211232-
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 IML2:Putative mitochondrial o  ------------------------------1-1--1-1-------1---------------------- 1-1----------------------------------------2--------11--------------------------------1111------------1-11-------------11111---11-11-1---------1-112-----1---------1----11-------------------1-----------2----2-----------------1--111----------------------3-1-----------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----1-------------1-------------1--------1--------------1--1-----------------------1-1----------------------------------------------------------------------------1--------1-------------------------------------------2-1--12--2---1-111--1111-----1------------------------1--11----1-1-----1-----11------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------12----------------11----1-------2-------------------1------2---2211-------------------------------------------------- ----231-622-3122122332252211111113231------2322132121411111111212111-34321234334222231243-2213351221132327-3-647250395645544375265-321496475653545756758267344434323325-2361524-223--31--3221224--31321
 uter membrane protein                                        * *  * *       *                       * *                                        *        **                                ****            * **             *****   ** ** *         * ***     *         *    **                   *           *    *                 *  ***                      * *                                                                                   *              *     *             *             *        *              *  *                       * *                                                                            *        *                                           * *  **  *   * ***  ****     *                        *  **    * *     *     **                  *                                                                                              *                                   **                **    *       *                   *      *   ****                                                       *** *** *************************      ************************* ******************** **************** * ********************* ************************************ ******* ***  **  *******  *****
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 nknown function (DUF885)          *                          *                    *    **      *    ***********   ***    *   *      *********   **************  ***********                               *** **                        *          *                *    *                **     *                            * *   *****                   *                        *            * *                                    * ***** *     **    ***   *          *         * *****                **                         **    *      ***    *   *          **   *                               *****            ** *    ******  *                *   *        *                       ** *         ****** *   * ***** *               ** *  **** *******************   *                                                    *                                          *           *                *******                      **            *          **************  *  *****                 **           * *       *  * * * * ** **** *   ****   ***       ****  *********    ******       * *  *      * ** **              *    *     * ** ******************** * ******** *** ************   * **     **** * *   * * * **** * ** * 
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 Spt5_N:Spt5 transcription elo  -------------------------111---------------------------------------- -------------------------------------1-------------------------------------11------------------------------1-----------------1----------------------1--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------1----------1----------1-------------1-------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1------------------------------------------------------------11--------------- 2212523-412-1225236311141424354-2524133343323152-211212132253423432213351322211223328521189323281113354953-25553462452228943563666-41763433663423254328356442231287857364483311151631431265431061335361
 ngation factor, acidic N-term                           ***                                                                              *                                     **                              *                 *                      *  *                                                                                                                                                                                           **           *          *          *             *       *                                                                                                                           *                                                                                                                     * *                                                                                                                                                                      *                             *                                                            **                ******* *** ******************* **************** ********************************************************* *********************** ********************************************************************
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 PI3K_C2:Phosphoinositide 3-ki  -1--------------------------1--------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1---------------------------------------------1---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-11----------------------------------------------------------------------11-1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1----1----------------------------------1-------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1--572-4123121-11111111111111111111111111121222111323-1211111211111-1111211111211111111112112121111131-1--52722023937877098978387-8-872777975894788981543707848163537553264652-1-18-1-112232112--1533-
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 DUF26:Domain of unknown funct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     178 02       
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 cosamine deacetylase                   ******                *                    *              *  ***                                                                                **************  ******** ***************************          *************************************     ***  *                           **                 *                                                                                      *            ***          *    *   *        **************  ********************** *******************************************************            *************    *     *****************************************************************   ***********  ******************* ***********************************************************  *****      ***************** *******************************************************************************************************************************************************************************   *              *                           ****     *   *              *                                               *      *                          *  * *  *       *     *** * ******   *** **     **       **         * ************** ** ***** 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 P2X_receptor:ATP P2X receptor  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------1---------------1--------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1-----------------------------------1----------------1----------------------------------------------------------------------------------1-------------------111----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1----2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-----------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------1------------------ ----261---1-222------------------111-------------------1-----------------------------------------------1---21-60388392887009748131-9-41859895207740102077288858--1-122----1-146---41665-----1-----41--2
                                                                                                                                          *               *                                                                                      *                                                          *                                   *                *                                                                                  *                   ***                      *                                                                                                                                                                                                          *              *    *                                                                                                                                                                            *    *                                                                             **                                   *                       ***   * ***                  ***                   *                                               *   ** ******************** * **************************  * ***    * ***   *****     *     **  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2636] PF11712            711                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Vma12:Endoplasmic reticulum-b  ------1-------1-------1---------1-------1--------1--1---11-------1-- ------1------1-11-------------------11---------1-------1-----1--1-123--1--------------------11------1-------------------------21111-1--1----1-11-1-1-12-----------1----1--1-------------1--1---1-111111221222111-1111-2-1--1----------1--11111111111111---1---1-----2---1--11------2-----------11111-111111--------1------1---111--3211----2--1-231----1---------------------11-1--2--1----1-------1-----1------------------------1-----1-2-1-----1---2--------1--------1---------------------11---------1--------1---------1---------1-------111---------------1----------1----------------1-------------------------1--------------1-1111211--------11---1-21-------------1-----2---2---------1-11-3-2112222221-1211111111122112113---11--12222222221212123111-1--11----------------1----------1---------------211222221------1111----------1-----------21----------21-1-----------------------111-1---1-2----------111---------------1---------- 2-22533-81-21112121-2231-1144311212213234432223221121223331211111123121221211121111111132-111-221112211341-13544444211233321421216-3-424111152211223123112432221-23624-5-34141212-112111122544144123151
 ased factor for assembly of V        *       *       *         *       *        *  *   **       *         *      * **                   **         *       *     *  * ***  *                    **      *                         ***** *  *    * ** * * **           *    *  *             *  *   * *************** **** * *  *          *  **************   *   *     *   *  **      *           ***** ******        *      *   ***  ****    *  * ***    *                     ** *  *  *    *       *     *                        *     * * *     *   *        *        *                     **         *        *         *         *       ***               *          *                *                         *              * *******        **   * **             *     *   *         * ** * ********** *******************   **  ******************** *  **                *          *               *********      ****          *           **          ** *                       *** *   * *          ***               *           * ***** ** ******** **** **************************************************************** *** ************ *********************** * *************************** ***** * ******** *********************
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[2637] PF06743            711                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1                                                                                                       1           11 2 2 1 111    1            1                      33 211111              
 FAST_1:FAST kinase-like prote  ---------------111-------------------------------------------------1 --------------------------------------1--------------------------1---------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1----1----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1------1----------------1-----------------2----------------------1------------------------------------65----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1----------------------------------------12--1----------------------1----------------------------------------------------1--- 47111---2-42--1---------------1----1------1--------2-1---------1---11------12122----1------1--11-----1--11--4197059638545443516375-14308767605484564638652786641111613242231118-4691545451151----8-2--2
 in, subdomain 1                               ***                                                 *                                       *                          *                                       *                                                                       *                                      *    *                            *                                                                                                        *                *      *                *                 *                      *                                    **                                                                                                                *                                                                          *            *                                                                                               *                 *                                        **  *                      *                                                    *    *****   * **  *               *    *      *        * *         *   **      *****    *      *  **     *  **  ********************** ******************************************** *************    * *  *
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 dent synthase, N-terminal dom  ** * ***********        ********                    * *** *  ***     *    * ************ * **********    *****  **** *     ** ***    * **** *******    *******          **   *****                       * *        ****     **     *    *    *                    * *************************   **  ******** *******************    ***  * **  **    * ******    **************             ********* *                **          *  *   * *       *  * *  **        *  *****  *               *    ***                                    *** *  *                                * **********************************  *** * **    **** ****************          *  ****  *     *         **** *****  *       ********** ***   *******  ******* ***** ** ************************ ************* ************************************** **************  ******* ***** *** * * *******          *******************         * *************          *****                                *      *          * ****        **  *** *** ************************************** ********************** **************************** * *  *            *   * *  *                *     *    ** *       * ***     ********** **** 
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 Activator interacting domain     *                     *                                            ***                                                  *                          *  **************  ************************************        * **   *   **                                  *****************************************                   * *    *     **      *           **       *                              ************** ******* *   *  * ********** **    *******     ************************ ***********  ** ************** *****  *        ********                              **************************************  *********************** **** *************************************** *** ******************  ********************************  *****      ***************** **************************************************** ************   *     *********               ************************* ***         *****************************  ************  * **                           *        **** *   * *           *     *    ****          ***            *      **           *     *          *   *        *** * ***     *    * *   *         *       *** * *  **   * * *    *      *   **** **  **** 
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 lutaryl-coenzyme A synthase N        **         ****** **************  * ****** *****       *  * **     *       *           **          ****                          * *               *     *  *     **   *                              *            *                   *                  **  *********** * **** ****      *** ****** ******************************************************************************************* *             **  *    *             **         *               **                         *     *                 *      *             *                *************                      *     * **** *  *                        *                                    *    ** ***       *** *                   *                           * *          **** ************ ******************    ** *** *********************** ************ *******                                                        *    * *            **                    ************  *                                    *    *  *** ******************************** *************************** ********************************************** ************** ***********************************************     ****************
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 FliH:Flagellar assembly prote  ---------------------7------1--1---11---------------------1--------1 1111-----------11----1--1------1--------11--2---1--1-1------2-1-1------------------1-1-11-----------1-1---11-222222222222221-----------1--1-----1-1----1-----------1-1------------------1-----1111111111211111111111111111111111111111111---------------11----1-------------------------------------------------------------------11112222221131321--2111111--1111111112111-112111--1221111-------22111111211------------11112111--1-----1----1----11111-1111----------------121------------------1-------------111211113222432222111213334131222211--222113121--121111211211-------111-11121-1111111222311111111122121-1-11-1-111112111111111212----14-111211211211121311123122221---112111111121111111111111111-1211211111112-11--11-11122111111111111111111---111111333333233232---------1111--211------------------------11122121221211111111---------1122311111333111122322223------111111111111111111-------111----------------1-111--111-1-- ------------112--1------1-1--------1----------12---1-2---------------------------111-1-----1--11-------1----13-1-----------1-----1----1-----------------------2-1-1--2--------4----------1-1111--------
 in FliH                                             *      *  *   **                     *        * ****           **    *  *      *        **  *   *  * *      * * *                  * * **           * *   ** ***************           *  *     * *    *           * *                  *     *******************************************               **    *                                                                   *****************  *******  ************* ******  *******       ***********            ********  *     *    *    ***** ****                ***                  *             ************************************  *********  ************       *** ***** ************************* * ** * ******************    ** ***************************   *************************** ************* **  ** ***********************   ******************         ****  ***                        ********************         *************************      ******************       ***                * ***  *** *               ***  *      * *        *          **   * *                           *** *     *  **       *    ** *           *     *    *                       * * *  *        *          * ****        
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 GspH:Type II transport protei  --------111111-----1---1----------------------------1--------------- ---1----------------------------1111-1---11-------------------1-------------------211--1---------------------------------------------------------2-1211-1--------1--1-112--------1-----1-1211-1-------------------11------1-----1-------------------------11-----1------------------------------------------------------------------------------------------11---121----2-----------3-21111-------124------------------1-111121---2--1-----1-------112-----1-1----------111-1----------------------------------111-1---13111122222222222232223335454113452243352324522121114-1-11111111322-213122--21111-----2--2-----2121-------------------------11323443213334344434345533434333--13534------2-11---1111122212-1111112111121211221-1-11-------------------2111----1-11--1-----11--1411111333322321---------------22222122211143563444411133222111111111-11-1333333223244444443233333-----1---------------------------------------------------1-- -----11-1-1---1--1------11----------12121------------1-------------------------1----------1----11----1-1---1-11--11-1-------12--11--------1---1-----1---------2----2-311--2-----1-1--11--31-21--11-2---
 n GspH                                 ******     *   *                            *                   *                            **** *   **                   *                   ***  *                                                         * **** *        *  * ***        *     * **** *                   **      *     *                         **     *                                                                                          **   ***    *           * *****       ***                  * ******   *  *     *       ***     * *          *** *                                  *** *   ***************************************************** * *********** ******  *****     *  *     ****                         ********************************  *****      * **   ********** ******************* * **                   ****    * **  *     **  ****************               ************************************** ** *************************     *                                                   *        ** * *   *  *      **          *****            *                         *          *    **    * *   * **  ** *       **  **        *   *     *         *    * ***  *     * *  **  ** **  ** *   
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 Yippee:Yippee putative zinc-b  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------1--1-------11-----------------------1----------------------------------------1-2----------------------------------------11-----------------311------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11--1------------------1----------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1211421-313-2121222133332212221222211----3122342222312222222222111111112122113111222-212135423443332241444-34256875646652465665756-7-76736846665347754655655756588445435355254412223---430996206215566-
 inding protein                                                                                                                 *  *       **                       *                                        * *                                        **                 ***                                                            * *                                                                                                                                          *             *                                                                                                                                                                                            * **  *                  *                                        *                                                                                                                                  *                                                                                                                                                 ******* *** *************************    ******************************************* ********************* *********************** * ***********************************************   *************** 
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