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Ranking of HM:PFM:REP : from 3301 to 3400

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 rt protein family                                                                                           ***                                 **                 **  ***     *      *     **                                             *****                                     *            *************************** ******   *   ************************ ** ** ******** *  ********* *   ***  * ****                      *            * **   ******** * **    *  **  *** *    *         * ***        ***********          *  ************ *    *     *          ***                                           * ******     ****      ***         * *   *****       **                       * *                                              ***     * *       *      **                ***************** **************************************************** ************                ******   **************          **** ********          **************                                                       *     ***  **** **        *    ***               *              *      *                 *           **        * *          *     ****** ********* *** * ****  ******  *  *  **   *   ****        *          *         *  *
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[3303] PF04376            541                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ATE_N:Arginine-tRNA-protein t  -1------------------------------------------------1----------------- -----------------------------------------------------1------------1-11---------------------------------------------------------------------------1-1-------------------1---------1-------------1-------1---------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1----------------------------11-----------------21111-----111111111111111111111111-11111111111-111111-121111111111111111111111111111111111---------1--------------------1111-1111111111111111111111111111111111111111211111111111121111-------111111-1--1-1-----1---------------11--1--1-111111-1-------11-11111121111111-1111111111111111111---1111------------------------------------------------1-------------------------------------------1---------1111----------------1-11111--21111111111111111111----------1111111111111111111111111111--1---1111--------1----------------------------------------- ----111-----111112-111-16-2211121111-11111111112111-1-111121111111111112211111111222111111111-22-111-1111---1121111--11-1221351316-2-43311112-1111111-111412114265111123133262111-16-11--12241211------
 ransferase, N terminus          *                                                *                                                                       *            * **                                                                           * *                   *         *             *       *               *  *                                                                                             *             *                            **                 *****     ************************ *********** ****** ************************************         *                    **** **********************************************************       ****** *  * *     *               **  *  * ****** *       ** ************** *******************   ****                                                *                                           *         ****                * *****  ********************          ****************************  *   ****        *                                              ***     ****** *** ** ********** ************** * *************************************** ** *** ****   *******  ** ********** * ******** ******* *************************** ** **  ********      
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[3304] PF05443            541                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1 3114 2                                                                                                                                                                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                                                                       
 ROS_MUCR:ROS/MUCR transcripti  --1----------------------32-1-------1-1--------1--1----------------- --------11---------------------------1--------------------------1---1--------------------------------------------------------------------------1-------------------1--1-------------------------------1---------------1------1------------------------------------------------------------------111---11-11-----------------------------1------3-----------------1-1-------------------333211111212111111111111111111111-67112765192142111231115333221----------1111111115443832----------------------11------12611----------------------------------------------------------------------1-2---3331825441315211113------14--------------------1---1----1----------------1--------------------------------------1--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1-1-1--1------------------------------------------------2---------------1----------------------------1------------ -1------1--1-----------1-----1------1-------11--12--1--1----21--------1-1----------1--1------2---11----1---1-3211221-11-212----218-1-932-1-11-11111--12-----1-3-1-1222-131-111---1---1------3-11---4--1
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 DUF294_C:Putative nucleotidyl                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         6                                                                                        
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  domain                                               *            *                                     ****** ***      *   *       *** *     *                 *     *               * ***            ****                   *** * *** *******    *      *                              *  **   **                **        **          **                                                                                                                         **   *    *      * **           **   *                * ********             **  *   * ********             ***                                 *           *                *      ******   ****    **   **          *** *  **** * *** *******  *****   *                   *****  ** ** ********** *************    ***      *    *                               * *    **                                                   ****            **        **** *****************         ***************   * **         *                                                      *           * * **    *              *          ***  *  **     * *   *   *  *                         *   * **  ****** **                                 *         *    **         * *     **  *     ** * 
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[3310] PF03588            541                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Leu_Phe_trans:Leucyl/phenylal  -------------------------------------------------------------------- ---1-------------------------------------1111--1--------------11------------------1--1-----1---3---1111111112---------------11-1111111111111---1-21111111111-----111111111---1--------111-----------------------1----------------------------------------------------------1------------1-------------1-------------------------------1------------11---1--1------1--2---------------1-2111-----11111111121111111111-1-1-11111221111111111111112111-1111111112111111111111111111------------------------------11111111-1111111111111111111121111111111111111111111111111211111111111111121111111111111111-------1-111111111--1-111111---------11112111111-1111111111111111111111111--11111-1----11221111111111111-111111111111111111111112111111111111111111111111111--111111111111--11-----111111112---------------11111111111111111111111111111---------11111222221111-11111111121111--1-111111--------1-------------------------------------1-11 12--1-1-512---------1--------------------1-1--12-1-----------------------------------------------------111--1--------------1------------------------1-------1-1---------125-2------4-----1--1-1-141111-
 anyl-tRNA protein transferase                                                                          *                                     ****  *              **                  *  *     *   *   **********               ** *************   * ***********     *********   *        ***                       *                                                          *            *             *                               *            **   *  *      *  *               * ****     ******************** * * ************************** ****************************                              ******** **********************************************************************************       * *********  * ******         *********** *************************  ***** *    ***************** ***************************************************  ************  **     *********               *****************************         ************** **************  * ******        *                                     * ** **  * * ***         *                    * *  ** *                                                     ***  *              *                        *       * *         *** *      *     *  * * ****** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Cmc1:Cytochrome c oxidase bio  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1------1--1-------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------111-1--------------------------------------------------------------------1--------------------------11------------------------------------------------------ 3211211-6451231422-222221-143234423313333334444544343454334433322222233123212111322222121153262423331--252-17361442213433444252626-4-432322344331343234335163433-1242212112331214221452431244321312-1-1
 genesis protein Cmc1 like                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                        *                                               *      *  *                                                       *                                                                                                                                 *                                                                                                       *                                                              *                                                                      *** *                                                                    *                          **                                                       ******* ********** ****** ***************************************************************************  *** *********************** * *************************** ********************************** * *
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 PTH2:Peptidyl-tRNA hydrolase   1111111211111111111111111-111111111112111111111111111111111111111111 ----1111111-11-----------2----------2111----1--------1-1-------1111111--------1--------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------11---------------------------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------------------------------1--1--1---------------------------------------------------------11----1111-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1--------------------------------------------------1-------------------------1------------1--------------------------------------------1----------------------------------------------1-----------1-2------------------1----------------------------------------------------------1----- 2312112-73352231111111111111-1111111122221111112111111-1111111111111-11121111111111111111-1312221222112223125352246423212431423638-51546112-333343311-51231334223-3424233412232422243223354551541132313
 PTH2                           ************************* ******************************************     ******* **           *          ****    *        * *       *******        *                          *                                                                                                                                                                          *         **                                                                     * *                                                                                 *  *  *                                                         **    ****       *                                                                                                       *        *                                                  *                         *            *                                            *                                              *           * *                  *                                                          *      ******* ******************** ************************* ************* ******************** **************************************** ******** ********* *********** *************************************
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 plementing protein             **************** ****** ***  *                        ************** ******************* **************** *******     **       ****  *******       **********                    ***************************************     ****************************** * *****   *****  *               *               *                          *                                                              **** ******* *  ********* **** *****************  **    *     *                                             *  *    ***      **************  *******************************                                                            *            *    * ************************ ******************************                                                  ******     * **** * ***   *        **                                                  * *                                            *                           *        *      * **********  * **                          ********** *    *  **     *  *              ****          *     * * *  *                            *     *   *  *  * ***   *   *  * *          * *   *                 *         *  *  ****             ***     ** * 
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 HgmA:homogentisate 1,2-dioxyg  --------1111111--------------1-------------1-----------------1---1-- 11111---------111----1--11-----111112111-1-1---1------------111-122211------------------11----------21113-1-1--------------------1-----111-----1----------------------------------1--------------221221121222112-1----221-------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1--1111-------1111--11111--------------1--11-11--1---11111111-1---122----111--------------1---------------------------------21-111111111111111111111111111141112--11111-----1-1-------11-----------1--1-1------1--------------111112------1----------------------1--1---1-1-11111111111111111-1---1----------------1--1111111-1-11-----111-11111------1-------------------------------------------1-----1111--1-1--------11---------------1-11111111111111222-------------211111111121111111111------1--------------------------------------------------------1 ----112-----11131324222232411112211112222111211114376644321211---------------------------2-111------1-1211-111312121121-1111331117-2-11112211113-111-113111111111213123311-21221121----1111213211122221
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[3319] PF11721            539                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 Malectin:Di-glucose binding w                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1463 51       
 ithin endoplasmic reticulum    -------------------------------------------11----------------------- 4-9-----------------------------------------12---1----1-----------------------------------13--------1-17----2----------------------------------3---------------------------------------1-----------------------------------------------1-11---------1----------2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----3----------------------------------44-64-3-------------------------------------------------------------------------1-1---1---------------------------------1--1-------------------------1--------------------------12------------1------------------------1---------11---------11-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5-- --11-18-------1------------------------------------1-1------------------1----------------------------1--1-----221111211-2111211111-11214211111111-1111111-111112342311121111122---------92959-714-1----
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 Topoisom_I:Eukaryotic DNA top  --------------------------------------------------------1---------11 --1-1---------1-1----1---1------11111----1---1---11-111-----111-1-----------------------------------1-1-111-2--------------1------------------------------------------1---1-----------111----------------1------1----1------1----------------------------1----------------------------------------------------------------1------------------------------1-----------------------------1--1------12111-----------------1-1111111112---111111111111-----1-1111--------------1----------------------------------113---11-11111111----1111-------11111---11---1--1---1----11-1-----------111-1-----------------------1111-1--1-----------------------------1----1-----------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1--------------11---------11-111111111112111111-1-11--11---------------1111111111-------------------------------------------------------------1-1 1211111-311-12111511131111111121111121111111111112111111111111111111112111111-1111111111112211111111111211-21324486442212242542436-3-63322322423312322331523235124512114120221121-151111121151371222112
 oisomerase I, catalytic core                                                           *         **   * *         * *    *   *      *****    *   *   ** ***     *** *                                   * * *** *              *                                          *   *           ***                *      *    *      *                            *                                                                *                              *                             *  *      *****                 * **********   ************     * ****              *                                  ***   ** ********    ****       *****   **   *  *   *    ** *           *** *                       **** *  *                             *    *                                                                             *                                                      *              **         ** ****************** * **  **               **********                                                             * * ******* *** ***************************************************************** **************************** *********************** * ******************************************** *********************
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[3325] PF07744            538                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1  1 1             1                    11                                 
 SPOC:SPOC domain               ---------------------------------------------------------------1---- ---------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1----------------------------1-11---------1-1-------1---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1------------------------------------------------------1---------------------------------------1----------------------------------------------- 11---11-1---2221-111111111111111121211111111221111111121111111111--1-1-1111111-1-2211-111111-1121-1--11111----47887484565475294154-739696446766253643373495765434362503733838221-21111123254916---11-2-
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 FdhE:Protein involved in form  11---1-1----1---2-111111-111211---1----------------111----------11-- 132-----------1---------------------1----3-2--1-1--------1-------11-4---1------111-1---------------------1-1--------------------1--------1--111-1-------1111------1--------------------11----------------------------1----------------11---------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------1--2---111-112-11---8-----1-------11--1111--2---22----------1-----1113-1---------1---111-----2-----1-11111111----------------------------------------1--1----1221111122211112222121321-1---2-12--121-------3----31------------1--21-123252343-13111-1113222-3321--------------1---------------2-2---1-1222--1322--22-----------------11111111221111111-211111121121111111111111111111111111111111121121111--111111111111---------------11-111111111111--1-------1--1-11112-1--11112-1------------11------1-111221-----------------------------2----------------------------------------- 1-11112-1--1--1----1----1--------1--1-1------------332--------2--11--11----------221-----1-1---1---1-11111-1312--1--2-12-12-141414-1-214-21-111-1---1-2-1--1-1----1-12-----1-1132--4123-11213--111421-1
 ate dehydrogenase formation    **   * *    *   * ****** ******   *                ***          **   ***           *                     *    * *  * *        *       ** *   *      *** *                     * *                    *        *  *** *       ****      *                    **                            *                **                                 **                                                                                *  *   *** *** **   *     *       **  ****  *   **          *     **** *         *   ***     *     * ********                                        *  *    ************************* *   * **  ***       *    **            *  ** ********* ***** ******* ****              *               * *   * ****  ****  **                 ***************** ***************************************************  ************               ** ************  *       *  * ***** *  ***** *            **      * ******                             *                                          * ***** *  *  *    *    *        *  * *            ***        *  **  **          ***     * *   *   * ***** ****  *  * ** ** ****** * *** ** *** *   * * *  * *    * **     * ****  **** *****  ****** *
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[3327] PF04478            537                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                               1                                                   1                         2          
 Mid2:Mid2 like cell wall stre  ----1--------1------------------------------------------------------ -----------------11-1-----1--1------------------------1--------------1-------------------------------1--------------------------------------------11----------1--------------------------------------------1-1---------11--------------1----------11------2--1----------------1--1----------1------------------------------11---------1-----------1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-11----------------------1-------1---------------------------------------------------2-----1111-1---------1-------1-----------------------------------------1-------------------------------------------1--------------1-----------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1--1----------------------------------------------------------------------11--1-----------------11---1--1--1---1----1--1---------------------------1 --2113---1--21-23336664144322123234233233332330543445434235223-23112132111422133221113-1-16135172321112313-2-3753343-231112-752212-21112-11111122-111-11-215213771169-1-2-22222-3-----1--2641481111132-
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                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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  C-terminal all-alpha domain         *                        *                 **                     ********** ***** **  ************************ *********  ***********       ****                      *                             *         **                   *                * *      *                 *  *   *              *                    *   *           **     ***                                             *                                                *  **** *           * *  ** ***   **       *  *   ***********       *     *               *                                 *       ******     ****      * **  *                 *          *             *          * **  *      **                      *      **      *    **   *   ** ****                            **     **    *    *    **     *     *     *   **      *  ************                 **            * *   *           *         * *           ***   *  ****      *           **                                                             *           *                        * ** **  *    * *            *       *            *              *       *           **   *** *      *     *   *       ** * *        ** *   *** * * *   * * 
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[3335] PF05138            534                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PaaA_PaaC:Phenylacetic acid c  -------22--22241--------2----------------------------------------1-- ----3--2--3---2--11-1----111111-1---344431-111-2----222223--224-3343241---------1-2---------------------3-------------------------------------------1---12-----------1--1-------------22222---2------------------2--------44--2-------2------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------2--------1------------2-1-----1-----3343--32333--------------1--61-----1-----3---22-2-1-233-----25--------2----1----------------------------------2--222233222324233422442222222367563--22332---3112331------1-----------652----------------------------13-------------1-------------------------2-1111----------1--2--------------------2---2---22--222---2-2-----2--2222--------1----------1-2-----------------------1------------1-2----1-1-----11-22222-----1-----22---2222-------------1---1--------------------------------------------------------------------------------1--2 --------1------1-1-----1-1-----------111111---------1---1---------------------------------------------1--1---22-1-1-6111111141-117-1121221-1111131-1-11-1111113----11111112--6---1-2--------1----------
 atabolic protein                      **  *****        *                                        *       *  *  *   *  ** *    ****** *   ****** *** *    ******  *** *******         * *                     *                                           *   **           *  *             *****   *                  *        **  *       *                                    *                                                                                  *        *            * *     *     ****  *****              *  **     *     *   ** * * ***     **        *    *                                  *  *********************************  *****   *******      *           ***                            **             *                         * ****          *  *                    *   *   **  ***   * *     *  ****        *          * *                       *            * *    * *     ** *****     *     **   ****             *   *                                                                                *  *         *      * *     * *           ******         *   *                                             *  *   ** * * ********** *** ******* ******* * ** *******    ********  *   * *        *          
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[3336] PF06544            534                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                        
 DUF1115:Protein of unknown fu  ---------------------11-----------1--------------------------------- ---------------------1-----------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1--1----------------------------------------------1---------------------------------------------11---111-1------------------------1----------------------1---1-------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------12111---1211-1--1------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------1----------------------------------111-11-11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------- 2132122-411-21223342222231111211111111111111111131233322212122111111-1111211111111111111124133343331343221-15223443733434444952638-4-447434643442444434554375456722633333211132-22232112131323222312211
 nction (DUF1115)                                    **           *                                                       *           * *                                                                                                                   *                                                                 *  *                                              *                                             **   *** *                        *                      *   *                   *                                                                                                         ***                         *                                                                                                               *****   **** *  *                                                                                                      *****      *                                  *** ** ** *                                                                                                    ******* *** ******************************************************** ************************************* *********************** * ****************************************** ***********************
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[3337] PF03198            534                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                                                                  1111 
 Glyco_hydro_72:Glycolipid anc  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-------------------------------------------------1------1----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1------------------2---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-------------------1----------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1----- ----------1----6776577688765544444455564454455675643325455555687467552654455658555555544445172101111-11233--112------------------------1-------------------------12111-------1-----1-2-----1-6111156481
 hored surface protein (GAS1)                                                                                                                                                                                *                                           *                                                 *      *                *                                                                                                                 *              *                  *   *                                                                                                                                                                                                                                    *  *                   *                                                                                        *                                                      *                                                                  *                                                                       *                *    ************************************************************************************* *****  ***                        *                         *****       *     * *     * **********
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[3338] PF09788            533                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Tmemb_55A:Transmembrane prote  ----------------1---1-----1---1---------------------1--------------- -1---------------------------------------1------------1--------1-----1------------1-----1-----------1-----1---------------------------------------------------1-----1-------------------1----1------------------------------13------------------------------2-----------------------------------11111111111--------------------------212111111-1-2---1111--1-------1211--------------12---------------1-1-21--------------------------------------------------1-11111111---------1-----------------------------1---111111111112----2211------211221111111--1---1---1------1-----------------11---1-----1--11-1-112--1--------------------------------111---1-23-11--1--2--111---112----1--------1-2111-2111222222-122222222212222222112222211-211-111111-1--111222212-1111111111111112------1111---1-1111111111-2223----------11----111111111-111---------111111111112111----------------1------------------1-------------------------1------------ ------1-42212-----------------1---12----------1--11----1211--1--11---------1---------1-----1---2-----3--2--11-44462432314123232223-3-322222224322132423333221241211225131313221------1---2-13--1--3332-
 in 55A                                         *   *     *   *                     *                 *                                       *            *        *     *            *     *           *     *                                                   *     *                   *    *                              **                              *                                   ***********                          ********* * *   ****  *       ****              **               * * **                                                  * ********         *                             *   ************    ****      ************  *   *   *      *                 **   *     *  ** * ***  *                                ***   * ** **  *  *  ***   ***    *        * **** ********** *************************** *** ****** *  ********* ****************      ****   * ********** ****          **    ********* ***         ***************                *                  *                         *                   * *****                 *   **          *  **    ****  *  **         *         *     *   *     *  *  ** ******************** * ******************************************      *   * **  *  **** 
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[3339] PF10331            533                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 AlcB:Siderophore biosynthesis  -------------------------111---------------------------------------- ----3------11-12111-11--2111111211111-12-2-121-1-11-2212----551-1-1547------------1----------1------1---11---------------------------------------3--112--------1--2--121-1------------111--------11111--1---1----1111-11---------------1--------------------------1------11------------------------------------------------2------1---------------------------2----11-----------1-----1---1----1-1112-1---1------------1---1----111--1--121321214111--112------------------11--------------1--11--1------------1----111-222222-----22-2------21-1-1--------1--1---1-------------------1---3--------1--------1----1-----------------------------------------------1111---1111-1--1-1---1---------11----1---1---11------1-1-11-11---11-1-1---1--1--------------111-1111---22322212222---1-----1--1-111----------------1122112---11--1-1-1-111111---1---------211-------------------------------------------------------------------------1-------1--- ------1--1----1-3224342333222222213333434333334233444533342443----------------1-------122---321-11---13-----2--2--31-11--112121-23---122---12-11-11-1-11-111--1------1----1--11-22-72--11-1-23-2--1-1--
  protein domain                                         ***                                             *      ** ***** **  ************* ** * *** * ** ****    *** * ****            *          *      *   **                                       *  ***        *  *  *** *            ***        *****  *   *    **** **               *                          *      **                                                *      *                           *    **           *     *   *    * **** *   *            *   *    ***  *  ************  ***                  **              *  **  *            *    *** ******     ** *      ** * *        *  *   *                   *   *        *        *    *                                               ****   **** *  * *   *         **    *   *   **      * * ** **   ** * *   *  *              *** ****   ***********   *     *  * ***                *******   **  * * * ******   *         ***                                                                         *       *          *  *    * **********************************************                *       ***   *** **   **     *  *  ** **  ****** **   ***   ** ** ** * ** ***  *      *    *  ** ** **  ** * ** *  * *  
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 -lactamase                     *** *** *******   * ***                                                                                                        **             **                        *     *           *                                                                                                                  *              *  *                         **                                                            *  *                                                                                                                                 *                         *                                                                                                                                            *                                                    *      *   *                                         * ***** ***  *                                                                      *                                                                                       **  *** *** ******************************************************** ******** **************************** *********************** *********************** *************************************** *** 
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 iated transmembrane protein (  **   *            ** ** *  *                     *   * *               * *************** ***************************************************     *    *                           *******        ** **         *      **       **  *    *                          *  *************** *   ****     * * ** * *                     ** **         **  *                                                                                   ***  *           *   ***       ***   * *  * * * **    ******** *  *  *** **   * *                    *    *                           * *     *  ***    **   ***  **  ****   ** *      *      **    *  **           **    *   *          * *  ******* *  *                      **  *     *  *     **  *  * *      ***                                           *        *                         *   *    ***                                 ******          ** ******   *             *     *       * *****                                                          *  *                 * **  *  * **    * **      * * *  * ** *   *  **            *               ******      **** ** ****   **  * *** *** * * * **** *** ** *    ** * **  *  ** *   ** **  ***  ****** * **** 
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[3358] PF05255            530                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 UPF0220:Uncharacterised prote  --------------1------------1----------------------------------111--- --1---11111-------------------------11---1------------1-----1------------------------------1----------1---------------------------1--------1-----12--11--------------------1-1-----1-------1-1-1-11111111-311111-1----111-1-1--1-2221----111111-1111111-------1-1----------------------------------------------------------------------111--1-1----------------1---1-------------------1--1---1-1--11------1-----------1--------1--1---------1-----1-------11-----------------------1---1------------------------11-----111-11-111111--11111112-----1-1-------------1-1-----------1----------11--------1----------1----------11-----------------1---------1--1-----1--------------1-------------12----1---1--------------------------11121--1---------------------------------------------------1---1-----------1--1-------------------1-1111-1-1-----------11-1-111-1-------------------1---11---------------------------1-------------1-------1-- 1---211-42211111211111221112211-112111112211112211221112211221111111111-1111114211111111112222111211111344-18281533122432254422540-4-34333113234334333514222233211212-121213221-21-----132345132-121111
 in family (UPF0220)                          *            *                                  ***      *   *****                         **   *            *     *                              *          *                           *        *     **  **                    * *     *       * * * ******** ****** *    *** * *  * ****    ****** *******       * *                                                                      ***  * *                *   *                   *  *   * *  **      *           *        *  *         *     *       **                       *   *                        **     *** ** ******  ********     * *             * *           *          **        *          *          **                 *         *  *     *              *             **    *   *                          *****  *                                                   *   *           *  *                   * **** * *           ** * *** *                   *   **                           *             *       *   *   *** *********************** *************************************** ********************************** *********************** * ******************************** ********* **     ********* ******
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[3359] PF12158            530                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3592:Protein of unknown fu  ------------------------2--2-111----1-----11------1----------------- -34-5-1211211141111-13--2212122212221233---1211--23-142-----113--216531--------1-1----11--1--------12-1-511----------------1-------1---13327---1-5122--11-11------1---111-------------2-1----3--1-1-11-----1-11-----2---1--------11------------------------------------------1-1-1-111-------3--------------------------1------------1-----------------1-1-1----------------------2---1-----------5231-1-111---------------------12-----21-------11--------------------------2---------------------------------1-------13335352----222-1111--432---1---1------1---1--------11----------21--9----2---1----1-1---111--1-4--1------------------------1--1--13-------111--111-1-121---1--1-2-1---------1---1--212111----11111111-11-111111111-----------1--------1---------1--------------2-----1111-11--------------11-----------1-11-1-1-13-----1--1-------------111-1--1--111-1---1-------13221112------------1------------------------------------- 1-1-21--644-1-1---1----1--1--1111--1---------112--2-1----2------------31-----1-1-----------1-1-11----1--1---175--1-2131----1-1-1-2-1--24------1-1---11---------21-1311-22----11-1-1----1---1323--11412-
 nction (DUF3592)                                       *  * ***    *     **      *                   ** * ************* **  ****************   ****  ** ***     ***  ******        * *    **  *        ** * ***                *       *   *****   * ****  ** **      *   ***             * *    *  * * **     * **     *   *        **                                          * * * ***       *                          *            *                 * * *                      *   *           **** * ***                     **     **       **                          *                                 *       ********    *** ****  ***   *   *      *   *        **          **  *    *   *    * *   ***  * *  *                        *  *  **       ***  *** * ***   *  * * *         *   *  ******    ******** ** *********           *        *         *              *     **** **              **           * ** * * **     *  *             *** *  *  *** *   *       ********            *                                      * * **  *** * *   *    *  *  ****  *         ***  * *    *            **     * *           * * **    *  *   ***  * ****    * * * * *  **      * *   **         ** **** **    ** * *    *   ****  ***** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3360] PF06161            530                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF975:Protein of unknown fun  ---------------------------3-----------111-11211--------1----------- --1-1--------------------------------1-------11-1------11---------112------------2------1123-2--------121-------------------22112-----21--11---1-1-11--2--22------1112-11---------------------14-666662453445373------537-----46222222-5-22212122222222-1-21223-441-62322114542232-222222111112211111-111111111111111111133---2221-12263333333-3-11--2332--21-221--------1-----1------1111----------------------------------------1--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------1112-----------------------1---------------11-------1-2---------1------------------1--11-------------111-1-----1-------------------------------------------------------11------------------------------------------------------2-1------1--------------------2232---12----1--1-----------1-------1-1----------------------------------1-1-------------------------------1------1 ----1-------11-----1---2----------1--------111-1--1----------------------------1111-1---1-------------11----124-----1--2--1-3213-5-1-313-1--12111-2-1-11-111-12-14----11--213---------1--1----1---1----
 ction (DUF975)                                            *           *** *****        *              * *                                *       ** *      **         ***            *      **** *        ***                   *****     **  **   * * **  *  **      **** **                     ** ***************      ***     ******** * ************** * ***** *** ************** ****************** *********************   **** *********** * **  ****  ** ***        *     *      ****                                        *                    *                                                                                             *    *        ****                       *               **       * *         *                  *  **             *** *     *                                                       **                                                      * *      *                    ****   **    *  *           *       * *                                  * *                               *      *     *       **     *   *          *        *** *  *                            **** *   *             **    ***     *  *  * **** * * *** *  ***** * * ** *** ** **    **  ***         *  *    *   *    
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