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Ranking of HM:PFM:REP : from 4201 to 4300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4201] PF00214            405                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1 1             1          1                                                          
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 GRP / IAPP family                                       **                        *                  *                                                                                                         *                                     *      *     *                          *                                      *       ******* ******* **                                                                                                                                         *                      *                                                                                  *                                 *              *   **     *            *   * *      *        *   *                *                      *                                                          *                     *                                                        *                   *      *     *                              *        *       * *                                                         *    *       *   **  **  ** *   ****  * *  * *     *  * * *        *                  **     *  **  * *   *      ********************** * **************************   **  ***  **  **  *  * ****  *    *** 
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 tein A N-terminal motif                          *    *     **                                           *     *                     ***       *        * *       ***                                         *         **                  **  **       **        * *   *     *     *       **                  *                  *      *               *       *  *           *    *                                                                                              *    * * *         *   *                 *  * *      * * * * ****           **              *                                *                   *               *  *  * *         *    *         *         *     *          *    *  *                          *  ** ** ************************             ***************** **************************************************** ************  *           * **   *** **** ***         *    * **** ********          **************                                                                              *       *     *  **           **  ******   *  *      ****    *  * *      *  **   *   * *  ***            *     **  *   * *  *** * * *    *  *       * *         **** * *    **      *  **           
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 iated plasma protein-A                                      *                    *               *              *                         **       * ** *       * *                 *       ***        *********                  *        *       * *     *    **  *    *       *   *                                              *   *                                                                                                                                                                                                                                                                                   *    *                                  *                         *                   *   **** *                              *      *  * *         ** * **                                                                                                               *         *          *       *     *  *                              **           ***    ******                                                         *     **************       **********   ***************** *                      *  ******      *  * ** ******************** * **************************   ***  *     *  ***    *   * *  **  ** 
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 d archaeal DNA primase, large    ******************************************************************                                                                    **                           *                                                *                       *                            *                 *      *                                                                                                                 *               *                                                                                                                                                                                                                                                         * *        *         *                     *          *                                                           *                                              ****                    *** **               *                                                *       * *                           *                   ******* ***************************************************************************************************************  ********* * ******************************************************************
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[4219] PF03398            403                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      111 1        
 Ist1:Regulator of Vps4 activi  ----11--11111--1-------------------1-------------------------1------ --------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------------------------------------------1-----------1-----1----------------------1-------111--11----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------1-------------1--------------1-----------------------------11----------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------1-------11-1-------1-------------------------1---------------------------------------------------1------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1----------------------------------1-1------------------------------------- 12--32--312111111212122212222222222322222332221111211111111111111111-1111111112211112111113212321111111152-12243541221221141112317-112122111211112142122332211312-35111211-22-12-1151111130181631111121
 ty in the MVB pathway              **  *****  *                   *                         *                                                                                                   *              *                                                     *           *     *                      *       ***  **                                                                                                          * *      *             *              *                             **                                              *  *                                                                                   *       ** *       *                         *                                                   *      *                                                                                                      *                                    *                                                                     *                                  * *                                      **  **  ************************************************************ ************************************* *********************** ****************************** ******** ** ** **********************
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[4220] PF08411            403                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Exonuc_X-T_C:Exonuclease C-te  -----------------------1---------------------1--------1-----1------- -------------------------------------1-------------------------------------1--------------------------1------------------------------------------1---21------------1-----1---------------------------------1-1-1-----------------1---1--------------------------11---------------------------------------------------------------------------------1----1-----1-------1---------1----------11--1--1---------1----------------------11------------------------------------1-----------------------------------1----------1-----------------------------1111111111111111-----1--------11------1-1---------1----------------------1111--------1---------111112111111111111122211111211-------111--111112111111111111-1111121111111111111111111111121212112111111111111111-111111111111111-11111----1-111111111111111111----------1111111112111111111111111111-111111111111111111111111111111---1----------------------1------------------------------- -1----------1---------1--12-11---1-----------------1------1------1---1--------------1------1-2-1------------1-423122331--222222224-2133622-142132-2111111211213---22-1----1--11-1--------1--111---2-1--
 rminal                                                *                     *        *     *                                             *                                     *                          *                                          *   **            *     *                                 * * *                 *   *                          **                                                                                 *    *     *       *         *          **  *  *         *                      **                                    *                                   *          *                             ****************     *        **      * *         *                      ****        *         ******************************       ***  ****************** **************************************************** *************** *****    * ******************          **************************** ******************************   *                      *                                 *          *         *  ** **   *                 *      *      *   *              *      * * *            * *********  ********* ******* ****** *************   ** *    *  ** *        *  ***   * *  
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 n of monoamine-oxidase A repr                                *                                   *                                                                                                                                                    *    *                         *                           *   *                                                                                                                                 *            *                     *           *    *                                   **                                                                                         *  *                             *    *                      * *          *                                           *                          *             *                                                                 ************                                                                           *          *                                                     *                      ****  * *   * ************* ******************** ***********        *                  ******* * * ** *   ********************** * *******************************     **  *  ***************** *  **
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[4231] PF04979            402                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 IPP-2:Protein phosphatase inh  ----------------------------------1--------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------11------------1---------------------------------------1- 1111321-511-1123222222424322223232223232222222132111111223324311112111111111212121111211211223112222-22213--6332111231232242842435-3-2441-1263234132434112-21142-131113723134311222111-222353211112231-
 ibitor 2 (IPP-2)                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                             *                                          *                                                          *                        **                                                                                                 **            *                                       *  ******* *** **************************************************************************************** *****  ********************** * **** **************** ***** ********************* *************** 
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[4232] PF08361            402                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 TetR_C_2:MAATS-type transcrip  ------------------------------------------------------------------1- ----------------1---------------1-----21---3121-----1----------------1------------------21---1---------1---------------------------------------2-1--111------------------------------------------------112111---2-11-------1-----------1----------------1--1-----------------------------------------------------------------------11-----1---11-------------------1----1---------------111-----1-------11--111111111111-------------3222111221111----------------------------11---------------------------------------23231221122222122222223221111--1111-112121211111-2122111111111-11-1-1-----3--1--1--------1--------1----1--------1-------------11--2--2-1--111-------------------1--------22211212222222222-2222222222222222222222111112222222222212121122111121-111111111111----11111-----1-1------1-------------------1-22211111211112333-------------------1----12---------------1----------------------------------1--------------------- 12------1-----1----------------------------------------------------1------1---1-----------1----1--------1------------1-1-------------------------------11---1--------1-------22------1---1--1-1-1------
 tional repressor, C-terminal                                                                     *                  *               *     **   ****     *                *                  **   *         *                                       * *  ***                                                ******   * **       *           *                *  *                                                                       **     *   **                   *    *               ***     *       **  ************             *************                            **                                       *****************************  **** ************ ************* ** * *     *  *  *        *        *    *        *             **  *  * *  ***                   *        ***************** **************************************************** ************    *****     * *      *                   * *****************                   *    **               *                                  *                      **      *     *                                                    *      *   *           *    *        *            * *                               **   *        *       **      *   *  * * *      
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4233] PF11711            401                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1                                                                                                                                                                                                  
 Tim54:Inner membrane protein   22---------------------------1--1----------------------------------- ---------------------------------------------1------------------------------------------11---------------11-11---------1111----------------------1----------------------------------------------1-----------1-----11-------------11------------------------------------------2-----------------------------1111111111111-------------1------------1---------1--11-------------------1----------------------1---------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-------------------1---------1------1-----------1-------------------1----------------------------------1-------------------------11--1-1-------11-----1-------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1-----------------1--------1-- -211212-1---12114421221111212421211111123212234213211122211231311112121111232-3213432211211342354125451133-1334112-1212122--43-515-3122521--21-21-11-11112--1-121231--21-3-5511-11-7-1------4111121221-
 import complex subunit Tim54   **                           *  *                                                                                 *                                          **               ** **         ****                      *                                              *           *     **             **                                          *                             *************             *            *         *  **                   *                      *                                                   *                                                                                                *     *                   *         *      *           *                   *                                  *                         **  * *       **     *             *             *                                                                                                                                *                          *                 *        *    ****** *   ***************************************************************** **************************** ******* *******  ** *** *******  ** ** ** *****  * ******  ** * **** ** * *      ********** 
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 DUF2079:Predicted membrane pr  ---1---4------1-1--------1--------1-------------------1122---131--1- -13331----1----------1---------------111-11-313-133----11----1--2--3-2---11-------------1-----------1-212-1-----------------------------1174---11-22122111--3221321111--14-21----2-----------------1---------------------------1-----------------------------1-------1-11-------------1111221--------------1111111111111-11---1111----1------1-----------------1-----1---------------11-----------2-1--111---1---1-1-1-----------1-------1--------1--1---1-1-----------------1--------------------------------1----11----2211------------------2--1--------1-----------------11---------2--3---1--11-----------1--1-1-11--2----11-----1------------------1---2-11--111--1--2-1-12----------------------11-117---1-121------11--411111------------1-1--------711-11-1------------------------1111--11--------1-11----------------------11----------------------1-------11-1---------------1-2234321------------1-------2---------------1--------1111 -1--2-3-11--------------21-22---11----1----111-1--11-1---2--------------------2------1--------21---1----1-11--21111-----1-11-111-9-2---2-11----1-------------12-1-2-1-11-1-------------2-1-211----1--1-
 otein (DUF2079)                   *   *      * *        *        *                   ****   ***  *   *****    *          *               *** ** *** ***    **    *  *  * *   **             *           * *** *                             ****   ** ********  **********  ** **    *                 *                           *                             *       * **             *******              ************* **   ****    *      *                 *     *               **           * *  ***   *   * * *           *       *        *  *   * *                 *                                *    **    ****                  *  *        *                 **         *  *   *  **           *  * * **  *    **     *                  *   * **  ***  *  * * **                      ** ***   * ***      **  ******            * *        *** ** *                        ****  **        * **                      **                      *       ** *               * *******            *       *               *        ****  *  * * **              ** **   **    *    *** *  ** *   *                    *      *        **   *    * **  *****     * ** *** * *   * **    *             ** * * * ** *             * * ***    *  * 
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[4235] PF04780            401                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1           1                                       1          11 1                1   2        
 DUF629:Protein of unknown fun  -------1--------------1--------1-------------------1-1-------------- --------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------1-----------------------------------------1------1-------1-----------1-----------------------------------11------------------2--111111111111111-1--------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------------------1--1-------------------1-------------------------------------------------------1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1------------------------1 21-22-2-1------2--3-----11-111312----------1-11214125311--211-----12------------------1--12---21---1-1-8-5-113654636--1-12-241-2-3---13212112112-1-21-4124102124335852451646522-32---1--24028-2---32-11
 ction (DUF629)                        *              *        *                   * *                             *                                                 *                                        *                                         *      *       *           *                                   **                  *  *************** *                                                                                *                                                                                                                                                           **                                                                                                        *                    *                  *  *                   *                                                       *  *                                                                                                                          *                                                   *                        * ** ** * *      *  *     ** ******          * ***********  ***     **                  *  **   **   * * * * *********  * ** *** * *   *********** * ** ************************* **   *  ***** *   ** **
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Cadherin_pro:Cadherin prodoma  11------------------------------------------------------------------ -11---------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------------1---------------1-----------------------1---------------1-------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1--------------------------1---------1----------------------------------------------1----------------------------------------------------1-1---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-----------------------------------------------------------------1--------------------1--------------------------------------------1--1------------------------------------------------------------------------ 1----1-------------------------------------------1---------------------------------------------------2--1------1580114754544605144-1-38047550572336655845534347121-12---11-441-----------1--------1--1-
 in like                        **                                                                    **                                                                                                   *             *                                            *               *                       *               *             *                                                                                                     *                  *                          *         *                                              *                                                    * *   *                                                                                                                                                                                                                * **                                                                 *                    *                                            *  *                                                                         *    *                                           *                                                   *  *      ******************* * ***************************** **   ** ***           *        *  * 
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 DUF2296:Predicted integral me  1-------111111------1----11---1--1------------1---3------1-11------1 -21----------1------------------1---------------2---------------------1----------1---1-------------------------------------------------------------1-----------------------------1---------------12-22-1--11111---------1-------------------------------11-------------11----------------------------------1-------1--------------------------1-1-1-------------1---------------------1-----------1-----1---------------------------------------------------------------1--------------1-------------------------1-----------------------------1-------------------------------------1--------1--1-------1-22-----------11-----------------------------------1-------11-----11-1-2--------------------------------------------1-------------------------1-1-1-------------------------------------1--------------------------------------1211--------------11---------1--1-----------------------1-----------------------------------------1------- -1--13--42-1221212121112121211132111111111111112122222-1113232111111111122111-1111111111113212111111121139115-4532235111121-431315-115331--24323222--33224121121113121-411411-21---2-----445313----1-1-
 mbrane metal-binding protein   *       ******      *    **   *  *            *   *      * **      *  **          *                  *               *                     *          *   *                                                             *                             *               ** ** *  *****         *                               **             **                                  *       *                          * * *             *                     *           *     *                                                               *              *                         *                             *                                     *        *  *       * **           **                                   *       **     ** * *                                            *                         * * *                                     *                                      ****              **         *  *                       *                                         *         *  **  ** ******************************************* ********************** ******************************* ************* ****** ******  ********  ***************** ****** **   *     ******    * * 
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 DUF563:Protein of unknown fun  --------------1----------------------------------------------------- --1-----------------------------------------1---------------------------------------------1--------------2-1---------------------1---------------2--1---------1----------1------------------------------------1---------1--------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------1-----1---1---------------------------1----------1-----------------1--11111111---1------------------11--------------------------------------------------1-------------------1-----------------------------1----1-1------------------------------------------------------------1---------------------------------1--1-11------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------1----------------------11----12-1------- -----22-21-1121------1---------------------1------1--1--2------1-------------------------------1-----2-2-2-23262422243223432642024-6-066312122333122313317332223585132211141144-111---1233381-953-1---1
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 TFCD_C:Tubulin folding cofact  -----1-1----------------1---------------------------1-----------1--- 1------------------------------------1----------1----------------------------------------------------1----1-----------1------------------------1------------1----------------1----------1--------------------1----------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1-------1------------------------1--------------1-------------1---11-1------------------2----------------------------------------------------1-------------------------------------------------1-------------------------------1---------------------------------------------------1---1----------------1----------1-----------------1----1-1------------------1-------------------------------------1------1-1--1----1-------------------11----------11-1----1-------------------------------------1----------------1----------1----11111-11-------1-------------------------------------------------------- -1--213-33111111111111111--11111111112211112112431221122222333-51---1---1131----------22111211211111-32122-4153321121222111121-333-21226221-12232-111134-22232231112243323512121231-23221-2-21131122132
 or D C terminal                     * *                *                           *           *    *                                    *          *                                                    *    *           *                        *            *                *          *                    *                                                                                  *                                     *       *                        *              *             *   ** *                  *                                                    *                                                 *                               *                                                   *   *                *          *                 *    * *                  *                                     *      * *  *    *                   **          ** *    *                                     *                *          *    ***** **       *                                                          *  *** *****************  *********************************** **   *   ****          ************** ***** ******************* *** ******** ***** ****** ************************** ***** * ***********
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 Hydroxy-O-Methy:Putative hydr  --------1--1-------------11--------1-------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------1-------------------------11--------------------------1----------------12-----------1---------1-------1----------------------------------------1--------1------------------------------------11----------------1--------------------------1-------------1---------------111------------1--------------------------------------------------------1------1-----------11----------------------------------------1----------------------------111-111-------1----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1111111111-111111111111111111---------------------------11111---1111111-1111---1---------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1------------ --21211-21222211211-1112121211111313-11111111131121213-1111111111111-11111111211111111211-5221132223213221-14141442212212222223236-2-2231221213221232-2322132123411121111112212-1117111111112-11113632-
 oxyindole-O-methyltransferase          *  *             **        *                                                                                                               *                         **                          *                **           *         *       *                                        *        *                                    **                *                          *             *               ***            *                                                        *      *           **                                        *                            *** ***       *    *                                                                                                                                        *                  ********** ******************                           *****   ******* ****   *                     *  *                                                                                         *                            *               ***** *********** **************** ***************** ************* ******************** **************** *********************** * **************** ************************* ************* ******** 
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[4264] PF02252            398                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1   1                                                                     
 PA28_beta:Proteasome activato  --------------1-------------------------------------1--------1------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------1--2----------------------------------------------------------------1-------------------------11111-311112--22-----11------------------------------------------------------------1111---------------------------------------------2------1--------1-------1-------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111----------------------------------1-----------------------1-------------------------22------1--1----------------------------------1-1---1111111111-1111111111111111111-----11------------------11-11-1---11111111111----------111-----------1------------------1----------------------------------------------------------------11--------1----------------------------------------- 1111131-4113--2--1--------1----------111111-----------------------1-----------2----2-----132-112-----11221-12314634322224333612530-6-546343534344244334237431445441122211122121---------------11232922-
 r pa28 beta subunit                          *                                     *        *                                                                                                          *  *                                                                *                         ***** ******  **     **                                                            ****                                             *      *        *       *                         *                                                                                                                                                                    ***                                  *                       *                         **      *  *                                  * *   ********** *******************     **                  ** ** *   ***********          ***           *                  *                                                                **        *                                          ******* ****  *  *        *          ******                       *           *    *     *** ***     ***** *********************** * ******************************************               ******** 
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[4265] PF02747            397                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 PCNA_C:Proliferating cell nuc  33333323222322231222222111111111111111111111111111111111112111111111 --------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1---------------------1-----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-------------------------------11-------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1-----------------1----------------1--------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1------- 22222211622111221111111111111111112111-111121111111111111121111111211111112111121111111112411221222222211211113111121112111-11-112-2-111-1-11111-1121112131311111-21112311711-111227211222232-211121111
 lear antigen, C-terminal doma  ********************************************************************                                                                                                         *                                         *                     *                                                           *                                                      *                               **       *                                                                                                                                                                                                        *                                                                            *                                                                          *                 *                *                    *                                                                                                                                                                *            *        ************************************** ************************************************************************************ ** *** * *** * ***** **************** *********** *************** *********
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[4266] PF07940            397                                                                                                                                                                                    1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 Hepar_II_III:Heparinase II/II  ---1-------------1------1--1---------------------------------------- -14-1------1-------------------11------1-111151------1--------------4-------------------1261-1-----2--1-2-3-1------------------------3---------1-1--1------------------------------1-------------11111--1---1-1-------1-1------3-------41-------------------2---11----------1--------11111------111111111111111111111111-11---111--1-----------------1-223----------------1-----2---1--111111111212211111111111111111111-22222122111-122223122311112122111111112111111111111211------------------------------111111------1-----------1---------1------1-1--------1---12---------------11---1---1----2--------2----11-12422---------------------------1----1--111------1---------------1--1-------1---------------------------------------1-----------------------------111111111111-----------------1-------------------------1--11-------1-------------------------1-2-111---------------1-----------------------------------------------------1-- -----21---1-----1------------11-1----111---------1----1-------------------1--------------1211111111--1--21-4321111112--1--1121----------1---11-11---1----------1111---1---1-13----11-1---222------1-1--
 I-like protein                    *             *      *  *                                          ** *      *                   **      * ******      *              *                   **** *     *  * * * *                        *         * *  *                              *             *****  *   * *       * *      *       **                   *   **          *        *****      ************************ **   ***  *                 * ***                *     *   *  ********************************* *********** ******************************************                              ******      *           *         *      * *        *   **               **   *   *    *        *    ** *****                           *    *  ***      *               *  *       *                                       *                             ************                 *                         *  **       *                         * * ***               *                                                     *        **   *     *            ** *    ***         *    *                   *              **********  *  ** **********  *  ****          *   ** **   *          ****   *   * **    ** *   ***      * *  
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 otein                              *                                                              *  **                                                                                    *      **    * *   *                *                     **      *     *                                 ***************      ***              *     * *                                          ***                                      **  ******* * *       *               *                          **      *                                                                *                             *                                                  *                                         **                 *         *  *         *            *             * *                                                          *                                                      ** *   *          *                                  *       *        **                  **  ** ***  *   *          *              *   ** ***   * * ***** ** **** *   *** * *  *      *******   *      *     * ****    * * *   **  * *        *******  *  **** ********************* * ******************************************   ***** ***** **   ****
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[4270] PF09445            397                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Methyltransf_15:RNA cap guani  ------------------------1------------------------111111111111-12---- ----1---------------------------1---------11----1----------------11111-------------------------------1----1-1----------------112211-1--2111----1---1---2--------------1--------------------------11111----1-1---------------------------------------------------------------------------------11----111---1-------------------------121--------------1111-1------------------11----1--1-----------2-------------------------------------------------------------11111111-111-----------------1---11------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1-1----1---------------1------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21-1----1-------------------------------------------------------11-------1-------------11------------------------------------------1------2------------ 1122111-2--22121111-11111111111211111111211211211111111121111111111111111111111111111111122112111311321142-11251212111211-12131612-2-113121241112111111112162112421-47211133432123-211-1111211612222322
 ne-N2 methyltransferase                                *                        ************ **         *                           *         **    *                *****                               *    * *                ****** *  ****    *   *   *              *                          *****    * *                                                                                 **    ***   *                         ***              **** *                  **    *  *           *                                                             ******** ***                 *   **                                                                        *                                                * *    *               *                  *                                                                                                                     ** *    *                                                       **       *             **                                          *      *             ******* *  ***