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Ranking of HM:PFM:REP : from 4301 to 4400

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[4301] PF10524            394                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        21 1 2   2 2                 1 1                                           
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 DUF2312:Uncharacterized prote  11-1111---------1-------2-----2--1--1---------1--------1-1------2--- --1-------1----------1--1------11----1-----------------------------1---------------------------------------1---------1---------------------------1-1-11---------------12------------------------111111--11-11--------1--2------------------111-------1---1----1---1----------------------------1---------------------------------1---1------1--1-----------2----1--111-2-----1-1------1111111111211321221111111111111113-4254344222111111111122211311111242361211111111112231221---11111--1111111111111111111-13111----------1---------------1----------------------------------------------11-----------1-1---1----1---------------------1--1--------1---------------1-----1-----------------------------1-1-1--------1-----31------------------------------------------------------11----------------------------------------11111--------------1----1-1---11--------------------------2-------1-----------------------------------1------------- -1---2--31-----2-1--1--1-------1--------------2--1-2-2-----------1----13-1---1-----1--------------22-----1----1------21-31232----1-----211-1---1212-1-1--1----11662-212--31-1-1-----2-1---211-421--22--
 in conserved in bacteria (DUF  ** ****         *       *     *  *  *         *        * *      *      *       *          *  *      **    *                             *                                       *         *                           * * **               **                        ******  ** **        *  *                  ***       *   *    *   *                            *                                 *   *      *  *           *    *  *** *     * *      ********************************** *******************************************************   *****  ******************* *****          *               *                                              **           * *   *    *                     *  *        *               *     *                             * * *        *     **                                                      **                                        *****              *    * *   **                          *       *                                   *               *   *  **     * *  *  *       *              *  * * *           *    ** *   *     *              **     *    *      ** *****    *     *** *   **** * *  *    ***** ***  ** * *     * *   *** ***  **  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4303] PF11174            393                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2970:Protein of unknown fu  ----1--1---11------------------11------------1------1--------------- -------------------------1------1-1-1312-112-1-1---------111121------------------1----1-------1---------11----------------------------1226-----2----1111--------1-------11------------1----------------1----------111---1-------------1-11111112111111-1-------------------11-1-----1-----------------------------------------------1-----------1-----------1---2---------1-----------21------------11-1-1-1---------------1---1------22-1----------1----------1---------1---1----1---------------------------------11112222221233322243223222222223111111211111112-11-1---11-1-----2-111----1---11----1------------1---------------1--------1----------111112-111111111122-1211111----1---------1---------------------------------------11111---11-1-1-------------------------------1---------111----------------1----------1--11111111111111--------1-----1--------1-1--------------11--111111----------1--------1-1---------------------------1 ----1-2---1---1---11---1------------1-----1---2--11-----11-111---------1----------------------------11-----3-563322---11111----1-1-1----1---31-11--1-1----2-111121-53131-1-1221-11---1---111111-2111---
 nction (DUF2970)                   *  *   **                  **            *      *                                         *      * * **** *** * *         ******                  *    *       *         **                            ****     *    ****        *       **            *                *          ***   *             * ************** *                   ** *     *                                               *           *           *   *         *           **            ** * * *               *   *      ** *          *          *         *   *    *                                 *********************************************** ** *   ** *     * ***    *   **    *            *               *        *          ****** ************ *******    *         *                                       *****   ** * *                               *         ***                *          *  **************        *     *        * *              **  ******          *        * *                           *     * *   *   *   **   *            *     *   *  **     ** ***         *                            **     * ******   *****    * * *    *   ** **  * *    * ****** ***** * **** **   *   ****** ****   
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[4304] PF09797            393                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NatB_MDM20:N-acetyltransferas  ------1--------------------------------------------------------1---- -------------------------------------------------1-------------------------------------------1------1--112---------------1-1----------1----------21----1-------------1------------------1---------------------------------1----------------------------------1--11---1--------------1-111----------------------------------------1----122221-1121------------------------------1---1----------------1---------------------------------------1----------1------------------------1----111----------------------------------------------------------12----------------------111-----------1----2--------------11--11--------------------1--------------1-1--------1-11---1------------------------------1-------1----------------------------------1----1--1----------------------------1-------1----------------------------------------------1------------1------------------------------1-11---1--------------------1----------1---------11111---- 1111131-211-1111212111111111111221111222311111123242332211111111111221111132212311111111131121111221211211124323432322111212232323-1-112221-13112111321-13222231111323521212111111112111121112321-2311-
 e B complex (NatB) non cataly        *                                                        *                                                      *                                           *      *  ***               * *          *          **    *             *                  *                                 *                                  *  **   *              * ***                                        *    ****** ****                              *   *                *                                       *          *                        *    ***                                                          **                      ***           *    *              **  **                    *              * *        * **   *                              *       *                                  *    *  *                            *       *                                              *            *                              * **   *                    *          *         *****     ******* *** ********************************************************************************************************************** * ****** *********** ***************************************** **** 
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 RusA:Endodeoxyribonuclease Ru  -------1------------------------------------------1----------------- -----1------------------------------1-----------2--1--------111------------1----1--111----11---------------------------------------------------1----1-------------1------1--------------------3----1-1----------1-11-1----------2-------2111-1---1221411-12-1---12--2---2--1---211-2211--1-----------1-2-1-1111-111-1-11----------11111121111122113111131-1-11--2-1---1---1-1---1--1---1111---------11---11-1------------2--12--1---------1---1---1-11--1--1--2-22222222-----1---------------------------------1---2---1---1--2----11-2-------1--1-----1----------1---1---1-123------------------1--------------------------1---1--2-------------------------------------------------1----------13---2-177315163119-12145114964111113-11----1---1121---1---12--3133443---------------1-----------------111----------1-2-2---------1-------1------------------1-------------1-------1122------------------------------------------------------------ -----1--1-----1-------------------------------1---1----------1----1-----1--------111-----------1----------------------1---------------------------------------------11------1---------------1---11-----
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 Peptidase_C50:Peptidase famil  -----------------1------------1-----------------------------1--1---- ------------------------------------------------------------------1---------------------------------1----11------------1111------------------------1--------------------11-----------------------11111-1---11--1-1------------1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1--1---11------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------11----------1---------------------------------------------------------------------111111-------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1----------------------------1---------------------------1-------------------------------------------------- -2112231742323211121212111122222212113235222221511422211111111111111-12111121-111-1221111151111112121411131121331321-3112131251214-2143332113212412124312131-2122211152111-222-1331221132211224121-2--1
 y C50                                           *            *                             *  *                                                                       *                                 *    **            ****                        *                    **                       ***** *   **  * *            *                                                       *                                                     *  *   **                                                                              *                                                         *                                                        **          *                                                                     ******                                                 *                                                             *                                                                         *                            *                           *                                                    ******************************************************************* ******** *** ********************************** ************* ************************* ************* *** ******************* *  *
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 TetR_C_3:YcdC-like protein, C  ------------------1-----------------------1--------11--------------- -1-----------1121--------1----------1-----1-----------1------------1--------------------------11-------------------------------------1---------1-1-1--------------------1----------------------------------1---------1--------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------2221------------------------------11--------1-1---1--1-11111-11114-11-12-1-21--211221111123---2-111223311111111111---------------------------------------21------1422225-222122532232-25142222--112-----11--52--1----------------------1----12-----2111-1---2112-----------1--------------1-------3--3-2---------------1------------------111--311111111111-1111111111111-11111222-----11-111111111111121111111--1--------------------------112---------------1111111111-244544444225343333-------------1-----------1----------------11--------------1-------------------------------1----1-- ------------------------------1----------------1-----------------------------------------------------1---------1-----------------------------------------------21-11131--------------------21----1-----
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[4308] PF07571            393                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                             1       
 DUF1546:Protein of unknown fu  ------------------------1------1------------------------------------ ------------------------------------1121----------------------1------------1---------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------1-----------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1---11-111-----------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1---------------------1--------------------------------------------------1-----------------------------1--1---------1------1-----------1--------------------1-----------------------111------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------- --1111----13221113211111111111122111111111111111111111112111111112121121121111111111111214121111111113311-1111623252-314-233642320-6-323-223312421333231132-11421323332511622231-118121-41364148112313-
 nction (DUF1546)                                       *      *                                                                         ****                      *            *                                                                           *             *                                      *           *                                                                                                                                        *                                       *   ** ***                       *                                                                                                                    *                                   *                     *                                                  *                             *  *         *      *           *                    *                       ***                                                                                                *                                                           ****    *********************************************************************************************** ********** *** ********* * *** ****************** ******************** ****** ************** 
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[4309] PF12243            393                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CTK3:CTD kinase subunit gamma  -------------------------1---------1---------------------------1--1- -1---------------------------------------------------1----------------------------------------------1--------------------------------------------1-1---------------------1-----------------------------11--------1-----------------------------------------11-1-----1----------1---------------1----1---------------------------------2111--11-------------2-------11--------11--------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1-----------------------------------------------1---------1------------------------------------1-------1-------1----------------1----------------------1--------------------------------------------1-----------------------------1-----2---1111-1---------------------------------------------------------------------------11---------------------------------1------------------ 221122--2---223-2221121312211121111112222221111-1122311121111111112211232122112222221122112123112123-81-22-1-1332112411121114415-9-22537112221221122-23-1922242--41136211112121-1----11--4437165--1111-
  CTK3                                                   *         *                           *  *   *                                                   *                                              *                                            * *                     *                             **        *                                         ** *     *          *               *    *                                 ****  **             *       **        **                                                  *                                                                                                                    *         *                                               *         *                                    *       *       *                *                      *                                            *                             *     *   **** *                                                                           **                                 *                   ******  *   *** ******************************* **************************************************** ** ** * ******************* * ***************** ** *******  ************** *    **  *******  **** 
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 SPC12:Microsomal signal pepti  ----1---1111111-----------1-----------------------------1-------1--- -------------------------1---------------------------2----112-----1--------------11--1--2--1--------11-1--1----------------------1--------1-----------------1------1--1--------------------------11111312-112321----1-211----1-1---------111111-1111111----1----1---------------1----------1---------------------------------------1-2--------------------1--------12-------1--------12------------------------------1----------1----1----------------------------------------------------------------------------------2---121---------------1-------11--------------1-------22-2--1---------------1--------------------------------------------------------------1-------------1-------1--------21------------1------------1------------1------------------1---------1------1-1-------------------1-1-------------------1---------11--------1------------1-1---------------------------11-------------------1-----------------1----------1---1--- 11-1321-4111222212--121-1-111112111-111111111113113112121111-11-11112111-2-121121112-111-1-11111--1-15-1--112132122111212212111214-1-22211111-1111121-21111131142-1352211112121-121321111621514312-1--2
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 tion DUF302                          * ********        **** ***                  *    * * *****     *** *  *       **    *  **     ***********          ***       * *   *             ********   *      * ** *                  *     ** *          **              *  *  **                 **   *               *           *   ** *     *                           *                                                                   ****  *                *  *          *          *  *      ** ** *     ****** ***    *  *****   *    ***    *  ***     ***        *      *                *              *   ****            ****            *        * * **  ** * ** ********    **  *  * **  *** ******  *****    *  *        *       * *****      *  **      *     *          * *                                                   ** *************            *  * ***            ****    *** * *     ** **  *  **                             **         ****    *         *** **             *                                    **           *       **    *                       ** *  *                                    ** ****            **   *                                              *  *      * **                *    *   
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 DUF3186:Protein of unknown fu  --------11--1-----1-----3-1111-2-1---1-----1--1--------------------- --1-111111111211111-12111111111131111123---1211-1---1-------1251113-1-1----11-----3----------------12-1-2----1-----------------------------1---1----------------------1-1--------------1----------------------1--1--1---1-------------131-----------------1----122---------32--------1-------2------------------------------------121--1111111-2--111---2---------2--32-1112-1111------11111----11111---11-2--------------1-------1--3--2-1------1--1--111111-----------------1111-----------------------------12-1-----2-1--111------1-2-----111--1-------122----1----21--------------1------1-1--------1-1------1----1-1------1------------------11--------2----------111------1--------------2---------------------------------------11-----------------------------------------------------------------1-----------------1--11-1--2-1----1222-----------112-----1----1-31311322----------------------1---------------111--------------------1-1 --------2-11---1-211--1-11-----------------111--11332111-22-1------------11--12--11-----1---------1---1--1--212--11---11-1112211-2-1-211--111-12111--111-1--11122--2-31-1-4-1---1--21----2--1----11--1-
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 MetW:Methionine biosynthesis   --------111111----------1-----2-------------------21---------------- --3-----111-------------11----------1------11------------1--1--1-----11-------------1-------------------1---------------------1----------------1-1---22------1--------------1--1--1-------------------2----1-111---------21---1------------------------1----1------1---------------------------------------------------------------1---------1-------------1------1-12-1---1----------11112-----2212111111111-11-11-1-1--11221112111------111--2112-------------1111111111111121------------------------1----11-1111111111111111111111111111121111111112111211311113111-121211111111211111--211-1--11----1-1--1---------1---1---------------------1211---11-------------111-----------111-----------------------1--------------------------1-----------------------------------------------------1111---------------11111121111122222112111111123---------1----11111-1-------------------1-111111-------------------------1---------------------1-- 1---11-1---1--1-----1111---------1-----1-------------11-1---4--------------1-1-1----------21--12---111---1----3--31------------3-6-2-31211-1--1---11-1---1---11---11--2--13--2----1-----1111--211---1-1
 protein MetW                           ******          *     *                   **                   *     ***             **          *      **            *  *  *     **             *                   *                     *                * *   **      *              *  *  *                   *    * ***         **   *                        *    *      *                                                               *         *             *      * ** *   *          *****     ************* ** ** * *  ***********      ***  ****             ****************                        *    ** ******************************************************* ******************  *** *  **    * *  *         *   *                     ****   **             ***           ***                       *                          *                                                     ****               *****************************         *    ***** *                   * ******                         *                     *   *   ** *   *  *     ****         *     *             ** *   *              * * *          **  **   ***   *    *  **            * * * ***** *  *   ** *   *   **   **  *  **  *    *     ****  ***   * *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 olase family 65, C-terminal d                                                          *    * *         ** *   *** **** ******************** *******  * *****   *** *** ***                 **         ** *** *                 ********* * ****        *                 ***                      *                  ** *        ********                      *** ** ********** **** ***                                            *  *    *      **    * *               *   ****               *    *                   ********                      *                    *                                 *  *                                          *  *              ******         * *   *             *     *                                   * *  *   *          *  *   * *        *   * ********** ***** ****** *****        * *                  ***** *                            *                                                                     *                                         * **    *   **     *        *           ***    *******************************  **   **   *  **  ***  **** ******           **       *        *       *         ** * ***        *             *   ** **      *          *   **      ** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4326] PF04568            391                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 IATP:Mitochondrial ATPase inh  ---1---------------------------------------------------------------1 --------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1---------------------1--------------------1----------------1-----1----------------------11-1111-1111121--------1-----------------------------------------------------1--------------1----------------------------------------------------1--------------1--1-----1-------1------------------------1--------------------1------------------------1--------------1------1-----------------------------------------------1------------------1-------------------1----1-----------1----1-----1-------11-1-11-----------------------------------------------11111-----------------1----------1--------------------1-------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------11----------------------------------------- -1--2-2-112-22611132111-112112222121333334413311112222121312112-11111-22-11223221--11-111-1213224231211124-13142221311123211121316-4134522112212-114114322-13121-211121622312111121112---2544224221--1-
 ibitor, IATP                      *                                                               *                                                               *                                         *                     *                    *                *     *                      ** **** *******        *                                                     *              *                                                    *              *  *     *       *                        *                    *                        *              *      *                                               *                  *                   *    *           *    *     *       ** * **                                               *****                 *          *                    *       *                                                                                                                                                                *        **                                           *  * * *** *********** *************************************** ***** ** ********  ** *** **************** *********************** ************* ********* ***** *********************   **********  * 
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[4327] PF05620            391                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF788:Protein of unknown fun  --------1111111-----------------11------------------------1--------- -----1--111------------------------------1-1-------1--------------------------------------2-----------1-1---1---------------1---------1-------1-----1---------------------1--111----------------1--------1----1---------------11------11----------------1-----1-------1---------------111------111111-11-11---------------------------1----1-----2------1-1----2--1---11---------------------------1-----1----------------1--------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----1---111----1---------------------------------------------------------2-------111-1-2-1---11--------------------1----------1---------------------------------------------------------1------1-----1---------------------------1--------------1-----1------------------1-------------------11-1-11-1------------1-------------------2------------------2-----------------------1---------1--- 3-11231-31111111111-111311111221111111-1111---441-12111221-111131111111112221121132111122-211213111112111-11427413442111-321332213-1-212-11-231111111-11-2113113612213241121211-21111-11111332222111211
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 DUF3707:Pherophorin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     03                     
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 SPC25:Microsomal signal pepti  ----1--1---1-------1----1---1--1-1--------1-------1-1-----1--------- --1----------------------1----------1------------------1-------1-----1----------------------------------1----------------------1-1--2-------------1-------------------11-1------------1-------1-------11-----12--111-----1-------11-----------------------------11-----11-------1--211-----1-----------------------------------------11----------1------1--1-1---------------------1----11--1---1-1----1------------------------------------11-----1------------------------------------1--1------------------1------------------------------------1------------------------------------------1-----1----12111-2-1--1-----------------------------------1--1------------------------------------------1---1------------------------------1------------------------------1111----------------------------------------11111-2--1-------------1------------------1-----2------11111-----------111------1--11-------------------------111-------------- 1-21241-4-121122122111111111111-11121111212111-11212121111111-1211111111211111111111111211121122212212111111-421311231122321111421-21122211221111111111111-21121111223112121121112-1221114275231221111-
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 DUF1943:Domain of unknown fun  ------1--------1----------------11-----------------------------1---- --------111---------------------------3-----------------------------------------------1-------------------1-----------1--------------------------------------------------------------1-----11---------1----------------------1----------------------------------------1-------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1---------------------11-11-1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--------------------------------------------------------1-------------------111-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------11------------------2----------11--------------1--------------------------------------- 111-2-7-3---11----1--111121-1-------1111111-12-1--11------1-1--1--------1--1-----111------1---1------1--3---1239319831211212244114-1-423112-2-11121111411-195302--5947646738144-111------51-2111--1212-
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 MAS20:MAS20 protein import re  --------------1--1-----------------------------1-------------------- ---------------------------------------------------------------------1--------------------11-----------1----------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1-2---------------11221-2211--1-----------1------------------1----------1-11--------------------------------------1------------------1-------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------11---------------------------------------1------------------1--1------1------------------------------------1-------1---------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------1-------------------------------1------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------- 1---113-1---11111331111111111212211111--111112122212233311-11121111111122131111122221412212211122121121333-2114653351113212333-717-425532411422361423421462323222-333224312233211--1-2------121-----4--
 ceptor                                       *  *                             *                                                                                          *                    **           *                                                    *                                                                 *                                                          * *               ***** ****  *           *                  *          * **                                      *                  *                                                                                     **                                **                                       *                  *  *      *                                    *       *                                                               *                                                        *                               *                                    **                                                                           *   *** *   **************************  ****************** *********************************************** ******************* *** ****************************** ***************  * *      ***     *  
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 NMT:Myristoyl-CoA:protein N-m  ---------------------------------1-----1---------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------1------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------21------------------------11------------------------------------------------------------------------------------- 13111111322211-1121111111111111111111111212111111-11121211111211111111112112111111111111116111121111111211117323633522132322762628-3-84034223322132222311523322121132211111132-111181111142141211124341
 yristoyltransferase, N-termin                                   *     *                                                                                                                      *                  *                                                                                                                                             *    *                                                                                                                  *                                                          *                                                                                                                 *                                                                   *             *                                                                                            *                                                                                   **                        **                                                                                      ************** ********************************** ******************************************************************************** * ***************************************** ************************
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 DUF2039:Uncharacterized conse  -------------------------------------------------1------------------ ----2---------1-----------------------11---------------1-----------111---------------1----------1--------1--1-------------------------------1--------------------------------------------------1------------1----1------1------------------------------------------1---11----------------------------------------------------------------------------1---------------11---1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-------2-----------------------------------1---------------------------------------1---------------1--------------------1------------------------------------------------------------2----------------------1-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----352-21331111----------111-------1--11-----2------121-1-------------------------------------2-1-----121-11152333317353354401966-0-08224446267245254525326422---3343-3352-452---1121---4112-3-1-1222-
 rved protein (DUF2039)                                                          *                       *         *                       **               *           ***               *          *        *  *                               *                                                  *            *    *      *                                          *   **                                                                            *               **   *                                                                                                                                                                                                                *                   *       *                                   *                                       *               *                    *                                                            *                      *       *                                                                                                                   *** ********          ***       *  **     *      *** *                                     * *     *** *********************** * **************************   **** **** ***   ****   **** * * **** 
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[4347] PF03285            389                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1 11        1  1 2   1 1                                                               
 Paralemmin:Paralemmin          -------------------------------------------------------------------- --1-----------------------------------1----------------------------------------------1------------------1----------------------12------------------1---------------1-------------------1----------------------------1---------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------1----------1---------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------1-----------------------------------------------------1111----------1--------------------------1--1-----1-2-----1--2111-1--------------------------------1------------------------1-------------------------------------------111--------------1---------------------------------------------------------------------------------------- -----1--1-1----1-1---11-----21111----221111---121----------1--1-11-----1--------------1------243--------1--32115370172243335264030-92269353-7337534443533836444----2131--1-11----111-----11-1-2-1-13-1-
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[4348] PF07396            389                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Porin_O_P:Phosphate-selective  -------------------------------------------------------------------- ----11------1-----------------------------------------------------------111--------122134456-211---2311-21222------------------------------------------------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1-32222-------11-11------------------22122-21--2---------------1-2----------66666666-1111-2-------------------1-----------1211-------------------------------2----111----1-1------13132---------213---12-------------33232141-332457----------------------1---122---2-24-21-1211112--11-2-13-32---24-3--------------------------------------------------------------------------------------------2---------3-------------------------------2232-1--211211---------------------------42565665552222----221111-----------------------------------------------321 -----2---------1----------------1--1---------1---2----1-1------------------------------1--------------2------------1----------------------------------------------1------1--1-----------11111--1--3----
  porin O and P                                                                                          **      *                                                           ***        ********* ***   **** *****                                                *     *                                                                                                 *                                                                                    *                         * *****       ** **                  ***** **  *               * *          ******** **** *                   *           ****                               *    ***    * *      *****         ***   **             ******** ******                      *   ***   * ** ** *******  ** * ** **   ** *                                                                                            *         *                               **** *  ******                           **************    ******                                               ***      *         *                *  *         *   *    * *                              *              *            *                                              *      *  *           *****  *  *    
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[4349] PF04930            388                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 UN_NPL4:Nuclear pore localisa  ------1---------------------------------1-------------1------------- -----------------------------------------------------------------1-----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1--1--------------------------------------1111--------------------------111-------------------------------------------------------------111------1----------1-------------11-----------------------------------------------------1-------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111-------------------------------------21----------------------------1--------------------- 1111311-1--1-112211122221221111112332333233112121222221-22112111111111211-1322122111111121-12111111-131121--412383333113--22311221-2123421-221221-22122124-2123241231419337--331-1181112122251511112111
 tion protein NPL4                    *                                 *             *                                                                               *                       *                                                                                                                 *  *  *                                      ****                          ***                                                             ***      *          *             **                                                     *                                           *                                                                                                                                         * *******                                                                                                                                                                                                    ********                                     **                            *                      ******* *  * ****************************************** ***************** **************** ******** ******  ************  ******** ******* ****** ******** ****************  *** **********************
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 nance system killer protein                                    *     *                              ***  *   *              *        *     * *   *  **   * *                        *       **   *        *  ***                  * **  *      *     ***   *           *  ** *       *               ******** ******      ***                     * *             *      * **                    * *                                                *                   **  **     *  *    *    ** * ** ****** *           * ***   ** ** *       * **** *                   ***  ***                                **       **          *       *    **   *      * ** *  **  * * *     ** *   ***     * *** ** ** * *       *                      *****    *  **            *  *       **  *      **    ********* *  ***  *******  *  *    ***           **   **  *   *  *             ********   *  **   *** ***** *       *   **    ** * ***  *              * ******       **  *******  * ****            *                          * *           *                   *  *                             *                                    *    *       *       * * * *       *   * *       *             *       * * **  **  *  *          *  **  *    
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[4357] PF09685            387                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Tic20:Chloroplast import comp  11--1-----------1------21---1-1----1211-1111---1-13----1-1111------- -22------------11-------------------1------11-1-1--1---1------1-------2----------12-----1----1-----1611131----------1-------------------11-1111--2132221111111111111111211111111111111----------1---------------1122--------2---------11---------------1-----------------------1---------3-------------------111---111----------------------------11-----1----1--------1-----------1--------------1-----11-------------1-----------1-1---------------------------------------4------1----------------1---------1----------------------1------1----------------------------------------------------1-------111---11----1--1---------------------------------1---1-1121-1-1111-11-1-1-----1--------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------2--11-----------11--------------1----------11------11------3----122----------------------------------------1------1-1 1--112--2---2131121111-11-1111111111-11111123232131-1111111111-------1-----1---1------------1-2-1111221212--51-------------------------------------------1-----31---2---11113--23333332338478-52111----
 onent protein (Tic20)          **  *           *      **   * *    **** ****   * **    * ****         **            **                   *      ** * *  *   *      *       *          **     *    *     *******          *                   ** ****  *************************************          *               ****        *         **               *                       *         *                   ***   ***                            **     *    *        *           *              *     **             *           * *                                       *      *                *         *                      *      *                                                    *       ***   **    *  *                                 *   * **** * **** ** * *     *                                            *                                                                                        *  **           **              *          **      **      *    ***                                        *      * * *  ***  *   ********** ** ********** ************** **********       *     *   *            * * **********  **                                           *     **   *   *****  ************** *****    
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[4358] PF08482            387                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HrpB_C:ATP-dependent helicase  -------1------11---------------------------------------------------- 111-11111111-1---------------------------1-11-1-----11111---11-1111112-----------------------------------1-1------------------------------------------------111111---------1-----1----111----------------------1----------------------11-------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1------------------2-11111-----1-11111121111---1--11-11-1111111111--1111111111111211-11111111111111111111111111------------------------------12111-----------------------------------------------------------------------1-1-1-111--111-111111112111121-2------------------------1--111111111111111111111111111111------1------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111-1111--111111111111--------------11-2-------------------------1111111111112113211---------1111111-111111111111111111111--1-11---------------------------------------------------11- --------1-----------11-----11-1-11111--------------1------------------------------------------1-----1--1---12----7-----1----11-----1-----------------------1-------1--1---------1217111-1---1-1--1----1
  C-terminal                           *      **                                                     *** ******** *                           * ** *     *****   ** *******                                   * *                                                ******         *     *    ***                      *                      **                                     *                                                                                   *                  * *****     * ***********   *  ** ** **********  **************** **************************                              *****                                                                       * * * ***  *** *************** *                        *  ******************************      *      ***************** ********************************************** ****  ************              ** *                         *******************         ******* *********************  * **                                                   **          *           **     ** * *****              *                                          *     *  *   **    *     *    **     *                       *       *  *         ******* *   * *  *    *
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 UMPH-1:Pyrimidine 5'-nucleoti  ---------111------------2531---------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------1---1----------------1111--1------------------------------1----1-----------------1-----------------------------1-----1--------------1------1---1111121---------------------------------------------------------------------1--1-1--111----------------------------------1--1--------------1----------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-111111111-1----1--------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-----------------------------------11---------1-1-111---11---------------------1--------------1---------1--------------------------------------------------- --11-11-----321--121221---12211-112113-2111----1122111---11--1-11-------2-1---1-222213---21-----------1212-14376433123224223952323-4-642123343221222312232233231112126212342622----------4335123-152373
 dase (UMPH-1)                           ***            ****                                                                                                                          *   *                ****  *                              *    *                 *                             *     *              *      *   *******                                                                     *  * *  ***                                  *  *              *          *                                                                                                                                                                                                                                              * ********* *    *                                                                                      *                                        *                                   **         * * ***   **                     *              *         *                                                      ** **     ***  ******   ***** ****** ****    *******   **  * **       * *   * ******   **           **** *********************** * ******************************************          ******* ******
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 Ric8:Guanine nucleotide excha  --------------1---------------------1---------------1-1------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1---11---------------------------1---------1--11---------11-----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1---------------------------1------------------------------------------------1--------------1---------------------------------------------------------------------111-1--111--------------1--11111111------------------1---11-----------------------------------------------------------1----1----------------------------1------------------------1------------------------------------------------------1---------------------------------------1--------------------1-------------1----------------------------2-------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------- -3--131-11--111111112122211111111323123222222223111242121112121-2--3-----------------111-12213111122-22221-3-336543442123322443540-2-7381342432221433223-413433-343521331312433--1-1------21-1--11-21-2
 nge factor synembryn                         *                     *               * *                                                                                                        *   **                           *         *  **         **                                                                       *                                      *                           *                                                *              *                                                                     *** *  ***              *  ********                  *   **                                                           *    *                            *                        *                                                      *                                       *                    *             *                            *                   *                                                                                                        *                                  *  *** **  *************************************************** *  *                 *** *********** ***** * ********************* * ******************* ****** ***************  * *      ** *  ** ** *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 COXG:Carbon monoxide dehydrog  11-1--3533333334-221211------1--1---------1----------1-------221---1 1-112------------11-11--131111111333-1241-12-----1----11------4--22111------------3-1---11---------------------------------------------11111----2-1--------------------1--------------111------1--------------------------1-11--------21-------------------------------------------------------------------------------------1---------1111-11-----------1----1------------------------1----------41111-1213111111111111-1132-313111-1---1132111111---22-1111113--------2----111-----------------------------------333111111111-11111341111111182451--221-1---2-1-21-1---------------------1-------------1-1------11-1---------121111--------------------------------------------------1----------------11--------1---------1-------------1-------------------------------------------------------------------------111111---------------------------------------------------------12-21---11------------------------------------------------------ --11111---------------1---1----------------------------1---1----------------------------------1--------1-----1-------111---12--212-212131-1121-1--11---1-7-1111--1-----11----1--1-1---------1--2-------
 enase subunit G (CoxG)         ** *  ********** ******      *  *         *          *       ***   * * ***            ** **  ************ **** **     *    **      *  *****            * *   **                                             *****    * *                    *              ***      *                          * **        **                                                                                     *         **** **           *    *                        *          ***** **************** **** ****** *   **********   ** *******        *    ***                                   ************ ********************  *** *   * * ** *                     *             * *      ** *         ******                                                  *                **        *         *             *                                                                         ******                                                         ** **   **                                                         *****               *   *                            *   *                                  *        *     *       ***   **  *** ****** **** *  **   * * ****  *     **    *  * *         *  *       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4366] PF05852            386                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1        
 DUF848:Gammaherpesvirus prote  11--1-1-121211----1----------------------1--1-----1---1----1-------- ----1-------1------------------------1----------------------1-------1---------11-----------1-111----2------1---------------1---------------------1--1---------------------------------1-1-------2-----------------11----------1-1---111--111-1111111111---------11-1---------------------------------------------------------------1-1----1---1-1--11-----------1--11--1--------1---1-------------1-111--2111--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1------------------1--------------1---------------------1-------------11----1--2----------------11111---------------1--------1---------1-----------------------------1--1111111111-111111111111111111----1-----------------------11111--1--------1-------------------1-----------1-------------1--------2-1------1-------------1---4-1--------------------111111---1-----1----------2-------------------------111--- -2--1-1---221142--2--------------111-121111---1--2112111---11-1141-1--1-11-21332------1-1----1-3111---3----22551-2---1212-3-73-2-5-1-516-1123-23-1----2--2--62--1--1131--13373------2---151323011122131
 in of unknown function (DUF84  **  * * ******    *                      *  *     *   *    *             *       *                        *                      *       *         **           * ***    *      *               *                     *  *                                 * *       *                 **          * *   ***  *** **********         ** *                                                               * *    *   * *  **           *  **  *        *   *             * ***  ****                                                              *                                                   *                  *              *                     *             **    *  *                *****               *        *         *                             *  ********** ******************    *                       *****  *        *                   *           *             *        * *      *             *   * *                    ******   *     *          *                         ***     *  * *   ******  *              *** ******   *  *******   ** **** *  * ** *****      * *    * ****   *    ***** *   **** * ** * * * *** **** ** *    *  *  **  *  ****  *****      *   ***************
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 UPF0122:Putative helix-turn-h  ---1----------1---1-1------------1-----2---------------------------- ------------------------1---------------------------111------11-------------------------1-----------------1-2-------1------1--------1-----------1-1--------------------1----------1---------1-11111111221111121212221111111132111111114131111121221111111214111111111121111111121121111111111121111111111121111111111111111111111113212222222212211112111121122111122121111111211111-11--------5-----------------------1----------------------------------------------------1-----1------------------------------------------------------------------------------------------11----1-1---------------1------------------------------1---111-111---1----------------------------------------------------------1-----------------------1-1---1-111-1111--1-1-------------1-----------------------1----------------1--------1------------------------------------------11-12----------------------91--------1-2----1-111111----111111111-------------- 2----1--1--1-1------------111-------------------------------1---2--------------2-11----1-------2--------11---1-------11-1------111---121-------2----1--------11-4-2-41--1-2-221------1-----------------
 elix protein, YlxM / p13 like     *          *   * *            *     *                                                     *                           ***      **                         *                 * *       *      *        *           * *                    *          *         * ************************************************************************************************************************************************************************************** **        *                       *                                                    *     *                                                                                          **    * *               *                              *   *** ***   *                                                          *                       * *   * *** ****  * *             *                       *                *        *                                          *