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Ranking of HM:PFM:REP : from 4501 to 4600

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[4502] PF06925            375                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 MGDG_synth:Monogalactosyldiac  -------2211121---1---------------1---------------------------------- --212------------------------------------111--------1-------112--11-1----------211------1--211-----1--2-12-----------------------1-----22233----1------1-------1-----2212-------------111---1-211111111122111121112232111212----------2211111111111111111111-------1-1---11--------------1111--------------11111111111-1----------1-12122222221212522-332112111-11122121---1----1-----11----------------------------------------------11-----------------------------------1---------------1-------------------1-----------------------------1-1-----------111-1111-----------------1-3----1-21--1--1--------1----1----------1----------------------------------------1--------------------------------1---1--------1--1---------1------111--1111111111111111-------------------------------111-----------------------1-------------------------------------1-----------1-----------------111--11--------1-------------------------------------221- -1------------------11----111-1------------111-2--------1------------1-----1--1------1-------------1--------8-----1------------1-------1-------------1------------111----13----11116111-12224-6133----3
 ylglycerol (MGDG) synthase            *******   *               *                                     ***                                    ***        *       ***  ** *          ***      *  ***     *  * **                       *     *****    *      *       *     ****             ***   * ******************************          **********************       * *   **              ****              *********** *          * ***************** ********* ********   *    *     **                                              **                                   *               *                   *                             * *           *** ****                 * *    * **  *  *        *    *          *                                        *                                *   *        *  *         *      ***  ****************                               ***                       *                                     *           *                 ***  **        *                                     ***   *                  **    *** *            *** *        *            *     *  *      *             *        *     *            *       *             *            ***    **    ******** ***** ****    *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4503] PF11168            375                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2955:Protein of unknown fu  --------2112223----1---------1-1--1--------------------------------- -----1-1-------21-------11----------1--1----------------------1-11--2------------1------12----------------1-------------------1----1--------------1-1-------------1----12----1---1-1---2------11-33323214-313211-----1311-111-11--------1-1--------1--22---1------------1--11---1--1--------1111------------------------111---111-12--1---------------------------------------1---1---2-11-----------------------------------1-13--1--------12-1-11---2-11---21------------------1------1-----11---------------1--------1111-1--------1------2--1111-------------1--1--------1---------------1-----1111---1------------1------------------------1--1122-2--11121221121132221413111--------------11---1-------------------------------1111---11-11111111111111----------------------------------1--1-----1--------------1---11-212222212-122231121-1----1-1-31341-1-122154----1-1---------1-11----------------------------------------1--1---------- -----1--1--2----1--------------------------1--11-----------------1---1-----3--11-11--1----1-1-1--1-1-1---1--112----------------1-----------------------1----------1-11-11121-111-1-3-1---1132-------1--
 nction (DUF2955)                       *******    *         * *  *                                       * *       **       **          *  *                      * **  *            *      **                *                   *    *              * *             *    **    *   * *   *      ** ******** ******     **** *** **        * *        *  **   *            *  **   *  *        ****                        ***   *** **  *                                       *   *   * **                                   * **  *        ** * **   * **   **                  *      *     **               *        **** *        *      *  ****             *  *        *               *     ****   *            *                        *  **** *  ***********************              **   *                               ****   ** **************                                  *  *     *              *   ** ********* ********* *    * * ***** * ******    * *         * **                                        *  *                *  *  *    *                          *  **                 *   *     *  ** **  *    * * *  * * *   *  ***                *                       *          * ** ***** *** * * *   ****       *  
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[4504] PF04109            375                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 APG9:Autophagy protein Apg9    --------1----------------------------------------1------------------ ----------------------------------------------------------------------------------------1--1------------1--------------------------------------------2-------------------------------------------11111--11--------------1--------1---------------------------------------------------------------------------------------11---111------111-111-11----------1---------------1---------------------------------1111111111-----------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1--------1---------1------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1-----------------------------------------------1--- ----231-221121112113111111111111112111112121112111111232121111211111-22111111-22111111121-1122111111121131112322222223242232241620-3-324132122221135113222321221231111232131322-12191112221321112122222
                                        *                                        *                                                                                                           *  *            *                                            *                                           *****  **              *        *                                                                                       **   ***      *** *** **          *               *                                 **********           *                *                                                                                           *                      *                                                            *                                                                     *        *         *                                                      *                                                           *                                               *                                               *        *** ************************************************************ ******** *********** **************************************** * ****************************************** ***********************
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 PI3K_1B_p101:Phosphoinositide  -------------------------------------------------------------------- --------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1--------------------------------------------------------------1-----1----1-------------------------------------1-------------1--------1-----------------------------------------------1----------------------------------21---------2-------------------1---1------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------11-------------------------------------------------11--1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------11----1--------------------------------------------- -1---4--1-------1-211211111------2111111-22--2211112--11-----1--1--2-1-1--1--------1--------1--1-111-11311-2--16763637555846656568-21643465543636437654544253432313242--12-1-1----1611----111-31--25---
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 DUF576:Protein of unknown fun  --------1---11---1-----------------1--------------1---------------11 ------------------------------------------------------------------------------------------12------------1------------------1------------------1----2--------------------------------------------111111122-112-11------112------------1--111313611811197-6811-----------------1------------------1111-111111-------------1-----------1-----11-1111--11----1------1-------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------1-------1-------------1--11-1------1---------11-1---------------------------------------------1------1--------------------------1------1--------------------------------------1----- ---122-----------------1-------1----------------11----------------------------1-----------2------------1-1----1------1---1-----1-----11------1-1--------1-----1------11----1--1-----------242-11-----1-
 ction, DUF576                          *   **   *                 *              *               **                                                                                           **            *                  *                  *    *                                            ********* *** **      ***            *  *************** ****                 *                  **** ******             *           *     ** ****  **    *      *       *                                                                                                                                                                                                                 * *                                                                  *      *                                                                                        *       *             *  ** *      *         ** *                                             *      *                          *      *                                      *         ***                 *       *                **                            *           *            * *    *      *   *     *     **      * *        *     *      **    *  *           *** **     * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4517] PF06772            374                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 LtrA:Bacterial low temperatur  --------11111111-----------1-----------------------------------1---- ----3------12-1----------2------1---2333---121-1----2111--1131----1113-----------------------------1--------------------------------------------11--------11----------111-------------1-1--------11111112-3-2--1-2----11-----1-2111111-1-111111111111112-----3-1111-212----11--2--------------12------------------------211---111------1111111-11----1--------------------1-----------------2---1-2211---1111----------1-------------111-11-111-1-2----------------------21-------------------------------------1-------------------------1------1-----11---11--------------1---------------1---------------1------1---1--------------------------------------1---------------1-----------------1-1------------------1--------1----------11------------------2---------1---------1----------------------------------111111---1-------1-----1-1-----------------------1---11-----------------------------------2---------------1-------------------- --111-3--------6-331312312422222114211-11112222243344431-1-----31----1--111------11111----2-----121--15223----1-1--2--1---------------1--1-----11------1----------1--1-1----1-1-------1---1322--311---4
 e requirement A protein (LtrA          ********           *                                   *         *      ** *          *      *   ****   *** *    ****  ****    ****                             *                                            **        **          ***             * *        ******** * *  * *    **     * ******* * ***************     * **** ***    **  *              **                        ***   ***      ******* **    *                    *                 *   * ****   ****          *             *** ** *** * *                      **                                     *                         *      *     **   **              *               *               *      *   *                                      *               *                 * *                  *        *          **                  *         *         *                                  ******   *       *     * *                       *   **                                   *               *                       *** *        * ********************* ***************** *     **    *  ***      *****    *     ***  *****    * *  *  *               *  *     **      *          *  * *    * *       *   ****  ***   *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4518] PF09440            374                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2                   
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 nal domain                                    *                                  **       *                                                                                                   *         *         ** * *                           *              * *                                             *                 *** *    *** ** *******     * *  *                *                                   *            *        * * * *        *  *     *             **         *      *                                                                                ***                    *                                 *            *                                                                        *             * * *        *         *    *      *                                                                                               *                                         *                              *                                                                          *    *     *  **** *** **************************** ************************    *   *            ******************** ********************* * * **** ****** ************************** ***** *********************
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 IL10:Interleukin 10            -----------------------1-------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------1------1-----1--1----------------------1------------------1---1-------------1---------1-----------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-----------------------1----1------------1-------------1----------1---------------------1------------------------------------------------------------------------------1------------------------1---------------------------------------------1-----1-----1--------------1---------------1-----1--------1-------------------------11--------1---------1-----------11---------------1----1-----1---------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------11111-1-11111---1-----------1-----------1---------------------------------1------------------------------------1--- -1------1-------------------------------1----------------1----1-1----2---11------11113-----------------1-1-----4332686655366097856-9-997364696865475445447365441--4111--------2----------223-----1-1-1-
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[4520] PF10205            374                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 KLRAQ:Predicted coiled-coil d  --------------------------------1----------------------------------- ----------------1-------------------1-------------------------------------------------1--1---------------1---1111111--1-----1--------------------1---22--------------1--------------------------1-----1------12--1--------1---------1--11------------------------------------------111---------------------------------------------------------------1--------------1--1--------------2------------1-----------------------1---1-----------1-------1----------1----------------1-----------------------------------------11--------111--------11-----1------------------------------------1-------------1-----------1-------------------1---------------------1------1------------1---------------------------------------------------------1---------------------------111-11111-------------------1----------------------131-----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------- 1111121-315221112--1--112-1-----1-----------1-1----112--1--212--------11--1-2-121-2---1---1-2-3-1-11-31213-14394525351141112532611-2-325112142241113212213332243734261512542111-21---1---523212322-22-1
 omain-containing protein                                       *                                                    *                   *                                                 *  *               *   *******  *     *                    *   **              *                          *     *      **  *        *         *  **                                          ***                                                               *              *  *              *            *                       *   *           *       *          *                *                                         **        ***        **     *                                    *             *           *                   *                     *      *            *                                                         *                           *** *****                   *                      ***                                                                 *                                                    ******* *********  *  *** *     *           * *    ***  *  ***        **  * * *** *   *   * * * * ** ***** *********************** * ****************************************** **   *   ********* ** *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 lobulin RAP, C-terminal domai        *                                  *               *        *         ****              *                                                                          *                         *     ** *  *                    *  *                              ***** ** ***  *  **  ***             *                     *                 *       **  **                             **   ***  *  *         *  **      * ** *    * *                                                                               *                   *                                        ***                                               *                             *       *  *           * * *****   **   *   * *          *              *    *              *           * *                     *   *                      *                                  **             *     *       *                   * *  * **** ******  **                 *                                                     *        **     **      *      ******          *  *  *   *  *  ***  * *    **       **  * * *    **  **  *   * * ********************* * ***************  ************ ***********  ****    ***** **   *   
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 DIM1:Mitosis protein DIM1      ------------11------------------------------1---------------------1- --------------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-------------------------------------------------11111111-1-1111---------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1------------------------1----------------------------------1-------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1111111--111--------------------------------------------------1------------------------1----------------------------------------------1------------------------------------- 121111-162122311122111111121111111212122311111211111111121111111112111111112111111111111112111131111131121114242122322432322252325-3-333321222322332222322-212212114211111-24232111912111333512411212--
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Aha1_N:Activator of Hsp90 ATP  ---------------------------------------2---------------------1-----2 ---------------------------------------------------------------------------------------------1-----11-------1---------------------------------------11-----------------------------------------------------------1--2------------------------------------------------------11----------------------------------------------------1---1-----------------------1------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--1-------------------------------- 4433111-511111111111111111111111111111111111111111111111111211112222222212222122222212111111111111111112-1-2912311142-311222322123-1-224123113232223222-222221111-2113331321122143414332354451332113331
 ase, N-terminal                                                       *                     *     *                                                                                              *     **       *                                       **                                                           *  *                                                      **                                                    *   *                       *      *                                                                                                                                                                                                                                                                            *             *          *                                                                                                                                                                                                                              *     *  *                                 ******* ************************************************************************************************ * ********** ************ * ****************** ********* *************************************
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                                                                               *                                                                                                 *           **    ***                           *       * *                                 *                                                                                                                                                              ***   *    *       **                                      *                           *                                             *                                                                 *                                                                                                    **           *                                                                                     *                                                                             *                          *****                                                                                 *  **  * * ***************************************************************************** * *  **  ******* * **  *** **     *   *     ****  *   * * ***    ************* ***** ** *** * *  ****** **** 
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 Vps36_ESCRT-II:Vacuolar prote  -1-----------------1-------------1-----------------1------1---11---1 -------------------------------------------1---------------------------------1----------------------------1----------------------------------------1---------------------------------------------1111-2-111---1-------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------------1----------------11------------------1-----------------------------------1----------------------2-------------1----------------------------------1---1-------------------------------1------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1222131-3111-1222212122131211111122222122221-11222212322111222222121-311212111-12222222221412232--11-11132-2211333153112211212-515-3-432211122421132213132233322522122211221222-2111---113113222211312-
 in sorting protein 36 Vps36     *                 *             *                 *      *   **   *                                            *                                 *                            *                                        *                                             **** * ***   *       * *                                                                                                                                                          *                                                       *                                 *                **                  *                                   *                      *             *                                  *   *                               *                              *                                                                                                *                                                                                                                                                 ******* **** ******************************* *********************** ********* *****************  ** ***** ******************* *** * ****************************************** ****   *************** 
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[4535] PF09106            372                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SelB-wing_2:Elongation factor  --2-------------1-1------------------------------------------------- 112-----------111--------------------1-1--21-1--1---------------------1-----1--111---------1-------------------------------11-----------11-----112-1---1--11--1--1----1----1-----1-----1-------1--1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--1111111-1--1---111----11--111111111121--1-1---1----1------11----11-5------------1---1-1-12---------------11----1-1----------------------------------------------------------1--1-1111111111111111111-1211--111-23-2----1---11---1---11------------1-1111111111121112111112-11111-11----------1-----------------------------1111-1111-111-----------------12--13-1111111111-1111111111111111111111--112111111111111111111111111--1-1-111-1111----------------1-111111111112111------------12211-1--13221----1------1--------------111-------111-1--------------------------------------------------------1--- -1--------1-1-------121-111--------------------3-----------111--------------------------1-----12-----------14-----1-------2----2-4-1-2-----1-1-----------------162-111----------26-------1--1-----1122-
  SelB, winged helix              *             * *                                                  ***           ***                    * *  ** *  *                     *     *  ***         *                               **           **     *** *   *  **  *  *    *    *     *     *       *  * **                                                                                                                             **  ******* *  *   ***    **  ************  * *   *    *      **    ** *            *   * * **               **    * *                                                          *  * ******************* ****  *** ** *    *   **   *   **            * ********************** ***** **          *                             **** **** ***                 **  ** ********** **********************  ***************************  * * *** ****                * ***************            ***** *  *****    *      *              ***       *** *                                                        *     *        * *       *** ***                    *           ***                          *     **           **     *       *    * * * *     * *                 *** ***          **       *  *     **** 
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[4536] PF06553            372                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 BNIP3:BNIP3                    ---1--1----------------------1--------------1----------------------- -------------------------------------------1----------11---------------------------1-------1-1-----------------------------------------------------------------------------2-------------11------11-11-1--111--1----------------------------------------------------1-1-------1--------------------------------------------------------------------------1----------------------------1--------------------------------------------------------11----1------------------------1-1----------------------------------------------------1---------1-------------------------------------------------------------------1----1---------------1---------1-------------------------1-11112-------------1--------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------11111---------------------1------------2----------------------------------------------------------------------------2---------- --------241-1--1-32-11-2---12-----2-2-1----1--3-1--2--1121-1---2---------2----1--12-11--1-11--2--1111111-1--4-59945552432222772731-3-546432253342133217347424322123113142311241---1-1-11-321--32315-13-
                                   *  *                      *              *                                                                   *          **                           *       * *                                                                             *             **      ** ** *  ***  *                                                    * *       *                                                                          *                            *                                                        **    *                        * *                                                    *         *                                                                   *    *               *         *                         * *****             *                                      *                                                                            *****                     *            *                                                                            *                   *** *  * ** ** *   **     * * *    *  * *  *  **** *   *         *    *  ** **  * **  *  ******* *  * ******************** * ******************************************   * * ** ***  ***** ** 
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[4537] PF07362            372                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CcdA:Post-segregation antitox  ----1243322221-32-2111-1----1211-1----------------1----1114-----1--- -----------------11-1-----11-11----------------1-------------1--1-1--1---------------1---------------------2--------------------------------------11-113----1-----1---111-----------------------111111--11------------------1--------------------------------------------------1------1---11--11------------122--133-21----------11--------1-11----54-1-1--1-1--21-1-1122--2----3-----11--------------1---------------------------11------11-11-11---1----1-----11111111-1-----1---------------------------------1---------1----------1--1----1---1---11---------11--------1-------111-1----------------11-1---1---------------------------------------1111-----1---1--------1---------11-------2-43--11332132131-3112132122321111112-1-2213-111-211--11-1--112232111--2---1----111-------------1----------------1--------1----1----------------------------12-1-1-1-------11111-1-------1-------1-------3---------------------------------11------ --1-1--1------2-1---------11---------------1-1-2--1--2---------1---1---3--------------------1--1-1--1----1----1-----1-----------------1--------3-----1---11----11--21-2-221---1---2------212-----21-1--
 in CcdA                            ********** ** **** *    **** *                *    ****     *                     ** *     ** **                *             *  * *  *               *                     *                                      ** ***    *     *   ***                       ******  **                  *                                                  *      *   **  **            ***  *** **          **        * **    ** * *  * *  ** * ****  *    *     **              *                           **      ** ** **   *    *     ******** *     *                                 *         *          *  *    *   *   **         **        *       *** *                ** *   *                                       ****     *   *        *         **       * **  *********** ******************* * **** *** ***  ** *  *********  *   *    ***             *                *        *    *                            ** * * *       ***** *       *       *       *                                 **         * *  *      * *         **               * * *  *  *         *   *   *                    *  * *  *    *    *     *                 *        *     *   **    **  ** * ***   *   *      ***     ** *  
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[4538] PF07111            372                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             9   1                                                                 
 HCR:Alpha helical coiled-coil  ----------------1--------------------------------------------------- ------1-------------------------------1----1-1--------------------------------------------------3-------------------------------------2---2----1------------21----1-1--1------------1--1--------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------12---222-----------------------------------------------------1--------------------1------------------1-1---1------1-1------------------------------------------------------------------11------------------------1---1--------1------1-1------------------------1--------11-----------1--1--1-------------------------------1-111------1---1-1---------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1-----------11--------------------1-------121111----1----------------1-----------11---------1------1-------1------------------------------------------------- -1-------1-11---1----------1---111------------3-1---1-1121---2------------------------------113------1---1--112131-3213--2231-2150-41492-242122432143413292-13413--132-223222221---2-3-2-4--2-22-122211
  rod protein (HCR)                             *                                                          *                               *    * *                                                  *                                     *   *    *            **    * *  *            *  *                                *                                                                                                **   ***                                                     *                    *                  * *   *      * *                                                                  **                        *   *        *      * *                        *        **           *  *  *                               * ***      *   * *                                                                     *                                         *           **                    *       ******    *                *           **         *      *       *                                                   *       * **   *          *   ***            * *   * ****   *                              ***      *   *  ****** ****  **** **** ***** ****************** *****  *** *********   * * * *  * ** ******
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 CesT:Tir chaperone protein (C  ----------------------1-----------------------1--------------------1 -------------------------1-----------------1--------1-----------2--------------------------------------------333333333333333------------------------211-----------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------2-11-1-------11--1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----11----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------33411---111322-----4333-2-----1-----11-1----1-------1--1-------------1---1-------6556--------1-------------------1----------------8-----1----1-1---1------11--------------------2-1-11--------1----1----1-------------45112222222222222221-111--11-566666-65-6----------------8--111---------1--------------44-4---11-----542-------------------76-11--1111111----------------------------------------------------------------- --------621----1------1--------------11--------------1--------------------1--------------------------111----112---1--------------4-1-2--1----------------1----------1--------------------11221--1------
 esT)                                                 *                       *                    *                          *                 *        *           *                                            ***************                        ***           *     *                                                                                     * ** *       **  *                                                                                                            *    **                                                    *                                                            *****   ******     **** *     *     ** *    *       *  *             *   *       ****        *                   *                *     *    * *   *      **                    * * **        *    *    *             ******************** ***  ** ****** ** *                *  ***         *              ** *   **     ***                   ** **  *******                                                                          ***    *      *              **              *                    *                          ***    ***   *              * * *  *                *          *                    *****  *      
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 ction, DUF399                                               *                                        **            **                   *  * *  *      * *      **  *  ***             * *****         *    * *           *    *   * *               *  *  *          * **  *               *    *        **   * ***    * *                *                           *                                                     *    ***                            **    **               *  ***      ***         *            * *  *          *   * *     **  *******         * * *           *           *        *           *    ******   *   * ****** *   * *********  *   *         ****  * ** *** ***** *** ***  *****  *  *  **                    **  *  *  *                 *    ****      *   **      *                             ***           *    ***    *                  *****      *             *             * **************            *****************        ** *  * ******   * ****                                     ** *         **          **                *    ***    *  *         *      *             *        ***      *     *   *    *    *   *          **              *      * *  * *     * ***      ***** ****    *
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 NO_synthase:Nitric oxide synt  -------------------------------1------------------------------1----- ----1--------------------------------211--1-----------------1---1-21-------------------------------------------------------------------1-------1------------1-------------------------111-----111111111111111111111111112-1-1311------12111111111111111111112--------------------------------------------1----------------------------------------1-------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1-1------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-----------------1----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------111----------------------- ----------------2------122--------------------------1-------------------------------1-------2-1-------------1271-23464432384863643-3-04214345335624352545743233-35-21360211-123-----1-2--1---1-1---1---
 hase, oxygenase domain                                        *                              *          *                                ***  *                 *   * **                                                                   *       *            *                         ***     *************************** * ****      ***********************                                            *                                        *                                                       **                                                                                                                                                                                  *                      * *                                    *                                                                               *                                        *                 *                                                                *                                                ***                                        *      ***                          *                               *       * *             **** ***************** * ************************** ** ******** ***     * *  *   * *   *   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 RuBisCO_small:Ribulose bispho  -----------1-------------3------------------------------------------ ---1-----------------------------------------------------------------1---------------1-----------------------------------------------------------9556555654411111165555566111111111111--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------11-1------------------------------------------112332-11211----------------------------------11-1-----11211-----------1-----2---------------------------1-----1---------------------11-------11-21------2-------1----1------------111----------1-1------------1-------------1--------------------22--------1------------------------1111------------------------------------------------11----------------------------------------------------1---------------------------------------------------------2---------------------------------------------------1-----------------2--------------1--- 1---2------------------12-----1-------------11-2--11---------1-------1---------1------1-1--1--3------1-----------1-------1-----21--------1---------1--------------111-------1--12533324229689-72-1-6---
 sphate carboxylase, small cha             *             *                                              *                                                                 *               *                                                           *************************************  *                                                                                                                               *                          ** *                                          ****** *****                                  ** *     *****           *     *                           *     *                     **       ** **      *       *    *            ***          * *            *             *                    **        *                        ****                                                **                                                    *                                                         *                                                   *                 *              *    *   *                  **     *             ** *  **         *       *         *      * *  *  *      *           *       *     **        *         *              ***       *  ************** ** * *   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4552] PF07808            371                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RED_N:RED-like protein N-term  -------------------1------------------------------------------------ -----------------------------------------------------2---------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1----------------------1--------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------------------------1-------------------------------------------------------------------------1---------11----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---1--------------------------------------------- 211-152-1---111211-2222222222451222121-111123123221222221122121-1-------------21-1----22123212322222122221-11144332471331323432323-2-224113131121112112123222213643515332151323-2213222212417215131311-
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 Mannosyl_trans2:Mannosyltrans  ----------------------1-------1--------------------------1---------- --1-211---------------------------------122221---1-2---1-------11-1222------------1-1-----------------1-----------------------------------12-----11--111-1------------112---------------------1--------1--------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------1----------11----------1---------------1----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1111----------------1--1-------------------------------------1---------1---------2-----------1----1--------1-----------1----1-------1----------------------------------------------------------------------1------------------1-----------------------------------------------------------------------1------------------------------------1---------------------------1-------------------------------------------------- 2-1132--0433311122--21212212211112222121211---3222112111111111221211-1122-14111211111111122121111111-1112-21-161233-21211111221411-2-223-3-222111-22311321211111311211-211--221-12241111-1123111--3122-
 ferase (PIG-V))                                      *       *                          *             * ***                                 ******   * *   *       ** ****            * *                 *                                   **     **  *** *            ***                     *        *                                                        **                                                                              *          **          *               *          *                                                                                                         *            ****                *  *                                     *         *         *           *    *        *           *    *       *                                                                      *                  *                                                                       *                                    *                           *                                                   * ****  **********  ***********************   ********************** **** ************************** **** ** ****** ************** * *** * ****** ******************** ***  *** ******** *******  **** 
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 DUF1167:Protein of unknown fu  ---------------------------------------------------------------1--1- -----------1------------------------------------------------11------------------------------11-----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------1---------------------11--------------------------------------------------------------------11--------------11-------------------1------------1---------------------------------1------1------------------------------------------11--11---------------------------------------------------------------21-----------------------------------------------2----1-----------1---------------1-1----------------------------1------------1----------------------------------------------------------------1----------------------------------------1-------------1----------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- 11----2-2--21-11-2-122----1------311--1-----1121-----6--1--11--1----1---------1-----1----11--216-------132--2-42474362424443893053-52948214261434333443326433332332321121-1-131-1111-1--16-22232-11222-
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 Lambda_tail_I:Bacteriophage l  -------------1-------------------------------------------------1---1 -1-2--11-----------------------------111--1-1----11-----1-------11-2-------------------------------------11----------1-------------------------------------1--1-----------------------1-211------11111111-111111------111----11------1-------------------------1--1-------------------------------------------------------------------------1---------11-1----------------------------21-----------1----------------------1---7-1-1--211-1------------------1--------------113-1-1------------11----1-11-----------------11--------1111-1---1--1--------1-----------11------1---11-1--1---1-------------------------1-1--1------------1-----------1---------1----2--2------3-1-112------1--------1---11-993-315---11-4145244044111-11-----1-1--1-11-21-113--2-23-21222-1221-2222---1-----------------1-111------1--1--1-1--1----112-11-1--1-1--11--------------------------1-1-111111-1---------------------------------------------------------1-- -1----------------11-----11---------------------11-3-1--1-1-------1-12---------1----------1---11-----1-1----1-2-1--1--------11-213-3-11---2-2--1--1-----1--2-------12--212------1--3-1--12--2----11----
 ambda tail assembly protein I               *                                                 *   *  * *  **                             ***  * *    **     *       ** *                                     **          *                                     *  *                       * ***      ******** ******      ***    **      *                         *  *                                                                         *         ** *                            **           *                      *   * * *  *** *                  *              *** * *            **    * **                 **        **** *   *  *        *           **      *   ** *  *   *                         * *  *            *           *         *    *  *      * * ***      *        *   ** *** ***   ** ************* **     * *  * ** ** ***  * ** ***** **** ****   *                 * ***      *  *  * *  *    *** ** *  * *  **                          * * ****** *                                                         *    *                **     **                     ** * *  * *       * **         *          *   **     * *    * * *  *        ** *** * **   * *  *  *     *  *       **  ***      *  * *  **  *    **    
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[4560] PF02431            370                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Chalcone:Chalcone-flavanone i  ---------------1--1------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------1----------------111---1------------1-------1----1-----------------1-1----------1-----1--------1-----------------------------------1--------------------------------------1--11-------------------------------------------------1-------------------111----1---------------------1------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------112--121--22222341-211------------------41112--1--------------1--212221--1-------------------1----------1--1--11111121111121111113------1--------1-----------------------------------------------------------------1-----------------------------2-1----1---------------------------------------1-1-1111--111------11--------------------------------------------------1---1---------------------- -2--112----233111321111111-111222112111111111111122111-1122111111111211112232122111221-1112111111111131123-13141--------1---------------------11--------1---------11-1---1-11--14536322358777375362-21-
 somerase                                      *  *                                                                                                                                     *                ***   *            *       *    *                 * *          *     *        *                                   *                                      *  **                                                 *                   ***    *                     *                              * *                                                                                                             *                             ***  ***  ******** ***                  *****  *              *  ******  *                   *          *  *  ********************      *        *                                                                 *                             * *    *                                       * * ****  ***      **                                                  *   *                        *  ***    *************** *************************** ******************************* ******************* *****        *                     **        *         ** *   * **  ******************** ** 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Kin17_mid:Domain of Kin17 cur  --------------1-----------------1----------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1----------------------------------------------------------------------------------2---------------1--------------------------1-1---------------------------1--------------------------------------------1---------1---------1--------------------------------------------------11111111112-------------1--111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1--1----------------1--1---------------------------1--------------------------------1--------1-----------------------------------1-1--------------------1------------------ 2211211-2--1222231211112221222322111212111123243113-221111111132211213211322123213333311112132212122111233-12222232511111121211211-1-11121121112-1111-1121112313241132122341111211-71111211333231213211
 ved DNA-binding protein                      *                 *                                                                                                                                             *                   *                                                                                  *               *                          * *                           *                                            *         *         *                                                  ***********             *  *********                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                *  *                *  *                           *                                *        *                                   * *                    *                   ******* *  **************************************** ****************************************************** *********************** * *********** **** **************************** ********************
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  C-terminus of cactin protein                         *                           *                   *                                                                                                 *    **                     *                                    *   *                                               **           **                 *                                                                                                      *                                                                        **                                                                     *                    *                                                          *                       *                                    *                                                                                                         *                                                                                                               *                                                **          *********** ***************************************************            *          ******************** *********** *  ******** * *** *  * ****** * * **** ***************** *********** ***********
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 CAP_C:Adenylate cyclase assoc  -----------------------1------1---------------------1--------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1--------------1-----------11---------------1------------------11----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1------1----11----------------1-------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-111----------1---------------1-------------------------------------------------------------- 1111353-421-1121111111111121111111111111111111111111111111111-111111-1111111111211111111112211112111111122-25433222442222222521424-4-438332252224222222532323221-1222222131233111129--12111121212121121
 iated (CAP) C terminal                                *      *                     *                                                                                                                        *                                          *              *           **               *                  **                            *                                                                                    *      *    **                *                                     *                                                                                       *                                                                  *                                                      * *                                                                                                                                                                                                                    **** ***          *               *                                                               ******* *** ************************************************* ****** ************************************* *********************** * *************************** *******************  *****************
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