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Ranking of HM:PFM:REP : from 4701 to 4800

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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[4702] PF10140            357                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 essB:Predicted membrane prote  ------1----------------------------1---------------------------1---- ----------------------------------------------------------------------------111--------------------11-1-211---------------------------1----111-1-1---11----------------11--1---------1--1---1-121111112111-1-1111122112-2--1-21-12222211-22222121122211---1--1-1--111-1-----11----1---111-1112-------------1-11-1-1-11--1----1----1--2---------------11-11------------1----1----1-1------------2----1-------------------------2-------11----------------------1----------------------------1--11------------------------111111-1111111-1111-1-11-------------------------------------1--------11----1------1--------------1---------1---------1--1----------------1--------1------1-------------1----1-1111111111-111111111111111111-------11-1---------------1111111---1-111111111---------------1-----------------------------11-1---12--11---------------------------------------------1-----111111111----------------111-11---11----1---------- ----51------1--1-1------------1------1-111-------1-------1-111----1-----------------21-----1-12-11----1--3---21-121------12-11-215-2-22-1--11-212--11121------1---3-212211111-1----------1-11-----1-31-
 in essB                              *                            *                           *                                                                                 ***                    ** * ***                           *    *** * *   **                **  *         *  *   * ************ * ********** *  * ** ******** **************   *  * *  *** *     **    *   *** ****             * ** * * **  *    *    *  *               ** **            *    *    * *            *    *                         *       **                      *                            *  **                        ****** ******* **** * **                                     *        **    *      *              *         *         *  *                *        *      *             *    * ********** ******************       ** *               *******   * *********               *                             ** *   **  **                                             *     *********                *** **   **    *               **      *  * *            *      * ***       *       * ***    *                 **     * ** **    *  *   ** ***      ** ** *** * ** *  ** ***  *****      *   * ********* *          * **     * ** 
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[4703] PF08551            357                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 DUF1751:Eukaryotic integral m  -------1-------------------------1---------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------1--------11----------------1---------------------------------11----------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1-------------------------------------------1----------------------1-2--------1------1-----------------------------------1---------------------------------11-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1-------------------------1-------------------------------------1-----------------1---------------------1--1111111111-1111111111111111111------11---------1--------111111------------------------------------1----------------------------1--11------------------------------------------------11------------------------------------------------------ 11--121-523-11123232222322-32112132212111112223122222222212222123111112121341-1112221211224131111111121111-1--212122-1121111111111-1-11111--12111111-1-1-1-1-11111311111113331211112111112443221--2211-
 embrane protein (DUF1751)             *                         *                                                                                                                  *        **                *                                 **                                                                            *                                                *                                           *                      * *        *      *                                   *                                 **           *                                                                                                       *                                *                         *                                     *                 *                     *  ********** *******************      **         *        ******                                    *                            *  **                                                **                                                       **  *** *** ************** ************************************************** **************************** *  ****** ************* * *****  ******** * * * * ***********************************  **** 
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[4704] PF06632            357                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 XRCC4:DNA double-strand break  -----------------------1-------------------------------------------- -----1----------------------------------------------------------------------------------1----1-------1---------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1--11111111111111-------2----11------------------------------------------------------------------12121-1-------1-------------------------------------1-----1-----------------------------1--------------------------------------------------------------1-------11------------------------------------1--1----------2-1----------------------------------1-----------1----------1-1-------------------------------1----1---------2------1-------------------------1-----------------------------------1--------------------------------------------------------------1--------111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--- --1131--1-----32221-212121111----12212123111111111112111122111111-----11--1------12--1---15-212-----1----5-32-24244411222133332333-312412-312-222223211-28322221-1351532-312132-1-3212212533314-132643-
  repair and V(D)J recombinati                         *                                                  *                                                                                  *    *       *                                             *                                                                                  *  **************       *    **                                                                  ***** *       *                                     *     *                             *                                                              *       **                                    *  *          * *                                  *           *          * *                               *    *         *      *                         *                                   *                                                              *        ******                                                                                                                     *      ****  *     ***** *********    ********************************     **  *      **  *   ** ***     *    * ** ******************** ****** *** ********* ******** ******* ****** * ************* ****** 
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 PucR:Purine catabolism regula  --------------------------------------------1--------2-------1------ 1---42--111---3------3--18------4444-7711---51-1----5441-2--22414208544-----11-111---------------------1----1--------------------1-----11111-1-22----------------1------------------------------1---------------522221---11371--222232341--------------1----5---11-----11---1---111------------------------------------------------2222------------22-111-2-----2--33-11----2---------1-------1---111----------------------1-11--1---111---1-1-1-------11--------------------1----------11---------------------1-------1-------111-----1111-1----1-----1--1---1------------------------------1-----------1-1-----1--1----------------------------------1----------1-----1----1----------1--------11---------------------1-------------11----2-------------------------------------------------------------------------1---------11-11--111-12--------------------------11----1---------------------------------------------------------1----------- -----1-----1--1--11-1------112111-----------1-----11-1------------1-1--1----1----------------1--------------8----------------------------------------1-----1---1-3---1-----------------1--1----------1-
 tory protein-like family                                                   *        *       *       *   **  ***   *      *  **      **** ****   ** *    **** *  ***********     ** ***                     *    *                    *     ***** * **                *                              *               ******   *****  *********              *    *   **     **   *   ***                                                ****            ** *** *     *  ** **    *         *       *   ***                      * **  *   ***   * * *       **                    *          **                     *       *       ***     **** *    *     *  *   *                              *           * *     *  *                                  *          *     *    *          *        **                     *             **    *                                                                         *         ** **  *** **                          **    *                                                         *                 *     *  *  ** *      ******           *     ** *            * *  *    *                *              *                                        *     *   * *   *                 *  *          * 
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 Kri1:KRI1-like family          ---------------------------------------------------1---------------- ----------1-----------------------1------1---------------------------------------------------------------------------------1----11---------------------1---------------------------------------1--------------------1-------------------1---------------11----1-1-----1---------------------------------------------------------------1---1---------------1-----1----1---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1---------------------------------------------------------1-----1-------------------- 2111111-41122132122122121211111211111111211111221112211214211211111112111122111112312222223213242311144214-241423123112121112-2316-3-21112-112123-21-24--22-11123213222311454112211211212311323323-221-
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[4707] PF12607            357                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3772:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -1------11-------11-1-----11111-------1----1---111--1--------12-1-2--1------------1------------------------1----------------11---------1--------1------11--------11---------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1------------------1-1--1-----1121--111-----1---1---1---11312112-1---11--11---12221---11222211111111111--11---------------------------------------111-11221112111111--11121111-2111----11111121--1----1----2--1-1-1-----1------1---------1--------------------------------------------------------------------1-------1-----------2--11111111111-1111111111111111111---11---111111111111111111111111--1------------------------2-----------------1-------------11211-1-111111111--------------------11--2211111222-111------------------------------------------------------------ -----1--2--1--1--2--22-----------1-1--1-1------1-----1---111-12------------------111--1----2--121--2-1---2--5--12----31---12----13-12112-11---1---1-2-3--21-1-1----1-11-1-------1--51111--24221---1-1--
 nction (DUF3772)                                                                                     *      **       ** *     *****       *    *   ***  *        ** * *  *            *                        *                **         *        *      **        **                     *                                                                                                                                        *                               *                  * *  *     ****  ***     *   *   *   ******** *   **  **   *****   *****************  **                                       *** **************  ******** ****    ********  *    *    *  * * *     *      *         *                                                                    *       *           *  *********** *******************   **   ************************  *                        *                 *             ***** * *********                    **  ********** ***                                                                  *  *  *  *  *  **           * *  * *      *     *   *** **                  ***  *    *  ***  * *   *  *  **    **   **    ** ***** **   *   * * *  ** * *    * ** *       *  *****  *****   * *  
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[4708] PF06537            357                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1111:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- -35-----------1-----------------1----------21----------------1----------1111--------------22-2-------42--4-1-------------------------------------3-2----2223---21----1-1---1-----2-------33--------------1--------11------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------3---------2--1---------------------21-1--1121--22222221122122---12-2222132-----------1---------------------------------------222221------1-------------1-1------11-122--12----222-22--1---------2-2-2----1----------------2--1-165--2-----------------------1--1---351---1--11-211----1111-11----2---------------------------------------------------------------------------------------------------------28-2----------------------1114811414222222222212----------22221111121311------1-------22----4444------------------------------------------------2- ---------------------------1--------1----------1-1-------1-------------------------------------2-----1---2--3-1-----1-11----11-1------------1-1---------------2-1223----------1---------------31-11-1--
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 DUF2320:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------1----------------------11---1------1--1121-1--------------1-1-----1---------------1--------------------1---------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------2111------2-2342351212211111111111-11211111111-111111111111--112211-------22222222222--122------------------------------12221-------------11--------1-----1--1------2-----111-1133211--1------22314112522-3---1332-213233522321231211-----------1--------1--1-----221214121----11-11-----1------1224---------11--------------1---1----------------1----1-1------------------------------------------------214-1---------------111111-----2------11----1--------------323-1111112-22--1-1--111------1-11---------------------------------------------------33- ----------1-------1-----------1------1--11-----1--------2-2--------1-------------------------------1--1-------2-----------------------------------------------1---23-31--1-212-------1------1------1---
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                                                                        *                      **   *      *  **** *              * *     *               *                    *               *                                                                                                                                                         *                                   ****      * ********************** *********** ************  ******       ***********  ***                              *****             **        *     *  *      *     *** *******  *      *********** *   **** ******************           *        *  *     *********    ** **     *      ****         **              *   *                *    * *                                                *** *               ******     *      **    *              *** ******* **  * *  ***      * **                                                   **            *       *           *      *  **     *        * *        *                               *  *       *                                               *   ** **  * ***       *      *      *   
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 EKR:Domain of unknown functio  11----------------------------1-------------1----------------------- 111-2-------------------1-------1111-----11--------1-----------1--------------1111------11111-11----1-----------------------1111111112111111-----1111111--11------11--222--------------------1----------------------------------1112111---------------------2----------------------111---------------------------------------------2223222222222221221111221211111-222-1-12-1221--21------1------1-----------------------11-1--------1---11-1-1-----------------11111111-----2-1---------------------------------------------1-----------------1-----------------------1-----------------1-111111211111112121113211121--1--1111111111----------------211-1--------------------1--1-1------------112111-1111111111-111111111111111111112121---11-111111111111111111111--1111111-1111-------------1------------------------------1------------------------------111111---------------1---------1111--------21------------------------------------111- --12-------3--------------------11----1---------11--1------------------1-------------1-----1---1---1-1----1---1----------------1-----1-----------------------------1--1---------12-----2----21---1-----
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 Nha1_C:Alkali metal cation/H+  --1---1---------------------1--------------1----------1---1--------- --------------------------------21-1---1--------------------1----------------------------------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1-------------11--------------------------------------------------1----------------1---------------------------------------------------------------1------1------------------------------------------1-----------------------------1---------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1------------------------------1-------------------------------1-----------------------------------------1--------------------------------------------- 211-233-11--1--23411221213211121122112332221122152154233322322331213111-311-2-21411323211132313112-1-1112113226142211-----1154-1-4-3121-12-211-3-11-1---121312--21232-1311-21221421----3--3512-1-136151
  antiporter Nha1 C terminus      *   *                     *              *          *   *                                          ** *   *                    *                                        *  *                                                                                                                                                         * * *             **                                                  *                *                                                               *      *                                          *                             *                                                         *                                                                                                                                                                                                     *                  *                              *                               *                                         *                                              *** *** **  *  ******************************************************** *** * ******************** * ****************     **** * * **** ** *** * ** *   ******  ***** **** ********    *  **** * ******
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 TAF:TATA box binding protein   ---1---------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------1------------11----------------------1--------------------------------------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1---------1---------------------------------------------------------------1-----11-----------1---11-111--11------------------------------------------------------------------------1111111----11--------1------------1---1-------1-------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------1------------------------112-----------------111-1111------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ 111111--1---211211-11111111121111111111111111111112111112122231111111121111111111111111111-113111111111112121242323212223222634226-5-212-1212123--221222121-112334322434213123411117111-11135141--2131-
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                                                             *      *          *                                                                   *    *                *            *    *    **         *                                             *  *             *                           ****** * * ***      ****                *** **********     *                                                                      *                     **      *    *            *  *                                                   *                                   *                                                                                      *              *                     *                                            *         ****   *     *                                                         *                                                           *                           *    *   *                                                                                             *       *      ****     ****       *    ***    *        **   *** * ** *  *    ** * * ***      ***  * **** ******* ***** * ******* ** ********** * ************************************** *** *************** * **** 
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[4723] PF06941            356                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NT5C:5' nucleotidase, deoxy (  -------------------------------1---------------1--222--------------1 -------------------------------------1------1--------1---------------------1---------1--------------1--11-2-1---------------11-11122--1---------21-----1-----------1-------1--------------------------111-1111--1----2------2111------2-11111111111111121111--------------------1-1----------1---1-1--------------------1----------11211111121-1--111---------1-1--1211111-----1-------1111------1---------------------3-21-3111-------------------------------------------1--2------------1---------1-------------11111--------------------------------------1-21---------1-121-1111------1--1--------------------------1--------------------------1------1-----1------------------------------1-----2---------------------------------1---------------------------------------------2---------------------1-11----112111--1--------------------------------1-----------1111111111------2--------------------------1--------1-------------1------- -1----1-11-111-1----------------------------1--1---1--------1-------------1--------------121-1112223--1253--212242211111-223423224-2-222-122222221212-22-2-1242-1-12321--1--11-211-----111111211311111-
 Pyrimidine), cytosolic type C                                 *               *  ***              *                                      *      *        *                     *         *              *  ** * *               ** *****  *         **     *           *       *                          *** ****  *    *      ****      * ********************                    * *          *   * *                    *          *********** *  ***         * *  *******     *       ****      *                     * ** ****                                           *  *            *         *             *****                                      * **         * *** ****      *  *                          *                          *      *     *                              *     *                                 *                                             *                     * **    ******  *                                *           **********      *                          *        *             *         *    * ** *** *                            *  *   *        *             *              *** *******  ****  ************ ********* * *** ************ ** * **** * *****  *  ** ***     *************** 
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[4724] PF11882            356                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF3402:Domain of unknown fun  ----------------------------------------------1----1---------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1---1-------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--------------------------------1----------------------------------------------1------------------------------1-------------------------------------------------1--------------------1------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------- -1--111----232111112111121111112111121221111113411111111112111211112111111111-11111111211-3111111112221231-1-333222544552223653636-3236434232333233344336242422344142112117-221--1-------1-111---11133-
 ction (DUF3402)                                                              *    *                                                                                                                                                                                                *     *                                                                                                                           *                               *   *                         *                                                                                                   *                          *                                *                                              *                              *                                                 *                    *                                    *                                                                                                                           *                                                                               *  ***    ****************************************************************** *********** **************** * ********************* **************************************** ***  *       * ***   ***** 
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 Peptidase_M15:D-ala-D-ala dip  -------------------------------------------------------------------- -1112---------12111-11--111111114222-----2-1---1-------------------142-----------1------1111--11---111111-1-1------------------11---11-----------1111111--111111111112111111111-11-111-------1---111111-1-111111------111--11---------1---------------------1-1--------11-----1-1-1----------------------------------------------------------------------1--------111--1-------1------1111-1----112------2222------------11-11-1-11--------------111--1----------------------111----------------112---11----------------132121-111111111111-1212--------------11---2-------2--1--1-1------1------2-1111-1-------------1--1------------1------------11-------------------------------------------1-----1111-1---11-11111--1111-111111--------12222222222222222111---11---11111111111---1-----333311-11-------------------------1--11-11---1111----------------------------1111111111--------11----------------------------------------------------1- ----11------------1---1-----1----1-----------------1-1-------------------------------------------------1-1---------------1--1------1---------------------1---------1-11--1---------------21211-2--1---2
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 AATase:Alcohol acetyltransfer  ---------------1----------------------------1-----1----------------- ---------------------------------------------------------------------------111--1------------------1----1------------------------------------------1--------------------11----------------------------------1----------------1---111------------------------------------------1----------1-------------------------------------------------------1-------1---1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1-------------------------------1-------------------------------------1------------111------------------------------------------------------1---------------------------1--------------------------------------------1------------------2----11-------------1------------------------------------ -1------21--2221214433325131122221311222222---3223789864331232343324133142365344133334--13922111111-114111-121-------11111-1-----------1---11----12-----------1111-2-2-------3-----------412-221148750-
 ase                                           *                            *     *                                                                                             ***  *                  *    *                                          *                    **                                  *                *   ***                                          *          *                                                       *       *   *  *                                                                                                                                                                                                               *                                                                 *                               *                                     *            ***                                                      *                           *                                            *                  *    **             *                                      *      **  *******************************   ****************************************  *********** ****** ***       ***** *           *   **    **           **** * *       *           *** ********* 
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[4732] PF12417            355                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2     1                                                               
 DUF3669:Zinc finger protein    ---------------------2--1------------------------------------------- ------------------------11-----1-111---1----2---------------1---1--1-------1---------------1------------1----------------------------------1-------------------------1-------------------------------------------------------------------------1-------------------11-----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------1-----------------------1---------------------1--------------------1------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1------------1----------1--------------------1----------------------------------------------------1-----------------------------------1------------------1------------------------------1--------------------------------------------------1--------------------1--------------1--------------------------------------------------------------- ----12----------2311--12134-1----1-31-1-----1-1225-242-1-2-233-----1---------------------2--2--31---12-------1------43432335984870-81775452398676166--522952121----2111312--1------1-----3213--6-11----
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 TraI_2:Putative helicase       ---------------------------------1----1--1---1---------------------- 112-------------------------------------1------1-------------1-------------------------------------1-1------------------------------1----------------1-----------1------1-----------------------1---------------11-------1--1111-------111111111111111111211111-111111111--111111111111111111-111111111111111111111111111111111111---1------1--1-111111111-----1-------1--1------1----2----------------1------------------1-----1--1-----2-----------------------------------------------------------------------------51--1--1----11---------11--12--31--124-2121112---------1------1-3-211--1111--1--1-1112111121211--11--1----------------------1--1213-------1------1--1-------------1------1-111---------11--------2--1---------1-11-12311--------12-1--3---------2--------1------222221111---------1-41----1------------1--1211111--1111112-----------------1--------11221---1----------------------------1---1--------1-------12--121-1-1-1- --21------------1--1-------1------1-------------1------1----------------1------1-----2----2-1----1--1----3------1-------11--11---1------1---11------3-1--1-------1-1--1--1--1----------1-2111----------
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[4752] PF10454            353                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2458:Protein of unknown fu  ----1--1-2111111------1----1----------11-2------1-------1-1--------- ----------------------------------------------1-------------------------------------1--------2------1------------------1-------------------------1----------------------1------------------------111112-1-111211------111-1--------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1-------1------------1--1-----------------------------------------------------------------------------12----1------------------11------11----------------2----1-----------------------------------1-----------------------1----1----1---1--1-----------1---------------------1---------1--1----------------------1---------1--------------1----11----------------------------------------1------------------------------------------1---------1-----1---------------------------------1-----------------------11-11----------------------1------111----------1-1---------------------------------- 1---2-1-122----132-11111311232222121322212221112-1--1---111-1-212-1--1-1212-21----1-12122-1132232111-31343---321-52221423111722211-1-111111111111122121-233--31-321-132-514171----14--22-2-13112---23-1
 nction (DUF2458)                   *  * *******      *    *          ** *      *       * *                                                        *                                     *        *      *                  *                         *                      *                        ****** * ******      *** *                                *                                                                                     *       *            *  *                                                                             **    *                  **      **                *    *                                   *                       *    *    *   *  *           *                     *         *  *                      *         *              *    **                                        *                                          *         *     *                                 *                       ** **                      *      ***          * *                                   *   * * ***    *** ***************************** *  *   *** * *** *  * **** **    * ***** ********** *****   *** ***************** * ****************** ***  ** *** *** ******    **  ** * *****   ** *
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 Chal_sti_synt_C:Chalcone and   --------------------------------------------------1----------------- 11--1----------3333-32--4133333212221----1111-11-11-1111----11---11132------------1-----1-----------1-1211111-------------------1-------11-----1-1-1--------11-11----------1-----1----212------11---------------111111----1111--------1-----------------------------------------------------------------1---------------------------1----------------------------1--------------------1---------3113221111111--------------1----2----1---22-111--11------1-11--1--------------1---------------------------------1-----------1------------------1-----------1---1---------1----------------1-----1--------1-1-1----111112---11----------------------------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------1--3----1-1---------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1--- ----32-----1----121----113-------1111111111---23--1121-121-111--1---------2----------1---3-11---------------31---1-----1-------1-------1------------1---------------------------53-----15087815611---14
 stilbene synthases, C-termina                                                    *                  **  *          **** **  *************    **** ** ** ****    **   *****            *     *           * *******                   *       **     * * *        ** **          *     *    ***      **               ******    ****        *                                                                 *                           *                            *                    *         *************              *    *    *   ** ***  **      * **  *              *                                 *           *                  *           *   *         *                *     *        * * *    ******   **                                  *                                                                                                     **                                                    *  *    * *         *                                                                                               *        **     *    ***    ***       **********   **  **** *** ***  *         *          *   * **               **   *     *       *       *            *                           **     ***********   **
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 MCC-bdg_PDZ:PDZ domain of MCC  ------------------------------------------------------------1------- --------------------------------1------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1---------------------1---1---1-------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------11------------------------1---------------------------1-----------------------------------------1--1-1--------------------2-------------1------------------------------------------------------21-1--------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------2----------------------------1--------------1-----------1---------11-1----------------------111----1--------------------1----1-----1-----1--------------------------------------------------------------- -1---1--2---111--------------1-----1----------11---22------1---1--------------1-----2----1-1--11--1--1-1-----14-113-15353641655291-81711734544832672335764244641--243216-261131-11-----1-1211-----2-13-
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF800:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- --1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------111-1--1111----------------------------111--------------------------------------------1------------11-------------------------------------1---------------------11111111---1---------------------------------1----------------------------1--------1---------------------------------------------------1------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1-1------------1111-111------------------1-----1--------------------------------------1-----------11-------------------------------------------------- ----32--2-1-11--1--------1----21-1-1----------11--2------1-1-1--1----3-12-1------222---1--111---211----111-11186613623221222652439-2-74633337317212222441833512333533-422223621----11----1112-1-12-11--
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 DUF2083:Predicted transcripti  -1------------------------------------------------------------------ ----122222211133333-31113233333311113333-1112--1-----111-1------14-1111--------------------1--------1------------------------1-------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----1-------------1112-----232432222321322321232332---------111-1221113112221111142522223221111111131111121-----------------------------11232--------------121------22-----------------111----1---1------------------------------1--1--------1111121----------------------------------------------------1--------1----------1----1---------------------------11-------------------------1-------1-1--------------------1-----------1------------------------------1-1--------------------1--------111111121211---------------------------------------------------------------1 -----------2-1------1---------11-----------1------1-1---2-1---------------11---------------1-------1--------1-----1-2-----------14-1-215--1--1-----------1-1------12----31-----21----2--11----2--------
 onal regulator (DUF2083)        *                                                                       *************** ******************** ****  *     *** *      ** ****                    *        *                        *                   *                                                                                                                                                                                                                 **    *             ****     ************************         *** *******************************************                             *****              ***      **                 ***    *   *                              *  *        *******                                                    *        *          *    *                           **                         *       * *                    *           *                              * *                    *        ************                                                               *            * *      *         **           *      * *   * *               **               *       *        *     * *           ** * ***  *  *           * *      **    **     **    *  **    *        
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 DUF295:Protein of unknown fun  -------1------------------------------------------1----------------- ------------------------1------------------------------------------1--------------------11-------------------------------------------------------2-----------------------1--------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------1-1-1--1-------------1-------------1-----------------------------1-----1-------1-------------------------------------------------------------1-------------------------1--2--------------------1-1----------11---------------------2-------------------11---------------------------------1------------------------------------1---1----------------------------------1-------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1--------------------------------------------------- 1----------2-----1---1--------------1----11-------1-------1-------------------1-----------1--2------12---2-----1--12--1-----12-----------1--1---------------211--21--2----111---2---------131-22-------
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 DUF1875:Domain of unknown fun  -------1-------------------------1----------------------1----------- ------1------------------1--------------------------------------------------------1--------------------1-1---------------------------1-----------------------------------1--------------------14------------------11-----11---1-------1-------------------1-----------------1-------1----1784---------------1--1---2-1-------------------------------1---1----1---1-------------------84------------------1---------------------1----------------1--------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1---111-----------------------------------------11------------------1------1----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------11----------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------1-------------------1------------------------------------------- -----11-3--2111---11-----------------111-111--2---111-1--1-------1-1--1--2-----------111-----1-1-1---212-3-24342421431511212255327-2-64832212124322121111211334111221211314-21--2--8-11-121-11111-11212
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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