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Ranking of HM:PFM:REP : from 4801 to 4900

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF3431:Protein of unknown fu  ---------1--1-1----------------------------------------------------- -------------------------------------1-------1---------------------1-------------------------------------1-------------1111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4------------------------------------------1-------------------------------------------------------------11------------------------------------1-----2---------11-------------1--------------1-----1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------212--------------------------------------------------1------------- -1-1--1---1----777466680009767766988433333376655121112--122122------------------------------7--31112231-1---92-------------------2------------------------------2-1--1----------12-4-1-34112-5-1---1--1
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[4809] PF01111            349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CKS:Cyclin-dependent kinase r  ----------------------------------1--------------------------1------ ---------------------------------1-11-------1---1----------------1---------------------------1----------------------------------1------------------1---------------------------------------------11-11------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------11------------------------------------1---1--------------------------------------------------1-------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1-1-------------------------1-----------------------------------------------------1-----------------------------------1------------------------1--- 22-1121-4111-131122-111211-111111111-122212111111111131111121111211122111111111111111211112111122221211211-1424-22-312122223462326-4-43813222222222222122313132332241112221333111-18111212112222-1111-1
 egulatory subunit                                                *                          *                                        * **       *   *                *                           *                                  *                  *                                             ** **                        *                                                                                         *                   **                                    *   *                                                  *       *                                                                                                                                                                                                   *                                                                                             *                                            * *                         *                                                     *                                   *                        *    ** **** **** ****** ****** ********* ********************************************************************* **** ** *************** * ******************************************** ************** **** *
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[4810] PF07542            349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ATP12:ATP12 chaperone protein  ----------------------------------------------------------1--------- -1-----------1-------------------1111-----------------------------------------------------1-------------1----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1----1-----------------------1--------------111111111111111112111111111111111-111112111-1-12211111121121111111111111111111111211-1111------------------------------11111----------1----------1--------------1------1---------------------------------------------------------------------------------------------------11-------1----1--------------------------------------------------------1------------------1--------------------------------------------------------------------------1-------------------1------------------------------------------------1-------------------------------------- 11--111-5211111111111121211111111212111111111111111111211-111112211211111111111111111111112111111111121111-3213111211111311121-113-1-11111111111--111211-1111211111111-1113-11111-191112-111111311211--
                                                                                          *           *           *                   ****                                                     *             *                                                                      *                                                       *                                                                                                   *    *                       *              ********************************* ********* * ************************************** ****                              *****          *          *              *      *                                                                                                   **       *    *                                                        *                  *                                                                          *                   *                                                *                                       **  *** ************************************************* ************************************************ ******************* *** * ***********  ****** ************* **** ***** ****** ************  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 in conserved in bacteria (DUF       * *         *                 **         **  * *    **       **  *             *                          **                   *  *               *  *              * *** *                ***  *   *          *     **               ** *                  *  * ** ***   *****  ****   *   * **      **                    * *    *                                 * * **                       **************** ***** *** * ****** *** ******** ***            *                                                                          *       ***      **  *                            ****     *  *                  *         *           *         *                           *   *                   *       **  *      **     *    **                                                                    *    *                                   *   *     *                **             * *               *                             *****************                          * ********           *    *  ** ***** * *********          *  *  *  *     **         * *     **       * * * * *            ********            ** * *         *  **  *  **** *   ******  *  **     *    **** * ** *  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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 DUF1003:Protein of unknown fu  -------1-------1---------------------------------------------------- 132-5-1111111221111-11--1111111-111111111333111111112211111111111--111------------------11---1------11--11------------------11-11-11---1111----1----1--------------1-1112---------------1-----1-1----------------1---------------------1----------------11--1-1-11-----11--11--111-1111111----11---------------------------111---------1111111-1-1-----------------33-----1----1---11--1111-----1-12121111111------------2324312-121-222232-2322111------1-11---------------------------------------------------1-------1----------11--------------------------1--1-1--1---------------------------------111-11-----1---1-----1---------------------------------------------------1----1-------------3--------------------------------1-----------------------------------------------------------1-----------------111111--------1--112---21--------------111-1111111-11----2------------------------------2-----------------------------1--11---1 -2------111122-1--1-----------------------------11--1--1------1--1-1-----------1-----11---1--1-1-----1----------1--2---1-----1-2-3-1121-------------------11---11--1-1-5--11----1--2-1--1--331--1---11-
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===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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 BCAS2:Breast carcinoma amplif  ---------------1---1-----------------------------------1------------ ---------------1-----------------------------------------------------1------------------------------------1--1---------------------------------------1-------------1-----1-----------------------------1--11---1-1-----1---------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------11111-1-1--------------1------2-------------1--------------------------------------------------22--1--------1-----------------------------------------------------------1--------------1-------------------------------1-----1--1---------------------------1---1------1-----------------------------------1-------1--------------11-------1-------------------------------------------------1------1------------------------------------------1-----------1--------------------------------------------1-------------------------1-----------------1111---------------------------------------------------- 2212111-831-122111111111111112111221112121111113112115111212131-12-11111213-1--11221-211122112122111121113-13251211221112122111215-2-32231111312211111212122111328212-211221131-111-113214--21113322111
 ied sequence 2 (BCAS2)                        *   *                                   *                            *                                                     *                                    *  *                                       *             *     *                             *  **   * *     *               *                                                                                               ***** * *              *      *             *                                                  **  *        *                                                           *              *                               *     *  *                           *   *      *                                   *       *              **       *                                                 *      *                                          *           *                                            *                         *                 ****                                                     ******* *** *************************************************** ** ******** *  ***** ********************* *********************** * ******************************** ********* *** ******  ***********
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[4822] PF05994            347                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1     1                                                               
 FragX_IP:Cytoplasmic Fragile-  -----------2----------------------------------------1-1------------- ------------------------------------------------------------------------111--1-----------------------------------------------------------------------------------------11----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------------------------------1---------------------------------1--------------------1------------------------------ ----211-----532-------------------------------------1-------------------------------1----21----------2---2-12233324354534536687753-72640444644432654352995722331593321513111231-1-------131-7-33--12--6
 X interacting family                      *                                        * *                                                                                      ***  *                                                                                         **          *                                                                                                                                                                                            *                                                          *                                                                                                                                                                    *                     *                               *                                                                                                                       *                        *                                     *                                 *                    *                                   ***     ***                                     *                               *    **          *   * *********************** ******************************************** *       *** * **  **  *
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[4823] PF00940            347                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 / protein conserved region                                                   *   *                                                                           *                                          **                                     *                                                 *               ***      *   *                                                                  *   *     * *                                                     *                *               *                        ** **                *                                                               *                * **      *   *                                                           *                                  *                                                                                             *                                                                                           *      *                                                                      *                             *  *  *** **  **** *********************************** *********           * **  * *  * ****** ************* *  ****************** * * **************************** ************* **************** ***** 
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[4827] PF00647            347                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 EF1G:Elongation factor 1 gamm  -------------------------------------------------------------------- -1------------------------------------------------------------------------------1-------1--2----------1--------------------2---------------------------------------11--1-11-------1----------------------------------1------1-------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1---------------------1------------------------1-----------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1----1----------------------1--------------------------1----------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------11-----------------------------1-------------------- 122115--512111-212111111111121111122211111121111111111111111112212121222-212222222221211113211121111131332-1-1311113112--111461318-2-236-12121133-212112-513-221112214142161512111----1-133751211-22232
 a, conserved domain                                                                                  *                                                                              *       *  *          *                    *                                       **  * **       *                                  *      *                               *                                                                         *                     *                        *                                                                 *                                                                                     *                                                                        *    *                      *                          *                                                                      **                                                                                                      *                                  **                             *                     ******  ****** ********************************************************* ********************************* * **********  ********* * *** ******** ****** *** *********************    * ********* *****
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[4828] PF04938            347                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1 1                                                                     
 SIP1:Survival motor neuron (S  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------1--------------------1----------------11------1----------------11------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1------------------------------1----------------------------------------1-222-------1--------------------------------------------------------------------1-------11----------------------------2----------------------------------1------------------------------------------------------1---------------1---11------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1-131--311-111112111111111--1-1-1-2-111112111521---1111--11111122113121111112121111221121-11221121112113--21321211331213221261032-61515231121111121222223131211213224-1213-421--22-1111-82232331-35231
 MN) interacting protein 1 (SI                                                                                                                                     *   *                                                             *                    *                **      *                **                        *                                                                                                                               *        *                              *                                        * ***       *                                                                    *       **                            *                                  *                                                      *               *   **                                                                                          *                                                  *      *                                                                                                               * ***  *** ***************  * * * * ************   ****  ******************************** **************  *********************** *********************************** **** ***  ** **** ******** *****
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 Ribosomal_S30:Ribosomal prote  11111111111111111111111--11-------------------------------------1-21 -----------------------------------------1----------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1---------1-------------------------------------------------1-------------------------1------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------1----------------------11--------------------------------------------------1--- 1-12211-732-111111111111--1211121311343335521-12112111231212221-1111111--11-2--11-11--222-1111222111-2122311603221131-131111151113-1-2211212411211141111-11-31-11-2221221411121111121111142163321112111
 in S30                         ***********************  **                                     * **                                          *                                                                *                                                                                                                *                                                *                                                                                    *                                     * *                                                                                                              *        *         *                                                 *                         *                                                                              *                                                                                              *  *                                                           *                      **                                                  *    * ***** *** ************  ******************* ***************** *******  ** *  ** **  *** ********** **************** ************ * ******************* ** ** ** *************************************
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[4830] PF06634            346                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1156:Protein of unknown fu  322-1---1---1---1---1--11----12----------------1-----21111------1--- ---------------------------------1-11-----11--------------------1--22-------------1---------------------------------------------11--1---1111----11--1----1--------1---1--3------------2-1-1---1--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------1------------------1-1---1---2---------1--------------1--1-1------------1-----1-211----111--1-1--1-2--1-----1--------------1--1------------1--------------------11---111-------11111---1212-2----1------------------2-11-----------------1--1-1---1----------------11212-2-------------------------------------------------------------4----------------------------------------------------1----------------------------------------------------211-----------------------------------------1--------------------------------------------1------------------------------------------------1-1111--- --------1-1---1----1111------1-----1-------------1-2-1----------------1------------------------------------12-3553452232213276-629-7-94712225235132222222133122---111145123--2--122-11-2-122-1-----1---
 nction (DUF1156)               *** *   *   *   *   *  **    **                *     *****      *                                     * **     **                    *  **             *                                             **  *   ****    **  *    *        *   *  *            * * *   *                                *                                                                                                  **           *                  * *   *   *         *              *  * *            *     * ***    ***  * *  * *  *     *              *  *            *                    **   ***       *****   **** *    *                  * **                 *  * *   *                ***** *                                                             *                                                    *                                                    ***                                         *                                            *                                                * ****            * *   *    ****      *     *             * * *                *                                    ** **************** *** * **************************   *********  *  *** ** * *** *     *   
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 TYW3:Methyltransferase TYW3    111212121111111111121111-----------11111111----------12223222---11-- -----------------11-1-----11111-----------------------------------------------------1---------------1-----------------------------------111-----------------------------------------------------------1------1----------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-111---1--------1-------------1-------------------------------------------------1-----------------------------------------1----------------------------------------------1----11----------------------------1-------------11111---1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------- 2-11--1-5221--1111111111121111111111111111111212111-1-13111112111111-11211121-11111121111---111211---2-111--8-34321111111121341239-4-116111111131111111112-63221--111-21--1--31-1227-1--121-512122-1112
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 DUF2208:Predicted membrane pr  11111112111211211111112---------1--------1--------1---11----1--1---- --------------1----------------------------------11-1----------------1--------------1---1--1--111--12---11--1---------------2-----------------1------221------1---11----------------1------1-----------131----1------1--1-1-----------1-----1-1-11---11------1--11--1-1----211-2---111-------1--11111111111----------------111-----2--1111-1--------1-1--2---1-21--------------------1------------------------------------------------112----1---------------1--------------------------------11--1--------------------------------------------1---------------------1----------------------1-----1---1------------------------------1-1111-21-------------1-1-----------------------1----------1----1-1111111111-11111111111111111111111111-1111111111121211-1111111--111111111111---1------112--1-------------1----1-----------------------------------------11111-1-11--------1--------1-----11--1-111-------------1---------1----11------------ --13---------------1111---1--1---2-1-111121111-------------------------1----1--1-----------1---1-------211-2122---11-2----11121122-2-222-------11----12----1111-111-11-1123--11----------1-1111----2---
 otein (DUF2208)                ***********************         *        *        *   **    *  *                   *                                  ** *                *              *   *  *  ***  **   **  *               *                 *      ***      *   **                *      *           ***    *      *  * *           *     * * **   **      *  **  * *    *** *   ***       *  ***********                ***     *  **** *        * *  *   * **                    *                                                ***    *               *                                **  *                                            *                     *                      *     *   *                              * **** **             * *                       *          *    * ********** ************************** **************** *******  ************   *      ***  *             *    *                                         ***** * **        *        *     **  * ***             *         *    **               **               ****   *  *   * * *********                         *    *  *           *   *       *** ****   ** *    ******** * ***       **    **    **** *** ** ****  **          * ****    *   
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  protein Nu1                           ******       *        *                                       *           *          *      *    *      *     * *        *                               *                              *                        ***   **       *                          *                 * ***       *                              ***   *  * * *     *    ******* * *          *             *           *            *            *           *           *             *  ***               *   * ** * * ***  *  **    *  ** ***** *            * **                          *  *          *             *        **       * *    **     *  *   *       ** **  **     *                 **   *** *                                   ******                         **     *********  **** *************                *    *  ** * * **                       ****  *                   * **         *     *            *             *              ****  *     *                                                **   ** *            *     *    *        **  **   ***  * *  * *             * *      **     *  *  *      *  ** *     * *  *  ********* * ***********  **  * **    * *    *     *          ** *  **  *      
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 CAP59_mtransfer:Cryptococcal   -----------111---1------------------1---------------------------1--- ------11--------------------------------------------------------------------1-----------1--1-------------------------------1----------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------21-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------21--------------1--1----------------------------------1---------------------------1-----------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1-------1----------------------------------------------------------11------------------------------111-1111------------------------------------------------------1---2-------------------------1---------11------------------------------------------------------------------- 1---1-1-31-321-21343333364423223245544444542334244235422432222----------1--1-------------27416314444343-2--1-22----11-------1----7-3-1-------------1--------1--11211-11-1---13-151111-1-7---141--21--12
 mannosyltransferase 1                     ***   *                  *                           *          **                                                                    *           *  *                               *                      *    *                                                                                                **                                                                                                                                               *                    *             **              *  *                                  *                           *                                                           *                                                                          *       *                                                          **                              *** ****                                                      *   *                         *         **                                                                    *   * * ** *** ***********************************************          *  *             ************** *  * **    **       *    * * *             *        *  ***** ** *   ** ****** * *   ***  **  **
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[4837] PF07445            346                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 priB_priC:Primosomal replicat  ------------1-------------------------------------1----------------- ----1---------------------------1-1--------2-----------------------1-----------------------1--------------1----------------1-------------------1--1---------------1----------1-----1-----------------------1-11-------1-1------1111111---------------------1-----------------------------------------------------------------------2----------1----------------------1--1-1-----------1------------------1--1----------1-1-1--------------11---1-----------------------------1----------------------------------1--------------------------------1--------1----------------1-------------------------------------1--------------------------------------1--331132222222222212321122------2------12111111311121111-51111211231221111121111121111111111111-1-11111111111-111111111111----------111--1--11112111111-111---------11--1-----1-------------------11211111111112------------------111111-------1------------------------------------------ -1---1--1111---1-1--2112-121111-112--1111111--1--21111---1-------1-1----------------1---------11-----2--11---222-211--11--13-----1--------------1-2-11--1---11-134-3-1-----2-----1-----1-4----1-211221-
 ion protein priB and priC                  *                                     *                      *                           * *        *                       *                       *              *                *                   *  *               *          *     *                       * **       * *      *******                     *                                                                       *          *                      *  * *           *                  *  *          * * *              **   *                             *                                  *                                *        *                *                                     *                                      *  ************************      *      ***************** ************************************** * *********** ************          ***  *  *********** ***         **  *     *                   **************                  ******       *                                            *   *  ****   * *  **** ****** ***  *******  *  *****   *       * *                *         **     *  **   *** ***  **  **     *              * * **  *   ** *** * *     *     *     * *    * ****** 
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 ion                                              *                                *          **                                                                                               *  *                                                 * *   *  *                                              **             *         *       *************** ***                                                                        *  *        *          *    *                           *     *                                                                                           **                                                                       * *                 *                                 *            *               *    *                                       *                                    *                                    **                            *                                               *         *                      **    *   *                    *            *    *   ******* *** ****************************************** *************************************************** ********* ****** ****** * ************ ********************************     ***  ***********
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 DUF494:Protein of unknown fun  --------------------1--------1---------2----------------------1----- -----------1-------------------------------------11---------------------------------------1-------------------------1--1111-------------11---------------------------1--1---1-------------1----1------------------------------------1-------------------------1----------------------1--------11----------------------------------------------1-1------------------------1----------1--------------------------------------------1---------------------------------------11------------------1---------------------11111---------------------------1-----11----1211-111111122111111111-11-------1---------------1----------------------------------111211--111211111111112211111111--111111--11111111212121222221-222222222222222222211111---1111111111111111122212111-111111111111---11111111111-1-----1-1-----------------------------------1---1111-111-111111111111111122122222111111---------------------------------------------------------- 1----1----------------------1----------------------------------1------1----1---------1---11----------1-------22111--2-111---0--1-2-1-2------1----1--------1--------1121-----1---1------1-1--1-----1--2-
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[4853] PF07092            345                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
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 Alpha_adaptin_C:Alpha adaptin  --------------------------1-------------------------1--------------- ----------------------------------------------------------------------1--------1--------------------1--------------------------------------------11----1----------1------1------------------------------------1--------------------2--------------------------1---------------------------------------------1-1-------1--------------1----------------------------------------------------1---1-----1------------------------1---------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1--------------------------------------------------------11------------------------------------------------------ ----311-----1121111111111211111111111111-1111111111213-1111111111111-11-1111111111111111114111111111131111113363233113221222443327-31317112222251-221151-1221221404112132111221--1112111131121422221111
  AP2, C-terminal domain                                  *                         *                                                                                      *        *                    *                                            **    *          *      *                                    *                    *                          *                                             * *       *              *                                                    *   *     *                        *                                                               *                                                                                                                                                            *                *                    *                                                                                                               *                 *                                                        **                                                           ***     **************************** ************* ************* ** ********************************************************** ************** ****** **********************  **********************
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[4864] PF05018            344                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1               1                                                 1                   
 DUF667:Protein of unknown fun  -----------------------------------1----------------1--------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------2---1-----------------------------111112111111111------------------------------------------------------------------------------1---1--1-----------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1---------------------------1-----1------11-----------------------------------------1---------------------------------------1----------------------------------------------11--1------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------2------------------1------------------1-11 11----3-3112222-1-----------------------------11---11-------------------------------------3-1-3311-2-1-12---2382518333311133441422-31536222122231321313113332311342431422281122-32151112152-2-14-145453
 ction (DUF667)                                                    *                *                                                                                                                      *                                                                                                *   *                             ***************                                                                              *   *  *                                                                             *                    *                                                                                                                   *                                       *                           *     *      **                                         *                                       *                                              **  *                                                                        **                                   *                  *                  * ** **    * ******* *                             **   **                                     * * **** * * **   ********************** ******************************************** *********** * ** ******
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[4865] PF02921            344                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              4                1                   
 UCR_TM:Ubiquinol cytochrome r  --------------------------------------------------1----------------- ---------------1--------1---------------------------------------1-----------------1---------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1---------1----------------------------------------------------------------------------------------------1--------1-1-----------------------------------1-----------------------1------------111-1-------------1----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------11--------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------1--------------------------1--------------------------------------------------------------------1---------------------------------------2--------------------- 11--111-1---1221211111111111111111111111122111111121111111111111211111112111111111111111113122111111111223-12133242211211-12421415-2-412-1-2111211-1111111121112211111231221121111163121143421521111111
 eductase transmembrane region                                                    *                                 *        *                                       *                 *                                                               *                                                                         *         *                                                                                              *        * *                                   *                       *            *** *             *                                                                      *                                   **              *                                                                                       *                                                                                  *   *                               *                          *                                                                    *                                       *                      **  *** *   ********************************************************************************************** ************** ******** * *** * ******* ****************************************************
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[4869] PF07817            344                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Mtp:Golgi 4-transmembrane spa  ----1-1-1-------------------------------------------------------1--- -----------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------------1--------------1---------------------------------------1----11-1-----11--------111----------1-----------------------------------------------------------------------------------------111--2111111----------1----1111-11-11-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------112---1111-------------1-----------------------------------------------------111-----------1-------------------------------------1--------------------------------1------------------------1---------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------1---------------------------------------------1---------- -1--11--31--1-----1---------------1----------------------------------------2--1------1-11-2-------------21----24655754443574772640-636693533544434633362383753511-222233-3-1141----1-----1131--1-------
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 nt of SMC5-6 complex                               *            *                                                                       **              *       *                            *      *   *     *                      *                                  *         *     *                 *    *     *    *       *       *                    *  *                                    *                       ***        *           *                                                         *                                      *                                          **                                                                             *            *  *                        **     *                                      *             *      *                                                        * ***  *  *                     *         *               *  *   *            ***              *                    *                   *    ***                               *                     ****  ********** ********************************************