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Ranking of HM:PFM:REP : from 4901 to 5000

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF441:Protein of unknown fun  ------------------------1--------1--------------------------1-1----- ---11---------------------------------12---1-------11-------1--------1--111----------------------------------------------------------------------1-------------------1--1---1-------1----------11111111211111111111111111111--2111111132--------------------11--11---1-111111111----1-----------------------------1------------------1-----11-1-1-1111--------1--11--222-11-2------11-------------2-----------------------------------------------1--------11-----------------------------------------------------------------1--------------------------------------11---1--11-1111----------------1----------------------1--------------------------------------------------------------------2211-212472222122-5222223222422222222111111123123333332333333-22211-21-222112222212--1---------1-----1111111111111111111111--------------------------------1-----------1--------------------------------------------------------------------------- -11111---------------1--1----------------------1--1------------------------1---------------------------1-1--1-1-----2-1----------------1------------11--1---------12-2----1----------------------------
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[4908] PF10204            340                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                1                         
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Condensin2nSMC:Condensin II n  -----1---------------------------------------------1---------------1 -------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-1------------------1-------------------4------------------------1------------------1-111112121211122------221-----------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1----------------------1-1-1---------------1-----------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--------------------2------2--------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------1111--------------11111111---11-----1-----------------------------------11-1----------------1---------------------- 1212131-1-------1---1--1-2--------------------1---1--11----1-1-----------1111-2-----1-1-----1111---1--2--2112134541273352221672923-2-42322236222-22321223932332--132122----3401111-2-1--2-2-3-111112122
 on structural maintenance of        *                                             *               *                                                                                            *              * *                  *                   *                        *                  * ***************      ***                                   *                                                                       *                      * * *               *                                         **                                                                                                *                  *                                                                        *                          *                    *      *                                                        *                                                                                        ****              ********   **     *                                   ** *                *                       ******* *       *   *  * *                    *   *  **    * *           **** *     * *     ****   *  *  ************************* * *********** **************  ******    ******* * *  * * * *********
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 Channel_Tsx:Nucleoside-specif  ------------------1-----------------------------------------1------- ----------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-----------------------------------------------------------1-11------------------------------11----------2-----1------------1-2--------------1-1------1111----1-----------1--------------11-1--2----2233222732232453352-------------11111212114234411-112244414214111211211111221323233333333332311211111--111111111111---------------11--------------1-11111-2-----34332333233232212-----------1131111111111---------------------------1-----------------------------111-------------- ----1-----------------------------------------1------1------1---------1-----1-------------1------------2-1-13-----------1------1------2-1--11------1--1-----------1-----------------2--------11--------
 ic channel-forming protein, T                    *                                         *                  *                                         *                                                     *                                                                                  *                                                                                                                                        *           *                                                                                                  *     *                                                           * **                              **          *     *            * *              * *      ****    *           *              ** *  *    *******************             ***************** ***************************************************  ************               **              * ***** *     *****************           *************                           *                             ***                   *                                         *      *      *         *     *             *            * * **           *      *      * *  **      *  *           *                 *        **        
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4932] PF06617            338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1 2 1 1 1                                                               
 M-inducer_phosp:M-phase induc  ----------------------------1--------------------------------------- -------------1---------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------1---------1-----------------1---------1-------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------11111--------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1---21--1113----1------11-1----12---1-----1---1-1-1-1---------1-----1--1-----221-1--------12---1--1-1---1132243254546453683551-0-64246556655645955512631234--1-2-11--12-----121--1---1---131--1213-
 er phosphatase                                             *                                                     *                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                       *                                                                                                                                   *                                  *         *                 *         *                                                                         *                                                                                     *****                    *                                                                                                                                       *   **  ****    *      ** *    **   *     *   * * * *         *     *  *     *** *        **   *  * *   ********************** * **************************  * * **  **     ***  *   *   ***  **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4933] PF11498            338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2    1                               
 Activator_LAG-3:Transcription  -------------------------------------------------------------------- -------------------------1------------1----------1-----------1-----1----------------------------------------------------------------------11---1---------------------------------------------------------------------1----------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------11---1------------------------1-----------------1---1--------------------------------------1------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------111------------111111----------------------------------11-11111--------1-1-------------1-------------------------------------11--------------- ----794-2-1-1-2-1-1-12----1--1---3-21111111-22-1-21112---12223--1-23181111-321213-1412----1311-3-111-1-243-615131-2-61-2----3---11---1-2-2112-1-2-13112--3-1-12-1301-12145-24-1167-1---1111432216313531
 al activator LAG-3                                                                                                           *            *          *           *     *                                                                      **   *                                                                     *                * *                                                                                                                                                          *                                                                       *                                                                                **   *                        *                 *   *                                      *                                          *                                                                                                  ***            ******                                  ** *****        * *             *                                     **                    *** * * * * * * **    *  *   * ******** ** * *****   *****  * ******** ****** ****    **** * *** * *** ****** * ** *    *   **   * * **** * * *****  * * ** **** ***** ** **** *   ****************
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 MYT1:Myelin transcription fac  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------1-1---------------------------------------1-------------------------------------1---------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----1---1---1--1-1-2----2----1211------------1-1--1-------------1-1----------1-----11-1--12----1---11112-1----17768426434455285731-5624646635453125443643954533-1-12-111---12------------21112-1---21--
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 tein L35Ae                     ** ***          *                   *                ********    *                                                                                                            *                                                                                                 *   *      *                                                                     *                                                                      *                                                         *                       *                                                                                  ***                                                        *                      *                                     ******  ****** ****                                                                                                         *                  *              *                                                                                           *                         ****** ****************** ************************************* ****  * ***** ******  ***************************** **  ********** * ***** *********  ********** ********** ********* *****************
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 Sec39:Secretory pathway prote  ---1---------------1--------------------------------------1--------- -----------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------11--11----------------------1-----1-------1-1-2----------------------------1---1--11--------------------------------------11------1-----------1----------------------------------------------1----------------1----1------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1----------1---------------------------------------------------------------------1-----1--11-----1-------1---------------------------------------------------------------1-----------------------------11111111111---------------1-----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------ -1------1--123111211112111111223211121112112112211221111121111111111-11111111111111121111-2112112213141111-21231111223432253224237-1-112232231112122321326431252-1-13221-13--21-2311321112--5121---1---
 in Sec39                          *               *                                      *                                                                                                   *                                                       **  **                      *     *       * * *                            *   *  **                                      **      *           *                                              *                *    *      *                                                *                                                                                                                  *                 *          *                                                                     *     *  **     *       *                                                               *                             ***********               *                                                                 *                                                                                *      *  ********************************************************* ******************** **************** *********************** * *************************** * ***** **  ** **********  ****   *   
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[4937] PF05297            337                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                              1                         
 Herpes_LMP1:Herpesvirus laten  ---1-----------------------1--1--------------------1--------1------- -----1--111---111-------1---------11-11------1-2--1--1-------1--111-2--1---1------------------------1--------------------------------1----1----1---------1------------------------------1---------------------2---11-----------------1--111121-1--1111---------------1-------1---1-------------------1--------------------1---------------1---2---111-------1---1----1----1-----------1---1-----1----------------------1--1---1---------------1----------1--------------1-----11-------2---------------------------------------------1--1--1--1-------121---1------1-------11----------1--1--1----------------------------------------------------1---1-1------------1--------------------------------------------1------------------------------------------1--------------------------1-11----------------------------------------1---------------------------------------1-11-------------1111-------------------------------------------------- 22-1331-2-1-----21-1----1-211---------1-------1112------112221--1----2--1-------1----11---1-2-122112-211----3-021111-23-1122512217-6-323----2-1322222131-121234--3-56-3--11-11-1212---11-2236111--31313
 t membrane protein 1 (LMP1)       *                       *  *                    *        *             *  ***   ***       *         ** **      * *  *  *       *  *** *  *   *                        *                                *    *    *         *                              *                     *   **                 *  ****** *  ****               *       *   *                   *                    *               *   *   ***       *   *    *    *           *   *     *                      *  *   *               *          *              *     **       *                                             *  *  *  *       ***   *      *       **          *  *  *                                                    *   * *            *                                            *                                          *                          * **                                        *                                       * **             ****                                                   ** **** * *     ** *    * ***         *       ****      ******  *    *  *       *    **   * * ****** ***    * ****** ** ********** * ***    * ********** ******  * ** *  ** ** ****   ** *******  *****
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 rotein, lambda family                          *              *                                      *  *         ***** * *** ******      *  *    *                 *     *                                                                            *    * **      *   *                *                *            *      *                                                                                                                   *           *      *  *             *       ** *    **** *             * * *  **  *     *      *     *  ***** **           * ***                           **  **   *        ** ***  ***** * ***  *     *    ***     *      * *  * *   *      *  * ****               ** ** *                                    ******                          *      *** ***** **** *********** **          * ** ** * *  ** * ****                           ***  * *        *                  * *   **   *           *         *    *         ****  *                                                       *          ** *  *  * ***  *    *                  *  *             * *  *       *  *** *     * *     ***   *  *    *        *    * *   *                        * *  * **  *               *             
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  LuxE                             *  ******* *        **       ***   ******** ******   *              * *  *  *   *                     ****     *      *  **       * ***  *   ***  **      **** *     ******** *                      *          **                                      *****           * * *           ******    *     *                       *                  *                                                *  **          ****    * * *   *   ***   *    *   **         *  ***   *** *                 *     *       *    **   **       *         *   * *                                *  *   *****************************  ******  *    *  *    *           *** ****  *     * *** *** *     **                      ***   **        *        *  *   ** *     *        *   * *  **   **  ***   * *     *  ****  **                                                        *               *** *           ***                    *** ******                                                                          *  *                  *             *                             *          *  *                       *       *  ****                   * **     *                  *   *      **       *   *  *          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 DUF2130:Uncharacterized prote  --------2---21---------1------------1-----------------------------1- ---------------1-----------1111-----------------------------------------111-----1-----1111----212---1----11-1---------------1--1------1------1-----1-22-----111-------1---1--1222-1112-----------111111-21111211-1-----22---1---1111132-1-------------------1----11--1----------1-----1111111111111111111111111111111111111---1111-2--1---11---2-1---------1---1----1--1----------1----------------242--1-111----------1--------1-2--1---1-------1------------1---------------1------111--------------11---------------------------11----------------------------11-------11--------------1---------------1----------------1--111111-1-1111111---1-----11------------1-------------------------------------------------1--------------1----------------------------------------------1---------1--2------1-------------------------1-------------1------------------11----1-------------1--22--21----1-----3----1-1--1--1111-311-1111---1---------- -1--231-------12-1-1---11-1--1----1------------1-1121--------1------------1---------------2--2-----1-3---2---161---2---1--2-1--------11-1---------1-----1-11-1-23142311---2-61---1-1-------13-2----2--1
 in conserved in bacteria (DUF          *   **         *            *                             *                 *           ****                                         ***     *     ****    ***   *    ** *               *  *      *      *     * **     ***       *   *  **** ****           ****** ******** *     **   *   ******* *                   *    **  *          *     *************************************   **** *  *   **   * *         *   *    *  *          *                ***  * ***          *        * *  *   *       *            *               *      ***              **                           **                            **       **              *               *                *  ****** * *******   *     **            *                                                 *              *                                              *         *  *      *                         *             *                  **    *             *  **  **    *     *    * *  *  **** *** ****   *            *  ***       ** * *   ** *  *    *            * ****        *            *               *  *     * *   *   ***   *   *  * *        ** *         *     * ** * ********   * **   * *       ** *    *  *
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[4954] PF07173            336                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1  1    1                                                                                     1        1             
 DUF1399:Protein of unknown fu  ---------------1---------------------------------------------------- --------1--1----------------------------------------------------------------------------11----------1----1----------1------2-----------------------1--------------------1-----------------------1----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------1-----------------------------11---------------1---------------------------------------------------------------------------1-11------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1 -----1--11--212222-4234444422----13-11111221---334696755173222--------1-2-3------918-3----0-24-32-1---13-1--955----------------------------------------1----------487--2---225--16-1-----5346-622---1-2
 nction (DUF1399)                              *                                                             *  *                                                                            **          *    *          *      *                       *                    *                       *                            *                                                                                                                                                        *                                                                                                       **                   *                             **               *                                                                           * **                                                *                                                                                                                                            *                                                                                                  *      *  **  ****** **********    ** ********   ***************        * * *      *** *    * ** ** *   ** *  ***                                        *          ***  *   ***  ** *     **** ***   * *
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 Sterol_MT_C:Sterol methyltran  --------------------1------1---------------------------------------- ----1-------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1----1---------------------1----1-1---------------1-----------------------------------------------1-----------------------------------1--------------1--------------------1--------------1--1---------------------------------11------1--------------------------------------1-11----------------------------1-----------------------------------------------------1111--------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ ----111-321-11123111211222111112323222222111112122222212322121111111-11111111-1111111121113133711111121323-112------221111-3111512-2-4231-1--121--212-221312-------1-----------11223223-1444013213--1-3
 sferase C-terminal                                 *      *                                             *                                                 *                                                     *                                                       *                                                                                                                                                                                                      *                                             *    *                     *    * *               *                                               *                                   *              *                    *              *  *                                 **      *                                      * **                            *                                                     ****                                                              *                                                                                         *** *** ******************************************************** ******** **************************** ***      ****** ******* * **** *  ***  *** ******       *           ******** **********  * *
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 PCP_red:Proto-chlorophyllide   -----------------------1---1--2------------1------------------------ --1-------------------------------1------1-11-1-----------------1-------------1---5------------------------1----------------3333432332322222----12243222212212212233132221111111111111----------------------------------------------11-------------------------------------------------1-----2--11111211111-------------1-----------1------------------------1---2------1--1---------------------3-22--12322211111-1111--22223-23----1---------11-----22-22222---------------122--------------------------------1-----1-211111-111-11--1111-1--------------------11--------------1----1----111------1--1--------1-2111-----------------------------11-----------------------1----------13-------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1---------------------1-1------------------------------21--1---------------------1-----------------------------------------------1--- ------1-1--------2-1--1-11-------2-21---------211--11-----1--1-1--11-11---111111111111---11--1--------------1----1---------------1-1---1-------1----------------------1---------1211121-1--31--1--1211-
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===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[4957] PF06782            336                                                                                                                                                                                                                                                                                                 11                                          1                                                            1                               1      1     2   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
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===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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 Barren:Barren protein          -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1--------1----------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1----------------- 2112121-622211211121121121112231311212121111122211111111122111112211-21-1121111211111111111211161111251213343112111123212412322128-212235113211311121113113431214212123212--3212411221121222121-2411231
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 RELT:Tumour necrosis factor r  ---1--------------------1--------------------1------1--------------- -1---------------------------------------------------------------1------------------------11--------1-1------------------------------------------1-1---------------------------------1---------1-22122111-31233--1---1-12-11111-1111112--11111111111111-------------------------------------1--------------11111111-11------------------------1-1-1--1-1--1-----1-----------------2--1-----------------------------------------------------1-1-11-------1---------------------------------------1---------1--------------------------2-------------------------------------------------------------1--------1-----------------------------------1--12--1-----------------------1------------------1------------------------------------------------------------------------------------1111-11-1--1-------2---------111111---1--------------------1------1--1-----------------------------1------1----------------------------1---111-------------- 1111------1------1------------------1--------------1---------1-------------------------------1--------------1133322833-51332442738-6-54634413353323132332952323-2--5-3-----13-1-----------1-2-32---2---
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