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Ranking of HM:PFM:REP : from 5001 to 5100

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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 DUF2934:Protein of unknown fu  ------------------------111-1--------------------------------------- 112------------1122-2-111-222221---------2----1--------------1-----2----------1-------11---------------1--------------------111333213-1-----------11----3-1-------1-------------------1-1---------------------------------------------1--------------------------------11-----------------------------------------------------------------1----------------------------1-------------1-------------2-3---1211------------1222242311--1221453506313-------21221-------------11132--------------------------------1------1-1121-1----1132-------2-1-----11-2----1--1----211-1------------1-------------11-------1---111111---------------------------22--1-2-----------------1----1-----1--1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------1-----------------------------2-11111112111213111--------------------------11111-11------1------------------------------------------------------5-- -1--------------11------------1----1-1111-1---2---1113------------------------------------121--1111---------1---11------1---32---3-----------11--------1-----------1--1--------11124122-421-1-21---1-1-
 nction (DUF2934)                                       *** *                                        ***            **** * *** ******         *    *              *     *          *       **               *                    ********* *           **    * *       *                   * *                                             *                                **                                                                 *                            *             *             * *   ****            **********  *************       *****             *****                                *      * **** *    ****       * *     ** *    *  *    *** *            *             **       *   ******                           **  * *                 *    *     *  *                                                 *                                                    *                             * *****************                          ***** **      *                                                      *    *              **            *    * **** *   *   ****                                    ***  ****         *   **      *   **   *           **        *           *  *        ******** *** * **   * * 
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 EutC:Ethanolamine ammonia-lya  ------------------------111----------------------------------------- --1---------2-2---------11-----11---1112-1--1-----------------1--111--1------------------1--------------11--------------------------------11---1----------------------1-----------------1-------1----------------1----------1---1111112---------------------1-----------1-----------------------------------------------1----------111------------1---11-21--------11-1-----------111-11--------11112---11111------------12111312----1--1111211--11----1--------11111111-11-1--1----------------------------------------1121111111111111111112111112--221211---1-111------11------------1---1---1------1--------21----1-------------------------------11-2---1-1-----1--------------------------1------1111111111-11111-1111111111111222--11-111111111111111-1111---1-------------------------------1---------------11121-----1-11111211111111111--------------------------121111111--1----11-----------------------------------------------------1 --------1--------1----------1--------1-1----1-1----11-1-1----------------1------1----------1---------1------1------2-1---1---1-516-4-111-12-2--1-1----11-----1--21--------------1-------1----------1---
 se light chain (EutC)                                  ***                                            *         * *         **     **   **** *  *                 *  ***  *                  *              **                                **   *                      *                 *       *                *          *   *******                     *           *                                               *          ***            *   ** **        ** *           *** **        *****   *****            ********    *  *******  **    *        ******** ** *  *                                        ****************************  ******   * ***      **            *   *   *      *        **    *                               ** *   * *     *                          *      ********** ***** ****************  ** *************** ****   *                               *               *****     * *****************                          *********  *    **                                                     *         *        *          *        * *    * *    ** * *                *      *          *         *      *      * *   *   * *** * *** ** *  * *    **     *  **              *       *          *   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5003] PF03921            334                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1        1    1 1 1 1                                                               
 ICAM_N:Intercellular adhesion  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1----------1---------------------1----------------------------11---------------------11111111----------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1-----------------------------1-----1------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------1-------------------- ---2----------------1---------1------1111-----------1--1----1-----1---1----1--2---------1------1---2-3---1---21635-036323775176867-5-1861563947792442363184--1113114411--11-1------------2--2-11-1-1---
  molecule (ICAM), N-terminal                                                                                                                    *                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                *                        *          *                     *                            **                     ********                                                                      *                                                          *                             *     *                                                                                          *                       *                                                                                                    *  *                                                     *                        *                *         *      ****           *  *    *     *   *    *  *         *      *   * *   *   ***** *************** * **********************  **********  ** *            *  * ** * *   
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[5004] PF04971            333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11        1         1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 Lysis_S:Lysis protein S        ---------------1--11-1--1----1-------------------------------------- ---------------------1---1-----------1-------1---------1------1----1------------1---------------------------------------------------------11---11-------11--------1-------------------1-1----------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------11---111---1-------------1----------------1--1--1--------------22----------1------------------------------------------1-------1--------------------------------------------------------1---------------11----11111-1-1----------------------1-----------------21--------------------------------------------------------------------1---12-1----------1--1--------------2---2-3204342332-3253257334155233433----1--1-----11--1--------2335322-----1---------2------------1-------111-----1-1121------------11---111--------------------1-----------1-11------------------------------------------------------------------- ----1---11-----11--1----24--------12-222111---1-2----21------------1-------1-----11-------2-1-------------1-3---2---21----111-1-21-1-32---------------1---2----1-1---21---1--1--1----1-1---13-------21-
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 Nop16:Ribosome biogenesis pro  ------------------------1-----3-----1------------------------------- -----------------------------------------------------------------------1111------1-------------------1---11-----------------------------------------------------------1-1-------------------------------------1---------------------1------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------------------------------------1----------1----------------------------------------------------1-----------------------------1----------11------------1-------------1--1---------------------------------------------------------------------------1-----------------1-----------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1----------------------------------------------------------------------------1-------------------------------- ----223-31212121211121111-111111111112222111111211211111211211211111111111211113111111111-1121111112-212111153434322-1122211131216-3-21313113-113111122111-1112-22112212112-732-211-22122211222-1222322
 tein Nop16                                             *     *     *                                                                                                       ****      *                   *   **                                                           * *                                     *                     *                                    **                                                                                                       *                    *                                           *          *                                                    *                             *          **            *             *  *                                                                           *                 *           *                                                                                                                          **** *                                                                            *                                     *** ***************** *************************************************************** ********** *************** ************* * ******** ************ **** *********** *** *** *********** *******
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[5007] PF08708            333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
 PriCT_1:Primase C terminal 1   -------------------------11--------------------1-------------------- ------11-------------1--------------1112-------1-------11---1--1-1-222------------------332--1------------1---------------------1-------------111-1-----1311-----1----123--2-----2-----1--1--1-1--1-11--------1-------1-121-----1------1221-1-12----2--1--1-2----2-11-122--1213-1--113-33--1---------1--2--11222-233-111---1-11--12-------1--11-1----1----21-1---------2---------------------------------------------------1----1-----------1---------1--------111111111-------------------------------------------------11----------21--------1-1-----1--------1--------1---11--------------1-----5---------------1-1--------------------------------2--2-----------------------------1-----------1--1-331----1--41----31-14-211-11-------1------1--1-1-------2----1---------------------------1-----------1-------4-1-----11--------1-----1-221-----1-------1--------1---32121----------------------------------------------------1----------11-- -----2----1----1--11---1-1---------------------21--11---1-1----1--11------------1-------------1-122--1--1--12---------1----2-1-1-------1------1----------------11---1-12-------1-1---1------2-----1111-
 (PriCT-1)                                               **                    *                           **             *              ****       *       **   *  * * ***                  ***  *            *                     *             *** *     ****     *    ***  *     *     *  *  * *  * **        *       * ***     *      **** * **    *  *  * *    * ** ***  **** *  *** **  *         *  *  ***** *** ***   * **  **       *  ** *    *    ** *         *                                                   *    *           *         *        *********                                                 **          **        * *     *        *        *   **              *     *               * *                                *  *                             *           *  * ***    *  **    ** ** *** **       *      *  * *       *    *                           *           *       * *     **        *     * ***     *       *        *   *****                                                    *          **        *    *    *  **   * *                     **  **   * *    *  **            *             * ***  *  *  **         *    * * *       *      *                **   * **       * *   *      *     **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5008] PF12414            333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        21   2 1 1 1                 1                                             
 Fox-1_C:Calcitonin gene-relat  --------------------------1----------------------------------------- ------------------------------------------1-121----------------------1------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------11------1-211---------------------------1-----------------------------11--------1----------------------------------------------2------------------1---1--1--------11--------------------------------------------------------1------------------------------------------1----------------------------------1--1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111------------------------------------------------------------------- -----------1---1------------------1--1111-1-------11-1---1---------------------------------1---1--------------16555666324435162955-1-26134347356235322632243453-----------------11-1--21-----1-------1-
 ed peptide regulator C termin                            *                                                                                    * ***                      *            *                                                                                                                    **               *                                                                                                            *                                                  **      * ***                           *                             **        *                                              *                  *   *  *        **                                                        *                                          *                                  *  *                                                                                                                                                                      ****                                                                               *   *                  *  **** *       ** *   *                                 *   *              ******************** * **************************                 ** *  **     *       * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5009] PF06218            333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 NPR2:Nitrogen permease regula  ------------------------------1------------------------------------- --------------------------------------------------1--------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1--------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-11-------------------------------------1--1-------------------------------------- --42222-111-211121111211111111111111111121121133222222221111121111111111211121112-111111112123222222123241-26-32223132211214522420-2-2213112211111113122-1122222422413611231441--1-6------1--2-131-116-
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 otein (DUF2044)                                                                    **                                                               *                                                           *              *                                                 *     *                        *                               *                       *                                                                       *  *                *         *                                                        *    *                                                                                  *                    * **  ***                             *                               *       *                                *                                                                                                                             * *                 *                     *                      *                 ***                                                                 ******* *** ***  *   **    *   *            * **  ** * * * ***     * *   *     * ** ******** ** ********************************** * ************************************* ************* **** *** **** 
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[5014] PF09649            333                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CHZ:Histone chaperone domain   -------------------------------------------------------------1------ ---------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------11---------1--------2------------------------------------------------------------------------------------------1--------1------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1------1------------------------11--------------------1---------------1------1----------------------------------------1------------------------------------1----1---------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1-----------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------- 11--12--2---22211434343233533222322232222222122233233312332433113111-11213111131121121111-5212-2211-321113-226111-12---1-11111-3-4-1-213211-2111--11-211-21--11-112321-22----1--3112-12211245331--3124-
 CHZ                                                                                         *                                              *                                                                                                   *                                                          *      **         *        *                                                                                          *        *                                                            *                                                     *      *                        **                    *               *      *                                        *                                    *    *                                                   *                                                                *                       *                                                                                               *                                                                              **  **  *   ******************************************************** ******************** **** **** ****** ****** **   * ***** * * * ****** ****  ** *** **  ** ****** **    *  **** ***********  **** 
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 XAP5:XAP5 protein              -------------------------------------------------------------------1 -----------------------------------------------1-------1-----------------------------------1------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1--------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1------------------------1--1---------------------------------------------------1----------1-------------------------1---------------1------------------------------------------------------------------------------------------------111---1------------------------1-11--1-1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------- 1212121-1---22111112112111112211212212222211221111211111111131111----1----11-------1-111211111121322121114-17232311121121521453226-3-424-11111121-3-11221-2-1125531223322331211-112431-11311421521221-1
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 DUF3267:Protein of unknown fu  -----1-1----22111-------2---1-1-------1111-1------11--121-111------- 11--1---1-------------------------------1-----------------11------------------1--2------1---------------1-1----------------------------111----13--------11------------1--------------------11---245345333-425322-13332433---21--222222111222222222222221223221------2------111-1-1-------12--1---1111111-11-------------111---11111-1-12121111112----1-21--2--------------1-----2--1--1-----1-------------------1------1-------------------1-----------------------------2--------------------------------------------------------------------1--1----------1--------------------------1---11---------------1-----1--1--1---------------------1----11------1---------------------------------------1---------------------1---11-------------------1-----------------------------------1---1-------------1-----------------1---1---------------------------1---1--------------------------11-------1--------1--------------------------------------- -----1-----11-------121-----------------------4--1--------1111----------1--2--11-----------1------1----1-1--23--------1-1---1----------211-----1-------1--------4--1-2-2--1--11----------1--3-11-1-1---
 nction (DUF3267)                    * *    *****       *   * *       **** *      **  *** ***        **  *   *                               *                 **                  *  *      *               * *                            ***    **        **            *                    **   ********* ****** ********   **  ******************************      *      *** * *       **  *   ******* **             ***   ***** * ***********    * **  *              *     *  *  *     *                   *      *                   *                             *                                                                    *  *          *                          *   **               *     *  *  *                     *    **      *                                       *                     *   **                   *                                   *   *             *                 *   *                           *   *                          **       *        *                                             *     **       ***                       *  *        ****          *  *  **           *      *    * *  **        * *   *          ***     *       *        *  * * *  *  **          *  * ** * *   
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[5019] PF07923            332                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 N1221:N1221-like protein       --------------1----------------------------------------------1------ -------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1------111-----------1---------------------1-----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1--------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1--------- 1---31------22111111112111111111111132112111113211131211222111121131111121111-11122111-11-221111112111123--5--23225442412222542436-2234632222222243233323431423134-213221171321--1----------211--11232-
                                              *                                              *                                                              *                                                                                                                                               *                               *      ***           *                     *                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                      *                            *        *                                                                                                    *          *   **      ***************************************************************** ******** ** ***************  *  ******************** ******************************* ************  *          ***  ***** 
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[5020] PF05549            332                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                                                                     
 Allexi_40kDa:Allexivirus 40kD  -----------------------------------1----------------1-------------2- ---------------------------------------------------------1-------------------------11--111----------------------------------------1--------------11-------11--1---------2--1-----1------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21111------2-1------1-1-----------------11----------------1--1--1---------------------------------------11--1-1---------111------------1--------11---------------------------------1--1---------11--1-----2---1---------------1-1---1-1------------------1-----------------------1---1----------1----1--1-----1--------------------11-------------1----------2----1---1-------11----1-------1--1-------------------------------------------1----------------1---1------------------------------11---1----------------------------11----------------------------1---------------1---------1-----------1-1-1-1-- -13222--211----1-11-1---3--222111-11--1-2--1--3321-331-21-111-1-1--1-233-12132-1-111---2---2-1-3-1-1221121-21261-188313--13-32-1-2-112-3--12--23----32---1-11-11512251312---3111--1--1--34114-1-12122-1
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[5034] PF11078            331                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Optomotor-blind:Optomotor-bli  ---------------------------------------------------1----1----------- -1-----------1-----------1--------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------11-----2----2---------1------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1----------------------11-11--2---------------1-1------1-11------------------------------------------------------111111211111----1111-----1111---------1----1-1-------1--1------------1-----------------------------1------------------------1----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1---1----1-----------------------------1--1--------1----------------------------112----------------------------------------------------------------------- ----51--31-1---111-11111-112345133111-223441215-3-12131--4321111-----1-111-----1-3441----1-2112--2-1-6--63-28--111-121-1----4-1314-4-3211111-1-41-21-311-3-2121-1-31-12415132--11623---312322-11-21-221
 nd protein N-terminal region                                                      *    *             *           *           *                          *                                                                                   **     *    *         *      *                                                                                                      *                                                        *                                                            *                      ** **  *               * *      * **                                                      ************    ****     ****         *    * *       *  *            *                             *                        *                                                    *                                                                                    *   *    *                             *  *        *                            ***                                                                            **  ** *   *** ***** ************ ********* * *****  *******     * ***     * ****    * ****  * * *  ** **  *** *** *    * **** * ******* * ** ** *** * **** * ** ********  *****   ****** ** ** ***
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[5035] PF12355            331                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                               
 Dscam_C:Down syndrome cell ad                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1                               
 hesion molecule C terminal     --------------------------------------------------------1----------- 1---1--------------------1------------1-------1------------------11-1-----------1-------------------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------13------------------------------------------------------11----1----------------------------------------------------------------------------11--------1---1-----------------------1-----1--------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-1--------------1------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------3------------------------------------------------------------------------ ----12--4-1-----111-----11112--1-----111-111-1-1--112-411324-11---1---1------1-1--1-------1111-----1-2-11---9-31--5---3--1112112-1-2-2-1--2-11-1111-11-332-2--1--121134026612---423-111-11533-23-112-42
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 DUF497:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- 1-2----1-------------------------------1-----------------------------------11---1---------------------------1---------------123-22--7-----13------05-481--13-------1-1-31--------------1--1----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1------------1111--3--31-----12131341111111-112-32131351-------1----21-121--1---4---------------1----4----------1-1--11-211------------1--221-1----1--------1-1-1--2-112-2--------11--11--6-----------1--1-11-------3--2-1--21---111--6-1----------------------------3---114---11----1-----1-------------1---6--4------------1--------1-------------1------1-1------1-111-1-1--1111-1----------11211111-22--2-1111----------11---------1---1---1---1-1-----11---1-21----1---------1--11-1-------1---------2121----11--2---------7---------------------------------1------- ---1------11-----------1-------11------------------------------------------1-------------------------1-----------1----------------------------------------1----21-1--------------------1----1-----1-1--
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[5038] PF04520            331                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1      111 1        
 DUF584:Protein of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ------------------------1-------------------------------------------12--------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------11-1--------------1----------------------------------------------------------1-------------------------------2----------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--11-----132-113-11---1-1--22-121222-3211-1322-2--11121-1----------1211-111131----11-12221-------31-1-334221111-12421412329-51223111231211111121-1-2512321-311211-1211---3141--2124885167123423-
 ction, DUF584                                                                                                               *                                           **                                                                                            *                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                        *                                            ** *              *                                                          *                               *                                                                                              *                                                                                                                                                                                                    *  **     *** *** **   * *  ** ****** **** **** *  ***** *          **** ******    ** *****       ** * ********* *********** ******************** * ******* ****** ****   ****  **************** 
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[5039] PF12436            330                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 USP7:Ubiquitin-specific prote  -1----------11------------------------------------------------------ ----------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------1---------------------1--------------------------------------------------1------------------1-1---1-----------------------------------------------------1---------2-----------------------1---------------------------------------11-11-------------------1------------------------------------------------------------------------11------------1-------------------------------------------------1----1-----------11-----1-------1----------1----------------------1----------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------11------------------------------------------------------ 1---11--311-3213222-1111111333333212111121123431212123113222112121-1111121111-2213321222222121211211221322-12161111-2111111132-4-2-1-213-1--11123--121121224211142111121--211321-2-2113113125235--1211-
 ase 7                           *          **                                                                                                                                                           *                                                                                  *                     *                                                  *                  * *   *                                                     *         *                       *                                       ** **                   *                                                                        **            *                                                 *    *           **     *       *          *                      *                                                                            *                                                                                             *                                                   **                                                       *   **  *** ******* ********************************************** ********** **************************** ******** ********** * * * *** *  *****  *********************  ****** * *************  **** 
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 MRP-L28:Mitochondrial ribosom  --1-------------------------------------------------1--------------- ------1-----------------1------1--------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------1-31--1-------------------------------1-------1-----------------------------------------------------------1-----------1---------1-------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------1-------------------------1--------------------------------------------------------1------------1-----------1-------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1------------------------1---1---------1--------------------------------------------1------------------------------------------------------------- -1--21--312--1112421112111111111121111111111112211222111111121111112111112143-4311122113115121-22121121231-12-3121-311121231711425-3-34221--32213-3122322311122-133221111121111---1-1321121233312-2324-
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 in signalling-like domain             *                                                                                                                                  *                                                                            *                         *                        ****   ***                                                                    ***                                             *                                                                                     *                                                           **                                                         ****  ***   *   *  ***   *                                       *                   *   * * *                                                                                                                                              *****               *                                                             *    ****             *  *                                            *    *        *        * *     *    *                        *       *             **   **      * ***  *   *  ******************** ****************************   ** **********  *       *  * **  ***  
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  RNA-associated protein 10                          *                                                                                     **                 *                                                                                           **  *                 *     *                                                       ** * *********     *       *                                                    **       **                                                             *                                                                                                                                                    *             *                                                   *                                                                                    *        *   *  **              * * ********** *           *** **              ***                            **        *                                                   *                                              *           *   * * ** ********************************************************* ******** **************************** ********** ************ * **** *** * * ******************** ******** **** ************ **** 
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 CIAPIN1:Cytokine-induced anti  -----------------------------------------------1---1---------------- ------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1------------1-----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1122----------1--------1----1-----------1--------------------------------1------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1-----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1211112-421-11111111-11111222113311113122221-112111111111122121111111111-111111112112111111112222211-12211221222521132113211111313-2-524-2-1121--222121111-232348424243211112221-1132113142222321112231
 -apoptosis inhibitor 1, Fe-S                                                  *   *                                                                                   *                                                                                 *                                                       *            *           *                                                                                                                                                                                          *                                                                                                      ****          *        *    *           *                                *      *                      *                                                                                                                                                            *              *                 *                                                                                                       ******* *** ******** *********************** *************************** *************************** ***************************** * *** * ****  ********* ********************* **********************
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 DUF1342:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------1--------------1----------11111--------------1-111----11--7--------------11------1------1-------------------1-------------------1-----------------------1-------------------------------------11------------------------------------------------------------------------1----------------1------------------1---------------1---11------------------------------------------------------------------------------------2222111111111111112111111111111111111111111112111111111111-------111111-1---1-1--1--------------------1-----------------------1-1111-1--111-12122211111112121111--1-111------21111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--111111111111----2-----1----1------------------------------------------11111111111111-----------------------------------------1---------------------1---------- 1-1111----1----1----111--------11--1-1-----------1--1---1----------1--1---132----12--------------1------2----231-11----------1-1-2---1-----1-------1-------1-------11-1--1-12-1----------2-11----122-1-
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Rep_fac-A_3:Replication facto  ---------------------------1-------111111-11-----------1---11------- -1--1--------1-------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1--------------------11----------11--------------------------1-11---------------------------------1-----------------1-------------------------------------------------------------------------------------11---------------------2-----------------------1---1----1-----------------------------1---------1-------------------------------------------2------------------------------------------1---------1--1---------------------------------------------------11-----------------------------------------------1--------------1----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------11------------------111-------------------------------------------------------------1-- 23-11-1-411-122121111112111111111111222222211131231211112121222111111111111111221111121211-122121111-212331111212111-1121131122215-1-11211141111-111211111122222-122122411---1--1-11111122115242111222-
 r A protein 3                                             *       ****** **           *   **         *  *        *                                                                                           *                           *                    **          **                          * **                                 *                 *                                                                                     **                     *                       *   *    *                             *         *                                           *                                          *         *  *                                                   **                                               *              *          *                                                                                                   *                                                                     **                  ***                                                             *   ** ** * *** ****************************************************************************** ********* *************** ************* * *********** *************** *********   *  * ******************** 
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[5069] PF05766            328                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     2                                                                                                                                                                                                                                                                             
 NinG:Bacteriophage Lambda Nin  --------------------------------1-------------------1-------------1- --1-1-------1---1----1----------------------1-----------------1---1--------------1---1--3153-21-----32------------------------------1----------1-------1-------------------------------------------------------------1-----1-1---------1---------------------1--------1--------1------11-1--1--1-----------1212221132122-----------1-------111----111-----------1---1--1-------------121-------------4--11-1---------------1------------1---1-1---------22----------------------------------------------------------1-------------------------11-------------13-----12--------------1-1-----3----1-1---2----------1------------------------------------------------11-------1-1-----------------12-1-1--44--------4-1---2---4----1--1-1---2--31-121-22-222212----------1111--1111-------------------11--1---3--2211----------------2-1-1-111--1-1----------11-------11------2034-----------1------------------------------------------------------- ----3---1---11---1--11---1----111---------------1-1-1------111---------------------------------2-------1----212223-32---1--------------1--1---12---------11---211----41---2--------------2--11-1-1131-1
 G protein                                                      *                   *             *    * *       *   *    *                      *                 *   *              *   *  **** **     **                              *          *       *                                                             *     * *         *                     *        *        *      ** *  *  *           *************           *       ***    ***           *   *  *             ***             *  ** *               *            *   * *         **                                                          *                         **             **     **              * *     *    * *   *          *                                                **       * *                 ** * *  **        * *   *   *    *  * *   *  ** *** ** ******          ****  ****                   **  *   *  ****                * * * ***  * *          **       **      ****           *                                                            *   *   **   *  **   *    ***               * * *      ***                                 *       *    ****** **   *              *  *   **         **   ***    **   *              *  ** * **** *
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 of unknown function (DUF1100)                                                **  *                       *        * *       *       *    ***** *             *   ** *  *          *                                      ******            *   *    *           *           *                                        *      *                                    *      *           *                                                    **                                       *                   ****  *                        *   *  * *           * *      *                                               **        ***   ****  * * *** * **       *        **        *              *   *                       *                           *  ***       *                                ***************** **************************************************** ************     * *         *   *         **      *           **      ***          **************                                                                         *                ************      **********   ****************          *       *    *      *        **         ** *                                           **    *   *         **  *     **      * 
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 Upf2:Up-frameshift suppressor  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------11----------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------11-----------------1-----------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1----------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1------- ----132---1-111131121211112112111121111111121112111111112121111-1111-311-111111111111212111432311123111111-23-12111132111232321318-31425211212231122122315313312522215222121523-11222112181244122212-2-
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