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Ranking of HM:PFM:REP : from 6001 to 6100

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 deoxycytidylate deaminase zin                            *                    *                       * *      *  *      *   *      ***** *  ***     *               **           *                            *                     *   *                      *                                                               *                                                                                                                                   *                     *****                                *                  *                                                                          **    ****** ******* *       *                                          *                                                   **       * *******************             ***************** **************************************************** ************               *  ***************                  *                    **************                                                                                 *    *    *              *        *          **        *                       *   *  ** *           *  *         *  *   *                 *                      * *   * ************* ******   
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[6008] PF03832            265                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1   1   1 1                                                               
 WSK:WSK motif                  ---------------------------------------------------11--------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1----------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----------------------1--------------------------------------------------1-----1-----11------------1----------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------1----------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1 --------22-2--1--2------1--11---1--1----1-----------11------2-1--------------------------2---1111------1-1---21--54344332243744717-8-25354344231535311431435242------122--2--1--------1---11---1--211--
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 Extensin-like_C:Extensin-like  -------------------------------------------------------------------- --1------------11----1----------1111----------------------------2-1---------11-----------------------------1------------------------------1------1-------------------1--1-----------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------11--1-----122234321222211221222222-22222222211-32212325222233-1-111111111111111111-11--1-1------------------------------21121--------1--------------1--1--------1--------1--1-----------------------1---2---1------1-1-----------31-1-----------------------1---------------1-1---1111----1-1-------------11---1-------------------------------11111---1111111111111111------------------------1-------------1--------------------------1-1111-111111121111--------------------------1-1---------------------------1---------------------------1------------- ----2-------1---1------------------1--11------11-------------1-1----------1-----------------1------1---------------1---------------------------------------811-1121----------2----1------2-----1-----1-
  protein C-terminus                                                                                   *            **    *          ****                            * *         **                             *                              *      *                   *  *                             *                                                                                                                                                  *                            **  *     ************************ *********** ************** * ****************** **  * *                              *****        *              *  *        *        *  *                       *   *   *      * *           ** *                       *               * *   ****    * *             **   *                               *****   ****************                        *             *                          * **** ************                          * *                           *                           *                  *       *   *                  *  **      **             * *          *                 *      *               *                                       *** ****          *    *      *     *     * 
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[6010] PF06207            264                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1002:Protein of unknown fu  ---1-----------------------------112--1112---------1-1-------------- ----------1--------------------------1---1----------1---------1-----1-------------------------------111--1-1-----------------------------------1---2---------1-------1--11-----------1---------111111111121112312122211112112111------111--1-1--11----1----2-112112111111221212-------1111111-11111111111111-11-11---11-1111121111-11111112212111-2111222-1-11--1-------1--1-112-------------------------------------------1----1----------------------------------------------------------------------------1-1--------------1--------------------------------------------1----1111---------------1---------------------------------------1-----2---------2-1------------------------------------------------------------------------------1----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1-----1--------------------------------------- 11-11-1-----1--2-------1----------------------1--1-1-----------1--1----1-----------------1-------------------11--1-2---1------------------------------1----11-1322-22-13--13311--1----1----11-1----1---
 nction (DUF1002)                  *                             ***  ****         * *                         *                          *   *          *         *     *                               ***  * *                                   *   *         *       *  **           *         *********************************      ***  * *  **    *    * ******************       ******* ************** ** **   ** ********** ************** ******* * **  *       *  * ***                                           *    *                                                                            * *              *                                            *    ****               *                                       *     *         * *                                                                              *                *                                                                                                   *                                   *     *                                        ** ** *     *  *       *                      *  * *           *  *    *                 *                   **  * *   *                              *    ** **** ** **  *****  *    *    ** *    *   
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 MecA:Negative regulator of ge  --------------1----------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1------------------------------------------------------------------------132222222222222232222222222222122311111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111112222221222111111111111111111111111---1--1------2-1-------2-1---223-11------------------1----------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------11------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111--1111-1-1111------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------1----------1-1------11--------------------------------------------------------------------------1---------- -1--11-------------------------------111111---------------------------1----111------------1----------1--22---22----------------------3--------------------1---21----12--2-1--1----------------21----1--
 netic competence (MecA)                      *                                                                                                                                                 *                         *                                                                        ************************************************************************************************************************************   *  *      * *       * *   *** **                  *                                                                *                                                   **                        *                                                                                                                          *****  **** * ****                                                                                                *                                                    *          * *      **                                                                          *            *  **                               ******                           *    ***            *          *  **   **                      *                    *   **    **  * *  *                **    *  
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[6016] PF09483            264                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HpaP:Type III secretion prote  ------------------------2---1---------------1---------1------------- --2--11---------1----------------2222----21-11--1--1-11-----1-1-1-1--2--------------------------------------------------------------------2----------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2---1------------------11-1-------1-1--1----1---2---3---11111111----------------------------------------1----11-1---111211-----212212-----------1--1-----11--------------------11-------------11-1--1--------1-2-1---------------------1----------------11-11--------1--1---------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------111-1---------1----------------------------11111111---------------------------------------------------------1------- -----1--4------11-3-111-11211--11--1--3-1-1-----11-32121-2--1----------------------------12211--1-2--3-1---14-------1--22--211-216-1-221--1-1-1-1-35-------232---111211--1---1-141122--3--4322--1--3-42
 in (HpaP)                                              *   *               *         *                *  **         *                ****    ** **  *  * **     * * * *  *                                                                    *                *                                                                                                                                                                                                                                            *   *                  ** *       * *  *    *   *   *   ********                                        *    ** *   ******     ******           *  *     **                    **             ** *  *        * * *                     *                ** **        *  *               *                                                                                                 *                            *** *         *                            ********                                                         *             *  *      ** * *** *****  **  *  * * *     ** ***** *  *                            *****  * *  * *   **       *  **  *** *** * ***  * * * * **       ***   ******  *   * ******  *  ****  *  * **
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6017] PF11598            264                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                                                                                                              
 COMP:Cartilage oligomeric mat  ------------------------1-----------------------------------1------- ------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------1-------1--1------------------------------------11------------------------1----------11---------------------------------------------------------------------------------1---1---------------------------------1----------------------------------33----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1------------2--1-----1--11---------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -1---12-2-11------11----------------1111-11---13------------------1------------------1---1-----2---1--11-----1338456-3323333452437-4-5262222433331332333342434236311-125113-1----1-11----2--3-2------1-
 rix protein                                            *                                   *                                                                                                  *                                            *       *  *                                    **                        *          **                                                                                 *   *                                 *                                  **                                                    *                                                                                                                                              *           *            *  *     *  **                     *                                                                                                               *                                                                                                                                                                           *   ** * **      **                **** **   **                  *                  *   *     *   *  **     ******* ************* * ******************************* ****** *    * **    *  * *      * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6018] PF06707            264                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                          
 DUF1194:Protein of unknown fu  ------------------------1-----------------------------1-1---1------- --------------1-----------------------------1-------------------11-311--------1------------------1-------------------2---------------------1---1----1-1---11----------11----------------1------11-------------1---1111--11---------------11111111111111---1-1-1----1---11------111-11111111111111111111111111111111111111111111111---------1-----1------------------------------------------------221-1111111----------1-1211211224--1---1121111-11--341-21223-3------------213----------------------------------1--111----1-------------------1---------2------------1--1--1-------------1--1-----1----------21------1--------------------1--------1----1-----------1--------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-------------------------1--1-----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------1--- -1----------11------11-1-1--------------------1-------11---111----1------------1---------111---------21---1-5-------------------------1--------------------1--11-116------11-1--1---1--1-------1--13---
 nction (DUF1194)                                       *                             * *   *                      *                             *                   ** ***        *                  *                   *                     *   *    * *   **          **                *      **             *   ****  **               **************   * * *    *   **      *** ***********************************************         *     *                                                *** *******          * **********  *   ******* **  *** ***** *            ***                                  *  ***    *                   *         *            *  *  *             *  *     *          **      *                    *        *    *           *        *                                                                                                                   *                         *  *           *                                                                                                   *     *          **      ** * *                    *       **   ***    *            *         ***         **   * *                         *                    *  ** ***      ** *  *   *  *       *  **   
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 ction (DUF3372)                                                 *                                    *    *                                       *       *      *  *  *** *                ****                                           ***     * *           *      *                 * *      * ***************  ** ****     **            * * **   **      *                *           ***   ***********              ** * *****   *     * * *  *******  **  *  *     **     *      *              *                                                                                                                                                                   *  **           *                                                          ** * ** *  *  **         **                   *                    *            **** **      *                                               *                            *        *    *   *********   ** * * *****  ********                *       *          *  ****        **********         **              **        ***           * *       *                             *                      * * *  *       *                                 *  ** ****  *     * ******* *** * **  * ** 
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 ein                                                                 *                                         *                                                                                                                                *                                            *             ***    **  *                                                                                                                                             *                      *               *                    *   *       **                                                                                                                     *                      *    *   *                     *    *                                *          *               *           *  * ******* *** **** *********** *****   **** ****** ******  *** ** *           *                 *                      **           *    *                                                                                           *                                          *             *   * *                                                        ***  *  * *   *** * * * *** ****  ***    ** *** ** *     *** ***     ** * *  ***          
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 otein N terminal                                                                                 *               **                       *                *                                                                                    ***     *                *                                                * *                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                               *  *** *   ***  *  *  * *           *******  ****************       *       * *      ****** ******* **    **  ***** ************* * ************ * * ****************** ****** **** ******** **** ****
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 APP_amyloid:beta-amyloid prec  -------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------1----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--1----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------12------------1----------111-11---1--1----------------1---1-------------------1--------------1----13549633223343862138-6-143233263364133326-2038133--1321211114121--------1-1--------------
 ursor protein C-terminus                                                                                *                                                            *                                                                              *                                                                   *                *                                                                                                                                                *          *                                                                                                                                              *                          *  *    *                                                                                                                                                              *   *                                                                                                                                                                                                         **            *          *** **   *  *                *   *                   *              *    ******************** * ****************** *******  *************        * *              
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 nction (DUF3147)               *   *              *         * *           *   ** ***                    *   ***                                *                 *      **         *                        *                  *          *           ***                                 **         *** ***************  * **  *          ********************       *                                                                *   **** ** **     **     *       **  *            *           * ** *                        *    *  *                                *****                               *              *      ***         *  *           *     *    *   **        *                  *   *  *     ***                               *    *              * *                                                     ***  *                                                       *       *               *           *  ****             *   *                                                                       *               ****     *  * **         ** *                * ***    ** *                        *     * ** *            * *         * **** *** * ***       ** *   * *     ** *       *     **     * ** * *     * * 
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 HrpB1_HrpK:Bacterial type III  11-----------------------11----------------------------------------- 1-2-1----------1211-11--1-11-1-11------------11-------------1---1------------------1-----------------------311111111-------1--1--------------------111-1--------------111--1------------------1------------------1---------11-----------------------------------11----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------1--1---------------1------------21-22-1---11-11-----21--------------1----1-------------------------------------4-1-1422341----3343-2-21---1-1112--3--1111-11-1-----3--------1---21-1---1----1111-11---1----2-21---------------------------2---1---1-1---1---------------------1---------1----1-1---------------------------------111---------------------------------------------------1-1-----11--------------------211-11-------1-1---------------------------1-11111111-----------------------2---------------------------------------- ------1-62-------------------------------11--------1-11--11------1----11---1--1-1---------------1-1------1--4-1-----2---12-----223----1-1--1--1-11---1-----22------1-2------11-1-21---11----2-1-1-13-2-
  secretion protein (HrpB1_Hrp  **                       **                                          * * *          **** **  * ** * **            **             *   *                  *                       *********       *  *                    *** *              ***  *                  *                  *         **                                   **          *                                                                                                             *     *        *  *               *            ** ** *   ** **     **              *    *                                     * * *******    **** * **   * ****  *  **** ** *     *        *   ** *   *    **** **   *    * **                           *   *   * *   *                     *         *    * *                                 ***                                                   * *     **                    *** **       * *                           * ********                       *                                               * **                               **        * **  **      *    **   *  * *               * *      *  * *     *   **     ***    * *  *  * **   *     **      * *      ** * **   **    * * * ** * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6029] PF07415            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Herpes_LMP2:Gammaherpesvirus   -1-----------------------1-------------------------------1-----1---- -1----1------1111------------------------------1----1---------1---------------------------------------------------------------------1---------------------------------11--------------11------1-----------------------------------------------------------------1------11------------------------------------------------1--------1-------------1-------------------------------------2----------------------------------1---1-----------------------1----------------------1--------------------1-----------------------11-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---111111111111-1111111111111111111111---1-1111111111111111-12----1---111-----------------1-------1-------------------------------------------------------11--------1--------------------1------------------------------------------------------- -----2----1-11-----1-----1-111------1111---2--111-----------11----------------11-111---------11---1--11112112-2-1212-1--123232-425-3-33612213232122-1-32-4-4412123-2--1--1--21--11-21--1-7-12----11-1--
 latent membrane protein (LMP2   *                       *                               *     *      *    *      ****                              *    *         *                                                                     *                                 **              **      *                                                                 *      **                                                *        *             *                                     *                                  *   *                       *                      *                    *                       ** **                                                                                                                                                       *           *   ************ **********************   * **************** **    *   ***                 *       *                                                       **        *                    *                                                             *    * **     *     * ***      ****   *  ***           **                ** ***         **   *  ******** * **** *  ****** *** * ************** * ** * ******* *  *  *  **  ** **  * * **    ** *  
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[6030] PF08222            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Gpi1:N-acetylglucosaminyl tra  ---1---------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------1----------------------------1---------------------1--1------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1-------1--------------------------------------------------------------------------------------111-----1-----------------------------1--------------------------1-----------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------1-----1---------------------------------------------1------------1------------------------------------------------------------1-----------1----1-----------1------------------------------------------------------1--------1-11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----- 211111--322-111111121111211111111111111211113111111-1122211111112111-21-11111111132111111-811111211111112221-131121131111111311116-2-212-11121121-11211--3111111213111-111-1122--1-1111-111-41111--111-
 nsferase component (Gpi1)         *                                                                                                                       *                            *                     *  *                                    *                                                                          *       *                                                                                      ***     *                             *                          *                                               * *                                                                                                       **                                      *     *                                             *            *                                                            *           *    *           *                                                      *        * **                                                                                                                *      ******  *** *************************************** **************** ** ***************** ****************** ********************* * *** ******** *****  ************* *** ****  * **** *** *****  *** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6032] PF10134            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RPA:Replication initiator pro  ---------1--------------------1------------------------1---1-------- --1------------------------------------1----------------------------------------------------------------1--------------------------------------1-----------------------1--------------52211------11111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--------1-------2-----------------------1-1--3--------1-11311322--1--1---1-111---2-1111212-------------141--114121121-33333333-541--12-------------------------------211-----3---1-1-----331-----1-11----3---11--13222--121-1---------------2-1-11-----1---11-2---------------------------------------------------------------1----------------1---------1---------------------------------------------------------------------------------3------1-------------------------1-------1--11----------1---------------------------1---------------------11-----------------1-----1-------------------------- --1--------1---------1--------3-------1-----1--1---1-1------1---1------------1-----1----1-------1-----1-1-------2---11211-11-1----------111-11-1111111211--11--22--1--1-2-713---1--------11---1-1------
 tein A                                  *                    *                        *   *           *                                    *                                                                *                                      *                       *              *****      *****                                                                                                                                 ***        *       *                       * *  *        * ********  *  *   * ***   * *******             ***  ********* ******** ***  **                               ***     *   * *     ***     * **    *   **  *****  *** *               * * **     *   ** *                                                               *                *         *                                                                                 *      *                         *       *  **          *                           *                     **                 *     *                             *        *         *        *       *     *  *   * *      *   *            *     *    *       *     * *       *   ***** ** *          *** ** **********  **  **  *  * * ***   *        **   * *      
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[6033] PF12549            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1   1                                                                 
 TOH_N:Tyrosine hydroxylase N   ---------------------1----------------------------1----------------- 11-------------1-----------------------1-1-1------1-----------1-1-1--1--------------------------------------------------------------------1--------------1-----------1----------------------------------------------------------------1------------------------------11--------------------------1-1-------------------------------------------------------------------1----1---------2---------------1-------------------------1---------1-------1------1-111----------------------------------------------------------------1-1111-1---221--------------------------1-----2-----------1-----1-------------------21-2---------------------------------------1-----------------------------------1-------------1---------------------111---------------------1---------111111111111-----------1----1---------------------------1--1--11------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------2--1--1-1-------1-1---1--2-------111-111-1--211--11232---1---------1--------------131--1---1-13----12--1413112-11222252336-91064--214232-1-1-1---623228--2----2-----1--211-1--1--1--1------1--1
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[6036] PF07359            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 LEAP-2:Liver-expressed antimi  -------------------------------2------------------------------------ -------------------------2-------121-------1-------------------------1--------------------1----------------------------------------1-----------------------------1---------------1---1-11--------------------------------------------------------------1---------1-----------------------------------------------------------1-------------------1-----------------1------------------1--1--------1----------------------1--------1-----1--11----1----1---------11111111---------------------------------1----------2---1----1--------1---11-1--------------1------------11----------------------1----------------11-------------------------------------1--------------------------------------1---------------------------------------1---1---------1--------------1--------------------------------------------------------------1-------------------------------------11-1----1---------------------------------------------------------------- -----1--1--2---3-3-----1-----1-1--1--------------1-2-1-------1-------------1-------------131-32111---12-----223453521112121313-214-2-2231422122441141432322311226-254116-32-------1-1----222213----2111
 crobial peptide 2 precursor (                                 *                                                              *       ***       *                         *                    *                                        *                             *               *   * **                                                              *         *                                                           *                   *                 *                  *  *        *                      *        *     *  **    *    *         ********                                 *          *   *    *        *   ** *              *            **                      *                **                                     *                                      *                                       *   *         *              *                                                              *                                     ** *    *                                                                      *  *  *   * *     *     * *  *              * * *       *             *             *** *****   **     ****************** *** * **************************** ****** **       * *    ******    ****
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6037] PF08918            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11                                                                         
 PhoQ_Sensor:PhoQ Sensor        -----------------------------------1----------------1------1-------- ----------------------------1----------------------------------------------------------------1----------1-----------------------------------------------------------------------------------1----------2----------11-------------1-------------------------------------11--------1--111-1-------1--11--1-11--------------11---111--1-------------1-----------------------2-------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1---------------------1---------------------------------------------------------------1----------------1----------------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111------------------111---------------1--------11111111111111--------1----------------------------------1-22--11-----1-----------------------------------------1-- ----4------1-1----1---------------1--1-1-1----11-------------1-------1-------4---1-----1---1-------1-1-11-----1----------1--101519-8-719-12--2-1---11------------1---1-2-3-131--------------1---------2
                                                                   *                *      *                                     *                                                                *          *                                                                                   *          *          **             *                                     **        *  *** *       *  **  * **              **   ***  *             *                       *                         **                                                                                          *                                                                        *                     *                                                               *                *                ***************** **************************************************** ************                  ***               *        **************        *                                  * **  **     *                                         *       *      * *    *               *  * * *    **             *       *       *   *     *   *       * * **     *          *  ****** * *** **  * *   **            *   * * * ***              *         *
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[6038] PF11208            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF2992:Protein of unknown fu  ------------------------------------1----------------1-------------- -----------1-----------------------------------------11----------------------1--11--------------------1--------------------1-----------------1-1----1--1-----1-----------1----------------------12222222121-122------1111-------------1-1--1-1-1--------1-1---1-11--2-1-1--1----------111----111------------------------1------------1111-1111211-111-----1----11---------1--------1----------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1----1----1---1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---12----4471----1----------------------------------------------------------------------------------------------------2-11111-----1-----------------------------------------------1---------------------------------------------11------------21------------------------------------ 1---111-22------11-1-----------221-2-1-1111111211----------22121-1------1--------21212------12-1-112-21121-2-121----11-1-11112-111-1-112-11-21-11-111-1--311212--111-41---1-511--1-2----12121--1---111-
 nction (DUF2992)                                                   *                *                          *                                         **                      *  **                    *                    *                 * *    *  *     *           *                      *********** ***      ****             * *  * * *        * *   * **  * * *  *          ***    ***                        *            **** ******* ***     *    **         *        *                                                                                              *                                     *    *    *   *                                                                                                                       *   **    ****    *                                                                                                    * *****     *                                               *                                             **            **                                     *   *** **      ** *           *** * * **********          ***** *      *        *****      ** * *** ***** * ***    ** * ***** *** * *** ** ** ** *** *  ******  *** **   * ***  * *    *****  *   *** 
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 DUF736:Protein of unknown fun  -----------------------------------------1-------------------------- --1----1---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------1---------------------------5-1-1112222------111-1112-------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------8112-----214-833713--1----------3-23----21946-3338322211611212-625----11----------87--2---------------------------------375-----2-----------11------1-1-----4---11-112121--1-11------------------------1------------1-------------------------1---------------------------------------------------1---------2--------------1-------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1--11--------------------------1-----------1-1-----------------1111-------------------------------------------------- -----1---1------------------------1-----------1--------------------------1--------------------------1-------2----------1---------------------------------------------------------2-11----2------1------
 ction (DUF736)                                                          *                             *    *                                 *                                                                           *                           * * *******      *** ****                                     *                                                                                                                                              *                        ****     *** ******  *          * **    ***** **************** ***    **          **  *                                 ***     *           **      * *     *   ** ******  * **                        *            *                         *                                                   *         *              *                                                                                     *                     *  **                          *           * *                 ****                                                        *   *                        *           *                          *                          *       *          *                                                         * **    *      *      
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 pper chaperone (COX17)                                                                   *           *                                                                                           *                                                                            *   *** *  *                                                                                                                                             *                                                                                           *                                                                                 *                   **       **                                              *                                                                                                                            *        *                *  *                                         *  *                            *                                                                                                                 **  **  ***  **  * ******  ** ********************** **** ** ******* ****** **** ** ***** ** ********* *** ********* *** ********* * *** ************* *** ** **  * ******* ***********  ******* ****  
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[6043] PF01341            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Glyco_hydro_6:Glycosyl hydrol  -------------------------------------------------------------------- ----4-----1-1-11111-11--1111111-1111----22-21-1-2----1------113-3-14342----------------------------3----1----------------------------------1---2-------1------------------------------------1------------------------------1---------------------------111--1---------------------------------------------------------------------------------1-1------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1----------------------1-111----1---1------1-11---------------11----1--------1-1111-11-1----------1-------1-----232-1-1-----------------------------1----1--------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1----------------------1---------------------2-221211111------------------------------------------------------------ -1---1---1-------4321221212-------------------1311111164354333--------------1------------1-1-51------11------2-----------------------1-------------------------4271---1-1---1-------1---11-4-3----58882
 ases family 6                                                                                           *     * * ***** **  ******* ****    ** ** * *    *      *** * *****                            *    *                                  *   *       *                                    *                              *                           ***  *                                                                                 * *            *                                                                                                                                                                                   *      *                      * ***    *   *      * **               **    *        * **** ** *          *       *     *** * *                             *    *                                                                                *                            *                      *                     * *********                                                              *   *   *       **********                   ****************              *            * * **      **      *                       *                         ****   * *   *       *   ** * *    *****
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6044] PF06693            263                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1190:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- ----------1------------------------------1----------1-1---------------------------------------11--------1--------------------------------------------11------1-----11-----------------------------------1------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1-------------1-------------------------------------------------112---------12--------------------11111111-----111-1-1111--------11111-----------------1----------------------------------------------------------1-----------------------------------11-----------------------------1-----------------------------------1-------1-1--1------------1---------------------12111112222222222-2222222222222222222111113312122222222222222122222211-111111111111--1----------1-1--------11-1----------------1----1111------111-------------1-----11-111111111111---------------------------------------------------------------- -----1--------1---1--------22-111-1------1---1-1---------2------------------------------1-21--1----------1--3---1-----1----------1-1---2-----------------------------12---1--3------------13------1----
 nction (DUF1190)                                                                                              *                              *          * *                                       **        *                                            **      *     **                                   *                              *                                                                               *             *                                                 ***         **                    ********     *** * ****        *****                 *                                                          *                                   **                             *                                   *       * *  *            *                     ***************** **************************************************** ************  *          * *        ** *                *    ****      ***             *     ** ************                                                                      *        *   *        ** *** *      *   * *         *                              * **  *          *  *   *     *          * *   *                             **   *  *            **      *    
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[6045] PF09863            263                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 DUF2090:Uncharacterized prote  -------------------------------------------------------------------- ---------------------1----------2-----2-----12------111------1--------------------1-------------------------------------------------------1-----1-1-------------------31-------------------------------1------------------------------1-------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------111-------------------11-111----1------1--11--111111211111---1---1--11-----------111-----------------------------------------1---111111111111111111111111-------121-1--11---111----1-----------------------------------------------------------------------------1----1----------------------------------1--11-1-----------------1------------1111111-1--------1--1---1---------111111111111----11-1-------1-1----1------111----------11------1-1------1-1-------------1-----11----------1-----------------------------------------------------------1---1-- --------11---------------------------------11---1-------------------------------------12--1---1------1--1----1-111-2-121-21334-439-2-533-2-212111-221-1--422211---1--2------11---1-8-----1--1--1---1---
 in conserved in bacteria (DUF                                                                                            *          *     *     **      ***      *                    *                                                       *     * *                   **                               *                              *                   *                                                                                                          *                 ***                   ** ***    *      *  **  ************   *   *  **           ***                                         *   ************************       *** *  **   ***    *                                                                             *    *                                  *  ** *                 *            ******* *        *  *   *         ************    ** *       * *    *      ***          **      * *      * *             *     **          *                                                           *   *           **                                 **   *                                     **  *   *      *  *    * *** * *** ***** *** * *** * ****** *** *  ******   *  *      **   * *     *  *  *   *   
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 RunxI:Runx inhibition domain   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1-1-------------------------------------------------------------------111111-1-----1-------111----21---1-1111111--1----1-1------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1----------------------1--------11111------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----1-----------2----------1--1--------------3-111--1------1---1-1----11-----------------1----1-1---4-------125555943233251751036-8-74023126233313312322335323---11-1---1--11---------1--311------1---
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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  transfer system pilin assemb          ******         *                                        *                                         *                                  ***          *                                     *                                             *                                                   *                               *  **  * *  ****         ******* ************************** *********                           *     ** *                           *                      *                               *                                **  ** * *          ***         **  * *****  ****   *    *      * *                 *        * *                  *    *      *          *               *  *    *     ****   *  *            *            **     * *      ***     *       **     *           **           *         *            ***                       *   *            *                   *  *   *    **                                *                                                  *      *      *      *                                           *           *         *    *       *      *  *     **   *   * *  *     *      *        *  *  * **               ****    *     
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 DUF761:Cotton fibre expressed  ---------------1---------------------------------------------------1 1------------------------------------------------11------------1------1-----------------1------------------------------------------------------------11----------------1--1-----------------------------------------11-----------------1---1-1-------------------------------------1---------------------------------------------------------------1------------1---------1-----------1---------------------------------------1---------------------------------11111111---------------------------------------------------------1-----------------------1----------------------------------1-----------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1----------------------- -----4--1-----1121-1--------1------------21-11-------1-----------1----1----1--11------------2--1-1---1-1-3---111-2---111111-21------1--1--1-1---1-1111-111----2-2---32-215--2-1111-------3574163-11-1--
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 , N-terminal ig-like domain                    * *        *                           * ***                                                                                                      *      * * *                              *****   *                                              ** ******************* ***************** *                    **   *  ********* **   *** * *****   ******* * *    ****    *         *   *       * ***   **** *   **        *  *****  *                                              *                                                  ***                                                    *                                         *                                                           *  **                                         **  ** ********** **********************     **** ************   ****  ************               *      *                            *                     ***      ****                                  *                          **                 ** *                     ***                         *                                           *      * * **              *      *  *   *           *       **     *                   *        
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 MRP-L46:39S mitochondrial rib  -----------------------------------------------1-------------------- --------------------------------------1--------11-----------1----------------------------1---------1-------------------------------------------1--------------------1---------1-----------------------1---1--11---11--11------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1----11-----------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------1----------1-----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------11-------------------------------------------------------------------------------------1--------1--------1----------1---------------------------- 21--25--422-11111211111211-1111111111111111111211211121111212211111111111111111111112221111111111111111113-1113212121111121-121112-1-1111111111111111-111111222111121112112-1111--11-111-1111111121611-
 osomal protein L46                                                            *                                                           *        **           *                            *         *                                           *                    *         *                       *   *  **   **  **                                    *                                                                       *                                               *                                                                                                       *    **                                                     *                                                                                     *          *           *                                                                                                      *                     **                                                                                     *        *        *          *                             **  **  *** ************** ******************************************************************************* **************** ****** * **************** ********************* ****  ** *** ************* 
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[6057] PF04927            262                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11  1        
 SMP:Seed maturation protein    -------------------------------------------------------------------- --1-2--1---1-11------1-------------------------1-----11-------1----1-------------------------------------------------------------------1-------------------1------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1---1-----------------1-1-----1--1-----1---1------1--1212-----------1--1-11----------1---------------------2-1-------11-11-1---111------12-1--------1------2-1---1--------1--------1-------------------------------------------------------------1--------1-----------1----------------------1--------------------------------------1------------------------------------------------------1---1------------------------------------1-------------------1--------1----------------------------------------------------------------------------- ----11--21----122343553-2-2--112-----11----1112-2-2234--1-1343---------------------------36-2-------11-1-1--5-2-1--3-----2---1---1---1111---------1--1-----11-1-------2-1----1--43-111-138304349-1----1
                                                                                                       * *  *   * **      *                         *     **       *    *                                                                   *                   *                        *                                                                                                                                                                                                           *   *   *                 * *     *  *     *   *      *  ****           *  * **          *                     * *       ** ** *   ***      ** *        *      * *   *        *        *                                                             *        *           *                      *                                      *                                                      *   *                                    *                   *        *                                                                                  **  **    ********* * *  ***     **    **** * ****  * ****                           ** *       ** * *  * * *  *     *   *   *   ****         *  *     ** *       * *    *  ** *** ********* *    *
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[6058] PF09352            262                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DUF1994:Domain of unknown fun  -------------------------------------------------------------------- ----122322222221111-12--1111111-1212235311122--116612331-3--111122346812111211-------1---------------------------------------------------------------------------1---1---------------------------11111--112-1-1---------------11---------------------------------------11---------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------11----------------1--------------------------------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------2--------------------------------------11----------------------3-1---1--------1----------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1-1------------1---------1----1-------1--1-1------------------------1-1------------------1-------------------------------------------------------- ----1----------211111111-1121----11212112111111111121222211111--11----1------------1-----1-11312--------1----------1---1---------------4----1-----------------11--1--1--------1-1-1---------211--------
 ction (DUF1994)                                                                                         *************** **  ******* *************  ********* *  ******************       *                                                                           *   *                           *****  *** * *               **                                       **                                                                     *                         *         **                *                                *     *                                                                                                 *     *                                      *                                      **                      * *   *        *                                                                            *                                           * *            *         *    *       *  * *                        * *                  *                                                             *          ********* ****    *****************************  **    *            *     * *****        *          *   *               *    *                 **  *  *        * * *         ***        
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 PLA1:Phospholipase A1          -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------11---1-----11-1--1-----------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1---1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------1------2---------31111--11--1111111121---11-1-11111-11---111-111---1----------1-----21-2----111111111--2122-22-211--------12-111111111111211111-21111------1------11111111111111121-111111111111111111111121--11111111111111111111111111-111111111111--1111111-----1311--------------111111-1111-1--------------------------11121-----22-11121111111-----------------------------------------------1--------------1-- ---1----------------------1-----------------------1--1----------------1----------11--------------------------1--1--------------------------------------------------1-----1---------------1--1-----1-21-
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 DUF2870:Protein of unknown fu  11------------------------------------------------------------1----- -------1---1111-1-------11-----1----1----------------------------------------------------------------1--1-------------------11---1---11---------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1--------1---1-------1-----------------------1-------------1------------------------1111111-----------------------------111--------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1----1---------------------------------------------1---------------------------------1---------------------------1111-----------------11-111-1--------------------------------------11111-1-11-------------------------------------------------------------------------- 21---21-6222331--1---------1---------------1--22221--2------21-1-1--1---------------11---------------1--18-14-621322-1111212221517-1-1241212311111111-12-3-1231111131-12322--11-1217-11-1511-113-142111
 nction (DUF2870)               **                                                            *             *   **** *       **     *    *                                                                *  *                   **   *   **                                                                     *                                          *                                                                             *        *   *       *                       *             *                        *******                             ***                                            *                                                             *                                                                                                *    *                                             *                                 *                           ****                 ** *** *                                      ***** * **                                                                           **   ** *******  *         *               *  *****  *      ** * *  *               **               *  ** ** ****** ************* * **************** ** * ********** *****  ** **** ** **** *** ******
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 BCLP:Beta-casein like protein  11-----------------------------2-----1-------------1----1---1------- --------------------------------------------1------1--------11------1-----------------------------------------------1-------11------------------11--1--------------1----------1------1--------------------------------------1---1----1-------------------------1--1----------------1-------1----------------------------------------------------------11-1---1---------------------------------1---1-----------------------------------1----------------------1---------111---1---1---------------------------------------11-------11---------------------------------1------------------1-------------1--------------------------------------------------------1-----2---------------------------------------------------1--------------1-1--------------------------------------------------------1-----------------------------------1------------------1---------1--------------2-------------------------------------------------------------- --------1-----111---1-121-11--1----------------1--12-1-----1------------1-----2----1-----12-1-2----1-1--2---1323753343333334732639-2-42412222333122323212921214--2-1------2--21-1-----------5--3---1---
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 of unknown function (DUF3566)                   *               *         * * *  **   *                 *************** **********************************************************                      **  *      ****             *                  *    *                    *     *                   *   *  **         **     ******  *                  *   *  *         *                 **                                 * ** *         *       **  **  *            **       *          *  * *                              *****            ** *  *           *                                               **************************   **          *                       *    *    *     * * *         *                         * **         * *     ****  * **                 *                                    *                                               *            *                        * *       *                     * *     *               * *                  *           * *     *                  *         *         ***                                                  *        *             *           *        *  *            *           *                      *   * * *    * *     ****        * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6066] PF04654            261                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1 1          
 DUF599:Protein of unknown fun  ------------------------1------------------------1------------------ 1-1------------------1---1----------11----------------------------------------------1----------1----1----------------------1----------------------1-------11----------1111------------------1---1------2--1-----------------------------------------------------11---------11-----------------1----------------------------------------------------------------------------------------1112------11-1--------------------11211211-1-1111121222222--1-1--21111111-------------11---------------11--------------1-----111--11------------------------------11111--2---11-----------------1-1--1--------------1--------------------------------------------11-11----11111111111111111----11---------------------------------------------------------1------------------------------------1-----------1-1-------------------------1-12111211111111-------------1---------1-----------------------11------------------------------1--------------------- -1--11--2---1141--11--1----------1---111111-------11---------------1-------1------------11------------1--8--131-----3---------1--1-2--------1-1--2----------1-----11---------1--1----1-123080-841-2--11
 ction, DUF599                                          *                        *                   * *                  *   *          **                                              *          *    *                      *                      *       **          ****                  *   *      *  *                                                     **         **                 *                                                                                        ****      ** *                    ******** * *************  * *  ********             **               **              *     ***  **                              *****  *   **                 * *  *              *                                            ** **    *****************    **                                                         *                                    *           * *                         * **************             *         *                       **                              *                       *  **  *   ****  **  *          *   ******       **               *       *            **            *  *  ***     *         *  * *        * *  *          *     **         *  *    * ****** *** *  **
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6067] PF04351            261                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PilP:Pilus assembly protein,   ----------------------------1--------------------------------------- -1--------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1------------------11--------------------------------------1-----11--244--1-3331--111---4----1------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------1-1------------------------------------1------------------------------------------1------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------111111-1111111111111111111111-111111111-1111111111--------1111111111111111--------------------------111111111-1111111111112212111111--111-1--------------------------------------------------------------------------------------------1-----11111111-111111111111--111111111111111111111111121111111111111-1111111111111111111111111111------------------------------------------------------------ 1---11-------------1---1-1--------------------1----------11---1--1------------------1---------1-------------1--------------------------------------------1---------311-1---111--------------1-----1----
 PilP                                                       *                                         *                                                                                *                                             *                  **                                      *     **  ***  * ****  ***   *    *                                                                                                      **        * *                                    *                                          *                              *                                                                               ****** ********************** ********* **********        ****************                          ********* **********************  *** *                                                                                            *     ******** ************  *************************************** ****************************                                                             *   **             *   * *                    *          **   *  *                  *         *             *                                            *         *** *   ***              *     *    
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 ERG2_Sigma1R:ERG2 and Sigma1   -------------------------------------------------------------------- ---------------------1--1------11---1----------------------------------------------------1----------1------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------11--------------------------------------1-------------------1-1--------------------------------1---1-------------------1---------------1-----------------------------------1-----------------------111-----------------------1----11-----1-----------------1--------11------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------2-----------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------121-------------1111---------------------------------------------------------------1--------------------- 1---112-212---11--111111111111111211-------1111111111112121111211111131111111111111222111111-1211111112131-3-2822221-1111211362416-3-415-1113-112-112-11111-113-11131------1111----------1222-11---1--1
 receptor like protein                                                                                                    *  *      **   *                                                    *          *                                          *                                                                                                           * *                    **                                      *                   * *                                *   *                   *               *                                   *                       ***                       *    **     *                 *        **                                                                                                *           *                 *                                                                                                           *                                       ***             ****                                                               *                      *   *** ***   **  ******************       ************************************************* ************* * ******* ************* * *** **** *** *** ***** *** *****      ****          **** **   *  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6072] PF09523            261                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 DUF2390:Protein of unknown fu  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------1-----1------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--11-----------------------------------------------------------------2221----------------------------1--11--4-11----111--111--1-----1-1----1----------------11-------------------------------12-------------------------1--------------1-1--1----1-----------------------------------1-------0-6-----------------1-----------------11-111--11-2111111111111111111---1111--------------11--------1---------1---------------------------------------1-----------------111111-----111--------------------------11-11-1111111111111----------11111111111111------1-----------11------------------------------------------------------ -----1--22---12--1-----1-------1---1-------111--11---1------1-1----11--1-----------------------------11-----1---3---31122122111114-3-226--1-2122-12111213111321--2-1-11------5--2-13-----121--1----31--
 nction (DUF2390)                                                                                                                          *     *                        *                                                                                                 **                                                                                                                                   *    *  **                                                                 ****                            *  **  * **    ***  ***  *     * *    *                **                               **                         *              * *  *    *                                   *       * *                 *                 ** ***  ** *******************   ****              **        *         *                                       *                 ******     ***                          ** ** *************          **************      *           **                                                            *  **   **  *     *       *   *       ***  **   *      * *    **  *                             **     *   *   ************** * ***  * **** **************  * * **      *  * **     ***  *    **  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6073] PF05020            261                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 zf-NPL4:NPL4 family, putative  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------1--------------------1-------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-----------------------------------1-------------------1------------------------------------------1-------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------111111-1111------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------11-------------------------1---------1----------- 1121121-1--11111111111211111112111112222311111211111112111121211111111111-1111211111411111211112111112112211--3122123-11-311241-12-1111423112111--212-1111221212411-11-31151521--1-------2--111--11----
  zinc binding region                                                                                                                                                                  *                                          *                    *                                                             *                                                                                                                                  **                 *                                                                                                                         *                                                      *                                   *                   *                                          *                                                             *                                               ****** ****                              **                                                                               **                         *         *            ******* *  ************************************************************** **********************************  ******* ** ****** ** *************  *** ************* ** ********  *       *  ***  **    
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 DUF1696:Protein of unknown fu  -----1---------------11-1-------1-------1--1---1---------111-------1 ------1---11------------------------1-22-------11-1---11----11--111-11-----------2--------1---------222-11--------------------------------111111----------11------------------------------------2222222151222222-11113222111412211111-21----------11------1-11---------11----------1-111111--1---1-11-1--1--------------1111111111-----11111112111-1111---1-1------11--------------1-------------------------------------111111111-------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------1------------------------------1-----2------------1------1-------------------------------1----11-11111--1111-1211-11------------------------------------------------------------------1-------1----------------1--------------111----------------1-------------1--------1-------------------1--1-----11------1-11---------1--------------------------------------------------------- -1--1------------1--------------------------------------------------1--------------------------------1-1-----1-----------1----------------------------------1-3---3---------------------1--------14465-
 nction (DUF1696)                    *               ** *       *       *  *   *         ***       *       *   **                        * **       ** *   **    **  *** **           *        *         *** **                                ******          **                                    **************** ******************** **          **      * **         **          * ******  *   * ** *  *              **********     *********** ****   * *      **              *                                     *********                                                                               **                                            *                              *     *            *      *                               *    ** *****  **** **** **                                                                  *       *                *              ***                *             *        *                   *  *     **      * **         *                                                           *  *            *                                                  *                                * *     *           *                                  * *   *                     *        ***** 
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[6077] PF03125            260                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       56                          
 Sre:C. elegans Sre G protein-  -------1---------------1--------1----------1-------1----1----------- --1------------------------------------------------------------1---------------1-----1-11-----1-------------------------------------------------------------------1---------------------1---1----------1---21-----112--------1--------1---------1---------------------------1-------------------11122111211--------------------------1-111-2---2----------------1------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------111-------------------------1----------1-------------------------------------------------11----------------1----------------1---------------1--11111-------------------------------2-----------------1----------------1---1-1-----------------------1--1------------------------------------------------1---------------------------------1---------------------------1-----11---------------------------11----11--------1---1-----------------------1------------- -----1--31-------------1-1--------------1------------1--------------1------31-23-11-----------1------1-------1-1-----------12--1------11--11--------11----------22-2-4----2742--1---------1---1--------
 coupled chemoreceptor                 *               *        *          *       *    *              *                                                            *               *     * **     *                                                                   *                     *   *          *   **     ***        *        *         *                           *                   ***********                          * *** *   *                *                                                                                    *                          ***                         *          *                                                 **                *                *               *  *****                               *                 *                *   * *                       *  *                                                *                                 *                           *     **                           **    **        *   *                       *                   *  **             * *              *            *              *      ** ** **           *      *       * *           **  *      **  **        **          ** * *    ****  *         *   *        
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[6078] PF03714            260                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PUD:Bacterial pullanase-assoc  -------------1------------------------------------------------------ -1-------------------1------------------------------------------2--222-----------------------------------------------------------1-----------------1----------------------------------3-1--------11111111-111111-2----111-----23---1-------------------------1------------------------33333331-1333333333332222222222222344---44411-----------2-1----1-2-1------1--------1------1----------------------------------------11-11-1----------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--------11-1-------------------------------11-1-22-1--1--11----------1--------------------------------------1---1----------111--11------------------------------------------------------1----------------------------1--------1----1----11----11----1-2-2-11122----------------------------------1-------------------------1111111111---- ----11-------------------------11--1-1----1--------------------------------1---1---------------1-----2----------2------------------------------2-----1------------1--1--------121-26111--1--1-1--------
 iated domain                                *                                                        *                   *                                          *  ***                                                           *                 *                                  * *        ******** ****** *    ***     **   *                         *                        ******** ****************************   *****           * *    * * *      *        *      *                                        ** ** *                                                    *                                                                                         *                          *        ** *                               ** * ** *  *  **          *                                      *   *          ***  **                                                      *                            *        *    *    **    **    * * * *****                                  *                         **********         **                         **  * *    *                                *   *               *     *          *                              *     *            *  *        *** *****  *  * *        
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