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Ranking of HM:SCP:REP : from 1001 to 1100

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[1001] c.8.3.1           1325                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 Carbamoyl phosphate synthetas  ---1-11111111111-1111111111111111111121111111111111111-1-----111--11 1111111111111111111-11111111111111111111121111111111111111111111111111111111111-1111111111111111-111111111111---------------11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112211111111111111122222211122212221111112111111111111111111111121411432223322111222211112221111111111111111111111111111111111111111112-11---111-1-1222211111-2--1112122111111111111-11111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---1-11----1--111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--------------------------------------1--111111111 11--112-311-1121222222222222222222222322222222222222222222222222222212222221212222222122222222242222221343-2214332231232212243221672-32212222122-1221222122312212-1221121161141211181111121222122223222
 e, small subunit N-terminal d     * *********** ************************************* *     ***  ** ******************* *********************************************************** **************** ************               ******************************************************************************************************************************************************************************************************** **   *** * ********** *  ******************* ************************************** *****************************************************************               **************************************************************************************************************************************************************************** *************************** ***********************************************************************************   * **    *  ******************************************************************************                                      *  ********* **  *** *** ********************************************************************************************** ************************* *********** **************** *************************************
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 Folylpolyglutamate synthetase  ------------------------2--11111-----------------------------111---- 1111111111111111111-11111-1111111111111112211111111111111111111111111111111111111111111111111111---1-11111-11--------------111111111111111--1111111112211111111111111211111111111111112212211121111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111211221212222112113211111112111222222222222222222222222222222222222111211111111111111111111111111111111-11111111-11212111111111111111111111111111111111111-211111111111211111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111-1111111111111121111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111111111111111111111111111222222222111111111111111111111111111111111111111--------111--1-1---1--------1-------12111111111211 11--111-211-2223322244334333353334333323332221432233433343332222222222222223313222222222213232222222222223-121211111211--11-1-11-332-111---11113--11-----11-11223112111121-23111-219312223235255212222-
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[1005] d.113.1.3         1321                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                                    
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 Thiamin phosphate synthase     -----------------1-----11--111-111----1111111211--111-111---1111---- 2221111212211111111-1111111111111111111111111-11111-111112--222211111111111111-12-22232222221222----22--22323-------111-----22222222222111111111211111111111111111111111211111111111111111111-22222222222222222211222222222211211111112121111111111111-222221-1-11-1---1111111-112-111111-------22222222222--------------11---111-121221111111111122222221211212221111211-122322112-121222222222322532222222222222222222-33333333222-32223332222233222212222242222222222234322221111111122-------------------22222222222222222222222211333212221111111112211111112111122222221111111222222-211122211122212222222322222223222222222212-2111111-22321221121221111211111111111111111111--2222------11111111111111111-111111111111111111122211111111111111111111111111111-1111111111111---1111111111221211-1111-111111-1222222222222222222222222222221--------222211111122211222222222222222221111111------------------------------------------1---1-2- 1-------1----12-11111111111111121111111111112111111111--111111111111-111111111111111111111211111111-111111--11------------------------------------------------1----1----------12122322232113211222-----
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[1009] c.23.8.1          1315                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 N5-CAIR mutase (phosphoribosy  --11--1111111111-111111221122221333222222232222222223211111-11111-22 2222211222211111111-1111111111111111111111121121111111111111112111111111111111112221111111111111---1111111111---------------1111111111111122111112222222222222222222222222222222222222111113211111111111111111111111111111221111111111121111111111111111221211111112-1-2211112121111111111111111111111111111111111111111111111111122122222222212122221111112211112222222112323322111112111111111111111111111111111111111-11211112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222223222222212222232322222222212211111111-1-------12111112221111111211111111111121111111-11111------11111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111--------1---------------------------1-111212221121 ----111-----111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111--13-2111111111-1114211-273-2221--11-171111111112-1112125121-2111-1111122151112211121223222221
 laminoimidazole carboxylase,     **  ********** ****************************************** ***** ** ******************* ****************************************************************************   **********               **************************************************************************************************************************************** * ************************************************************************************************************************************************* *****************************************************************               **************************************************************************************************************************** *       ************************************** *****      ***************** *****************************************************************  ************************************************************************************************************        *                           * ************     ***     *********************************************************************************************  ** ********** ******* *** ****  ** ************ ********** **** ****************************
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[1010] b.29.1.6          1314                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   3                                                                                                     118             1    12  1 1       1      1          1 21        4    1            1  1 1 4
 Clostridium neurotoxins, the   ---1----2222-2---------------2-------------2-2---1--1----42-----11-- --6-31------2----11-1-----11111-21-1-1-111--2231252---------12--714358----------3-------2292-1-----23-33337-2-------------------1-46---555641135-11-1--23----------2--12-3-----------------221-------------------1-----------1--------12---------------------------------------------------------------------------------------------1-22224422422----33--12-----4---1-------1--1-----71221--------11---12-11------------2211111-----1-----------------------2---------------8-------------------------------------1----211-11---------------11-111---11-112--3---2--1-111-----------------5----------------31-72-----13------------------------21----1--141131-----261-22221--12--------2----------------2-1-2-----------2--1-1--21-------------------------3----------------------------------1-4----------------------------611111111--------------------11--------1--1111111---------61991111--------11------------------------------11---2-411 3213563-822-11---------111----------------------22--1---1-1----11------111-111---11111-------------------1-8546899967555555609475197-061456584715654630876495581743072221-7-112-2609221632----171-17452
 second last domain                *    **** *               *             * *   *  *    **     **     * **      *    ** *     ***** ** * * ***  *******         **  ******          *       **** *     ** ***** *                   * **   ********* ** *  **          *  ** *                 ***                   *           *        **                                                                                             * ***********    **  **     *   *       *  *     *****        **   ** **            *******     *                       *               *                                     *    *** **               ** ***   ** ***  *   *  * ***                 *                ** **     **                        **    *  ******     *** *****  **        *                * * *           *  * *  **                         *                                  * *                            *********                    **        *  *******         ********        **                              **   * *** ******* *** **         ***                      **  *   * *    **      *** ***   *****                   * ************************* ************************************ * *** **********    *** *****
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Putative anticodon-binding do  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211 1211111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111112211-111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111122211111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111-111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111 1111221-31111111111-111211111-1111111111-111111111111111111111111111-111111111111111111111211111111111122212313333251222222223222332122212222212212222221243221222221223222221222228222-222331222223222
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[1015] d.67.2.1          1308                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 Arginyl-tRNA synthetase (ArgR  11-11111111111111--1---111111111111111111111111111111111111111111-11 111121111111111-111-11111111111111111111112111111111112111112211111222211111111111111111111111111--111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111122222122222222222111122211121111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11112111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111-11111111111111111111111111 11-11-1-3111111-1221111111122221222211111112221111223221121111111111112111122-22111111111-2-111----111-333113-2131115122212232-32512-42312222-232221212212222221321211-11111222111182221111112221121112
 S), N-terminal 'additional' d  ** **************  *   ****************************************** ** *************** *** *****************************************************************************  *************************************************************************************************************************************************************************************** ***************************************************************************************************************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************** ***************************************************************************************************** ***************************************************************************************** ****** ************************** ** ** * ******* ************************************************************* *********** * ***    *** ****** **************** ***** ******** ************************ ********************************
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[1016] c.71.1.2          1307                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RibD C-terminal domain-like    11-1111111111111-1111111111111111111111111122232112221-1-111-1----11 1322622333212123322-24222322222253335343232214332223422-231156413253332----1-----13222223421-111---111111262311111111111111111111111111344-111121222322222222222222122223122222222222211111---1111111122311112111111211111111111------1111111111111111121111--1----1---1-33--1-111-1-1111-------11111111111-----------------------11-21111111111211111111-111--1111221111311111-1-11311-11111111112221111111111111111111-22223432141113214425532222-211111111111111111111111-1211111111111---------------11121112111111111111121111113122221221312121122111122212211111111111111111111112111111111111111111211111143335511111111111-111111111111111112111211111111111111111111111111-1322111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111113112211111111111111111111111111111112211111111221111111111111111111121111111111111121111111222222----------1-------------------------11-111-1111212 ------------22211111222222211111111111-111111111111111111-1111111111-1111111111111111111112111111121111111-12-------------------------------------------------1----------------21117111115233123231--11
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[1017] a.156.1.2         1306                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 Middle domain of MutM-like DN  ---1-------------------------------------------------1-------------- 3331423333321344545-441144444444444444441413743334344443341132423254442-----------3-------2--1------1-1-2-112--------------1-----------11-1111111211111111111111111111111111121111121111111---111111111111111111211111111111111111111122111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-----------------------1----1--113311111111-------3-21111111111111121111111111111111-1-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111----1-1111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111---111111111112221111113333211--------------------------221111111111111111111111111111111-11112------22112222222222222-1222222222222222221222221112222222222222222222222221-111111111111---1-----111111211111111111111111-1111111111111111111111112111111111111121111111111111212222211122221111----------------111111-1111111111111111111-----------2-2 ------1----2--1111111111111111111111-11111111111111111111-1111111----1--1-1------11111---111111-21111--111-16-5322221333333345143813-4371333333521323-322315514----221-------111222411112422112112----2
 A repair proteins                 *                                                 *               ******************* ***************************************************           *       *  *      * * * ***              *           ** *************************************************   ************************************************************************************************************************************                       *    *  ************       * ******************************** * ********************************************************** ****    * ******* ** **********************************************************************************   ***************************                          ********************************* *****      ***************** **************************************************** ************   *     ************************ **********************************************************************                ****** *******************           * *       *    *  ********************** ******************** *******    *  * *      *****   ****** *****  *** ** ********************** **************** *********    ***       *********************    *
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 Glycerol-3-phosphate dehydrog  -----------------------1--------1-1-----------1--------------------- 111-111111121121222-22112222222222221222111111211111111111111111111131111111111111-11111111111111--111111112111111111111111111111111111-----1111-11111111111-----111111111------------11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111112112111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111-111211111111111111-11121111111111111111111111--1111-111111111111111111111111111111111-11111111111111112111112111111211111111111111111111111111111111111111111-111-1111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-121111111111-1111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11211------11111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111113333331111111111111111-111-11----111-111111111111-111111 2311--1-411-22111112222222211111111111111111111111111111211111122111-22221232-22122222222111112132212-1335126123533442112221342223121222-11122222121112111323341313121162413531253172223365571522343322
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Archaeal histone               ----------------1------21112111-36344211112----11--1-2---2221---22-- -------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1211451-082111131212211111111311111111111112111112133211222121211111111111111-1111111122133412271-11231222-2153579182610815103566555-851990658213719715606068144328602123131704132563352887151463756522
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[1022] d.136.1.4         1301                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Polyphosphate kinase C-termin  ---------------1--------4--22-1-22----11---242-4--222--------1-1--1- 22322---------22222-23222222222222322222-22222-3222-232--2--222222222222222222-2222-1--24446-222---25244426-4---------------4442222234222222---2-242522222222222222322223222222222222222-21---22-222222323222223-2----222---2-22-------22--------------22222--222222--1222222---222----------------------------------------------2---22------------22------122-222-22---------------2122222-2222242222222222222-22222222-22222222222-2222222222222222222322222--2222222222222222------------------------------3-222222222122222222222222222222224442--2222232222222222322222222222222222222---21---------2-22221-2-12-22---222222222222222222222-2222222222-22-222222--1222221--2--2122222------22222222222222222-2222222222222222222222222222222222222222222222222222-222222222222---2-----222232222---------------44422442222222222222222223222---------2---2333332222222222222222222----222222--------------------------------------3-------2222 ----221------2-----------------------------------------------------1---------------------------------------2-------------------------------------------------------2-----------2---1222--4--1--------1-
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 Tyrosyl-tRNA synthetase (TyrR  ----------------------------------------------------------------1--- 1221111222211221111-11111111111111112211111-2131122111112111111112212121222111111121211111111211111132112111111111111111111111111111111111221111211121111111111111121111111111111111111111111122222222222122222312331322222232221111112111111111111111111111213222222122222222121112231112122211222222222221222112221211222111222111132222222222211441222212111112222111221112211111111111111111111111111111111111111111-111111111211111111221111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111222212111112222111111122111111112111111121211212111212222222111111211111111111111121111111111112121111111111111111111111111222211111112111111112111111111111-111111111111111111111111-111-11111111111111111111111222111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111222122111111222211111111111111111111111111122222221222111111-11111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111-1 11--11--1-----1----1111111111-111---1112111111111------1111----11111-11111111111111111111-1--1111-1111111--161211111211-111111---141-1111--11111-111--11121111212111-111116--1211110111111111-111121121
 S), C-terminal domain                                                                          *    ******************* *********************** **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************* ************************************************************************************************************************************************************************************* ************************ *** ******************************************************************************************** ***************************************************************** ******************************** ******************************* * **  **  *     *    ********** ***   *************      ****    ***** ******************** *  **** *******  ************ ******   *** ****  ***** ***  ************** ******  **************** *********
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 Haloalkane dehalogenase        -------------------------------------------------------------------- --418--2333---38654-51--01666665090873321635311--22-3112-3--4641-297642----------2------------------221-1-11---------------1-111---11-144421---1--2332221211---11-21123341------------211------1---------1-------1---1-----11-1--1111--2-11111111111111-1111----------1-----1-------------------------------------------1-------------1-------1-1---------1----1-1------------------4125333-----43524-1232224----------2-3-431214136-522-341562111-44312--1-12-4--------1---1-11------------------------------2121--11-15665644233244233233128252131--11131211124232-1----------111111---2-4121----1---1-2221--2-2112122--2-1---------------------1--12-24-122121111116111111121121-----11----------11----------------------------------1-11-----------------2---------1--------------111111-----16-1---------------------1-2321334334152334421---------------2----------55213111111111----11----------------------------------1----------------2-- ----112-32----315433244341422111112-23635321213257645954322112121---11111-2-----2--131---87253361111-11221-20201512-411332213212-45--1--222-21121223-332-32--2211213-63-11--214-3-301144485572443283556
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[1026] a.2.2.1           1298                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2       1           
 Ribosomal protein L29 (L29p)   11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-111 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111--11111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111-111111-1111111111111111111111111111111-1111111111-1111111111111111111111111-1111111111111111111111111-11-111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111112111111111111111111-11111111111111111111111111111-111 2111222-62212211111111111-111111111111-111111111111111111111112-1111-11--11-2---1111--1111121111222211144432322221331111211149141282-231111-11-31-11112-11121121121111-21122122222303331375081752212232
                                ************************************************************** * *** ******************* *************************************************************** *************  ******************************************** ********************************************************************************************************************************************************************************************************** ************************************************************* *************************************************************** ******************************************************************************************** ****************** ****** ******************************* ********** ************************* ************************* ** ************************ ************************************************************************************************************* ******************************************************** ***************************** *** ******* ***************** ************ ************************ **** **  ** *   ****  ********************************************** ****** ** ** ***** ************** ********************************
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[1027] d.20.1.3          1297                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1 2111111 1  11 21 1 261 111 1 11 11  1 1 11 1 1 12    11        1     1                   
 RWD domain                     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ 31-3675-934121655454555455555555544544445445554466445455645453654334143343433234434444355-3354444333153333-62464400319198039446752851318709227148909081293948208668308595594728233383455255465443424641
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                     ** **** ********************************************************************************* **************** ********************************************************************************************
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[1028] b.132.1.1         1296                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Supernatant protein factor (S                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1                                                                                                     22211111 1111 21 1 301 112  1 11111 11 11  1 1 1 111 113 1    1 1                        
 PF), C-terminal domain         ---------------------------------------------------------2---------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---1225-262-4263333333333123323333333333333333333332333333332333233413243333444433333333324232222222222443-65201345351712128298799252735892872061721812889909090049804626969394----1-----24573451178771
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[1029] a.160.1.4         1296                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11  211                                                                                                 1 1 11111       11 1 381 112              1  2 1           1   11   1  1      1        111 
 RNA editing terminal uridyl t  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3311141-303733733443333433433333344444444444443333333333333333111111-1221112223211111166623434454333323756146448111068977697518974244721988997999999973991919995679657317670854219645546690994867591435
 ransferase 2, RET2, domain 2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ******* ************************************************************ **********************************************************************************************************************************
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[1030] b.6.1.2           1295                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      2                            
 Periplasmic domain of cytochr  22----4233333324-12-2--252221133-----------------------------1----11 1342111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111211111111------------2-2--------------112211231--------------11----------22222---16132211111112122222212534211111111211212-22---23222222222222222223222222235633221111114321111111111111111111-------------------------------------------------------------------------------------1------------2----11---------------2-21222111111254343223243333332323331356436344421422254335555211113123434223111111113221243-1111111111111111111111111111111112-1332543333435444444877776645647671155632233212251323221121-------2255331-----11-1-111-1-1-1211-333322---111----------------31-122211132121222112222212222311221211-42-111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111----111111111111111111111111121122211---------------1111111---2133332322222223111-11111111-1--3-----221113322222222111111--111111----------------------------------------------23-1 21------2-----1--1---------111-11111-------111-1------121-1---1-111---1-----1-----------1----1---11-1--111-----111111-----1-11-1-19--11-----1--11--------1-1-------2--12--9-12-122-------1--2--1--1----
 ome c oxidase subunit II       **    ********** ** *  *********                             *    ** ******************* ***************************************************            * *              *********              **          *****   ***************************************** **   **************************************************************                                                                                     *            *    **               * ***************************************************************************************** ********************************** **********************************************************       *******     ** * *** * * **** ******   ***                ** ************************************ ** ************************ **********************************************    *********************************               *******   ******************* ******** *  *     *********************  ******                                              ** * **      *     *  *         *** *****       *** *      *** *   * ***   *     *           *    *   ** *  ***     ******     * ** * **  **     *  **        * *       *  **  * ** ***       *  *  *  *    
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