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Ranking of SCOP_FAMILY : from 1001 to 1100

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[1001] d.142.2.1         1680                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                                                                   2                    131   1                                           2                   
 ATP-dependent DNA ligase cata  22122111222211112111111321112111112222222211111132233322222221112111 236-4---1-----24433-34--343333334567438512112312-1--252-----224-225463----------1--2-1--------------2-21522-3--------------2--------------12----------------111111------1-2---333-2--3-----11-1-1---------------212212------21--------12-----------------1---------1-----------------------------------------------------------------1-----------1-------1----1---111-111211111-----1-12115-----2393452222322----------2-11111111331-16624555656022-1-11223221----------111-1-1-------------------------------2231--1--11121112----21251211---223321--111132322122311-12--1--1111111--12311-1----------1-111-1-1--435422--1-111111111---------1---------21-1111111111-1211111121111---111--------------------------------------------------111-1---1111111--1------------11--1-1-------1-111--11-1--1---111-1111-11-------1-----11111-23222222222---------1111111111-11113224244111------------11----------------------------------------------14-3 11-1545-163221554654445444444445544444444554444356444345545554223222-2222222212232222223346347555555436344181584867563254463894623301552343443483364457214477554735564543294333234372227323444464144542
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[1002] b.92.1.10         1678                                                                          1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                                                                                         1                                              1                    1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      111                                                                                                                                         1       
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[1003] c.23.10.9         1678                                                                            1                                                           1                                         1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                                 1 1  1               1    22                   1       2    1      111                         1
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 or, C-terminal domain                                                                               ******************* ***************************************************************     ********* ***********************************************                                *    *****  *************************************************************************************************************************************************************************************  ************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************ **************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** *********************************          *          *                              *                                                           *                                              *      *           *          *          
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[1005] f.4.5.1           1673                                                                                                                                                                                            1111122                                                                                                                                                                                                                                                                 11 1                                                 1                                                1                 111                                              1                        1         1                                                                                               111  111      1    1  1                                         111111 1111                                                                                      11                                                                      1                                                                                                                                                                                                         
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[1006] d.143.1.1         1670                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 SAICAR synthase                --11--1111111111-111111122222121111112111111-11111131111122-1111--11 1211122222222221123-2122122222212222232221212222122132111111421122111122111111112111111122221111---13222311121-1111----111111111111122122222111111122222111112211211212211111223211212111111122111111111111111112111111111112111111111111111111111111111111111-11111-1-11111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111112111111111112111222111111111121111211233221112123442222333222222222222-223224232322322233223211222222222222222222222221222221311222222111111112121121121111211111222222222222222222222222222321223112222213221121222222222111111112122222111111121111113222221212222222111111111111-1-------11111111311211111211111111111111111221-12221-1-11122222221111121111-11111111111111111111112212211111111111111112111222121222222222222-11122222222222121222111-1111111111111112222133432222322222222222222222111122222211112211121111122221211221111--------1--------1------------------1-111111112122 ----112-----2211122232212112212222222323344123212211112111232232111111111211311211122231113111221111121212-22-441242111111214212-223-2431-211-181121122112-1214125111-151111112243203222254432421123211
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 Porin chaperone SurA, peptide  -------------------------------------------------------------------- 345---------------------11--------------11---11------------------11112--------1-11-32222222222322--22212112321111111111111112322222132211112-1-11122-111--------------3222------------21133--3-11333333331333343113322432112-32122222221-111111111111111111111--22-111211--22--1111-2111111111111111111111122222222222221111111111241111111111-1133---221-11112121----11212212222--1132222232223232422222322233333333332-112222123232222222222222222324223233332222222222223222222222222222223332232222232222-2142222223333342322222234222222324333343333433333222232233332232211111323233354322333333333355325422435543332222222222223222222222223122232232222222222222222222222221-2222321-22222222222332221222-3222222222322222222222222222222222222222222222222222-22222222222211222222222222232211122221111222222222222223322223232233332322222222222222222222222222222222222222221132111111--------11--------------------------12222212222-32 ---------11-1--1--111-1-------1-1-1--1---1--111-1---1-21-----------1-11-1--11-----------1--1----3--2-----1----3122---11-111241142713-416-33141112-114-11122511-----2---4--211----21--1-----341----11-11
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[1008] a.194.1.1         1665                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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[1009] d.159.1.12        1662                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1                                                         1                              1              1 1                  12                      1         1                        1       11 
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[1010] d.160.1.1         1662                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1     2    1                                 1         2                   
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[1016] d.118.1.1         1656                                                                                                                                           1                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       2                   2    1                              12111                            
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 PepSY-like                     11111111111111111111111111111111142-11111111111112638111111211111111 --1---11222-1-4------1---1------1-----22---1--3---1-----1-------1-11312-----------2-----11--------------1231---------------122-1111111143342---3111111112211111111111311411111111111111211111-24499999666596996608336769534358324666644144443444444444432211583222233265433235332431113332444322333333333332222222212222433222333311441544354224114331111111212111111221111121121-58-1-1331-----1123322144113----------2-23133524-11-111---2-1---3-1412-1---1-1--------------12111111111-----------------1111-1122-----2--111--------1--------121115--11--22114-111--31-4311-111111123--11----1211111111-------11-111123---321-111111-1------------1133-1122-1-12444422343352322524---41-2--------------------------------------------------------------------------------------------2-----211123212-----------------------212466654665334523444111-11111-11113333311333221111-111------1-----11111111111---------------------------1211111111---- 1211221-622298-2222111111111111111111111111111-111112121111122111212-2221111221211112111111121121111--1222123332224131-212212321-323-23421-131222121113-12-221334224212211222412323842133424522233-223-
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[1019] b.84.3.2          1651                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                                                        
 Peptidoglycan hydrolase LytM   -------11111111----1-----------1-----1----------1------------------- -12-1311---1-112233-37--4132334-412235482-11-22-312-63522311126-41225211-11111----3122-121123----1----1-1142-----------------1---222--133333---1385443344455223122246746551211--12-11-42231---1--222221212212211-1111-221-13-111------211223333233332231-1111-1----------11----1-1----1-6----------11111--1--------------11---2-1-131--11111-------11-121--2--4--312-12123--3---1--11--544521221222443332332255555455543-42522422313-222222322234413-22212-2223111111111-221-34211-------1--2-11-13-21111---1-653512333433333351222223222222432324431121-2432222413122222111121-1---2--3321-2--1-32-111--5-4-2132-442435--------------11111111--1--11464433432334455544564453444533--13251----1-12111212222222222-2223222222222222223523--11-3133333322333333122122222-2111111111111-122222212111263212221122221222322-12-11113266654444354555546---1-----21114544546442456245442222222--124444551111111-14--------1------------1----1222213221--12 ----1------------------1-1------------------------1-----------------------------1-------------1---------1---2-11212-2---1-----12-541--1----1------------------------2------111-1-111111--81-2--21-1----
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[1020] c.37.1.7          1651                                                                                                                                                                                                   4                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  11111        12 1 26  1 1    1            1 1           1  1        1                   
 6-phosphofructo-2-kinase/fruc  ------------------1--1----1-------------------------------1--1------ 1--11---11-1-32------2---1------1--224----3411---1-1-------1-1111-1-1-21111-----1--11------------------1-111---------------32-2111111--111-1222--5111221-1---------12-1121-1--1--11---3-3--1--------------------1-------------2--------3------------------1-1------------------------1111-1-----------------1--1--1-------------------------2------11-----1-----2-1---------2--------111--2-----2--121-1-1--1----------2------1---2--2--1-1-21111--11--1----1---111111112----211---------------------1--1-----1-1------------------1112------111123---212---2211-422-121---1----------1---112--1113212221111--21-1-----321-------------------------1111--1---------1--2-1--1----111---11----------1--11-----------------2--1---------11-1--------------------2-------------1-----1--------------1-2-1---1-----------------------11214633223221233---------------------------2-221-2------1----------------1-----------------------------1------111- ----334-853-4344464579566555555548774977588666445578975474536555557655664656526555555564536446484344334897-5556461448765758571555859-784665838787367547768507884555445424822355145272224354762544345453
 tose-2,6-bisphosphatase, kina                    *  *    *                               *  *       *  **   ** * **      *   *      *  ***    ****   * *       * **** * * *****     *  **                  * ***               ** *******  *** ****  ******* *         ** **** *  *  **   * *  *                    *             *        *                  * *                        **** *                 *  *  *                         *      **     *     * *         *        ***  *     *  *** * *  *          *      *   *  *  * * *****  **  *    *   *********    ***                     *  *     * *                  ****      ******   ***   **** *** ***   *          *   ***  *************  ** *     ***                         ****  *         *  * *  *    ***   **          *  **                 *  *         ** *                    *             *     *              * * *   *                       *****************                           * *** *      *                *                             *      ***      *** *** ********************************************************************************************** ************************* ******************************************************************
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[1021] c.18.1.2          1650                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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 Hemopexin-like domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 4433433222122244132473 32522222223212211211322113 11                                     
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 Pseudouridine synthase II Tru  12112122211111221111111111111111111111111111111111212111111112211111 1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111-11--11211112-1-1211111-111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111121111111111111-1111211111122111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111123111111111111111111111111111111111111112111111111111111111211222211111111111111111122222222221111111111221-11111112111111131111111111111111111111111111111111111111111111112111---1-11111111212111121111111111111111421111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111-1-------1111111111111111111111111111111-111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111222221111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111131111111-111111-111121-1111111111111111111 231112215131112124432222322323333332333333333324433333333233332242322433343332333333332332222222435215321312729363235443233364433993-556243354323333324334335452473323182232221364272223235543222242333
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