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Ranking of SCOP_FAMILY : from 1201 to 1300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[1201] g.3.15.2          1394                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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[1207] b.113.1.1         1387                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 N-terminal domain of MutM-lik  ------------------1------------------------------1----1------------- 3331423333321344534-341144333334444444441412743334344443231132423254442-----------3-------2--1------1-1-2-212--------------1-----------11-1111111211111111111111211111111211121111121111111---111111111111111111211111111111111111111122111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111---1---------------1---1--1-1--113312111111-------3-21111111111111121111111111111111-1-1111111111111111111111111111111111111111111111111111211111-1111----1-1111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111112111---111111122112221113113333111--------------------------221111111111111111111111111111111-11112------22112222222222222-1222222223222222221222221112222222222222222222222221-111111111111---1-----111111221111111111111111-1111111111111211111111112211111112111121111111111111212222221122221111----------------111111-1111111111112111111-----------2-2 ------1---2---1111111112121221111111111111111111111111112221111121---1--1-1------1111----111111-21111--111-16-6523332223333256364824-649134344465133214316355231331352-2123221112126111-2423112122----2
 e DNA repair proteins                            *                              *    *              ******************* ***************************************************           *       *  *      * * * ***              *           ** *************************************************   ************************************************************************************************************************************   *               *   *  * *  ************       * ******************************** * ********************************************************** ****    * ******* ** **********************************************************************************   ***************************                          ********************************* *****      ***************** **************************************************** ************   *     ************************ **********************************************************************                ****** *******************           * *       *   *   ****************************************************   *  * *      ****    ****** *****  *** ** ********************** ********************************* **************** **********    *
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[1208] c.124.1.4         1385                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2                   
 D-ribose-5-phosphate isomeras  11-1121111111111-1-1111121121111111111111111211-211111------11111-11 -1--31---------------2---1----------1-12---13-----121-1-----11--112212-1111111----1-1---11---1----------2-11-111111111-11111-----1-----22211----11111111212211111-121211-211---221---13222221-2--11111211-1112112-11--111-11-21133323321-2222222222222211111121123111113311121212221111111111---1-1-111-1-1----1-111--11-11---111-31-142222132-2-11------11----1---------1--2---1------2--11111111111111121111111-111111-2212223112113111111111111111111121221121111111121111------------------------------------1-22222233332322222224232222222222322222222222222222222222222222222222232-311-111111111----11------1-1111-------------------------222222222322222222222222222222221-1222211111122222233332322232-3233323332323333332323232222222112111122222222233323-2333333333231112222222222222222223221111122321111111222323323222222222222211111111122222222222232433222222222222221-------1111111111--------------------------------1-1---1- 11--11--1---11111111111111111111111-11211111111111111111111111111111111112111111-1111111113112111111111321111-212-132-1131111111-131-11111-111111-11111111111211111111111141-112222422221845914513211-2
 e (RpiA), catalytic domain     ** ************* * **************************** ******      ***** **  *  **               *   *          * **   **     *** *     **  ****** *******    * *   **   *          * ** ********* *****     *     *****    ***************** ****** ***   ***   ******** *  ******** ******* **  *** ** *********** ****************************************************   * * *** * *    * ***  ** **   *** ** ********* * **      **    *         *  *   *      *  *********************** ****** ****************************************************                                    * *********************************************************************** *** *********    **      * ****                         ********************************* **************************** **************************************************** *******************************************************************************************************************       **********                                * *   *  **  **  *   *********************** ******************************************** **************************** *** *** ********** *** ***** ****** ************************** ************************ *
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[1209] a.4.5.60          1384                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
 ScpB/YpuH-like                 -------1---------------3-1111-1-----------------22222-22222221211-22 222-122222222222122-22222322222222222222212112-122222221-2--221-1221211----22222222-----------------1---22-2--------111----222222222-2222222---21222333322222212223323222222222112222---12222222422222222222222232223322222232222222222213333331333333121131122222222223322222232222222223333233222222222223333333333333222222222322222222322322222222333223322222123-2-222223322-112232111-----621226212122222332322234--11-21--802-2227122422222422273224224422222222222212222-----------------------------22222-2222222222222222222222222222222222222222222222323222-22222221222222222222-2----1----1-212211222232222--1------------------------2222-222-222-2223322222222222222--22222------------------------------------------------------------------------------11111111111---22222222222321----------------22222221222222222222222222222------------------------33222222222222--61222222--------21-----3-32222222223222222221222122112-2-- ----1--------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1--------1----1--------1----------------------11---------------------------------1----
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[1210] a.4.5.29          1383                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     11                                                                                   1                  12                                                       223 11       
 Plant O-methyltransferase, N-  -----1--2222221-1-1-111-1111--1-1--541142-1-12-2-1542--12-2-----1--1 --41221211112-12333-33223433333325452344112222211111423322--541242722421111222-1-1--11232212-111---1-----23-221111111-1----1-1111111211111-------1123111--221-----2-2-1-21--------------1------1----------------1-11-----111-1---11-1--11--------------------1----2-----------1---------------------------------1-------------------1----------------1--------1111---21--1-12---1-2-112---1-111--38233122223111111111112-32132211232-233--22--111-411-1111-111-1111111113--1-11322111111111111--11111-11-2131-11111155345233243444333376666467342734--442--2112-1244-11-1-11111111-112221--133------2--11-1-22132---1-43-21---1------11--------1-1211-----2-1---2-----111111-111-111-12--2---------1-1----1--------------------------111-214-------------------------2-1-------------1----1-2322--3--222-1-----------------1--1144351--21---1-1--1---------2331------111112-111111111111-3111----------------------------------------11--------12-1 ----55--------1123144768924--1---5331323334---74143232--412323--1-------------1-------1--2832121---11------23-246343711-13222413-956-45611-25224213231212821272---2121-1112--71222-8---142908297--1----
 terminal domain                     *  ******* * * *** ****  * *  ****** * ** * ****  ** *     *  *   *********** ***** **************************************  ****************** * *  ******** ***   *     ** ********* *    * *************       *******  ***     * * * **              *      *                * **     *** *   ** *  **                    *    *           *                                 *                   *                *        ****   **  * **   * * ***   * ***  *********************** *********** ***  **  *** *** **** *** **********  * *****************  ***** ** **** **************************************  ***  **** **** ** * ******** ******  ***      *  ** * *****   * ** **   *      **        * ****     * *   *     ****** *** *** **  *         * *    *                          *** ***                         * *             *    * ****  *  *** *                 *  *******  **   * *  *         ****      ****** ************ ****                                        **        ** *     **        *************  *   **********   ********  ******  *             *       *  *******   **      ** ********* ******** *** ***** ********************   **** ****  ***** *   *********  *    
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 Virulence-associated V antige  ---------------1----------------------------1------2---------------- --------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------1111111121---------1---------------------------------------1-------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------11-1-------------------------111111-11-1----------------------------------------------11-1--------------------------------11----------------------------------------------------------------------------- 1-11123-131322222212222232222122222422-213222212322252343242232336432357233335454444356555962564533226218823-5103689528091917980056932219999182128906629991503158216668782470552--13-2-1275662531121-14
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[1217] b.139.1.1         1378                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Surface presentation of antig  -------------------------------------------------------------------- 3332-1----------------------------------2---1---2----2--------2-2------------------22433-------------------2-111111121111112--------------------2--------------------1------------------------222224244444444444222222444222222244444422------------------------------------------------------------------------------------------24122222222222223222---222--32222224432223322222--22432332----226233333533511221221222-5555535533323222334222222-3432124444222--------2222-263------------------------------1-222232325334653444244325557262433222--223223222--242222222272-------222-22222-2221222222422222222233132-2-3333-33333333333333333331--25-222222222422252422242244442---222222122242232252332222233-2523422222325-22--2---3343344444444444444442231322372466666536565--2------2222--622-------------------------2233232223522222353---------2222422222562222233333335------233333332222222222--------------------------2-22222122-2-- --------21-----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2----------------------1------2----------
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[1218] g.44.1.3          1378                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                   2 1221111 1   1131 1 362 112  111 111 1  11  1 1111        1  1 11  11 2     1233 31       
 Variant RING domain            -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------1-1------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 2233431-045-111223333322323332233223322213333323225424342323332322122122121122221-111112213322432221-32543250393077928079950068690003645890079353838905989742257944775254806142321935858523084883223337
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[1219] d.75.2.1          1373                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 DNA repair protein MutS, doma  ------------------------22222222-----------1111112111--------------- 112--------------11-1-----11111---------------1-----------------------------------11-11-2112111111111111111111111111111111111211111-11111111111121111111111111111111111-1111111111111111-11111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111-1111111111111-1111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111211--111112-12221121111211111111111111111111111111121111111111111111111111-------------------1-11-111211111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--11111111111111111111111111-111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111--1111111111111111111-------------------------11111111111111 2211334-5221223333333334343333333333333333343323332233333333333323331333333331333333333333433433333323333214414223422221212135-31272-234122322221122123112252221331322111111153324634423454583452233231
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 DNA mismatch repair protein M  ------------------------11112121-----------1111111111--------------- 111-------------------------------------------------------------------------------21-11-111111111--111122111111111111111111111111111111111111111211111111111------11111111------------111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11-1111111211111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111122112111111211111111111111111111111111111111111111111111111112112-11111111111111111111111111111111111111--11111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-----------------------11111-111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111111-1111111111111-11111111111111111111111111111111111111-111111111111--3-111111211111111111-11-1--11111111111---111111111111111121111111111111111111111111111111111111111--1111111111111111-11-------------------------11111111111111 1211222-4121332222223222222222222222133323322223222222232222222223222222222221223222221111322222222223212113115953326332325387212266198132532246444434525934433374234333143414333227222122112221-222223
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[1224] d.83.1.1          1368                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Bactericidal permeability-inc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111 1 1111111142121432 3241111211211211121 41211111 11       22                          
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[1225] c.56.6.1          1367                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                              1                 1       11        1 
 LigB-like                      111113233334334211131111-----1--111211111112211111221132223333421121 11121---------221----4--12-----13556223511121--1------2-------2-2211111------1--12-22111------------1-1-11--2---------------21-1-----21---22111-1---1-------------------1----------------1111-31-111111111111111--221-111-1-----------11--------------------------------------------------------1--111-1-1------------------------11-23------------43----1-1--1--11221111211111111---112111-----211551--4-131---1-1----1------1---11-2--111--1----131----1-11-11111111111--114-2-------------------------------43--3331122222213332332433331443514121122132112532531112211111-------1-12552222-121111112-211111121112112131-------------------1-11211112111-11-11111111121112111111---1--2------11121112221211123-2323212322213331332444113312122222222222222322-2223--122222222222---1-----11111-425----11--------111111121214122222212122251112-------------1------1--11122222322------1-221111--------1---------------------------2111111111-1-1 11--231-3141223334234425573112111-2123331322213233468433432222322431-2112221111113322221223132222222343233-21541121122-1111-1212-682-4221-3-2-12113221111311113380242-321211222133-4--1223446423329673-
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[1226] c.1.8.6           1367                                                                                                                                                                1111        1       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                                1                   3                                111    1  1                 1       
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 atalytic domain                                **         *                      *      *           *** *            ** *     * ***     *   *   *** *  **    *  ** ********    ***    *     ********   ** *** ***                     *    *****   ** ** *** *            ****            ***  ** * ** * ********************   **        ***                   *   **     **          *         *  ***********             ***   ***   *         * ***   **** *  *        *     ****  ** *****       * *   * **************             ************   **   **** * ************  * **                             *  *     ****** ****    ******** ****  ****                 *                         **       **                              *   *  **  ****   *******************     *       **  ** ** ******* **********************  **            *    ********* ************  *            *  **** *                    *           *  ****         ****************************   *              * *                         ***** *    ***     ***  *  ************************************************** **    **** *      *****   ***************** ************************* ******************************************  *     ********** * ***
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[1227] c.37.1.16         1364                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                                         1                                                                    
 Helicase-like "domain" of rev  6652645466666664312322332332233143345-1131-122235234112443444-2252-1 233-23-222211122212-13--2111111-35553332211-2--2111-322112--112111315211111-121-1--4-322--11-1-----1--11111----------------1----11--2-11--1222--1-12-1222---2211--1--152111----11----1-1-2412--1-1111111-1--1----1--------1---21-----111-----------------1-----------11----111------------1---1-11111111111----------------------12---1----2---1-1-----1-211--1---11122---1-2--12----112221-----1-2113--2-2-21112111-111-11-131-1111-1--11131121113-1-1121122--1--------21111-2-------------------------------1--2-211112111121111122211121122431-2---221--12111--1---2---2------------11--13-121--1-12--1-11-2--1322323-1-1------------11-----112-----111-1--1----------1----1-------2--1------12-12112442222222-4322422232423222222223-1-112211122222222222-3222232--122122222222---------1---1-2--2111111111-1112----------------1--1111112-11---1------1111-------1-21123332121------3---------------1---------------------------21-312-22212-- 531131311322211112211333221221121331-1111111--1334435313442665412322-3112222--1222222411124-15492232232221-2744244214421221293162563-32211-111-1322--3221-22734-1121132231-2-43-15-81-2341115221-341131
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 Phosphonoacetate hydrolase     2212413233333321-1-2-1-1311114212-1------------1------2111121211-1-- -3913---222----11----11132-----13111132211-11511-1-1212112--113223234411111211----21----22---311----21239-614------------------------2-12223---13-16-------------1---3-111------------11---------1111121121111111222--1111-11-2-1111113-----------------------1--------1111------11--------------------------------------------------23-----------1111111--1--2-11-1813-121-1-------2-21111--------111-111------------------------3-----1------11--1111------111--------------1--------------------------------211212---2222222111122111111-1312343---12--------2--1--12---2-111-212----1-12---121242111-211-----2----32-1---1-1111------------------11-1---1111-------------1---------111--------11--1--------------------------------------------------1---2-------1----------------------1-----1---------------------------1-1111221112111-121----------1111------1-111111111-211111----22------------1---------------------------1111111211-32- ---135----2-2222111111121221111112112111111211121111111111111141112--12111143132111121121322122-1111121455-32501384188876803477177391996876507793788863989577870436855131365856--122--1--3213139--2331-
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 Ribosomal protein S19          11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111-11111-11111111111111111111-111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111-111111111111111111111111111111111 11111111422122122212122221222222222212222222222222222222222222222222222222222222222222333232222522222-244511312121112112--2-33121144-126-11-11-11-11-1-1-1121112411121121111112212141111283282731111111
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