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Ranking of SCOP_FAMILY : from 2601 to 2700

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[2601] d.126.1.5          355                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2    1                                                               
 Peptidylarginine deiminase Pa  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------1--1----11----------------------------------------------1--------------------121-11------------------1-------------1------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--------------1------1---1----------------11------------------------------------1--------------------1----------------------111-2121--11-1--111112111-111-------------------------111--11---------------------------------------------------------------1------------------------------------1-----------------------------1-----1------------------------------------- 1-------------1--1---------112121----------11----211383111--------------------------1-1------1----------1-----8212226554354555455985155235558546445642655443223-1---2-----2-------------2-141----1-----
 d4, catalytic C-terminal doma                                                                                                                                           *  *    **                                              *                    *** **                  *             *      *                                                                                                                                                  *                    *             *                                                                                                                                                                               *      *              *      *   *                **                                    *                    *                      *** ****  ** *  ********* ***                         ***  **                                                               *                                    *                             *     *                                      *             *  *         ******          **    *********                          * *      *          *     ************************************************* *   *     *             * ***    *     
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[2602] c.55.1.11          355                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cyto-EpsL domain               -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------1-1-------------11------------------------111-----------------------------------1--------------------11----------------------------------------------------------1--------111-111111111111111111111111----------------------------------1----------------------11--------------------------------------2332-1322222222222233332222322----2-1------213311-2232233323-322222222233222222233334--1111111111111111111211111--533333313333--2------1111--------------------------------1111-----111-1------------1333333333333331122222111---------------------------------------------------------------- ---------1----2--------11----1-------------11----1-----1-----------------------------------------------111------1-------1----------------------------------------------------------------1-------------
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[2603] d.218.1.14         354                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 adian clock protein KaiA                                    *                                        *                                   *             *                              *     **** *            *                  **            ***   ******* *************   *                                                                                                                                                                                    *    ** *    *        *** ***     ***** * *** *            *********** *  **   *  ***** * *****                                                   *  ***************************** ***  **************        *       ** * * ***  ** * **  *******  ** ****             *                   ***  * ***** *********      *              * ********** ** ***************         ********** *************                             ***                         *      **  * *  * *                        *******                                                                *            * *                                             *                            *          *                                                                    *                   *   *        
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[2607] a.4.5.51           353                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Heat-inducible transcription   ------------------------1------------------------------------------- ----2---112----1111-1---121111111----141----2----1---22111----21--341311------------------------------------------------------------------1-111---------------------------------------------1----1111-11111111111---1-111---1--1211111---111111111111111---11---11--------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------221-------112--------1111111-11-------1--2---311--25--11131---2--1-11---666666663------1--------------------------------11--2211222132-222-11342322-31-2-1----111-11--1---23-1-------11--------------------------------------------1111------1-1121211---------------------------------1------------------11---121-1---11-11-11--1-1111--1----1-22-------------------11--2212--1----------------------------------1---------111-1-----------1112211-1-213-------------11-11--------------------------------------1-------------------------------111111---- ---------------------------------------------------------------------------1------------------------1----1---------------------------------------------------------------------------------------------
 repressor HrcA, N-terminal do                          *                                                *   ***    **** *   *********    ***    *    *   *****    **  ******                                                                  * ***                                             *    **** ***********   * ***   *  *******   ***************   **   **              *                                                                                                       ***       ***        ******* **       *  *   ***  **  *****   *  * **   *********      *                                **  ********** *** ******** ** * *    *** **  *   ** *       **                                            ****      * *******                                 *                  **   *** *   ** ** **  * ****  *    * **                   **  ****  *                                  *         *** *           ******* * ***             ** **                                      *                               ******                                                                                *                        *    *                                                                                             
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[2608] a.101.1.1          352                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1   11  11   121  11       1   2 11                                                
 Uteroglobin-like               ------------1------------------------------------------------------- ---------------------1---------------------------------------1--1--------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------2-2----------------------------------------------------------------------1----------------------1---------------------1-11--------------------------------------1-----------1----------------1--1------1--------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1--------1-----------1-1-1-----------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1---------------------------------------------------1-------------------------------------------------2-1112111-------------------------------------------------------------------------------------1-1-----2----11--1----------------- ---------------1------------------------------1---1-----1--111----------------------1--------1----------------------1458217431576001-70553764320443223326111-1-----2-----------1-1-1-----1-----------1-
                                            *                                                                             *                                       *  *                                                                                *                                                 * *                                                                      *                      *                     * **                                      *           *                *  *      *                                *                                                                               *                                       *        *           * * *                                                                                         *                     *                                                   *                                                 * *******                                                                                     * *     *    **  *                                 *                              *   *     *  ***                      *        *                      **************** *********************** *     *           * * *     *           * 
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[2609] g.93.1.1           352                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                        1           
 Zinc hairpin stack             -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11111----3322-111-11111111112--21--211211-----111-1111111-11111-11-1--111-----111121111---1----1-1111121-11-1232234252122343372045152332121-22245122215522312242221211113114112317111226629163451333-
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 GRIP domain                    -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1-1---1-211------------------111-----11--1------------------------------------------1-2--1111111-1-2-1-211434555742323336525383218332424433442433-5127143333453221262221112-1116---112111-2-232112-
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Pyruvate phosphate dikinase,   ------------------111----------------------------1111---------11---1 -2111--------------------------1--------1----1-1---------------1-----11-------11111-----111-1111-------1--1-----------------111111-1111111-1----1------------------------------------------1-11---------------------------------111111--1--------------1111-1---11---------111--------1111---1--------------------------1--------1111-21111111111-11111111111111111111111-111111111--11111111111211111111111111111111111-11111111111-11111111111121111--11111-1-1111111111---111--1-----11--11-1111111111111111111------------------------------------------------------------------------1-111----------111111112--1--1-1-------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------11111111-------------------------------11------------------------------------------1111111111-11- --------1111----------------------------------1--------------------------------------------------------------2----------------1--------------1-----------2-------1--------------22202221-1351-21-111321
 central domain                                   ***                            ****         **   *  ****                          *        *    * *               *     **       *****     *** ****       *  *                 ****** ******* *    *                                          * **                                 ******  *              **** *   **         ***        ****   *                          *        **** *********** *********************** *********  *********************************** *********** *****************  ***** * **********   ***  *     **  ** *******************                                                                        * ***          *********  *  * *                                     *                                                                                                                                *                                                 ********                               **                                          ********** **          ****                                  *                                                              *                *              *           *       *              ******** **** ** ******
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 Mannose-6-phosphate receptor   -------------------1----1----1-------------------------------------- --------------1---------11-----1-1-1---1--1-11-------1--------1--------1111----1-1--------------------1----------------------------1-----------1------------------11---------------------------------------------1---------------------1--------------------------------------------------------11111111111--------------------------------------1-----------------11--1-------------------------1-1------------------------------------1-------------11---1-1-1--------------12------------------------------------111---------------1---------1-----1111---------1-1-------------------------------11-----1-------1--211-----------1-1111111------------------------1-----------------------------1--------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------12-11111---------------------------1------111----------11---------------------------------------------------- ------1---1---1--1--------2------2--1------1--1----1-1---------1-----1-----1----------1--1-1-21------------11-4357445321135352143524144923326456314333321643253--1-12--1115121--11---11-1-------1--121-
 binding protein 1 (Tip47), C-                     *    *    *                                                     *         **     * * *   *  * **       *        *        ****    * *                    *                            *           *                  **                                             *                     *                                                        ***********                                      *                 **  *                         * *                                    *             **   * * *              **                                    ***               *         *     ****         * *                               **     *       *  ***           * *******                        *                             *                                                        *                                                                        ** *****                           *      ***          **                                                           *   *   *  *        *      *  *      *  *    * *         *     *     *          *  * * **            ** *************************************************  * **  *******  **   ** *       *  *** 
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[2613] f.23.12.1          349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
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[2614] d.58.38.1          349                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Urease metallochaperone UreE,  -------------------------------------------------------------------- -------1111--1--------------------------------------11111-------2----------1------------------------1---1---------------------1------------------1--1--111--1111-11111115-11-11111-1-1--1--------------1---------1--------1-1------------11111111111111111-1---------------------------------------------------------------111---------------------------1-1------------------------------------11-11----1-1111111111111-1122122211--1111111111111-1--111111111111111111----1---------------------------------------111-1111111111111111111111111111-1111111--111111-11-1-1-----------1-11--------------------------------1----------111111111---------1111---11-------1--------------11-1------1----1--12--------1---------1--------111----1----------------------------------------------------1111111----2111----1111111-2-1-11111111111111111-----------11---------------------------1---11-----------------------------------111-------------- -----------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------41112-211--1113-11-111-42221-121211-213-2--3-33-2-------12124--31----------------11------
  C-terminal domain                                                                                         ****  *                                      *****       *          *                        *   *                     *                  *  *  ***  **** ******** ** ***** * *  *              *         *        * *            ***************** *                                                               ***                           * *                                    ** **    * ************* **********  ************* *  ******************    *                                       *** **************************** *******  ****** ** * *           * **                                *          *********         ****   **       *              ** *      *    *  **        *         *        ***    *                                                    *******    ****    ******* * * *****************           **                           *   **                                   ***                          * *                                                                                                ***** ***  **** ** *** ***** ****** *** *  * ** *       *****  **                **      
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[2615] a.133.1.1          348                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1             1    12                                   11                               
 Insect phospholipase A2        -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------1-----------------111---------------------------------------------1--2742546852367668354165-76534358645633525541633542-1-139503867128-------------------------
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[2619] c.52.1.33          345                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Acetoacetate decarboxylase-li  ------1121131421-------221111211------1--1----11----------------1--- 1-1-1----------2222-21--212122212111112112-21----11------1----1-111211-1---------11-1---111-----1-------11----------------------1--------------2---11------------------1----------------2-----1-1---------------1-11-1----------------1----------------1--------11-----11--1--1------------------------------------------------------11-------1-------------------------------------------------224-1-9-----1--------------1--2---3-----2---12---11---------------------1--------------------------------------13--11---2111111111111221111-1222------1111-----1-----------1---------------2-1--1--1----------1--------2-----------------------------------------1112---221--111--1---------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1111--------------------11--1---------1--------------1-1-11-------------1----------------------11--11------------------1------------------------------- ------2--------212-322-4232------------------112-1256721-2-1----------1---1--------------1--1---------1-11---32-----1----------1-783-3---------------------------1--11--1---------13----1-12-2---------
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[2623] d.110.10.1         343                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[2624] b.81.4.1           342                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Guanosine diphospho-D-mannose  ------------------------1--11--------1------1-1---1----------------- 111-1-----------------------------------------1--1111111111111-1--------111--------11---222312111--1-11111111-----------------21111-111--------1--111111--11111111-1--1111-1----111----11111--1-----------1----1-------1-11-----------13------------------------------------------------------------------------------------------2--21111111111111111211-1----2--1---2-21---11-2--1--11111-----21111--1----1--------------------11--111-111111-1--1111-12111---11111111-11----1--------------1---1-------------11------11---1--111--13--------31--1-----11----11-1---------1-------------11----11---11-111111112111111111--1-----------------1-11-21---------1-----------------------1---------111--2-111111111--1111111111111111111--------21111-2111111111-11-11-11----------------------1111------------------------------1------1--3-----1-----1-------------------------------------1111111-------------------------------------11111-1111111 ------------------------------------------------11---------------------------------------121-111------1------------------------------------------------------------------------------------------------
  pyrophosphorylase/mannose-6-                          *  **        *      * *   *                  *** *                                         *  ************* *        ***        **   *********  * ********                 ***** ***        *  ******  ******** *  **** *    ***    *****  *           *    *       * **           **                                                                                          *  ******************** *    *  *   * **   ** *  *  *****     *****  *    *                    **  *** ****** *  **** *****   ******** **    *              *   *             **      **   *  ***  **        **  *     **    ** *         *             **    **   ** ******************  *                 * ** **         *                       *         ***  * *********  *******************        ***** ********** ** ** **                      ****                              *      *  *     *     *                                     *******                                     ***** *******                                                 **                                       *** ***      *                                                                                                
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 AtpF-like                      11-1-11111111111-111111111111111111111111111111311111-11111111111-11 -------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1111111---------------------------------------------------------------1--------------------------------1--1--111-1-1--1111111111111--------------1111111111-1--111121122-----------1---11---11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1--1----1--------------------------------------------------------1--------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------12------------------------------1--1----- 1111221-311111111112112111-11-111111111111111111111111111111--1111111111-11111111111111111-1111111111111111-112111211111221-111-1331-1111-1-11-11-111----21---11212111131112111111191111122-11111211111
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                                                             *                  *                        *          **** *************   * **    *               **  *   ** *             *    *  *       *   * *        * *****          *         * *** **          *    ****          *                 ***  *   *                   *   *                                                                                           *                          *    **   *           * * **          *                  *   *             * **  *    *                      *   *                              *             *        *           *         *                             *          *                  *                                * *                 * *                                   *         *     *    ***  *                               ****      *           * *                  * ***      *  * *  *  ****         *           *         ***            *         *                                  *       *   * * *       ********* *   *** ****  ******* *********      **    *   *  *    *** **   * *******      *  *******   *    *** * *** *** * *******  * * ** ****    * ***** ** * *  *       *****  ***  
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 YkgG-like                      11---1111111111--111121--------1-----------------------------111---- 1-1-211--------------1---2------2222-222-2----11-----1-11------2211222-----------12-----1111--22----1---212-1--------------------------11111----1-------------------------------------22111----1-222221121212112-----11111--1---------211------------------------------------------111------------------------------------------------------------------------1----22-11---32--------1----------1--------------------------------1----------------1-----2----1----------2--1-122----------------------------------------3224233322222133333233312222--111--------1----1----111111111---312-23-3222121222-1-----11-1111---21----11111------------1----1---2-1--1211111-111111111111-----1-2--------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1------12------1----------------1--------11-----------------------------------------------------------------------1-- --------------------11--1------------------------------------------------1--------------------2----2--------1--------------------11-----------------------1--------1---------1-------------------------
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[2628] c.23.14.3          340                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                2                                                                    
 ADP ribosyl cyclase-like       -------------------------------------------------------------------- -----1--------1----------1------------1-------------------------1--1----111------------------1------1------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------1-------------1111---------------------------------------------------------------------------------1-----------------1-------1----------------1-1-1-------------------------1----------------------------------------11-11--------1--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1---------------------1-----------------------------------------1111-------------------------------------------------1---------- --------------1--111-1---1--------1--1-1111------------1--------1-----1--1---------------------11----------2-1-761943345445385374984184834447444624542522735534---4321-----1-23-----2-1---1-1--2-----12
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[2629] g.49.1.2           339                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 TFIIH p44 subunit cysteine-ri  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 22--331-63-11212121-2-1111--1111111-1111111--1-1313224333211--21121112321-11112211121211222111222--1--1212-12123322222411-3-21-12713-233-1222-12-1122--23423112232233313216452113321111111117-821222311
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Dextranase, catalytic domain   --------------------------------31----1-----1-----39---------------- --3-2--1---1---------------------111---------4-11------------------11---------------------2-------------11--1---------------------------11-------1--1----------------1--2---1-------------------------------------22-1--------------1--31111-1-1--111--2----2--------------------1---------------------------------------------------------------2-------2-----------------------------1---------1-1---------------------1--1-11------1-1-1-21----------1------1---------2---121---------------------------------1---------1-----------------11-----------------------1---------------------1--------1-----------------2--------------------------1-------------1---------1---1-----------------11----2--------------------------------------1-1111-11111-111------1-----------------1----------------------------------------3---------------111---------------------------111-1--1----------------1------------------------------------------13-1 1---4-4--1---1-321-3352212411-35512-21111114231127436134243424---------------------------11-21-1------1----151-----------------2-131-----1-12-----1---1---------112-2-----1-----11-----31-232221-----1-
                                                                **    *     *     **                   * *  *   *                     ***         * **                  **                     *             **  *                           **       *  *                *  *   *                                     ** *              *  ***** * *  ***  *    *                    *                                                               *       *                             *         * *                     *  * **      * * * **          *      *         *   ***                                 *         *                 **                       *                     *        *                 *                          *             *         *   *                 **    *                                      * **** ***** ***      *                 *                                        *               ***                           *** *  *                *                                          ** * *   * *  *   * *** ********** ***** **************************                           ** ** *      *    ***                 * ***     * **     *   *         *** *     *     **     ** ******     * 
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[2632] d.58.4.16          338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[2633] a.137.5.1          338                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13    1                               1                               
 Moesin tail domain             -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111111-1111111111111111111-------------------------1111111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------2----------------------------------------------------------------------------------------------------1--36768463434244754523551744444342473245434338363421353231202141221------------------------
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 Tubulin chaperone cofactor A   -----1-------------------------------------------------------------- --------------1-----------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1--------1------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-11111-311-111211111111211121111111-111111111211112121121-21-11111111111--1111111112111312211112211221113-22-4232321212242134272683232544233-131132114111133421-112121211111311111722-1141-121112-11--
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 FinO-like                      ------------------1------------------------------------------------- ----1-----------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2----1--2-1-111--------------1----------111---------------------------------------------1111112----11111111-1221111------1111111111-111-1--111111111---111-----------------------------------------------------------1111--111111111111111111111111-------------11-11111211121221-21133211142211111113211111112112111312121-212321-133-111111112111--4------2222---1-111111111121111------------22221-1-11111-1--1-11-111--11112222211111-------------------------------------------------------------------------1 ----------------------1-2-1---------------------11231221---111---1-1---------------------1---------------------11-1-1-1-1--1--12126--2----1-1--1-1--11-1---3--------------------------1-1---1-------1--
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[2637] a.39.3.1           336                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           211                                                                          1                                                                                                       11 
 Cloroperoxidase                -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------4084553415543332332----------1118444483811453111---------------------------3868835-----83112------1---1-----2154-212511212-111111-1121--1--21--1-----------------------------1-9----7702-
                                                                                                                                                                     *                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                             ***                                                                                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                  *******************          *******************                           *******     *****      *   *     **** ********* ****** ****  *  **  *                             * *    **** 
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[2638] d.107.1.1          335                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Ran-binding protein mog1p      -------------------------------------------------------------------- 111---1---------------------------------------------------------1------------------111-1---------------------111111111111111---------1---------1---1-----------------------------------------1----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--11---1---1---11-------------------------1-----111--------1--11-------1----1--------111--1-1111-111111----11---------1111-11--1----1------111111111111111--1--1-11---1-1111111--1-11----------------1-1--111-11-1111-111111111--1---111111111111111111111111111-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-------------------11-1-11-1---------------11111111111111111-----------------------------------------------------111- 1-2-22--111-1-1--11-111-----------------1--1--11111111111-11111-1-11-111-11111111---1---1-11-11-1--1-111---112111121-2-1-21221231211-21311121-11-1111-11211-211---1-2----1---3-----5-----1115131---11-1
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 N-terminal domain of eukaryot  11111111111111111111111111111111111111111111111112332111111111111111 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111111113-1111111121111111111111111111111111211111111111111111111111-111111211111111111111111111223111123212221131121111111111-3-161-111111111111111111111211111461111161111111111181111144441321111112
 ic peptide chain release fact  ********************************************************************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ********* ********************************************************** ********************************************************* * *** ******************************************************************
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[2645] b.68.3.1           332                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Thermostable phytase (3-phyta  ----1-----------------------------------------------------1-------1- --1--1--------------------------------------1-----------------------1-------------------------------1---1-11-------------------1-1---11----------11-111--------------1111-----------------------1-----------------11-1---------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------1---22----------------1-1------------11-1----1-1----11---------112------------------------1---------------------------------11---------------------------1----------------1-------1-----------------1---------------------1-------1------------------------------1--2-112-2----12---222--2-2----------------11---1-1111111111-11111111-1111111111111---1-11-11111111111111111---1--1--------------------------1---------------------------22-----2-22----222-------------------------1111111111---------------------------------------------------------------- --1-1-1---1---11-322------2223333---1---1--222-2--2323333311-21-111-1-11-11111111--1-2--1----1-------1-------2-11211-12-1---24141512-2-4112131121-1-1-1-12------2--------2-11----------1-----4----11-11
 se)                                *                                                     *       *    *  *                                      *                       *                               *   * **                   * *   **          ** ***              ****                       *                 ** *         *                                                                                                              *                                     *   **                * *            ** *    * *    **         ***                        *                                 **                           *                *       *                 *                     *       *                              *  * *** *    **   ***  * *                **   * ********** ******** *************   * ** *****************   *  *                          *                           **     * **    ***                         **********                                                                   * * *   *   ** ***      *******   *   *  *** *  ********** ** *** * ** ********  * *  *    *       *       * ***** ** *   ******** * ********** * * * **      *        * **          *     *    ** **
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[2646] c.108.1.8          331                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 5'(3')-deoxyribonucleotidase   ----------------------1--------1------------------111--------------1 -------------------------------------1------1--------1---------------------1------------------------1--11-2-1---------------11-11121--1---------1-----------------1-1-------1--1---------------11-----1-1----1--211112---1112111-----11-21111111111111121111--------------------1-2-11---------------------------------------------11211111111-1--222---------1-1--1111111--1--1-------111-------1111------------------1-21-21-1--1----------------------------------------1---------------------------------------11111--------------------------------------1--2----1--------------1-----1--1--------------------------1--------------------------1------------1------------1-----------------------1------------------------------------------------------1------------------------1---------------------1-11-------------1-----------111-----------------------------111111-221------1-----1-------------------------------------------1------- ------1----1-------1--------------1---------1---------------21----------1------------------1-1111113-1-112--213131111211-22254232773-422-223223221212-32-212221--2-11---------1211-----111111-1---111--
 (dNT-2)                                              *        *                  ***              *                                      *      *        *                     *                        *  ** * *               ** *****  *         *                 * *       *  *               **     * *    *  ******   *******     ** ********************                    * * **                                             *********** *  ***         * *  *******  *  *       ***       ****                  * ** ** *  *                                        *                                       *****                                      *  *    *              *     *  *                          *                          *            *            *                       *                                                      *                        *                     * **             *           ***                             ****** ***      *     *                                           *              *    *       *              *         *               **          *                  * ******* * ***  ************ *********** *** ************ ** ******  * **         ****     ****** *   ***  
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[2647] d.24.1.5           331                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[2651] b.92.1.7           329                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Isoaspartyl dipeptidase        --112---111111-1------------1--1-----1------1-----121-1-------1----- -15----1-----12--11-11--14111111-1111213121121----1-143221------4-22-------1----3-1---------------------1-13---------------------------111-1-------------1--11-----------1------------------111--11111--1---1---3-----1---11----1----121----1--------------1--1---------------------------------------------------------------------11-----------13------1-11------21---1-3----1----1---1-1-------333---1--11------------3212122211--------1-1--12-1--1-1---131------------------------------------------------12-------1112112---11121-11---111-11--------111111-12-1---------------------11---12--1-------1----1-----2----------------11-111----------1--31---------11----1--1-1--------------1---1---------------------------------1------------------------------------------------------------1---------------------------122-2-1--2----1111----------122-----------11---------------------------------------------------1------11112--------- ------1--------------1-1-11-----------------------1121---------1-----------------21------3---11-3311----1-----2-----------1------------------------11-1----1------------12-11----------2----1-----2-11-
                                  ***   ****** *            *  *     *      *     *** *       *       **    *     **  ** **  ******** *************    * ******      * **       *    * *                     * **                           *** *             *  **           *                  ***  *****  *   *   *     *   **    *    ***    *              *  *                                                                     **           **      * **      **   * *    *    *   * *       ***   *  **            **********        * *  ** *  * *   ***                                                **       *******   ***** **   *** **        ****** ** *                     **   **  *       *    *     *                ** ***          *  **         **    *  * *              *   *                                 *                                                            *                           *** * *  *    ****          ***           **                                                   *      *****                *              * * **                       ****         *                 **      *   ** ****    *     *           *                        ** *    *            ** **          *    *     * ** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2652] c.6.2.2            329                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 4-alpha-glucanotransferase, N  --2-3-11111111112123222-------1----221111111--1-1222222123222212---- 2-1-11-1-------------------------------1-----11------1------------------------------2-2111111111---1--1--2----------------------1----2----1-----11111--122--------1---11-1------------1----111----------------------1------------1111-11-------------------------------1----1-1----------------------------------1-1---------------1---11111------111-111--------------1----1----1--111------------1-----1--1----------1-2----1-----------------------1--------------------------------------------------------1---------------------1------1--------------2---1--------1111--------2111-1--1---1211111-1122-----12322-11--1-------------------1-1311--------1---------------1--------2-11-------------1111111111-1111----1111-111111-----------------------------------------------------------11------------------11111-----1-3323-1-------1----------------1--------------------------11--------------11----------------------------1---1211211- ----2-----1------111111-1-1----------------1--12-1--1--1-1-1-1---1-----1------1-------------------1-----1--2--31-2-21----1-------11--------------------2----1-----11----1----11----1-----1--11---------
 -terminal domain                 * * *****************       *    *********  * ****************     * * ** *                               *     **      *                              * **********   *  *  *                      *    *    *     *****  ***        *   ** *            *    ***                      *            **** **                               *    * *                                  * *               *   *****      *** ***              *    *    *  ***            *     *  *          * *    *                       *                                                        *                     *      *              *   *        ****        **** *  *   ******* ****     ***** **  *                   * ****        *               *        * **             ********** ****    **** ******                                                           **                  *****     * **** *       *                *                          **              **                            *   *******      *     *      ****** * *                *  ** *  *  * * * *   *     *      *                   *     *  *  ** * **    *       **                    *    *     **    *    **    *     *  **         
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2653] d.180.1.1          329                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Conserved core of transcripti  -------1-111--1-------------1--------------------------------------- -----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-----------------------------------------------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------1------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1111--1--------------------------3-1------------11--------------------1--------1------------------------------112---1-1111111111111111111111-1-11--------12222211111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-222222222222--1--------------1---111-1111-111----------1-11111111111111111----------11122222222111-------------------------------------------------------------------------- -1---1-----------1-2---1-1-----1--1--------------112-1--1--111---------------------1-------1-11---------1----13351122111-1-152--126212121111-111111-112--212211-12-1---51--1--1------1---42411-1---1---
 onal regulatory protein vp16          * ***  *             *                                             *                                                                                                                                 ***                                                                       *                      *                                                                                          *                             *                                                            *                                                                    *                                   ****  *                          * *            **                    *        *                              ***   * ********************** * **        ***************** **************************************************** ************  *              *   *** **** ***          * *****************          **************                                                                            *   *           * *   * *     *  *              *** *  *  ***                     *       * **         *    *********** * ***  ************ ****** ***  ****** ** *   **  *  *      *   ***** *   *   
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 3-Methyladenine DNA glycosyla  ----111211111111-1-------111----11---------------1425-11111-11------ ---11---11----1---------12-------11122111111-11-----111-----122-213311--------------------------1----------1---------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1------------------1--1-11111---11-11---1------1------------------------------------1------------------------1-1--1111111-1---11-----1--1--1-1-----1----1-1-----31----------1---1----1-1----------1-1--1-11-11--111231111211-------119--11------------1----------------1-----11------------1--1---1-15-----------1--------1-----1--1------411-----------------------3-1-------------------------------1---111111111111111-1-1----1--2--2-----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------11111111111----------------------1-------------------------------------6---------------------1----------------------------------------------------------------1----1------- --------1-----------111------------------------1--3-----1--------------1-----------------------3-------1----2---1114----113122-314821534-3--111-1---1-2-------111--1------------------------1122-----1-
 se III (MagIII)                    ************ *       ***    **               **** ***** **          **   **    *         **       *********** **     ***     *** ******                          *          *                                                         *                                               *                  *  * *****   ** **   *      *                                    *                        * *  ******* *   **     *  *  * *     *    * *     **          *   *    * *          * *  * ** **  ************       ***  **            *                *     **            *  *   * **           *        *     *  *      ***                       * *                               *   *************** * *    *  *  *           *                                                                                               ***********                      *                                     *                     *                                                                *    *                *           ***                        *  *     *              *                       *       *    *   ****    ****** ********* *  *** *   * *       ***  *                        ****     * 
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[2657] b.35.2.1           328                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BglG-like antiterminator prot  -------------------------------------------------------------------- -----11---2-1----------------------------------------11--------1-------1---111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------23111111122111111435554211121-12312231311-111111111111111111223--33--4-335--15---21-11-11222122-12222222221211111111111112211112222-1-434445335232-8--1111-----1-------1------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------132-2-1--2122211--1111221---2-11111112144111----------------1-1-1111--1--------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 eins                                                                                                     **   * *                                        **        *       *   ***                                                                                                                 ***************************** *********** *********************  **  * ***  **   ** ** ******** *********************************** * ************ *  ****     *       *      **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *** * *  *******  *******   * **************                * * ****  *                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[2658] a.69.4.1           327                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BH3980-like                    ---------------------------------------------------1---------------- ---------------------------------------------1------11---------------------------------------------------1---1----------------------------11-----------------------------------------------------4444445624444433411--6341---2--222222-2-111111111111112112121215411111221144-1111133422211111112222222222211111111111111221112221-1-1-1111111-121-55----1---------12-2-------------------------1---------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------133---1----------1-1------ ------------------1-------211--------------111-----1-1--------------------1------------------------------------1----1---1-1--1---151-212111--1133---------------------------1---------------------21---
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 Small-conductance potassium c  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------4077665345366270284137-7513442654662662343353333513222131811283-1------------------------
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[2661] a.6.1.2            326                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 DNA repair factor XPA DNA- an  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1--2-1---1121-111111111111111111111111111111111112-11111111111111111111111111111111111122-1121111111111111-34324523132341863725131332222242354232322223322332242322-32252221-1111---21-123111--2111-
 d RPA-binding domain, C-termi                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ** *  * *   **** ************************************ ************************************** **************** ******************************************************** ******** ****   ** ******  **** 
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[2662] d.79.6.1           325                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Holliday junction resolvase R  ------------------------------1------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------1--111-----1---------------------------------------------------1----1-------------11--------------------------2-----------------1-11-1----------2---------11-1----22-4----1-1----1------1--1---2---1--1--1-------------1---1--------1-------------11111111111111112111111-1-1---------1--------1----------1----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1---2----------1------------------1-----1------------------1--23--------------------------------------------------------------------------------------1---------------1-----------3-----177315163119-12145114964111113--1--------1121---1---12--3133443---------------1-----------------111--------------1-----------1-----1----------------------------------------1112-------------------------------1---------------------------- ----22-------11---1------------1-1---------------------------------------------1---------321-1-6----1--111-1-5-1-12121112-3--12-1-2-----1-2--2---2221-13--1----1-3-11-3313------------------1----------
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[2666] c.132.1.1          323                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bacterial fluorinating enzyme  11111111111111111111111121111111---11-----------1-111111111111--1--- -21-----------------------------------1-1222--1-1-----------12--------1---------3-111111-----------1111121-11---------------112212-1111---111-111112-1111111------1-131121---------------11-----------------------111--------1-1111111---11111111111111--------1-11-1-1----11----1-----------11111111111111-------------11112111111-------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------121--------------------------------------------------------------------------------------11---------------11--1---111-11111----------1111--11-----------1-1111111-------11-------------------------------1111--------------111-111---1---111-1-11-11-111-------------------------111---1---------------------------1---------------1----------------------------------------------------------1-------------11------------------------------------------11111111111--1 -1-----------------------------1---------------2------------------------1----------------------1---------------11--1-112111222121151111121121111--111-131-1-1-1-------------1--------------------------
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[2667] d.190.1.1          323                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Chorismate lyase               --------------------------------1-111111111-1----11111-------------- -----------------11-1-112-111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------1------1---------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1--------------11111------------------------------1-----------------------------------------------1------------------------------------11111111111122121111122211111111111111--------1--1111111-11111111111111-------2-------------------------------------------------11111111111111111111111111111111----11-------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--1111111111111111111-1------111111111111111111112121111111112111111111111111111111111--------------111--------------------------------------------------------- --11----11-1-------------------------------------1------------------------1--------------------1-------------------11----1-----------------------------------------1------1-------------1-----1--------
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