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Ranking of SCOP_FAMILY : from 3101 to 3200

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3101] d.344.1.3          164                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[3102] f.4.1.3            163                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111                     1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1        
 GNA1870 immunodominant domain  11------------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1-111-----------------------------------1-----1--------------------------------------------------------1------------------------------------------2----------1-1-----4766765----------------1-----------------------------------------11-------------------------------------3----------------------------------------------------111-1------------------------111111111111------------------00021--2321432----------1-------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------1--1---1-------------------1---------------------------------1-------------------------------------1-----------------------------------------5------1-
 -like                          **                                                                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ** * ***                                   *     *                                                        *                                          *          * *     *******                *                                         **                                     *                                                    *** *                        ************                  *****  *******          *                                           *                                                                                                                           *  *   *                   *                                 *                                     *                                         *      * 
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[3103] b.37.1.1           163                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                              
 N-terminal domains of the min  ------1-------------------------1--111-------------1------1--------- ------11---------11-1-----11111------1------------------------------------------------------------------------------------------------1----1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-11-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------- -------------------111-------1111----------1111111--1---11----------------------------------------------------------32-222213323-672-33522224224222111222111111-----1---1-1-1--1--13--2-----------1111-
 or coat protein g3p                  *                         *  ***             *      *                **         ** *     *****      *                                                                                                *    *                                                          *                                                                                                                                                                                                                  ** ** *                                                                                                                                                                                                        *                                                                      *                                                                                                                                           *                                                                                                           ***       ****          *******  *   **                                                          ** ********* *** **************************     *   * * *  *  **  *           **** 
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[3104] b.1.18.20          163                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Enterochelin esterase N-termi  -----------------1111----------------------------------------------- --1-1--1111---------------------------1--1---------------1----1-------------------1-------------------------------------------1-------122211---------11--------------11111--------------1-1----------------------11111----------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------23-11----1---------------1------------1----------------------1----1--1---------------1------1-------------------------------------------------1--------------------------2---------11---------1-------------------------122-11--1---2-1--1----------212--------------------------------1-----------11-11----------------------------1211122211-2121111111221111111--------1111211111111111-1111111-----------------------------------------------11111------1--------1----------------------------1---11---------------------------------------------------------------------1-- ----------1--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1----------------1-------------------------------------1--1----------
 nal domain-like                                 ****                                                  * *  ****                           *  *               *    *                   *                                           *       ******         **              *****              * *                      *****                *                                                                                             *                              ** **    *               *            *                      *    *  *               *      *                                                 *                          *         **         *                         *** **  *   * *  *          ***                                *           ** **                            ********** *******************        **************** *******                                               *****      *        *                            *   **                                                                     *             *  *                                                                                                       *            *                *                                     *  *          
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 Hypothetical protein YjcS      -------1---------------------1---------------1------1--------------- ----1----------------------------------2-1------1------11---22------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1-----------------11-1----------------1------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--1-------122------------------1-------1----------1-1-1--1----------------------1------1-------------------------------1-11---------------------------1-1-1-------1111--1-1------------------------------1--1111------11------1----------------------------------------1-------1-----1-------------------------------------------------------111---------------------1------------------------------------11----1---------------------2-2211--111---------------------1-------1-----1-11------------------------------------------------------------------- ---------------21111-2-111------------------1-11-111212-------------------------------------1---11221-1-----1----11--1-----1-----22--1-1------11--1--------1--------------------2---11-11----1---16547-
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[3107] b.82.1.21          162                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Acetylacetone-cleaving enzyme  -------------------------------------------------------------------- --1---------------------1-----------1-21--1-------------------1---------------------------------------------------------------------------1------4--1-------------2--1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--------121----1------------------1-------1------11---1-11-1--32-----2-1--------1------1--------------------------------4---111-2111121111-11-11111-1122221--2--1-12---------33-----------------2------------------------------1---------------------------11---26-2111112222-2-1--1---2-22------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------4--1----------------------11-----1-----------11----------22111------11---------------------------------------------------------------------------- -----------------------211----------------------111211------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1------
 -like                                                                                                 *                     *           * **  *                   *                                                                           *      *  *             *  *                                                                                                                                                                                                                 *        ***    *                  *       *      **   * ** *  **     * *        *      *                                *   *** ********** ** ***** *******  *  * **         **                 *                              *                           **   ** ********** * *  *   * **      *                                                                                                       *  *                      **     *           **          *****      **                                                                                                    ***                      ******                                                                        *                                                                 *      
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[3108] d.155.1.2          161                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Arginine decarboxylase         ----------------1------3-111-1--1111111111111111-123211111111111--21 11-------------------------------------------1-----------------------------------------------111-------------1-1111-1111111-11212111311------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------11--1111-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1---1------------1------131------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------- --------------------------1---------------------------1-1--------------------------------1-----1-----1---------221113-1-1-2-11111191111111--1111-11-1-111111111---1--------1-------------------1-------
                                                *      * *** *  **************** ***************  ** **                                           *                                               ***             * **** ******* ***********                                                      *                                                                                                                                    *                              **  **** **                                                                                                                                                                                                               *   *   *            *      ***                        *                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                           *                           * *                                *     *     *         ****** * * * **************  **** ** * *********   *        *                   *       
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[3109] a.237.1.1          161                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA polymerase III theta subu  -----------------------------------------------1-------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21112212112222-22-22222223222222222225322211222222222222232224221112211222212222322---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------1------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nit-like                                                                      *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ************** ** *****************************************************************                                                                                                                                                                           *      *                                                                                                                                                                                     
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[3110] f.23.21.1          161                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 membrane domain                                                                                                *                        * **             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                * *** *       ***                                                            ****    * ***********************      *  ***************** ** ************************** ************************* ************ * *          *  *   ****     ** ******  * * ****    *    *            *****     *****              *                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Mitochondrial cytochrome c ox  ---------------------------------------------------------------1---- --1----------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1--1-------------1------2--1---------1---11-2---1-1-1----1-------------1----------------------------------------1---------------1---------2111--11------11-1----1--------------------------------------2---------------------------------------------------------1---------1---------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------12---------------------------1111-1----11---21---------------1--1-1---11------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---3-111322321212212-663-52212222124122--21-2131111-------1---1-----------------------2----
 idase subunit VIIb                                                                            *       *                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *           *  *             *      *  *         *   ** *   * * *    *             *                                        *               *         ****  **      ** *    *                                      *                                                         *         *                                                                           *                                     **                           **** *    **   **               *  * *   **                                                                                                                                                               *                    *   * *************** *** **************  ** *******       *   *                       *    
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 RPA2825-like                   -------------------------------------------------------------------- ----1----------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-2----1----------------1----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111-11121231----111--1-111-----------------11111111-1111---------------------------------1-1-------------1------13--------111-------1--------1--1-------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1--------------1------------------------1---------------------------------------------------------------------------- --------------1--1-51-----1---111-------------------------1-------------------------------1--------------------21----111--1-45-51741---2-1-14-11111--1211----------------1-----------------------------
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[3118] f.23.4.1           158                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Mitochondrial cytochrome c ox  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------1--4133432223223144332803-65514134325312121311332224------11326---1-------------------------
 idase subunit VIIa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *  ********************** **************************      *****   *                         
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[3119] d.94.2.1           157                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Putative transcriptional regu  ---------------1----------------114------------------4-------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111-11111111-----------------1----1---11-----11--111-1------11111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111-1111---11-1--12----1----1-1111--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1111111--1- -----------------------------------------11-------11---------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------2----1------------------------4-
 lator TM1602, C-terminal doma                 *                ***                  *                                                                                                                                                                                                             ******************************* ********                 *    *   **     **  *** *      ******************************************** ************** ****   ** *  **    *    * ****  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ** *******  *                                           **       **                                                   *                                                               *    *                        * 
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[3120] e.72.1.1           156                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cas DxTHG                      --111112211212212132213------------11----------1-------11--1-1-21--- -----------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------21---1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111---------------11-1----------------------------------------------------------------------------------------1---------------1-----1--------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------111---------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------11--------- ---1----1---2--11--1---1-1---------1---------1---2---111-111-1-1--1-------------1-----------1--2-1---1-1------21--11511-1-1--4-2-251-11111--31121-----5------1-----3--1----2-2-----------1--2-2---12---
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[3129] d.147.1.1          152                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                                                                                                              
 Methenyltetrahydromethanopter  -----------------------1111111111111211111111122111211-------------- ---------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1--1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-----------------------------------------------------------1------------------1-----1------------1----------1-----------------------11111111-----------------1----1---1----------------1-----------------------------------1----------1--1-11111-2111111--3-111-1---22-1111113-----111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1------------ -----1--334---1-----11--------------------------1----2--------1-1-------------------1--------2-2-----1------2-1-1---1-----1---1--------------------------1------1--1---------------------1--2------1111
 in cyclohydrolase                                     *******************************                                                                              *                                                                                                  *  *  *                                                                                                        *  *                                                           *                  *     *            *          *                       ********                 *    *   *                *                                   *          *  * ***** *******  * *** *   ** *******     ***                                                                                                                                                                                                                     *                                       *                                                                                             *                  *  ***   *     **                          *    *        * *                   *        * *     *      * * *   *     *   *                          *      *  *                     *  *      ****
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[3130] d.155.1.1          151                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Histidine decarboxylase        ---------------------------------------------------1---------------- --------------------------------------------------------------------------------1----1--11------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------111----------------------------------1---1---------------------------1----1--1----1-1------------1-----11----------111----------------1-11-1-11--------------1---1111111111112211222221121--1------11----------------1----------------------------------------------------------------------1-11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111----2------------------------------------1-1-1-1--111----------------------------------------------------------------------------------------1--------- --------1-----------1111-1--------------------11----1-1---------1-------1-1------222-1----2---25---11111-------11----1-1----------1------111-1------11-----1-1--11-2--1-1---1--12-----------2--41-----1
                                                                                   *                                                                                                 *    *  **                                                *                                                                                                                              **                                                                           ***                                  *   *                           *    *  *    * *            *     **          ***                * ** * **              *   *************************  *      **                *                                                                      * **                                                                                                                                 *****    *                                    * * * *  ***                                                                                        *                  *           **** *                    **    * *         *       * *      *** *    *   **   *****       **    * *          *      *** *      **     * *  ** *  * *   *  **           *  **     *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3131] d.3.1.12           151                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         25                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
 IgG-specific endopeptidase Id  -------------------------------------------------------------------- ----1----------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1---1------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------222--------------11111111111-1-12---111-------------------------------1------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1----------------------1--------------1----------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------1----1-----2611--1---------------------------------------1------2-11--------------------------------1-----------------------------------1---2- -----1---------------11----11---------------1111---------------21----1------------1-------------------------2-----------------------------------------------1------2-----1--1---------------2----------
 eS (Sib38)                                                                                              *                                                                            *                                                                 *   *                                                            *                                                                     ***              *********** * **   ***                               *                  *                                                                                                                                                                               *                                                          *                      *              *                                                                *                                                               *    *     ****  *                                       *      * **                                *                                   *   *       *               **    **               ****               **    *            *                         *                                               *      *     *  *               *          
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[3132] d.58.26.4          150                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phosphomevalonate kinase (PMK  --------1---1111-------------1-------------------------------------- ------------1--------1--1------1----1-------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1--111111---11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------1--------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1-1-111111111-1-11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------- 1-------------------------------------------------------------------------------1-------1-----2---------1----31-111-----------------------------1----1---1--------------1-21--------------------------1
 )                                      *   ****             *                                                   *        *  *      *    *                               *                                                                                                                       *                                *  ******   *****************************************************************************************                                        *        *                                                *                                                                                                *                                                                                                                                         *                                                           * * ********* * **                                                                                                                                              *                                        *                                                                               *       *     *         *    ** ***                             *    *   *              * **                          *
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[3133] d.196.1.1          150                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Outer capsid protein sigma 3   ------------------------1-------------------1----------------------- ------------------------------------------------------------11--------------------------111-------------1---1--------1-------------------------1------------------1------------------------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1------------------------------------1-----------------------------1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1----------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------2----------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1------------------------------ -----------1--1-11--11----1------1-1-------1--1---2121----1-1---11--1-11-1-1--------1-----2-111------1--------513211---11-1123-2-34213141111111-2-112121---1--2---1-1-1-1----2-----------11-6--11-1-1--
                                                        *                   *                                                                                    **                          ***             *   *        *                         *                  *                                                            *       *                                                                                                                              *               *                                    *                             * **                                                                                                                                                                                                           *   *                                  *                                                                                    *                                        *                                                                      *                                          *  * **  **    *      * *       *  *   ****    * *   **  * ** * *        *     * ***      *        ******   ** **** * ************** * ******   *  *   * * * *    *           ** *  ** * *  
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[3134] f.23.6.1           150                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Mitochondrial cytochrome c ox  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ----------------1-1111111-1111111111-1111111111111111-1111-1111-1111--11-1-11111111111--1-111211111--11--2-1--111111111111-121131131-21111112-16111--1-12111111--11--12233-111---------------1---------
 idase subunit VIIc (aka VIIIa                                                                                                                                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   * ******* ********** **************** **** **** ****  ** * ***********  * *********  **  * *  ************ ********* ******** *****  * ********  **  ***** ***               *         
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[3135] a.24.1.1           150                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Apolipoprotein                 -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------11----------------1-----------------11----1111----------------------------------------1----------------36225623-123212541753-425121-24442-32-232-425122----1--------1--1----1------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 **                *                 **    ****                                        *                ******** ************ ****** ***** ** *** ******    *        *  *    *                  
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[3136] b.40.4.7           149                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phage ssDNA-binding proteins   -----------------1------1------------------------------------------- -2-----------------------------------------------11--------------------------------1-----------------------------------------------------------1----------------------1---------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1------------------1-1-----1--------------------------------------1----------------------------------------2----111----111--------------------------------------------------------------1----------1--------------------------1------1---------------------------------------------11---1-------1---1---21-1---------1-------5--------------------1---------------1------1-----1---11-------------------1112-111-111111------------------------1-11111---------------------------------------------1-------1--------1-----------1--1--212-121-3241-----11---------------------------------------------------- ------1-----11--11--11---------------------1---1-1---1-------11--------1--------------------11---1--11-----------11--221-1------1-------1-2--1-1---1---------1-1------1--1------------------1---1------
                                                 *      *                                             *                                               **                                *                                                           *                      *                     *                                                                       *                                                                 *                  * *     *                                      *                                        *    ***    ***                                                              *          *                          *      *                                             **   *       *   *   ** *         *       *                    *               *      *     *   **                   **** *** ******                        * *****                                             *       *        *           *  *  *** *** ****     **                                                           *     **  **  **                     *   * *   *       **        *                    **   *  **           **  *** *      *       * *  * *   *         * *      *  *                  *   *      
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[3137] a.134.1.1          149                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              3244 
 Fungal elicitin                -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------4------1814-
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 Beta-galactosidase LacA, doma  --1---------------------1------------------------------------------- ----1----------------------------------------------------------1---11---------------------1-----------1---------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------4-4---------1----------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------1---------------1--------------------------------------------1--1--------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- ---------------31242443655411----1------------3411224433-1-322-------11---------1--------3241-41-----21------1-1-------------1------------------2------1-------11--1---1-21--------------1---4---------
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[3140] d.3.1.13           148                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3141] b.45.1.4           147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[3142] d.228.1.1          147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Replication modulator SeqA, C  --------------------------------------------------1----------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111--111111211111112111111111-------------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--1---------------111111111-11111---------------------------------------11111111111111-----------------------------------------------------------------------1-- --------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1--------1-
 -terminal DNA-binding domain                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                  ****  ************************             ***************** **************************************************** ************  *               ********* *****                                       **************                                                                       *                                                                                   *                                                                                                        *  *        * 
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[3143] d.58.32.4          146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 Cytokinin dehydrogenase 1      ----------------------------1--------------------------------------- ----11--------11122-2-111-1221211---1-----------------------1---1-1---------------------------------------1------------------------------------1-1--------------------111-----------------1-----111111--1-111--1----111111----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12---------------------------1-1---------------------------1---------1--------------------------------------------------------1-------11-------------1-------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------11111-------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --11---------------1-11-1-111--------111111--------------1---1-1-1-----------------------------------1-------2--------11-1-------------------1--------------------------------------1-1--6941-93-------
                                                            *                                            **        ***** * *** *******   *                       *   * *                                       *                                    * *                    ***                 *     ******  * ***  *    ******    *                                                                                                                                                                    **                           * *                           *         *                                                        *       **             *                                                             **                                                                                                                   *                                               *****                                     *                                                                                                                **               * ** * ***        ******              *   * * *                                   *       *        ** *                   *                                      * *  **** **       
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 X-Prolyl dipeptidyl aminopept  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111-1--1-11111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ ----1-1--------------------111-1-----------111-1--------------1-1----------------------------2------2------1-1133211----1--1--1--13-----1---1-121-1-12----11-1-----213--------1-----------867-11-------
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[3146] a.145.1.1          146                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Flagellar transcriptional act  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111112111121111111231111112321222--111211111--11111-1121---------111---------------------------------------------------------------------------------------------------------11111121111111111-111111111111111-111---11111111111111111111111-1---1211---111-1111----------------1--------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------1--------------------------------------------------1------------------1---------------------------------------------------------------------------
 ivator FlhD                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            *********************************  *********  ***** ****         ***                                                                                                         ***************** *************** ***   *********************** *   ****   *** ****                *                          *                                                                                                                         *                                                *                                                  *                  *                                                                           
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[3147] b.177.1.1          145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 YmcC-like                      -------------------------------------------------------------------- --------------1--------------------------1------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-11111--------------------------------------------------------------------------------------------1--------2-------------------------------------------------------------------1--------------1--1---11---1111---1111-1--1---------------11-1-112221211122-2222121212211222221---11---1111111111111111-2222222-------------------------------1---------------------------------11-------------------1111-----11111----------------1--------------------------------------------------------- --------111------11---------------1--------111-------1------------------------------------------------------------1--------1------1-------------1-------------------------------------------3-1--------
                                                                                                                   *                          *                                                                                    *                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                      *       * *****                                                                                            *        *                                                                   *              *  *   **   ****   **** *  *               ** * ************ *******************   **   **************** *******                               *                                 **                   ****     *****                *                                                                  ***      **               *        ***       *                                                            *        *      *             *                                           * *        
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[3148] b.3.3.1            145                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 VHL                            -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------1------------------11--------------------------11------------------------------------1---------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3------------1-------1-------------------------------------------2------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------1-11-------------------------------------111--12-------------------------------1------------------442121-2-111111111112473-225-11-311111111-1112-11111--11111113111-114614-213--------23----3
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[3149] c.24.1.1           144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Carbamoyl phosphate synthetas  ---1-------------------------1-------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------111---11--11111111111111111111-------1--11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--1---------------------------------------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ----1--------------111--------------------------------------------------1-----------------1------------1-1----2---1----------------------------------------------1---1------------------------------1--
 e, large subunit allosteric,      *                         *                                                                                                                                                                                                                                              *    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                     ***   **  ********************       *  ******************** **************************************************** ************  *                                                                     **************                                                                               *              ***                                                  *                 *            * *    *   *                                              *   *                              *  
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 Diphtheria toxin, middle doma  ------------------------1---1-----------------------------1--------- ------1---1----------1---------------------------------------------1---------------1----------1------------------------------------------------------11--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------11111-------------------1----------------------1------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--2111--1-----111111-----------11----1----1-------------1------------------1------------------1--------1----11-111-11---11-------------11--11-1111111111-11112111-1111111111111-1---1111111111111111---1---1------------------11-------------------------------------1-----1111111111111-------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------1---2------1---------------1--1----2----------------1------------------11-----------------11----------------1------1-----------------1---------------111---1---------------------
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[3153] c.23.1.3           143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Positive regulator of the ami  -------------------------------------------------------------------- 11--2-------------------------------1-1-1-1--1-2-1----1--1----2---1-1-----------1-----------------------312-----------------------------11-1221--------------------1-1-------------------------------------------------------1---------1----------------------------------------------------------------------------------------------2---------1---------1----------11---1--11--------1111-----1------1--12---------------12-21-1-1-112111112211---1--1-11-----------------1-1---------------------------------1----------1-------11--------1-11-1--------1111---11----1-------------------------------------------1-1------1--------------------------1---1-1--------1--------------------------2------1-1---1----11--------------------------------------1--------------------------------------1----------------1-111-1-----1111----2----2111------------1----------1------1-------1------------------------------------------------1-1-111---- -----------------------1--------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------
 dase operon AmiR                                                                                    **  *                               * * * *  * * *    *  *    *   * *           *                       ***                             ** ****                    * *                                                       *         *                                                                                              *         *         *          **   *  **        ****     *      *  **               ** ** * * ************   *  * **                 * *                                 *          *       **        * ** *        ****   **    *                                           * *      *                          *   * *        *                          *      * *   *    **                                      *                                      *                * *** *     ****    *    ****            *          *      *       *                                                * * ***                            *                                                        *                                                                                                  *                   
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[3154] a.34.4.1           143                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Adapter protein APS, dimerisa  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------2------------------------------------------------------1----------------------------1-------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------222512231-12172-42783132611-342333-221-232532231--------3112----------------------------
 tion domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                *                                                                                                                                   *                                                                *                                                                  *                                                      *                            *                                                 *                                                                                                                                                                                       ********* ***** *********** ****** *** *********        ****                            
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[3155] f.4.1.2            142                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Outer membrane enzyme PagP     --------------------------------------------------1----------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1222211111---111111-1211-1----111---1---------1-21--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11112211111111111-1121-1111111111111112111111111111111111111-11-111111-111111111111---------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------1----------------------111--1-----1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1---2-----1-
                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                       *                                                                                                                            **** **********   ****** **** *    ***   *         * **  *                                                                                                                   ***************** **** ************************************* ** ****** ************         ****                                                                                                                                                                            *                      ***  *     ****                                                                                                                         *   *   *     * 
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[3156] b.154.1.1          142                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                                                                                                        3                                                                                        
 Agglutinin HPA-like            -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------111-----11----------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------1--------------------1------------------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ----44-----------------323------------1--1----3-3-863-63----------------------------------6--7----------------6---------------1--------------------------------2----1--------2--2-------------------1--
                                                                                                                                                                                                                                                    *                  *                                                                                                                                                                                                                                                 *                                 ***     **                                                                      *                                                           *                    *                        *             *                                                                                                                                                                                                                          *                                                              **                 ***            *  *    * * *** **                                  *  *                *               *                                *    *        *  *                   *  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[3157] a.137.1.1          140                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ribosomal protein L39e         -----11111111111-1-----1111111111-111------11111111111---11-1111--11 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1--1-11-----11----------1---------1-1-----------------11-111111--1---1----1------111-----121-1111111-1-314-1----------1----121-62532-211-------------1-1-------1-1-----------1-----1-1-112316-21-----1-
                                     *********** *     ********** ***      ***********   ** ****  **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *  * **     **          *         * *                 ** ******  *   *    *      ***     *** ******* * *** *          *    *** ***** ***             * *       * *           *     * * ****** **     * 
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[3158] c.140.1.2          140                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Aminoglycoside 3-N-acetyltran  ------------------------1------------------------------------------1 ----1--------------------------------1-------1--------------1-----2212----------------1-------1-------1-------------------------------1----------4-------------------1-1--------------112--------111111111111111----111111----11111111-2---------------------11-----111-------------1-----------------------------------1---------1--11---------1--------1-----1--------------------------------------------------------------1---1------11-1--11-------1------------------1--------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1--1--------1-----1-1-----------------1-221113----------------11-------------------------------------------------------1-------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------1--------------------1--------------------------------------------------------- ------------------------------111----111111-----2111-1-------1--------1--1-----1-----------1-1------11-1--------1--------1----------------1-----------1----------1--1-----1-----------------1------1---
 sferase-like                                           *                                          *     *                                *       *              *     ****                *       *       *                               *          *                   * *              ***        ***************    ******    ******** *                     **     ***             *                                   *         *  **         *        *     *                                                              *   *      ** *  **       *                  *                                                                    *                                      *  *        *     * *                 * ******                **                                                       *                         **                                                                                                                  **      *                    *                                                                                        ***    ******     **** *       *        *  *     *           * *      ** *        *        *                *           *          *  *     *                 *      *   
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[3159] b.121.2.3          140                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Major capsid protein vp54      ----------------------------------------------11-------------1---1-- --------------------------------------1---------1-----------1----------1---111------------1-----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------1-----------------1---1--1------------------------------------1-----------1----------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- 22---21-2-------11----1--------------111211---1----1------------1--------1----------------1-1----------1----314--1----2--1-3--2-2-4---2---3----111-11-11---1--11551---2----2-1--------------311---21-11
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[3160] b.137.1.2          140                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Rof-like                       -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1------------11---------------11--------------------------------------------11-1----1-1--11111111111111111-1---11-1------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111--------------------------------------------111-1--1-1----------------------1111111111----------------------11-------------------------------------------------- ---------------------------11--------111-11-----------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3161] b.61.5.1           139                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Dipeptidyl peptidase I (cathe  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1------------------------1---------------1111-1-----------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------2---------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11----------------------------------------1-- 3222----2--41----------------------------------------------------------------------------------------------1-47121123111111123121532-414111111111111-11114111211111121--------1------------1-----------
 psin C), exclusion domain                                                                                                                        *                                                                                                *                        *                        *               **** *                 *                                                                                                                   *                                                                                                 *                                                  *                                                                                 *                                                       *                                                                                                                                                                                                                                         * **                                        *   ****    *  **                                                                                              * *********************** *************** *****************        *            *           
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[3162] a.60.5.1           139                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Barrier-to-autointegration fa  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------11-512232-221122232231524-225-4313123212222311511-12---2341-11111151------------------------
 ctor, BAF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    * **                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ** ****** *************** *** ******************* **   **** ********                        
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[3163] c.37.1.3           138                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Chloramphenicol phosphotransf  --------11-111--------1-1------------------------------------------- 2---1--------------------------------------1---------11--------------1---------1----------11----1---2--------------------------------1--------11----------------1----------1-----1------1--------------------------------1------------------------------------------------------------1--1-----------------11---11-11111-22---312-----------------1---11-2-1---------------1-111-1---------------------1---------------------------1-----11--1-------1----1------------------1---------------------------------------------1----------------------------------------------------14--------------------------------------1----------------1---------------1----------1---------1--------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------1--1------------------1---------1------------------------------1-1--------------------------1-----------------1-------------111----------1------------ -1--11--521-22--------11--1----1----------------11----11---111-1-------------1--1-----1-1-----------------1---4-1----------------1----------1---------------2-1--------------------1--------1--11------
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 Chorismate mutase              -------------------------------------------------------------------- ---11-------------------------------------1-1-----------------1----1111----------------------------------------------------------------11111---112111111111111111111111111111111111111---111--111---------------111111---11111--11111111------------------------------------------------------------------------------------------1-1--1111111-1-1--------11-----1111-1111121-111-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------111111111-----------------------------------------------1-----------------------------1----------- --------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------13---------4----111--------------------------------------------------------
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[3167] c.67.2.1           138                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PhnH-like                      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1---------12--111-1-1--1------------------------------------------------------------------------1-------------------------1---------------1--1-----------------1----2------1---------------------------------------------------------------------------------------------11-1---1111111121-111111111111111111-11112----1--------------11-1---1--111111-11111---------1111---------------------------------------2------1-1------------------------------------------1111--1------------------------------------------------- ---------------11---11-1111---------------------11--1-------------------------1-------------1------1-------11-1--2---2-4-3------1-1--1-2--11-----11212-12-1-----------1----1----------------------1----
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[3168] d.24.1.3           137                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Pseudopilin                    -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------111------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1---------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------1-1--------------------------1----------------------------111-------11----111------------------------1-11----111-111---11----1---11-------11111-------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ------1-1--1---------------11------------------1----1-111-1---11--1--1--1-1------11111---1-1--1-1112-1--------11---1-----1111--1-381-1------1--111-111-----11-1---1-11-1-2----1-231---211--11111-------
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 Defensin                       -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------3111-32248332444-35334123118--232-4-1--------------------9-----------1--2-1--------
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 Hypothetical protein Yhr087W   11--11-----------1------1--1-111--1-------------------------------11 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------211----11122221111111111112111-111111122222222-1222222111-1111111-111111111111-11111121111111211-1-1-12-------------------1-----------------1-3------------------------1-------------1---------
                                **  **           *      *  * ***  *                               **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ***    *********************** *************** ********** ******* ************ ***************** * * **                   *                 * *                        *             *         
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3173] d.275.1.1          134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 Hut operon positive regulator  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111-1---1111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1111-----111111111212111111111111-11111411111-1111111111111111-1111111111---------1111112------------------------------1111------------------------------------------11----1-----------------------------------------1-----------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------1-------------1-----------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------1-------
 y protein HutP                                                                                                                                *                                                                                                                                                     **************** *   *******                                                                                                                                             *             ****     ************************ *********** **************** **********         *******                              ****                                          **    *                                         *                                         *                                                       *                           *             *                                   ****                                                                                                                                                                                                       *                                                            *                               *                                              *       
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[3174] f.3.1.1            134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 Light-harvesting complex subu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22211-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-24---00225------------22222-22---------------------44-66664----------------22--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nits                                                                                                                                                                                                                                       *****                                                                                                                                                                                                                                                     * **   *****            ***** **                     ** *****                **                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[3175] f.23.14.1          134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Subunit X (non-heme 7 kDa pro  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------1-1111-1-111-1---11111-11111-11-11111111-11-1111111-1111--11-1--1---1111-1111--111-11111--1112-12---11--------1-21-1-393-1-1----2--12----------1111---1111-1111--1-1111-1111121-211---11-1-
 tein) of cytochrome bc1 compl                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               **      * **** * *** *   ***** ***** ** ******** ** ******* ****  ** *  *   **** ****  *** *****  **** **   **        * ** * *** * *    *  **          ****   **** ****  * **** ******* ***   ** * 
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[3176] b.122.1.7          133                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 yqfB-like                      ---------------------------1---------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------11111111111111121111-------------12--11-1111111111-1111111111111111111111----111111111111111111111--11--111111111111------------------111-1-111121--1------------------1--------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ----11------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------1----------------------------------------------1------------------------------
                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                 *    **                                                                                                                **        ********************             **  ** ********** **********************    *********************  **  ************                  *** * ******  *                  *                    **************                                                                               **                                                                                                      *            *                                              *                              
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[3177] d.1.1.4            133                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Fungal ribonucleases           -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111---1111-1--1-1----11---------------------------------------------------------------------------------------------------1111-----------------------------------------------11----------111-------------------1--------1-------------------------------------------------------- --------1-------13133424336------1121---------2114234222223111----11--1-11--------1111---1111-23-1--1-2------1--------------21-------------21-1---------------1-----------------------------12---------
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3181] a.170.1.1          132                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 BRCA2 helical domain           -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-----11111---------------------------------------------------------1----1---------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------2--------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----11------111--1---------1--111----------1---------------------------------------------131-1-11-11--112--1-11111212211111111111161-11111-11-121131112-121313----1221--122--1--111211-12--11-2--11--1-
                                                                                                                      ** *     *****                                                         *    *                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                            *                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          **      ***  *         *  ***          *                                             *** * ** **  ***  * *********************** ***** ** ********* ******    ****  ***  *  ****** **  ** *  **  * 
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[3182] a.29.8.1           132                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Carnobacteriocin B2 immunity   -------------------------------------------------------------------- ---------------------1----------11-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-1331---133--221-111----2221222---111111111112222222222222------1112-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1-----------------1---------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ------------------------------------------------1---------------------------------------------1-----------------11111--1111111----1--1121111--11-111-1111211-211---------------1--------------1---1--1-
 protein                                                                                                                  *          ** *                                                                                                                                                                                                                         * ****   ***  *** ***    *******   ************************      ****                                                                                                                                           *                                                                            *                 *                                       *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                             *                 *****  *******    *  *******  ** *** ******* ***               *              *   *  * 
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[3183] a.246.3.1          132                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 FLJ32549 domain-like           -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1---------1-----------------------------------11-----1----1----1------------------------------1-1-1---1--3222421212222225232301142412222222112221211222122--11111-1--1--21-----------1------------
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 Sulfolobus fructose-1,6-bisph  111111111111111111111111--------111111111111111-1----111111111111-11 ------------------------------------------------------------------1----------------11-----------------------------------------------------11111--1----------------------1----------------11-----------------1-----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1----1--1111111-----------------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1---2-------------------------------------1-----1---------------------------------------------2------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1------------------1--1-----11- ---------------1--1--1---------------1-1-11---1--1-1-1----1------------1-----1---1-----1-1-----1--------------1--1--------1----------1----------------1---1-------2--2------------------------1--1---1-
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[3187] c.18.1.4           130                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Swaposin                       -------------------------------------------1------------1----------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------------------------------------------------------------1--346364--3-2-312-1-112---21-1-1--2-121-1-3--11----161-------1---1---2181--114407-44-------
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[3189] a.57.1.1           130                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Protein HNS-dependent express  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111--11-1--1-----------------------------------------------------------------------------------2----------1----------------------------1----------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--2222222222-2222222222222222222121-----1111111111111111-2222222--211111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------------1-----------------------------------
 ion A; HdeA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      **********  ** *  *                                                                                   *          *                            *                *                                                                                                                       *  ********** **********************     **************** *******  ************                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                               *                                   
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[3190] e.5.1.2            129                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                        
 Allene oxide synthase          ----------1----------------1------------------------------------1--- ----1---------------------------------1----------1--------------------------------------------------11---------------------1---------------------1---------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1-------------1--------------1--------------------------------1-1-212121----------1--------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1------1--------------------1----------------1-----------1--------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------- ---11---------1-----1---1---------1-----------1---2----2---------1----------------------------1--------1-1--4-1-1--21--1-11-1--1-151-441----11--1----------2111---3311-2---------7--1-----222--21-1-1--
                                          *                *                                    *        *                                 *          *                                                  **                     *                     *                     **                                                                                                                                                                        *       *             *              *                                * * ******          *                                                                    *                                         *      *                    *                *           *                                      *                                                                                                                           *                                                          *                                                                                                     **         *     *   *         *           *   *    *         *                            *        * *  * * *  **  * ** *  * *** ***    **  *          ****   **** *         *  *     ***  ** * *  
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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 Hypothetical protein TT1725    -------------------------------------------------------------------- 1--------------1111-1-112-111112----1----211-1------111---------1111111---------------1-----------------1------------------------------111-----11-------------------------------------11111-1--11111111111111111-111-11111-111--111111-----------------------------------------------------------------------------------------------111111111-111----1111-------11----1--1-111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1-1---------------1----11111--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------1-111---- -----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-1-------1------1--1---1-1---1--------------------------1---------------------
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 Caliciviridae-like VP          -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1----------------------------------------------2----------------------1-------1--------------------------------11-----------------------11111111-111111------11-------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------1-----1----------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1-------------------------11----------------------------2--------------------- 1----1----------1-11-----------------------1-----2----1--1-----1-----------1-2--------------1--1--1---------1--2312-2-1-121-63132201-122----1-1211--11---2----3------1-3-----2-----1-1-------21--1-1-1-
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 Proguanylin                    ------------------------------------------------------1111-11------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------- ----------------1-------1----------------1--------------------------------------------------1--1---------------1-22-13232153452334731333233134334-313132-221-1---------1---11---------------1----------
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[3194] e.2.1.1            128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Replication terminator protei  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1-----------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1----11--------2-1---------------------11111111111111211-1111111111111111111122111111111111111121111111111111-111111111111--------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------1----------- --------1--------2------11------------------1------------11----------------------11-1---1--1-1--------------1----1---------------1------1------------12-1----------1----------1-----------1-1---1------
 n (Tus)                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                      *           *                                                                                                            **                                                                      *                                                 *                                                                                                                                                                       *   *    **        * *                     ***************** **************************************************** ************                                                                          *                                                                         *                    *        *      **                  *            **                      ** *   *  * *              *    *               *      *            ** *          *          *           * *   *      
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[3195] d.17.1.3           128                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1                                                       
 Cathelicidin motif             -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-8223211232332392-224112222342323234229-3112-----------4----------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ** **************** ********************* ****           *                            
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[3196] a.232.1.1          127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RNA-binding protein She2p      --------------------------------------------------1----------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------2---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-1----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------4----------1---------1----1--------11------121------1--1-211--11---11111111----------3----11----------1423111-1111112111-121-11311111124112111112111111--212111-1----2-----------1--1-2-11-----
                                                                                  *                                                                                                                                                                     *                                                                                                      *                         *                                                                                                                                                                                                         **                                                                                                                                                                                                                                              *   * *    *                                                                                                                                                                                                  *          *         *    *        **      ***      *  * ***  **   ********          *    **          ******* ********** *** **************************  ****** *    *           *  * * **     
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[3197] f.4.4.1            127                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Outer membrane protease OMPT   -------------------------------------------------------------------- -----------------11-1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-21-----------1---1---1211---22-------1------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-11-1------------------------------------------------------------------------------------------------1---1-11111112---1-2111--1-131--11---1------1211111111111111-1111--1---32323342122---------1111--------------------------------------1---------------------1------------------------------11------------1----------------------------------------- --------------1-----1----------------------------1---1----------1-------------------------1--------------------2---1-----------------1----------------------1--------1-----1----------1-------------1--
                                                                                                                      ** *                                                                                                                                                                               *             **                                                                                                                                                                              *     * **           *   *   ****   **       *                                                                              *                                                            * ** *                                                                                                *   * ********   * ****  * ***  **   *      **************** ****  *   ***********         ****                                      *                     *                              **            *                                                        *     *                            *   *          *                         *                    *   *                 *                      *        *     *          *             *  
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[3200] a.4.5.55           126                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Transcriptional regulator Rrf  ----1-----------1-1-----1---11---------------1--1---1-------------12 1-------111---1-----------------------21------------1----------1---1---------1--1---------1-----------1------1-----------------1-------1-----------------------------------------------1--------1---------------2111-1--1--------------2------------------------------1----------------------1---------1-1--------------112---122---------------1-1-----1--1----------1-------1------11--------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------1--------1----------1----1-1-----------1----1---1------------------------------------------1------------------------11-1------111-----------1-----------------------1------11---1-111111111----111----------------------------2-1--------------------------------------------1-----------------------12-------------------------------------------------------------1------------ -----1------------------------111--------------------------------------------------1------------111-----------1----1---------------------------2------------------1----------------1--------3-11--11-1-
 2                                  *           * *     *   **               *  *   *             ** *       ***   *                       **            *          *   *         *  *         *           *      *                 *       *                                               *        *               **** *  *              *                              *                      *         * *              ***   ***               * *     *  *          *       *      **              *                                                                                                                                                    *       *        *          *    * *           *    *   *                                          *                        ** *      ***           *                       *      **   * *********    ***                            * *                                            *                       **                                                             *                  *                        ***                                                  *            ***           *    *                           *                  *                *        * **  ** * 
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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