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Ranking of SCOP_FAMILY : from 1201 to 1300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[1201] b.43.3.3           295                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11    1                                                1                   
 Ribosomal protein L35ae        11-111----------1------------------------------------11111111----1-- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111111-152111111111111111-1111111111111111111-1111112111111111211111--1-11112-111111--22213111111111111334112121121-11--111112171501-11212-121141111--2111111111-1112121121-111111101-111624424211111-2
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[1202] b.43.3.4           881                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 ATP-dependent riboflavin kina  -------------------------------------------------------------------- 1--1111111111111111-11111111111111111121111111111111121111-111112111111111111111--111-1-11111111---111111111111111111111111111111111-11111111111-11111111111111111111111111111111111111111-1-111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--1-1-1112211111121111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111---------------111111111111111111111111111111111111111---1-111111111111111111111111111111111-111111111111111111-111111-111111111-111-1111111-111-111--11111111-11-111111111111111111111111-1111-1-----11111111111111111-111111111111111111111111--11111111111111111--1111111-1-----------1112-----1111111-1111111111111111111-11111111-11---1-------111-11111111-1111111111111111111111111111-11111--11--------1-1-1--1---11-11----111--111111111-111111- 11---11-4211221111-11111111112111111-111111111113333332223333311111111111111111111111112111112231111112212-15325069753244554572835451557133454242242514317352271-1221114--11113122233222222341132211112
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[1209] b.43.5.2           166                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 CTP-dependent riboflavin kina  111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111-11 ----------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------1------------------1------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------111111111111111-111111111---111-1111111111111111-11-1--11-111--------------12111-11111111121-1--1-------------44------------------------------------------------1-1--------111-2--------1
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[1210] b.44.1.1          3713                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 EF-Tu/eEF-1alpha/eIF2-gamma C                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   11                                                                                              11  112 1111   1  1  1 2 22  111 1  4  11     1  1 1    12     1   11      5     1132 1        
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 Aminomethyltransferase beta-b  111-111111111111--------52324-22----------------------11111111111--- 132121-----11112211-132231111112322221552222224212215643122222522684222----------191---11111-111----211111111--------------11111111111122222---24222222222221111111222222211111111112111-1111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111-----------------------------------------------------------------------11--1111111-1--111----1---11----22-1111111111-1--2-2211111111141221111112111231232224-33234331392-0665758870015611160533334191111111131114111----------------1------------81331-112212222223211122362222122332321--11331111111112--112-21111111111111111-1--111111111-1111111-1222223-------11-11-------------1-112211-15222232222222222222222221-1111211-11122222222332222222-32122222223222222222222222322222222222222222222222221222222222222111111111111111122111111111111111-1--1-1111313333333664433144411111111112222122222222211121221111111111-111111--------1-1-------------------------11111111112111 221111--521-11122222221222211111111111111-11113111222221211111111-21-111112-111111-1111111312112111111111--25156555562333334554434241568242253341232334227433444652545334722453122101121231232311231114
 arrel domain                   *** ************        ***** **                      ***********    ******     ******** ***************************************************          ***   ***** ***    *********              *****************   ***************************************** ********************************************** ********************                                                                       **  ******* *  ***    *   **    ** ********** *  * ********************************** *********** *******************************************                *            ***** *********************************  **************  *** ***************** *  ********* ******* *******       ** **             * ****** ************************** ******* ******************** ************************************************************************************************** *  * **************************************************************** ******        * *                         ************** ******  *** ***************************** *********************** ** ****** ****** **********************  ********************************************************************************************
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[1213] b.45.1.2          2214                                                                                                            1 22                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1111     1                                                                                              1 1 1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                3                   
 NADH:FMN oxidoreductase-like   111121121111112122323222-----2-1-32-----11134-12-1533-111-112-1-3--- 1-2-8--12241--46444-44115444444364541831-7392311-321764215--65317135672-------1-1641-1234423-411---1122121121------------------1------134433---133664665223333333335226653333333333333312452134-1111111121111111333312111113111122222131-22222212222222232111111111--------11-----1111---------111111111111-------------1--121---112-16333445424322331222614--212--22421-1122---1121111511-111113396712-4236211221222224-44144131542-10006657708857221236534433332333333222113321111111111--1111111111111-----1531-52114678977822228885443323044436311223324114155741412211211111111----5413----11-23112-112321111--1-12311-----------1---------111----13-121232-3111-211111111-1-1------1------2332-312222222323-132322232222333233456522211111111111112111141112223--211111111111----------1--11224222--31-----11155545261123123327665447452554---------11--------2-2-14412122111-------2111111--------2---------------------------13-1122222--22 ------1-----11344335342575533222211111211113444335346321233222222111-21-212-----12223321147242543223323111-13-5---31-1---1-1---21402--26-3111--1--1---------2-1--1-21--1-29--2--34462224431123-5523325-
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[1214] b.45.1.3           725                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[1215] b.45.1.4           147                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 YkvR-like                      -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1-------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------
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[1219] b.46.1.1          1551                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                  13                                                                    
 Post formyltransferase domain  ---------------------------------------------1-1-------------------- 1121111111121221111-11111211111111111322111211111111211111111211222222111111111111121111211111111--121312112211111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111112111111112122222324223222322222222224321111111122111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112211111111121212111111111111311111111111111111111111112121111111122222222221-22322314121111131132113311111112111112211111111111112211111111111111111111111111111111111112311322223222222222122222222223323222231111212111131111411111111111113221112111111111222221222111114111211111112411111111121122112212132111221111111112111111311-1121111111111222222222222222-222222222222222222222222352212222222222222122222222222222222222221121111111221111121111111111111111111111211112222133211111112211111111111111111111111111111111111111111122112211111111211----1-111-111---11111111111111111111211 11--1---1----11-1------1-1-11--1--------------11--22-211-------11---111111-111-111111-1111-111111111-1111---111333331443333352183683-957323152453334324225323132222322-6322113312217211123111-111121112
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[1220] b.46.1.2           512                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 3-methyladenine DNA glycosyla  11--------------1-----------------------------1-----------------1-11 111111-111111111111-11111111111111111111111111--1111111111--1111111111--------1--11-------------1-------11-11-------1111111-11111111-11--------11---1---1111111111--11---11311-1141111111-------11111111111211121-11-1111----111111111--11111111111111111111111111111111111111----------------11------------------------1-----------1111111111111-1111111-1--------11111--11-------11-11--1------111111111111------------1131111211--111111111111--------1111---------------1------11111--1111111111111111111------21111-1111------1-11------1-11111----------------2----------------11---1--------------111------111111----------------------------------------------------------1---1-------------------------------------------------------1--------------------------------------2-111111111--------------------111111--1--11111111111111-111-11-1-111---------------2-1111121---------------11111111--------------------------------------11-1 11------1----1----------1--------------------------1-1---------------------------------------------1--1---2---311111-1112-1124111623-214-1--3-111-11-11--21111-221-2-1------222----------1112-21-12121-
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[1222] b.47.1.2          8771                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1111111     1 21 1 371 112    1  1      1  1    1      212342                            
 Eukaryotic proteases                                                                                                                                                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3 7242385977793809779214 72068877896949876274988787689545237403  82        1         21122 
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[1224] b.47.1.4          2135                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1              2                                                4        1          
 Viral cysteine protease of tr  --1------------111---11-111111-1--1-----------1-----11----------1-13 2462511111111134433-333343333334344432432434321122212321-1114421325345211111111111412222221113221--1212132131-------1--1111-111-1-1213-333334343331473332233222231243445343212-23312222211122-413222222222222222113333223122-2121--1--45211111111111111111-1111111111111111111111221111111111211----------11111111111111-1111111112113111111111113133211121211211212232212-3222221-1215233632222446465325555333333333333-5535543436415333663644333323232233331233333333323333643111111111111111111111111111111212222222234454434333444544444455444222233343342344342314232223111111121236312112122231222125244223244247625112-11-----1111111111111-11112112222-21121111223221212323--13233------11111111111111211-1111111111111111111111111111111111111111111111111121-111111111111--11-----222232312111212211111221222221221221111111-2221222222---------1111-111111-11133222222221111--221122221111111-232-------------------------1111-1-1112311 1---121--1--112123211211112111112122222222222221211122112131111-2--------1---------1-11--11121-3------11-1--91546544244-335354154945-228122245533-3313222626466312241434222321-254452335277405754454235
 ypsin fold                       *            ***   ** ****** *  *           *     **          * ** ******************* ************************************ ****************************************  **********       *  **** *** * **** *************************************** ************** ****************************** ****  *  ******************** *************************************          ************** ************************************************* ******* ************************************* **************************************************************************************************************************************************************************************************** **     ************* *********** ********************  *****      ***************** **************************************************** ************  **     ****************************************** **********         **** ****** *****************  *************** ***                         **** * ******* *   ***  *  *************************************************** *        *         * **  ***** *      ** *  *********** ************ ************ **************************** ************************
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[1225] b.48.1.1            46                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 mu transposase, C-terminal do  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------4-----1----------------------------------2---------1-------2------------------1-----------------------------------------1----------------------1------------2----------------1--------------1----------22---------1------1-------------------------------------1--------------1-----------1---------------------1-----1-----------1-------------------------------112--------------1--------------------------1----1----------------1----------------------------2--2------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 main                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                       *                                                                                       *                                                           *     *                                  *         *       *                  *                                         *                      *            *                *              *          **         *      *                                     *              *           *                     *     *           *                               ***              *                          *    *                *                            *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                       
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[1226] b.49.1.1          3884                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                               11         1             13                        1     1     1  1        4       11 1        
 N-terminal domain of alpha an  22121222222222222222222222222222222222222222222622442222222222222122 3333222222222222122-2222222222222222222232222222322222222222222232222222222222222223362344442422222222222223244444444444444543222224224222222222344224422222222222422222222222222222222222244233333333333333333333333333333333335555553322222222222222222222422222222222222222222222222222222422422444242424443444444444422222222233333555555555535335444755543553333333353333333544335344322222524343333333322222222222-3333333343323222334222222233343252553332222222222252453222222222222222222222222222222223333444354446547575445588883734843332233433333342543335433363222222235523333523553335444433333357766463252322222222222222222222233222352333335353534355433343344443222432333133343344343443333233-443343333343523322322244444555555555555555532334334635666665665652242222223555428352222222222222222222222222534434333353333345422222222233336333337553333444444452222223522333333333333346----2-242323222253225333332333533534322 4434334-46523444426444444444444344442444343444334444434442444443444423444444435443443344445443474444442920246396967055344665954851661666543591667552345436314464525645414535834645453333398234064453344
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 Eukaryotic ODC-like            --1-1------------1-----11--111111111111111222111222221-1-1---111211- 1121421333321122222-21111222222111114211122211112111111112--321132355311111111112212221144453323-112212232312---------------2111111122122222111312132222222222322224323332222233322222543111111111111111121111111211111111112111111111211222222222222221111111-11111-1-221111-11111111-------11132222222222-------------111111111212-12111111121262112111211--1331122121211111121--2225322233333222243222223233333333333-3323333233323444224222332343222433331252222222222221353---11111---------------------2444431222112223214443113144452222212221111311211112211212211133333333335432335621134321555144434333322224312332333333333333333334344433443333534553333353233333324332-1-443311111133553333334334333-3333334334333333334333444444444444444444444333333334-33334333334311241111133334343611111111111111411131123425344546646566655566223223222232223333344444334444444433331131111111--------1-1-------------------------22322222222332 12--334-4111111121-13324152111111112222222211131122214-1112111111111121111111-1111111111122121111121121112-37574827402546344184545151638443383523444656447185607982722125724443244362223466491554266853
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 Retroviral protease (retropep                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                        2   5       1                2    1       4         4 1         1             1     6        11 3 
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 Pepsin-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11      1   00 22211   111       11           211222221122112131 1    1 1112  11111121   5822132 1  111233  1 111 1 21 1121121 21492 2 2 11121172  11 2  311111        1   32 1    2    14911174  1111 
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 LPG0085-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11                                         7 1   1   1 2   5                        1                             1 2  31          2       3        4765 
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