[GTOP] [HELP] [ORGANISMS] [SEARCH] [SUMMARY]

Ranking of SCOP_FAMILY : from 2801 to 2900

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 0002000001200001001230016001234000120000000100000010000000010000000000000120010100000C0101000001001000000000000123450000123020000100000011000100010123400101123456700010000123456789AB1000100001001234012345678900010001020100000012300000123456789ABCD001000000010000001010100000001201210120010123456789A0123456789ABC00101201200000001234567890001001200000000000100000001010000000000101000000001000012340100120001000000100000000010010012000000500001230010123456700100000020000120001000100000001001000000000000000123000123010101234000000100001000000000010000101100010123400001000000000200012200100000001010010000010123400001234562000001000000000000012300001230000000000000001234000000000123456789ABCDEFGHIJKLMNOPQRS0012010000123456789A0123400100120000012345678010000012340123000000120000012300100123450000000234001200123001200123456701011012340000101001230120123000001010100100000000010001001010001200000000100000100000000 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2801] d.65.1.3           229                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MepA-like                      -------------------------------------------------1------------------ ----------------------------------------1--------------------------111----------------------------------1--------------------------------------2-------1----------------1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111-1111121111--11111111111111---1111111111------------11----------------------------------------------------------------1---------------------1---------------------1---------------------------25-1---------------------------111--1------------2------11--2-------------11111111111111111-111111111111111111111111---111111111111111111111111--111111111111---1---------2----111121111111111-------------------1---1------------------1-----11111-------------------------------------------------------------------------- ---------------------------1------11----------1------------1------------------------------1--------------1---12--1---------------492---1---------------------------1-------2---------------2-----------
                                                                                 *                                                           *                          ***                                  *                                      *       *                *  *                                                                                                                                                                                                                    ************************ **********  **************   **********            **                                                                *                     *                     *                           ** *                           ***  *            *      **  *             ***************** ************************   ************************  ************   *         *    ***************                   *   *                  *     *****                                                                                                      *      **          *            *                              *              *   **  *               ***   *                           *       *               *           
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2802] d.65.1.4           634                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 VanX-like                      -------------------------------------------------------------------- -1111---------21111-11--121111113111-------13--3----111112---------131-----------31-----1111--11---111121-1-1------------------11---11-----1---1-5222222112222222223243333222221221222-------1--13333342423234521-11113351122122----11522--------------11-112-1--------22-----1-2121111111111111-----------11111111111112111111111-1211222222211123------1-1--11--111--1-------1------11111-----111------1111------------11-11-1--1--------------111--1----------------------111------------1---121---22----------------122121-111111111111-1212---------------1---211-1---2-----1-1------1---1--2-1211121-1---2----1-2--1---1--------1------------111111-1111111111111111111111111-------------1-111-1111-1---11-11111--1111-111111----111121111111111111111211---111-111111111111---1-----22221--11111111112111111----------11111--1-----------1-1111-1--1111111111111122222222221111--1-2211111111111--1--------------------------------------1- ----11--------------------------------------------------1---1-------------------1-------------11-------------1-111----------------------------1-1-------------1-1-----------------1------2--------1----
                                                                                                      ****         ***** **  ************       **  *    ******         ***           **     ****  **   ****** * *                  **   **     *   * *************************************       *  ***************** **************    *****              ** *** *        **     * ****************           *********************** ****************      * *  **  ***  *       *      *****     ***      ****            ** ** *  *              ***  *                      ***            *   ***   **                ****** ************ ****               *   *** *   *     * *      *   *  * ******* *   *    * *  *   *        *            ****** *************************             * *** **** *   ** *****  **** ******    ************************   *** ************   *     *****  *****************          *****  *           * **** *  ****************************  * *************  *                                      *      **                                                  *   *                   *             **             * ***                            * *             * *                 *      *        *    
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2803] d.65.1.5           293                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 VanY-like                      -----------------------11------------------------------------------- ----1----------------1----------222212------11--2--------2----2-1-1--------------1------------------1---1-1-1---------------------1-11-11111---------------------1------2----------------------11-----1------11-1---11---11--1321--11--1-------------------------------------------------------------------------------------------1-1111111111113111----2-----12-----1-1----------12------------111332---------------------------1--1112-1-------1---1-1-----------------------------------------------------------11--11111112222111-22222211-1-------1-----------111----4------------11--2-----11----1----2--------421-1211--------1--------1--1---------------------------------------------------1-----1--1-----3-1---1--1------1----1-1-------1111-----211-------211131111144--2------------1------1--1--1----1111121------------1----------1----1-1-3212-------1--1------111-------1--------------11--------------------------2-----------1- ----1------------------------------2-------------1-----1--------------------------------------------------1---2---------1-------1--------------------------2---233--2---1-2---------------11-----------
                                                       **                                                *                *          ******      **  *        *    * * *              *                  *   * * *                     * ** *****                     *      *                      **     *      ** *   **   **  ****  **  *                                                                                           * ****************    *     **     * *          **            ******                           *  **** *       *   * *                                                           **  ************** ******** *       *           ***    *            **  *     **    *    *        *** ****        *        *  *                                                   *     *  *     * *   *  *      *    * *       ****     ***       ************  *            *      *  *  *    *******            *          *    * * ****       *  *      ***       *              **                          *           *      *                              *             *     *                                                  *   *         *       *                          *   ***  *   * *               **           
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2804] d.66.1.2          1771                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                3                   
 Ribosomal protein S4           11111111111111111111111112211112111111111111111111111111111111111111 1111111222211121111-1111111111111111111211121121122121121211222121111111111222122221222111111111111111111111111111111111111211111111112122211122222111122222222221222122212221221231221111111221111111111111111111221211111111111111111111111111111111111112121211212121111111121111111111111111111111111111111111111111111111111113331222222212111222222111113111111121111111111111211211111111213322222233111111111111122122122111111121111212111212111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211222111112212111111222111111221212222223221111222212211111212122212331121222221212112311111133111111111111111121111121112221111211121224444121111212322211-1111211111111111111111111111-11111111111111111111111111111112212222121111111111111111111111111111111111111111212111222122122111111111111112111121111111211111111111111211233333224321111111222111111111112112221111111211112-121121122212212111121112111111111 221122119432222112212222221111222222222222222221223333222222122233331341233242223222113332521224222222233523224244-5322-323458161272-422-31132131-33-31212-11232122213153251131232272222275792452222212
                                ******************************************************************** ******************* **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************* ****************************************************************************************************************** **** ************ *** ******** ** ***** ********************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2805] d.66.1.3          2304                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Heat shock protein 15 kD       --------------------------------------1---1------1------------------ 32311312222313111----2--11-----122221-1--112122211-2212222--1-1-111---1-111---1111111111111212-111-1112111111-2222221-1111111111111111-31111111112222221111122222222111111121-11121-11222-1--143314445344444444433443444344433334334345434443443444443444444125455443335455445514434445554444644555555555554565544453444544555555434433333344444333554544224321343222252-2-3244331-431222222112122-221222111122222223222-2232222221222111214112231-22222112122222222222222222222--12211121--2222222222222212212112233323333334333333444333333343232233333343343433222334544313343233332343211-2122232111222232113343547323-112111111111111121112122223332323332342222332222321223222-3333222122232323322222222222-22222222222222222222222233233333333333333232222222231222222222222112322222222233333333333222222113555455432322111131323133312223333333333234333333233333323333322222222222211222223222432211111-2111112---1-1212112-124321211-11- 11--111-3---11111211111111111111--1-1111111111111111111111111121121111331112322311112111112111111111--132-117221-1----11111111-11131-111111-1-11-111-111-1----1---12111411--111321182112123241512252112
                                                                      *   *      *                   *****************    *  **     ****** *  ********* *******  * * ***   * ***   **************** *** ********** ******* **************** ************************************** ***** ***** *  *************************************************************************************************************************************************************************** * ******* *************** ********************* ************************* *****************************  ********  ************************************************************************************************* **************************** ********************************************************* **************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** *******   * ******* ********* **  **  *** *   ********************  * ****************************************************************  *** ****** *    ******** ***** ****** * ** *** *** *    *   ********  ***************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2806] d.66.1.4          2544                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                  1  2  1         1                                   3     1  1          
 Tyrosyl-tRNA synthetase (TyrR  1111111111211111111111121---1--1111111----112-1111-1-21111111-1111-- 112-223222334321122-232224222222333344322231422131322332311122243223323211111111-2321112332213131112222221123111111111112222111121111112222211-2132323322222222223221322231224112214212222233133344444433355433243333344433242333333333322222222222221232232424122121214433213343324663333233233132223222223233332223333333333333433365444445454554555333433242332222322434333322142122111123213233222211322433333332333-33133232443-444244365422342221143232-12111111111111143311111111-1111112111111111---113343121111222222222223222232223224443312222233231-2231431322223222131111-111312111225114422434343333222222221122111111213111111121121223321-431-431-11121332222--42121-1111-11111112121122222221222-22222222222222222222223311311111111111111212221222211222222222222121211111111111111111---1-----221-------12121222313121-2122333111111111122211111133-232232222233111111334422221112122-11111112--122111---22112122222121233232213 1211122-532-113342243322323443323322331423323323222222222222212221211212222331321333334442424222212224334511324233433221313258201886-258211223292322-13225232243522325332171224224363553307801564252232
 S), C-terminal domain          *************************   *  *******    *** **** * ******** ****   *** *************** ************************************************************ ************************************************************* ************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************* *********** ************************ ************************** ****************   *************************************************** ********************** ****************************************************************** *** *** ***********  ***** **** *********************** **************************************************************************************   *     ***       ************** **************************** ********************************* ********  ******   *********************** ******* *** ************************************************************************************************************************ *************** **************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2807] d.66.1.5          1995                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Pseudouridine synthase RsuA N  ------------------------------------------------1-1-1--------------- 122-212211111111111-11221111111111111222222-111121-111111---1112111222112222121111-21223111112121--1212122212-------1-1111111111-111111-11111111111222222222222222222222212222222222222224334-33315555565455565633333355533353443333334443333332333333322222142333323442222333322123223333344233323332333334323344434444333333333433325444432343512112355433444322133231112222233233211333311111121111112111111111111111-112112221311222222-22222213411111111211111111111111111111---111----1111111111111-----111112222212211122222112122222211122222211232222223223334222244223323322222311112221111111111111211122122-11544332222223322332233343222332243413433544466434434153344--1111111111132222333333333333-3333333333333333333333222233333333333333333533323332-322232222333--21111111111-2124222212222222112111111133222332322222112122221111111112433533333334335555555343222211111111111111111-1-311111-11211--111121-2211-42-12221122222 11--32--211-----------------------------------------------1----------1----1---------------------------------431-----12-111113-11---------1111-1-1-12--1-11111-211113---212-111123356544221223-22344122-
 -terminal domain                                                               * * *                *** *************** *********************** ****** ******   ********************** **************  **********       * ********** ****** ***************************************************** ************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ****************** **************************************   ***    *************     ********************************************************************************************************* ***********************************************************  **************************** **************************************************** ************  *********** ******************************************************************************************************* * ****** *****  ****** **** ** *********** **  **  ***                                               *          *    *                                 ***     ** ****** **         **** * * **  * ***** ******   *** ****************** ******** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2808] d.66.1.6           230                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 YbcJ-like                      -------------------------------------------------------------------- -1-------------------------------------1-------1---------------------1------------------------1------1--------1111111-1---------------------------1-1--------------------------------------------------12---1-111-----111----1--------1------------------1----1111111-1----12----1--------1-----11111111111--------------------------------------------------------------1-----1--21---111---1---------1---------------1----------------1-1------------1------1---------11111-----1-----11--11--111111111-------------------1--1111----1-111------------------------1-----------1111-----1------------1----------------1---------------1-------------------1---------------------12-1-------1---11--1111111111-1--1111111111111111111111--11-111111111111111111121111--1111111111111--------------------------------------1------------------------------------------------------------------11------------1----------------2-----11--------------- --11--------11-----------------------------1--11-------------1-------1-----------------11-----111111---1----1----------1----------1-----1-1--1------1-------1---------1--------2-----1-----111-----11-1
                                                                                                      *                                     *       *                     *                        *      *        ******* *                           * *                                                  **   * ***     ***    *        *                  *    ******* *    **    *        *     ***********                                                              *     *  **   ***   *         *               *                * *            *      *         *****     *     **  **  *********                   *  ****    * ***                        *           ****     *            *                *               *                   *                     ** *       *   **  ********** *  **********************  ** ************************  *************                                      *                                                                  **            *                *     **                  **        **                             *  **             *       *                 **     ******   *    *          *          *     * *  *      *       *         *        *     *     ***     ** *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2809] d.67.1.1          2188                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1   1           11 1 24    1                 1       1                 1                   
 Threonyl-tRNA synthetase (Thr  11-1111222222222-111-11-11111-111-111------112111----11-111211121112 1221212111122121111-11111111111111112111232211211111221112222221222222211111112112121111221212331--111211111111111111111111221212111112122111111123121131122212121121342221221112211211123233112233333233333333332443233322121112222222222222222222222232232111111121111111211212222211112111222222222222221111111111111122222222224435333333343443223444433121223211341222322232321221111211221211111111111111111211112-11111111121222222222222211211112222221211111111111122112112222222111111112111112222212112111111111111111111111111111111111111111111111111111121111221111111121111212221121212221222112222223221112111111111222222222222122112211112211111111111111111111112-1212222211132222222221222222-22222222222222222222221212122222222222222221222222222222222222222111122222111111111111221222221122111112111121111112111111112121111111112322222222221111112222222222211112211111111111122221111-111111111111111111133223343331212 1111322-622332411111111111111322211111111111112111122222121111122121211121211-2112221111114112312222111121140586565666255666106250371864566695686366758471866542602214242551433223362223262242362343323
 RS), second 'additional' doma  ** ************* *** ** ***** *** ***      ******    ** ************ ******************* *****************************************************************************  ********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************* *********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************* ******* ********************************************************************* *************************************************************************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2810] d.67.1.2          1259                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 AlaX-like                      112-1231222222223111211121112231-1---111111-----12222-34332233324--- 211131-1111--3-1111-1111111111111111-111----11-11211--111------1-------1-11111-11-2-1111213212--1--111-111123111111111111111-1-1-11111-2111111122111-11-11---1-1-11---11--1--111--11-1221-11121--222222222222221-1---1221--12122------11--------------------1111111-1111111-11-1-----1111-111--------------11111111111111---------1--1------------111----1--21212--22-11121--11111111-1111-11--1111221111211122222122221-11111111111-1111111-111111-1122-1111-11111111111111--22-11-------1111-111111111-----1-11--111122222222233322223333213232222112221122221112211211112-11111111-11-1-11--12-1-22211---11----2212-211-111111111------------1--11--1111-11111111111111111111111--1-1-----111111-11--------------------------------211-211----------------2---------1-------------11-----232211312111--1-----11--11111-1111-121111223122211111211111111-2--11111112222111-----------1111--11111111111111111111-1111111111111111111112212-111111- 2222231-411112122221222323211111132211-11111113232423322212222311111-22-121221122111221112322111111221132312512333242241-111131-2792-344111121-1121-11-3122642123434434433122-4233253431343844333222333
                                *** **************************** *   ******     ***** ***********    ****** ****  * **** **************** ***    ** *****  ***      *       * ***** ** * **********  *  *** ********************* * * ***** ************* ** **   * * **   **  *  ***  ** **** *****  *************** *   ****  *****      **                    ******* ******* ** *     **** ***              **************         *  *            ***    *  *****  ** *****  ******** **** **  ************************* *********** ******* ****** **** **** **************  ** **       **** *********     * **  ********************************************************* ******** ** * **  ** * *****   **    **** *** *********            *  **  **** ***********************  * *     ****** **                                *** ***                *         *             **     ************  *     **  ***** **** *************************** *  **************           ****  ******************** ************************* ******  ******* ****************************** ***************************** ** ************************************************ ****** **** ********* **** ** ********************** *************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 0002000001200001001230016001234000120000000100000010000000010000000000000120010100000C0101000001001000000000000123450000123020000100000011000100010123400101123456700010000123456789AB1000100001001234012345678900010001020100000012300000123456789ABCD001000000010000001010100000001201210120010123456789A0123456789ABC00101201200000001234567890001001200000000000100000001010000000000101000000001000012340100120001000000100000000010010012000000500001230010123456700100000020000120001000100000001001000000000000000123000123010101234000000100001000000000010000101100010123400001000000000200012200100000001010010000010123400001234562000001000000000000012300001230000000000000001234000000000123456789ABCDEFGHIJKLMNOPQRS0012010000123456789A0123400100120000012345678010000012340123000000120000012300100123450000000234001200123001200123456701011012340000101001230120123000001010100100000000010001001010001200000000100000100000000 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2811] d.67.2.1          1310                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                1                   
 Arginyl-tRNA synthetase (ArgR  11-11111111111111------11---11-11111111111111111111111111111111-1-11 111121111111111-111-11111111111111111111111111111111212111111111111222111111111111111111111111111--111112111111111111111111111111111111111111113111111111111111111111111111111111111111111111111122222122222222222111122211121111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11112111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111-111111-111111-1111111111111111111 11-11-1-3111112-1221111111122221122211111112111111222211121111111111212111122-221111111111211112--1111-223--3-3241115122212222-32512-42312223-232221212222222221321211-11111222111182211111113251221215
 S), N-terminal 'additional' d  ** **************      **   ** ******************************** * ** *************** *** *****************************************************************************  *************************************************************************************************************************************************************************************** ***************************************************************************************************************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ******* ******************** **************************************************** ************************************************ ***************************************************************************************** ****** ****** ******************* ** ** * ******* ************************************************************* ******************  **** ***  * **************** ***** ******** ************************ ********************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2812] d.67.3.1          1334                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                1                   
 Ribosome recycling factor, RR  -------------------------------------------------------------------- 2121111111111111111-11111111111111111111111121111111211111111221111211112221111111111111221111111-1111111111111111111111111111111111111111111111121111112111111111111121111111111111111111121111111111111111111111111111112121111111111111111111111111-1111111-111111111111111111111112211111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111122111111111111111111111111111111111111111-1111112111111111111111111111111111111211111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111112111111111111112111211111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111 22--221-41212122142222222-22233332222222232222123422422323232321111111121111111111111132223112243323133334-1435122111111121122141212-425211112111111221111122-11--12131111-2221222242222123422514223111
 F                                                                                                   ******************* ***************************************************************************** **************************************************************************************************************************************************** ******* ********************************************************************************************************************************************************* **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************* **  *** ***************** ******************************************************************************** ************************* ************************ **  ******** ****************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2813] d.67.4.1           110                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 General secretion pathway pro  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------1111--111--------------------------------------------------------------------------------------------1111111111-1111111111111111111----111--------12---1111111111-1-1111111111111111111111--------------------111------1-------------11-----1111--1----------------------------11111----1------------------11111111111111-------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1
 tein M, EpsM                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           * *                                                                                          ****  ***                                                                                            ********** *******************    ***        **   ********** * **********************                    ***      *             **     ****  *                            *****    *                  **************                                                                                                                                                                                                                              *                                                  *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2814] d.68.1.1          1102                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Translation initiation factor  -------------------------------------------------------------------- 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112211111111111111111112251111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111112211111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111113111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111211111112211111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111-1111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111--1111111111111111111-11-11-111----1--11111-11111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111-1111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111 1----11-1---1111-311111111111111111111111111111111111111111111-----11------------------11111-111-111-11-3--131-1111121-1-1114-11-401-11111111-112-11111-1111211----1-1-1112--2122228242224223132211111-
  IF3, C-terminal domain                                                                             ******************* ************************************************************************************************************************************************************************************************ ********************************* ************************************************************************************************************************************* *********************************************************** ****************************************************************** ********************* **** ****************************************************************************************************************************** ***  ******************* ** ** ***    *  ***** ******************************** ************************** ************************************************************** ***** ******************************************* ********************************* *    ** *   **** *********************************************     **                  ***** *** *** ** *  *** ******* * **** ** *** ******** *** ***** *******    * * ****  ************************* 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2815] d.68.2.1           778                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                1                   
 RNA 3'-terminal phosphate cyc  111121122222221212222221-22--2-1--111211111-2-1-2222221112212---2-12 -2---------------------------------------------------------------------------------2------------1--1-----------------------------------------------1------------------122--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--2-------------------2----------------1---------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------12-----222-1---2---------------1----1-------------222---23-12112122---------------------------------------------------------------1-------------3222322233-2333222323222333332----------2---2-222-2--2-3323333---------------------------2-2--------------------1--------22-2-22-2---------------------------------------------------------------------------------------------------------- 111133314111114123122222132223333223232312321221223233222223231111121111111112111-11111111722434111111-112134353343382212333352844751877242343444444435333233322223423333431361112111112221123172212231
 lase, RPTC                     ************************ **  * *  ********* * * *************   * **  *                                                                                 *            *  *                                               *                  ***                                                                                                                                                                                      *  *                   *                *                                                                     *                                                                         **     *** *   *               *    *             ***   ** ********                                                               *             ********** *******************          *   * *** *  * *******                           * *                    *        ** * ** *                                                                                                           ********************************************************************************* ******************** ************************************************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2816] d.68.2.2          2607                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                2     1             
 Enolpyruvate transferase, EPT  22-1111121112211-111121111112112111112111211111112221311-211-1111-11 2232432233222223323-2233222222222222222243332233222233332322442242234422222222222222222222222222111222222422322222222222222222222222222222221112232223222322222322222222322232222222232222222123333333333343333344333344433353333333334533333333333333333333412111131113322112222223333333333333333333333333333333333333353443233344533233333343332333333336224234333453423344454122221222222223222342222222222222222224-2222222223225222222332222222222223322222222222222222222221111111111111111111111111112222223443233333344555332255564334223232232322233322342222232232222222222222222222333423333222322222232222422222222222222223232222222222222232232222222232322232222322312223222122232222222333223233-221322222222222222222222353232222222222222223223323212222222222222222222223233222342222232222222222222222222222333234323224243322222222223333333333334322222222222222222233332211111111311------------------1-2----11211213222222 23----2-2--22212232-52342522232122311111111112-11222332115211212-122-222222131122-1222131241251241211312131134632331221111217133-855-3192--231121112114211115132--172224--42142131271211205341422122112
                                ** ************* *************************************** *** **** ** ******************* **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ******************************************************************************************************************************************************************************************                  * *    ************** **    * *  ******** ************************** ***************** *** ************ ********************************************** *** ****  *********************  ******  *****************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2817] d.68.3.3          1487         1  11 11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
 SirA-like                      1--1--1790090089156561245425-363--12242232112-1--11112-1----1-222-11 ---31--1111111-------1----------------1-41-1--324------11---1162-1-2211-------141521543423211122------21--2------------------11112111-122211---3211121112111111111111-1112111111111111-----11-132333333331343334--22223334452231------21133222322233322223111-----------------------------1-1------------------------------111---1253133333333432122212222-111312-13322421256223221--4-11-1-----111115154222433333332333-11111111511-14413132114311-1-11111111112222222222212522-----------------------------------1111111121111222111133332212121231123231122133211212512111-111111221122-2321111221112-2222333315445211221122222232-2-------122-233221222111142233322333322332223---332411111132112213332322-33-3333323333332233223222111132222222222222222233333332-233333333333--1211111----13223333232122222111222122222222333322222222232231--------222213333322232-1------------2252--------------2--------------------------------2223212-- -----------------1--1------------111--1---1-------11-1------11------------1--------------1---------1----------1---1-----1---1----241-4-3111-1---11--------1---2----2------2--1---1-1----1-1-1--1-------
                                *  *  ********************** ***  *********** *  ***** *    * *** **    **  *******       *                * ** *  ***      **   **** * ****       ******************      **  *                  ******** ******   ********************** ****************     ** ******************  **************      ***********************                             * *                              ***   ************************* ****** *****************  * ** *     ************************ *********** ************** * **************************                                   ********************************************************** ************ ************* **************************** *       *** *********************************   ************************ ** **************************************************** ************  *******    **************************************************        *************** *            ****              *                                *******                    *  *            ***  *   *       ** *      **            *              *         *          *   *     *   *    *** * **** *   **        *   *    *      *  *   * *    * * *  *       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2818] d.68.4.1           712                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     2213 31       
 YhbY-like                      111-11-1111111111------1111111111111111111111-11-111111111111----1-- -----------------------------------------------------------------------1111111-----------------------------1---------------------------111-----1-----------------------1-----------------------11111111111111111111111111111111111111111-11131111111121111111-1-11-1---11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111--54----1------1-111-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111112111-1111----------1111111111111111--------------------------11111111111111222221121221211211--11111------11111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---1-----11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--------11--------------------------------------------1-- ------------------2-----------------------------------------1-------------11--------------------------------3------------1-1-----------------------1-----11--------1----1-------22-----2-03601242----1-
                                *** ** **********      ********************** ** ************    *                                                                          *******                             *                           ***     *                       *                       ***************************************** ******************** * ** *   *********************************************************************************** ******  **    *      * *** *                                                                                                                            ***************************************************** ***************** ****          ****************                          ********************************  *****      ************** ** **************************************************** ************   *     ** *******************************************************************************************        **                                            *                     *                                         *             **                                *            * *                       *     **        *    *       **     * ********    * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2819] d.68.5.1           491                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 C-terminal domain of ProRS     11111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 --1-1-----------------11--------------1--1-1-----------------------1--------------1-----111111111111111111111--------------11111111111111111----1-------------------------------------1111111-1--111-11111111111----1-111---11--------11--------------------------------------------------------------------------------------------1--1111111-1-11111---1----111---------1---------1-1--------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------11-1------------------------------------------------------------------------1111--------------------11-111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------11111111--111111-1111111111111111111----------1-11 111111--521111-11111111212211111111111111111111111112111111111111111111111111-111111111111211111111121111111322211112-11111112112181-1122111111121111111121111-126211112-14121-222282213222441422222112
                                ***** **************************************************************   * *                 **              *  * *                       *              *     *********************              *****************    *                                     ******* *  *** ***********    * ***   **        **                                                                                            *  ******* * *****   *    ***         *         * *                                                                                      *                                ** *                                                                        ****                    ** ***                                                                                                                                                                                                             *                                                           ********  ****** *******************          * ** ******  ****** ************************************************************** *************************************** ************** ************************* ********* ***** ************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2820] d.68.6.1           369                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA-binding protein AlbA       222222222222222222111112--------11111111111111111----211111111111123 -------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------ 3211221-724---1-1---1111111211111-11-111111111-111111111-1--1-111111--1-121111111---11-1----1--1-1---1-12--2-14445322212313343-43564-333221242233-12--33-3-2122---2211-3222-2221122411-243577-231-2222-
                                ************************        *****************    ***************        *                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                      *                                                                                                                                                                                     *                                                                               ******* ***   * *   ************* ** ********* ********* *  * ******  * *********   ** *    *  * *   * **  * ***************** ***** ************ **  ** * ****   **** **** ********** ****** *** **** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2821] d.68.6.2           107                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     2                                                                                                1         12 
 Hypothetical protein At2g3416  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------- ------1--------------------11------------------------------------------------------------2-----3-----12------1--------------------------------------------------------3---------1--------4044-62---135-
 0                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         *                                *                                                                                  *                    **                                                            *     *     **      *                                                        *         *        **** **   *** 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2822] d.68.7.1          2465                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 R3H domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1 1111212111112167131682 225111131121 111121131111111  111 1  1  1     3     1 11 1        
                                --------------12----------------------------1----------------------- 11111-------1-11112-1111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111----------1-----------1--1--------------------------22222222223333333333322222-333333331211111211111111122111122222111111111111111111111111--111111111-------------------1-1-11-1---11111111----1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------111111111111111-----------1--112-----------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------111111111111111111-------------------------1111111111---- 3211432194611165456666665645577676754666656555566566567766677744544434443425545543344345558445655554345878185496765753342480383871594364268305432854105117687422165006727636536147414647418016743238556
                                              **                            *                        *****       * ***** **************** **********************************************          *           *  *                          ************************** ************************************************************  *********                   * * ** *   ********    *************************************************************************************************  *                                                                                                              *                                                                                    ***************           *  ***           *                                                *                                                                                                                                                                              *                    ******************                         **********     *******************************************************************************************************************************************************************************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2823] d.68.8.1          1396                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                              1 11 1        
 Smr domain                     -------------------------------------------------------------------- 112-1-------------------------------------------------------------1----------------111112222-2222----11--3221---------------11111111111111112211111111111111111111111111111111111111111111111-11111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111121211111112121-1111111-1111111111112111111111111-11111111111-111111111111111111111111111--------111111111111111111---------------11111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111-111111111111111111111112111222222222122223222233333312111111111111111111111111122221211122112322213222222222221--1121111111122222222222222122-2222222222222222222222--111222222222222222222221122--111111111111--111111122221112111111111111111111111111111111111111111111111---------11222222222222211111111111111-1-2111111111111-1211------11--2-----1---1----1111111111-1-- ----442-52213323332333333333333333324333333333333343333333322242222222322222222222222222233634343333233334-28421-211111111-121111271111111111111111-11111-1111-----1---211--611353122228608703053832353
                                                                                                     *** *                                                             *                ********* ****    **  ****               ***************************************************************** ******** ******************************************************************************************************************************************************************************* ******* ************************* *********** ***************************        ******************               ******************************************** ************* ***************************************************************************************************************  **************************** **********************  ***************************  ************  ************************************************************         ***************************** * ************* ****      **  *     *   *    ********** *       *** ************************************************************************************************** ***** ********* ************************ ***** ****     *   ***  ***************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2824] d.70.1.1            25                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Virally encoded KP4 toxin      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------1--1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------- -----------------1-------------------111--------215312--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
                                                                                                                                                                         *  *                                                                                                                                                                                                                                                                           **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                       *                   ***        ******  *                                                                                                                                *             
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2825] d.70.1.2             7                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 SMK toxin                      -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------33-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                          **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                         
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2826] d.71.1.1           433                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cell division protein MinE to  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------1-11-----------------------------------------------111-1---11111111111111111111-111111111111111111---1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1111111111111--11111-1--1111111111211-1111----------------11111-------111111111111-1121121111--111111111111-------1-------1111111111111-1---------------------------------1--111111111111111111111111111111111--111111111111111111---11111111111-111--1-1-1----------------------111-----------111111111-1---1211111-1-11111111111111111111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------11-111111---------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------ -----1-------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------1----------------------------------------1---------------------------
 pological specificity domain                                                                                                                                                            * **                                               *** *   ******************** ******************   ****                                                                                                                                      ** *************  ***** *  ************* ****                *****       ************ **********  ************       *       ************* *                                 *  *********************************  ******************   *********** ***  * * *                      ***           ********* *   ******* * *********************** **************************** ********************************************************************      ** ******               *******************************************************************                                                                  *                                                                                                 *                          *                                        *                           
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2827] d.72.1.1           234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cyanase C-terminal domain      ---------------1---------------------------------------------------- --------------211----1--11-----11111-----1-----------------------1-----------------1-------------------------------------------------------------1--1--1--1111111121--11--1--1-----1----------1---------------1---------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1--------------------111111-1--11------------11111111----------------11----------------------------------111-------------------------------111111111111--2-111111112--11-1111-1-----1111---11--1-------------1--------------------------------------------------------------1-1--1-1-----------------------1---------------111-1---11-11111--1111-111-11------11-----------------1--------------------------------------1---------------------1----11111111----111111---------1------------------------------------------------------------------------------------1--- ---------------1111111111111111111111121-1111111--1114111-1111---------------------------1111111111-11-111--2----------------------------------------------------------------------7---12111211111----3
                                               *                                                                   ***    *  **     *****     *                       *                 *                                                             *  *  *  **********  **  *  *     *          *               *         *                                                                                                                                     *             *                    ****** *  **            ********                **                                  ***                               ************  * *********  ** **** *     ****   **  *             *                                                              * *  * *                       *               *** *   ** *****  **** *** **      **                 *                                      *                     *    ********    ******         *                                                                                    *                   ************************* *******  ******* ****                           ********** ** ***  *                                                                      *   ***********    *
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2828] d.73.1.1           300                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               4     2             
 RuBisCO, small subunit         -------------------------------------------------------------------- ---1--------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------8556555654411121155555566111111111111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------112332-11211----------------------------------11-1-----11211-----------1-----2-------------------------------------------------------1--------11-21------2-------1----1------------111------------------------------------------------------------22---------------------------------1111------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------2------------------------------------------------------------------------------------11-- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12533323219688-52-------
                                                                                                        *                                                                                *                                                            *************************************                                                                                                                                                                                                           ****** *****                                  ** *     *****           *     *                                                       *        ** **      *       *    *            ***                                                            **                                 ****                                                                                                      *                                                         *                                                                                    **                                                                                                                                                                                  ************** **       
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2829] d.74.1.1           794                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 PCD-like                       ------1111111111--111---11112111-----------1--1-------------------11 11121--1111---11133-3-1111233231111121211153-212----111-1---2-1-1221121-----------111-1---------------1111111---------------11-1-1-111111121---11122122111112322221112211122222222222211-11---1--1111111111111111-----111111--11------1--------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------1----1-11111-----111222211111111111111111-11111211111-1-1111111111-11111111111111--------111-1111-------------1111-111-11-----11111-111111111111111111121111111122221111112-111112111111211111-------1211111---------------------1-111111---------------------------2221-111111111111111111111111111---1112--------------------------------------------------------------------------------------------1-----111111111----------------------1221111111111111111111---------2---1111111111111111111111111--1-111111----------------------------------------------11-- 1---211-622--111111112121211111112211111-1111111111111111111--111111111111111-11111111-11-111-1-1111---111-1322313212221132221221332-343221223221122312222123221-11411111111131122212221242451222115111
                                      **********  ***   ********           *  *                   ** *****  ****   ***** * ********************** ***    *** *   * * *******           *** *               *******               ** * * *********   ***************************************** **   *  ****************     ******  **      *                                                                                            *                                           *    * *****     ************************ *********** * ********** **************        *** ****             **** *** **     ***** *************************************** ******************       *******                     * ******                           **** ***************************   ****                                                                                            *     *********                      **********************         *   *************************  * ******                                              **   *   *** ***  *************************** *******************  *************** ******** ** *** * ****   *** ************************* *************************** **************************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2830] d.74.2.1           620                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 C-terminal domain of arginine  -------------------------------------------------------------------- 1111111111111111111-11111111111111112111111111111---111111--11121121111111111111111-----1111-1-----------------------111111-11111111111-----------------------------------------------1111111-111111112212112221112211221111111111111111122222222322223232214-212212---22222222232-111333233233333333333333333333333333333322233321111111111111111-11122211111111111111111-1111111--1-1-------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------2211--211111111111111111111111-------------22112211112122211-1111112121111111112111111112222222222222222111111111-111111111111----111111111-----111111111111111-----------------------------1---------11121111111211-----------------------------------------------------------------1-111---- -------------------------------11---------------------------------------------------------------------------1-2----------------------------------------------1-----1-------------2---------------------
  repressor                                                                                          ******************* *****************************   ******  ***********************     **** *                       ****** ***********                                               ******* *************************************************************** ******   *********** *************************************************************** *********************** *******  * *             *                                                                                                    * *                                                                                                      *****                              ****  ************************             ***************** **************************************************** ************    *********     ***************                             *         **************                                                                 * ***                                    **                                                                           * *                                              *     *             *                     
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2831] d.74.3.1          1026                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11                                                1                   
 RNA polymerase alpha subunit   11111111111111111-1-1--11111111211-1111111111--------1111111-2111-11 1----1111111-111111-11111111111111111111-111--1-1------1--111111111---11111------1------1---1-11---1--1--1--------------------1------1----111111--------------------------------------11111---1111111111111111111111111111111111-------11111111-1111111111111-1-11-1---11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11-------------1---111----11--1211111-11111111----1-11111------------1-111----------1--------------------------11--112111111211111111------1-11-11--------1-----------112-1-----222222222222222222222222222222222--22211111---111112121212-------1111211111-1-1-111111-------1-------11-----------------------------1-11------------------------1-12111--------1--------------------------------------------------------------------------------111122222111111111-----1-1111----22222221111111111111111111111111111111-----111111111111111111111111--------------------11----------------------------------11-1 3322112-821222212312322121322222222222222222222222222212222212222222122122222232211122222242222222221322-3224241326251-2322234171293-7263233322221222121222321433232262332-2522112282222234732622212211
 dimerisation domain            ***************** * *  *********** **********        ******* **** ** *    ******* ****** ******************** ***  * *      *  *********   *****      *      *   * **   *  *  *                    *      *    ******                                      *****   **********************************       ******** ************* * ** *   *********************************************************** **             *   ***    **  ******* ********    * *****            * ***          *                          **  ******************      * ** **        *           *** *     *********************************  ********   ************       ********** * * ******       *       **                             * **                        * *****        *                                                                                ******************     * ****    **************************************     ************************                    **                                  ** * ******* ************************************************************************************************ ************* ************* ************************************* ****************************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2832] d.74.3.2          1552                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 RBP11/RpoL                     1111111111111111111111111111111-1121--1--11111-111111111-11111111111 1111611222222112355-532233555552333332121314221122311111111142312234221111111111121-----111111111--1111111111111111111111111-11111111112112211141-11------------------11--------------11111111123333333233333332333333333224331133433321233333333333333222221121221111122112211211111122212222111111121111111111111111112111111111111411111111111111111111131121211222111111111111-1112111122222111212111111122222222222-22223322221222222222222222112111111111111111111111111121111111111111111111111111111112121111112322222222222222222222222222211222131112211111111111212222222111111112111111111111111111111111111111111111111111221211211111-11111111112111111111211111111111-11111------11111111111111111-1111111111111111111111111121111111111111111111111111-11111111111111-1111111111111111111-11111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111121111----1------------------------------1111 23111212622211122-1-1111111221111111122222212221121111222221112-22332-23-1133233311--11112-12121---221121121414442322-1121114234-391-32312124-221111-11122-334322-1412-134-1111122-3--21113431231111212
                                ******************************* ****  *  ***** ********* *********** ******************* ***************************************************************     *********  ************************* ******************** **                  **              ******************************************************************************************************************************************************************************************** ************************************* ************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ******************************** *****      ***************** **************************************************** ************** ******************* ***** ********************************************************************************************    *                              **** ***************** * ******************************************* ***** ** **********  ***** *****   ****************** ********** *** ******** ****** ***** ****** **** *** ******* *  *****************
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2833] d.74.4.1          1496                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 GAD domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               3162  11 2 5513 70  133   13  71  2315  2    1                                        
                                111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111 -11--------------------------------------1------------------12--------------------11----11------1--111111----------------------------1-----------11111111-11111111----1111-111---111--1-111--1----------------------------------1---11---111111111111111-------1--11-----11--1---1--------------------------------------------------1-------------------------1----11------------1---1-------1111-111--1-1--1--------------2-----1-11---1--------1---1----1-1-11--------------1--1-1111211-11-111111111111-11-1---11---11111111111111111112111111111--111-1111111-11--1---1---111111-1----------1-------------1-------1-1------------11-----1----1---111-1-1-1111222211-11121111211-----1-1-1111--111112222312122-2232222222213332332---11111-----------------2221122111--------------1----------11-1-----------1---1111111--2-111-111--1111-----------1---1--------11111-----------------1------111-1-----111--------11-111--1-1-1111-11----1-1--- ----1-------31------------1--------2-------111------1------1-1--1--------1-111111--------------1-------1-----15960571551266541093808171933831371539310324639549----12112311-----1--41----122--11-1--1--
                                ************************************************************  ******  **                                      *                  **                    **    **      *  ******                            *           ******** ********    **** ***   ***  * ***  *                                  *   **   ***************       *  **     **  *   *                                                  *                         *    **            *   *       **** ***  * *  *              *     * **   *        *   *    * * **              *  * ******* ** ************ ** *   **   *****************************  *** ******* **  *   *   ****** *          *             *       * *            **     *    *   *** * * ********** ***********     * * ****  *************** *******************   *****                 **********              *          ** *           *   *******  * *** ***  ****           *   *        *****                 *      *** *     ***        ** ***  * * **** **    * *        *       **            *        *       ***      *      * *  *        * ******              *       *     **************************************************    ********     *  **    ***  ** *  *  
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2834] d.74.4.2            57                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PH0730 C-terminal domain-like  --------------------------------------------------------1----------- ------------------------1--------------------------1---------------------------------------------------------------------------1-------------------1-11--1-----------------------------------------------1--------11-----------1-------------------------------------------------------------1------------------------------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------1-22--------------------------------------------------------------1----------------11----------------------------------------------1---1--------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1--------------------1------- --------------1----1-----------11----1111111------1-12----------------------------------------1-1111------------------1-------------------11---------------------------1--1----------------------2-----
                                                                                        *                                    *                          *                                                                           *                   * **  *                                               *        **           *                                                             *                                    *             *                                                                                                        * **                                                              *                **                                              *   *        *                                                                                                                                                                         *                                                                                                                              *   *                    *                      *    *           **    *******      * **                                        * ****                  *                   **                           *  *                      *     
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[2835] d.74.5.1           678                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PH0987 N-terminal domain-like  ------------------------------------------------------1111111------- --2-1--21111-12-133-31226333333212222465111-2--1-22-311--1-----1-1-11----------11---------------------11-------------------------------111------1---1----------------1----------------11-1----1-111111111111111111111111111111--------1212222222222222222122-------1-------------1-------------------------------------------------1--1-----------111---------1--1-----1--11-111-11----111------1231211122212------------22122222--1-5224222432--221--1121111-1121222222111112-1-----------------------------1-1---221121223312222222222222112321311--112--1--21-223--1---11---11111221-11--1-2------------------------1-1-----11111-----------11------211211-111-----------1----12-----11------1235-121111111111-1111111111111111111121431111111111111111111211111111-1-1-111-1111---1---------21-11-------1111-11-11211-11-112333312243222214431----1---111111111111111--1----------------------------------------------------------------------- ---------------1-1111112111----------------111---21222-11-----211111111121111-11111111---121-----11-------------------------------------------------------1---1----1------------11-----11----1--------1
                                                                                      ****