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Ranking of SCOP_FAMILY : from 3201 to 3300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[3201] d.196.1.1          150                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Outer capsid protein sigma 3   ------------------------1-------------------1----------------------- ------------------------------------------------------------11--------------------------111-------------1---1--------1-------------------------1------------------1------------------------------------------------------------1-------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1------------------------------------1-----------------------------1-11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1----------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------2----------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1------------------------------ -----------1--1-11--11----1------1-1-------1--1---2121----1-1---11--1-11-1-1--------1-----2-111------1--------513211---11-1123-2-34213141111111-2-112121---1--2---1-1-1-1----2-----------11-6--11-1-1--
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[3202] d.197.1.1           10                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Protein-L-isoaspartyl O-methy  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-111---- --------1----------------------------1-1111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ltransferase, C-terminal doma                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 * ***             *                            * ****                                                                                                                                                            
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[3203] d.198.1.1         2006                                                                                                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            12           1                                             1          
 Type III secretory system cha  ------------------------11111121111---1111111111-2111-------------11 1211111111111111111-131112111111111112111112111-1111111111--111111221211---1111112111111222211--2--1111-11112444444444444443112101118-111111111-12234227162211--2112214335---41--2-212111111111-1111111112111111111111111111211111111111122222222222222111111-1111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111--1111111112144211111325771112112411111111111-2222212-1111333022221211251111112122-311111111121121813111---------1111111111111111122121113332522125244421125444424412221215111313114111221131343221111111211122-1111121-2-44453126111-21111131-11111212111112111111111111117111121111122221-122221211211--11111------22122231221111111-2111121111211111111111225524555555555555555113331134-877777177171--21111111111213212222111111-111111111111112144-41122111111321111111111121221111156111113232233211111-6211111111111211111111-1-111111111111111111111111111111311 21--311-91111-1334332335443333333342433352333322233353232334332-111---1---21--111111-21-133-32221-111222121142611224322134437234186713391441432833434333133235335724122311423322-1182312276505631355467
 perone                                                 ***********   ********** ****             ** ******************* *************************** **********  ************   *******************  *  **** ***************************** ********* **************  **********   **  * ************ ************************************************************* ******* *****************************************************************************************************  ******************************************* ******* **************************** *********************         ********************************************************************************************** ******* * *********** ******** ******************************************** ************  *****      ***************** **************************************************** ************  ************************** ****************** ***************************************************** ********************** * ********************************* **  *** ***** ************************************************* ***   *   **  ****** ** *** ***** ****************************************************************************** **********************
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[3204] d.198.1.2           34                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Tll0839-like                   -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------11-----------------1---------1-------------------1------------------------------------------1-----------11111111111-------1111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1------------------------------------------------------------------------------------------------------1---11--------------------------------------1-----------------------1--------------1-------
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[3210] d.199.1.1            5                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA-binding C-terminal domain  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
  of the transcription factor                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *             
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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[3214] d.203.1.1         2555                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                 1                                    1 75                              1                16     1     1       
 DsrC, the gamma subunit of di  -----------------113122122221122-----------1111111222----------1---- 433---------------------------------------------------------111-------------------121221443313223--332338362211111111112222134333332343222221112322222222222222222222322222222222222222212222122233333233333333333222233312133232222223333333333333333322222322133123322222332222112222222---3221222222222222111211111113222222222244524434434243544433347221222-2355433322342332131242111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111--11211112111111--111111111111111111-111111111-1111111111111111111111111111--111111-1111111111021111-------112111222223333343332222222213343335122--1-------11111111111221331111211212111111111111111111111---22612-11111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111112-----11112-1121111111111111112222222222212222121211212222222222222211111111111111111111111111111332122222222222212211-------------------------22222122211112 3322654-255245566464555554666565656565554556556655555645666566443453-564334653555445653336356676656574666528948465547444455367223548-839554463563454256457475452643437323263575767007765805685825655555
 ssimilatory sulfite reductase                   ***************           **********          *     ***                                                         ***                   ***************  ***************************************************************************************************************************************************************************************   ******************************************************************* ******************************************************* ************************************************  **************  ****************** ********* ****************************  ****** ****************       ***************************************  *       ***********************************************   ***** ******************** **************************************************** ****************     ***** **********************************************************************************************************                         ************** ******* ************************************************************ *************************************************************** ******************************************************************
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[3215] d.204.1.1         1200                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Ribosome binding protein Y (Y  ------1111111111-12-----11111122---------------------1-------------1 1211111111111111111-12111211111121112111111121111111111111--11113111111111111111111111111111-111---1212212211-------1111111111111111112111211111-11121111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111-111112-----211131111111111111111112-12112121311-11111111111111111111121111111111111221-111111-1111111111111111111111-----21111111-111111112222111122222211111121144121222232421113211111-------1122211111111111113111111111113333422211111-----1---------2111111222112412232333333433333333343--12222------22222222222222122-2222222222222222222222222222222222222222222212222222-213123313222--11222222222211131111-111111111122222221113211112222212224222111111111122232222222322112222222211111111111111111111111-1-------------------------11111111111511 -1--1-------------1--------------------1---111----------2-1-------------------------------------------------3-1------1------------1-----1----------------1---------1--1------1-12115111213136-1111--211
 fiA homologue)                       ********** **     ********                     *             * ******************* **************************************  ******************************** ***   **********       **************************** *********************************************************************************************************************************************************************************************************************************** ******     ************************ *********** ************************************** ****** **********************     ******** ******************************************************       *******************************************     *         *************************************  *****      ***************** **************************************************** ************  ******************** ************************************************************************************************ *                         **************  *  *             *                    *   ***          * *                                                 * *      *            *     *                *         *  *      * ************** ****  ***
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[3216] d.205.1.1           60                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GTP cyclohydrolase I feedback  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------- -------------------------------------------1------------------------------------------------------------------2111111111111111111131-111-11111111111121111-1111----11-----1--1-1---------------------1-
  regulatory protein, GFRP                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                       *                                                                  ********************** *** ***************** ****    **     *  * *                     * 
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[3217] d.206.1.1          992                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 YggU-like                      111-11-----------------1--------1-11111111111-1131111111-1111---1--- 222-1---------1--11-11--1112122-1---1---1-1-----------------11-111---------------1--1221--------1-------1----11111111111111111111111111112--22111--1111------------111111---1----------------2111222221121212112211111111111-111------1-11111111111111111111------------------------------------------------------------------------1--1111111-1---11----1-1--1-121--22211-11--1---1-21111-111111122222222222------------22222221212-2122121222--22111--21111-21------------2112----------111111111111111------13-111111111111-11111121111111111111112111211111232-2112211112111111122222211-11221122222133323232222221122--------------------1-111232221111121322222122222222222221--2121------22222212331222222-3322322222322222222222221112222222222222222222222222-222221222222--211211123221121122222221111222211111111-12212221221311111111---------122222222222322111-1--11111111121111111----------------------------------------------111- 1---11--211-11--1111111111--------------------11121111111-1111----------1--------------1----1---------------2121-1--2111111-1111-121-1121111111111-1-12112-1121---12---11111111-11171-1123234-41-------
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[3218] d.207.1.1          445                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Thymidylate synthase-compleme  1111111111111111-211111-111--1------------------------11111121211111 -1-1121111111111111-1111121111111111-1111111-----11-------1111--1111111--------111121111---------------------2222222111111111111111111111111111111------111111111111121111111111121111-1-11111---11111--2---------------1---------------1-----------------------------------------------------11----------------------------------1111-1111111-1--1221111-1-11-2-11112221111111111--11----------1---------------------------------------------1--2----111------11111111111111--1112111111111111111111111111111----------------1--------111-1--------------------------------------------1---1-111111111111111111121111-2311111111111111111111111-1111----------------1--------1--1-----------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------1-----1-------------1-1111111112--2-11------------------11------1112112111---- --1111------------1--11---------------------------------1-------------1----1---1-------------------------------------------------15---------1---2---------1---1------------------3----11-1--1----------
 nting protein Thy1             **************** ****** ***  *                        **************  * **************** **************** *******     **       ****  *******        *********                     *************************************      ****************************** * *****   *****  *               *               *                                                     **                                  **** ******* *  ******* * ** * *****************  **          *                                             *  *    ***      **************  *******************************                *        *** *                                            *   * ************************ ************************* ****                *        *  *                 *                                                                                                *                                                                *     *             * **********  * **                  **      **********       ****            *  **                                 *             *    *   *                                                 **         *   *         *   *                  *    ** *  *          
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[3219] d.208.1.1          255                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 VSV matrix protein             --------------------------------------------1---------------------1- ----2-----------------------------------1---111-2---1-1-----1---2--2111-----------------------------1-------------------------------------11---1-------------------------------------------11---------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------1-----------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1--------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11----------------------------------------------------------21211---- ---------------------------------1---1111----------------------------------------------------1--------1-----------------------------------------------1-----------------------1-------2---11-----------
                                                                            *                     *      *                                   *   *** *   * *     *   *  ****                             *                                     **   *                                           **                                                               *                                                                                                      **                               *                             *                                                                                                                             *                                                                                                                                                                   *   *                    *                                                                                                              * **                                                          *****                                      *   ****                                                    *        *                                               *                       *       *   **           
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[3227] d.214.1.1           18                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein MTH1880   --------------------------------11111111111----------1-------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111---------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------
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[3231] d.217.1.2          309                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1    11    1                                                               
 SMAD4-binding domain of oncop  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1---------------------------1---------------------------------------------------------------------------9679893543345335454476-972453353555353126518574361213342262231112------------------------
 rotein Ski                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                           *                                                                           ********************** ******************************************                        
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[3232] d.218.1.2         1513                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1                            1    1 1                                    1                 1 1       11  1 11 1 37  2 1  1         1    11                                 1  1  1    
 DNA polymerase beta-like       ----1-1---1---312-12-1-211121111--1-211212-21-312-211-21-1---111---- 212-1111-----1-1112-11--1111111--------1--11111--------1----11--12-1------------1-311332---1----1---1---11212-----------------2--3--1-1---22---11---2--1--------11----12--------------1111122--111111111111111111111111112111111111111--111111111111111111111------------------1-------1------------------------------------------11--------------------------11-11---11212111111111121-----------2-1--111-11--------------1----1-----1-----------1---1-1----1----------11--1-------------------------------------------1112212----111-1111-11-1-1----22--111111-1--1--1--------------111-------1--------1211--2--2123221-----1-----------------23222--11--11--------------------------1-1-------------1---1---11--111---1-1---111111---21---------------------------------------------22222--112-1----------------------------------121121---111--------------------------11211111--------------------------------------------------1-1-------11-1 -1--455-745-11363189255838832224436335241333242748706166644453322222-2211322212222122222176636453244333221-34166766687004919678476671089973975688574169780287746565982833251267155372214345414411107377
                                    * *   *   *** ** * *********  * ****** ** *** *** ** *   ***     *** ****     * **** **  *******        *  *****        *    **  ** *            * ******   *    *   *   *****                 *  *  * *   **   **   *  *        **    **              *******  ***************************************  *********************                  *       *                                          **                          ** **   *****************           * *  *** **              *    *     *           *   * *    *          **  *                                           *******    *** **** ** * *    **  ****** *  *  *              ***       *        ****  *  *******     *                 *****  **  **                          * *             *   *   **  ***   * *   ******   **                                             *****  *** *                                  ******   ***                          ********                                                  * *       ** *  *  *** *** ******************************************************** ************************************* ********************************************************************************************
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[3233] d.218.1.3          688                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3               13                      1                                    1      1 
 Poly(A) polymerase, PAP, N-te  --------------1------------------------------------1---------------- ------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------1----------1-----------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1--------------1-------------------1-------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-1582-511322332221211111411333311121111211211123314122234223122222123321123222322222332231212222111115561-437474576633447587464255-687624463364444426440384441-39334343325932111182111136472121245713
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 RNA editing terminal uridyl t  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- --------634----1---1---1-----------------------------------------------------------------------------1-----1--------------1---------------1------------------------------------------------------------
 ransferase 2, RET2, catalytic                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                                                                              ***    *   *   *                                                                             *     *              *               *                                                            
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[3241] d.218.1.11         884                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1        2                         
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