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Ranking of SCOP_FAMILY : from 3301 to 3400

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3301] d.262.1.1          105                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[3302] d.263.1.1           24                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein Yml108w   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------11111111111111111111111--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ***********************        *                                                                                                        
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[3303] d.264.1.1          876                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1        
 PriA-like                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        2                                                       552 6        
                                11111111111111111151111212211111111221232321112222843112212121111111 ------------1----11-1-11--11111------------1--------1---1-------------------------------------------------------------1-------------1-1-----------------------1-------1--------------------1----------11---------1-------------1--------1-------------------1------1-----11------------------------2----------------------------------1-----1---------------------111--1--1-----------3-----1------------1----------------------------1112-111---1----1-1----------------------1--------1---11---1111-11----------------------------------------------------1----1--------------------1---------------------------11-1---------------1----------------1-----------------------1------------------1--------------------------------------11------1-----------------------1-1111-1111-----------------------------------------------------------1---------------------3--------------------1------------------1--1--------------1-------------------1 1121212-41111121211211112211131222321121111111112211122211211112121112122114222213322111112321111114-2121111337332-14411131237142221-3144243511112213221412221224112-12211212131111941-2137052841223123
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[3304] d.264.1.2          138                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bifunctional DNA primase/poly  --------111---12-------------------------------2-------------------- -------1-------1-----1--1------------1---------1-------11----1--1-2222----------1-----------------------1---------------------------------------13-------------------------------------1-1-----------------------------------------------------------------------2-1---21--1212-1----------1----------------122--122-1--------------------------1----1-----7-----------2----------------------------111-------------------11--4----------------1---1------------111111111----2----------------------------------1--------11--------------------------1---------------------------------------1-----4-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------1----------------------------------------------1--------------------------------------------------------- ----------------1------1-1---------1---------------1-1---------------------1----------------11-2--------------11-------1--1--1-------1---------2---------------------1------------1-1------------------
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[3305] d.264.1.3           58                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HP0184-like                    ---------------------------------------------------------1---------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----11---1---------1--1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111-111111111111111111-1------------------------------------------------------------------------2------------------------2----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------1111-------1-------------1--1------------------1--1--------------------1----4----2-----------------------------------------------1---11-----1----------------1------------
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[3306] d.265.1.1         1934                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                                   1                     1                                       1        4        1    1     
 Pseudouridine synthase I TruA  ------------------111111111111111111111111111111111111111111112111-- 1121211111111111111-11111111111111111111222211111111111111112223212222211111112222111111111111-11111112211112-1111111-111112111111111111111122211222222222332222223222322212211111112111111221111-2222222222222211111123211111111111111111111111111111111111-11111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111124322333333323223223333432111332222222232222222212122111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111-111111111111111111111111111111111111111111111112333222222222122222222233332232111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111--111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222111111-11111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111---1--11----111--11122122212221111 4334542-3543446334343333323444444433322222244345433432342333333423233244232333332222335452523233222213244524966354543323243288343665-335113233334232233-15434343524333333313422398707774475423899055566
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 Pseudouridine synthase II Tru  12112122211111221111111111111111111111111111111111212111111112211111 1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111-11--11211112-1-1211111-111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111121111111111111-1111211111122111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111123111111111111111111111111111111111111112111111111111111111211222211111111111111111122222222221111111111221-11111112111111131111111111111111111111111111111111111111111111112111---1-11111111212111121111111111111111421111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111-1-------1111111111111111111111111111111-111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111222221111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111131111111-111111-111121-1111111111111111111 231112215131112124432222322323333332333333333324433333333233332242322433343332333333332332222222435215321312729363235443233364433993-556243354323333324334335452473323182232221364272223235543222242333
 B                              ******************************************************************** ******************* ************************************************************************** **  ******** * ******* *************************************************************************** ********************************************************** *********************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************   * *********************************************************************************************************************** *       ******************************* ****** **************************** *********************************************************************************************************************** *********************************************************************** ****** ****** ******************* ************************************************************************************************************************************ ******************************************************************
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[3308] d.265.1.3         5748                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1 111           1              1                           1                              11    1 11 1111111111111 11111                                                                          1                                                                 1                           111111111111111111111 1                                                                  1       211                                                                                                 41                   13                                              1241111    1 1 221 111
 Pseudouridine synthase RsuA/R  --------------1-----------------------11111------------------------- 3342244444453533345-63223344444333334544233322433222333333112223423333223333333222232444555525-42113556377848-3333333-323335222222222223333522242446455634445555545444444325222225222244433441755-7777777677777744555677755575555555557865555555555555555555-5656655555665566666554666666666665566666666666666666666666666766666665565755555557576555667756655456324426223243444515642566663333345444444444443333333333417765655534434443444444444488465444445564444444444444664222222223311333333333333321222454534444676676766666666666666666666665656586080008886997776609678777745469813548594445444364545564588882935544444444444444444446444555008899361292555567722245-76467215344533333387777998888888888-88888888888888888889997777988888888888888880888788851977787777888224733333444457869888788788887768888788878780888888888188888883333333339211100000002001100000909444433566644443334333374522223-433332233332223422244344333333754 0922784-9014333111111111111111112112111111111111212311111111112233431244333553243333231112421232111112242512518353549343264276254314-55344436345324443444443445-135945242241233690117560797831191638003
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 tRNA pseudouridine synthase T  11111111111111111111111111111111111334222221112111111111111111211111 -------------------------------------------------11--------------------1---1----1--2-2------------------------------------------------------------------------1-----------------------11111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------1----1-------11---1----1-----------------------------------------------------------------1-1111---------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------111-11111222121--211111111111111111112112211111111111111111111111111111121--11111------11111111111111111-111111111111111111121211111111111111111111111111111--111111111111---1-----211111111111111-111--111-------1111111111121111111351---------1111111111111111112122111------1----111-------------------------------------------------- 3322113-27832222122111112111111111111111111111211112-3121112221122111132211221122221111112511112121112111111334342261322222233253754122222112223323222222112422153232814214113221216111232333122123334-
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[3310] d.266.1.1          790                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11111     1 111 2 471 212    1         11 2 111  1                                      
 Hypothetical protein MTH677    -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -2--115-32----1-211212121-1111111112-----111111111111-11-1--111--1-1-1--11111121111211-----221---1-----11--261720675588990717070664356469794238786961521206201960918334436611741---11---1-111112-2-24-6
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3311] d.267.1.1          473                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Hypothetical protein SAV1430   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------2222211111----------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111222------1112222222222222211122---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111211111111111121111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------1------------------111---2---------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2 ----111-211-1111111111111-11111111111111-111111111111111111111122111121122211-11122222-1111111111111111112-1212363242111111131111372-11-1-111111-111111111111112112111141111111111181121111121211121111
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[3312] d.268.1.1           52                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 ParB-like nuclease domain      -------------------------------------------------------------------- -1-------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------1-----4-11-1----------------------------------32------------1------------------------------1----------------------------------1---------------------------------------------------------1-------------1-1------1------1----1---------------------------113-----1------------1-------------------------1-----1----------------------1----------------------------------------------1-------------------2----------1------------------------------1---1----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------1-----------------------1--------------11---------------------------------------------1---------------------------------------------------------1-- -----------1-----------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------
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[3313] d.268.1.2         1714                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1      11        1                                                                           1               1                1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 Hypothetical protein PF0380    --1-1121211223142----11-1--11-22-----------1-1----1---2211121-----3- 4421131111111111112-121111112121121331211212111212111111211113121112521111111111212--2--1211-1111--11111111121111111111111111111121111133322--1226221111----------2--14631------------454-11117222222222222222222322222223222222322322332222222222222222222242222222522222222221111111212112111111111212111211121111411211111111112332233334332342222221112411125213212-2321132521--111611411214127266774311222222222228-373137250761655005585965221317255535431222222222532141111-11111111111111121111112-32148741231264334430222277432322333032336118782647570455426111211112111112212131342-113111112111241121244221--3111111111111111111111111121123122111111123421111111311111--23113-------1-114--22--1-34--2--22-----22-11-11-4132112111---1--2-23-1-21---------1111111111-----133313242232311------1--------1122111111111221231411112132111111111111122111111212233327342221-----911111921112121121--1---------------------------------2111 -----1----2-22---2--23-------------11------1-----1--------------------2-----------------------1------1----------11211-1----------------1------1-1-1-----------1--1--1-11-1---11--11----1-1--4-221--232-
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[3317] d.270.1.1         1233                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 2-isopropylmalate synthase Le  ---1--1111111111-11111121--11111222222222222222222222222--------2-11 --22311111111121111-121113111111211123322222122-2111111111--222122322221111111-121222222222222------1--11-221---------------22223333323111222222222212232222111111222222321111111111111112222-21111111111111111111112111111121--11111133-1111111111111111111------------------------1--------11111-1111-----------------111111111-21-22-------1-12122----2-2--211221123222-2211-2--1-221111-----222222223222222222222222-11111111222-2112222222222211122222222121111111111111323-----------------------------211111211111222312-1112222111111212222211222212223121212231212111111111111132-2222222122222-2222222222222-3222111111111--1-------11111222211221-2121111111111111111111---1211--1--111211211111111111-11-1111111111111111222121111111111111111111211111111-11111111111111-----------11122111111-111-111111111111112111211211211112111211-12111211111111111111111111111111111131222222--------------------------------------2--2-222222- --------------11111111111111211-11111111111111111112221111111112222112212122222222222211113312211121111111--1-1--------------------------------------------------------------1-211271111121211222221113
 uA, allosteric (dimerisation)     *  ********** ********  *****************************        * **   ***************** *************************** **********  ****************** ***************      *  ** ***               ***************************************************************** ********************************  ******** *******************                        *        ***** ****                 ********* ** **       * *****    * *  ************ **** *  * ******     ************************ *********** *******************************************                             ****************** ********************************************************** ************* ************* *************  *       ************** **********************   ****  *  ****************** ** ************************************************* **************           *********** *** ************************************ ********************************************                                      *  * ******                ***************** **************************************************************************  * *                                                              * ************************
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[3318] d.271.1.1         1405                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    11                                                                                                                   1   17  1                          11   2             6     1 11          
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 0002000001200001001230016001234000120000000100000010000000010000000000000120010100000C0101000001001000000000000123450000123020000100000011000100010123400101123456700010000123456789AB1000100001001234012345678900010001020100000012300000123456789ABCD001000000010000001010100000001201210120010123456789A0123456789ABC00101201200000001234567890001001200000000000100000001010000000000101000000001000012340100120001000000100000000010010012000000500001230010123456700100000020000120001000100000001001000000000000000123000123010101234000000100001000000000010000101100010123400001000000000200012200100000001010010000010123400001234562000001000000000000012300001230000000000000001234000000000123456789ABCDEFGHIJKLMNOPQRS0012010000123456789A0123400100120000012345678010000012340123000000120000012300100123450000000234001200123001200123456701011012340000101001230120123000001010100100000000010001001010001200000000100000100000000 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[3321] d.274.1.1           48                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein PF0899    ------------------------------------------------------1111111------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21-3--11481-1121---2111111-111--11--------------------------------------------
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[3322] d.275.1.1          134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 Hut operon positive regulator  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111-1---1111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1111-----111111111212111111111111-11111411111-1111111111111111-1111111111---------1111112------------------------------1111------------------------------------------11----1-----------------------------------------1-----------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------1-------------1-----------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------1-------
 y protein HutP                                                                                                                                *                                                                                                                                                     **************** *   *******                                                                                                                                             *             ****     ************************ *********** **************** **********         *******                              ****                                          **    *                                         *                                         *                                                       *                           *             *                                   ****                                                                                                                                                                                                       *                                                            *                               *                                              *       
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[3323] d.276.1.1          871                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein yfbM      -------------------------------------------------1111--------------- ----111111111111111-111111111111111111111111111-1---1111-1--111111112111111111--11-111111111-1------1---21111---------------11111111111111111111-21111111111111111111121111111111111111111111-11211111111-11111111222211111111--------21-----------------------------------------------------1--11111111111-------------111---111-----------------1--1-----------11111111--11111--21-11111111211111111111111111111111111-11111111111----1--111-111111211111111111111111111111111-----------------------------121111111111222211111111111111111111111--11111111121111111111111--11111211111-2111111-11111-11111111111111111-11----------------------22111211-12211222222122222111211---1111------11111112222222222-2222222222222222222111111111111111111111111122221221-111111111111---------111111211111111-11111321111111111-11111111111111111111--------111111111111111111---111-------11----11--------1----------------------------11--1-111-1-- --12---------1132212222222232222221121313222222222221222222222111111-12311123122111111111111222-1112111311--2---------------------21----------1--------1----1-1--------1----1---211711211---12----1--1-
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[3324] d.277.1.1            3                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bacillus phage protein         -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 YggX-like                      -------------------------------------------------------------------1 111------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111----1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11------------------------1111-1---------------------------111111111111111111111111111111111--11111111111111111111111111--11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------------------------------------------------- ----------------------------------------------11-----------1-1------------------------------------------1--------------1-----1-----------1-------------------------------------------------------3-----
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[3329] d.280.1.1          131                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Sulfolobus fructose-1,6-bisph  111111111111111111111111--------111111111111111-1----111111111111-11 ------------------------------------------------------------------1----------------11-----------------------------------------------------11111--1----------------------1----------------11-----------------1-----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1----1--1111111-----------------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1---2-------------------------------------1-----1---------------------------------------------2------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1------------------1--1-----11- ---------------1--1--1---------------1-1-11---1--1-1-1----1------------1-----1---1-----1-1-----1--------------1--1--------1----------1----------------1---1-------2--2------------------------1--1---1-
 osphatase-like                 ************************        *************** *    ************ **                                                                   *                **                                                     *****  *                      *                **                 *           *                                                                                                                             *           *    *  *******                 *                                         *                                                                             *   *                                     *     *                                             *                                                      *                                                                                                       *****                                                                  *                                                     *                  *  *     **                 *  *  *               * * **   *  * * *    *            *     *   *     * *     *              *  *        *          *                *   *       *  *                        *  *   * 
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[3330] d.281.1.1            9                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hemolytic lectin CEL-III, C-t  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------1------------------1----1--1-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------11-----------
 erminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                    *                  *    *  *                                                                                           *                    **           
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[3331] d.282.1.1          160                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[3332] d.283.1.1         1690                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Putative modulator of DNA gyr  224242555555555552322212---1---1322222222222222222322266776652222--2 24724-1-------22222-24--22223232222223322222----------------632--1-2322------------22-22-161-2--------22--4----------------1----------------2221-46666644444322222744977632222222222222-12-662---------1---------2----------2-2-1----1--------11--11----------1--1----------------------1-------------1------------------21---2-1---242-2-----2-2-2---2222---2---22222222-622--3-4--921244222222--2222322222222222222222-1-------232-222322322232--222222222222222222222222221222222222222---------------22222-2222222222223426444433424444224252222222222532232222222222224222222222222224--1-----------2222223--333352---------------------------224422--225222222222222222222222--2-22422-22222223222222222222-2222222222222222222222442222222222222222222222222221-233323323233221222222222242-2-22222222121322211111-1--44-44445555464654444----------232422222444445555555222222222-2222222--------6122222--------------1------24222242222--- ------1-411----1121-----1-1-----11-1----------121122-321--111--------1------1-----------1-3-1--1-1----1-3--1--31111-1-1----223-1-121---5-1--21-3---1111113----2-1-13-225-1-3231--1-1-1-112111--3-13-1--
 ase, PmbA/TldD                 ************************   *   **********************************  * ***** *       ***** **  ********************                ***  * ****            ** ** *** *        **  *                *                **** ************************************** ** ***         *         *          * * *    *        **  **          *  *                      *             *                  **   * *   *** *     * * *   ****   *   ******** ***  * *  ************  ********************** *       *** ************  ***************************************               ***** ****************************************************************************  *           *******  ******                           ******  ************************  * ***** ******************** **************************************************** *************************** * ******************** *  ** *****************          ****************************** *******        *******              *      ***********          * ***    ****     * *     ** *          ****** ***  ***        *      *           * * *  * *    * *  *  ***** * *    *** * ***   * *  ** *   *******    * * ** *** * ****  * * * ******  * ** *  
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[3333] d.284.1.1          487                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 PurS subunit of FGAM syntheta  --11--1111111111-111111111111111111111------1-1-11111111-11-1111--11 111111-111111111111-111121111111111111111111111111111111111111111111111-----------1-1111------------1---1--1----------------11111111111111112221111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111112111111111111111111111111111-11111111-11111-1-111111111111111--------------------------------------------11-----------------------------12--212-1-1211111--1-1111111111111111111111111111111111-1111111111111-11111111111111111111111111111111111111111-----------------------------111111-----------------------------------------------------------------1------112-1211212-212222222221111--2111111111111-1-------11111------1-----------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1-1--------------------------------------------------------------111111------------------------------------1-111111111-1- --------1-----------1---------------------------------1----21---------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------1-----------------
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[3337] d.287.1.1           22                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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 Type I restriction modificati  ----2--------2---------3-22--2--27269--622424221-6867-3-----22-2---5 122--229---4-7---22-24--1-23222-24242-2--553-6-44----232----2-2-4-31212-----445348---2-4-333--3-----3343-622---------------1246409--9-4444-61--4-6-58989--22------443-6974--2----------4-------22-----33----2-----66-----5621---4-41-422-44446424444444-2322---4-3--45--286-7-7-2--2-21221143332866869698883333333333333-89673777217--2222-42132-4-552-2---4-92233--55--745222-222-24302223-----24212-5--2-2-3333333333----1-------32-----224--22-3-22--1--4-44287888888---3-----------1----2-24-2--2-22----------24---2---2-----------3-21-22132-2--2-4-4322--438-2--22622-245---4-6215222-67---8-3643--4220--23212-2122-2245-42365235907917854-2-00--8311-2-24-96-144-0-44-6-19-2--24534-------2160-3224222224--22--246-222221-22-422-4432122321-3242-2222-222-222-------5----232--1---------293322666332-64668612----143482142-42-2--22-2-842-511-17-112-2443230252226-2255754448475--2411--17--------6-5-1-5--5--0222---4-470-5672-4-2------43- -1----1----1--3-1--221-1-1-111--1--1-2121-----121-2114-----111-1--1--------1-1--1--1-1----111253-----1--21-31-5121-111-2-12-31-3-4133317---1-12-1-2-221--1-11---1--1-41-210--1-1-5------1-1-1-2-----3--
 on DNA specificity domain          *        *         * **  *  *****  ********* **** *     ** *   * ***  ***   * *   ** **  * ***** ***** *  *** * **    ***    * * * *****     ******   * * ***  *     **** ***               *******  * **** **  * * *****  **      *** ****  *          *       **     **    *     **     ****   * ** *** ************** ****   * *  **  *** * * *  * *********************************** ***********  **** ***** * *** *   * *****  **  ****** *** ********     ***** *  * * **********    *       **     ***  ** * **  *  * ***********   *           *    * ** *  * **          **   *   *           * ** ***** *  * * ****  *** *  ***** ***   * ******* **   * ****  ****  ***** **** **** ***************** * **  **** * ** ** *** * ** * ** *  *****       **** **********  **  *** ****** ** *** ********** **** **** *** ***       *    ***  *         ************ ********    ********* ** *  ** * *** *** ** *** ************* *************  ****  **        * * * *  *  ****   * *** **** * *      **   *    *    *  * *  *** * * ***  *  * ****     *** ****     *** *  *        * *  *  * *    ******     *  ** ** **** *** * ** ** * *******   * ** * * ***  * **   *  * ** ***  * * *      * * * *     *  
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 WWE domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11                                                                                                      2 3332232111112132131733132311113112111111211311112 11111  1    1                          
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[3341] d.290.1.1          247                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Alpha-acetolactate decarboxyl  --------------------------------------1111111-1111221--------------- -----11----11-----------1------1-------------------------------------1-----1------------------------------1----------------------1-1----------------1----1---1-1-1---2--1-----------------------111111111-111111--1111111-----1-1111111-122222222222221111111-1-11-1--1111111111121222111----11111111111111-------------1111111111---1-111-111-------------------------3-------------1--------------------------------------------------------------------------11111111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-----11-------1---1--------1------------------------1--11------1-----------------------------------111-12------------------------------11121--1----------------1---------1---------------1--1-----1-----------------------------------------------1--------------111-1--------------------------------------------------------1-1-------------------- ---------------2112---21112---------------------111111-1111112-----------------------1------1--------1--------1--------------------------1---------------1---------1---1-----1-------1-1--1--1------11-
 ase-like                                                             ******* *******                     **    **           *      *                                     *     *                              *                      * *                *    *   * * *   *  *                       ********* ******  *******     * ******* ********************* * ** *  *******************    **************             **********   * *** ***                         *             *                                                                          ********                                                                                                                   * *     **       *   *        *                        *  **      *                                   *** **                              *****  *                *         *               *  *     *                                               *              *** *                                                        * *                                    ****   *****                     ****** *******                       *      *        *        *                          *               *         *   *     *       * *  *  *      ** 
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[3342] d.290.1.2          144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
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[3343] d.290.1.3          421                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1223 3        
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[3346] d.293.1.1            2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Phosphoprotein M1, C-terminal  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------
  domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              *             
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[3347] d.294.1.1          211                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          2                                                                                        
 Eukaryotic EndoU ribonuclease  -----------------------------1--------------------1----------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------1-11--------------1111--------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------1----------------------------------------------------------------------------- ---------11---11-----1-----------------------------121-----------------------------------1---1--------------512564573111111121121261-11311112111-211111-13123232323448221133331-11------12211--12121111
                                                             *                    *                                                                                                                                                   *                 * **              ****                                                              *                                                                                                                           **                                                                                                                                       *                        *                                                                                *                                                                                                                   *                                                                                             *                            *                                                                                       **   **     *                             ***                                   *   *              ************************ *********** ****** *********************** **      *****  ********
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[3348] d.294.1.2            7                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Nsp15 C-terminal domain-like   -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1-------1--------------------------------------1--------------------------------------------------------------1-----------------------------------
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