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Ranking of SCOP_FAMILY : from 3501 to 3600

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[3501] e.43.1.2           277                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              11                                                                    
 Capz beta-1 subunit            ---------------------------------1---------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------7--1111-------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1111111-1---11111111111212111111111111111111111112111211111111111111-1111111111111111111112111211111111111-1212231112111111164131142-63311-111112111111113221221121111111111122----------11221111-11141
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[3502] e.44.1.1          1762                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111               1        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 2-methylcitrate dehydratase P  11----1111121211-11111----1---2-1-1--------------------------1112--- 122-122144321212222-211124222222-----35621232121-22-544222--3341123211-111111111115-----3333-222---111111-1-1-111111-------1--------------------11-------------------1----------------11111--11133333322223233222233332331113211122221111111111111111112111121--11---1111111121--1-11111111111--1111111111111111111111111112111111-22122222222121-222122221-11-11--11112-2222112--1-1-23111-1111-1222--112111-111-111114-11411614561-4225321531233223121311591151111111131111-11-----------------------------1-12114770844443433333338055451594734652212411322313339122--1-411111-11112---12--2212213111-----1-1------11-1--2--122212111111111--1----431111123222111112211112122233--12111------52434214444443444-4434454444444343443242473235544555555555545333333331-211111111111---2222222222-1232111-111111----111111--2212-44444555144462311111112111-222422232322232211111111-------1--------------1---------------------------1-211-1---1-11 ----111-1--21312331322256671123222121221312211443365363413122211-11-1123--1111112----1---49332341-11272222--2-2234342221-112111-125112121111321212111111-325434121-32------1-2---118111-1---333--1-----
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[3503] e.45.1.1           613                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Antivirulence factor           -------------------------------------------------------------------- 1---1-1-------22222-211122222221211123572---211211---212-1--11121122312-----------2--------------------1--------------------111111111-1111------1-------1--------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------1-1------------------1-------------------111111111--2--1111111111111111111-213112-222-1111211211111121111--1111-----------1---112211111111111111111111111111111-1111------222122-----22111-----2213332--3311-----112----1----11----------21----------------121-1-11-----1------------------------------11-111211111111111111111111111---211-------------------------------------------------------------1-------------------------------111111222212211----------------------1112122222222222222253-----------1111111-1111111231221111111--------------------------------------------------------11-- ------2-1-21--1-34-2-1123222111111211231221122211222-51-22222212111-1-11-1121-111222121134213--11-1--9----------23-1--211--12211115--1--11121----2-1-1-1-3-32---1---112-11-------51------1-1------2----
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[3504] e.46.1.1          1378                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                                                                                      1       1 1    12211111 1 1 122 21371 213    2 111  1  1  111111  11    2 1111      2     1             
 Virulence-associated V antige  ---------------1----------------------------1------2---------------- --------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------1------------------------------------------------1------------------------------------------------------1111111121---------1---------------------------------------1-------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------1---------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------11-1-------------------------111111-11-1----------------------------------------------11-1--------------------------------11----------------------------------------------------------------------------- 1-11123-131322222212222232222122222422-213222212322252343242232336432357233335454444356555962564533226218823-5103689528091917980056932219999182128906629991503158216668782470552--13-2-1275662531121-14
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 ein, IBP39, C-terminal domain                                                    *                                          *                                    *                                                                                                                                                                           ****** *******                                                                                                                                                        *   ****      *        **                      *                                                                                                                                         *                                        *                                                                                                                                                                        *                                                                                                                         * ***** *** *******************************   ************************** **** ************* *** ***** *  ************** ****** ***** *** * ********** * **** **  ***** *******  ***** *****************
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[3507] e.49.1.1           925                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Recombination protein RecR     -----------------------1---------------------------11-----122------- 1111111111111211111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--111111111121111111111111111111111111111111111112312211111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111131111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111122111211111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111--11111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111--11111------11111111111111111-1111111111111-11111111111111111111111111111111121111-111111111111--11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121112111111111111--11111111---1-111111---11-111111-111121-11111----------1111 ----------------1------------------1--------------------------------------------------------1------------------1-1-1-------1------------------------------1--------1-------1-1-----------1113-2-11-----
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[3508] e.50.1.1          1881                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 AF1104-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            112111       22 1 40  111    1         1  1 1     1     11 1        3     1 11 1        
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 Urocanase                      -----1-----------111----111--------------------1------1------111---- 111111-------------------1----------1111----1111----111111--11121-1111-----1------1-----1111-211----11112---2----------1111------------111-----1-1-1-11-------------------------------111-------111111111111111112---11111111---------111111111111111111---1--1------------11----1-------2---1-------------11111111111111--11------11--------------------11---1--1---1-1--1---11-12-1--1111-------111--------11111111111---1--1--31--211122143211---21--21-11111--------1--1--11--------------------------------11------1111111111111112221212112322--113--1--1-2-11-------2--1--------1--2-2-1-------------------111111-1----------------------1----11-1-1111211111111111111111111------1------1111-11-------------------1----------111--11-111-11111111-1-11---------122222222322---1-----1212--1-1---------------111211--111-1111111111111-111----------111111111111111111111111------1---------------1---------------------------11111-1------1 ----111-311-1--11---1--1-1---11----1-------11112---1-1----1-21--------111------1------1-----1--1--11-31--1-1124332233121121212-436921522111-21132-111-12-1213111422331-111-22321-1-------1115--11122231
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 NAD kinase-like                11111122111111121221122132221222231111111111111121423222222222121-22 1211411111111211111-1111111111111111112112223111111121111111221111142111111111111121111111111111---1121111111--------------11111111111212211111113323223223322222222322222222222222222-----11122222222222222222212222322222212222222222121111111111111111111111111111111111111111111112221222111111111111111111111111111111111111111111111111121211221111111111111111112111111111111111111111111111221111111111111111111-32122123111111112211111122111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222222111112222111111223222111112121112111111111111111111111111111111111211112211111121121111111112111211111111111111111111111211111122111111111111121121111-1111111-11111111111111111111-111111111111111111111111112-111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111112111111111111121121111111111111111111111111112222211111111111111111111121111-111121111111-----1---1--11----111--11111111111111211 1111323-321144433333333434333333333333343333333434334333333444332222223322233-332222224442323233746213254413125456646322224287212595-049122361332232213218236333242243212352321233395323254584452363222
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 Diacylglycerol kinase-like                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1  2221122111111133131543 314111 1112111111111311111 12 11 12 13111     2     1112 1        
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 Rap/Ran-GAP                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 11                                                                                                     1  112121211  11132121411 212 11 11111 11  11 1 1111 11     1  1                            
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 YaeB-like                      111-1211111111121-221322-111-2--1-111111321124631-12112111211---1--- -11-2-------------------------------1------------------------1------1-------------1----------------------------------------1--------1-------111-11-1---------------------------------------11----1111112111111111-11--112--1------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1111111-1--111----------11--343--1--1-1111----1--11------1-11122123212------------11111111-1--1-------11--11-1---1------1------------1-11-----------------------------------1------------------------1-----------------1-------1----111111111------34412322-32112-1111-1-2211-1-122---------------------------111211111111111111211111112121----11-------11111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111---------------1111111111111111211111-111111111111111111111111----------21111111111111------------------11---------------------------------------------1-111--1- --22222-2312-------------------11-------------------------1-------------------------------------------------9411111121111-1121-51621-21511--211111111112-11---1---131-13122--12111142121211111111232233
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 Vacuolar ATP synthase subunit  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------1-----------------1-1-1---------------------------------------------------------------------------1------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------111------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------11111-1---1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11---------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1------------------------------------------1-------------------------------------1---------------------------------------- 1111511-3212121221131111112111111112112222211111111121111111112111111211211111112111111111112311111211111211113175544222123251132433-435322252222122222228332353622222361241321111101111121221111221111
  C                                                                                                                                                *                 * * *                                                                           *                        *                                                                                                 ***      *                                                                                                                                         *      ***** *   * *                                                                                                                                                                     **                                                         *                                                                                               *                                      *                                          *                                     *                                         ******* **************************************************************************************************************************** ******************************************************************
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[3517] e.58.1.1           470                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Viral ssDNA binding protein    11----1--------1------1-------111---1111111-----112----11---------1- --1----------1----------1---------1-1--1----------------------------1------1------------22----1----1------------------------------1--------1----------1---11-1----1---1--2--------------1----1----------1---------11-------11---------------------------------------------------------------------------------------1------1-------------------------------1-----1------1------1------------1-----1------2----------------------1----1---11-111-----------------------------------------1-11--23---1--------1-------111------1----------------1----1----3--------1-------------------1-----------1-----------------1--111---1---------------------1-----1--1----1---------------------------------------11--1-13--11---211-3111---1---------1------------------1--------11--1111----------------------------------1---1--------1-------1----------------------1-------------------1--------12-----------------------------2-----1---1-------------1 42-2231-3112211-14-313-1--1--1111-2--111111111212222742213-221232111-23212123314-23211111-211--1212113-212--1122-32112223222331-2191-1231131322313111234332421334-1424212-11641---111112--355-1-213221-
                                **    *        *      *       ***   *******     ***    **         *    *          *          *         * *  *                            *      *            **    *    *                              *        *          *   ** *    *   *  *              *    *          *         **       **                                                                                       *      *                               *     *      *      *            *     *      *                      *    *   ** ***                                         * **  **   *        *       ***      *                *    *    *        *                   *           *                 *  ***   *                     *     *  *    *                                       **  * **  **   *** ****   *         *                  *        **  ****                                  *   *        *       *                      *                   *        **                             *     *   *             * ** **** ******* ** *** *  *  **** *  ********************* ********* *********** ******** ***  ******* ***  **** ************** **** **************************** ******* *****   ******  *** * ****** 
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[3518] e.59.1.1           911                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2                                                                                                                                          1    13  1                             11              3                   
 FdhE-like                      111-12-121112224431111114----11-21121-11--1321221-11-21-111-----2-3- 221-------------111-1-----111-1-------1---------1-------------1-----1---------1215-2111------1-------------1-----------------11-----1-------111-11-2-11-----------2----1-1---------------------22-------------1---------1---1-1------------------------1------------1---------------------------------------------------------------121111111--1-2-22--1--21-1111-1111122121--19----12-------11--1-----11--------------1-------211--------------111-----1111----11111111------1-------------------------1----------1----1111111111111112221-11211-1---1-1-----11-----31----112111111---2-1-1233122142323-13223-22-2332--33-----------------------------2-1-1---111222-112111-1121-1-------------21111111111111111-111111211111111111112211111111113111111111311111111--111111111111------------------311112111111--1-----1----1-11111-1--11112-1------------11------21-1-11------------------------------1---------------------------3--1121------- 21---111931-12-1------21--1--1---1-11---1111--11----1--1---1-1-------121--4-1---1------1-11---3-111----------2846737211--12204-5-937115622-143333221-21--52435-649630-442451233-3--9---212-23-21-149-32
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[3519] e.60.1.1           935                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Thermophilic metalloprotease   111-111------1-------1--34433333-----------------1---1--211131--1--- 112-------1--11----------1----------1121-2--1-----------------2-1-1---1-------1-1-11----121-----1--------2-1-------------------------1-2111111231-----------------1----12-------------33322--112122222333234233432111123311132222222228521111111111111111111--1-11-1---11--1121112----11111-11--11111111111-------------1111111111121-2111112121121--122221-11111--4314--2122-1-1--1-1--11-11111--322111-221-1111111-111-2212212-13-112211111312211---1---1--112222222221111-----------------------------1-11---1--2222-212231-----11-1----11211323------2121121113232111111---------11111-1-1-111-12111-121221512-1--2-1--------------------------------121-----1----11----1-1--11---21-1-------------111111111--111111111111111111-1-1-1111-1--1-1-1--21---3--1---------------------1-1-1-1111111-----------------121121--2-111111-112121112112-------------------21--111111111111111--11221111111111111-1-------------------------1-111-3----11- ----32--411-23-21-2211-2112221----112-1--11212----3314-13-----1-1-1---213---4-12-242122--3261221-1---2---2---24231224151112224123654124422123111312--1311213331111-11----1---2----------112-2-1-1--1-22
 (M29)                          *** ***      *       *  ********                 *   *  ******  *    ***       *  **          *          **** *  *                 * * *   *       * * **    ***     *        * *                         * **********                 *    **             *****  ***************************************************************  * ** *   **  *******    ***** **  ***********             ************* *************  ****** *****  ****  **** * *  * *  ** *****  ****** *** ******* *** ******* ** ***************   *   *  ***************                             * **   *  **** ******     ** *    ********      *******************         ***** * * *** ***** ********* *  * *                                ***     *    **    * *  **   ** *             *********  ****************** * * **** *  * * *  **   *  *                     * * * *******                 ******  * ****** ************                   **  ***************  ***************** *                         * *** *    **      **  *** ** ** **** *******    *** *  *****    **** **     * * *   ***   * ** ******  ******* *   *   *   **************************************  ************* **    *   *          *** * * *  * **
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[3520] e.61.1.1          1029                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                                                                                                       11    1             12                             1         1                            
 ImpE-like                      ---------------1---------------------1-1-1-----2--31---------------- --2-11---------------1----------1-----------------------1-----------------------1--11--4---2-1------11-1132-2--------------1--------111------------3---1-----------1---225---------1---------1-1---------1------1-11-1--1---2---------11-------------------------------------------------------------------------------------------1--2222-22--2111112---121-------111--1---1------31------11111--1---------1111-111111----1--1--11---111---1----2----11--------1111111121---------1-111------1----------213-11-1---11-12----111111--113333-11---111-21----1--1---2---1---1--11--121111-112221------1----1111--2---1---1------------12-12112212-12-121--1-22-21--2212-1121111-1-1-2---1----------3--------1-11---------1-1---1-11--11---2----12111212212222122---1112--111111111111---------1111-----221222-21221111---1-22-1---1111----11-12-------------21221------2111--11211111----111512122223121122----------------------------3-21-211111--- 34--784-71--335211--2-22-21--11-1234-121-21311-1223122----1--1-12-226142--22112--1--33232--112-1-1--13--1314184427-49558436664342153-629545681373435559-581333486556452-2321259-2-231-1--31-8-58-42-211
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 DP dimerization segment        -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----111-------1--------------------1----------11--------------------------------------1--1----1-----------12112221145332122251273733-5352221423323321-233232223222211112111331122111111-13312-512221111
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[3524] e.63.1.2           787                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1          1 1 15    1                 1                1                            
 E2F dimerization segment       -------------------------------------------------------------------- 1-----1----------11-11----11111-----------------------1--1------------1-111------------------111------------1-----------------------1-----11------1----1-1-----1--------------------1-------1-1--11111-11-1111111-22---1-1-1--1--1111---------------------------11----2--11---1----111--------1-------------------------1------------------------1-------------------------------------111-11111--111-----11-11111111111---1--1-1-1---111-1111111-1--1------------------------------------------11-111111-----1---1-----1----1--------------------1------1-111---------1-----1111111--------1--------------------------------------------------------111112121-11111111111111111111---1111------11111--1111111111-11111111111111111111-11111--1--------------111111111-1--------------------1---1--1-11-1-21111-1--1----------1111111111111111111----------1111111111111111111111111111------------------11---------------------------------------- ----112----1--1----------------------111-11---------------------------------------------------------------11217978259658586781616109289567659868757665844089676--21232141211572111111-1114435-621-21211
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[3526] e.65.1.1           483                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                                1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
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[3530] e.69.1.1          1872                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             12                                                                    
 Poxvirus poly(A) polymerase c                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         3343432211121264152255 621 2213224  23113  522111123          1                          
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[3538] e.76.1.2           702                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1 41    1       1  1 13    2       1         1                   1                         
 Spike glycoprotein-like        -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------1--------------------11-------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------3--------------------------------------------------------------------------------------------------1---1111111-1---------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------111------------------------------------------------1-1----------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------1------1------------- 11-1-23-74341152111224333111221112221-1--11211324232541-1212313-5-11-24111-24242232-2--1-22214-2-1-122-1-1-1812496870135244745114334-84122429473725631944037587--13241222154343216642327-35121513212-15
                                                                                                                                                                        *                    **                                                                               *                                                      *                                                                                                  *   ******* *               *                                                                                                                                                *                                                                                                                                                      *                                                             ***                                                * *                                                                            *                                                      *      *              ** * ** ***************************** *  ************** ******* * ** ***** ******** *  * ***** * * *** * * ************************* **************************  *********************** *********** **
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[3539] f.1.1.1            937                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          6                  13                                       1                            
 Colicin                        ----------------------------------------------------------1-1-----1- 1-2-11-----1--1---------------------2-11---1----------------1--11122--11-------------1--11-----12--12-1---2-----------1-----11-1-----1----1----2-2112--111--1--------11-23-11----1--1------------22222211-112122113311212-1-11--------321--1-1-----------------2--2-----------------------11----------------------------------------1----------1---11--------31----11---------------1-1---------111-1----------1---1-11--1----21----------1---1-----------1----1----------------1111111111-1-------------1111----1-122211111111222211112223111111111-21----------11---11111-11111111--1111-1-----1--2--1-1-1------1211-1----1111---111121122-1-1-1-11----1----------------------------1113-----------21--------------11------1------1-----1-2--11111121----1--------1----------------11-----1111-1------1---------1-1111111111-222-----11--------1-----------------------1111111-1-------4-----11-----------11-----------------------1-11111111111- -1--115-2-1342141122222314311544312111111112322242332231111313112221-12-31211-11111111121-111446111242-323-14-9413371464234176374214-666353314542246135-13467631695566-233122661--12----17-132-22224124
                                                                                          * *     *  * * **     *  *                     * **   *                *  *****  **             *  **     **  ** *   *           *     ** *     *    *    * ****  ***  *        ** ** **    *  *            ******** *************** * **        ***  * *                 *  *                       **                                        *          *   **        **    **               * *         *** *          *   * **  *    **          *   *           *    *                ********** *             ****    * ********************************* **          **   ***** ********  **** *     *  *  * * *      **** *    ****   ********* * * * **    *                            ****           **              **      *      *     * *  ********    *        *                **     **** *      *         * ********** ***     **        *                       ******* *       *     **           **                       * ***********   *  *** * ********************************************************** ** ***** *********** ************ *** ** ********************** ****************** ************** *********  **    ** *** ********
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[3540] f.1.2.1            144                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Diphtheria toxin, middle doma  ------------------------1---1-----------------------------1--------- ------1---1----------1---------------------------------------------1---------------1----------1------------------------------------------------------11--------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------11111-------------------1----------------------1------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1--2111--1-----111111-----------11----1----1-------------1------------------1------------------1--------1----11-111-11---11-------------11--11-1111111111-11112111-1111111111111-1---1111111111111111---1---1------------------11-------------------------------------1-----1111111111111-------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------1---2------1---------------1--1----2----------------1------------------11-----------------11----------------1------1-----------------1---------------111---1---------------------
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 Bcl-2 inhibitors of programme                                                                                                      1         1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1            1   1111                      21 11   1                                     8            5 6222221121122154142983 434111122232 2111211211111  1111        16 12 2         1         
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 Exotoxin A, middle domain      -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------1--------------------------11----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-1-----------------------------------------------------------11-------------------------------------------------- ------1-512-1213314--112133221311---1212143522121231331-32-4231-1----1-1--1---------11----113221-111-2--12----64422665362363232222531954457472656124120-382853414---31-1--232-1-11-2-----12--3-1--1213-
                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                  *                                                                                                                                                                                         *                                             *                          **                                                                                                                            **                                     *                                                                                                                                                                          ** *                                                           **                                                         * *** *******  ************   ******************* ** **** *    * *  *         **    ****** *** *  **    ***************************************** *********   ** *  *** * ** *     **  * *  **** 
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[3544] f.3.1.1            134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
 Light-harvesting complex subu  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------22211-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-24---00225------------22222-22---------------------44-66664----------------22--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 nits                                                                                                                                                                                                                                       *****                                                                                                                                                                                                                                                     * **   *****            ***** **                     ** *****                **                                                                                                                                                                                                        *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
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[3545] f.4.1.1           3111                                                                                                                                                                1121        1   1                                                                                                                                                                                                                                                                                         32211111111   1 11 11        11 1               1                             11222111                                                       1                              1           1                                                               11     1 1   1     1 1 11                     11        2  1 1  1 1                1111111111111111                           1                                                                  1111     11 1                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Outer membrane protein         -------------------------------------------------------------------- 548----------------------------------------------------------------------------------21-9723-7652--90365067821------1------5554447236-7----------1212-------12151122-1133--11---281-1-121----7---------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------1--------1361-554337456351060239245388908119119-558656107521798455567764823633463222312444444443332-17155464777212223443233332244335-26532322129889884566477776666476806845123432741239333-34-452241432265212222-15-13-2-221---19995869753333945-1321222221212----1--1112911771572276439091986078888095736---32351-111156596946768686976-0560809839998777777665676581110211131104002586365664-877776777777--22909988577267353334352343213234444436467485555444544443432211111211122431999998591934655553423222---411----1----1--11-------------------------------1-1113416 ---------------------------11----------------------------------1-----------1-1-2-1----------------------------1--------------1-1--3------------------------------1---1---1-1213----------1111-1---3----
                                                                                                     ***                                                                                  ** **** ****  ***********      *      ********** *          ****       ******** ****  **   *** * ***    *                                                                                                   **                                                                      *        **** ********************************* *************************************************** ******************************** ***************************************************** ** ****************** ** ** * ***   ***************** *************    *  *************************************   ***** ********************* **************************************************** ************  **************************************************************************************************   ***    *    *  **                               * *******                            **                                  *           * * * *                            *              * *  *                              *   *   * ****          **** *   *    
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[3546] f.4.1.2            142                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Outer membrane enzyme PagP     --------------------------------------------------1----------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1222211111---111111-1211-1----111---1---------1-21--1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11112211111111111-1121-1111111111111112111111111111111111111-11-111111-111111111111---------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------1----------------------111--1-----1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---1---2-----1-
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[3547] f.4.1.3            163                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111                     1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1        
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[3548] f.4.1.4            213                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1       1           
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[3549] f.4.2.1            230                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Outer membrane phospholipase   -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------1----------------------------1-----11-1--1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------11111------1------1---------21111--11--1111111111---11-1-11111-11---111-111--------------1-------------111111111--1111-11-111--------12-111112111111211111-21111-------------11111111111111111-111111111111111111111111--11111111111111111111111111-111111111111--1111111-----1211--------------111111-1111-1--------------------------11111-----22-11111111111--------------------------------------------------------------1-- --------1--1----1------------------------------------------------1------------------------1-1------------------------------------------------------1---------------1---------------------1--1-----1----
 A (OMPLA)                                                                                                                                                           *                            *     ** *  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                                                                                *****      *      *         *****  **  **********   ** * ***** **   *** ***              *             *********  **** ** ***        ** ****************** *****             ***************** ************************  ************************** ************  *******     ****              ****** **** *                          *****     ** ***********                                                              *           *  *    *                                                *                        * *                                                      *               *                     *  *     *    
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[3550] f.4.3.1           2282                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                3454442222144543332127381323  111     2                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 Porin                          -----------------------------1-------------1-----1------------------ ------------------------------------------------------------------------------------11----3--2-------21-111----------------------1----------------------1----------11-111-1---1-----------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-1--------1---1----1--1---------------------11---------------1--1321111112--------1------21-1-----------------------------1--555366605418646922030118373399653116687764538769649212--5512222221116311--1-------------12--1--21-2-11-1-----------1--------21-1--431-22431337777625267768787699--2-5341--11194224754887577776-46586577666776445576661122289678888898686885654877621443547555454111-----------21112223222111111122212212112-211-1-1--243411------------1668944444978593211-111-----------------11-1-------------------------------1---1--------- ----1---2------211-11---1-----111---11-1111---32111----1--1-112-1111--11---112111111----21--11-----1----1---1131-2-141---1-11--21593--1----1----1-13---1-3--1-4-1--1-1112----211---2-----11-611---11-1-
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[3552] f.4.3.3           9230                                                                          1                                                                                     1111        1   1 1 1                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
 Ligand-gated protein channel                                                                        330                                                                                     0020 911   3034381632                        21          1                1  312                                                                                                                                                                                                            4  1776     2 11112121 11            21 11122               11 653  2       22222222 223  31                              38542111111222211    11  1111 12111111  1 1 11113   1 13  2121  11111131  21 11                    1    22  2 2                  1   1111 5 65394 3334433234332224324   1 1       2 1  1 11111111   1 1 111 11111  1   11122111                1  1   1  111111111111   1          11 11 1 1   1     122221 2  13634333434134321222             1     111  78887885661111        11                                              25 3                                                                                                                                  12                           1                             2     6    
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