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Ranking of SCOP_FAMILY : from 3701 to 3800

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[3701] g.26.1.1          1598                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Antifungal protein (AGAFP)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             221222111111 3314 913 42411112 1211111111 311111                  1        112 21       
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 Fibronectin type I module                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             6664985222123276243341 354222142342131126 1824346 1         1                            
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 VWC domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            9434655212224365252933 54822223235313221521415334232 121 2121  1                         
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 Thyroglobulin type-1 domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           8433223222123243222783 526222232233 2121211524232 11   1 1211114                         
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[3705] g.29.1.1            31                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1                                                                                                                                                                    1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
 Type X cellulose binding doma  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------1-------------------1---111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------0--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------5------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------
 in, CBDX                                                                                                                                            *                   *   ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                      
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[3706] g.30.1.1             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Carboxypeptidase inhibitor     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   *                                                            
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[3707] g.31.1.1          1719                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                    111 2121                            
 Tachycitin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1 1                 2                            341 02681931322                   2     
                                -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----1--1------1---1121111-------1---------------------------------------------------------------------1------068356111111-232141913-4342221312421-21--12915133528986132900178--11-----1---1----12-----
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[3708] g.32.1.1          1117                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          4232322111 11133122491 213 1 121111 111121 411111  2        1                            
 GLA-domain                     -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------1----------------------------------1------------1-1----7323675024916550160117-08487760377998515129849406895374342742-168-------1---------------1
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[3709] g.33.1.1            34                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cholecystokinin A receptor, N  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-112111-11111-11211--1111-111--1-111111-----------------------------------------
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[3711] g.36.1.1           117                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Ferredoxin thioredoxin reduct  -----------------------1----------1--1-----2212212222--------------- -------------------------------------------------------------------------------------111---------------------------------------------1------111--1111111211111111111111111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1112111-11111-----------------11-------------------11212------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------11118111112111-2111----1
 ase (FTR), catalytic beta cha                         *          *  *     **********                                                                                                     ***                                             *      ***  *************************                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                       *                                                                             ******* *****                 **                   *****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *                       ************** ****    *
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[3712] g.37.1.1         16311                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                      1                                             
 Classic zinc finger, C2H2                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             8111121111111142142763 3241111111311111 211711222  1 11    11                            
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 BED zinc finger                -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------1---51-----------------------------------------------------1---------------------------6-----8---------591612-32--22851625863431-1--644-5-37-43--222-2----84-9352-134------2------538----17455-
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 Zn2/Cys6 DNA-binding domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         1118717766478447656567875756467454086410042399088845524313225353313334444511134473656574227342 127                                                                             1 8         
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 Erythroid transcription facto                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               22      1 2 1       11  1               1     1 11  1     111    1    1    1 11111    1111111111 11445 1  1222231111111132 21542 223 11 21121 111 11 212111   211  1 1 12   11 2     1223 3        
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 Nuclear receptor                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      4675664222234315172818 75922235334313222422534333 221212 3114031                         
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 LIM domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            12322221 1 11143 3 642 324 11121111 11  1  311111        2  1 1                          
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[3720] g.39.1.7          1239                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1          
 Ribosomal protein S14          ----------------------------------------------1--1111--------------- 1111111111111121222-2211222222222111222211112111211111111111221221222211111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111-111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111213322111111121122222211122222222222221222223-21321212222223212211121122222221111111111111122222222212221111112222111111111111111111111111-11111-111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111-1111111111111-1111111111111211111111111111--111111-1-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1-12111111111111111111-111-1111111-111111111111111111111 22----1-2---111111111111111111111111111--1111111111111111111--11111111111111111111111111112111111112121111----12323311-1-22122122282-22511112222112-224112232121--1211-11111112211-------1341112-------
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 of MutM-like DNA repair prote                   *       ** *    *    *****        *          **     ******************* ***************************************************           * *     *  *        * * *                *           ************ * ********************** * ************   **************************************************************** ********  **** * * ******* * **********************  ** *   ***   *                       *    *  ***** *****        * ******************************** * ********************************************************** ****    * ******* ** **********************    *************************************  ******************  * *** *   *****************                          ***** *******     * *   ********* *** *      ***************** **************************************************** ************   *     ************************ ******* ***    ********************************** *******************               *  * * * * ********** ****** *         *         *                                                                                                     * ********************** ****** *******************    ***       **  * *    **         *  *
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[3722] g.39.1.9          1098                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11 1 24    2                                           2                   
 Hypothetical zinc finger prot  1111111111111111111111121111-1-1-111111111111111-1111111-11111111--- 111---1----1----------------------------------------------------------------------------1-2---------------------------------------------11------------------1------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------21111-1111211111111-1-1111111111111-1111111111111--11111111111111-11111111111111111--1-1111-------------------------------11-1-----111-111-111111111111111-11-1--1111111111111111-111-111-11111-11-11---------------111-2211-111111-----------------------------111111111111111111111111111111---1---------11111111111111-11-111111----11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111---1-----1111111111111111111111111111111111-11111111111111-111----------11111111111111----------------1---------------1----------------------------------------- 1111222-6332222222222222212222222222-22222222221222222222222222222222222222333332222223332112222222222254412325595686557356332435079-854343354563355437257446531132223222232232222272212285792321124221
 ein YacG                       **************************** * * *************** ******* ********    ***   *    *                                                                            * *                                             **                  *      *                                                                                                                                                                                      *                          ***** ************* * ************* *************  ************** *****************  * ****                               ** *     *** *** *************** ** *  **************** *** *** ***** ** **               *** **** ******                             ******************************   *         ************** ** ******    ** ****************************************************   *     ********************************** ************** ***          **************                *               *                                          ******* **************************** *********************************************************************************************** ******************************************************************
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[3723] g.39.1.10          358                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1                             
 Transcription factor grauzone                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 15691                            
  Cg33133-Pa, zinc finger asso  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------13-----1-------------------------------1----------------288256----------------------------
 ciated domain                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            **     *                               *                ******                            
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[3724] g.39.1.12          378                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 PARP-type zinc finger          -------------------------------------------------------------------- -------1-----------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1---322-512---421-21-11111111----11--111111--1-11111111-111-1-------------------------11124212121111-11--1-1934243433333335366352774-53633325334-331223233153243373332232272335-2-261--5-32221821-11112
                                                                                                            *                                                                                               *                                               *                                                                                                                                                                                                                              *                                        *                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                                        *   *** ***   *** ** ********    **  ******  * ******** *** *                         ************** **  * ************************* *********** ****************************** * ***  * ******** *****
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[3725] g.39.1.13         1151                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Prokaryotic DksA/TraR C4-type  -------------------------------------------------------------------- 126-1---------------------------------1121--3111111-11------2241--2131------------122333111111112--111111111111111111111111111111111111---1111111--------------------------------------------11122222221222122212133332221111211------11------------------------------------------------------------------------------------------1111-1111111-1-11111----11--1--1111111111111111---2221111-1111111111111111111111111111-11112111111-122421221122111223133222233111111111111141111111111111111-11111111111111131121111122222221222222212222122321232112231312212422121322113122111111221312341123343387514343333225335322311111111111-1-------12113113521312222323332234223424334451-1332411-11132441332722243232-2323334323335332333243221233222222222223222422222221-31222211212111131111111112233211111122211211111112113333144643324533232542---------1322214114321112222222222111111211111111111111111------------------------------------1111 ---------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------11-1--11---1--------1---------1-1-------1----------------------------------------
  zinc finger                                                                                        *** *                                 ****  ******* **      ****  ****            ***************  ************************************   *******                                            ***********************************      **                                                                                          **** ******* * *****    **  *  ****************   ******* **************************** *********** ********************************************************* ************************************************************************************************************************************** *       ************************************** ******* ******************** **************************************************** **************************************************************************         *************************************************                                    ****                                                                      *                                                ** *  **   *        *         * *       *                                        
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[3726] g.39.1.14          619                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2                   
 Type II thymidine kinase zinc  ------------------11--1--11-1-1--------------------------1111-1----- --1-----------------------------------------1121111-11111---111111-1--------------1-----1111-111---111111-111------------------------1-11121---1--------------------------------------111--111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111-111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111----111111-111------1--1111-111-1-11-1-------------------------------------------1--1111111111-1--111111----111-----------1--1-------------------------------11111----------------------------------------------1---------1--------------1---------------------------1------------------------------11-1--111111111111111111111111-------------11111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111--11111111111111--111111111----1111111111111111-----------------------------111111111-111111111111111112122111-------1------111-1--1--111111-11111111111111111111111111111---1 --11111-2121------------------------------------111111-1111111--------------------------------------------11-111111221111-111--21261-11111111111--1-111--3111111---211-----1131-1110221122124-21--2121-
  finger                                          **  *  ** * *                          **** *        *                                         ******* *****   ****** *              *     **** ***   ****** ***                        * *****   *                                      ***  ********************************************************************* ****** ********************************************************** **************    ****** ***      *  **** *** * ** *                                           *  ********** *  ******    ***           *  *                               *****                                              *         *              *                           *                              ** *  ************************             ***************** ***************************************************  **************  *********    ****************                             ********* ************************       *      *** *  *  ****** *****************************   *   ***** ****                                    ****** *******                                            ** ************ ***  ***** ***********  * ***  *******   ***     **** ************* **  **** 
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 A20-like zinc finger           -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------- 1111221-1------------------------------------1-------------------------------------------------------1-23--1245411017536465435606519-9796535947654644555645656611-53332326622311111-----16975-25-2-1-1-
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 THAP domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           111  4        11 1 241 111    1 111 1     1     212 32151314  11                         
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 Retrovirus zinc finger-like d                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               111 421 2 3  2111221 1111 111111 11211121347  11 11116 1  1 1    1  1  11      1  1 1274 2131110151352 12 3342262111123353131873 33421213126222211312422256122767791 221221  2151 11 4862272  3976 
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[3731] g.41.3.1         16376                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                      1                                             
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 DNA primase zinc finger        ------------------------1-------------111------1-------------------- 1121111111111111111-11111111111112114222112311111111111111111121111111111111111112311111664835241--11211413111111111111111111111211111112211224311112321112211111111112651111111111111211111112111212211111111111111122121112111111111112111111111111111321131112211111111112111111112216111111-111222121121111111112111122111312131321111113212132331211212111242152423223121223111111111122223234164332312222122212124-232134327331222423231312311311151312111333333331753121111111111111611222112111113153125341112112222213111132222111-116112131152412222134312131111123111121312241413613113212341121121211422112122111121111212111111111112121142121111111123511111131111111111211111111112561221221111111-231122111121111111321183222221213132222222222112221111323233232221111121121321212111111111111111111111111211121122121212112111111111111112112-1121111322111111111321211721111111111111111152321-1111111111111111111111-1111111111 ----21-1---1221111-1-----------------1-111--1---122121-22-12122-1-1211112--2--113-----2111--11------------122-6232231-2--21--21--23---22--111-111-12--2----11-1--11--1-2--11211211-71111145652921212321
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 Prokaryotic DNA topoisomerase  -----------------------122233223322334333331111113333-11211121112-1- 323--------------------------------------------------------------------1------32122-----1111--11----1----11--222222211211111222343224222223211141------------------1-21------------------221122223535635324553533222224342342223122222423333332124333232432231111121111111111221112112111111111111111111111111111111111121111111111223333333434442733344414122113114435121214111111111-111111111111121111111111111111111-111121131131111111112111141112111211211111111111111111111112111111111111111111111111111311----4-----12---------------211211--111-224-23111-2-11112222322222-1-41--351-314236332332223222122122131-211211212411222222223123238986748555768787576555565665554--2--13--33355576555455555565-5555555555555555555555665676555555555665655864555336-555555555655--342222211111543584355566555566443353344534334543555433445455222222222-66656666676857111-412---3--1--51111111--------12112211-111-121111112111111112-11-111-2-- --------211-1-----------------------------------------------------------------------------------------------212322211111111142111111-11111-1221411111111-31111113313-11111---1--1118111111112-22--1----
  I, a C-terminal fragment                             ****************************** *********** *  ***                                                                    *      *****     ****  **    *    **  ************************************                  * **                  ********************************************************************************************************************************************************************************************* ********************************* ******************************************************************************************    *     **               ******  *** *** ***** * ************** * **  *** *************************** *********************************************************  *  **  ******************** **************************************************** ************  ********************************************************************* ***************** ***   *  *  ********        ******** *** ****************** ** *** *           *** *                                                                                               ************************ ***** ************* *********** *****   *  ************* **  *    
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[3734] g.41.3.4           207                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                   1                      2               1                             
 Putative zinc binding domain   ---------------------1---------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------11----------1------------1-----------1---------1-11-----1------1-------------1-----41233431-811-22-345723-5274-1212152222--3436226131-113112210-1-3---------------1---------
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[3735] g.41.4.1           528                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             51                                    3           1                   
 Casein kinase II beta subunit  ------------------------------------------------------------------1- --------------------------------------------------------------1------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111----11-------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111-1-------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111------1-----------------1-----------------------------------1--------------2---------------------------------------1- 2212111-4122222222222222222222222221222222222222232322122222222222222222222222222222222232322249222222354612312242221122-11211151962-624-22152122-222121112--112411111101-212311-1151111142242533222322
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[3736] g.41.5.1          2838                                               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1       1       111                                                                                                                                                                                                                                                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111          11   36  1 1    1            1                         3       11          
 Rubredoxin                     11-2121-1111111343111218111121-13473323111191598453431322-2241--51-- 231--121---1-122133-33--6233333433243526111111--111-1111-1--1111111111111111111124311222434425111--26-74253-2-111111-1-1111-532357116233321-3341334213322133343323222244541432221422221211133411-111112111111121------11122111-1------1111111111--111111111-11--11-11--11111121----111111-111111-----------111111111111--11---111123450555555505947555012676533325199842322452232331231622411111315444213332211111111112-651383521231211222443322364526133233-2211111111231-131211-11111---1-1111-11-1--11-11-231413233454444435545665544445469655672465337386455633634342223222222324346419967485456666367664658056656486-21-21111211--------321-411232-6322-234444425654433647632--23534------21-12212221222322-2323322224222222222323221--3343333333233333222222221-111111111111---2111113444251-1-------------1-4233422446313333232273344332211111111142222111111122244333333332222-155212111--------21--------------------------32124323331321 -12----1712--1-12112111-1-11111-11-1-11--11-2--132411-21-1--11-1-1-1111-21-21-11----1--1211-212-5334-13-1--28-5001675434345430386248316748440557555483721665443-11633-64232-512565605644376111874333111
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[3737] g.41.5.3           320                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1              2                                                                    
 Cytochrome c oxidase Subunit   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------131-242-2121-----112----------22325121-113----2---1---2----1111111111----1--1-11111-1----2----69754062332242761738261758333163523--24-61-73-23212-2211193581-21------1----1111---------
 F                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *** *** ****     ***          ******** ***    *   *   *    **********    *  * ***** *    *    ***********************************  ** ** ** ***** ********** **      *    ****         
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[3738] g.41.6.1            26                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein MTH1184   ------------------------345111111-1--------------1111--------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 Aspartate carbamoyltransferas  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-11 -----------------------------------------------------------------------1111111----------11111111-------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------1-111111111111--11-1--11-11-11------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------1--------111111111-----------------------------------------------------------------111-------1-------3-----------1------1--11111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------------------------------------------------------------------------11111111111211--------------------------------1---------------------------1-11111111---- 11----------1144-22544655332331123133312-22233222222181334143442--11--2122---11------11-2219--225444164131-11-31624048078078876226041852568086366408276301909042989060788423182---1------24221---------
 e, Regulatory-chain, C-termin  ***************************************************************** **                                                                        *******          ********                                           *                                                                                                                  *                                                                    * ************  ** *  ** ** **                  *                                                                                                                                          *                                   *        *********                                                                 ***       *       *           *      *  ******************** *****************************************************************                                                                        **************                                *                           * ********     **          **** *********************** ***********************  **  ****   **      ** ****  ************ ** *****************************************************************   *      *****         
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[3740] g.41.8.1          1032                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Ribosomal protein L37ae                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1       11    32121502 113  1 1     11  11 4  1 1                    1                   
                                111111---------1111111111111-1111111111111111111111111111111111111-- ---------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 11-111115221111212121212212211111111111111111122113321113222222-21111-11-11-212-2-11--2--1211-111111121346114-9647484520548752387684-895780704989834575178676923112331465621221111141111183551211111211
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[3741] g.41.8.4           542                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Ribosomal protein S27e         11111111111111111111121121122131111221111111111111111112-11111111121 ------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------116------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------1-----------------------------------------1---------------------1-1-----1----------------------------------------------------11111111--11----111111111-1111121-------1---21---111---11------------121---11--11----1-------1----------------------------------------1------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------1---------111-1------------1------------11----1121211111111----------111-------111111------------------1111----------------------------------------------1--- 111111-142111111122111111-11111111111111111-1-11111111332-1111122111-21-223-212-1222322113211211111112133312322234322-1435422513-686-369321443142113232122212211111111-11-1121112118111215363192-133321
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[3742] g.41.8.5           927                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ribosomal protein L32p         --------------------------1----------------------------------------- 111-1-------------------------------12-11-1111-1111111111-1121--21111111111111111-1111111-1-1-111---111111-11111111111111111111111111-1111211111111-111---11------111-----------------1111111111111111111111111-1111111-1111111222221211-1111111-11111-1111131111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111-1111111-1111111-111111-111111114111111111111111111111111-111111111111111111-11111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111-111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111-11-111111-111111111--1-111111-111111111111-11111-111111111111111111111111111111111111-11111111111-111111111-111--1-111111111111111111111111111-111--1----11111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--11111111111111111111-111-121-111111111111111111111111- ----1----------11111-11-11111-11111111-11-1111111111-1221-1111111-1--11-111-----1---1--11-1111111111-11111----2----------11---1--------1--1-1111---------1-1--1----21------1-1-1--11111--123412-----11-
                                                          *                                          *** *                               ** ** **** ********** ****  ***************** ******* * * ***   ****** ************************** ************* ***   **      ***                 ************************* ******* **************** ******* ***** **************************************** ********************************************************** **** ******* ******* ****** ********************************* ****************** ***************************** **************************************** *************************************************************************** ** ****** *********  * ****** ************ ***** ************************************ *********** ********* ***  * *************************** ***  *    *********** ***********************************************************************************************************************  ******************** *** *** ************************      *          ***** ** ***** ******** ** ********** **** ******* *  ** ***     *   *  ** ********** *****    *          **   *        *  * ****         * *  *    **      * * *  *****  ******     ** 
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[3743] g.41.8.6          1234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Ribosomal protein L33p         -------------------------------------------------------------------- 1111111111111122222-2211222222222222222211113111-111111111112212212233111112111111111111111111111111111111111111111111-111111111-111111111111111111111111111112111111111111112111112111111111-1333332223-2222221213332--222212222212-222-222332322332231332341222122222111222222121333311313311-331112313331113333333333-113333333111111111111-111111-1111-111111111111111111-1111112-111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--1--1--111111-1-1111111111123111---111111111111111-1-11-111111111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111------1111111111211211-2211212---1-1221111--1-1111-11111 1---11--1-1--1-1-11--1111--111111111-111111-11-111111---111-111111111111-1111111111111111-21-1121-11-1-111--2---111-1-11111111-11221-211211-1211-1113--1-1-1111--------111---1-22225221211216-2211121-1
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[3744] g.41.8.7          1244                                   1                                                                                                                     1                                                        11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1 12    1                                           2                   
 Ribosomal protein L40e         11313133233333472222222131111311532111121119451622212111122212111-33 -6211-----------------1131-----1-242----1112----------------112-1--2--12-----11126-----------1-----11-2----2----------------1-----1--1-777132-271424422512-1----1133125533--------------1------12222222131333343--22--2431--1-1--------2---------------3232---11331211164--22333-----1----------------------------------1----1----25-1-3333323131--2212332-21-38---43-211---1-111--11-11-----------------------------------------1----------11------1---1------------------1-------------------------------------1------1----1---------------1--2231----------------11-----11---------21--141------1---------111-2----24-------------------------1---11--111-1112111111122111111111----1--------1111-111111111111-1111111111111-1111111111111222222222222322211111111--111121111111---1----------1-22----------------------11---1--1-----1---1-------------1112111112111111----1---1111--------11--------1---------------------------------------11 1-22231173-4112-11231222123111111222111112211111-33212111111--111312111-22112---2111114321-21311112--2221523418421427353246406412978-96013235255424224621642313-13-21--41112211211241212-8627232-12533-
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 RpoE2-like                     11111111111111111111111111111111111221111112111111111111-11111211-11 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------1---------------------------------------------------------11-------------------1---------------------------------------1----------------1-1------------------------1------------------------------11----1--1----------------------------------11--------------------------------------------------------------------------------------------------------1111--------------1-----1111-11111111------------------------------------------------------------------------------------1------------- 11-1111-1--1111111111111--1111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111131211121-11--11121-11151-1111---11-1111---1113111-12-11111-1211111221110---1111-21211121221
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[3748] g.41.10.1         3485                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          2                   2                      2                                             
 Zn-finger domain of Sec23/24               11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1                 1 3334344222222374362965 43632212324322222322132343112233112243111     6     1111 1        
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[3749] g.41.11.1         3732                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Ran binding protein zinc fing                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1 311  11       1                                                                      1         111  4 4443345223223366262954 54732214233323222422622232 1 111215123 21    14   1 2366 42 125331
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[3750] g.41.15.1          542                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NOB1 zinc finger-like          ---11-1-1------1-------121213322--111--1-----1--21211436243462232211 -1111-11121-11-1111-11--11111111111111--11--11-11111111-11-11-2121-12-11111-----1--1111211-2-----------1---------------------1--1113-121-------------115--111--------1171--------------2-11-------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-12-----------1-----------------------21-11121---23--------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------111111--1111121111111111------1---1-11--1-1112--------------11---------211--1--1---------------1-------------------------------111--------------111111--111---1-----------11---------------------------------------21--111111-1--1-1---------------------------11111-------11---1-1------11------------------------------------------------------1---------------111111------------1--------------------------141-111-1---- 11--111-2211111111111111111111111111111111111111111111112-1111111111-11111111-1111111111111111111111111111-1-1335322221222224522-171-113211112121-111-1114-1212--111111112-1112-1-14111-112312111111-11
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[3751] g.41.16.1          292                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Nucleolar RNA-binding protein  11111-1-11111111-11111111112111122211111111-12111211-211-1211-1-1--1 1------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1--------11----1------1------------1------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-- 11-1111-3111-1111111-1112--111111111111111111111111-1--1111111111111-11111111-1111111111112111111111111122-1112-111-2111111-13-12221-2141121111121121211-13-2111111111-11141111111171111111121111111111
  Nop10-like                    ***** * ******** ************************** ******** *** **** * *  * *                                                                                          *                                                     *        **    *      *            *                                    *                                                                                                                                                                         **                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        *   ** **** **** ******* ****  ************************ *  ************* ******** **************************** **** *** ******* ** ***** ******************* ** ********** ********************************
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 CSL zinc finger                -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 2212231-412-232111122233222222111222222222211122222112112222222222221222222222222333232221-21222121222232-134211321312-311227333-493-33311-322334233222303222221--2212-322-113213228222-2334223111-3511
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 B-box zinc-binding domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   74  1                                                                                                    11197709454445448455562 38634447447625454633943368111324  2111 28           1111 1        
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 RING finger domain, C3HC4