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Ranking of SCOP_FAMILY : from 401 to 500

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[ 401] a.54.1.1            61                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Domain of early E2A DNA-bindi  -----------------------------------------------------1-------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------1---------------------------------1-----1-----------------------------------1--------------------------11111211317911215-11-2111-1111-2-11---------------------------------------------
 ng protein, ADDBP                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       *                                 *     *                                   *                          ***************** ** **** **** * **                                             
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[ 402] a.55.1.1          2524                                                                                                                                                                111  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                                                                                                                                   1                                                                                                                                                                                                                                                                       1                   11                                                                                                                                                                                                                                            
 Prokaryotic DNA-bending prote  ------------------------------2------------------------------111---- 343-2---------11111-11111111111111111111111151-211111211111112112-122211111111----12344444793268---222222212111111111111111-2232322243211111---21731122122221111111113214111111111111142111111311333333333344344221112334111111111111112-1111111111111111111111211211111111111211112321111111111111111111111-111111111111111111111211111111111111211111111-1111111111113211111112122132644333333536344443433633333333334-225245344342655733344433333433433533334666666665864504312333333111133331333333333333334643343334335335333333693233333465678338654346533535333646445433343333334384544535746478625459755424434445411-1111111111111111112111865552455335455555554555445444441-3534431233344444444444444244-44444444444444444454444444444444444444444444444444451444444444444--84455553333444433333333333333333333333333755555545655555455511111111136444444444454444445444444444336-11----1111111111173513--13112-11111--1111112111111112232 1-------1-----------------------------------------11-1---------------------------------------------1--------1-------1-----1-13-1-121-121----1--11-----1--2-1-1-----1------2----121--1111----1---1-1----
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[ 403] a.55.1.2            12                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 DNA-binding domain (fragment?  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------1------1-1-------11---1-1-------2-------------------1-------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 ) of the TraM protein                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                              *      * *       **   * *       *                   *             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[ 404] a.56.1.1          1774                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111                    1 1  111               1                                                                       111111     1111        1111               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1              1                        1          2    1 11 1                           
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[ 405] a.57.1.1           130                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Protein HNS-dependent express  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111--11-1--1-----------------------------------------------------------------------------------2----------1----------------------------1----------------2-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--2222222222-2222222222222222222121-----1111111111111111-2222222--211111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2-----------------------------------------------1-----------------------------------
 ion A; HdeA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      **********  ** *  *                                                                                   *          *                            *                *                                                                                                                       *  ********** **********************     **************** *******  ************                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                               *                                   
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[ 406] a.58.1.1          1001                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
 Chemotaxis receptor methyltra  -----------------------11--1---1---1--1111122-11-2422-1-1-11-------- 1221-----------22----1---1--------------2---2---1-------------1-1---------------1----1--------------1-2-52323-----------------111---21-1111----1-111122--------------32221------------2-------211222222221222222111111222111111111111112------------------------------------------------------------------------------------------31123111111111111111---115--11121114213212111221--2124334-----3135631144225----------1-1131133511--1113323223431-211-2-4444251--------22211734--------------------------------211211-12223323111133351112122242312--11131422221421123121242-------11-2232822215318533217096848146747552-1111-1111---1-------21-4---32-224111142222221122212311133---2241------11111111111111111-1111111111111111111---111111111111111111111111-1111--111111111111---1---------12312-------------------------1444444334434334444-----1---1111233333111332244444333------62112222222222221---------------------------1-11111111-2-1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--2---1--------------------1-----1----
 nsferase CheR, N-terminal dom                         **  *   *   *  ******* ** **** * * **         ****           **    *   *              *   *   *             * *               *    *              * * *****                 ***   ** ****    * ******              *****            *       ******************************************                                                                                          ********************   ***  ********************  *******     *************          * **********  ************* *** * *******        ********                                ****** *****************************  ***********************       ** ********************************** **** ****   *       ** *   ** ***************************   ****      ***************** *******************   ************************ ****  ************   *         *****                         *******************     *   *************************      *****************                           * ******** * *                                                                                                                                                               * *  *   *                    *     *    
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[ 407] a.59.1.1          1925                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1              1  1 1  111        11 1 13                      1       1 1               3     1  2 3       1
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[ 408] a.60.1.1          1751                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Pointed domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        3332423112123144131772 43511113123212111311623221 1211 1 1112 1                          
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[ 409] a.60.1.2          8115                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1111111     1 11 1 371 112    1  1      1  2 1                                           
 SAM (sterile alpha motif) dom                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               225 1     1                                1    1                                          1     1 111 34254747518776828986680833702687827917597761652808983574554294552452 1111     11 1111  11111
 ain                            ------------------------1----1-------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------1-1------------------------------------------------------------2----------------------------------1-------1122--------------1--------------------------------------------------------1-------------2---------------------------------------------11--------1----1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 5421066-33437327797977878677798899967878788878616788087697878746675625765455767765555554467176614244334635139350522798233466534902803674635165704206206102693533444383886154068333275547472971451728678
                                                        *    *                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                   **                                                          * *                                                            *                                  *       ****              *                                                        *             *                                             **        *    *                                                                                                                                                                                                                      *                                                                                                                         ******* ***********************************************************************************************************************************************************************************************
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[ 410] a.60.1.3           473                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1              1 13  1                                                   1224 31       
 Variant SAM domain             -------------------------------------------------------------------- --------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--2607885342553686424388307855528654426444653956655---1111-311--3-1----------6201-44------1
                                                                                                                   *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              * *  *************************************************   **** ***  * *          **** **      *
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 NAD+-dependent DNA ligase, do  ------------------------1--12111-------------------11--------------- 1211211111111111-11-1111111111111111211112111111111112111111111121112211111---1111111111221211111--21111111121111111111111112322113122211112221113112111111111111111111111-111---1-11-21111--111122222222222222211111122211112111111111111111111111111111111111122111111122221111111111111111111111111111111111111111111111111111111121333332323111111121111111111211121311111111211111111211111112111111211111111111111-11212211211111121111111111212111111112211111111111111121111111121111122111111111111111111122222322422222223312222222121222223222222221222222222222111111111212222111112111112112211111111222221111111111111111111111111111212111111111111111111111111111111-12111-1111122221222222222222-222222222222322222122222221222222222221212211-1222211222222222222111111131111111121111111111111111111111111121111132322232232131111111112111111111111111111111111111111112211111111111111111111-111111111111122111111211111111211 ----12--1-------------------------------------1----11---------------1------2---11--------------------------1-11----------------1--1---1-----------------------------1-----6-1---1114111--1--1-1-12----1
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[ 413] a.60.2.3           222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[ 414] a.60.2.4           273                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[ 419] a.60.4.1           277                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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[ 420] a.60.4.2           234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NusA extra C-terminal domains  11-1-1--111111----------211-2----1-11----------1-12-11----------1-12 -----------------------------------------1--------------------------1--------------------------------------------------------1------1-1-------------1---------1---------1---------1---1---------------------------1111---------1------1--------------------1---1--1-1--------1-----------------------------------------------------1-----------------------------1--------1------------1--------1------------------------22122111-1----------1------------------11111111---1------1-------------------------------1------------------1---------------1------------------1-1---------------1--------1-------------------1-------------------------1----12--1112-1-1111-11111111--1---------------13-11111111111111-11111111111111111111111-21-1111111111111111121111111-111111111111-------------12-------------------------11--1------------------------------111111111--1-----------------------------------------------1----------------1-111---- -----1------------------------111---1111-1111111---1-1-----1---------------1--------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1-------------
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[ 421] a.60.4.3             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein AF1548,   -----------------------1-------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 C-terminal domain                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
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[ 422] a.60.5.1           139                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Barrier-to-autointegration fa  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------11-512232-221122232231524-225-4313123212222311511-12---2341-11111151------------------------
 ctor, BAF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    * **                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ** ****** *************** *** ******************* **   **** ********                        
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[ 423] a.60.6.1           876                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             24  1 1                                                               
 DNA polymerase beta, N-termin  -----1------------------1--11211--1---------1-2-11111---------11---- 112-3---------11111-11--111111111111-111-------1----111-------1-----1-------------211111--------2--------1111----------------------1--1---11---11-------------1-----1-----------------1111111--111111111111111111111111111111111111111--11111111111111111111-----------------------------------------------------------------------1--------------------------1--11---111111111--1----2-----------1-12------------------------------------------------------------------------------------------------------------------211112-----111-11121121-------11-------1-1--1--1--------------1------------------111---1--1121112-----------------------11111----------1-----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------11111----1---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------111------11-- 1111334-312-11212323333333333233333322221123222333313313333333111222--22111221222111111221322143123222221214214575877456345476595407-151345563485354555537455445533552-61421144-25342343221-32731-47541
 al domain-like                      *                  *  *****  *         * * *****         **     *** *         ***** **  ************ ***       *    ***       *     *             ******        *        ****                      *  *   **   **             *     *                 *******  ***************************************  ********************                                                                       *                          *  **   *********  *    *           * **                                                                                                                  ******     *** ********       **       * *  *  *              *                  ***   *  *******                       *****          *                                               *                                                                       *****    *                                 *                                                                                                   ***      **   ******* *** ********************************************************  ************************************************************** ********************************* ******** *********** ***** *****
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[ 429] a.60.9.1          3972                                                                          2                             1   1 22  11                  1                         2142 2                                                   1                      1                                  1                1             1              1  1                                                                      1                            11   11                             1                             2        11         1                 1                                      1       1  1   1    1112       1   22  11       11                      2           1             1                                 1     1         1         1                                                          1 11                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                              1   2                     
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[ 430] a.60.10.1         1170                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1                                      
 Enzyme I of the PEP:sugar pho  ----------------1-------1---1-1------------------------------------- ---12111111-1--------1---2------11111222---1--1-22211111-1--1-11--111111---1111--1-------------------------1-1111111111111111111111111123322---1---1--------------------1-------------12---1-211111111111111111111111111111111111111113311111111111112111111111111121111122111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111-1112111211112211----1--2--111111111-22331-1111112211111111111111111112-11211121121-111112222111111111112222111--------32213223------------------------------1211111111222222222222222222223222112111222112112111121121111511111111111111-261-112121222-12212222211211311-----------1--1-1-1------112241111111222222222222222222221-1211111-11152222225555565655-4555655545455555554344232233322323322313223354344432-333333333333111-111111111-12211111111111111112222212---2133333434222222222----------2223222222322222222222221111---3111111111111111-1----1-1-11111111111111--------1----121- -----------------------------------1--------11--1-1---1----1-11---------2------------------1---1-2-1----------1----2-------------------3-----1-------1---1-----424-1----4---2------------1----11-------
 sphotransferase system HPr-bi                  *       *   * *                                         ******** *        *   *      ********   *  * ******** *  * **  ******   ****  *                         * *******************************   *   *                    *             **   * *************************************************************************************************************************************** ************ ****************    *  *  ********* ***** **************************** *********** ***************************        ********                              **************************************************************************** *** ********* *****************           *  * * *      ********************************* ******* ******************** **************************************************** *************** ********* **************************   *******************          ****************************   **************** *    * * **************        *    ***                                     *        **  * *   *    * **         *                  *   * * *          *    *                   *     *       *   *     *** *    *   *            *    **       
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[ 431] a.60.11.1          691                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              3                                                                    
 Hypothetical protein YjbJ      -------------------------------------------------------------------- 1-2--11211-11------------1-----------21---1-1-------11--------1-1--1-------111----------------------1-11111----------------1----1--------------1-1111--2------1------2---------------------------111112-11--1-211-----1-1----11-1----1----------------------2---------------------11112123------111-11111112222322222232-111111111------------------------1-------------------------1-21--1-----2122243121222----------1-77877675231-13221212221121-1-121111111-1111111131122-11-------------------------------1-11211113132324----3354------2-51111--22--121112111-1--11-2---------1221-11--------------1----11------1---1-----------------------------1-1--11--1-1---------1--------1---------1111-121111111-11-111111111111111111111122--1111111111111111121111111--1--------------------------11-----------------------1211-111111--1222211-1---------1--------------1122222111---------------------------------------------------------------- --------1-----3-111-1211-12----------------11--2112111--2-----1----11--------------------12-12111-1-1--333-11133322232111221422526041337112262142222-2211313312----1--1------2-----11-1112--2142-------
                                                                                                     * *  ***** **            *           **   * *       **        * *  *       ***                      * *****                *    *              * ****  *      *      *                           ****** **  * ***     * *    ** *    *                      *                     ********      *** ******************** *********                        *                         * **  *     *************          * *********** ************** * ********* ************* **                               * **************    ****      * *****  **  ********* *  ** *         **** **              *    **      *   *                             * *  **  * *         *        *         **** ********* ** ************************  *************************  *                          **                       **** ******  ******* *         *              **********                                                                         *     * *** **** **                **  *******  *     *    **                    ** ***** * *  *** ***************************************** **********    *  *      *     ** ****  ****       
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[ 432] a.60.12.1          530                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13                                                                    
 DNA polymerase beta-like, sec  ---------1--------------1--221----1--------12-------2-1------1------ ---------------11------------------------------------1-------------------------------------1--------1-11-1-2---------------------2------------------------1-2-11----------111-1--------------------------1----------1------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------11------------------------------22-11---------1-------1---------------------------------------11--111111-11-------1311----21--------------1----------------------------------------------------------------------------------1--------1-1--------------------1---------1-------------------1-------------------1--1----------1--------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1112-----------------------1-------------1-1---1---------------------------1-------1---------1-----11-----------------------------1----------------1--- ----211-432---212222222222222122222211111-122222222122222222221--111-----1-------------11-42231312433-21-1-3415464555234334365463945-745244352354333434324243433222331----1--33112141115211-12231-12-11
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[ 433] a.60.12.2          486                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1               1               1   
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 Putative methyltransferase TM  ----------------1--------------------------1------------------------ 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111211111121111111-11111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222211111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111211111-111111111111111111111111111111111 11--11--311--11----------------------------------------------------------1------------1----------------211-1412-111-21111-111214-571-221-111211211--11-1121211213-12121211---211-128221111211-111112213
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[ 438] a.61.1.1             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Immunodeficiency virus matrix  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
  proteins                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                          
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[ 439] a.61.1.2             4                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 HTLV-II matrix protein         -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------1-----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                               *                                                                                               
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[ 440] a.61.1.4             7                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GAG polyprotein M-domain       -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------1------------------------------------2-----------------------------1----------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                    *                                    *                             *          
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
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[ 441] a.61.1.5             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 EIAV matrix antigen            -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
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[ 442] a.61.1.6            26                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 MMLV matrix protein-like       -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------16---------------171-12--------7-------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         **               *** **        *                                                       
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[ 443] a.62.1.1            20                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hepatitis B viral capsid (hbc  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11-------1--------------1----------------------------1------------------------1-------1----1-------------------------111-1------------1---------1--------------------1-------4-------------
 ag)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **       *              *                            *                        *       *    *                         *** *            *         *                    *       *             
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[ 445] a.64.1.1           920                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                23                                                                                                         11   1     1 1  11492 112    1  11        1   1  11  4  11   1 1            1         1 
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[ 446] a.64.1.2           130                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1       1           
 Swaposin                       -------------------------------------------1------------1----------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----1------------------------------------------------------------------------------------------------------1--346364--3-2-312-1-112---21-1-1--2-121-1-3--11----161-------1---1---2181--114407-44-------
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[ 447] a.64.1.3           122                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1                   
 Saposin B                      -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------1--------1---------------------------211122111211131151854-3-5-11131131-11-2111212121-3--1---------------5-------------------
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[ 448] a.64.1.4           309                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                                         1                                                                                  2                                         1                          
 Ameobapore A                   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --21611---1----1-1--11-11----------------------1111-----1---------------------------------2--3-1----1--11--4-14-112252-2225121-51984-679-42-2-122123223127422212651392-63638237-1-----112---------2225-
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[ 449] a.64.2.1             1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bacteriocin AS-48              -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------