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Ranking of SCOP_SUPERFAMILY : from 1501 to 1600

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[1501] d.237.1           1684                                                                                                                                                                                                                         11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             3                    34  1                                          11 8                  1
 Hypothetical protein YjiA, C-  ------------------------2---2-24------1----------------------------- -----11-11111-31411-12--1311111141113332-1-12---122-1--1-1--24--3-2222--------2--2111-1----1------------2-11---------------------------32111---3-3353445332233432322237534335333343433331------21333333332323332233311332---1322------22233333333333333333311-------------------------------------------------------------------------211111111111-11111111----11--111--11--------112-21111-22-2343552225324344444444444-5454444423--55556638775554---21522441322222222211133212-------------------------------11--35422433544333335573333333533354211223121115211322141211211111111---12------11111111--------1------11-2---------1-1-1111111-------111--11-1---1111-1-1111-1--1------1--------21111111112122211-11-111111112111111111411--1111111111111111111111111----------------------------1112-------------------------31223235452334314441111111113------------2-11111111111111-13111---------------------------------------------------1-- 11-1224-311-11221211222222211222221221-1111111--221222222111-1222132111121111-111-111131112111112221121231-2862-222232-1121245151268-0322121222322221-321413222---1-31----3---2210697549553242224767551
 terminal domain                                        *   * **      *                                   ** ***** ***** **  **************** * **   *** *  * *  **  * ****        *  **** *    *            * **                           *****   * ****************************************      **************************   ****      ***********************                                                                         ************ ********    **  ***  **        *** ***** ** ************************* **********  **************   **************************                               **  *****************************************************************   **      ********        *      ** *         * * *******       ***  ** *   **** * **** *  *      *        ***************** ** *********************  *************************                            ****                         *****************************            * ************** *****                                                   *   ** **** *** ************************** *******  ************ **************** *** ************************ **** ****** ************* **************** *********   * **    *   *************************
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[1502] d.238.1             41                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein TM0875    -------------------------------------------------------------------- 1------------------------------------1----------------------------------------------------1------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------1-----1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------1-------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1-1---- ------1--1-1--1-------------------------------------------1----11-----2--------------1-----1---1-----1----1------1-----------------------1-----------------2--1--1--------1------------1---1-----------
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[1503] d.239.1            132                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 GCM domain                     -------------------------------------------------------------------1 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------111--------------------------1---------------------------------4-1-----7--------3113112222222222321262-22322223222122221222213222---211113221--2-------------------------
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 Lesion bypass DNA polymerase   ------1111111111--------12211111-----------1--11-2122--11----1----11 111-211111111123222-23--242222223333423311-122121112353111--1131112222111111112132------2111-1-----1412233232--------------2---111111-2-----111--4--------11111111-1-1----11-111-11111--------2-22323313113121211222232312-2222232222222222222222222222322226112222-21111--2321223121121111111111111111111211111111111111113322111121111111111-1-2111-111211211-111321-12221111111111-14111-----212231111121111111111111-23112312231-1222421223331112111121222221111111111111321-----------------------------11111-111111111111111111211111111111211-111112111142211111-11521111111113121111321212-22213-111112113--211121-1-11-----1-----1-----11122311321212111346323333221222122----11-------33111322222222422-22242222222322222225331111222121312314433233-122221--111111111211---21-1114332-2122111111--1--11112234211-111-112112131123221221-1111-1-1211211121211211111111121------2-11--11--------1-3----1-1-1-111111111111111-1--------2112 ----1-2-94011-434223333444322222233333332331112434333323423333211212-12-11121-1123322133133242322222-22321-5928443474443434390413205-67732435436424434335936344313345434339348333320331143467205423124-
 (Y-family), little finger dom        **********        ********           *  ** ****  **    *    ** *** *************** **  ****************** ***************  **********************      **** *     **********              *   ****** *     ***  *        ******** * *    ** *** *****        * ************************** **************************************** *****  ******************************************************************* * **** ********* ****** ************** *****     ************************ *********** *******************************************                             ***** ********************************* ****************** ************************** ***** *********  ****** * **     *     *     ***********************************    **       ***************** ******************************************** ******  ************   ** ******* **********  *  *********** *** ****************** **** * *************************      * **  **        * *    * * * *************** *        ****     * * ***** ****************************************************** ** ***** ********************** ***** ************************* ***************************************************************** 
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 Translation initiation factor  11111111111111111111111132233313111111111111111111111111111111111112 11-11-11111--1---------------------------111111-1--1111111--111----111-----111-----------------------------------------------------------------1-1--1-----11--------1---1----------------------11111111111111-111111111111111-1111111------------------1---------------11----------------------------------------------------------------------------1-------------1-1----------------1------------------------------------------1------------------1-------------------111-----111------------------------------------1---------------------------------11--------1--1-111---------111111-----1111211111--------------------1---------1111111-----11--------1----------------1-------1-1---------------------------------------------------------------------------------------------------11111--1------------------------1-1-11111111211111111--------------------------------------111-----------------------------------------------------1--- 22222221722222212422222222222222222222222222222222222222212222232222222222222-222222222222222222222223222422324444343335426359344474-448233333332334223333343333552225282243422223252223274582562243232
  2 beta, aIF2beta, N-terminal  ******************************************************************** ** ** *****  *                           ****** *  *******  ***    ***     ***                                                                 * *  *     **        *   *                      ************** *************** *******                  *               **                                                                            *             * *                *                                          *                  *                   ***     ***                                    *                                 **        *  * ***         ******     **********                    *         *******     **        *                *       * *                                                                                                   *****  *                        * * *****************                                      ***                                                     *    ***************************************************************************** ****************************************************** ******************************************************************
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[1506] d.241.2            814                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Trigger factor ribosome-bindi  -------------------------------------------------------------------- 1111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111--1111111111111111111111111111111111111111111111111111111--1--1-1111-11111111-1--11111111111111111111111-111111--11111111--11--1111111-11111111111111111111-----------11-------------11-111-11------11--1-1-11-1---1-11-111111111---111111111111-1111---1111--1111221---111-111111-1111111111111-1111111-11-11111111111------1--1111111111111111111-1--11111-1-1111111111111111111111111111-111-1-11111-11111111111---111121111111111111111111111111-111111111111111-11111111111111--11-1111111111111111111111111111111111--1-1111---1--------1--111111--11111111111111111111111111-111111--11111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---111111111111111111111111111111----------111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111-1111111-111111111-111--1-11-11111111-1111-1111111111111 --------------------------1-------------------------1------------------------------------1-----------1--1-----1----------------1-----11---------------------------------------1111181--113242-3123-----
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[1507] d.242.1            347                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Obg GTP-binding protein C-ter  -------------------------------------------------------------------- --1-111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------------1111111111-------------------------------------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111111-11111111111111111111111111111---- 11------1---------------------------------------------------------------------------------------------------3-------2------------------1----------------------1----------------111151111111-2-13-------
 minal domain                                                                                          * *************** ***************************************************************                                                    **********                                     **********************************************************************************************************************************************************************************************                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ****** *****************************     **      *                                                                                                   *       *                  *                      *                ************ * **       
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[1508] d.243.1           1614                                                     211                                                                                                                           1                                        1                 111                                                                                                                                                                                                                                                11211 13            1                                                                                                                        1                  1               1 1                                                                                                                                                                                                                            1                                                1                                                                                                                                                                                                                                                                 
 Colicin D/E5 nuclease domain   ------------------------71122313--1-------126-28-7120--------------- 123-1---------223----3--21-----112224122-2-12--------43-------1-3-24541---------4-1--2--337--9--3---3-1-53105---------------1--1412377123321--121553511-2233---1--38-5004-------------22----1--1------1--1--111-1-----112-1---71-----11---------------------1-----1--1---------------1--------------------------------------------12212-------1-1-412-----12---212233-11--31-111------8966311111126675124234833333333332-58265380261125526828395222242-31232212---------32212569------------------------------113--111-1211-32411114334211---2-2-322--33465344-3341-311423483-------11429127911263395453-120445359--3-64431--2----------------12-----221362715294677736167775513753----225-------2---11-1-------------------------------1---1----------------1------------------------------222-2-222-------------------------1444433477025345332---------3---1-----11-115512112222------1-33--11----------1--------------------------11---1-1--9-1 ----12--------412111-1-322-221122122211111111111---1---211111-------------------------1111--2---1-11--11------2243542-112111-3121562-1122-1-1-11111--11--213212123212127231--11----------1--12----221-1
                                                        ********  *       *** ** ****                *** *         ***    *  **     ********* * **        **       * * *****         * *  *  ***  *  *   * * *****               *  *************  ********* ****   *  ** ****             **    *  *      *  *  *** *     *** *   **     **                     *     *  *               *                                            *****       * * ***     **   ****** **  ** ***      ********************************** ***************************** ********         ********                              ***  *** **** **************   * * ***  ******** **** *********       ******************** *********  * *****  *                **     ******************************    ***       *   ** *                               *   *                *                              *** * ***                         *******************         *   *     ** ************      * **  **          *                          **   * *  * *     **        ****** * *** *********************   *   ******                         ****  *   * **  **      ******* ****** ******* **** * * *****  **  ******************  **          *  **    *** *
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[1509] d.244.1            595                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Cell division protein ZapA-li  -------------------------------------------------------------------- 111-------------------------------------------------------------------------------------111111111---1111-11-1---------------111-111-111------------------------------------------------------1111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111--1-11-----11--11-----------------------------------------------------111111111111111211111111111---11---11-111111111---11-111111111121111111111111111111111-11111111111-11-111111111111111111111111111111111111111111-1111111--1111-111111111111111111111111111111-11111111111111111111-11111111111111111111111111111111-111111111111111111-11111111------11--------------------------11111-2121-111111111111111111111--11111--1---11111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-------111212222222212222-222---------11111111111111111111111111111--21111111--------11---------------------------------------1 ------1--------------------------------------------------1-----------------------------------------------------11---------------------------1------------------------3-------1-----2---------------1-2-
 ke                                                                                                  ***                                                                                     *********   **** ** *               *** *** ***                                                      ******************************************* *******************  * **     **  **                                                     ***************************   **   ** *********   ** ********************************* *********** ** ****************************************** *******  **** ****************************** ******************** ******************************** ****************** ********      **                          ***** **** *********************  *****  *   ***************** **************************************************************************************************       ****************** ***         *****************************  ********        **                                       *       *                                                  *                                                     **                           *                        *       *     *               * * 
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[1510] d.245.1            471                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           1 13    1                          1                                    
 NSFL1 (p97 ATPase) cofactor p  -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 11-1112-522113211111111111111-11111111111111221111111-11111111111111-1211111111111-1111211421113111112111211523333226323144388324688-94032327444334313434537632335822112142122212121111-122361511111113
 47, SEP domain                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                  *                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                 ** **** ********************* *********************** ************** ************* ************************************************* ************************************************** ***************
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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[1511] d.246.1            183                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 mRNA decapping enzyme DcpS N-  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11--------------- ---------------1111111111111111111111111111111--11111122-1111-111111-12111122-2211111111112111111111-111111--1112121-111111132111151-111111-21111111111111111111111111-11111111-1111----1----1----2123-
 terminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                      **                               *******************************  ******** **** ****** ******** ********************** ******  ******* *************** ****** ************************** ******** ****    *    *    **** 
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[1512] d.247.1             22                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Chromosomal protein MC1        ------------------------11111111----------------11323--------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                        ********                *****                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           *                                                                                                                                                                                                                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                
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[1513] d.248.1           1029                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1        1   13         1                                      4                   
 Coproporphyrinogen III oxidas  -----1--------------1-----------------------------------------11---- ---------------------------------------1------------------------------------------------------------111112111--------------1-----------111-------1111111111111111111113211111111111111----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1111-----111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111-2-111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-------111111---------1--------------11111----------------------------1111-111111111111111111111111111---1111------11111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111--1111111111111111---------------111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-------------------------------------------------------1-- 11--111-521122211111111111111122222111221121111132131111111111211111114213121-11211111322384143612111212331143-574650357233293473157-758234102553346345238234452462412223221124132302224282231323242334
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[1514] d.249.1             60                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein Ta1206    --1-1------------------1--------------------111-11111---------11---- -----------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-11111111111111111111111111111--------11-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------1-----------------------------------------1---------1---1---------------------------1------------1-----1---1-------------------------------1
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[1515] d.250.1           3756                                                                                                                                          1               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2  111 1 111111     11     112                                             1                        1                                                                                                                                                                                                                                                                                                11                                                                                                                   1                                                                                                   1 2     1          1 27  1 1                 1      11       1         3                   
 Folate-binding domain          111-111111111111--------62224-22--------1---2--11-----11111211111--- 3432221111122222222-242242222222433322662324224212217854222222523803222-------1--11411622322122311113222422221111111111111122222222222233333---343433333333333333333333334333333333333332332232222222222222222222222222222222222222222212222222222222222222211111111111111111111---111222122211111111111111111111111111111111111111221122222221211222122221112211114412122222224121131543333333337354333333434456456455617747967475425019192104459933304866679654444444453338343222222222222222222222222222220357323355355555564444556055553557646432233753333533345223352533333333333333321322223222222143322221222223312121111111111111111111111133332323833433434433433343334443212333522222233333333443333333-43233333334333333333333333433333333333333333333333332333333333333222333333433333355222222322222222433333533353666666600796638883333333333333323333334334533333333333323312222231111111121211111-111211111111111111122222222223322 54--453-03413334454455345473343344443333333333453357555464345433523424433652423334345433335444352443233465-41518868806663575875053571087467386566365467530665585004878456054976444606575582394553752548
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[1516] d.251.1            175                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein YwqG      -------------------------------------------------------------------- ----21-----1--1-------------------------------------------------------------------------------------2---21----------------------------------------1--111-----------1--1-1---------------1-------1222232221222222----11222---1--121112111-121111-1111111--------------------11--------------------------------------------------------1111111111111--------------------------------12---------------------1-1------------------1------------1-----2---------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------1---------------------------------------1------------1----1----------111-121------------111111111111---------------1---------------------------------1--1--------1------------------------2--------------------111-------------------------------------------------- -----11------1---1--1----------------------111--------------1------4--------------1-------------------1-----341--------1-----------------------1----------------1---------------11-------2--1-----1--2-
                                                                                                         **     *  *                                                                                     *   **                                        *  ***           *  * *               *       ****************    *****   *  ********* ****** *******                    **                                                        *************                                **                     * *                  *            *     *                                                               *                                                                                                         *                                                   *                                       *            *    *          *** ***            ************               *                                 *  *        *                        *                    ***                                                        **      *   *  *                      ***              *      *              *                   *     ***        *                       *                *               **       *  *     *  * 
===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
[1517] d.252.1           1234                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1                                                                                                                                                                                                                                                                 
 CheC-like                      11---------------------15445-524---2--2222212-15-12-2-2-2122-------- 3631------------------------------1-----2---2---2----1--------2-2-------------------1111----------------1--1-------------------1----------------2----11------------------1--------------------343223233333333333343333333333433333333343------------------------------------------------------------------------------------------66355555555535541553---437--57463445537343333342--3112-11-----11211111241141111111111--22322222--1----1--1-----1-1-1---1111-----------1111-621--------------------------------1-1111112221221322222223333132321111--11111222211212111112111-------111-224452544317322216367675462212114-3333-2223112322222225341---44-5224344-4444464344444533444--11112---11111111111111111111-1111111111111-11--1---11111111111111111111111--1111211111111-1111---------11111-412-----------------------2-1211111211211112222---------1555455555554551111111112------156655542222222243--------------------------4-44444344-4-- -----1--1--------------11---------1--1-11--------1-111--1-1111--------------1111-----------1---2---1----1-----2--1-1---1----1-----2------1----1-----1-----1-1-21------------------1-------11-21----1-1-
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[1518] d.253.1             59                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein YoaG      -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--1-1-1111111--1-111111111111111111-12111--11-11111111111111-111---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------1---------------------------
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[1519] d.254.1              9                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Nucleocapsid protein dimeriza  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------11---------------------------1------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------ --------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------1---------------------------------------------------------
 tion domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                *                                                          **                           *                                                      *                                                                                                                    *                                                                                                                                                                                                   *                              *                                                         
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[1520] d.255.1              8                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Tombusvirus P19 core protein,  -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------1---------------------1------------------------------------------------------------------------------------2---------1---------------------------1-------
  VP19                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *                                                                                                                                                    *                     *                                                                                    *         *                           *       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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 Chorismate synthase, AroC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   1   311 1 1     1 1  1111     1        11     1 1 111             1  1            11 11  1  1111 1     11 422221211 121143 31641 3231 1121111 11112112111121334111132261211  114111 11112 21  1111 
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 Hypothetical protein HI1480    -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------1------------------------1-------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1-----------------------------------
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 Suppressor of Fused, N-termin  -----------------------1-------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------1------1----------------------------11---21------------------------------------------------------------1-1----------------------11111112111111211-1111211111121--11111131--------------------11-------1---11--11-1-------------11-------------------------------------1------1-2-1-111-----------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------------------------------------------------------1-----------------1----------1--------------------11--1------------------------------------1-----1--1-11----------------11-------------111--------2------------------------1---------1--------------------------------------------1---------111111111111-------------------------1------------------11111-1-------------------------------1---33-1-11---------1-111111---------------------------------111-----------1-- 1----------------1--------1-------1------------1--1------------------------1-1-------------1------------------1211122111111152131691-212-1111211111122111112111233-13111111--1-------------1-----------
 al domain                                             *                                                                                                            *      *                            **   **                                                            * *                      ***************** *************  ********                    **       *   **  ** *             **                                     *      * * * ***                                                                                               *                                                                      *                 *          *                    **  *                                    *     *  * **                **             ***        *                        *         *                                            *         ************                         *                  ***** *                               *   ** * **         * ******                                 ***           *   *                *        *       *            *  *                        * *             *                  ********************** *** ************************* ********  *             *           
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[1526] d.261.1            721                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Hypothetical protein PH1602    11111111111111111111111111111212111122111111121111111222211121111111 -1--1111111--1---11-1-----11111-----1211-1-21-1-1----11--1--13--1111111---------1111-1--112---------3-1-31111--------------111-------1-111111212112212211---------11--112-------------2-11121----11111-11-1112-11111--112---1-11-1111121----------------------------------------1---------------------------------------1---------1-111-----------1------1-1--1---1111-1-111--1111---12------------22-------------------------1------1----1--1-----------------1-------------------1----------11-------------------1----111111--------------13--111-----2-----31111---11---2---------11-111221-121-11111-11111112111116511-----------------------------1--2-----------------------1---1111-------1-1---2333333344-3224343444333332332---131111-2121212221111214313332-------------------1-1121111-2-1---------------11121----11-2223241-1-1-1-1------111-----------------1111111----------1--------------1---------------------------11-21111111211 32--111-4112111--1----------1---------------------1111-----111--1--------------1-----1-------1---1-1-----112121111221211111112121641-112111111112122111211213111321311-2211323412119121122---111-1---12
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[1527] d.262.1            105                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 NinB                           -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------1-----------------------------------------------------------------1----------111------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-2-1-11-----2-----11--1---------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------1--------1-322-1-221--------2---1-2---1-12----1-1---------------------------1------21--42---------11---31-----1--21---11--121----1--2--2---1-1-2-12-----3-1--1-12-1--1--1-----------1111-2----1--
                                                                                                                                            *                                                                 *          ***                                                                        *                                                                                                                                                                                                                              *                                                                                                                                                                                                                                                                           * * * **     *     **  *               *                                                                                                                                                                                                        *        * *** * ***        *   * *   * **    * *                           *      **  **         **   **     *  **   **  ***    *  *  *   * * * **     * *  * ** *  *  *           **** *    *  
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[1528] d.263.1             24                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein Yml108w   -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------11111111111111111111111--------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ***********************        *                                                                                                        
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[1529] d.264.1           1072                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1        
 Prim-pol domain                                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1                   2                                                       552 6        
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 Pseudouridine synthase                                                                                                                                                                                        1 1                                          1                                          1111111 111111      111              1                                                                                  1        11 1       1 1    111111     1                                                                                  11                                                                   1    1                1          1 11111111 11     11  1        111   1 1        1     1  111111                      1      1111111 1111111112211111 21122             11111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111  111111111111   1          11 1111111 1111 1 1111111111111111111111 1111111         1111111111111111111111111                      1                                          11  111 5221111  11             1              11  1   1        111   1111 11  1111  1  1 1          1 1 1  722121111111 11 22111381 111 11 11111 11111 1111111 111111 1  2  1 12230222112223 223421222
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[1531] d.266.1            790                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11111     1 111 2 471 212    1         11 2 111  1                                      
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[1532] d.267.1            473                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 Hypothetical protein SAV1430   -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------2222211111----------------------------------------------------------------------------------111111111111111111111111111111222------1112222222222222211122---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------111211111111111121111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111----------------------------------------------1------------------111---2---------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2 ----111-211-1111111111111-11111111111111-111111111111111111111122111121122211-11122222-1111111111111111112-1212363242111111131111372-11-1-111111-111111111111112112111141111111111181121111121211121111
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 ParB/Sulfiredoxin              113-2121212233152----111211121231111111111121212--1---22211221----62 4521441111211111112-1211211121211315344314222112132133212111134321135412111211124152-2--3447-3111--113222111211111111121111111111211111455341-2526356334211211122142117053-1-----2--1-56433222722222222522233223232222222322222263343363333333333333333222228222222262222333222211133322321312112222232323232222233152122111111111273243333444334533333211462213042433313421132521-1223811511215349439085322222222222221-407472363861688426698066461419561881452333333332533184111-11111111111111121111114-5615114333127657676444441189454457557486012972205988255653081122111222231332714147323132123331122511313665431-3111111111112211211111111133333142111211245521121211411111--24223------32-13632563233951-413551211243144244185731123221122113259331552332-13--255515435611---133313242253412----1-12--1-2111123212111113455332021122143111111111115245222223424353527343333223--6144443522232222311-1------------------------1--------2221 ----231---2123-1-2--23-1-----------11------1---111--1-----1111111111112111112122111111111-----1-111111-112---23555027322224306272233294631226153745311422522235112--261314---42-221-1111121-71321-1333-
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[1535] d.270.1           1233                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               1                   
 2-isopropylmalate synthase Le  ---1--1111111111-11111121--11111222222222222222222222222--------2-11 --22311111111121111-121113111111211123322222122-2111111111--222122322221111111-121222222222222------1--11-221---------------22223333323111222222222212232222111111222222321111111111111112222-21111111111111111111112111111121--11111133-1111111111111111111------------------------1--------11111-1111-----------------111111111-21-22-------1-12122----2-2--211221123222-2211-2--1-221111-----222222223222222222222222-11111111222-2112222222222211122222222121111111111111323-----------------------------211111211111222312-1112222111111212222211222212223121212231212111111111111132-2222222122222-2222222222222-3222111111111--1-------11111222211221-2121111111111111111111---1211--1--111211211111111111-11-1111111111111111222121111111111111111111211111111-11111111111111-----------11122111111-111-111111111111112111211211211112111211-12111211111111111111111111111111111131222222--------------------------------------2--2-222222- --------------11111111111111211-11111111111111111112221111111112222112212122222222222211113312211121111111--1-1--------------------------------------------------------------1-211271111121211222221113
 uA, allosteric (dimerisation)     *  ********** ********  *****************************        * **   ***************** *************************** **********  ****************** ***************      *  ** ***               ***************************************************************** ********************************  ******** *******************                        *        ***** ****                 ********* ** **       * *****    * *  ************ **** *  * ******     ************************ *********** *******************************************                             ****************** ********************************************************** ************* ************* *************  *       ************** **********************   ****  *  ****************** ** ************************************************* **************           *********** *** ************************************ ********************************************                                      *  * ******                ***************** **************************************************************************  * *                                                              * ************************
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[1537] d.272.1             94                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Dystroglycan, domain 2         -------------------------------------------11----------------------- ------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1---------------------------------------------------1--------------------------------------------------------- -----------------11111121211-----------------------12-11--------------------------------------------1---------2222211111111111-11261-1-211111111--111111111111111-111-1---1--21--------------1---------
                                                                           **                                                            *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                                                                                                                                                                        *     *                                                   *                                                                           ***********                       ** **                                            *         **************** ***** * *********  *************** *** *   *  **              *         
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[1538] d.273.1            986                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             13                                                2                   
 YjbQ-like                      1111311111111111111111121--111-111111-1111111-122-22212222222-111111 1121-----------1111-11--1111111111111-111111---1------------111-1111111----------112122211-1----------111-121---------------32122312223---11111-12222111--1111122111-1222211211112111111111231-11---------------111111---111-1---------1------------------------1------------------------1----------------------------------------2--11---------12-22-111--2-----12112-22223122221---12---1-----11122--133333------------121111111---111111111111-11-11-1----111---------11------------------1---------------1-1--------1111111----11111111-1111------------------1---11222---------1--1-1-212-222122112-21221222211213242----------------------22111---1111111-1-----1-----11-1-11---2111-------1111-11111111111-111111111112111111111111--11111111111111111111111111----------------111111222221111------------------------1111111-1111----1111---------1----1111121111----------------22------------------------------------------221222222222-- ------1----121111111121111111-111111-1--11111-11111-11113-1211121----1--111------33312111-2111111111111111-12-63533352323-3254372523374922244332313433411936463---132114222--2--3333242322232112211112-
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[1539] d.274.1             48                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein PF0899    ------------------------------------------------------1111111------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------21-3--11481-1121---2111111-111--11--------------------------------------------
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[1540] d.275.1            134                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
 Hut operon positive regulator  -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111-1---1111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1111-----111111111212111111111111-11111411111-1111111111111111-1111111111---------1111112------------------------------1111------------------------------------------11----1-----------------------------------------1-----------------------------------------1-------------------------------------------------------1---------------------------1-------------1-----------------------------------1111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------1------------------------------------------------------------1-------------------------------1----------------------------------------------1-------
 y protein HutP                                                                                                                                *                                                                                                                                                     **************** *   *******                                                                                                                                             *             ****     ************************ *********** **************** **********         *******                              ****                                          **    *                                         *                                         *                                                       *                           *             *                                   ****                                                                                                                                                                                                       *                                                            *                               *                                              *       
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[1541] d.276.1            871                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hypothetical protein yfbM      -------------------------------------------------1111--------------- ----111111111111111-111111111111111111111111111-1---1111-1--111111112111111111--11-111111111-1------1---21111---------------11111111111111111111-21111111111111111111121111111111111111111111-11211111111-11111111222211111111--------21-----------------------------------------------------1--11111111111-------------111---111-----------------1--1-----------11111111--11111--21-11111111211111111111111111111111111-11111111111----1--111-111111211111111111111111111111111-----------------------------121111111111222211111111111111111111111--11111111121111111111111--11111211111-2111111-11111-11111111111111111-11----------------------22111211-12211222222122222111211---1111------11111112222222222-2222222222222222222111111111111111111111111122221221-111111111111---------111111211111111-11111321111111111-11111111111111111111--------111111111111111111---111-------11----11--------1----------------------------11--1-111-1-- --12---------1132212222222232222221121313222222222221222222222111111-12311123122111111111111222-1112111311--2---------------------21----------1--------1----1-1--------1----1---211711211---12----1--1-
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[1542] d.277.1              3                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bacillus phage protein         -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
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 Sulfolobus fructose-1,6-bisph  111111111111111111111111--------111111111111111-1----111111111111-11 ------------------------------------------------------------------1----------------11-----------------------------------------------------11111--1----------------------1----------------11-----------------1-----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------1----1--1111111-----------------1-----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------1---2-------------------------------------1-----1---------------------------------------------2------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------1------------------1--1-----11- ---------------1--1--1---------------1-1-11---1--1-1-1----1------------1-----1---1-----1-1-----1--------------1--1--------1----------1----------------1---1-------2--2------------------------1--1---1-
 osphatase-like                 ************************        *************** *    ************ **                                                                   *                **                                                     *****  *                      *                **                 *           *                                                                                                                             *           *    *  *******                 *                                         *                                                                             *   *                                     *     *                                             *                                                      *                                                                                                       *****                                                                  *                                                     *                  *  *     **                 *  *  *               * * **   *  * * *    *            *     *   *     * *     *              *  *        *          *                *   *       *  *                        *  *   * 
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 Hemolytic lectin CEL-III, C-t  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------1------------------1----1--1-------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------11-----------
 erminal domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *                                                                                                                                    *                  *    *  *                                                                                           *                    **           
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[1548] d.283.1           1690                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Putative modulator of DNA gyr  224242555555555552322212---1---1322222222222222222322266776652222--2 24724-1-------22222-24--22223232222223322222----------------632--1-2322------------22-22-161-2--------22--4----------------1----------------2221-46666644444322222744977632222222222222-12-662---------1---------2----------2-2-1----1--------11--11----------1--1----------------------1-------------1------------------21---2-1---242-2-----2-2-2---2222---2---22222222-622--3-4--921244222222--2222322222222222222222-1-------232-222322322232--222222222222222222222222221222222222222---------------22222-2222222222223426444433424444224252222222222532232222222222224222222222222224--1-----------2222223--333352---------------------------224422--225222222222222222222222--2-22422-22222223222222222222-2222222222222222222222442222222222222222222222222221-233323323233221222222222242-2-22222222121322211111-1--44-44445555464654444----------232422222444445555555222222222-2222222--------6122222--------------1------24222242222--- ------1-411----1121-----1-1-----11-1----------121122-321--111--------1------1-----------1-3-1--1-1----1-3--1--31111-1-1----223-1-121---5-1--21-3---1111113----2-1-13-225-1-3231--1-1-1-112111--3-13-1--
 ase, PmbA/TldD                 ************************   *   **********************************  * ***** *       ***** **  ********************                ***  * ****            ** ** *** *        **  *                *                **** ************************************** ** ***         *         *          * * *    *        **  **          *  *                      *             *                  **   * *   *** *     * * *   ****   *   ******** ***  * *  ************  ********************** *       *** ************  ***************************************               ***** ****************************************************************************  *           *******  ******                           ******  ************************  * ***** ******************** **************************************************** *************************** * ******************** *  ** *****************          ************************