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Ranking of SCOP_SUPERFAMILY : from 201 to 300

                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
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                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[ 201] a.58.1            1001                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
 Chemotaxis receptor methyltra  -----------------------11--1---1---1--1111122-11-2422-1-1-11-------- 1221-----------22----1---1--------------2---2---1-------------1-1---------------1----1--------------1-2-52323-----------------111---21-1111----1-111122--------------32221------------2-------211222222221222222111111222111111111111112------------------------------------------------------------------------------------------31123111111111111111---115--11121114213212111221--2124334-----3135631144225----------1-1131133511--1113323223431-211-2-4444251--------22211734--------------------------------211211-12223323111133351112122242312--11131422221421123121242-------11-2232822215318533217096848146747552-1111-1111---1-------21-4---32-224111142222221122212311133---2241------11111111111111111-1111111111111111111---111111111111111111111111-1111--111111111111---1---------12312-------------------------1444444334434334444-----1---1111233333111332244444333------62112222222222221---------------------------1-11111111-2-1 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--2---1--------------------1-----1----
 nsferase CheR, N-terminal dom                         **  *   *   *  ******* ** **** * * **         ****           **    *   *              *   *   *             * *               *    *              * * *****                 ***   ** ****    * ******              *****            *       ******************************************                                                                                          ********************   ***  ********************  *******     *************          * **********  ************* *** * *******        ********                                ****** *****************************  ***********************       ** ********************************** **** ****   *       ** *   ** ***************************   ****      ***************** *******************   ************************ ****  ************   *         *****                         *******************     *   *************************      *****************                           * ******** * *                                                                                                                                                               * *  *   *                    *     *    
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[ 202] a.59.1            1925                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1              1  1 1  111        11 1 13                      1       1 1               3     1  2 3       1
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[ 207] a.60.5             139                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Barrier-to-autointegration fa  -------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-11-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ -----------------------------------------------------------------------------------------------------------11-512232-221122232231524-225-4313123212222311511-12---2341-11111151------------------------
 ctor, BAF                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    * **                                                                                                                                                                                     *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ** ****** *************** *** ******************* **   **** ********                        
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[ 208] a.60.6             876                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             24  1 1                                                               
 DNA polymerase beta, N-termin  -----1------------------1--11211--1---------1-2-11111---------11---- 112-3---------11111-11--111111111111-111-------1----111-------1-----1-------------211111--------2--------1111----------------------1--1---11---11-------------1-----1-----------------1111111--111111111111111111111111111111111111111--11111111111111111111-----------------------------------------------------------------------1--------------------------1--11---111111111--1----2-----------1-12------------------------------------------------------------------------------------------------------------------211112-----111-11121121-------11-------1-1--1--1--------------1------------------111---1--1121112-----------------------11111----------1-----------------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------11111----1---------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------111------11-- 1111334-312-11212323333333333233333322221123222333313313333333111222--22111221222111111221322143123222221214214575877456345476595407-151345563485354555537455445533552-61421144-25342343221-32731-47541
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 5' to 3' exonuclease, C-termi  11111111-1-111112112222111112111111111111111111111212111131111111111 1221211111111122222-2211232222222333232222222212111122211111222-222322111111111211111211---1--11--------1-2-111111111111111111-1-11121--1111111-1-1--11-31---11111--11---1-1--111-1-112111111112222222222222222223222222221132122222222222222222222222222222111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111121-121111111111-1111111111112111111111111111112111-11----2-11-121111111121111111111111-12112211---1233111-1111122------1-1--11--------1--11-1-11111111111111111111111111111-1-1--2---1111-111111111--1-----121----11---12-111112-1121-112111211111-1-1111-111212111111122211122122222211121111111112-2121222-11--112231122111122322221222222212211-1-11211111122222222221222222-22222222222222222222222222422222222222322222222222221233323343232-111-----1222--1-1----1---------1-------211------1----2111----11111-111-122311111222111133333112----1-11111111---11---11111112-1121111111121111111-1111111111111 5533333-3435333575644545455446444444465665554433445454544455453333543334326443453433336456757758554523656543542996867442415464464247-951344534444356225-34486672274565415553543435456654469327163756775
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 sphotransferase system HPr-bi                  *       *   * *                                         ******** *        *   *      ********   *  * ******** *  * **  ******   ****  *                         * *******************************   *   *                    *             **   * *************************************************************************************************************************************** ************ ****************    *  *  ********* ***** **************************** *********** ***************************        ********                              **************************************************************************** *** ********* *****************           *  * * *      ********************************* ******* ******************** **************************************************** *************** ********* **************************   *******************          ****************************   **************** *    * * **************        *    ***                                     *        **  * *   *    * **         *                  *   * * *          *    *                   *     *       *   *     *** *    *   *            *    **       
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[ 213] a.60.11            691                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              3                                                                    
 Hypothetical protein YjbJ      -------------------------------------------------------------------- 1-2--11211-11------------1-----------21---1-1-------11--------1-1--1-------111----------------------1-11111----------------1----1--------------1-1111--2------1------2---------------------------111112-11--1-211-----1-1----11-1----1----------------------2---------------------11112123------111-11111112222322222232-111111111------------------------1-------------------------1-21--1-----2122243121222----------1-77877675231-13221212221121-1-121111111-1111111131122-11-------------------------------1-11211113132324----3354------2-51111--22--121112111-1--11-2---------1221-11--------------1----11------1---1-----------------------------1-1--11--1-1---------1--------1---------1111-121111111-11-111111111111111111111122--1111111111111111121111111--1--------------------------11-----------------------1211-111111--1222211-1---------1--------------1122222111---------------------------------------------------------------- --------1-----3-111-1211-12----------------11--2112111--2-----1----11--------------------12-12111-1-1--333-11133322232111221422526041337112262142222-2211313312----1--1------2-----11-1112--2142-------
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[ 214] a.60.12           1016                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             24                                1               1               1   
 PsbU/PolX domain-like          -----1---1---------1111-1--2211--12--------23231-2212-2--111-1------ 1321--11111--1-11-----------------------------1-----11--1------------------12-111---------22-1-----1312122-21--------------1--1313---11---11-----6113221212231221121122222121-1--1----11---11---1--------1------1-112--------1--111111-----------------------------------------1-1-------11111--2222222222211111111111112121112221232--111111111--1------11-1--2--122-31--1-----113-112--1-------1---1--21111------------2222222212--111111-11-------1312----21------------1-1--11-----------------------1-1-------------------------11--------1----------------11-1-----111-------------1---2--1--2-----11-21-2-111---1-2111-1-------------------1--1----------1----1-1-11-------------3--------------------------------------------1-1----------------------------------------------------1112---------------------112111-11------11-1---1--------------1-----------11-------1---------1-----11-----------------------------1------12---1112-11-1 ----212-432---2122222233233332323434222221223344334243323233331--111-1---1---------1---11162231412433-21-1-471777868634454537648332618673454634665435554263545432423311-1-1--34212151225231-22243346-45
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[ 215] a.60.13           1062                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Putative methyltransferase TM  ----------------1--------------------------1------------------------ 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111211111121111111-11111111111111111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111222211111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111211111-111111111111111111111111111111111 11--11--311--11----------------------------------------------------------1------------1----------------211-1412-111-21111-111214-571-221-111211211--11-1121211213-12121211---211-128221111211-111112213
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 YozE-like                      -------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1111111111111111--11111-111111--111111---44444334444434244311111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------2------------1-------------------------------------------------------111-
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[ 219] a.61.1              39                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Retroviral matrix proteins     -------------------------------------------------------------------- ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-----1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------1----1-----------------------1------------------1--------16-------1-------171-12--------7--------------2-----------------------------1----------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                               *                                                  *                                                                                                                                                               *     *                                                                                                                                                                         *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             *    *                       *                  *        **       *       *** **        *              *                             *          
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[ 220] a.62.1              20                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Hepatitis B viral capsid (hbc  -------------------------------------------------------------------- -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------11-------1--------------1----------------------------1------------------------1-------1----1-------------------------111-1------------1---------1--------------------1-------4-------------
 ag)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              **       *              *                            *                        *       *    *                         *** *            *         *                    *       *             
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                                aadishmssssssssstcpppptahhhhhhhnmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmpppttttpttkncn aasaccccccccccmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmmnrrrafffkbbkjcclaaakmrttssnpassssstbbbbbbbacesrahpssbbbbcpppasscffgrccdspccccccccccccccpccccccpppcpcccrrdddhtacccccmccsssssssssstgaantppppppppppppdddttddeaabbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbgggloeellllllbpmsssssssssssssssssssellllllllllllllllllpllolllssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssssaaacccccccccccccccccccccccafseehdddddpshncmtttccflgtrcccpbbbbbbmbbbnnorrrrrbbbbbbbbbbocmmmmmmmmmmpcaaaarrrrrrssaxhhmdjprrrrrssaaaaaaaaaggggmrraaaeeeeennoorrrrrrrrrrrrrwwwwpensszbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbcrrrpprrrlmaaddpprvvhjatmmmclnnnnnnnnnnaadbdddddddddddddlgggggggppaaaamsssacccccccccchhhhhhhhhtwnnsaaaatamscipppsssssssssssssssssssbcdnahtbbbbbbceddeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeekkkeppppssssssssssssssssssssssssswyyyyyyyyyyyybbckcccccllllmahcmaaaaamhhhhhhhhpaaaaaaapppacpppppppppppppppppffffffffftavvpvvvvvvvvvvssxxxxxxxxxxxxccmbllllllbbbbbbbbttaacopmbmmmmmmmmmmmmmmmmuuufkptttttttmoaf ppccddmglltgbbsmmsaaanaaaaabbhhhhmmtuccccccpppbsttffnfvvmcsnnnycdaklslcncppssssszcccccssspphpcslccctspumprecenbogttdopleoocdmrsmghhhhppctmotcftbsvpmesedcmmgtaxccchcldbdaaaccntccvmmoooccpooppasptppppa
                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
                                rrmsrtdilllllllknqrsllulrolklacaiaernorrrrnolbrnererznyrrmdnbrilyumr pcirirpfuuuioesuivvvvlpprebbbbbcnooorydalnnndvedncclrlhitliieoanrryeeisoiiifnnrrnllorrofaaelosnnieehhyrfntrbpraaaaaaovleeeearplmaabtaasgroseaahrsrnnnnnrllooeeeeeeeeoobbnyrrrrrrrrrrrrsodeeerniaytttttrrrrrrrrrralccmbuuibuehebgnnnnnlensrrrrrrrrrrrrrrriiepeielsslrslhaauuaaklntsncccaaasuuurtteeeeeeeeeeeoooooooooooooniieeeeeeeeteeittttttttttlfuuvrrryteegbicddffedeleederencoccrllleeccaniidlpddmnrllllloonlllciiitdlchttdpdotvbdmmtllzgggdlutlprinnhhhhnimssssssssyaaytgnbrranammmsnuurallnnlsaoccpddbpitotabiorrtbnnnnpullllllyyeeeeeakenitttcycclotedpiparrsstonabhonnnnnnnnrtlaaockteytcssglllltmbbvtlarohheenlimtnrtmjjjjjriplllllllncorfrrdlecugyillgallllnilwwwwieaetdocdderlohhhhhhskdateslllllllllllllllllllllllllllllreeerrymrtttttttttttpppppoyyseeenoetssssssssseeonmrrrrrreeeeprelieeechccffffrmmluuuuuuncycnprrrrtuuuntttturrrillllllllulssoooooorrlllllommmmyyyssssgsnoffrrttzrrtrrcrnlilyllomatpnrlnooobcnelnreedebrlrtratfrcc lemrsreeajutnnnjadadmsaagyrrrpppppnuemmmmssaaanlerareybhioeastpsnsceuoasisiyrdkrubbbroptmrantnmcooossayrayncxuotubgraprlnirdsrilrpppeogcrrrlmtuurcmcrabvfmgltrottvbiglrlmgliechrirsscruoltttiiaeiepfmjo
                                01000000012345000010000000000000000000012410003020000000000000000000 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 0000000000000100000000000000101230000012301012000000000000300000000000000000000000101000000000000120000000000010000000000000000000120000000000000000000000000000100000000000000000010000000112000010000
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[ 221] a.63.1             251                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Apolipophorin-III              ---------111--1-----------------1-----------------1----------------1 ----------------------------------------1-----------------------1-------------1--------------1--1------------1-------1-----------------------------1------------------111---------------------1---------------------1----1--1---------1-------1-1----1----------------2-----11---------------------1-----1------------------------11---11111-1-1------------1------11-----------------------------1-1-1-4--11------------32222-1---------------11------------------------------1------------------------------1-------------------------------1----------------------------1-1-111-1---------------1-------------------------------1--1----------1--------------------1--------------------------------1221111111-2111111111211111111-------1-----------------1-11111--------------------------1-------------------------------------1----------------------1-----------1--1--------------------------------------------------------------------1-- 12--------1-111-2-15----1-1------1-1-1-1111111----2112---------------1--1--------------1-1-12-11--1--1-1-1----2-31113--------1--1----2--1---121---1-1-11-22321114-14121--2--13---2-2-----11---311-24121
                                         ***  *                 *                 *                *                                         *                       *             *              *  *            *       *                             *                  ***                     *                     *    *  *         *       * *    *                *     **                     *     *                        **   ***** * *            *      **                             * * * *  **            ***** *               **                              *                              *                               *                            * * *** *               *                               *  *          *                    *                                ********** *******************       *                 * *****                          *                                     *                      *           *  *                                                                    *   **        * *** * **    * *      * * * *******    ****               *  *              * * ** **  *  * * *    * *****        *  *    *  *   ***   * * ** ******** *****  *  **   * *     **   *** *****
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[ 222] a.64.1            1481                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              1                                                                    
 Saposin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     34                                         1                                                           1 11111112     1 21 21652 224 1 111121 11 11  2 1 11 22 14  111 1212    4      121      111 
                                -------------------------------------------1------------1----------- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------1----------------------1----------------------------------------------1-----------------------------------------------------111-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1-21912---1----1-1--11-21-2--------------11----1121-11--11----------------1--------1------2--3111---1--21--0106882673999999811394109-741638090137432606871938418918199993686923-4240212446202-64--6007-
                                                                           *            *                                                                                                                                                *                                                                                                                  *                                                                                                 *                      *                                              *                                                     ***                                                                                                                 * *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        * *****   *    * *  ** ** *              **    **** **  **                *        *      *  ****   *  **  ************************* ****************************************** ************* **  **** 
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[ 223] a.64.2               1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Bacteriocin AS-48              -------------------------------------------------------------------- --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ---------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  *                                                                                                                                             
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[ 224] a.65.1            2088                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                                    
 Annexin                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1    2                                                                                                  2232232111122143141703 42411113112111111211312211 12 211 1111        3       12 1    111 
                                -----------------------2-----------------------2--1-1--------------- ------------------------------------------------1------------------11---111------1--------21-------------1---------------------1-1------22-------1-------------------------------------------------------1--11--1------1-------------------------------------------------11----------------------------------------------------------1---------------------------------1------------2-------------------11--1--------------1---------------1---------------------------------------------------------------1---1-----------------------------------1---------------------1-----------1-------------------------------------1----------1-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------12-1--------------------------------------------------------------1-----11--------------------------------------------------------------------------1-- 1111440-511611323444444433544354533324445335543445454444464333221111-21221111-1111112112124134143232222142-81203512238588217395571341344897946689579768953500577009187670747876-1-102322-89513063397723
                                                       *                       *  * *                                                                *                  **   ***      *        **             *                     * *      **       *                                                       *  **  *      *                                                 **                                                          *                                 *            *                   **  *              *               *                                                               *   *                                   *                     *           *                                     *          *                                                                                                                                                     ** *                                                              *     **                                                                          *   ******* ************************************************************ ******** **************************** ******************************************************************** * ****** **************
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[ 225] a.66.1            1262                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1  112             1 2221211  111121121481 21211 111111 11  1  111111  1 1   21 111                          
 Transducin (alpha subunit), i  -----------------------------------------------------1-------------- ------------------------------------1---------------1-1----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1---------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----972-----544343211114232222-11332211121121133334333233332332-1-1-2-11--21-----1111111162841373333552776-4187481880397004336001119-272107012094611992986240326719077244833666----------1689353-122112
 nsertion domain                                                                     *                                                   *               * *                                                                                                                                                                                                                                                                                                    *                                                                                                                          *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 *                                                                                                               ***     ****************** ******************************** * * * **  **     ************************* ************************* ******************************************          ******* ******
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[ 226] a.68.1             636                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1       1  1 14    1                 1                                             
 Wiscott-Aldrich syndrome prot  -------------------------------------------------------------------- -------------------------------------1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1-------------1------------------------------1---------------------------1111-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----1--------------------------------------------1-------------------------------------11---1------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ----422-1---5532111233322222222-2221121221212112221121222-1222223222-2322323332323332321155313343333343689-5132567883555246336304657-887423464644556458321355643474422-81131322---------1-1223---------
 ein, WASP, C-terminal domain                                                                                                             *                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          *             *                              *                           ****                                                                                                                                                       **     *                                            *                                     **   *                                                                                                                                                                                    *** *   ******************* ************************* ********** ************************************* ************************* ********************************* ********         * ****         
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[ 227] a.69.1            2697                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    11                        4                                                2        1          
 C-terminal domain of alpha an  -------1--1----1----1-------------1---------------22--1--1-1-1-1---- 2223333333343323322-22333222222323335343244332232333333223224422222112211112112222222422222222--21122222222221111111111111124322222422332222222226323222223322222242223333222222222222-----22212222222222222222222222222222222323333332222222222222222222222122222222222222222222222222222333222222222222222222222222222222222222223222222222222223222222212--244222222232232--22222223222222222322232222222222222222322-2222222222222222222222222222232232322223333333322242242222222222222222222222222223322222222222222232223233224433332322432333334322222332422333222223222222223522222432353224222232332335532433242322222222222222222222223222222222224222222224222222222222212222222-22222222322332222122-3222222223322222222223222222222222222222222222222222222222222222222222222223333232322222222222222222222222223222222322222222222222222222222242222242422223333333422222222222222----------2----2-343323233323224333322222222223222 2212123-823-2233333433333343333333333322322533443432213335333333242213212223323333333433334333433332362810125-74844323132343422528461462331251255234123338442243853223942474553433223341237803664332223
 d beta subunits of F1 ATP syn         *  *    *    *             *               **  *  * * * *     ******************* **************************************************************************  **************************************************************************************     *****************************************************************************************************************************************************************  ***************  ***************************************** ******************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************* ******************** *******************************************************************************************************************************************************************************          *    * ********************************* ******* *** ************************************************************************************************* *****************************************************************************************
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[ 228] a.69.2            8746                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           11           11 1 261 111    1            1                                             
 Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             1111553 722 33322222222222222222222222221222221222222212222222221111 1112111111111111122212122122222112555 32280189996566776215668612326555515786476549536676774775553364443554122151111133452521134341
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[ 230] a.69.4             327                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
                                eeaoauecssssssooeaeraseualauatahmtheaeaaaaaoaaauhucaaabuoaoniocorqya aasecuiflllerrbqvooooieeamuuuuulacccaropelaaaaaeeiiyuhthuahhrrcciirvorudnnnnooaueeyedazlrrhuziiisuucosoiiueueurrrrrrbaennnnraehihhiuhhegulashhtuoaaaaaaeeellnnnnnnnnliaauraaaaaaaaaaaaeeahhhuiclmnnnnneeeeeeeeeelaiiuuhheoahphiinooooereauuuuuuuuuuuuuuappaaacruaaeeaeolleehhaaeieeaaagggyqqqouunnnnnnnnnnnyyyyyyyyyyyyyauuhhhrrrbherceooooooooooeilloeeehehramleouaacehorhyhesearuuueaurruareurniaaaaiaaaaaabbaeeeivuunohitxxooasoaiauuittieeeeeauaeahneppppeloaaaaaaaariixeaeuaahahuuuiessfkeeaoeaeriiynnlibirilovraeemeeeeelaaaauuhhssssshrieauueeliioheviacaleairnhelotioooeeeeeuuuooralulseaeeaauuuneoooeurareeaaaecuuoueoeeeeeaceyyyyyyyeurtleeyauaqesotanmaaaaeraeeeeoneiueoiuochaipppppcoaaectaoooooooooooooooooooooooooooooennnaasuinnnnnnnnnnnyyyyyrooylllolrneeeeeeeeessleaouuuuunnnnaoharlllupuunnnnaoouaaaaaairryiaeeeenllleuuuutyyyhuuuuuuuuraiirhhhhhaapuuaaxaaaarrraaaaaegyiioonnfuuuaeeueaaehealpgraoeaeyyyoyenuyarrolofeeeaeeneua aooaiurhrarneeuiroriuillireeeaaaayaqemmmmoorrriceireaxlarlhrieiuaoahlllauataeuiaolluaracohlnsioieeeeorailruwurlacuienafeuroruoruoaaagryayuaeaaracaauuraooouauarnnaopiuoeaeerledeeauuutaluaaarrhorsanaon
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[ 231] a.70.1            1069                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               2                   
 N-terminal domain of the delt  -------------------------------------------------------------------- 111-1-1-------12111-1-221-1111111---11111-----------------------111----1-------1111111--111111--1--1111111111--------------111111111111-----111-11111111111111111111111111111111111111-------1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1--121111111111111--11-11121111111111111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111221111111111111111111-1-------1111111111-111111111111111111111111111-1111111-11111111111111111-11-1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111121211111111111111111112111111----------1------11111111111111111111111111111---1 11--111-31--111111-11111111111111111111111111111111111-11111111111111111111111111111112111-111111111121112-11-223321211111112114-461-11111-11-111111111-13111121111111221112212322242222272241321111111
 a subunit of the F1F0-ATP syn                                                                       *** * *       ***** * *** *******   *****                       ***    *       *******  ******  *  **********              ************     *** **************************************       ************************************************************************************************************************************************************* *  ***************  ** ************************************** **************************************************************************************** ******************************************************************************************************************* *       ********** *************************** ******* ***************** ** *******************************************************************************************************************************************************************************          *      *****************************   * **  *** **  ****** *********************************** *********************************** *************** ** ****************** *** ***** ** ********* ***********************************************
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[ 232] a.70.2             299                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             2                2                             1                                      
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[ 236] a.73.1             463                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      1      13            4         1   1                                         
 Retrovirus capsid protein, N-  ---------------1---------------------------------------------------- -1---------------12-1-----11111-----1---1-----------------------------1-------------------------------------------------------------------11-------------------------------1--------------------1-----------------11-------------------1------------------------------------1--------------------------------------------------------11----------------------------------------------------------------------------------1-----------1----------------------------------------1-----------------------------------------------------------------------1-----------1-----------------------1------------1---1------------------1-------------------------------------------------------------------------------------------------------11-----------------------------------------------------1--1--------------------------------------------------------------------------11111------------------------------------------------------------------- ------2-----11--2---12-1111112111-1-111111111111211221--2112-1---1----------1-----------1-1-2--15331-1---1--1-5544564344256575486226176822534323563762745054324132123441111--2--1----------------1-----
 terminal core domain                          *                                                      *               ** *     *****     *   *                             *                                                                   **                               *                    *                 **                   *                                    *                                                        **                                                                                  *           *                                        *                                                                       *           *                       *            *   *                  *                                                                                                       **                                                     *  *                                                                          *****                                                                          *     **  *   ** ********** * ******************  **** *   *          *           * * *  ***** *   *  * *************************************************************  *  *                *     
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[ 237] a.74.1           10056                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            11111       11 1 251 1 1    1            1    1                    1        1 1        
 Cyclin-like                                            11111121                                  11                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     1111332 4111334222222222322221222222122222222212222232222222222222221233222332333222222223532333222222245413538910000645668610525250 297566605786576567562596624545545374482543233222222367732144834332
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[ 238] a.75.1            1505                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              2                                                1       11          
 Ribosomal protein S7           11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111-111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-1111111111111-111112111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-111111111111111111111111111111111 211111215211222132222222222223333222342232222242223222222222222222321223222323232222223432323324423322243512314332335222-32242262202-224222222222223122211224242342223132652222333181112165082551111321
                                ******************************************************************** ******************* ********************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************************* ************* ********************************************************************************************************************************************************************************* ********************************* ************************************************************************************************************************ *********** ******************************************************************
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[ 239] a.76.1             676                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 Iron-dependent repressor prot  111112222222222312-1---4333124231121111111124245-3333111111112221-24 111-132233422322122-221122222222222222331111222122223233121111111221212-------123111----------112--111111312211111-111111111-1-1-----1143345--111-----------------------11------------31111-11211111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111-2-11-1---11111111----1111121121111111111111111111111111111111---1111-1-2323221121211-331---1122--11114411-111-1------1113---------11--2------1-------------1111111111--1--1--1----------2---------1111111111111--------------------------------------------------------------------------------------------------------------121111--1-----2131111121111---2----------------------------------------------------------------------11---111111111111-1111111111111111111111-----1111111111111111111111111--------------1--------------1------------------------------------------------------2--------------22111111111111---1--------------211-------------------------11122222221111 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------1--------------------------------------
 ein, dimerization domain       ****************** *   ************************* **************** ** *** *************** ***************************************************       ******          ***  *************** ********* * *     *******  ***                       **            ***** ***************************************************************** * ** *   ********    ****************************************   **** * ************* ***   ****  ******** *** *      ****         **  *      *             **********  *  *  *          *         *************                                                                                                              ******  *     *************   *                                                                      **   ************ **********************     *************************              *              *                                                      *              **************   *              ***                         **************                                                                                                                                                                 *                                      
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[ 240] a.77.1            7484                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                        
 DEATH domain                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          0 1  1        11 2 371 212    1  1      1  1         2          1                        
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                                ppkhmbsaiiiiiistpmaacinfmasmwulpsstfjammmmvbplmhtbabmkafhgkostavcesm cbufaadegggjkuaaabbbbgllmstttttuvyyyfehocarrrcfsdmmxacrrlswwatoamveacgfaaaaillpclhxaymaufftvadggammojpfbphfrhmttttttacfppppaptclppvlptaaahcoeeearmyyyyyayyeeyyyyyyyyevnnpemmmmmmmmmmmmdgrttttmafaaaaaaccccccccccchllpsttwektsisximmmmwbacaaaaaaaaaaaaaaceehsfabbccdfghjpprrrrsspcmolllaaadeeegmmppppppppppppppppppppppppsssttttttutmoabbbbbbbbbbbcdkknppppttpmyermahhartwoththptspnbaybacczbghqtisjrrhwcpppppaacmmmmossahcdeeenprelllrttveehlllmmcabnmsadssssdipppppppppcddobmcrmmpccrrrrsttaabbccfmpprrteeopulawamabpppacccccgmmmmmmppppppptuvxteemnoppscpacianofpeaapdfmevhggmmmmmeemzzabaaoprbddmsvvvibeelmsucpddnnxcafbccfhjjjjjlahpppppppdspiuffhsamadplahiabbbbdfhhhhhlopppswcrnoehhaaaaauksdzintcccccccccccccccccccccccccccccfpppccalmeeeeeeeeeeetttttpbbdfffsgbepppppppppppfphkbbbbbppppcbcsapppsasdiiiipssmbbbbbbcacsvjaaaaefffmppppsssspttttttttcsffpccccchpsvvmmaccccoooffffmvahbbbbiiabbdghrtdplypymfpaaccfgghhhmmpppspuunomamhlmnpitmb fyhpdpbtbmbiddpfgnbnffcfnotddccccgceriiiippbbbcsrvgvhoadggtcdtllhgltkegcgpsbckmpraadptjopcpaoccbnnnmrgmcbocohgflarnracatcppomntmgsssutpjsmgbfcttspvleacnhdeggctiisragpmmgambevamrcpplsthvpsstttmtpcirsa
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